1FLYA

Hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDANGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Gallus gallus
publication title Relationship between local structure and stability in hen egg white lysozyme mutant with alanine substituted for glycine
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 50
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-08-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1flyA00
4PHIA 154LA 1OUBA 4Z98A 5F14A 1GDXA 1FKVA 4J1AA 3LYMA 3WXUA 5JENB 1GFVA 1C10A 3A3RX 5LIOA 1IWVA 4YM8A 4AGAA 1GFKA 1VFBC 2Z2EA 4ETBA 4B4IA 1VATA 4NHQA 4NGLA 4UWNA 2CDSA 5KXNA 2I26L 5LAFA 2C8PA 4NGYA 2G4NA 1FLQA 2MEBA 4BS7A 4H93A 2DQFC 1XGQC 5D5FA 1O23A 4GLVA 5ILFA 4H92A 1LHIA 1YAQA 4I8SA 135LA 1RCMA 1IP4A 1IIZA 1JSFA 4H9CA 1LSFA 4OOTA 4H1PA 1SQ2L 2A7DA 1LZCA 4U3XB 1HEOA 2NWDX 4DT3A 3HBEX 4BADA 1TBYA 1LYOA 2EQLA 1NQIA 1REMA 3A6CY 4CJ2A 5I53A 1LHHA 3G3BB 1LHLA 1IP5A 3P65A 1LMAA 4ETEA 4RW1A 3LYTA 1BB5A 3KAMA 1LZAA 1UIGA 3WPKA 1LZEA 1RI8B 2ZIKA 4KL7A 5KKJA 5F9XA 4LZTA 4UWUA 2BQIA 1XFPL 4Z46A 3A93A 1C43A 2HEAA 1JISA 4M4OA 1IOCA 5E4PA 1GAZA 1B5XA 5I4YA 1CJ8A 2BQKA 1BB3A 1JJ1A 1YKYX 4ZEEA 1YL0X 2H9KA 2ZNWY 2X0AA 4W96A 4H8YA 1B5VA 1D0KA 1B7SA 208LA 4J0LA 1GFEA 3EMSA 1HEQA 1LZ6A 4WL7A 1GEVA 4NGOA 5FHWA 5C6JA 1NKHA 2Z12A 2FBDA 4XJFA 1IO5A 2BAAA 2D6BA 3CSQA 3W3EA 2Z38A 4NHSA 5L3IA 1LMCA 4X3BA 5HMVA 5KXWA 1DZBX 1GF8A 1LSZA 5EBHA 4LT3A 1LHKA 4NSIA 2YSSC 4HJYA 3RZ4A 3WL2A 4H9FA 1TAYA 2ZILA 4NHTA 3WUMA 1D6QA 4TUNA 3VWOA 4YF2A 1GFHA 1WQRA 1XGTC 1GFUA 5DLAA 1IX0A 3TXBA 5KXLA 3E3DA 1JITA 5IDDA 2FYDA 4PRUA 1DKJA 1IWWA 1LMPA 5C6IA 1IWXA 3IJUA 1LHJA 3T6UA 1GFAA 4CFOA 2HU3A 4O34A 6LYZA 1F6SA 1IR8A 1B7PA 1UA6Y 2CGIA 4GCFA 3P64A 1I20A 5ILCA 1XGUC 1KXYA 4TSCA 1YKXX 1TDYA 4H9BA 4LT1A 4MCKA 4NSGA 3W6EA 3BKVA 1PS5A 1YL1X 1AT6A 1LSPA 1YAMA 2FBBA 3A3QA 4HJZA 1YROA 1LSBA 5M1YA 5F16A 1GE0A 4HV2A 2LYZA 2YBJA 1W6ZA 3TXIA 1B5UA 3HBDA 4WLXA 1QDRA 1Z55A 4H90A 5I4WA 3CSZA 1LZ1A 1ZV5L 4NG8A 4EOFA 1JUGA 4B1AA 5D5CA 1YAPA 3TMWA 4KXIA 1QIOA 2BQEA 5IHGA 1EL1A 1D0LA 1LAAA 1WQMA 1BB4A 3J4GA 3HFMY 4HV1A 1EQEA 3QE8A 1JJ3A 3CT5A 1JTOL 194LA 2CJLA 3AW6A 4NGZA 5KXZA 2MECA 1J1PY 134LA 2YBMA 3EO5A 5HLLA 4XJGA 1GXV2 1LZSA 1DI4A 1KXWA 1E8LA 3TXKA 5L9JA 2YBIA 1GE4A 4XYYA 1OUJA 1OQMA 3B6LA 1GB8A 1GFRA 4XJDA 2MEIA 1GB2A 4DD2A 1OUEA 1HERA 1YAOA 4N0JA 2LHMA 1HSXA 2HECA 3GXKA 2BQCA 2LYOA 2YDGA 207LA 2VB1A 1B2KA 3WXTA 1FLYA 4HTKA 1GAYA 1HENA 1VAUA 3ULRA 1NMMA 3A34A 4NIJA 1LPIA 4HSFA 2DBTA 2LZTA 4HTQA 4YOPA 1QSAA 3AZ4A 1REZA 1HEWA 3TXDA 1UIHA 1YKZX 1GF9A 5KXYA 3CSRA 3A95A 5DM9A 3AYQA 1GB5A 1LSDA 1FN5A 1WTNA 2BQJA 3AGGG 2F2NA 4H9AA 2HTXA 4A7DA 1UUZC 1G7IC 4J1BA 1JJ0A 4DDAA 4AXTA 2A7FA 1DPWA 1LZBA 1OUAA 5KXSA 1QTEA 1MLCE 1IEEA 1BVXA 1JPOA 4WG7A 2BQFA 1C7PA 1HHLA 2C8OA 4H8XA 4WO9A 1LYSA 1GE1A 4OWBA 1CNSA 3J6KA 4TX7A 2G4QA 1NBZC 4G9SA 1B9OA 1GB9A 4IJ4A 1NWGA 4WLYA 3WU9A 3AB6A 1XSFA 4NWEA 4N1EI 4FDYA 3T36A 2Z18A 1XEJA 1SLYA 1BWIA 2HEBA 3FI7A 2I6ZA 1JTPL 5FDJA 3W6AA 5IELA 1GBYA 4NGKA 3OJPA 5B05A 3WULA 5APEA 1IWYA 1LZYA 5A3ZA 4N8ZA 4HP0A 5B59A 4R0FA 3WW6A 4L41A 1AM7A 4IATA 2Y8PA 1LZNA 4NGIA 3LYOA 1IORA 5APFA 1LSMA 5KY1A 2EPEA 4Z3MA 2DQEY 1HMLA 5FSTA 1T6VL 3FE0A 1QTKA 4CGEA 1D0MA 1G7MC 1IWUA 2IFFY 1LZGA 2YVBA 1IOTA 1LKRA 1V7SA 4NGWA 5KXTA 2GV0A 1H6MA 1C46A 2MEDA 4GCCA 2B5ZA 2FYCA 1JEFA 1N4FA 4WMGA 2BQDA 4LGKA 3F6ZA 5DN5A 4BAPA 4TWSA 1XEKA 1RFPA 3B72A 4NHPA 4WM1A 3WU7A 4RDSA 1GBSA 1GFGA 1LSCA 5AMYA 3TXFA 5I4XA 5B1GA 4FJRA 1IOSA 1VDSA 1HFYA 2IHLA 3K3TA 5I54A 4ET8A 1GF5A 1WVUA 4WLDA 1IC5Y 1REYA 1LSEA 3A6BY 1V7TA 5LVIA 3WUNA 1IVMA 5KXKA 8LYZA 1BHZA 1UBZA 1LJJA 1HF4A 2W1MA 4G4BA 1IWZA 4DDCA 1KIQC 5B1FA 1YQVY 2W1LA 2Z37A 2D4KA 2YBNA 4PRQA 4ETDA 4GN5C 1VEDA 132LA 3LHMA 4LFXA 2HEFA 1GF0A 1RE2A 1F6RA 3AGIA 1KIPC 4G4CA 1LCNA 1DI3A 5F9UA 5K7OA 1MELL 1WQNA 4DWXA 4LYOA 3WYHA 1C45A 1CKHA 4KT3A 5FCPA 4GCEA 3G3AB 1A4VA 1XGPC 1NDGC 5LAGA 4GN3A 4LYCA 5II3A 1JTTL 5T3FA 1LJ3A 1H87A 1B5YA 1VDPA 4NG1A 1CJ6A 1AKIA 1B7NA 3A96A 5FEKA 1GBWA 4WM3A 2BQMA 1YIKA 4E3UA 5DN4A 3WH1A 5A3EA 4RLNA 1GHLA 1QUTA 1OUDA 1GB6A 1WQOA 1JKDA 1J1XY 2DQGY 1OP9B 1NBYC 2XBSA 3WUAA 3D9AC 1UACY 4LYTA 1B7MA 1WVVA 2G4PA 5J7CA 1BVKC 3LN2A 4BAFA 1LTMA 1LJKA 1LYYA 1IP7A 2AUBA 3A90A 3B0IA 5DL9A 4B49A 1LJFA 3AW7A 3CB7A 1GXXA 3N9EA 4LFPA 5APDA 4WM5A 1OUHA 3CT0A 4H91A 1GF7A 1LSNA 4CHXA 5KKIA 4WG1A 4IASA 1DPXA 4C5FA 1UIDA 1FBIX 3N9AA 4ANRA 1XEIA 2HEEA 1GB3A 2PC2A 4OOOA 4NSHA 1LJ4A 3W6BA 2LZ2A 3AZ6A 1IP1A 5C6LA 1LJEA 1YILA 1RJCB 1ZMYL 2ZYPA 1AT5A 4N9RA 5HNLA 3TXHA 3ZEKA 2XBRA 4ZFPA 5KJ9A 4OWHA 1B7QA 1HELA 4C3WA 4B0DA 4YEMA 4Z41A 4J7VA 5KXPA 3SP3A 4TSBA 4MSTA 3WVYA 5LYMA 1HC0A 1LZ4A 1GPQC 1LKSA 1IP6A 3EXDA 1DXJA 4YEOA 3N9CA 5LVKA 1CJ9A 2BQLA 2W1YA 4QGZA 3AZ5A 4ET9A 2BQBA 4GCDA 5B06A 2DQJY 2MEHA 1IR9A 1GE2A 1JWRA 2ZQ3A 1JKCA 3LZTA 4WM4A 3TMXA 5KXRA 4PPOA 3A67Y 1G7LC 3P66A 2XJWA 133LA 3ATNA 4DD9A 5LYZA 2DKVA 2MEFA 3M18B 3RW8A 1UICA 4G4HA 4GN4A 5LYTA 3A94A 4NY5A 1QQYA 1GEZA 4RLMA 1XGRC 4XADA 4LYZA 1QUSA 1NHEA 4NSJA 1VDTA 5HMJA 4H8ZA 1IP3A 3WMKA 1CKFA 1LOZA 2CWIA 3CT1A 1LZRA 3M3UA 2W1XA 1OUFA 4WLTA 2BLYA 1JSEA 3IJVA 2ZWBA 1IP2A 3LZ2A 3B0KA 4H94A 4D9ZA 153LA 1GF4A 4WOAA 1GFTA 1NDMC 1YANA 2LYMA 1LZDA 4N5RA 2BLXA 4WL6A 3OK0A 4MR1A 4PJ2C 1GF3A 1LZ8A 1GB7A 1J1OY 1UIAA 1HMKA 1ZVHL 1A2YC 1OUGA 2D4IA 2YBLA 4GCBA 1HFXA 1LSGA 1F10A 3AJNA 1IC7Y 4LT0A 3WU8A 7LYZA 1BWHA 4DYGA 2F4AA 1JHLA 1LZTA 2DQDY 1CJ7A 4NWHA 4W94A 3RNXA 1B5ZA 4QEQA 1VDQA 1BQLY 5LVHA 3P4ZA 4II8A 5HNCA 2MEEA 2ZNXY 1IY3A 2HEDA 3BKHA 1BB6A 3WPJA 3A91A 2MEAA 1T3PA 1BGIA 3EBAB 1TEWA 4ZIXA 4ETAA 4DC4A 1GFJA 1LZ5A 1PZYA 1B7OA 4H9EA 5B07A 4B4EA 1AZFA 1HEMA 2H9JA 3TXEA 2BQGA 3W6CA 5HQ1A 1DKKA 5LVGA 4OW1A 3RT5X 4OWAA 4ML7A 4NGJA 1INUA 2Z39A 1P2CC 4KPMA 4LT2A 4ETCA 1LJNA 1UCOA 1CKGA 1CKDA 2H5ZA 5LXWA 2XTHA 3D3DA 1D6PA 1LJGA 1EQ4A 5LVJA 1FLUA 3TMUA 1JKBA 1GD6A 3TXGA 2Z2FA 2F30A 4NFVA 1HNLA 3ZVQA 3B0OA 1LJHA 3LYZA 4DD7A 1LZ9A 2DQCY 3WW5A 1GWDA 1LHMA 5KXMA 2BPUA 2BQOA 1UIFA 4QDNA 4WM2A 3QY4A 1FKQA 4WM6A 4TTDA 5L3HA 5LA8A 3AZ7A 2EIZC 4H9HA 1B7RA 4P2EA 2HU1A 4WO6A 3W6FA 5KXOA 1G7HC 2ZIJA 3CQLA 2DQAA 4GLAA 1UC0A 2D91A 3RU5A 1B5WA 4XENA 4B4JA 2MEGA 2F4GA 1C08C 193LA 1FLWA 1GDWA 4I0CA 1UIEA 4DD3A 2DQIY 2I25L 1DI5A 5F81A 4LYBA 3HBHA 5APCA 2Z19A 4QY9A 4CFPA 4XJBA 2ZQ4A 1FDLY 1WQPA 3A92A 5LINA 1GBXA 1GBZA 2BQNA 4HJVA 1JKAA 1ALCA 2DQHY 1TCYA 1D9UA 1HFZA 1LMNA 3WVXA 1IR7A 2N5ZA 1F0WA 4DD1A 1LSAA 2EKSC 1DQJC 1JIYA 2Q0MX 4OWCA 1LMQA 1HSWA 2RSCA 4HPEA 4PGJB 4LYMA 1LMTA 1GE3A 2WARA 2BQAA 1B7LA 1I56A 1HEPA 5FELA 1IWTA 1G7JC 1LSYA 3GXRA 3W6DA 1EQ5A 4XJHA 5KXXA 3A8ZA 1LJIA 5E9RA 4M6DA 1IY4A 3IWRA 4R6CA 1IOQA 5LA5A 1WTMA 4NHIA 4XJIA 4H9IA 1QSWA 4G49A 4UWVA 3ZVQB 5I5QA 3TXJA 1LMOA 1LYZA 4DD0A 1GB0A 1NF5A 1OUCA 3TMVA 1W08A 2BQHA 2D4JA 4DDBA 1QDTA 3MGWA 1GBOA 1CKCA 1OUIA 1UIBA 4NEBA 1KIRC 4HTNA 2YBHA 1REXA 2ZYCA 1I1ZA 3ATOA 4N1CC 4NGVA 4XN6A 4RW2A 3QNGA 4EMNA 1KXXA 3AGHA 1IC4Y 2HUBA 3P68A 1GF6A 1WQQA 1B0DA 1BB7A 1BWJA 9LYZA 1ZVYB 4OWEA 3WPLA 4YENA 6LYTA 4HPIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
196LA 139LA 5F14A 1FKVA 1QT3A 3L64A 3DN2A 4AGAA 1VFBC 4ETBA 1VATA 4NHQA 2CDSA 3HT6A 5KXNA 1L66A 4BS7A 135LA 1RCMA 2QARC 1IP4A 4LDLA 1IIZA 1JSFA 1QUHA 4H1PA 1LZCA 2NWDX 1SWZA 3LZMA 4EPFA 4W51A 257LA 1T8GA 1IP5A 103LA 1LMAA 4I7RA 3LYTA 3KAMA 1LZAA 1LZEA 5KKJA 1I6SA 4Z46A 1C43A 3SBBC 1B5XA 2BQKA 1YKYX 4ZEEA 1L48A 3DN6A 4W96A 1L37A 1G0PA 1B7SA 208LA 1GFEA 1G06A 1LZ6A 5C6JA 173LA 4NGOA 1L83A 1NKHA 1QTCA 1SX7A 1IO5A 159LA 1QT8A 3CSQA 3W3EA 5L3IA 4NHSA 4X3BA 5HMVA 4LT3A 2OE4X 4HJYA 172LA 2ZILA 4TUNA 1IX0A 3SB6A 3OE8A 5IDDA 2FYDA 4PRUA 4I7PA 5C6IA 3IJUA 4CFOA 4GCFA 5ILCA 1XGUC 1KXYA 1YKXX 4LT1A 1PS5A 1YL1X 1LSPA 1YAMA 4HJZA 4YXCA 2LYZA 1KW5A 3DMZA 3TXIA 3HBDA 4WLXA 4I7QA 3CSZA 1LZ1A 1ZV5L 1QIOA 1LAAA 3J4GA 1BB4A 3HFMY 1JTOL 2CJLA 1D3MA 4NGZA 2MECA 4ARMB 1L05A 3L2XA 3EO5A 1OV7A 4XYYA 221LA 1LWKA 2RB1X 1GB2A 2XQOA 1HERA 1YAOA 4N0JA 207LA 1KW7A 1GAYA 1TLAA 2ANVA 3HTFA 4YOPA 3TXDA 1UIHA 5DM9A 1L16A 1LSDA 1WTNA 4H9AA 3DN3A 2HTXA 4AXTA 234LA 5KXSA 225LA 1JPOA 242LA 4OWBA 3AB6A 4LDOA 4NWEA 249LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PHI A;  154L A;  1OUB A;  4Z98 A;  5F14 A;  1GDX A;  1FKV A;  4J1A A;  3LYM A;  3WXU A;  5JEN B;  1GFV A;  1C10 A;  3A3R X;  5LIO A;  1IWV A;  4YM8 A;  4AGA A;  1GFK A;  1VFB C;  2Z2E A;  4ETB A;  4B4I A;  1VAT A;  4NHQ A;  4NGL A;  4UWN A;  2CDS A;  5KXN A;  2I26 L;  5LAF A;  2C8P A;  4NGY A;  2G4N A;  1FLQ A;  2MEB A;  4BS7 A;  4H93 A;  2DQF C;  1XGQ C;  5D5F A;  1O23 A;  4GLV A;  5ILF A;  4H92 A;  1LHI A;  1YAQ A;  4I8S A;  135L A;  1RCM A;  1IP4 A;  1IIZ A;  1JSF A;  4H9C A;  1LSF A;  4OOT A;  4H1P A;  1SQ2 L;  2A7D A;  1LZC A;  4U3X B;  1HEO A;  2NWD X;  4DT3 A;  3HBE X;  4BAD A;  1TBY A;  1LYO A;  2EQL A;  1NQI A;  1REM A;  3A6C Y;  4CJ2 A;  5I53 A;  1LHH A;  3G3B B;  1LHL A;  1IP5 A;  3P65 A;  1LMA A;  4ETE A;  4RW1 A;  3LYT A;  1BB5 A;  3KAM A;  1LZA A;  1UIG A;  3WPK A;  1LZE A;  1RI8 B;  2ZIK A;  4KL7 A;  5KKJ A;  5F9X A;  4LZT A;  4UWU A;  2BQI A;  1XFP L;  4Z46 A;  3A93 A;  1C43 A;  2HEA A;  1JIS A;  4M4O A;  1IOC A;  5E4P A;  1GAZ A;  1B5X A;  5I4Y A;  1CJ8 A;  2BQK A;  1BB3 A; 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 1BWH A;  4DYG A;  2F4A A;  1JHL A;  1LZT A;  2DQD Y;  1CJ7 A;  4NWH A;  4W94 A;  3RNX A;  1B5Z A;  4QEQ A;  1VDQ A;  1BQL Y;  5LVH A;  3P4Z A;  4II8 A;  5HNC A;  2MEE A;  2ZNX Y;  1IY3 A;  2HED A;  3BKH A;  1BB6 A;  3WPJ A;  3A91 A;  2MEA A;  1T3P A;  1BGI A;  3EBA B;  1TEW A;  4ZIX A;  4ETA A;  4DC4 A;  1GFJ A;  1LZ5 A;  1PZY A;  1B7O A;  4H9E A;  5B07 A;  4B4E A;  1AZF A;  1HEM A;  2H9J A;  3TXE A;  2BQG A;  3W6C A;  5HQ1 A;  1DKK A;  5LVG A;  4OW1 A;  3RT5 X;  4OWA A;  4ML7 A;  4NGJ A;  1INU A;  2Z39 A;  1P2C C;  4KPM A;  4LT2 A;  4ETC A;  1LJN A;  1UCO A;  1CKG A;  1CKD A;  2H5Z A;  5LXW A;  2XTH A;  3D3D A;  1D6P A;  1LJG A;  1EQ4 A;  5LVJ A;  1FLU A;  3TMU A;  1JKB A;  1GD6 A;  3TXG A;  2Z2F A;  2F30 A;  4NFV A;  1HNL A;  3ZVQ A;  3B0O A;  1LJH A;  3LYZ A;  4DD7 A;  1LZ9 A;  2DQC Y;  3WW5 A;  1GWD A;  1LHM A;  5KXM A;  2BPU A;  2BQO A;  1UIF A;  4QDN A;  4WM2 A;  3QY4 A;  1FKQ A;  4WM6 A;  4TTD A;  5L3H A;  5LA8 A;  3AZ7 A;  2EIZ C;  4H9H A;  1B7R A;  4P2E A;  2HU1 A;  4WO6 A;  3W6F A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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