1FQBA

Structure of maltotriotol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA01
4NEDA 3RUMA 4JWOA 3IO4A 3IO6A 1KWHA 4JBZA 4U22A 2ZNUA 3K2DA 4ELPA 1JW1A 2P0SA 3MW0A 3IB0A 4MLQA 5H8SA 4F18A 1QKAA 1P1UA 2XX9A 3UK4A 1PB8A 1EU8A 4X9TA 4BLAA 1H43A 2BJJX 5I59A 4OYVA 2DXRA 2DE2A 4OEVA 1MXVA 4GL0A 4YKIA 1UIUA 1RYOA 5H8QB 2PX1A 1R1NA 1MS7A 2O7UA 2P1SA 2UVJA 1PBQA 1XOCA 4H8IA 3TTRA 2PYYA 4F39A 4F31B 1VR5A 5EHMA 4I9DA 3SERA 1Y20A 1LBBA 4PFYA 1WDNA 2XXRA 3EN3A 1OVBA 1Q35A 3O6IA 1MQGA 2DYXA 4HS7A 3HCQA 5AA2A 1H3DA 5IAIA 4U21A 5L9SA 1XVXA 2I6EA 5JTYB 4ELRA 4R2BA 2GFEA 3BFUA 3FUZA 4H1XA 4EQ9A 4X1BA 4GVOA 2DVZA 4KD5A 3DM0A 3FJGA 4LQ5A 3U94A 4C1UA 3CIJA 3OO6A 1B0LA 3OSQA 3OO7A 2RC9A 3M3FA 4R9FA 1DTGA 4QSEA 3O66A 1A8FA 4F3BA 5HPQA 5KZTA 4G8MA 4FJPA 1I6QA 4JWYA 4F1UA 4LZ5A 3KEIA 2D5WA 5DEXB 4FE8A 3SEUA 3IB1A 5TPAB 2DE4A 3O2AA 3V8XB 1LB8A 5KCJB 1SQYA 2Z8DA 1O7TA 1DTZA 3VV5A 2QSXA 3FVKA 4F1VA 3JV9A 3QSLA 1YTVA 4YMAA 3UA8A 1US5A 4ZE8A 1B1XA 3KJTA 2D21A 4NWDA 4P11A 3TODA 3LSXA 3H03A 4THIA 2F34A 3S4UA 4BDOA 2H4IA 4YB5A 3TAJA 1B0HA 3FVGA 3QIMA 1P99A 5CI5A 1XVYA 2XXPA 4GOTA 3S9EA 3RGYA 3K4UA 4Q30B 3Q26A 1B1HA 3MWBA 3PV0E 2QS3A 3H6TA 1BLFA 2ANJA 4R72A 4KQPA 5KDTB 5DVFA 3TYHA 1QUKA 2NWJA 2Q89A 4BDQA 1B05A 5AA2B 3IORA 3TCHA 3ZKLA 3B6WA 2DP8A 5CMKA 1MXWA 3EHSA 4NTLA 4EQBA 4WKMA 3GBAA 2P2AA 3N5LA 4BDMA 5A5XB 4QSCA 2RINA 4YKKA 3SEXA 3SEVA 3UORA 2ZNSA 1UIVA 4H5GA 3V83A 3OEKA 2IA4A 4RXLA 3MAMA 2PVUA 5DEXA 1QULA 3RQTA 3SEYA 3K01A 4GXSB 2Q88A 3H06B 3N6UA 3ZKKA 3MZBA 4NF6B 4LUBA 5H8FB 1FQFA 3HSTA 1FTMA 3H4ZA 3GBBA 1LAGE 5AA4A 1N7WA 2HAUA 3QK6A 4R9GA 1NH7A 2OJTA 1NH8A 5DTBA 2ZMBA 4HCYA 3JZJA 3K1PA 1MM7A 4ESXA 1XHYA 4DCXA 5H8NB 3KOTA 3MZ1A 1LFIA 1AH5A 1M5BA 2RF1A 3IOVA 3PU5A 3OD7A 1MQDA 1SD3A 4LVQA 4EXLA 1HSEA 1OLCA 1PB7A 4XIGQ 1VSOA 1NNTA 1PDAA 3U72A 4EXKA 5I56B 4NF4A 4PP0A 4NF8B 2ONSA 4LQ2A 2OZZA 4PE5B 3K0VA 4YB7A 1P1QA 1ZTYA 2Y7RA 3K6VA 4MFIA 4NMYA 3PUXE 4KR5A 2I48A 4ZEFA 2GHBA 2DSFA 3OELA 2XX8A 3EHTA 1URSA 3PD8A 4HCWA 4C1TA 2O51A 1BKAA 1RYXA 3TTMA 4OFLA 2DOJA 3KN3A 3O28A 1ZJLA 1I69A 3BFTA 1IXGA 1UTHA 1ZBMA 4KCCA 4RK2A 1QKBA 3H6WA 2YPNA 3R26A 4NF5B 5TU0A 3RTWB 3PUZE 4FECA 2OLBA 3C36A 3K00A 4KYSA 4YKJA 4FORA 3FV2A 1ZLQA 3E3KA 3MP1A 4GLIA 4ECFA 3MBPA 3W9VA 5J1DA 3PUYE 3S9NC 3K6UA 4ZEKA 1N04A 2ZXTA 3MZ9A 2O1LA 2XXWA 1JEUA 3LC8A 4NF6A 1NFTA 3U93A 2I49A 4YAHX 1SI0A 2NVUB 2UVIA 3K02A 3OMBA 1TT1A 4H67A 3E9XA 4DXBA 4RPNA 5I58A 4QF9A 1EZOA 3OEMA 1A54A 5CMMA 3ILUB 3ZS6A 3I3VA 4YMBA 1QUJA 1B2HA 2H9BA 3C34A 1HSJA 3CFXA 4XTCQ 5CMCA 1S50A 3MC2A 1LCFA 4ZZEA 2Q9TA 4PQJA 4DCYA 2I3WA 2V93A 2XXHA 1OQHA 2PT2A 2QS4A 1IXCA 3UP9A 4F22A 4NF4B 5CBSA 1B58A 2GRVA 4N07A 1PBPA 4IY6A 4PFWA 4AB5A 4IB2A 3TMGA 1LFGA 1P1WA 1ZKBA 2H98A 2H99A 2I3VA 3HPIA 3V89B 3PPQA 1A8EA 1JETA 2F36A 1Z7NE 3HHGA 3R6UA 1A40A 4ISUA 4ESWA 1Y4TA 4ELOA 3PUVE 4JDFA 4DE8A 2H5YA 4GXAA 5CRYA 2UYFA 3O29A 1FQEA 2QL3A 3CR9A 3G3IA 3HHFA 5EYFA 1B3FA 4LZ8A 2HXWA 1LLSA 2E1SA 1NNFA 5AA1A 2RC8A 1SI1A 2GHAA 4G2ZA 5I2NB 5HM4B 4ZZAA 1B6HA 1MXUA 5LOMA 3K6WA 1UTBB 1CE2A 2R9JA 2Z8EA 3BBRA 3FVOA 3OENA 4GIZA 4TLLB 1B3HA 1B52A 3A09A 3EPEA 3Q27A 4ZEBA 3THIA 4ZE9A 5I2KA 5DVIA 4U23A 1Y9UA 1JVYA 2ESNA 4NWCA 3V5AA 5AE4A 5I56A 5KCJA 4DLDA 4HTGA 1I6BA 1SW5A 2XHDA 2XX7A 2HZLA 2R71A 2XXIA 3FXQA 1JNFA 2XD3A 2XXTA 4IO3A 1AOVA 4XKNA 1O64A 1ZIUA 3RT6B 1POY1 4OQOA 3O97A 2PBWA 2ZNTA 1LSTA 4G68B 3H6UA 5ITPA 3B6QA 4ZEDA 4QFOA 2AL4A 1S9TA 2NXOA 3KN7A 2F6GA 4TQUQ 2QS2A 3ZSFA 4Q5TA 3E4RA 3TDJA 3QXMA 4R2FA 4KPTA 4POWA 3FATA 4H5FA 1BTJA 5TPAA 1FCKA 2Y7PA 1MPDA 3UGWA 1USYH 4TLMB 3VVEA 1LCTA 5F1QA 2G29A 3CFZA 3LSLA 2DWIA 1B7UA 1MXZA 1MXYA 1MPBA 4RJZA 3LSWA 3HO7A 3MVWA 3PD9A 2REJA 3PMWA 5F7VA 1FTLA 3D4CA 1LB9A 4ONYA 1R9QA 1B5IA 2VOZA 2NOOA 3TQLA 3FD3A 1B3EA 3G7WA 4OWDA 3PUWE 2V25A 2DWAA 4LONB 3LSFB 4WXJA 2CMOA 3TTKA 3Q28A 4IGTA 2VP1A 4TOZA 1XC1A 3SEWA 1EH3A 1SVXB 3C9HA 4JXIA 2YJPA 5H8HB 4OXVA 1FQAA 3CI8A 3KBRA 4XKRA 4X1DA 3TFLA 2ZYOA 3C31A 3S9LC 2DWHA 3FJ7A 2DE3A 3W15C 3M3LA 3FV1A 4N13A 3MVYA 4RNSA 1URGA 3H3GA 3FASA 2QPQA 3EHUA 3O9PA 5H8QA 4IY5A 1QW0A 1SW4A 1ZU0A 4XKPA 1H44A 1B3GA 1N3XA 2O6AA 3RLFE 1SBPA 3FJMA 1NKXA 2Z23A 1H45A 1SW2A 3D4GA 5FHOA 5B7DA 3G3FA 4KYEA 1PEBA 3LUYA 3RN8A 5M2VA 4DZ1A 5BUUA 1GV8A 1RKMA 3B6TA 3OXNA 3OSRA 4NF8A 1WODA 4ZEIA 3PPRA 4MBPA 5DT6A 3G3JA 1POTA 3FIRA 3P7IA 1H76A 2Y7IA 1D3KA 1N76A 1YCJA 3A3CA 1SYIA 1MH3A 3K1NA 4PETA 5TP9A 1B4HA 1FQCA 3SDFA 2Q8JA 1MH4A 3DLNA 4Z7EA 1SDXA 4F3SA 1XT8A 3ILTB 4H8JA 4OFJA 1Q1KA 3OOAA 5AA2D 3G3HA 3HN0A 1B46A 1Y3NA 3CRBA 5B70A 4R75A 3N94A 1NMUA 5HBCA 4I8CA 2F7CA 1Z7ME 2THIA 3S9MC 3FZVA 4G4PA 3MP8A 4QSDA 2QJEA 3W9WA 3TCGA 3UN6A 1FTOA 4YKPA 4M4GA 4EUOA 1DPEA 3OO8A 1EZPA 1AIVA 3MJNA 2ZYMA 1TWYA 2REGA 3S2VA 3IAZA 1Y4CA 2HZKA 4DIGA 4LP2B 2ZYNA 1YAEA 4OZ9A 1MDP1 1Y1MA 4R6HA 3TQWA 3I5OA 5L8DA 1N3WA 4I1DA 1NNKA 1MM6A 3T9VA 1BIYA 4EF2A 3VXBA 2B65A 1VE4A 2XXQA 2DQVA 2ONRA 4UA8A 1PB9A 4KHZE 2VD2A 2D3IA 5EHSA 1IXHA 3RY3A 3IJOB 2O84X 3TCFA 4U2RA 1GVCA 5JEIA 4EF1A 1M5FA 3U1OA 4JSOA 4R6KA 1MY0A 3TELA 4FEBA 1ANFA 4LA9A 2DWJA 2VD3A 1N0TA 1JW5A 3PMVA 4KCDA 1S7YA 4M1VA 2XXYA 2A5TA 1B32A 2NUVA 2Y7KA 4IO4A 1WVJA 1XS5A 2HAVA 2VGQA 2HFBA 4OENA 5CC2A 4LATA 4EQ7A 2FNCA 2I4BA 1DPPA 4ND9A 3EQ1A 1BP5A 3RNNA 4ZECA 4OTEA 2AL5A 4GWOA 2YLNA 5AA3A 1MY3A 3GLBA 2PT1A 1IIWA 3K6XA 1UTBA 1B7HA 3MQ9A 2PMSA 4ZS9A 2HCAA 3KSJA 3IOWA 3T9HB 1A55A 3TEPA 1D4NA 4LZ7A 1URDA 1LBCA 2RC7A 5ICQA 2I0CA 2O7IA 1R6ZA 3O6GA 4P0GA 2X7QA 3MVZA 2RKMA 3QUJA 4WEDA 3IK6B 2G93A 3CVGA 4KFQA 3RPWA 1II5A 1IUDA 2FA7A 4RK9A 1JEVA 3OO9A 1NL5A 3IX1A 4AB6A 3TTNA 2X26A 1EZ9A 4G8NA 3WAFA 3I6VA 1QUIA 1FQBA 1YPNA 1ELJA 2V3TA 3ECRA 2QMXA 5H8HA 3T96B 3MUQA 1MY2A 1JQFA 4DDDA 3G3KA 4RPOA 3LR1A 4DXCA 3M8UA 4C0RA 3FVNA 2QS1A 1AL3A 3CSGA 3L6GA 2Y7WA 2F7BA 2HEUA 4MF3A 1TFAA 4G77A 4JWXA 2Z22A 3L6HA 4KYDA 4JB7A 5CBRA 5L9OA 1A99A 3O6HA 3PMXA 4OESA 5H8FA 1GR2A 3H6VA 4IGRA 3FXUA 2UVHA 3MVXA 2OK2A 2I58A 3ODBA 4UACA 3TTLA 1R9LA 2HQ0A 4L17A 3U92A 3FXRA 4BDLA 2GH9A 1D9YA 4YZZA 4F29A 1DOTA 2XXXA 3C4MA 1VFDA 3CG3A 2XD2A 4G68A 4OFOA 4OVJA 1MDQA 1JVXA 1DMBA 4U4XA 1B5JA 5K2YA 4GFRA 2V3UA 3CSBA 3T22A 4KI0E 1L5TA 4IO7A 4ZDMA 2F7AA 4IO5A 2XXVA 3IR1A 3KZGA 3TKDA 3SKPA 1J1NA 2M8CA 3DP8A 1LFHA 3B7DA 1MXXA 1MQIA 1MY1A 2I0BA 1OMPA 2Y84A 3Q29A 3CG1A 3KSXA 1QJMA 5FTHA 3RT8A 4PFUA 3KGCA 5I58B 2F6PA 3SETA 1Y1ZA 4U4SA 2OBGA 4F1YA 5K2XA 2RCBA 3CFLA 3DELB 4E0XA 2Z8FA 3G3GA 1LAHE 3PPPA 4QFNA 2QMWA 4RA1A 4U1ZA 3M3KA 4H65A 3RTFB 1IQ7A 4GRKA 2O68A 4QFLA 3VXCA 2DS9A 5I57A 1B4ZA 1MRPA 2H25A 3TUSA 4GQOA 2OCUA 3LBSA 1LAFE 1AMFA 4X48A 2W7YA 3KN8A 2OWSA 3DP4A 5JK4A 4YU0A 4FAJA 3U8QA 3F11A 3VLUA 5I59B 3MPLA 3VVFA 3C32A 4OETA 1FQDA 2B3BA 4AQ4A 1PC3A 3QAXA 2F35A 4H6DA 1IZ1A 1B3LA 2F78A 2IEEA 4BDNA 4G68C 3E13X 3FGSA 3H7MA 3MP6A 1O63A 3R7XA 1QVSA 1OQGA 4YICA 5FTIA 5L9MA 3PPOA 4F3GA 1UQWA 3BKIB 4R73A 4JSDA 1SW1A 3ONMA 4O3BA 1GTKA 4N6PA 5ELVA 3QYTA 4K3FA 3T93B 2F97A 1SYHA 2O1MA 3N6TA 3C35A 1D9VA 3UIFA 3VDFA 2ABHA 3IOTA 5ITOA 3A3UA 1OVTA 4F19A 5AA4B 3IJXB 3SESA 4PFTA 4F2OA 4H0WA 3TZAA 1ZMGA 2ONKE 5KDTA 5CMBA 2DVCA 1US4A 2VHAA 4IO6A 4OMBA 4NE4A 5FHNA 4E0WA 2FYIA 4GL8A 5H8NA 2E0SA 4DXUA 1MQHA 1JW4A 4FEDA 2WKYA 3USDA 3VFJA 5A5XA 1MY4A 2UYEA 2CZLA 4O3AA 4QHQA 5DYHA 3HV1A 5I2NA 3VVDA 1LGBC 4OEUA 2OWTA 4WEPA 5ISUA 4FATA 3KG2A 1ATGA 2I4CA 3KJ7A 3C33A 2X7PA 4XXUA 5I2KB 2F5XA 1B40A 1MQJA 4GF8A 5CM6A 2Q2CA 2A5TB 5DVJA 3K1MA 3MPKA 2AIXA 2RCAA 5IKBA 2V3QA 4RY1A 3WAEA 1GGGA 4F3PA 1OIBA 3T9XB 2AYSA 4OHNA 3GZGA 4EDPA 2A5SA 4F2QA 1HSLA 2O69A 3EF7A 3JYRA 2LAOA 3VLWA 5I84A 3IL1B 1DSNA 3KOSA 1P1OA 1Y3QA 2UXAA 2XXUA 3IB2A 1MG1A 3QUFA 4G8HA 1VFEA 2R6GE 3PGFA 4QFPA 5FHMA 4R74A 5ICTA 1OLAA 3GXAA 4I62A 1T0KA 1N7XA 2Q2AA 1FTJA 4R6YA 3DP6A 2B3FA 2QRYA 1B5HA 3KFMA 5I57B 2F8DA 1P1NA 1B7ZA 1FW0A 1CB6A 1F9BA 2KLFA 2ZYKA 1IITA 1N84A 3T66A 3VE1B 1M5DA 4MH5A 4MLVA 4GD5A 4QFKA 4O3CA 4RYAA 4Q8RA 4ELQA 1Y3PA 4FIMA 3Q25A 5JTYA 1IXIA 3VLVA 4Z0IA 4U1OA 1I6AA 1B51A 3IOUA 3N26A 1MPCA 1NNPA 4IO2A 4POXA 1LAXA 4QRZA 2DXYA 1IEJA 1M5EA 4P0IA 1M5CA 1FTKA 2UVGA 4YB6A 1A7LA 1UTHB 4Q0CA 2ALUA 2V84A 4XKQA 4NF5A 4OERA 3T9UA 3AXFA 1USYE 5TP9B 1TFDA 4HW8A 5BWJA 1B9JA 3PPNA 3TPAA 1TXFA 4BDRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MYUA 3IO4A 3IO6A 4JBZA 1JW1A 5H8SA 1P1UA 1EU8A 2DXRA 2DE2A 1MXVA 4GL0A 4YKIA 3GYYA 1LBWA 2O7UA 4H8IA 3TTRA 2PYYA 4F31B 4I9DA 1OVBA 1MQGA 4I40A 1XVXA 4ELRA 3BFUA 3FUZA 2DVZA 4LQ5A 4C1UA 3OO6A 1B0LA 3OO7A 2QVVA 1DTGA 4FJPA 4JWYA 3KEIA 5DEXB 2Y5LA 3O2AA 3V8XB 2Z8DA 3IFAA 3VV5A 2QSXA 3FVKA 3UA8A 1B1XA 2D21A 3S4UA 3TAJA 1FBHA 3FVGA 3QIMA 5EQAA 3TYHA 1QUKA 4BDQA 1B05A 3TCHA 4PBQA 4NTLA 2JJKA 2P2AA 2RINA 2ZNSA 1UIVA 3MAMA 2ZZXA 4GXSB 3H06B 4LUBA 1NUWA 1NH7A 1IMFA 2ZMBA 4HCYA 4DCXA 5H8NB 3MZ1A 1SD3A 1TFDA 1NNTA 5I56B 1FJ6A 4NF4A 4NF8B 2ONSA 5LTCA 3K6VA 4KR5A 4ZEFA 2XX8A 2DOJA 1ZJLA 4AQ4A 5TU0A 1QKBA 3PUZE 2OLBA 3K00A 4GLIA 3E3KA 3MBPA 5J1DA 3PUYE 3K6UA 1N04A 4G61A 1NFTA 3ISPA 2NVUB 5I58A 1Q9DA 3OEMA 4YMBA 4DCYA 1LCFA 4PQJA 2I3WA 5CBSA 5IZ3B 4IB2A 1LFGA 2H98A 3ROJA 3HPIA 2XWVA 2V4CA 1A8EA 3PPQA 1A40A 4GWXA 1Y4TA 1FQEA 3CR9A 3G3IA 4I3EA 5AA1A 1LLSA 5I2NB 5HM4B 3K6WA 4YMAA 1CE2A 3OENA 4ZE9A 1BK4A 5DVIA 1Y9UA 2ESNA 3V5AA 5AE4A 4DLDA 4HTGA 1SW5A 1YYZA 1JNFA 2XD3A 4IO3A 1ZIUA 1NV6A 2PBWA 4G68B 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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