1FQBA

Structure of maltotriotol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA01
3THIA 4WEPA 1M5BA 4GFRA 4EF2A 4NF5B 2NOOA 3BFTA 2P0SA 2A5TA 1UIUA 3EN3A 1QVSA 4M1VA 1H45A 3LSWA 1SBPA 1UTHB 3VV5A 1SI1A 2UVGA 3HHGA 4IY6A 4DXBA 3O29A 1JVXA 4RNSA 1USYH 1B3GA 3GBBA 5CM6A 4GOTA 4GVOA 4ESXA 2QS4A 3KJTA 1IQ7A 2ONKE 3S9NC 4MLVA 1B32A 5I56A 3FXRA 3QUJA 4KYEA 4DDDA 5CC2A 3OEMA 1N7WA 4BDQA 2I3VA 4LVQA 1XVYA 1MXVA 1SDXA 2R71A 3A09A 4X1BA 3RPWA 2DE4A 4R9FA 3CVGA 1UTBA 4LQ5A 4OFOA 1QKAA 2XX9A 1NKXA 1FQDA 4YKPA 2UXAA 4KFQA 4QFKA 2HAUA 3JZJA 4NE4A 1H76A 4BDLA 1MDQA 1UQWA 1TFDA 1D3KA 2OWTA 4R74A 2B65A 1NFTA 3BBRA 3K02A 1B2HA 5DT6A 4FIMA 1UTHA 4NF8B 3U1OA 3ZSFA 5DVFA 4Z0IA 3MC2A 3TMGA 1M5FA 5CMKA 4C0RA 3QSLA 1MQIA 4FJPA 5H8NB 4OTEA 3N6TA 2PX1A 3CFLA 2RC8A 2XXQA 1JNFA 2D5WA 4OVJA 4BDOA 1ATGA 3B6TA 5I59A 4G77A 1VSOA 4RK9A 4R2FA 3A3CA 2XXXA 3DM0A 5JEIA 4G4PA 4EF1A 3K00A 3WAEA 2XXPA 3K4UA 1T0KA 3DP8A 1HSLA 3G3HA 3ODBA 3EHUA 2DWAA 3KSJA 1B51A 4ZE9A 2RC9A 4EXKA 4YICA 4EXLA 4HTGA 1Q35A 4IO5A 4F1UA 4F22A 3SESA 1I6QA 4JWYA 2XXRA 3EHTA 3M3KA 3SDFA 5BWJA 3TEPA 2ZYNA 1B4ZA 2Y7KA 3F11A 4PFUA 1O64A 3IO6A 5ELVA 2REJA 1H3DA 3N94A 3H6TA 4QFOA 2IEEA 4KHZE 4FEBA 4U23A 5I58A 3R6UA 2QS2A 4ZECA 3TODA 1P1OA 4YZZA 1POY1 1N76A 4U4XA 4NF8A 2F7BA 2HAVA 2H9BA 3Q28A 1IXHA 1CE2A 4QF9A 3LSLA 1Y3NA 4GXSB 1OMPA 4PE5B 2ABHA 3FZVA 2I0CA 1MXXA 2AYSA 5H8FB 3TAJA 3S9EA 3IB2A 3VLWA 4DCXA 1FCKA 3ECRA 2V3TA 1B1XA 1ZKBA 1AOVA 4QFLA 2HXWA 2WKYA 3T93B 3TTLA 1URSA 3FGSA 2Q89A 1N84A 1N3XA 1B05A 4H8JA 4F3PA 5F1QA 3O9PA 4H67A 3U94A 5IAIA 3ILUB 3H6VA 4NF4A 3IOWA 3VVFA 1LFIA 5TU0A 4NF6B 1SD3A 1BIYA 2F34A 1JW1A 3VXCA 3T96B 2NUVA 3MAMA 5AA3A 4YMAA 1MQGA 1US5A 2I4CA 3IOTA 1DTZA 3USDA 4YB5A 3Q25A 2O69A 3VE1B 4XKRA 5K2YA 4X1DA 1TWYA 3W9WA 3KFMA 5FHOA 1MXZA 3FXUA 4GXAA 3FJ7A 2VOZA 4KPTA 2FYIA 2O7IA 3IB0A 1MQDA 1M5CA 3VFJA 1OLAA 2O6AA 3C32A 1LB8A 3QK6A 2O68A 4O3BA 1MDP1 3TUSA 4H5GA 2Z22A 3T9UA 3UIFA 3W9VA 3S4UA 3OENA 4PP0A 4EQ7A 4OZ9A 1FTMA 3K0VA 4F3SA 2DP8A 3N6UA 2HQ0A 3EQ1A 2VHAA 3KSXA 3CFZA 1B0LA 3TCHA 5I2NB 3TDJA 4OXVA 5DVIA 4MBPA 3VVEA 1BKAA 1SW1A 4ELRA 4NF6A 4G68B 4FEDA 3FJGA 3R7XA 3HCQA 5DEXB 1P1UA 4OQOA 1R1NA 3RTFB 5I57B 3TFLA 2DE2A 4HW8A 5JK4A 4HS7A 1POTA 1JW5A 1OVBA 3OEKA 1MQJA 1NL5A 1IUDA 3UP9A 2F97A 3UA8A 2DWHA 4IO2A 4PQJA 3FUZA 4G8NA 1B6HA 4YKJA 2XXWA 2CMOA 5LOMA 3PD9A 2I48A 4G8HA 4OMBA 3DP6A 3K6WA 4KYSA 5DYHA 3K2DA 2B3FA 5CMBA 4C1UA 1LLSA 1OLCA 4IO4A 1FQFA 2V84A 3C36A 1LBBA 2F8DA 2ONRA 5B7DA 4ZS9A 3TCFA 4POXA 3SEUA 3VDFA 5B70A 3HO7A 1A40A 3PMXA 2F7AA 2XX7A 2IA4A 1D4NA 1MRPA 4HCYA 3CG1A 1XT8A 4U21A 4PFTA 5I2KA 3HSTA 1M5EA 3KEIA 3E3KA 4DXCA 2F6GA 1S7YA 4NEDA 5I2NA 3QYTA 3DELB 3FD3A 4NMYA 1PC3A 3OSRA 4MF3A 4P11A 5FHNA 4G68A 3RT6B 2PYYA 2F6PA 3K6UA 5L9OA 3P7IA 2XXVA 1B4HA 5ICQA 1Y3PA 5DEXA 3TTKA 2X7PA 1TFAA 3O97A 1AL3A 2W7YA 1B52A 4OERA 1IZ1A 4TQUQ 5J1DA 1VFDA 5TPAB 1FQAA 3AXFA 4RJZA 1B5HA 4OHNA 1FTOA 2XXTA 4U2RA 3T9XB 4EDPA 1YAEA 1LCTA 1PB9A 4Q0CA 2D21A 5KDTA 3R26A 2H98A 4OEUA 4OETA 3PPPA 5AA4A 4JBZA 2RC7A 1US4A 4ZE8A 1XVXA 1A8EA 3ZS6A 3JYRA 2UVHA 4IB2A 2F5XA 3RY3A 3C33A 5H8SA 4QSDA 3TQWA 1MXUA 1JVYA 1QUIA 1VR5A 4ZEIA 4U1ZA 4AQ4A 1H43A 4JWXA 3FV1A 2G29A 3O66A 2QJEA 1B5IA 2P1SA 2O51A 3IJXB 1SVXB 3H3GA 2I58A 4QSEA 2ZNTA 4EQ9A 1LB9A 2ONSA 3Q26A 4G2ZA 1MY3A 4YB7A 2QS3A 3FVNA 1N3WA 2AIXA 3V83A 1FTJA 3OO6A 4FE8A 1QKBA 1PB8A 5AE4A 1LAXA 2V25A 4IO3A 3D4GA 4YU0A 1P1QA 1XOCA 3MZ9A 1JEUA 3LUYA 2ZNSA 4RY1A 1BTJA 1OVTA 2XD2A 5CBRA 1MH4A 1MS7A 1UIVA 1URGA 1GTKA 3EF7A 4ESWA 2ZXTA 4NF5A 2QPQA 1Y3QA 1Y1MA 1B3FA 1PB7A 4R6HA 1ZTYA 3K6XA 4ELPA 2I49A 1IXIA 5H8QB 3TTRA 2F35A 3BFUA 3C31A 3MVXA 3MP8A 1EZPA 4I62A 1DPPA 5AA2D 3GZGA 4OWDA 1DPEA 1QJMA 4X48A 2DE3A 1B9JA 3K1NA 4N07A 4FATA 4H0WA 5BUUA 2XD3A 2E1SA 3RLFE 2H5YA 1MH3A 2Q88A 4QSCA 3TQLA 1NH8A 3QUFA 4GL8A 1OIBA 3RTWB 1NNTA 4OENA 1MY0A 2RINA 4GL0A 3CI8A 3VLUA 1MXWA 1R9LA 4ZZAA 2UYEA 4DIGA 4U4SA 4IY5A 1GR2A 3RNNA 1VE4A 3V5AA 1DOTA 5CBSA 1B7UA 4F29A 4ELQA 1WVJA 2I4BA 2XXYA 2ALUA 3MZBA 4O3CA 4PFWA 3FASA 4RK2A 1P1WA 1P99A 4KCCA 1N0TA 1Z7NE 1OQHA 3MW0A 4JSOA 3I6VA 4LA9A 3E9XA 4F2OA 2D3IA 1B1HA 5FTIA 3L6GA 5H8QA 3H06B 5H8NA 5TP9B 4LZ5A 2E0SA 5A5XB 3SEYA 3BKIB 5HPQA 3JV9A 2Y7PA 3O6HA 3PUZE 1B5JA 1JQFA 4AB5A 2V93A 3K1PA 3PPOA 5H8HB 2QS1A 4F3GA 5DTBA 2LAOA 3PPQA 3O2AA 3A3UA 5EYFA 4R73A 2I6EA 3OO8A 4LONB 4MH5A 4POWA 3K6VA 3G3JA 1S9TA 4AB6A 4KQPA 4KYDA 1OQGA 3PGFA 4R2BA 1MY2A 1B7ZA 2Z8FA 2DSFA 3OD7A 1YPNA 4LP2B 4PETA 1EH3A 2X7QA 4JWOA 3H7MA 3H03A 1VFEA 5I84A 1LCFA 2NXOA 3FIRA 5AA2B 1USYE 4FORA 3C35A 2YJPA 2ZYMA 4R6KA 5KZTA 1IITA 1LGBC 2XHDA 4G68C 3KN8A 3K1MA 1B7HA 3PUWE 2DWIA 3HN0A 1NNKA 1URDA 4JB7A 3RUMA 2UVJA 4O3AA 1IEJA 5A5XA 2HEUA 3KJ7A 3TYHA 1YTVA 4THIA 1B40A 2Z23A 3CRBA 4YKIA 1XS5A 4F3BA 3H4ZA 3HPIA 3I5OA 5H8HA 1R6ZA 3IX1A 5H8FA 3FATA 3SETA 3CR9A 5FTHA 5DVJA 1DSNA 1D9YA 4F39A 2A5SA 3LR1A 2GFEA 1SI0A 3O6GA 4OFLA 3PV0E 3U92A 1LAGE 4RPNA 3B6QA 3PUXE 3TKDA 3C34A 2QMWA 4XIGQ 1S50A 3M3LA 3OSQA 5L9MA 3G3KA 1B58A 2M8CA 3GLBA 1MM6A 2VP1A 2OWSA 5L8DA 3KBRA 1AIVA 2P2AA 3OOAA 4YKKA 1EZOA 1ZIUA 2DS9A 2R9JA 3PMVA 4TLMB 3GBAA 4ZEDA 3L6HA 2VD3A 4F2QA 1GGGA 2GH9A 4F1VA 3LSFB 1Y4CA 3ZKKA 3QAXA 1IXGA 1MG1A 1MQHA 4H65A 1ELJA 1ZLQA 3SKPA 2OCUA 3TTMA 3MPLA 1LAFE 1R9QA 5ITPA 3PMWA 4M4GA 2H99A 3T66A 5ITOA 3MUQA 1LFGA 1ZU0A 5I56B 3IOVA 3QXMA 4IGRA 5CMMA 4C1TA 2R6GE 3G7WA 1KWHA 4LZ8A 2OK2A 1H44A 1AMFA 1WDNA 2G93A 2Y7IA 1IIWA 4EQBA 2UVIA 2HFBA 3IL1B 2F78A 4WEDA 4LUBA 1I6AA 4OYVA 3QIMA 4WKMA 1NNFA 2OJTA 2RF1A 4F1YA 2XXIA 3MQ9A 3MZ1A 2F36A 4P0GA 4F31B 3SEWA 2OZZA 5I57A 4QFNA 3SEVA 1N04A 3O6IA 1NMUA 2VD2A 3S9LC 4DZ1A 1QW0A 4L17A 1RYOA 4U22A 2XXHA 1GV8A 4KR5A 1BLFA 3IK6B 3PUYE 4BDNA 1Y9UA 4HCWA 3T9VA 5IKBA 3ZKLA 3MP6A 3FXQA 2DXYA 4GD5A 2O7UA 4FECA 2BJJX 3ILTB 1MM7A 4OEVA 3OO9A 1A55A 3MJNA 3B6WA 2DQVA 4KD5A 4RPOA 3E13X 3KN7A 4UACA 1O7TA 2RCBA 3VLVA 3MWBA 3CIJA 1CB6A 5I59B 4E0WA 2H25A 2XXUA 4QRZA 1F9BA 1Y4TA 4BDRA 3IO4A 3KG2A 3EHSA 3HHFA 3C4MA 4Q5TA 2V3QA 2DXRA 3FVOA 1Y1ZA 3IR1A 1MPDA 1Z7ME 4N6PA 2PVUA 4BDMA 1MY1A 1L5TA 3IJOB 1ZMGA 2QL3A 3K01A 2PMSA 5ISUA 4BLAA 4H1XA 4IO6A 1LFHA 1ZJLA 3RGYA 5TPAA 1ANFA 2Q2CA 4H5FA 3V89B 3G3FA 2Z8DA 3LSXA 3CG3A 4TOZA 5JTYB 5KCJB 4Z7EA 2Y7RA 3MVYA 4F19A 2GHBA 4KCDA 5I58B 3RQTA 4Q30B 1PEBA 4ISUA 4DCYA 1QUJA 4YB6A 5AA1A 3FVGA 1QUKA 4RXLA 3TELA 3DP4A 2RCAA 1LSTA 3KZGA 2YPNA 3T9HB 2DVZA 1FTLA 1NH7A 3KOTA 1HSJA 2Y7WA 4MLQA 3I3VA 1JEVA 3LBSA 4R72A 1RYXA 4MFIA 2ZYKA 1B3HA 3HV1A 1JETA 2V3UA 3IAZA 2QSXA 4ONYA 4ZZEA 3MBPA 3IB1A 3PPRA 4OESA 4GLIA 3OELA 1MPCA 4I8CA 2ESNA 4GQOA 2PBWA 4PFYA 1LBCA 5HBCA 3UGWA 4U1OA 3O28A 1NNPA 4NF4B 3N26A 2GHAA 3UORA 4YMBA 1B3LA 3N5LA 2NVUB 4R6YA 1B0HA 3U8QA 5JTYA 2X26A 5KCJA 2THIA 2ZYOA 4RYAA 4X9TA 3B7DA 1J1NA 1LAHE 5HM4B 2REGA 3Q27A 3OMBA 4JSDA 2AL5A 4E0XA 5EHSA 4DXUA 4H6DA 1MPBA 2UYFA 3KOSA 3S2VA 4ND9A 3ONMA 1FW0A 4XKPA 3RT8A 5FHMA 2DVCA 1ZBMA 5L9SA 2B3BA 4K3FA 1GVCA 1RKMA 3PU5A 3G3IA 4GRKA 1SW5A 4GF8A 3PPNA 4NWDA 3M3FA 2CZLA 3KGCA 3KN3A 1FQCA 3CFXA 3H6UA 3OO7A 1A54A 3U93A 1SW4A 2ANJA 3TTNA 4GIZA 4ZDMA 2RKMA 1YCJA 3E4RA 3OXNA 1D9VA 2Q8JA 1PBQA 1PDAA 3C9HA 4EUOA 3FV2A 4ZEBA 1EU8A 4UA8A 4RA1A 3Q29A 1A99A 4DLDA 4IGTA 5CRYA 1I6BA 3TCGA 2AL4A 5F7VA 1MY4A 2Q9TA 3EPEA 1P1NA 1XC1A 2OBGA 1B46A 1DTGA 5K2XA 4F18A 4Q8RA 4N13A 4ZEFA 1Q1KA 1AH5A 1Y20A 5TP9A 4P0IA 3T22A 5CMCA 4YAHX 2I0BA 2NWJA 2PT1A 2FA7A 4KI0E 4JDFA 4NTLA 3MVZA 3UK4A 3FVKA 2DWJA 2GRVA 1A7LA 3CSGA 1TT1A 2KLFA 3LC8A 4H8IA 3IORA 1XHYA 3D4CA 5EHMA 4QFPA 3M8UA 1SW2A 4QHQA 1EZ9A 2DOJA 2DYXA 2FNCA 4DE8A 2O84X 4R75A 4I1DA 3WAFA 3FJMA 2Q2AA 1DMBA 3PUVE 1PBPA 3CSBA 4XXUA 3W15C 4IO7A 1I69A 4LQ2A 3GXAA 5I2KB 2O1LA 3VXBA 3VVDA 1FQBA 1M5DA 1N7XA 3V8XB 3UN6A 4OFJA 5AA2A 1FTKA 2I3WA 2HZKA 1SQYA 4XKQA 2QMXA 4R9GA 2OLBA 1MXYA 2Y84A 2O1MA 1WODA 4LZ7A 2ZNUA 2YLNA 2Z8EA 3PD8A 3TZAA 2QRYA 3RN8A 4TLLB 2A5TB 1HSEA 2PT2A 4JXIA 1SYIA 3G3GA 1FQEA 3SERA 3TPAA 5KDTB 2HCAA 2VGQA 3MP1A 3U72A 2ZMBA 4ECFA 1O63A 5AA4B 4I9DA 4XTCQ 4NWCA 4FAJA 5ICTA 1SYHA 3S9MC 3MVWA 1JW4A 4GWOA 4LATA 1B3EA 5CI5A 4WXJA 2HZLA 4ELOA 5M2VA 1BP5A 3H6WA 3DLNA 2F7CA 1A8FA 2XX8A 1UTBB 2H4IA 4XKNA 1TXFA 1II5A 3MPKA 1QULA 4G8MA 4ZEKA 3IOUA 1IXCA 3SEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THIA 4WEPA 1M5BA 4GFRA 4EF2A 1QGXA 4NF5B 2NOOA 3BFTA 2P0SA 2A5TA 1UIUA 3EN3A 1QVSA 4M1VA 1H45A 3D1RA 3LSWA 1SBPA 1UTHB 3VV5A 1SI1A 2UVGA 3HHGA 1YYZA 4IY6A 4DXBA 3O29A 1NUYA 1JVXA 4RNSA 1USYH 1B3GA 3GBBA 5CM6A 4GOTA 4N81A 4GVOA 4ESXA 2QS4A 2QFLA 3KJTA 1IQ7A 2ONKE 3S9NC 4MLVA 1B32A 4NG7A 5I56A 3FXRA 3QUJA 4KYEA 2CZHA 4DDDA 5CC2A 3OEMA 1N7WA 5EYHA 2B4LA 4BDQA 2I3VA 4LVQA 1XVYA 1MXVA 5IZ1A 1SDXA 2R71A 3A09A 1K9YA 4X1BA 3RPWA 2DE4A 1NV1A 4MAGA 4R9FA 3CVGA 1UTBA 4LQ5A 5IZ3A 4OFOA 2KR0A 1QKAA 2XX9A 1NKXA 1FQDA 4NHBA 5LDZA 4YKPA 2UXAA 4KFQA 4QFKA 2HAUA 3JZJA 4NE4A 1H76A 4O94A 4BDLA 1MDQA 1UQWA 1TFDA 1D3KA 2OWTA 4R74A 4N15A 2B65A 1NFTA 3BBRA 3K02A 1B2HA 5DT6A 4FIMA 1UTHA 4NF8B 3U1OA 2ZZWA 3ZSFA 5DVFA 4Z0IA 3MC2A 2CZIA 3TMGA 1M5FA 5CMKA 4C0RA 3QSLA 1MQIA 4FJPA 5H8NB 2OX3A 4OTEA 2PFZA 3N6TA 2PX1A 3CFLA 1EYKA 2RC8A 4X8RA 2XXQA 4GBVA 1JNFA 2D5WA 4OVJA 4BDOA 1ATGA 3B6TA 4FBPA 5I59A 1FPLA 1VSOA 4G77A 4RK9A 4R2FA 3A3CA 2XXXA 3DM0A 5JEIA 4G4PA 4EF1A 3K00A 3WAEA 2OWZA 2XXPA 3K4UA 1T0KA 3DP8A 1FBCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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