1FQBA

Structure of maltotriotol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA01
3CR9A 1D9VA 3CG1A 3MZBA 5CRYA 5JK4A 1LCTA 1N04A 2Z22A 4OVJA 3ILUB 2R9JA 3Q28A 2HAUA 4OFOA 1II5A 1OLAA 4RK2A 5HM4B 4R9FA 5AA2D 2H9BA 1UQWA 3DELB 1VSOA 1TFDA 3F11A 2DOJA 1SW4A 2HEUA 1B7HA 5TU0A 3UORA 4R73A 4F3GA 3JYRA 4OQOA 5L9MA 2Y7RA 1OIBA 4RNSA 4DCXA 4OESA 2ZNTA 4PFWA 4Z0IA 3RTFB 3KOTA 1WVJA 4G8NA 4R74A 4YICA 3CSBA 5I59A 1UTHA 3FIRA 1IXCA 3CFLA 2X7PA 4F39A 5H8QA 2NWJA 2HFBA 1Y4TA 5I2NB 5F7VA 5DTBA 3MC2A 3CIJA 1B7ZA 4PETA 2F34A 5ICQA 3OO8A 4EDPA 1JETA 1QULA 1NL5A 2ZNUA 5EHSA 1B3HA 1D3KA 1MRPA 2HQ0A 2I0CA 1TWYA 3VDFA 3C36A 3HN0A 4U21A 2Y7PA 4POWA 5H8NA 3B6WA 2ZYKA 4HCWA 1QUJA 3EN3A 3CG3A 2NXOA 2DXYA 1BKAA 4ZEDA 5AA3A 5FHMA 3LSFB 4NF4B 4KHZE 2V25A 3JZJA 3S9NC 4MH5A 3S2VA 3TAJA 4GIZA 3FUZA 4GFRA 1QW0A 3D4GA 3TODA 3H6UA 3CFZA 1DOTA 3PMXA 1S7YA 3LUYA 3TYHA 3G3JA 4IGRA 4EXKA 3IAZA 1M5EA 2B3BA 4R2BA 2W7YA 2FA7A 1MH4A 3FD3A 5AA4A 1MXUA 3FZVA 3H4ZA 3QUFA 2GH9A 4F31B 4LQ2A 4QSEA 4EQ9A 3S9LC 5I57A 1ZMGA 1XOCA 1YPNA 3ODBA 1ELJA 2X26A 2I49A 2ABHA 2D21A 5M2VA 1NNPA 1A7LA 4DXCA 1F9BA 4X9TA 3R7XA 4C1TA 5DVJA 1OLCA 4YAHX 3HO7A 4I8CA 4R2FA 1PDAA 4WEPA 3PPRA 3QYTA 1MG1A 4NE4A 3O28A 4KYEA 4OTEA 4GD5A 2O68A 3C31A 4FEDA 2XXWA 1MQHA 2Z8EA 4LUBA 3QUJA 3OSQA 4QFLA 4H1XA 1M5BA 4PFTA 4KPTA 4FE8A 4F2OA 3TMGA 4IGTA 1NNKA 1MXVA 2F7AA 1JQFA 3IOVA 3TCFA 2RC8A 4NF5B 3GZGA 1B1XA 3MW0A 4M1VA 3T66A 1B2HA 1H43A 3VXBA 2I4BA 3T9XB 3CI8A 1WDNA 5HPQA 4MBPA 4LP2B 4TQUQ 4LQ5A 3OMBA 5DVFA 3SKPA 3CSGA 1LFHA 4GOTA 2ZYOA 3T9HB 5H8FB 5FTHA 3VFJA 2CMOA 4E0WA 2QS2A 1EU8A 1MY3A 2H4IA 3QIMA 1B3FA 4LZ8A 3MVXA 4OYVA 5DYHA 3FVNA 4N07A 3BFUA 3SEXA 2QS3A 3O6IA 1RYOA 2DE3A 3DLNA 4K3FA 1IXGA 1IXIA 2NOOA 1N3XA 1JW5A 5A5XB 4U2RA 5FTIA 4GVOA 1GTKA 1ZU0A 2PVUA 1QUKA 3MVYA 1A55A 3A09A 1LAXA 3KN3A 3B7DA 3PPOA 4YU0A 1IXHA 3TEPA 3OENA 1D4NA 3PUYE 3G3GA 3IX1A 3CFXA 3DP8A 5ISUA 4ZE9A 1VE4A 2VGQA 5TP9A 2GRVA 1DPEA 5CBSA 3PU5A 1P1WA 5B7DA 2YPNA 3KJ7A 1PB9A 4QFNA 5DVIA 1YAEA 1HSEA 1XC1A 4JXIA 2QS1A 1N76A 1AMFA 1MH3A 2Y7KA 2RCAA 5KCJA 2DYXA 4QSCA 3MP1A 5HBCA 4NMYA 1JNFA 3IB2A 4ZEIA 3IL1B 5LOMA 2UVJA 3G3HA 1Y3PA 2KLFA 1B40A 1S50A 1MDP1 1DPPA 3EHUA 1OVTA 1XS5A 1B7UA 4OXVA 3VVDA 4IO6A 5ICTA 1LGBC 2DE4A 2XXTA 3VLUA 4ZZAA 4C0RA 5BUUA 4YMBA 2OZZA 3LBSA 5ITPA 1A40A 4FATA 1Y1ZA 1SW2A 1HSJA 3I3VA 2B65A 1MXYA 5L9OA 2RC9A 3TZAA 3VLWA 2O84X 2RC7A 3H6TA 3EQ1A 3FJGA 1URGA 2XD3A 4QRZA 4RPOA 1P1OA 4BDRA 1B32A 4QSDA 3EHSA 1I6BA 2XX9A 2THIA 4ZEBA 4U1ZA 3S9EA 2DSFA 3V89B 4ZZEA 3MAMA 3IOWA 5TPAB 4R72A 3LR1A 3W9WA 3Q26A 4DCYA 4POXA 2DWAA 4F19A 1H45A 3WAFA 3MBPA 3H7MA 3KSXA 2GHAA 5H8HA 4FORA 1ZKBA 2B3FA 2H99A 1MXXA 3PUZE 2FYIA 2Y84A 2FNCA 4QFPA 4G68A 2DQVA 3A3UA 2O69A 4JDFA 4IY6A 3HHFA 1P1QA 1MQIA 1B3LA 2Q2AA 1QJMA 5CC2A 4F18A 3PPQA 2V3TA 1N7WA 3P7IA 4XKNA 4F3SA 1SI1A 5JTYB 4U4SA 3UGWA 1B4HA 3TFLA 5EYFA 2AYSA 4R75A 3ILTB 5I59B 2DWHA 3SEWA 3RLFE 1P99A 5H8QB 2I4CA 1YCJA 4OEUA 3MPLA 3CVGA 2O6AA 3G3IA 5DEXB 2G93A 2P2AA 4LA9A 2Y7WA 1B0HA 4ONYA 5JEIA 5F1QA 3LSLA 4RA1A 3PUWE 4ZEFA 1PBPA 3M8UA 2I3WA 4LVQA 3C33A 2I6EA 3E3KA 4NTLA 5H8NB 4DXBA 1B5JA 1MM7A 3KZGA 3KJTA 1H44A 1SYHA 4EF1A 2Q8JA 4JWXA 3H03A 3K6XA 3ZS6A 4G77A 3B6QA 2UXAA 2HXWA 4RJZA 1XVYA 4DLDA 3KN7A 4KD5A 5ELVA 3E13X 5IKBA 4ZEKA 2ZMBA 1DSNA 3K1MA 3MWBA 3W15C 3BFTA 3TTNA 2ALUA 2O1MA 1QKBA 1OMPA 2V3UA 2QMXA 3PMWA 1IIWA 1GVCA 3M3KA 3SEVA 3FV1A 4BDOA 5AE4A 1UIVA 2DS9A 4JWOA 3PMVA 3PUXE 3FGSA 3LSXA 4JBZA 2DE2A 5B70A 1POY1 1B0LA 1B05A 1MPBA 5I2NA 2A5TB 2E0SA 2F35A 3K01A 2QL3A 1M5FA 4TOZA 1ATGA 4EQ7A 4G2ZA 1MXZA 3V83A 1TT1A 3R26A 3QAXA 5K2XA 4O3BA 4RY1A 4DZ1A 4XXUA 4F2QA 3FATA 3LSWA 3VVEA 1NH7A 1FQCA 3TELA 4X1DA 2VOZA 4G8HA 1Y1MA 4WXJA 3IB1A 1RYXA 3TTRA 3K2DA 4PFYA 1P1UA 1A99A 4C1UA 3MUQA 4E0XA 3O6HA 1GR2A 1PEBA 3TTLA 4H65A 4ND9A 1QKAA 3IK6B 3TQLA 5H8SA 2DVCA 3O6GA 4GL0A 2QSXA 1B46A 3SESA 4RPNA 2ONKE 3HPIA 4G8MA 3TQWA 2ESNA 3VE1B 1SQYA 4LONB 2F97A 4IO4A 3MPKA 1B58A 1O64A 1AIVA 4XKPA 2DP8A 5BWJA 2G29A 4DXUA 3C34A 3KGCA 3E9XA 4QFOA 2F7BA 2XXPA 2ONSA 1B1HA 3WAEA 2VD2A 4FJPA 3K1PA 1MPCA 2H25A 3TUSA 3EPEA 4G4PA 3SEUA 4YMAA 3RUMA 1ZBMA 3O29A 4PE5B 3H3GA 3PPPA 2OJTA 2GHBA 5J1DA 3PV0E 1N7XA 2VD3A 2HCAA 1B52A 1EZ9A 3H6WA 3MVZA 4RXLA 3SEYA 4HCYA 5CI5A 4H8IA 5CMKA 1EH3A 1I69A 2ONRA 1N0TA 5TP9B 1BIYA 3KG2A 4JSOA 1MY1A 3Q27A 1US4A 1USYE 4YB5A 5I58B 1DTGA 4NF5A 1A8FA 4ESXA 2Q89A 4MFIA 3PUVE 2OWTA 2PT1A 3OO7A 3K02A 3VV5A 3PD9A 3I5OA 4NF6A 1R9QA 4P0GA 1NMUA 2DWIA 5H8FA 3RN8A 2F6GA 4KYDA 2O7UA 4O3CA 2RINA 3C35A 4JSDA 4M4GA 1NFTA 1AOVA 3THIA 4BDMA 5DT6A 5A5XA 3S4UA 3RGYA 5I84A 1MY4A 2PMSA 1Y3QA 5I56B 4ESWA 1QUIA 5AA2A 2O7IA 4R6HA 3E4RA 4GXAA 1SW1A 3MVWA 1AH5A 1LAFE 1RKMA 1MS7A 1Y3NA 2QMWA 3MQ9A 3ZKKA 3K0VA 3ECRA 3V8XB 2D5WA 1SD3A 1NH8A 4AB6A 1ZIUA 1FQDA 1OVBA 3QXMA 2F6PA 3HSTA 3FXQA 1LCFA 3M3LA 3FVKA 2QRYA 3OSRA 3T22A 4NF8B 4JWYA 4YKKA 1BTJA 3MZ9A 2OBGA 1SBPA 3UK4A 2IA4A 2XHDA 5KDTB 3MP8A 1QVSA 4F22A 3K6UA 4WKMA 1ANFA 4PFUA 3KEIA 2XD2A 4NEDA 2R6GE 2F36A 4EXLA 3MZ1A 4H67A 1FQBA 4IB2A 5AA1A 2ZXTA 2UYEA 1Z7NE 4Z7EA 2XXUA 3HV1A 2REJA 1MXWA 1WODA 1IUDA 3OXNA 1B3EA 3RY3A 3CRBA 4DE8A 2UYFA 3T9UA 2RF1A 4IO2A 3KFMA 3B6TA 3DP6A 1XT8A 3TTMA 4KQPA 3UN6A 2XX7A 3RQTA 4KR5A 2AIXA 3K6VA 4OFLA 1LB8A 2F8DA 2V93A 5I2KB 2P0SA 4F3BA 1MM6A 2F5XA 1CB6A 3OD7A 3UA8A 1OQGA 3FXRA 3EHTA 4I9DA 4ZDMA 4UACA 4WEDA 1UTBA 1IITA 1B5IA 1ZJLA 4ELOA 4ZECA 3MJNA 4F1YA 3KSJA 4F29A 3O66A 2OWSA 3I6VA 4KFQA 3Q25A 3KBRA 1XHYA 3PD8A 2IEEA 5I2KA 3G3FA 2E1SA 2Z8FA 3U72A 2O51A 2Q9TA 4ZE8A 4F3PA 3IO4A 3T96B 4IY5A 3RT6B 3TDJA 1TFAA 1JW4A 4IO7A 4BLAA 3L6HA 3BBRA 1M5DA 4OWDA 2NUVA 3QSLA 2HZLA 3KOSA 1FQFA 4DIGA 1LSTA 2F78A 1UTHB 5TPAA 2CZLA 1H76A 3S9MC 3GXAA 3TKDA 3U94A 1US5A 2UVHA 3LC8A 4YZZA 2XXYA 3TPAA 1A8EA 1Q1KA 4YKIA 1P1NA 1DTZA 3U92A 1Y9UA 3T93B 4Q5TA 4R9GA 3C9HA 2D3IA 4OENA 4FEBA 3O97A 1LAGE 2XXIA 3PPNA 2AL4A 2ZNSA 2F7CA 4LATA 2WKYA 3HHGA 4H5GA 4RYAA 4THIA 1CE2A 3IO6A 2DXRA 1BP5A 2XXHA 1Y20A 3RT8A 3M3FA 4G68C 4OEVA 3U1OA 4FAJA 5JTYA 1FTMA 3VVFA 3OELA 1R6ZA 1LBBA 1SVXB 1URSA 1B9JA 1O63A 5IAIA 2H98A 1MY0A 5CMMA 4N6PA 4XIGQ 1SW5A 3SETA 5DEXA 4R6YA 3DP4A 4ZS9A 2BJJX 4GL8A 4ELRA 2I48A 2O1LA 4OMBA 2A5SA 2ANJA 1LAHE 3OEKA 5AA4B 4QFKA 3IB0A 2Q2CA 2NVUB 4BDLA 3OEMA 5I57B 4P0IA 3IOUA 4HW8A 2YLNA 1L5TA 3G7WA 1I6QA 5CMCA 3R6UA 3SERA 4R6KA 4IO3A 4NWDA 3IOTA 1SI0A 1J1NA 2PYYA 2OLBA 3D4CA 4GXSB 4X48A 2V3QA 4KCDA 4P11A 4ELQA 5FHOA 5ITOA 3ZSFA 3IR1A 4Q8RA 2XXQA 3N94A 3VLVA 1D9YA 3K4UA 4H8JA 1JVYA 5K2YA 3C32A 4NWCA 1B4ZA 2M8CA 3O9PA 5CM6A 5L9SA 1NNTA 4XKQA 1FQEA 3K1NA 1T0KA 4ISUA 4TLMB 4KCCA 4F1UA 2XXVA 4FECA 4H0WA 3QK6A 4NF4A 1N84A 4KI0E 3FV2A 3OO9A 4O3AA 2XXXA 3GBBA 4YB6A 3MP6A 2A5TA 4HS7A 4HTGA 4U4XA 4PQJA 4OHNA 4AB5A 1N3WA 2QJEA 2REGA 2XXRA 1B5HA 1JEVA 2XX8A 2ZYMA 3JV9A 3U93A 4BDNA 1MY2A 1FQAA 4FIMA 1VFEA 3N6TA 4XTCQ 2R71A 1R1NA 2Y7IA 5CMBA 2GFEA 3V5AA 2AL5A 3RTWB 3GBAA 2LAOA 4EQBA 3U8QA 2PT2A 3N6UA 4TLLB 4U22A 2Z23A 4EUOA 3VXCA 4NF6B 1FTKA 4IO5A 3T9VA 1PC3A 1PB8A 4QHQA 5L8DA 4YB7A 3OO6A 3FJMA 4GLIA 1TXFA 1SDXA 1Z7ME 1GV8A 1LB9A 1JEUA 4EF2A 2OCUA 4LZ5A 4OERA 3PGFA 3BKIB 1ZTYA 1LFIA 5EHMA 5AA2B 1POTA 1NNFA 1USYH 4I1DA 4GQOA 3W9VA 4YKJA 3TTKA 2I0BA 5KCJB 4ELPA 4QF9A 1PBQA 1ZLQA 1NKXA 1MDQA 4U1OA 2RCBA 1KWHA 4PP0A 4MF3A 1DMBA 3O2AA 1MQJA 2HZKA 3FVGA 2H5YA 1YTVA 3K00A 2DVZA 1OQHA 4Q0CA 5I58A 4JB7A 1URDA 4GWOA 4BDQA 3TCHA 1H3DA 3IORA 5FHNA 3USDA 2ZYNA 3N5LA 1EZOA 1XVXA 3ZKLA 4RK9A 2VHAA 2UVIA 1A54A 4H6DA 1Y4CA 2YJPA 4KYSA 1IEJA 1M5CA 3OOAA 4OETA 3RNNA 2OK2A 4Q30B 1FW0A 4OZ9A 1LLSA 5CBRA 4OFJA 2VP1A 5KZTA 1JW1A 3C4MA 3ONMA 1S9TA 4ECFA 1O7TA 1Q35A 2RKMA 2QPQA 3AXFA 4XKRA 3EF7A 5I56A 2V84A 1AL3A 3UIFA 4X1BA 2Q88A 3IJXB 3UP9A 1HSLA 4LZ7A 1B51A 4UA8A 3TCGA 2HAVA 1UTBB 1B6HA 4L17A 1MQGA 3FASA 3H06B 3HCQA 3SDFA 2P1SA 2UVGA 3FVOA 1MQDA 3N26A 1FTOA 4NF8A 2PX1A 3K6WA 4U23A 5H8HB 1B3GA 2DWJA 1FCKA 3FJ7A 1IQ7A 1MPDA 3A3CA 4I62A 5KDTA 4G68B 1FTJA 3DM0A 4AQ4A 1I6AA 1BLFA 1JVXA 4GF8A 3G3KA 1EZPA 4DDDA 2PBWA 3GLBA 2I3VA 4F1VA 3L6GA 2I58A 3IJOB 2X7QA 1LBCA 2QS4A 3Q29A 4N13A 1LFGA 1SYIA 3H6VA 1PB7A 3RPWA 4H5FA 4GRKA 3FXUA 4MLVA 1FTLA 1GGGA 4YKPA 1IZ1A 1UIUA 3KN8A 1VR5A 2Z8DA 4MLQA 1R9LA 1VFDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CR9A 4GWXA 4N6KA 1D9VA 3CG1A 3MZBA 1LBXA 5CRYA 5JK4A 1LCTA 4NN3A 1N04A 2Z22A 3IFCA 3QMFA 4OVJA 3ILUB 2R9JA 4NF0A 3Q28A 2HAUA 4OFOA 4GWYA 1II5A 1OLAA 4RK2A 5HM4B 4R9FA 5AA2D 2H9BA 1UQWA 3DELB 1VSOA 1TFDA 2CZIA 3F11A 2DOJA 1SW4A 2HEUA 1B7HA 5TU0A 3UORA 4R73A 4F3GA 4JVIA 5IZ3A 1FBCA 3JYRA 4O7MA 4OQOA 5EQ9A 5L9MA 1RDYA 2Y7RA 1OIBA 4NGUA 4RNSA 4DCXA 4OESA 2HHMA 2ZNTA 4PFWA 4Z0IA 3RTFB 3KOTA 2VT5A 1WVJA 4G8NA 4R74A 4YICA 3CSBA 4PAKA 5I59A 1UTHA 3FIRA 1IXCA 3CFLA 2X7PA 4F39A 5H8QA 2NWJA 2HFBA 1Y4TA 5I2NB 5F7VA 5DTBA 3MC2A 3CIJA 1B7ZA 4PETA 2F34A 5ICQA 3OO8A 2WX9A 3GYYA 4EDPA 1NI9A 1JETA 1QULA 1NL5A 2ZNUA 5EHSA 1B3HA 1D3KA 1FPKA 1MRPA 2HQ0A 4QBAA 2I0CA 3BIHA 1TWYA 3VDFA 3C36A 3HN0A 4U21A 2Y7PA 1FSAA 4POWA 5H8NA 3B6WA 2ZYKA 4HCWA 2XXKA 1QUJA 3EN3A 3CG3A 2NXOA 2DXYA 1BKAA 4ZEDA 5AA3A 5FHMA 4P3LA 3LSFB 4NF4B 4KHZE 2V25A 3JZJA 3S9NC 4MH5A 3S2VA 3TAJA 4GIZA 3FUZA 4GFRA 1QW0A 3D4GA 3TODA 3H6UA 3CFZA 1DOTA 3PMXA 1S7YA 4NX1A 4P1LA 3LUYA 3TYHA 3G3JA 4IGRA 4EXKA 5J16A 5EQAA 3IAZA 1M5EA 2B3BA 4R2BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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