1FQBA

Structure of maltotriotol bound to open-form maltodextrin binding protein in p2(1)crystal form
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqbA01
3H03A 4F29A 4DIGA 3ZSFA 1B52A 4OEUA 4X9TA 2HXWA 4QHQA 4ZEBA 4GIZA 1B58A 5CRYA 1AH5A 3K2DA 3PD8A 3H7MA 3TFLA 4PP0A 4EF2A 4NEDA 1ANFA 3I6VA 3OMBA 2RC7A 4DXCA 4Q8RA 4KFQA 1Y1MA 3TMGA 3KN7A 1XC1A 3W9WA 5AA4A 2IEEA 4THIA 3E4RA 4NF4B 4DDDA 4EQ7A 2ONKE 1QUKA 1SI1A 4IO7A 2P1SA 1JEUA 5CMMA 2UVJA 4F3SA 4FJPA 4PETA 4Z7EA 2F35A 2F6PA 2F7BA 1MXZA 1USYH 2V3QA 2H4IA 3IOWA 4KD5A 1D9VA 1S9TA 1MM7A 3HPIA 3VLWA 2O84X 3N6TA 1FQCA 2PBWA 4KYDA 4O3BA 2V84A 4POXA 2PVUA 3KSXA 1Y4TA 3IORA 3MP8A 5H8FB 3SESA 4U21A 4H1XA 2XXTA 3LBSA 3N94A 4ZZEA 5ICTA 1Z7NE 2O6AA 4BDQA 4QSCA 2ZYMA 1RKMA 2OWSA 3CVGA 3N6UA 4ZECA 3FIRA 4PE5B 1B3EA 3L6HA 2GHBA 3IO4A 3HHFA 2F7AA 2THIA 3O6GA 4KI0E 3K6UA 4NWDA 3S9NC 3UA8A 3TEPA 2O1MA 2XXIA 1D4NA 4AB5A 3CG3A 1GGGA 3DLNA 3DP8A 2Y7PA 4EUOA 1MXWA 3WAFA 1B0HA 4NF8B 3KOSA 3N5LA 4OFJA 4G4PA 3UGWA 1LFHA 1NMUA 3USDA 3IOTA 4QSDA 3WAEA 3TTNA 4AB6A 4M1VA 5HM4B 1OVTA 4IO3A 3T96B 1Y3PA 3FXUA 4JSOA 5TPAA 5I57B 2NOOA 4U4XA 5I84A 2RCBA 3TPAA 1OLCA 2Z23A 4YKKA 4WKMA 4ELRA 1UIVA 4NF8A 4KPTA 5DT6A 2I49A 2H5YA 4H5GA 5I56B 1DOTA 4YMAA 1B40A 4R6YA 4O3AA 1GTKA 1WODA 2ALUA 1B1XA 1IZ1A 2GHAA 3CFZA 3T9XB 2Y7KA 4NF5B 2A5TB 3KN8A 2NVUB 2R9JA 4OERA 3A3UA 3PV0E 2UYEA 2DOJA 4GXSB 4NMYA 1ZMGA 5CM6A 3O66A 3UK4A 4F22A 3CFLA 4E0WA 4L17A 4LA9A 1P1NA 2I4BA 2Z8FA 4U4SA 1ZU0A 2DWAA 3BFUA 4OESA 4ZS9A 5L9MA 1SW4A 1QUIA 2O68A 4TLLB 3TTRA 4OQOA 3TZAA 4EF1A 4F31B 3PUZE 2NXOA 3PUYE 4JB7A 4N13A 5DTBA 5HBCA 1NNPA 3MWBA 2XXYA 1Q35A 1B51A 3RN8A 5H8QB 4IO2A 5KCJA 1NFTA 4UACA 4RA1A 3PUWE 1FQDA 4MF3A 3TTLA 4FEBA 1B7HA 1PEBA 1QVSA 3IR1A 4EXKA 3G3IA 3C35A 3G3JA 1LCTA 3H6VA 1MS7A 1B6HA 1TWYA 1P1OA 5CBSA 3OO6A 3KJ7A 4GD5A 3N26A 4ZEDA 3CIJA 3VFJA 4U23A 3F11A 4ZZAA 1OIBA 3K1MA 3K1PA 4ELQA 5HPQA 2AIXA 3FJGA 1SQYA 2I48A 3KBRA 3S9MC 5I59A 3QK6A 1SVXB 3TCFA 4F19A 1Q1KA 1JNFA 3FATA 4HCYA 1URGA 3FD3A 1XT8A 4G8HA 4Q0CA 1MXUA 2XHDA 3EHTA 4FORA 5DEXA 2QS1A 2UYFA 3R7XA 1IQ7A 2QMXA 3RTWB 4DZ1A 3K6WA 4RYAA 3O29A 1LB9A 1TFDA 2D3IA 2H25A 1DPPA 2A5SA 4G77A 1M5DA 5FHNA 2DSFA 3IB1A 4X1BA 1L5TA 2QL3A 2DQVA 2OBGA 1URDA 3KFMA 4K3FA 4KCCA 5TP9A 1VSOA 4HS7A 1NNTA 1OLAA 1SBPA 1AMFA 1MXYA 4XKQA 1D3KA 1OMPA 2F78A 3OSRA 3RT8A 4I1DA 3MP6A 3G3GA 1NH7A 2R71A 2HCAA 1MQHA 2YPNA 1SI0A 1N7XA 2O1LA 3E13X 4ZE8A 5L9OA 1M5CA 1MQJA 5IAIA 5B70A 2GRVA 2O7UA 3H6WA 2Z8DA 4H67A 2PT2A 5B7DA 1Y3NA 4ONYA 1YCJA 3GBAA 5FTHA 1SD3A 4GWOA 4H65A 4NF6B 4YAHX 3U8QA 4BLAA 4QRZA 1SYIA 4KYEA 1DMBA 3TUSA 3JZJA 2A5TA 1TT1A 1A40A 1PB9A 4LQ2A 5I2NA 1OVBA 3RLFE 3THIA 3FVGA 1OQGA 3FZVA 4F1YA 5IKBA 3ZKKA 2W7YA 4H5FA 4NWCA 3EF7A 2Y7IA 4OZ9A 4GF8A 1LBCA 1Y9UA 2XD2A 4NE4A 5H8QA 3S4UA 3RGYA 2HAUA 1N84A 3PUXE 5L8DA 3K00A 1NL5A 4F3PA 5AE4A 5DVIA 3DP4A 3LC8A 4LZ8A 1TXFA 1MDP1 4OVJA 3RY3A 4XIGQ 5A5XB 1A8EA 1FTJA 1RYOA 1I6BA 4NTLA 1XHYA 1B2HA 1NKXA 1XVYA 5EHSA 3C4MA 2DYXA 3MW0A 2XXHA 2OCUA 4ESWA 5CMKA 1N3WA 3CI8A 4MLVA 2AYSA 3E3KA 3ILUB 4I62A 5CC2A 1I6QA 5AA2B 3B6QA 5AA3A 3QXMA 3SEWA 3W15C 3H6UA 2XX7A 1JETA 3CRBA 1H76A 4LZ7A 4R72A 2DWHA 1IITA 1WVJA 1O63A 3ZKLA 2QS4A 3HCQA 3MBPA 4F3GA 3T9VA 2ANJA 2V93A 5I2KB 4GL8A 2XXXA 2LAOA 3IB0A 4R9FA 3MUQA 4E0XA 3MZ1A 3DP6A 4UA8A 3A09A 2F7CA 3FXQA 5H8HB 4ELPA 2DE4A 1P1WA 4RNSA 3LSXA 4MLQA 1MPBA 4I9DA 1I69A 1A99A 3FJMA 4OXVA 1B0LA 5KZTA 2I4CA 4GLIA 2GH9A 4JWYA 1AIVA 4ZEIA 5ICQA 1MRPA 2ONSA 2Z8EA 2ZXTA 4BDNA 4EQBA 5ITPA 5L9SA 2X7PA 3SKPA 4F1VA 5I2NB 3S9LC 4GXAA 1SYHA 3KSJA 5FHMA 3IAZA 4ESXA 3B7DA 1I6AA 3KG2A 5I58B 3TCGA 3JYRA 2B65A 4HTGA 2I0CA 4IO6A 4OWDA 3VLVA 1MQDA 3GLBA 3HSTA 2VD2A 1Y4CA 1POY1 1GV8A 1H43A 5ELVA 3E9XA 3C34A 2QS3A 1QKBA 3QIMA 1VFEA 5DVFA 4OYVA 5FHOA 3K6XA 4YZZA 1A55A 1LSTA 3M3LA 4H0WA 2E1SA 3C33A 4H8JA 1ZLQA 2P0SA 4JXIA 2XX9A 3VLUA 1XS5A 1T0KA 2NWJA 4R74A 1JQFA 3IOUA 4IGTA 4XKNA 4DCXA 2RKMA 3TODA 4DE8A 4POWA 3MQ9A 2DWJA 3OOAA 1B9JA 4H6DA 5M2VA 3VXBA 3BKIB 3A3CA 4LONB 3OENA 4R73A 1Z7ME 3M8UA 4MBPA 3KN3A 1ATGA 2ZNUA 2REJA 1QUJA 3KZGA 3QUJA 4R2BA 3O9PA 2QSXA 4XXUA 1UQWA 1JEVA 1A54A 5TP9B 3U93A 1IXGA 3CFXA 3P7IA 1B3GA 1N04A 2XXPA 1DSNA 2G93A 4OMBA 3UIFA 5BWJA 4RPOA 4U22A 3GZGA 4Q30B 3V5AA 2O51A 1M5FA 3RPWA 3VVDA 1ELJA 4P11A 4YKPA 5AA2A 1QW0A 1MQGA 4FE8A 4LUBA 1B05A 2F5XA 4P0IA 2OZZA 4R9GA 1ZIUA 1MH3A 3GBBA 3OO9A 5EYFA 5BUUA 2GFEA 2V3UA 1LB8A 4YKJA 3PPPA 3G3HA 3O28A 3SDFA 5ISUA 1BP5A 2Y7WA 1PDAA 1VR5A 3EPEA 3MAMA 5LOMA 5I58A 4RPNA 1MY3A 3FUZA 4QF9A 1Y20A 4R6KA 2QMWA 3C32A 1LFGA 1MPCA 1II5A 3AXFA 1YTVA 3FASA 4KQPA 4ZEKA 3RT6B 4RY1A 2ABHA 3I5OA 2Q2AA 3CG1A 2H98A 2DS9A 3ECRA 3PD9A 1EZPA 1N3XA 3FJ7A 3LR1A 1FQFA 3O2AA 4R75A 3UORA 2D21A 1B4HA 1IEJA 3SEXA 2DXRA 1FCKA 2QPQA 1US5A 1FTOA 2V3TA 2Q9TA 3Q29A 1BIYA 1PBQA 3EHSA 3FV2A 3HN0A 3R26A 3VXCA 2QRYA 3FGSA 3GXAA 5DEXB 1LAXA 2V25A 4GRKA 1FQEA 2DE3A 2X7QA 3B6WA 5FTIA 2XXVA 5KDTA 5J1DA 2HQ0A 3Q25A 4JWXA 4HW8A 1HSEA 5I56A 1QULA 1SW1A 2AL4A 1EU8A 3C36A 2FNCA 3IJOB 4QFKA 3D4CA 3G3FA 3PMWA 3OD7A 4JDFA 1QJMA 1H45A 4OFOA 1KWHA 3V83A 1USYE 3T9HB 3M3KA 1AL3A 3Q26A 4R6HA 3O97A 4HCWA 2UVIA 2XD3A 1MG1A 1SW2A 3PPOA 2DE2A 4JBZA 4ZDMA 4EXLA 5TU0A 1FW0A 1LCFA 1VFDA 3EN3A 3VVFA 1XOCA 2ZYOA 3U92A 1DPEA 5F1QA 1LAFE 2ZYNA 3TCHA 5KDTB 3FV1A 4OTEA 5KCJB 3M3FA 3Q27A 1NH8A 4FECA 1DTZA 3PUVE 4IGRA 1CE2A 1H44A 4N6PA 4JSDA 4F2OA 4X48A 1LAGE 3QUFA 3U1OA 3PMXA 4AQ4A 5K2XA 1D9YA 5CMBA 4C1UA 3SETA 2UXAA 1PC3A 2CMOA 1JW1A 2F6GA 1O64A 2RC8A 1HSLA 4WEPA 2B3BA 4DLDA 2NUVA 1BKAA 3O6HA 1AOVA 3SERA 4YKIA 2Q2CA 4F39A 3H3GA 1UTHA 3S2VA 3HO7A 4TOZA 1UTHB 3D4GA 4NF5A 3PPNA 4ELOA 4BDRA 1US4A 1ZJLA 3HV1A 3ONMA 1UTBA 2DVCA 3MP1A 3MZ9A 4G68A 3LSWA 4G2ZA 4OHNA 4DXBA 2E0SA 4LVQA 2PX1A 4KHZE 1WDNA 3CSGA 4XKRA 4IO5A 3RTFB 1P1UA 2UVHA 4BDLA 1M5EA 2PMSA 1MY2A 2B3FA 1QKAA 3UP9A 1JVXA 5H8HA 1S7YA 2DP8A 1FQBA 1H3DA 1NNFA 5DYHA 3FVOA 3IL1B 4GVOA 5AA1A 2DWIA 4JWOA 1JW5A 3LSFB 4PFUA 4RK9A 4G8MA 1A8FA 1B5IA 3KOTA 5H8NB 1HSJA 1B4ZA 3IX1A 3K01A 2H9BA 1M5BA 1SW5A 1MY4A 2Q88A 3LUYA 2RC9A 2IA4A 3MVXA 2F36A 4IY6A 4KYSA 4GOTA 5H8SA 3VVEA 5A5XA 5JTYA 5EHMA 3RQTA 1B46A 1BTJA 4YICA 2ESNA 1MXVA 4R2FA 2ONRA 2ZNTA 4U1OA 4DXUA 2HZLA 2Q89A 5CMCA 3T9UA 5JEIA 1FTMA 5I59B 4F2QA 1B5JA 2Y7RA 3TAJA 3MPKA 4YU0A 4ZE9A 1F9BA 2I3WA 4WXJA 1B5HA 1UTBB 1IIWA 3Q28A 4G68B 3RUMA 3PPQA 4LZ5A 4RXLA 3MVZA 1MY1A 4P0GA 4ECFA 5I57A 4QFLA 2AL5A 3V8XB 2QJEA 1R9LA 5H8FA 2YJPA 4RK2A 3O6IA 4LQ5A 1B3HA 3PU5A 4ND9A 5JTYB 4G8NA 3MPLA 1RYXA 1JVYA 1ZKBA 3K4UA 4PFTA 4EDPA 3TYHA 1J1NA 1LBBA 2PT1A 3R6UA 4RJZA 2H99A 3U94A 1P1QA 4LATA 5ITOA 4IY5A 2O69A 3MZBA 5AA4B 1SDXA 5CI5A 4MFIA 1POTA 2F8DA 1GVCA 2ZNSA 3SEYA 3OO7A 3DELB 3TDJA 2OLBA 2VD3A 3OXNA 2VGQA 1IXCA 1N0TA 3W9VA 1LLSA 1EZ9A 5K2YA 3CSBA 4QSEA 3L6GA 2KLFA 2Q8JA 2M8CA 4GL0A 3QAXA 1IXIA 1N7WA 3IK6B 3PPRA 1GR2A 1MXXA 3CR9A 3IO6A 1JW4A 1LFIA 2RF1A 2XXQA 3OELA 3OSQA 2HZKA 3TELA 3VV5A 1B7ZA 3FVKA 4F3BA 4NF6A 2VHAA 2Z22A 3ILTB 1P99A 1B3FA 2YLNA 4Q5TA 2D5WA 2PYYA 4IB2A 3TTMA 4FIMA 2OWTA 1MY0A 3K02A 3C9HA 3K0VA 1IUDA 4ISUA 1B7UA 2UVGA 2WKYA 2I6EA 4G68C 4GFRA 3OEMA 4YB5A 2G29A 4MH5A 2OJTA 3C31A 3KJTA 4U1ZA 4XKPA 3IB2A 1R1NA 4H8IA 4LP2B 1FQAA 3T22A 1FTLA 3VE1B 4BDOA 4FEDA 4BDMA 3QYTA 1MQIA 1OQHA 4U2RA 4QFNA 3KEIA 2R6GE 5H8NA 2QS2A 1CB6A 1MH4A 2XXRA 3ODBA 2FYIA 2REGA 4XTCQ 1DTGA 1N76A 2I0BA 3H06B 1BLFA 4I8CA 4QFOA 4YB6A 1MPDA 1URSA 2BJJX 2F97A 2HEUA 4EQ9A 3MJNA 2F34A 1R6ZA 1EZOA 1TFAA 2P2AA 1R9QA 1LGBC 1O7TA 2DXYA 4C0RA 4PFWA 1MM6A 1YAEA 4F1UA 3I3VA 2XX8A 5CBRA 3G3KA 4YMBA 1Y1ZA 3OO8A 2O7IA 2XXUA 4KCDA 2X26A 1Y3QA 2CZLA 3PGFA 3T93B 2I3VA 1ZBMA 2FA7A 3KGCA 4M4GA 3FVNA 3IJXB 1B1HA 1YPNA 2VOZA 3RNNA 1EH3A 1A7LA 1LAHE 4YB7A 1IXHA 4QFPA 3BBRA 1XVXA 4OEVA 4X1DA 3FXRA 1B32A 1UIUA 4NF4A 4Z0IA 3LSLA 4TLMB 4C1TA 3MC2A 4O3CA 3SEUA 4OENA 3TQLA 3DM0A 2ZMBA 2VP1A 2OK2A 2RCAA 3JV9A 3IOVA 1MDQA 2HFBA 3MVWA 3EQ1A 3MVYA 4TQUQ 5TPAB 3EHUA 5F7VA 1ZTYA 3K1NA 3T66A 3V89B 5AA2D 1S50A 2HAVA 4N07A 4FAJA 2ZYKA 2DVZA 3TTKA 4PFYA 3ZS6A 5I2KA 3UN6A 4WEDA 3SEVA 4IO4A 1PB7A 4GQOA 1VE4A 4PQJA 4KR5A 1B3LA 2Y84A 3B6TA 4OETA 3BFTA 3QSLA 4OFLA 5DVJA 4ZEFA 3U72A 3S9EA 3TQWA 3H4ZA 2RINA 1PBPA 3TKDA 4DCYA 4F18A 3G7WA 4FATA 1FTKA 3H6TA 3VDFA 5JK4A 3PMVA 3OEKA 2XXWA 2I58A 3HHGA 1NNKA 1PB8A 3K6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PAKA 3ZSFA 4X9TA 1LBXA 3FXBA 4N15A 4ZEBA 5CRYA 3K2DA 3H7MA 3TFLA 4PP0A 4NEDA 4KFQA 4NF4B 1K9YA 4IO7A 2P1SA 4F3SA 4FJPA 1USYH 2V3QA 4N81A 1FQCA 2PBWA 2V84A 5H8FB 4U21A 3N94A 4ZZEA 1Z7NE 2O6AA 4BDQA 4NQ8A 4PCDA 3CVGA 4ZECA 1IMDA 2THIA 4KI0E 5LTCA 3DP8A 1MXWA 1B0HA 3N5LA 4G4PA 1LFHA 4AB6A 4N6KA 5HM4B 1Y3PA 3FXUA 4JSOA 1NV6A 5I84A 4YKKA 3KC1A 4NF8A 4KPTA 2I49A 4R6YA 1IZ1A 4NF5B 2A5TB 3A3UA 2UYEA 4GXSB 4PFRA 4AS5A 4LA9A 4ZS9A 5L9MA 2PCRA 4U4SA 4OESA 5J16A 2O68A 4OQOA 4DI3D 3GYYA 5H8QB 4N91A 4UACA 1FQDA 1B7HA 1PEBA 1QVSA 3IR1A 3C35A 3OO6A 3N26A 4ZZAA 3F11A 4GWSA 3K1MA 4ELQA 3FJGA 5I59A 3QK6A 1SVXB 3TCFA 1Q1KA 4HCYA 5LDZA 4G8HA 4FORA 5DEXA 1IQ7A 4N6DA 1LB9A 1TFDA 2WYPA 2H25A 1M5DA 2DSFA 1URDA 3VXCA 4HS7A 1AMFA 3QMFA 1D3KA 1NH7A 2HCAA 1SI0A 3E13X 5IAIA 2Y5KA 5B7DA 1Y3NA 1YCJA 5FTHA 4GWOA 4YAHX 1SYIA 4LQ2A 2F3DA 3FZVA 4F1YA 4OZ9A 3RGYA 5DVIA 3DP4A 1TXFA 1A8EA 3C4MA 2XXHA 4MLVA 3E3KA 4I62A 3SEWA 4LZ7A 2XX7A 1JETA 3MBPA 4F3GA 2V93A 2LAOA 1MPBA 4I9DA 1B0LA 4JWYA 5L9SA 1FBPA 5ITPA 4EQBA 5I2NB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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