1FQCA

Crystal structure of maltotriotol bound to closed-form maltodextrin binding protein
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqcA01
2F97A 1J1NA 2ZNTA 2QS2A 1B58A 2ZYOA 3S2VA 1P1NA 1MXVA 4YKPA 2X26A 2REGA 3P7IA 4NE4A 5LOMA 4F3BA 3S4UA 2Z23A 3KSJA 5F7VA 3Q26A 3EPEA 1NNFA 2B65A 3QSLA 1BIYA 1DPPA 4U21A 5KCJA 4DZ1A 1B5IA 4ISUA 3C36A 3C32A 3SERA 3KJ7A 4DXUA 5IAIA 1ZTYA 5HPQA 1OQGA 3G3FA 4BDQA 3W9VA 1MXWA 1B0LA 4EQ9A 1JEVA 1POTA 3TQWA 1D4NA 3OELA 2XXVA 4PFTA 2R71A 1SI0A 5IKBA 2OZZA 1QULA 4IO5A 4LONB 4KPTA 4RYAA 1A40A 2DP8A 3UIFA 5EHSA 3RLFE 4XKPA 2I49A 4QFPA 3C4MA 1PB8A 3PPPA 1MQJA 4N13A 5AA3A 1B05A 3QXMA 2A5TA 3KN3A 3T96B 1LGBC 2F7CA 3KGCA 3D4GA 4MF3A 3W15C 2UVGA 2I48A 3MP1A 3OENA 5I2KB 2Y7RA 3K1NA 3Q25A 4HW8A 2THIA 1MY4A 3MC2A 1MY1A 4YB7A 4FEDA 3RT6B 1LCFA 5A5XA 1UTHB 1AMFA 4GL8A 1P1OA 3RUMA 1LAFE 3FXUA 3CG3A 4R2FA 4R9GA 4LQ2A 4TOZA 4JSOA 3B6QA 2OJTA 4KR5A 5K2XA 2XXTA 3V89B 1P99A 3TUSA 3MZBA 1T0KA 1QUJA 4DIGA 1IXCA 2Y7KA 4C1UA 4Q30B 1WVJA 4F1VA 3TPAA 1LBCA 5KDTA 3IORA 1FTKA 5I58A 4QSCA 1B3GA 4BDMA 1B1HA 3PUWE 3LSLA 3O97A 3KJTA 3HHFA 3MZ9A 3ODBA 2DQVA 1A55A 4ZZEA 3FIRA 5H8NB 2QRYA 3H6VA 3F11A 1WDNA 3MUQA 2XXRA 5DYHA 3MW0A 1MDQA 3L6GA 2Y7PA 3V8XB 2OWTA 3BFTA 2XXWA 4KCCA 3SEUA 1IZ1A 1MPDA 1PC3A 1QUIA 2H25A 2ZNUA 1UTBA 4R2BA 2ZXTA 4ZEBA 3TODA 3TKDA 3RTWB 1YTVA 1AOVA 3E9XA 2O84X 1P1WA 5KCJB 1BLFA 3IAZA 1B3LA 2I4CA 4F18A 2H98A 5F1QA 1MRPA 3T22A 4I62A 1I6AA 3KN8A 4G8HA 1JNFA 1B52A 4KCDA 2HZLA 4JXIA 3RQTA 3LR1A 2R6GE 5CI5A 5I59A 3RY3A 3T93B 3PPNA 1M5FA 1A8EA 1RYXA 2P1SA 1AIVA 3SESA 1US5A 1DSNA 1R9LA 1B7ZA 3H03A 3K01A 3IR1A 1JVXA 1URGA 3UORA 2A5TB 2I0CA 3OXNA 1N7XA 5CMBA 4QHQA 3KG2A 5EYFA 4LQ5A 4YMAA 3MVYA 2RC9A 1MXZA 1QW0A 4KYEA 4C0RA 3ZSFA 1B4HA 3ZKLA 1PBQA 1R6ZA 4OMBA 3U93A 2M8CA 2F8DA 1H76A 1OIBA 5A5XB 5I57A 3EQ1A 1R1NA 3K02A 1NL5A 4UACA 5CM6A 1SDXA 1XVYA 4H67A 3TMGA 3SEXA 1L5TA 3TCHA 1LFIA 3LSFB 4NEDA 4OEVA 5JEIA 5AA1A 5DT6A 3FV1A 1XS5A 1EZPA 3OO8A 2VP1A 5AA2A 1MM6A 3B6TA 4FAJA 4XXUA 5FHNA 4E0XA 4G2ZA 5KDTB 1PEBA 1H44A 1AH5A 3PPOA 1URSA 5I58B 1LAXA 4NMYA 3UP9A 1IXHA 1P1QA 3OEMA 4PETA 3H6WA 1MQHA 3FGSA 3CFZA 3ECRA 1MY0A 1GVCA 3SDFA 2H9BA 5H8QA 4ZECA 2Z22A 5JK4A 4F3GA 4KFQA 1F9BA 1DMBA 4BDRA 2FNCA 4QF9A 3VLUA 2HXWA 1JW1A 3H6TA 3VE1B 1UTBB 1FQBA 4WEDA 4JWYA 4MLVA 4GFRA 2FYIA 4OERA 4Q5TA 2QS4A 3FASA 4P11A 2YJPA 2HFBA 2VD2A 4FORA 3WAFA 2DVCA 3PMXA 1LAHE 2F34A 1Y4CA 4DDDA 3G7WA 1GR2A 3N6TA 1YCJA 4MH5A 1MQIA 2I4BA 1IITA 4GRKA 2DS9A 3EF7A 3H06B 3V83A 3T9VA 2YLNA 4OFOA 4QFLA 1OQHA 2AL4A 2ABHA 5I59B 1SBPA 1OVTA 4U22A 4RK9A 3S9EA 1GV8A 3R7XA 5AE4A 1TXFA 3O6IA 2D5WA 3TFLA 2IEEA 2XD2A 4EXLA 1XT8A 2RC7A 3IJOB 3MZ1A 4IY6A 2NVUB 1B1XA 4FEBA 3K1PA 4HS7A 4THIA 3TYHA 3TDJA 3O28A 3MAMA 4F2QA 1TFAA 4EF2A 4OWDA 5FTIA 3DP4A 1S50A 1CE2A 2REJA 3C9HA 1S9TA 4FECA 4R9FA 4H65A 3G3IA 4OXVA 4RJZA 1POY1 3O6HA 2ZMBA 1BTJA 5I57B 1OMPA 5L9OA 5ITPA 3LSWA 2Q88A 2PT1A 4F2OA 4YMBA 2OK2A 4FE8A 1D9VA 3C31A 5DVIA 1AL3A 3Q28A 4XIGQ 5CC2A 2UVHA 4G68A 1B3EA 3DELB 5AA2B 4LP2B 4ZE9A 4GL0A 4M4GA 2DE4A 2UYEA 4G68C 3U1OA 2LAOA 3A09A 4L17A 4AB5A 3VLVA 1USYH 3HN0A 2Q2AA 3K6XA 1N0TA 5H8QB 3H6UA 4WEPA 3S9MC 4ESWA 1N3WA 4P0GA 1NNKA 1SI1A 3CSGA 3VV5A 3CR9A 2QSXA 3RPWA 3M3KA 4JWXA 1OVBA 3USDA 3D4CA 3VVEA 2DOJA 2GHBA 3PV0E 4R75A 1Y4TA 5H8FA 4H0WA 4U4SA 4ND9A 2B3BA 5CMCA 1NFTA 3CRBA 4U1ZA 1Y3QA 1N76A 3HSTA 1NH7A 5I2NA 1I6QA 1JVYA 3OD7A 4H8IA 4N07A 4HCYA 2XX9A 2Z8FA 3BFUA 4DE8A 1MS7A 4AB6A 1QJMA 2XXHA 3IB1A 5HBCA 4G8NA 1N04A 1ZBMA 3VLWA 3C35A 3I6VA 3PUVE 3K6WA 3ZS6A 3C34A 1HSJA 4N6PA 3PPQA 4O3CA 4F3PA 4OEUA 4NTLA 1TWYA 4GLIA 1XC1A 1PDAA 1M5CA 4G77A 5L9SA 4JB7A 1USYE 1B0HA 5ICQA 3SKPA 3TTNA 4R6KA 3N5LA 3UK4A 5CRYA 2RKMA 3FVGA 1VFDA 5B7DA 4NWDA 1KWHA 2HAUA 3OO6A 1LFHA 1SW2A 2XX8A 3LC8A 3KOTA 3H3GA 4LA9A 3T9XB 2HQ0A 4H6DA 2V93A 3K1MA 2H99A 3MJNA 5CBRA 3KBRA 3FJMA 1H3DA 3SETA 4F29A 4ESXA 3PMVA 1N7WA 4RPOA 4U2RA 4G68B 4YKIA 4R74A 3UN6A 2ONRA 2DE3A 2XXYA 3K4UA 1D9YA 3DLNA 5FHMA 1SD3A 4R6HA 4NWCA 2RINA 4U1OA 1NKXA 1MPBA 3LUYA 1ZJLA 4I8CA 2ONSA 5BWJA 4NF6A 2PVUA 1NMUA 2QPQA 1B32A 2XXQA 2XXIA 1I69A 4H8JA 1ELJA 4GIZA 3CFLA 4QSDA 2P2AA 3G3GA 1VFEA 2Q2CA 1IXIA 4QSEA 2HCAA 3QUFA 1UIVA 3IL1B 1MXYA 3PUZE 5ITOA 2D21A 2Z8EA 3K6UA 3MP6A 2OCUA 3MVWA 4ELRA 1A99A 3OO9A 2DWJA 1Y1ZA 1NNTA 2E1SA 4JBZA 1LB8A 2XD3A 5H8FB 4YU0A 2NWJA 1FTJA 4HTGA 1FTOA 2RF1A 4PFWA 3K0VA 2G29A 3OEKA 1FQEA 2F5XA 4PFYA 1JW5A 2DYXA 2Y7IA 5I2NB 4Z7EA 3U94A 3MP8A 4F19A 5TP9A 2DXRA 5ELVA 1I6BA 2BJJX 1XOCA 4ELPA 3IX1A 3CFXA 3IK6B 3ZKKA 1CB6A 5L8DA 3JYRA 3OOAA 4FJPA 4EQBA 4OTEA 2ZNSA 4ELQA 3JV9A 1QKBA 2IA4A 4C1TA 1LLSA 2X7PA 1PBPA 3MVXA 3IOVA 1TFDA 1Z7ME 3TQLA 3FUZA 3EN3A 4X48A 3IOWA 4G4PA 3O29A 4GOTA 3FZVA 1MH4A 2RC8A 2O1MA 2QL3A 2WKYA 5CMKA 2OBGA 3R26A 4TLLB 1MH3A 4DCYA 3OMBA 4ELOA 4MLQA 3QIMA 3PD8A 3IB0A 1FQAA 3V5AA 1MQDA 2AIXA 2QMXA 5CBSA 4OYVA 3K2DA 2A5SA 1LBBA 3IJXB 2O51A 1XHYA 1LSTA 3MVZA 3TEPA 3QUJA 4O3AA 3EHTA 1B46A 2VGQA 5DTBA 3T9HB 1A7LA 3KSXA 3E4RA 1JQFA 4JSDA 4DXCA 2DVZA 4X9TA 4GF8A 1SW5A 3GBAA 2VHAA 3FD3A 3K00A 4IO2A 1QUKA 1S7YA 3KEIA 1PB7A 2I0BA 2Y7WA 3FATA 2QMWA 4R6YA 4POXA 3FJ7A 1ZIUA 4EDPA 1LAGE 4YB6A 5I2KA 1B40A 4MBPA 4NF6B 2ZYKA 3L6HA 2Q9TA 4U4XA 3H4ZA 3VXBA 2I6EA 3S9LC 1DOTA 4Q0CA 5HM4B 3PGFA 5K2YA 2ZYMA 1B3HA 3MPLA 1GGGA 4IY5A 1B4ZA 2XXXA 3O66A 4XKRA 1VSOA 3QAXA 2O69A 3A3UA 4WXJA 1O63A 1MXXA 3I3VA 1VE4A 4BDOA 4DXBA 1UIUA 1II5A 1ZU0A 4ZEKA 2V3QA 1Q35A 3MQ9A 4F39A 3TELA 3LBSA 4H1XA 2I3VA 4KYDA 1TT1A 1BKAA 3LSXA 4I9DA 1SQYA 3PU5A 3TZAA 1B6HA 2VOZA 5TP9B 2V3TA 1EH3A 2ESNA 3TTKA 4I1DA 2P0SA 1A54A 5FHOA 2UYFA 5M2VA 4F31B 2G93A 3RT8A 4RXLA 3KZGA 2QJEA 2DWAA 5TPAA 3O2AA 2KLFA 3PMWA 4IB2A 3TTMA 4RK2A 1B5JA 4IGRA 4ZE8A 4BLAA 3B7DA 3SEYA 2VD3A 2OWSA 4X1BA 1LB9A 4KQPA 2V25A 3GLBA 3VXCA 2AL5A 5L9MA 1UQWA 4WKMA 4IGTA 1Y9UA 4XTCQ 3QK6A 5JTYA 2QS1A 3K6VA 2D3IA 4DLDA 4EF1A 3VDFA 4YKJA 3EHUA 1JETA 4QRZA 3BKIB 3G3JA 1B5HA 4U23A 4H5GA 3Q29A 3W9WA 3HPIA 1MXUA 1R9QA 4X1DA 5I84A 3DP8A 4YICA 3KN7A 1YPNA 1NH8A 4UA8A 5FTHA 4KYSA 1B9JA 1XVXA 2F35A 3TTRA 2H5YA 5BUUA 1EZ9A 4IO6A 2Q8JA 5DEXA 5EHMA 2HAVA 2XX7A 4GVOA 2DWIA 3FVOA 3FXQA 1EU8A 2E0SA 2F78A 3FJGA 4NF5A 1B7UA 3FVNA 1M5EA 2NOOA 4LZ5A 1SW1A 3N6UA 2FA7A 4F22A 1RYOA 2PX1A 5H8SA 3T66A 1B3FA 2HEUA 4GQOA 5DVJA 1O64A 4EUOA 4IO3A 3Q27A 4NF8A 1H45A 4OFJA 1HSEA 1QKAA 1FTMA 3TAJA 4R73A 5TU0A 4OZ9A 4F3SA 2AYSA 1FQCA 4HCWA 1LFGA 2ANJA 4GXAA 2OLBA 4OQOA 1B2HA 1IXGA 1O7TA 2CZLA 4IO4A 2V3UA 5ISUA 3VVFA 5H8HA 3DM0A 3RTFB 4EXKA 4Z0IA 2NXOA 3B6WA 1D3KA 4H5FA 3UA8A 1M5DA 4OESA 1MDP1 3IOTA 3M3LA 3CIJA 2O7UA 3MBPA 4LUBA 2F7AA 3M8UA 3S9NC 1NNPA 2I58A 1OLAA 1IUDA 4M1VA 4RPNA 3QYTA 3C33A 1JEUA 3FXRA 1DTGA 4OFLA 1FW0A 2QS3A 3CG1A 2GRVA 4ZEFA 1GTKA 2I3WA 3N94A 1Y20A 2ONKE 2DWHA 2HZKA 1OLCA 5TPAB 4GD5A 2DE2A 2NUVA 2Q89A 1Y1MA 1Z7NE 4NF4A 3IO6A 3U72A 3MWBA 4LATA 3MPKA 2O1LA 3VVDA 5JTYB 1B51A 1FCKA 3KFMA 3O6GA 3U8QA 2UVJA 4K3FA 2UVIA 4GWOA 4KHZE 2Z8DA 5AA4A 3U92A 1Q1KA 1MQGA 3E13X 2W7YA 2ZYNA 3VFJA 3IOUA 4PE5B 1MM7A 4ECFA 4P0IA 3A3CA 1VR5A 1A8FA 4JWOA 4BDNA 1MPCA 3HV1A 1DPEA 3GBBA 5DEXB 4ZEIA 1FQFA 3G3HA 2DXYA 1DTZA 1SYIA 5DVFA 1ZMGA 2UXAA 3CVGA 1Y3NA 2PMSA 4NF5B 4DCXA 1SW4A 3E3KA 3OSRA 4FIMA 1PB9A 4QFNA 2V84A 2RCAA 3R6UA 4QFKA 4RY1A 4GXSB 5I56A 2PT2A 3OSQA 2F36A 1ATGA 4YKKA 4AQ4A 4LZ8A 4NF8B 4YB5A 4E0WA 3TCFA 2RCBA 3RN8A 1ZLQA 2YPNA 4LVQA 2ALUA 4PQJA 3IB2A 2DSFA 3GXAA 2R9JA 4Q8RA 3N26A 5H8HB 1HSLA 5ICTA 1MG1A 1EZOA 3CI8A 4PFUA 1QVSA 1JW4A 2F7BA 3BBRA 3FV2A 2GHAA 5KZTA 1URDA 1WODA 4XKNA 4RNSA 3SEVA 3CSBA 3PUYE 3RGYA 2Y84A 4F1YA 1N84A 3ONMA 4O3BA 1ANFA 3HO7A 4ZZAA 3I5OA 3SEWA 4POWA 1LCTA 2F6PA 4OVJA 1US4A 4KD5A 1Y3PA 4BDLA 4TLMB 1P1UA 1ZKBA 1IQ7A 3OO7A 4OENA 1IIWA 3UGWA 3HCQA 3ILUB 1FQDA 1B7HA 3M3FA 3T9UA 1M5BA 3PPRA 1MY3A 3JZJA 4MFIA 4F1UA 1BP5A 4ZDMA 4RA1A 4QFOA 4NF4B 3GZGA 1RKMA 1IEJA 3WAEA 3THIA 4ZEDA 4FATA 4YAHX 4JDFA 3HHGA 2CMOA 3G3KA 1N3XA 4IO7A 4LZ7A 2XHDA 5AA4B 4OETA 3AXFA 2GH9A 2O6AA 3DP6A 3TCGA 3H7MA 1UTHA 2PYYA 5AA2D 4R72A 2H4IA 2XXUA 4YZZA 4OHNA 3IO4A 4G8MA 2F6GA 2GFEA 1MY2A 4ONYA 3RNNA 2X7QA 4ZS9A 2B3FA 3PUXE 5J1DA 4XKQA 4EQ7A 4TQUQ 1SYHA 3EHSA 3PD9A 2O7IA 1FTLA 3TTLA 5H8NA 5I56B 3KOSA 1SVXB 1YAEA 4KI0E 3ILTB 4PP0A 3FVKA 5CMMA 1H43A 2XXPA 2PBWA 3O9PA 5B70A 2O68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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