1FQCA

Crystal structure of maltotriotol bound to closed-form maltodextrin binding protein
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal structures of the maltodextrin/maltose-binding protein complexed with reduced oligosaccharides: flexibility of tertiary structure and ligand binding.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Sugar binding protein
total genus 120
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqcA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqcA01
1A99A 4NE4A 3VVDA 3TEPA 2QS2A 1PBQA 4ZEDA 1MY3A 4OFOA 5CBRA 1TFAA 2XHDA 1I69A 5F1QA 2RINA 4LQ5A 2OJTA 3UGWA 3U92A 1SBPA 3OSQA 3TQLA 3PPRA 4G2ZA 3TKDA 1POY1 4X48A 2GHAA 2ZNTA 5H8SA 2I0BA 5DVIA 4O3CA 3L6GA 3G3FA 3CR9A 1MM7A 1ZTYA 4YU0A 2UXAA 3K6XA 1B58A 3QK6A 3TPAA 3IB0A 5I84A 4ZEFA 4RXLA 1FQEA 1D9YA 3U93A 1URGA 1FTJA 1XS5A 3SEVA 4U1OA 3K01A 4PFTA 3PUZE 1NKXA 1B9JA 3ILUB 4G8NA 1B0LA 1SVXB 5I2NA 4K3FA 3LUYA 4BDMA 4DCXA 3N5LA 1F9BA 4LATA 1MQHA 3QIMA 2I4CA 3S9EA 3W9VA 2O84X 2Q88A 5ISUA 2H9BA 3GBAA 1QKAA 3MQ9A 5EHSA 5B7DA 3RUMA 2DE3A 2O69A 3B6TA 4KD5A 3PMWA 4MH5A 4ONYA 1JVXA 4FE8A 4EF2A 3MVYA 4YKIA 4Q8RA 2AYSA 3FJ7A 5ICQA 3TTMA 5CC2A 3QAXA 4PQJA 1Y9UA 3TELA 3PUYE 2XD2A 4EXKA 1ATGA 1USYH 3TMGA 3PUVE 2I4BA 2XXPA 2Y7RA 3EHSA 5LOMA 4R9GA 1M5CA 3FGSA 4ISUA 4NWCA 1AH5A 1MQIA 1T0KA 3CFXA 1FTKA 3KZGA 3K0VA 2RC9A 5I2NB 4JXIA 1A55A 2X26A 1NNFA 1Y20A 4JSOA 3ZKLA 5ICTA 1IXHA 1TXFA 4N6PA 3TTRA 1B5IA 3SEYA 2HEUA 4GOTA 3ZSFA 2QS1A 4GLIA 2CZLA 1II5A 4KPTA 4R6KA 3MZBA 5HM4B 4G8HA 4U22A 4RA1A 4AQ4A 4H1XA 3VVEA 3I3VA 3IR1A 4FAJA 2HCAA 4TOZA 4R72A 3K02A 2PMSA 5KDTB 2V3UA 4MF3A 1H3DA 3QXMA 2I48A 2NWJA 4OESA 4R73A 1S50A 4Q5TA 4H0WA 2ZNUA 3SEXA 2XXVA 5A5XB 3M3KA 3GLBA 2ANJA 4IO7A 1N76A 1TFDA 5AA3A 3H06B 1PB8A 1B51A 1B5JA 5I58A 3MZ1A 1SDXA 3H03A 1QUJA 3ONMA 2Z22A 3FV1A 4IY6A 3RT6B 5CMMA 3U72A 3TDJA 3O97A 4XIGQ 1MQJA 1OMPA 2Q2AA 4JSDA 5KCJA 5DYHA 2OCUA 3H6UA 3DP8A 3WAEA 4I1DA 3HO7A 3THIA 3OO7A 3PV0E 4LZ8A 3KBRA 3IX1A 3PPNA 4ESWA 4F3GA 4EF1A 1LB8A 5BUUA 3FV2A 2OLBA 2PYYA 5IAIA 3PUWE 1SI0A 4TLLB 3I5OA 2NUVA 4OWDA 2ZNSA 3K00A 2ONKE 2VGQA 1JEVA 1PEBA 4OENA 3OXNA 4OXVA 2CMOA 2X7PA 1MG1A 5I58B 1GR2A 1M5BA 2RCAA 5I2KA 2F7AA 5H8QB 4RK2A 1FQDA 2F34A 1NNTA 1QW0A 3D4GA 4GF8A 1MH3A 4P0GA 1M5FA 3QYTA 3Q26A 4ECFA 4H65A 2DS9A 3K1NA 3FVOA 1DPEA 3WAFA 2DQVA 5H8HA 2DE2A 1YAEA 4G68A 4FATA 1ZJLA 2XX8A 4GRKA 4IO4A 1HSEA 4EQ7A 1A7LA 1AL3A 1RYXA 5KZTA 1KWHA 2QS3A 2RCBA 4QHQA 4JWYA 3C32A 3ZS6A 1CE2A 4ELRA 1IIWA 3E4RA 5K2XA 3ODBA 1EZ9A 1NNPA 1I6AA 2LAOA 3G3KA 2H98A 3EHUA 3PU5A 2PT1A 3OMBA 4WEPA 1URDA 2PVUA 3OELA 3T9VA 2DSFA 1XVYA 3KFMA 3O9PA 4WKMA 3T9XB 1FTOA 2KLFA 4WEDA 4IB2A 3S9MC 4H67A 1Y4CA 2G93A 1D9VA 1LGBC 5I2KB 3RLFE 1B1HA 3SESA 4HW8A 4ZZAA 4ELPA 4GFRA 3O66A 3H6VA 2HFBA 3IAZA 1PDAA 2Q9TA 1R9QA 4HCWA 4F1YA 3PUXE 2V25A 4QFNA 1B0HA 5H8HB 1NNKA 3FXQA 1QUIA 3DELB 4G68B 4THIA 1H43A 3HCQA 3PPOA 1BTJA 3C34A 3Q28A 4ELOA 4U1ZA 4GQOA 4IO5A 4QSDA 2HAUA 3C36A 4LP2B 2O7IA 1MPCA 3MVWA 5TP9A 1XT8A 1LAHE 1LBCA 5AA4A 1B7UA 4R2BA 2NOOA 1TWYA 2REJA 2QJEA 4NF5A 4XXUA 1R1NA 4FEBA 2O68A 3P7IA 4ZECA 2XXWA 1ZMGA 4DXUA 2D3IA 2F97A 4ND9A 1AOVA 4DLDA 4P0IA 1XC1A 3C31A 2GHBA 3S4UA 3KJ7A 3M8UA 4OMBA 1LLSA 1B7ZA 5JTYA 2DWHA 1XOCA 1A8FA 1Q35A 1US5A 2Z8EA 3USDA 1LCTA 2GH9A 2Q2CA 2B3BA 4ZEKA 4OEVA 2XX7A 5DT6A 4OETA 1J1NA 2OZZA 3DLNA 2Q8JA 5CMKA 2PX1A 4U4XA 3MZ9A 3RTWB 3MWBA 3KJTA 3MUQA 3KEIA 4U21A 1VSOA 4F29A 2B65A 3H3GA 3BBRA 4NF4A 3A3CA 4KYSA 4OQOA 5TP9B 4O3BA 1WDNA 2DXRA 1B3EA 3OD7A 3KG2A 3SERA 2F35A 5EYFA 4XKNA 4GIZA 4NF5B 3TAJA 4Z7EA 3C9HA 1MQGA 3EHTA 3IO6A 4OHNA 5DTBA 3S2VA 3H7MA 4PE5B 3D4CA 2DVZA 5JTYB 3M3LA 2R6GE 1UTBA 2F5XA 3OSRA 1IUDA 3CRBA 2THIA 3BFUA 2XXQA 3SKPA 4MLQA 4QSCA 1B2HA 5K2YA 4C1TA 3H6TA 3K1PA 4LVQA 1ZIUA 2AL5A 2RC7A 1DPPA 3N6TA 3PPQA 4QFLA 4LA9A 1Y1ZA 2R9JA 3RQTA 3MPKA 4OVJA 3DP4A 4E0XA 2Y7KA 4ZEIA 1JW5A 3TYHA 1SD3A 1SYHA 3KN3A 4EQ9A 3VDFA 1Z7ME 5CI5A 3TTKA 4OTEA 2ONSA 2HAVA 3PMVA 3W15C 4R6YA 2Z8DA 2DVCA 2XD3A 4JWXA 4YKJA 4JBZA 4F2OA 4DE8A 3VLUA 3MVZA 2QMWA 1US4A 1B46A 3CG1A 4LQ2A 4GL0A 3IB2A 1B52A 4OZ9A 2HZKA 2QMXA 3VE1B 4OFLA 4FIMA 4GXSB 4F18A 5CM6A 2VOZA 1LFGA 3IK6B 4NF6A 4YMAA 3SETA 3OEKA 1OQHA 3O6HA 4QFOA 4F22A 4YB6A 4YB5A 4KYDA 4F3PA 3EPEA 1NL5A 1HSJA 2DWIA 5CBSA 4H8IA 3O2AA 3T22A 4KFQA 5TU0A 5L8DA 3MVXA 1LAFE 1R9LA 1JW1A 1P99A 2OBGA 5DVFA 1LB9A 1RYOA 4ZZEA 3IORA 1MPDA 3C33A 3ILTB 3LC8A 1IXGA 2IEEA 3UK4A 1Y1MA 3HPIA 2E0SA 3A3UA 4U2RA 3R7XA 3UP9A 2ZYMA 3JZJA 2Z23A 2ABHA 1VFEA 3IB1A 1SI1A 3TUSA 1JW4A 1DSNA 3K1MA 4Q30B 4BDOA 4NEDA 1H45A 1UTHA 4NF6B 2XXXA 4PP0A 4N13A 3OENA 4R75A 4E0WA 5AE4A 4ESXA 5H8NA 1NH8A 1N0TA 3G7WA 1OLAA 4GL8A 3MP6A 2D5WA 1OQGA 1OLCA 4QFPA 5H8FA 2NXOA 1FQAA 4X9TA 4O3AA 3FVNA 5JK4A 3B7DA 3OOAA 2O7UA 2OK2A 3VXBA 2UVGA 1FTMA 2F36A 4P11A 2GFEA 1FW0A 1NMUA 1O7TA 2Y7IA 4RK9A 1FQFA 1LFHA 1QKBA 3C4MA 1SQYA 3JYRA 2F8DA 4M4GA 3PMXA 1LAXA 1Q1KA 1MH4A 5KCJB 2DWAA 4FJPA 3V89B 3FXUA 2O51A 4I62A 4DIGA 1EH3A 4QFKA 3CIJA 3FJMA 4X1DA 1SW4A 3IL1B 4PFYA 3MC2A 2XXRA 3SEWA 1UTHB 3UA8A 3O28A 1ANFA 1I6QA 2Z8FA 4DXBA 1MXUA 4GXAA 3IJXB 4YKKA 3G3IA 2ZMBA 2F7CA 5H8NB 1HSLA 4KYEA 3C35A 4DCYA 1OIBA 3HV1A 4LUBA 4NMYA 5H8FB 1EZOA 4ZEBA 3PGFA 3MPLA 2IA4A 2O1MA 3KOSA 2VD2A 3K2DA 1PC3A 2I58A 1IEJA 4QRZA 4R74A 1D3KA 2H4IA 3VFJA 4R2FA 3KN8A 3IOTA 4ZE9A 3QUFA 1QUKA 4F1UA 2XX9A 4KCDA 3TTNA 4RPNA 5HPQA 3QSLA 4YICA 3IOVA 1EU8A 1SW1A 3SEUA 2DE4A 1IQ7A 1SW2A 1Z7NE 2ZYOA 5DEXA 3U94A 1MDP1 2YJPA 1UIUA 4LZ7A 3TFLA 2I6EA 5FTHA 1N84A 4PETA 1POTA 4QF9A 1P1QA 1B4ZA 4KR5A 1DOTA 4IO6A 3LSFB 3RNNA 4HS7A 1JNFA 3PD9A 2QRYA 4I9DA 3MP8A 3VXCA 1H44A 1IXCA 1RKMA 3O6GA 4KQPA 3MJNA 4G4PA 4M1VA 2Y84A 2Y7PA 1ZLQA 4RNSA 5AA2A 1MXZA 5AA1A 1B5HA 2F7BA 4BDNA 5EHMA 4KHZE 3LSLA 3I6VA 4WXJA 1P1WA 1QJMA 5L9SA 1JEUA 3VVFA 3CVGA 3U8QA 2A5SA 2HQ0A 5TPAA 3IO4A 2QSXA 5I56A 1CB6A 2DWJA 4LZ5A 2QL3A 5IKBA 1VE4A 1BLFA 4NTLA 2RF1A 1R6ZA 4XKRA 1BP5A 5DEXB 1JVYA 1YPNA 1MY2A 3V8XB 3GBBA 1DMBA 1MXVA 4H5FA 1A54A 1LSTA 3RTFB 3PPPA 3CFLA 3TQWA 3V83A 1WVJA 5L9OA 3QUJA 3S9NC 1EZPA 1QVSA 4AB5A 4G8MA 2R71A 2NVUB 2XXHA 1MXYA 2DP8A 4F3SA 2UVHA 2XXIA 5AA4B 2ZYNA 1ZKBA 3N26A 4BDRA 5AA2B 4R6HA 1Y3PA 1B05A 2DYXA 1B7HA 2REGA 1I6BA 3R6UA 1XVXA 1MXWA 3EN3A 3OO8A 1MXXA 2V3TA 2HXWA 5TPAB 4OYVA 5HBCA 2PBWA 1DTZA 4F39A 4MFIA 4NF8A 3KSXA 5I56B 1M5EA 2A5TA 4YAHX 3RGYA 3ECRA 2ONRA 5L9MA 1GTKA 5FTIA 1OVTA 1B1XA 3K6UA 3KN7A 4YMBA 3UORA 2G29A 2D21A 3DP6A 1ELJA 3BKIB 4HTGA 1LFIA 4BLAA 3VV5A 3G3JA 2H5YA 1IXIA 4ZE8A 1S7YA 2Y7WA 3O6IA 4C0RA 2UYFA 1PB9A 4NF4B 1O63A 1VR5A 3G3GA 4LONB 5KDTA 1MRPA 4QSEA 3KSJA 3HHFA 1USYE 5I57A 1NH7A 2XXTA 1MQDA 4TLMB 3IJOB 3OEMA 1N3WA 4X1BA 1FTLA 4YZZA 3TZAA 4F1VA 3LR1A 1YCJA 3E3KA 5A5XA 2OWSA 2QPQA 1IZ1A 3B6QA 2QS4A 5ITPA 1M5DA 1OVBA 2E1SA 4F19A 2I0CA 5CRYA 1UTBB 3L6HA 4NF8B 3E13X 2A5TB 1N04A 5J1DA 5DVJA 4H8JA 3GZGA 5AA2D 4U4SA 4U23A 4IGRA 3UIFA 4UA8A 2O1LA 4EXLA 1XHYA 3MBPA 3IOUA 3MP1A 5CMBA 3G3HA 1ZBMA 5B70A 1Y3QA 4RPOA 1QULA 3MAMA 4EUOA 4MBPA 1MS7A 3CSBA 5BWJA 2M8CA 2XXUA 4Z0IA 1P1UA 3Q27A 2FNCA 2W7YA 2VHAA 1AMFA 2PT2A 2OWTA 4F3BA 3R26A 3FD3A 2AIXA 1BKAA 2DXYA 4POWA 4XKPA 5I57B 4I8CA 1NFTA 4ZDMA 1A40A 4OEUA 2V93A 1URSA 3GXAA 2UVJA 3CSGA 2F78A 3FXRA 3HN0A 4L17A 3K4UA 1GVCA 4FECA 5FHOA 3FJGA 2X7QA 3KOTA 1FCKA 3EF7A 4IGTA 3VLWA 2RC8A 2VD3A 1D4NA 1SYIA 3ZKKA 4JWOA 5H8QA 4EDPA 1JQFA 1TT1A 1DTGA 3RN8A 3T9HB 1S9TA 1YTVA 3CG3A 1P1NA 4DXCA 3CI8A 1B40A 1B32A 1Y4TA 3W9WA 2I3VA 3N94A 3Q25A 1WODA 3E9XA 3T66A 4KCCA 5FHNA 4H6DA 4BDLA 4XKQA 4IO3A 3H4ZA 1MY0A 1O64A 1FQBA 3HSTA 2FA7A 2BJJX 1UQWA 3FVKA 3TCHA 1B3FA 1LCFA 5ITOA 3RT8A 4PFUA 2P0SA 5ELVA 5JEIA 3HHGA 1AIVA 1ZU0A 3K6VA 3LSXA 1B4HA 3T93B 4DZ1A 5M2VA 1MM6A 4IO2A 1BIYA 4AB6A 2I49A 1P1OA 2ZYKA 3K6WA 3B6WA 4F2QA 4JB7A 2HZLA 2P2AA 3FATA 1N7XA 2V3QA 2F6PA 2Q89A 3U1OA 2WKYA 3Q29A 1GV8A 3EQ1A 3F11A 4UACA 1JETA 1MY1A 2VP1A 4EQBA 1B6HA 2RKMA 4RYAA 2H99A 4H5GA 5I59A 4FEDA 2V84A 3BFTA 1UIVA 3V5AA 4MLVA 2GRVA 4ELQA 4XTCQ 3DM0A 3M3FA 1MDQA 2FYIA 3FUZA 1GGGA 4R9FA 2O6AA 4NWDA 1FQCA 4GWOA 2DOJA 3TODA 4JDFA 3TCFA 3H6WA 3OO9A 3TCGA 1B3LA 4GVOA 3FASA 3TTLA 1PBPA 2H25A 2ESNA 1B3HA 3T96B 4F31B 4PFWA 3SDFA 2YPNA 3FIRA 3JV9A 1MY4A 2YLNA 3N6UA 3O29A 1IITA 4BDQA 5FHMA 2I3WA 1H76A 1B3GA 4POXA 3CFZA 4GD5A 1A8EA 3RPWA 4IY5A 5CMCA 4C1UA 3AXFA 2P1SA 1VFDA 4KI0E 3A09A 3FVGA 5F7VA 3FZVA 4OERA 3LSWA 4OFJA 1Y3NA 3UN6A 5I59B 4YB7A 3IOWA 2XXYA 1L5TA 4ZS9A 1PB7A 1N3XA 3KGCA 3T9UA 4G68C 3PD8A 1LBBA 2AL4A 1LAGE 3LBSA 1MPBA 3S9LC 2F6GA 2ALUA 2UVIA 4RY1A 4G77A 3MW0A 4N07A 4Q0CA 4TQUQ 1N7WA 4FORA 3RY3A 4DDDA 4HCYA 2ZXTA 4YKPA 3VLVA 4RJZA 3OO6A 1SW5A 2B3FA 2UYEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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