1FQFA

Crystal structures of mutant (k296a) that abolish the dilysine interaction in the n-lobe of human transferrin
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFADSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and iron release properties of mutants (K206A and K296A) that abolish the dilysine interaction in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA02
1D9YA 4OESA 1BIYA 2ZYMA 2DOJA 2AL5A 1PDAA 2O51A 2O69A 2I4CA 1MY0A 1MPCA 3FV1A 4GOTA 4KI0E 3FVOA 1YCJA 4NF5B 3BKIB 4ZEBA 2XXUA 1Q35A 1URGA 2Y84A 3DP4A 4H6DA 4QFNA 1POTA 1PB8A 1UQWA 4OETA 3KN3A 1QW0A 1NKXA 2R9JA 4QRZA 5IKBA 1MY4A 3M3LA 3A3UA 1EZOA 2F5XA 3O6IA 1TFDA 4N13A 3H4ZA 1D4NA 1B5HA 4Z7EA 4KYDA 3MC2A 4THIA 4YKKA 3TPAA 1R1NA 3M3KA 2FYIA 4DDDA 4YB5A 1WDNA 1FTOA 4KR5A 4YU0A 3Q25A 1QUJA 1PB7A 2AYSA 3WAFA 4Q5TA 1OMPA 1PBQA 3VFJA 3S9EA 5B7DA 1NMUA 3CG1A 4MFIA 3OEMA 4IGRA 1LCFA 3VVEA 3G3JA 1MM6A 3H6TA 1P1OA 2QL3A 3OENA 1FQEA 4LP2B 1JNFA 3K6WA 4NF8B 1MXYA 4I62A 1DPEA 2Q2AA 1XVXA 3MQ9A 2XXTA 3F11A 2QS2A 4FEDA 4PFUA 1FQAA 3QUJA 3TTRA 3CFZA 5H8FA 4E0XA 2QMWA 2A5TA 3QAXA 2HAUA 1SYIA 3Q28A 4H1XA 3QUFA 5AA3A 4POWA 4XTCQ 5I57A 2X7PA 1N3XA 3UK4A 1LGBC 3KG2A 4O3CA 3JV9A 1NH7A 3IK6B 3B6WA 1AMFA 2H5YA 2Q89A 3IX1A 3KN7A 1M5BA 4BLAA 1UTBB 1UIVA 2UVJA 3O6HA 4OMBA 4BDLA 1KWHA 1AH5A 2AIXA 4JDFA 2XXQA 2B3BA 4XKPA 5TU0A 2M8CA 4MLVA 1B9JA 4U1ZA 1ZU0A 1MDQA 1NH8A 3KFMA 1D3KA 4ELRA 5TP9B 4U1OA 1IXCA 1LAGE 3FUZA 3K1NA 3SESA 3DM0A 1I6QA 1OIBA 5H8QA 3PV0E 3FVNA 1MXWA 3MW0A 5H8HB 4DCYA 4YKJA 3IOTA 4EQBA 2V84A 2V3QA 5CBSA 4MH5A 1O64A 1MQHA 3G3IA 3K0VA 4GXSB 2AL4A 3W15C 4UA8A 1LBCA 4H8JA 2Q8JA 5A5XB 3FVGA 4I1DA 4R73A 5H8NB 2E1SA 2I3VA 1B58A 3G3KA 1NNTA 3KOSA 1TXFA 4BDMA 4E0WA 5I2KB 3SETA 3FJ7A 3TKDA 5TPAA 3CVGA 3RTFB 2DE2A 4F2QA 3KGCA 4OTEA 1PB9A 1LSTA 3TYHA 3S9NC 4OEUA 4YAHX 3OEKA 4PFTA 5FTHA 4NTLA 5ICTA 2D5WA 5KDTA 3K00A 2REJA 3MP1A 1BLFA 2OJTA 4DLDA 4KFQA 1VSOA 1MQJA 5AA2D 5F7VA 4KYEA 1B2HA 4OYVA 3RT8A 2RC7A 2RKMA 1JW5A 2NXOA 2RCBA 3IB0A 3DLNA 3C33A 5I58B 2X7QA 4M4GA 3RPWA 2DWAA 1I69A 2ZYOA 4ONYA 4POXA 3FATA 4RPOA 1HSJA 4RK2A 1CB6A 3CG3A 5CC2A 5FTIA 3MZ9A 2HZLA 3KBRA 1RKMA 2V3TA 4WXJA 4XIGQ 2DWJA 2I48A 3R26A 3PPRA 2NOOA 2DE3A 1Y3QA 2WKYA 3BFTA 1WVJA 3C4MA 2Z22A 1RYOA 3DP6A 2XXYA 3O28A 2CZLA 3G3FA 5DEXB 3UA8A 1QKAA 1AOVA 4HCYA 4PETA 4ELPA 1SDXA 2XXIA 3VV5A 3PPQA 4Q0CA 1J1NA 3FZVA 4JSDA 3OELA 4YKIA 3LR1A 2ONKE 4R74A 4OFJA 4IY5A 4YZZA 5EYFA 5CI5A 2DE4A 2VGQA 4LA9A 3E13X 1S50A 2GFEA 3OO9A 1MM7A 4FORA 2VHAA 2BJJX 2THIA 4QFLA 2Y7WA 3GBAA 3K6VA 4R2BA 4YB6A 2UVIA 4JB7A 3CSBA 1BTJA 2I49A 3ONMA 1R9LA 3TMGA 3TTMA 2F78A 2Z8EA 1PEBA 1DSNA 5AA4A 1B3GA 4Q8RA 1POY1 4KCDA 4ZZAA 1SBPA 4FECA 4K3FA 1IXIA 4NF4A 2PMSA 1SYHA 4YICA 4X48A 1QJMA 1Q1KA 1VFDA 4F18A 1LFHA 3HSTA 4WKMA 2A5SA 4PP0A 3T93B 1YAEA 5ELVA 2Q88A 3LBSA 2F35A 3SEXA 1Y9UA 4QFKA 4EQ7A 2O7IA 3N6TA 4FAJA 2F6PA 3GZGA 3CI8A 1HSEA 3H06B 3MVXA 2HAVA 4BDRA 4GVOA 4EUOA 2KLFA 3VVDA 4N6PA 3SEWA 3SERA 2RCAA 1EZPA 3OD7A 3VLWA 5L8DA 2QS1A 3FGSA 3TAJA 2QJEA 2PT1A 4OZ9A 1XHYA 2XXWA 4GL8A 3KZGA 5BWJA 1MY3A 1URSA 1M5EA 1USYE 1FTLA 3QK6A 4NE4A 1MH4A 3T9VA 2UYEA 5I59A 4O3AA 1YPNA 4X1BA 1MXZA 1A99A 3FV2A 3RT6B 1JQFA 1A8EA 2Z8DA 4OQOA 2REGA 1Y20A 1SD3A 5I56A 1CE2A 4F31B 4NF6B 3TDJA 1DTZA 1SVXB 3USDA 2P1SA 4F29A 4ISUA 4C0RA 3MVYA 4UACA 3SDFA 3FXUA 4GF8A 3IO6A 3KN8A 1UTHA 2ZNUA 3VLUA 4NWCA 3IAZA 4OFLA 4HTGA 1ZTYA 3FXRA 3N6UA 2R71A 1XT8A 2IEEA 4EF2A 4ZEFA 4NMYA 2DWIA 3S2VA 1II5A 2YPNA 2DYXA 1A8FA 1VR5A 1JVXA 5KCJA 5I2NB 2OCUA 4ECFA 1PBPA 4GIZA 4BDQA 3MZ1A 4FE8A 3CIJA 3SKPA 3K4UA 3FJMA 3HV1A 3V83A 1ZLQA 3RLFE 3OO6A 4F22A 4G2ZA 4DXCA 1FTMA 4H5GA 4JWXA 4EXKA 2I3WA 4U22A 4RJZA 4I8CA 4Z0IA 3JZJA 5AA2B 3HO7A 1B46A 3MVWA 4R9GA 3C35A 1SW2A 2XXRA 2FA7A 4MF3A 1LAXA 5CMKA 4G8HA 4RK9A 1ZIUA 1A40A 1H43A 4OFOA 4ZE8A 5L9SA 4GD5A 3U8QA 2DXYA 3HPIA 3QYTA 2D3IA 3V89B 2XXVA 4R75A 2PBWA 4BDNA 1N7XA 3FVKA 4F3SA 4IO6A 3ECRA 3OXNA 3SEUA 2VD2A 1LLSA 4G8NA 3IJOB 3TCHA 1N76A 4ESXA 4F1UA 5DVFA 1NNKA 4YKPA 3QXMA 2ZMBA 5K2YA 3U92A 2RC8A 3IOVA 1DMBA 5J1DA 5KZTA 3PD8A 2Y7IA 5FHNA 3E4RA 3D4CA 4IY6A 3SEYA 1ZJLA 4R6KA 2F6GA 4ELOA 3N94A 4MBPA 5DVIA 1NL5A 3O6GA 3BBRA 3QIMA 1B0HA 2QSXA 4TLMB 2QMXA 2OBGA 2H99A 3ZS6A 1FTKA 3PUWE 3MUQA 2ABHA 1N04A 2I4BA 5JTYB 5IAIA 2P0SA 4F3GA 2ZYNA 3PUZE 5DVJA 1H76A 3H3GA 1B6HA 4ZECA 5FHOA 3KEIA 2OWTA 4QSDA 4FIMA 3H6WA 1OVBA 2UXAA 3EHUA 2XD3A 3D4GA 4R72A 3DELB 4Q30B 4ZE9A 2VD3A 1JEVA 4RXLA 1B7ZA 4OEVA 2DWHA 4H8IA 3WAEA 4KHZE 4P0GA 1Y1ZA 1GVCA 4U23A 4ZZEA 3TQWA 4ZEIA 4L17A 1OQGA 4KD5A 3B6QA 3PPPA 3ZSFA 3VXBA 4GL0A 5I59B 3IB2A 2G93A 4NF5A 3UGWA 1ZBMA 3O29A 3SEVA 1S9TA 1B32A 2I58A 4OVJA 4F3PA 2ALUA 5DT6A 5I56B 1FQCA 1MS7A 1AIVA 1MH3A 5HBCA 1Y3PA 1B4ZA 1B51A 3ILUB 3IR1A 4C1UA 1LFGA 1B0LA 3RNNA 1OLAA 1B5JA 4TQUQ 1OQHA 4OENA 1M5CA 4EDPA 4JWYA 2H25A 2QRYA 2XX9A 1LCTA 3PMWA 4IGTA 1JEUA 4ZS9A 3CSGA 2PYYA 1LB9A 4GRKA 1B1XA 3T9XB 4NEDA 3FIRA 4OWDA 5JK4A 4IO7A 4PFWA 2I0CA 2D21A 3Q27A 4R2FA 3MVZA 5DTBA 3R6UA 1N7WA 3LSXA 1EU8A 2F97A 1H45A 4XKRA 1MQIA 1Z7ME 1M5DA 4DXBA 5CM6A 1XS5A 3K01A 4IO3A 1LBBA 4IO2A 4H5FA 3LC8A 3TZAA 2R6GE 4NF8A 4FATA 3MWBA 1DPPA 4X9TA 2O1LA 3EPEA 3BFUA 2F7CA 2F8DA 1A7LA 1B7UA 3MBPA 1MPDA 5F1QA 1IXGA 4RA1A 5LOMA 1JETA 1WODA 3C31A 4NWDA 3MP8A 1A54A 3IB1A 4F1YA 1SW4A 1MPBA 2Y7PA 4F2OA 5BUUA 1B3LA 3RTWB 3K1PA 4GQOA 3T22A 4XKNA 3MP6A 5H8FB 2A5TB 2Q9TA 1GR2A 3OSQA 4GLIA 4G68C 1UTBA 5I57B 2Y7RA 3LSLA 1QUKA 1MY1A 4G77A 3IOUA 3S9LC 3M3FA 3CR9A 4LUBA 3E9XA 3MJNA 1S7YA 5CMMA 3VXCA 2O84X 1O7TA 4F3BA 2RF1A 1QULA 3I3VA 3O2AA 2O6AA 3L6GA 5I84A 3PPOA 1MQDA 1SW5A 1P1WA 5H8HA 1MXVA 4GFRA 4YMAA 1DOTA 3GXAA 4TOZA 1IQ7A 1FCKA 3T9UA 3OMBA 4PQJA 3N26A 1YTVA 3VE1B 2XXXA 1B52A 5ITPA 5ITOA 1GGGA 5H8QB 4R6YA 3W9WA 5L9OA 1IITA 1QUIA 1L5TA 3L6HA 3VVFA 3UIFA 2Z23A 5H8NA 4GWOA 3C36A 3O9PA 3TCGA 2V25A 5I2KA 5CRYA 2V3UA 3RUMA 4ELQA 3OSRA 4G8MA 4F19A 2RC9A 1OLCA 4DIGA 4H0WA 1NFTA 1VFEA 2ZYKA 3RQTA 4ZEDA 4EQ9A 2IA4A 4QFPA 3QSLA 4LQ5A 3MPLA 5TPAB 1SI1A 2ANJA 1MRPA 4G68A 4EXLA 1I6BA 2I0BA 3O97A 1UIUA 3IO4A 1SI0A 3U1OA 3KSJA 4QFOA 2OWSA 1ATGA 4RNSA 3RY3A 2H98A 3EHSA 5KDTB 3K6XA 5I58A 4JBZA 1JVYA 3I5OA 3TFLA 3VDFA 4F39A 3CRBA 4WEPA 4AB5A 2QS3A 2QS4A 1Y4CA 3A09A 4LONB 2Q2CA 3PMXA 4KYSA 1JW1A 1N3WA 2B3FA 3FASA 4PFYA 3HHFA 3ODBA 2CMOA 2B65A 2O1MA 3LSWA 2DXRA 2FNCA 5DEXA 4P0IA 4FEBA 3Q26A 4LVQA 5CMBA 1P1NA 1BKAA 3C34A 4IO4A 2QPQA 3C32A 4ESWA 2HXWA 1B3FA 2XXHA 2XHDA 1NNPA 3P7IA 3TELA 2ZNSA 1I6AA 2NWJA 3GLBA 4ZDMA 1US5A 3PGFA 1R6ZA 4ZEKA 3B7DA 2HCAA 4FJPA 1LFIA 5HPQA 4JXIA 2F34A 2P2AA 2UYFA 1NNFA 4RY1A 5EHMA 3CFXA 1SW1A 3G3HA 3TUSA 5K2XA 1P99A 1US4A 2GHBA 2ZNTA 1FTJA 3IORA 1IUDA 3K1MA 1N84A 2NVUB 1DTGA 2DSFA 4M1VA 3O66A 1O63A 5ICQA 5AA4B 3TEPA 3EF7A 4U4SA 3UP9A 1IIWA 3MAMA 1QKBA 3TTLA 3OO8A 1URDA 4JWOA 4NF4B 2RINA 3OOAA 3HN0A 3ILTB 1QVSA 3GBBA 1D9VA 1B1HA 2H9BA 4AQ4A 2OLBA 3KSXA 1H3DA 4PE5B 2XD2A 4RYAA 3E3KA 4YMBA 2UVGA 1Y3NA 4MLQA 4XXUA 4C1TA 1FQBA 3TODA 1XC1A 3AXFA 1MQGA 4YB7A 3DP8A 1MY2A 1EH3A 1MXUA 1Y1MA 1ZMGA 2NUVA 4JSOA 2OZZA 1ANFA 2Z8FA 1ZKBA 3LSFB 1B4HA 3U94A 3B6TA 5H8SA 4TLLB 2HZKA 2XX8A 3TQLA 3EHTA 2DVCA 1SQYA 4NF6A 1ELJA 3G7WA 4OHNA 1XVYA 1B5IA 3H7MA 4F1VA 4N07A 3UN6A 4O3BA 2HFBA 4HS7A 2XX7A 1USYH 3C9HA 4KCCA 2GRVA 3IJXB 2I6EA 3T9HB 1FQDA 4QSEA 4H65A 1Y4TA 3FJGA 1H44A 1P1UA 4G68B 3FD3A 3H6VA 2ONSA 4LQ2A 3KJTA 1MG1A 2DP8A 1P1QA 3A3CA 2W7YA 3PD9A 4XKQA 1T0KA 1TT1A 1UTHB 3M8UA 3ZKKA 4OERA 4LATA 4U21A 4R9FA 2ONRA 4AB6A 3RGYA 5I2NA 2XXPA 5FHMA 2G29A 1A55A 3IOWA 4RPNA 1GV8A 4ND9A 5KCJB 5EHSA 4EF1A 3EN3A 5AA1A 1F9BA 4R6HA 1JW4A 4U2RA 3JYRA 3TTKA 3K2DA 4BDOA 4IO5A 1B40A 2DVZA 2VOZA 1HSLA 5B70A 5AA2A 1BP5A 4QHQA 1RYXA 3ZKLA 4KPTA 2ESNA 1TFAA 1AL3A 5ISUA 1N0TA 3H6UA 1B3HA 2UVHA 4LZ7A 3KJ7A 1LAHE 4KQPA 3EQ1A 5DYHA 2O7UA 2Y7KA 2PT2A 2GHAA 3V5AA 1LB8A 1B7HA 2X26A 1R9QA 1Z7NE 4P11A 2DQVA 4QSCA 5JEIA 2E0SA 3VLVA 2ZXTA 3K02A 4X1DA 3UORA 3Q29A 3N5LA 4GXAA 2O68A 3PMVA 1IZ1A 1IEJA 2H4IA 1OVTA 1MDP1 4LZ5A 3U93A 5CMCA 3PUXE 3KOTA 1EZ9A 4IB2A 3S9MC 4WEDA 3FXQA 4U4XA 2PVUA 2YLNA 1XOCA 3HHGA 3HCQA 3PUVE 3THIA 2DS9A 5M2VA 5HM4B 1PC3A 5TP9A 3PUYE 4HCWA 3R7XA 4G4PA 1MXXA 2F7BA 2V93A 1FQFA 5JTYA 3S4UA 2HQ0A 2LAOA 3TTNA 1GTKA 1VE4A 4QF9A 2PX1A 3LUYA 4DXUA 3I6VA 4DE8A 3TCFA 2YJPA 3H03A 1IXHA 4DCXA 1B05A 2OK2A 3G3GA 3PU5A 4I9DA 1B3EA 3OO7A 3K6UA 2VP1A 5A5XA 3W9VA 4H67A 3U72A 4DZ1A 5CBRA 3MPKA 4LZ8A 3CFLA 2F36A 3RN8A 3V8XB 1FW0A 3MZBA 3T96B 3T66A 3PPNA 3IL1B 2F7AA 2HEUA 2GH9A 1LAFE 4HW8A 5AE4A 1TWYA 5L9MA 1M5FA 4OXVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XWVA 1D9YA 4OESA 1BIYA 2ZYMA 2DOJA 3PTYA 2AL5A 1PDAA 2O51A 2O69A 1NUZA 2I4CA 1IMCA 1MY0A 1MPCA 3FV1A 4GOTA 4KI0E 3FVOA 1YCJA 4NF5B 3BKIB 4ZEBA 2XXUA 1Q35A 1URGA 2Y84A 3DP4A 1IMFA 1IMEA 4H6DA 4PAKA 4XFEA 4QFNA 1POTA 1PB8A 5LDZA 1UQWA 4OETA 3KN3A 1QW0A 1NKXA 2R9JA 4QRZA 5IKBA 1MY4A 3KC1A 3M3LA 3A3UA 2FVZA 1EZOA 2F5XA 3O6IA 1TFDA 4N13A 3H4ZA 1D4NA 2MKZA 2XXKA 1B5HA 4Z7EA 2CZHA 4KYDA 5IZ1A 3MC2A 5I5PA 4THIA 4YKKA 4N81A 3TPAA 1R1NA 3M3KA 2FYIA 1FBHA 4DDDA 4YB5A 1WDNA 1FTOA 4KR5A 4MX6A 1SPIA 4YU0A 3Q25A 2FHYA 1QUJA 4OVRA 2PFZA 1PB7A 2AYSA 3WAFA 4Q5TA 1OMPA 5A5LA 3HFUA 1PBQA 4NG7A 3VFJA 4QXDA 3S9EA 4O7IA 5B7DA 1NMUA 3CG1A 4MFIA 4MEVA 3OEMA 4IGRA 1LCFA 3VVEA 4OVPA 3G3JA 1MM6A 3H6TA 1P1OA 3GYYA 2QL3A 3OENA 3SZPA 1FQEA 4LP2B 1JNFA 3K6WA 4NF8B 1MXYA 4I62A 1DPEA 2Q2AA 1XVXA 3MQ9A 2XXTA 3F11A 2QS2A 4FEDA 4PFUA 2OWZA 3ROJA 1FQAA 3QUJA 3TTRA 3CFZA 5H8FA 4E0XA 2QMWA 4OA4A 2A5TA 3QAXA 2HAUA 4N4UA 4DI4B 1SYIA 3Q28A 4H1XA 3QUFA 5AA3A 4POWA 4XTCQ 5I57A 4GX4A 4MMPA 2X7PA 1FBFA 1N3XA 3UK4A 1LGBC 3KG2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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