1FQFA

Crystal structures of mutant (k296a) that abolish the dilysine interaction in the n-lobe of human transferrin
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
Knots found
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
DKTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFADSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLREGTC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures and iron release properties of mutants (K206A and K296A) that abolish the dilysine interaction in the N-lobe of human transferrin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SEROTRANSFERRIN
total genus 95
structure length 329
sequence length 329
other databases KnotProt 2.0: S
ec nomenclature
pdb deposition date 2000-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1fqfA02
1I69A 5BWJA 4EUOA 4ZE9A 4ELOA 3MP8A 3IOTA 3VFJA 4G8MA 1NKXA 2GHBA 1FQEA 2F7BA 3CSBA 3GZGA 2V3TA 2O69A 3DP8A 3GBAA 4GD5A 4KD5A 2ZYKA 5CMKA 4F2QA 4IO4A 2ESNA 3EPEA 2HQ0A 5CC2A 3G3KA 3Q28A 3DP6A 2O7UA 4U1ZA 2DYXA 4ESXA 3CFZA 3RTWB 3PUXE 4YB5A 2X7QA 2Y7RA 4F3GA 1WVJA 3IJXB 3OO6A 1H44A 2Z8EA 1LAHE 1LSTA 1GGGA 4OZ9A 4AB5A 2F7AA 1SBPA 4DXUA 4GIZA 4G4PA 4HW8A 4MLQA 2DE3A 4ELPA 2D5WA 1Z7ME 2E0SA 4DCYA 4KQPA 4GLIA 1EZPA 4DXBA 4PFTA 1OQGA 1CB6A 3ODBA 3KOSA 4GL0A 5L9OA 3E4RA 3OO8A 5LOMA 4KCDA 4F22A 1Y4CA 1B9JA 3KN3A 4FAJA 3CRBA 2Y7IA 5FHMA 1MPCA 1L5TA 1FQFA 3ZSFA 4XXUA 4R9FA 2P1SA 4FECA 3H6TA 1JW4A 4MLVA 2Q88A 4PQJA 5H8HA 4KCCA 1B1XA 4H67A 2AYSA 2NOOA 5J1DA 3R26A 2PBWA 2PYYA 1MG1A 1BP5A 2FYIA 4IY5A 4TOZA 5AA2A 1MQHA 2NVUB 2KLFA 1M5FA 2ALUA 1SW1A 3T9XB 4MFIA 1Z7NE 3WAEA 3SDFA 4P0IA 1FQBA 3KJ7A 2F6PA 4RYAA 3UORA 2R71A 4H6DA 3RGYA 4HTGA 4NWCA 1MY3A 3SETA 5H8HB 2XXQA 4DIGA 3CI8A 1GTKA 4GVOA 2XXUA 4H8JA 3DLNA 3K0VA 3PPRA 3VLVA 4H8IA 1NNTA 2O1MA 3PD9A 3T9UA 3EN3A 5AA2B 3JZJA 2DE4A 1FQAA 2F34A 3V83A 3IORA 1UTBA 2XXPA 5CRYA 4H0WA 1EZ9A 1B3LA 3RPWA 1ANFA 1MPDA 1B3EA 5KCJA 3MVXA 3KG2A 4AB6A 1D3KA 3SEYA 4RA1A 1MY1A 4G77A 3CG3A 3VLUA 3TCGA 1FTJA 1ZKBA 3M3LA 3MUQA 1ZBMA 2DOJA 3LSLA 1MDQA 1SW4A 3JV9A 3O2AA 5AA4B 2OZZA 4KR5A 1XOCA 2V25A 1GVCA 3TTMA 4R6KA 4KFQA 5TP9B 1JQFA 3EHTA 2ZYOA 1B5HA 5IAIA 5KCJB 4I1DA 1QVSA 4X1BA 4XKNA 1A8EA 2HZLA 3FVOA 4THIA 5TU0A 1RYOA 3K2DA 2DXRA 1B40A 1LAGE 4LUBA 3B6TA 3PV0E 1B2HA 1P1OA 2DP8A 4BDLA 3TTNA 2HEUA 3Q25A 2UXAA 5H8SA 4F19A 1F9BA 3PPNA 3I6VA 1JVXA 1FTKA 1S9TA 1JVYA 4O3BA 5AA1A 1XVYA 4KHZE 1QULA 3GXAA 2XXYA 3VLWA 2Q8JA 3EHUA 4NE4A 4U22A 1MDP1 3N94A 1IXHA 4GL8A 1PB7A 4NF4A 3QAXA 1FTMA 3MQ9A 3FJMA 3SERA 5H8NA 3JYRA 1IITA 1OVBA 2ANJA 1FQCA 4OEVA 1VR5A 3ILUB 4BDMA 3M3FA 1WODA 4Q5TA 5JEIA 3MP1A 3RN8A 4H5GA 5I57A 5FTIA 2DWAA 4OENA 4G8NA 1AMFA 1QUKA 3CR9A 1QUJA 3B6WA 1LCFA 4X1DA 3VV5A 1POY1 4ZZEA 3MZBA 5I84A 1BKAA 4RK2A 3ILTB 4NMYA 4NF4B 4JB7A 1LAXA 4YKPA 1B58A 4N6PA 3CG1A 5H8NB 1S50A 2UYFA 3W9VA 3F11A 5A5XA 3FVGA 4WKMA 1Q35A 3IOUA 2O7IA 3O6HA 5JTYA 1RKMA 5I59A 2IA4A 3VXCA 3FIRA 2P0SA 5I57B 4R6YA 3MPKA 4OQOA 4P0GA 1ZU0A 3LSXA 2D3IA 5B70A 5DEXB 1B0LA 5I2KB 5KZTA 1N7XA 3KBRA 3PUVE 4OETA 2UYEA 5I58A 4TLLB 4JXIA 4OVJA 3SEWA 5F7VA 4X9TA 1IUDA 3O9PA 3W15C 1OLCA 4QFNA 3VDFA 3C9HA 5CMBA 5JTYB 5I59B 4I8CA 2UVGA 3OSQA 3O97A 1SQYA 1N3XA 2I0CA 1A99A 4EF1A 1B32A 3S4UA 2DQVA 2QRYA 1B05A 2HAVA 4FATA 2B65A 1Y9UA 2PX1A 1M5DA 3PPPA 3LR1A 5I58B 2I3WA 3IB0A 4OTEA 1PC3A 3K02A 5I2NB 3KFMA 1YPNA 3HHGA 3MZ9A 4GXAA 1LB9A 3HO7A 5L9SA 4U1OA 4ELQA 5TPAB 2Q2CA 3TCHA 4RPNA 3SEXA 3FV2A 4GXSB 4DZ1A 4Z7EA 2QMWA 2VHAA 5B7DA 2Q9TA 4XKPA 5IKBA 1J1NA 3RLFE 1SD3A 4KYDA 4I9DA 4PP0A 2ABHA 3TUSA 2CZLA 2UVHA 4Q0CA 1VFDA 3RY3A 2QJEA 2DVCA 2F6GA 3C36A 3K6UA 3TODA 3G3JA 1A55A 2DWIA 1I6QA 3H4ZA 1B5IA 1GV8A 3IB1A 3L6HA 3IL1B 4U4XA 3BBRA 4ND9A 1NH7A 4FEDA 1LB8A 1DTZA 4NF5A 3PPOA 3OMBA 3UN6A 1NMUA 2F78A 3T9HB 3G7WA 3K00A 4Q30B 3TFLA 5EHMA 1Y3PA 5HM4B 2VOZA 2RKMA 3IB2A 3IK6B 1B5JA 1VFEA 2M8CA 4LP2B 2ZNSA 3HV1A 3UK4A 2NUVA 2VD2A 5CBRA 1TXFA 1JW1A 3H7MA 1LFHA 2PT1A 2AL5A 2XXWA 2ONRA 4YAHX 3LUYA 3PD8A 1OQHA 4QHQA 4DE8A 1AOVA 2Z22A 5DTBA 2DE2A 1DPEA 3PUYE 1RYXA 5H8FA 4F31B 4PFYA 3OENA 5BUUA 4NF5B 3TTLA 4UACA 3BFUA 4F18A 1MXUA 4ELRA 2HCAA 4OWDA 5ITOA 4QFLA 1MQJA 2ZNUA 2REJA 3V5AA 1D9VA 1AIVA 2XXRA 3HPIA 4OHNA 2IEEA 3QXMA 2O1LA 4QFKA 1IXIA 4QSDA 1VE4A 3KGCA 2V84A 5L8DA 1XC1A 5H8FB 3MAMA 1DSNA 3MJNA 1B6HA 2QS2A 3PPQA 4XIGQ 3SEUA 3KOTA 3LBSA 3W9WA 1PDAA 1NNFA 4IGRA 2HAUA 4F3PA 1R9LA 3RNNA 2H99A 1SYIA 3S9EA 2FA7A 1P1UA 4FJPA 3R7XA 4WEDA 1TWYA 2F97A 2H9BA 1Y3QA 4FE8A 4F1UA 1GR2A 4EDPA 1TT1A 4N13A 5ITPA 5AA3A 5AA4A 1QKBA 3EF7A 4R9GA 1A54A 3DM0A 3ZS6A 2OK2A 3K1PA 3TDJA 3FASA 5TP9A 3OELA 4YMBA 2OJTA 3PMVA 4X48A 3O28A 4QFPA 2VD3A 2I4CA 3E3KA 1MXVA 3A3UA 1QW0A 5K2XA 1B7UA 2DWJA 3E13X 3LC8A 1USYE 2RC9A 2B3BA 4IO2A 2X7PA 4E0XA 2GHAA 3VXBA 4BLAA 3SESA 2O68A 1Y1MA 2H25A 1YAEA 1JW5A 4OMBA 2P2AA 3PMXA 1KWHA 4I62A 4PE5B 4EXKA 5FTHA 3RTFB 4LZ8A 2RCBA 2Y7WA 5JK4A 3K4UA 2ZYNA 2Z8FA 4HCYA 3QYTA 3S2VA 1H45A 2XD2A 4JDFA 1MQIA 3DELB 1D4NA 2V3QA 1QKAA 5DYHA 3THIA 3T93B 1O7TA 2YLNA 3OSRA 3H06B 3H3GA 1MQGA 4ZECA 1MS7A 4NTLA 1US4A 1Y3NA 3HSTA 4M1VA 1Q1KA 2RCAA 2F36A 3P7IA 3QIMA 3KSXA 4KI0E 1Y1ZA 1BLFA 2AL4A 3OOAA 1SW2A 1OMPA 4MBPA 1JETA 3FUZA 4HS7A 4R72A 4UA8A 2B3FA 3G3HA 1Y4TA 3FVNA 3OEMA 2QS1A 2R9JA 2H5YA 2F5XA 2QPQA 3B6QA 1SI0A 3C32A 1AH5A 1PBQA 1A7LA 4ESWA 1JEUA 4GWOA 4R2FA 3MBPA 3H6WA 4OESA 4F1YA 4GRKA 3U72A 2A5TB 1FQDA 3O6GA 1UIVA 4O3AA 4RNSA 5DEXA 5I2KA 3B7DA 3TQLA 3MC2A 1P1WA 1MH3A 5DVFA 2DS9A 4RPOA 3Q27A 4ECFA 3TYHA 1YTVA 4R73A 3KN8A 1ATGA 4KYSA 1FCKA 1MH4A 2R6GE 5H8QB 5ICTA 2PVUA 1USYH 1NH8A 2XHDA 4Q8RA 1PBPA 4C1UA 4O3CA 3EHSA 5CI5A 5CBSA 3O29A 3TMGA 3WAFA 4POXA 1N3WA 4M4GA 4F3SA 3KSJA 4OEUA 2QS3A 4MF3A 2GRVA 3FATA 4F3BA 3GLBA 2X26A 4IGTA 2QMXA 4NF6B 2CMOA 3UIFA 4TQUQ 4OERA 4ZEBA 3U93A 5I2NA 4R75A 4JWXA 3H6VA 1QJMA 4EQ9A 1UTHB 1OIBA 4JSDA 1URSA 4BDQA 3OO9A 1N04A 1B7ZA 5TPAA 3FJGA 3MWBA 5CM6A 2RC7A 2QL3A 4F39A 3G3GA 1MY2A 5DVIA 1H3DA 3G3FA 3K6VA 2D21A 4NF8A 3IR1A 5FHNA 2W7YA 2XD3A 2XXXA 3OEKA 3AXFA 4ZEIA 1R9QA 2F8DA 5HBCA 3Q26A 3KJTA 1SVXB 1M5BA 1HSLA 5AE4A 4DXCA 3QK6A 2V3UA 1NNPA 4U2RA 5ISUA 2XX7A 3KZGA 4C0RA 1LBCA 3CFXA 5CMMA 4NEDA 4EF2A 1B7HA 3U94A 4PETA 1B51A 4NF8B 1I6AA 3ZKLA 4IO7A 3TZAA 4H5FA 2Z8DA 1PB8A 4NWDA 1URGA 4POWA 2OCUA 2I48A 3N26A 3T9VA 4U23A 1YCJA 1LGBC 3K01A 3BFTA 4YKKA 3TKDA 4EXLA 3S9LC 4OYVA 3OXNA 2YJPA 3TEPA 4G68A 4ZE8A 2HZKA 2Q89A 2ONSA 4GF8A 4YMAA 3IX1A 3TTKA 2I49A 1B52A 1LCTA 3M8UA 1IIWA 2XX9A 3C33A 3IAZA 3HCQA 5EYFA 3IO4A 4GQOA 1EH3A 2O51A 3VVEA 2LAOA 3PUZE 3M3KA 1ZLQA 1Y20A 4AQ4A 2PMSA 1OVTA 2OWSA 1QUIA 2I4BA 3QUFA 2REGA 4G68B 3MVYA 3N6TA 5DT6A 4LA9A 3D4CA 1LAFE 4BDOA 1P99A 2OLBA 4ZS9A 3SEVA 1LBBA 5AA2D 4MH5A 3A09A 4PFWA 1A40A 3D4GA 4IO6A 4QSEA 2ZMBA 4G8HA 3FXUA 2HXWA 4XKQA 3FD3A 1N84A 4YKJA 2I58A 3LSFB 1SDXA 4FEBA 3FGSA 4LZ7A 1XVXA 3UGWA 3N6UA 1ZJLA 5HPQA 1TFAA 1DOTA 1H43A 2GFEA 3U92A 1HSEA 3KEIA 1EU8A 3V89B 3LSWA 3L6GA 3ONMA 4LZ5A 2H4IA 2UVIA 3MVZA 4ZEDA 3GBBA 1FTOA 2AIXA 3ZKKA 1B3GA 2RC8A 4C1TA 1MY0A 4L17A 3Q29A 3BKIB 4OFJA 2RINA 2XXHA 3T22A 3C31A 3RT8A 1TFDA 4JWYA 3QSLA 1B0HA 2NXOA 2G93A 3ECRA 3RQTA 4N07A 4LQ2A 1MQDA 2GH9A 4R6HA 3RT6B 4QSCA 4ZDMA 2DVZA 4E0WA 4ISUA 3KN7A 1B3HA 1PEBA 4U4SA 1B1HA 4JWOA 1S7YA 1IXCA 3PGFA 3VVDA 3U1OA 1IEJA 2O84X 4DCXA 4EQBA 3TAJA 4JSOA 3EQ1A 4F29A 4OXVA 1NL5A 2I3VA 1N76A 4R74A 1IXGA 2Z23A 1B4ZA 2ZXTA 2I6EA 3I5OA 4R2BA 3QUJA 1PB9A 2XXTA 2O6AA 3K1MA 4RK9A 1HSJA 1POTA 1WDNA 5K2YA 4GOTA 1URDA 1P1QA 4ONYA 2PT2A 3UA8A 2YPNA 1NFTA 1MXWA 4WXJA 1LLSA 3PU5A 2Y7PA 4QFOA 1DTGA 4OFOA 3S9MC 3CIJA 1XT8A 4RXLA 3MPLA 2V93A 3PUWE 1UTBB 3H6UA 2UVJA 2F7CA 4FORA 1ELJA 2QSXA 3MZ1A 3U8QA 3E9XA 3H03A 3I3VA 1II5A 2ONKE 3VE1B 1FTLA 5F1QA 1P1NA 3V8XB 2VGQA 4DLDA 3IOVA 4H1XA 3K1NA 2NWJA 1JNFA 5M2VA 1N0TA 2A5TA 3MVWA 1H76A 1UIUA 4G2ZA 3FXRA 4IB2A 4F2OA 1LFGA 1M5EA 4YB7A 1MRPA 3RUMA 3R6UA 3PMWA 1CE2A 4LQ5A 4BDNA 1AL3A 1D9YA 1UQWA 4IY6A 4YZZA 4RY1A 1IZ1A 1LFIA 5FHOA 1DPPA 5H8QA 1NNKA 3CFLA 3MW0A 4RJZA 3TCFA 1N7WA 4H65A 3MP6A 5I56A 2DWHA 3IJOB 4KPTA 5CMCA 2HFBA 1MXXA 4TLMB 1MPBA 4G68C 1XS5A 4WEPA 4EQ7A 1FW0A 3FZVA 3DP4A 4DDDA 4ZEKA 4NF6A 3TELA 4YU0A 2BJJX 1MM6A 4OFLA 1BIYA 1VSOA 4LONB 2ZNTA 1O64A 2THIA 3FV1A 1EZOA 3IOWA 3TPAA 1UTHA 4JBZA 3USDA 2RF1A 3T66A 3HHFA 4KYEA 1MM7A 1MY4A 5I56B 4FIMA 3FXQA 1SYHA 3VVFA 4Z0IA 4ZEFA 5EHSA 3T96B 1DMBA 5KDTA 4IO5A 4GFRA 3K6XA 4HCWA 3SKPA 3CSGA 1ZTYA 3TTRA 3C34A 2A5SA 3S9NC 3UP9A 4F1VA 2Q2AA 2XXVA 5ICQA 4QF9A 1XHYA 1SW5A 3HN0A 2XX8A 4IO3A 4LATA 1US5A 4YKIA 4K3FA 1B46A 4BDRA 3CVGA 3C4MA 1O63A 4LVQA 1T0KA 5A5XB 2WKYA 1I6BA 3N5LA 3A3CA 4YB6A 1M5CA 2OWTA 5ELVA 3G3IA 3OD7A 2OBGA 2DSFA 2VP1A 4PFUA 5KDTB 1MXZA 2I0BA 5L9MA 1ZIUA 2E1SA 4U21A 5DVJA 1A8FA 3FVKA 4ZZAA 1B4HA 3O66A 2DXYA 1MXYA 1JEVA 1OLAA 3C35A 3TQWA 2XXIA 3FJ7A 4XKRA 1IQ7A 4P11A 3IO6A 3O6IA 3K6WA 2ZYMA 1SI1A 4XTCQ 4QRZA 2QS4A 2Y7KA 1BTJA 2FNCA 1B3FA 2G29A 1ZMGA 2F35A 2H98A 2Y84A 1R1NA 3OO7A 4YICA 1R6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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