1FWT | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	263
structure length	263
Chain Sequence	EKFLVIAGPCAIESEELLLKVGEEIKRLSEKFKEVEFVFKSSFDKANRSSIHSFRGHGLEYGVKALRKVKEEFGLKITTDIHESWQAEPVAEVADIIQIPAFLCRQTDLLLAAAKTGRAVNVKKGQFLAPWDTKNVVEKLKFGGAKEIYLTERGTTFGYNNLVVDFRSLPIMKQWAKVIYDATHSVQLPGGLGDKSGGMREFIFPLIRAAVAVGCDGVFMETHPEPEKALSDASTQLPLSQLEGIIEAILEIREVASKYYETI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Substrate and metal complexes of 3-deoxy-D-manno-octulosonate-8-phosphate synthase from Aquifex aeolicus at 1.9-A resolution. Implications for the condensation mechanism. pubmed doi rcsb
molecule keywords	2-DEHYDRO-3-DEOXYPHOSPHOOCTONATE ALDOLASE
molecule tags	Lyase
source organism	Aquifex aeolicus
total genus	91
structure length	263
sequence length	263
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.5.1.55: 3-deoxy-8-phosphooctulonate synthase.
pdb deposition date	2000-09-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00793	DAHP_synth_1	DAHP synthetase I family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1fwtA00

3S9YA 1YDNA 4UFIA 1TRDA 5DELA 3CTLA 1Q6QA 1IXOA 1K8ZA 2CLFA 3TXVA 1GTHA 2E6YA 4M6PA 3N9SA 3LI0A 3L66A 3V1PA 1FWTA 3PG8A 4AB4A 4TO8A 1QPRA 3UNDA 5G2WA 2X1SA 1GZGA 3GNDA 2H3DA 4MLJA 4UTLA 3DFOA 2GVGA 3G8EA 4AF0B 2QJIA 4JGDA 1C9DA 1OYAA 4PEKA 3IEBA 7TIMA 3P84A 4Z08A 1QOPA 2A6LA 4N9EA 1FWNA 3OEXA 5EBUA 2Z6JA 3LBMA 2YW4A 2QCLA 3MP3A 3W2MA 1XDMA 3LRLA 5LGXA 1MEIA 2VXNA 2RHGA 3PR2A 3BW4A 4DF0A 4RK8A 4QQ3A 3SIZA 4LS2A 1F74A 4QNWA 2X1RA 4L4LA 5H91A 1HTIA 3QC3A 3B8DA 4NJKA 4JEQA 5AFDA 2OZ0A 5DBTA 3SR7A 4AAJA 1UBSA 3TK7A 4RXGA 1CI1A 5EYWA 5C55A 2Y63A 1Q6OA 4WD0A 2DZSA 2ZRUA 4UFMA 2PCQA 1DV7A 4MFEA 3G1SA 3CEPA 4MJZA 4JX6A 5LSMA 3M0ZA 1H51A 5CZSA 4JX5A 4CNNA 1RQBA 4WY0B 3FOKA 4N2YA 3FKKA 2WNQA 3NEVA 3CHVA 3EB2A 2X16A 4JNMA 4A22A 1ALDA 1AMKA 4UIOA 4AWSA 3EKLA 3THAA 2A7RA 1TPDA 3W1UA 8TIMA 4LOCA 1TPUA 3HF3A 1G4SA 1QDSA 4OHQA 4RKAA 1ZAHA 1BWKA 2DZUA 2ZDRA 1YXDA 4LW7A 4R34A 1EP1A 1FCBA 3KRUA 5I3IA 3IRDA 1VCFA 3NQFA 4ORIA 1ME8A 3QPZA 3HGJA 4JTJA 5HINA 2ZZ5A 1W0MA 3S1WA 4PC8A 3QQ1A 3L67A 3RMJA 3IIVA 3QM3A 4Q32A 2PURA 1JQXA 2V2CA 3GIYA 3TC6A 4BK9A 4PL1A 4HHPA 3ATYA 1XFBA 1Y0EA 3W1NA 3TW6A 4JDBA 1VYPX 5D37A 5HR6A 4AWTA 5D32A 1LYXA 3W1XA 2J9ZA 1WDWA 3IV3A 1H61A 4RJEA 4AHPA 4JTSA 1T8XA 3W7EA 4AHQA 3LBCA 4JIPA 3W9ZA 1DOSA 3S5ZA 4PA8A 4N9BA 4HPXA 4OBTA 3V75A 3TU9A 3A5VA 3TROA 2HMCA 2V5BA 2Y70A 4X2RA 1ZALA 2NUXA 1G7VA 3NQGA 1OFDA 3W6YA 2VFDA 1G6CA 3EXTA 4KFNA 2VENA 1RD5A 1OFOA 2ATMA 3M5XA 4HPJA 1JCYA 3G1DA 2Q3RA 1PHQA 1MXSA 3BLEA 3G24A 3R5EA 3W07A 4IX2A 4NX0A 3OA3A 1W8SA 1O60A 2NZLA 2ZZ3A 3Q58A 2VELA 4DXVA 5D05A 1WX0A 3HGSA 4JR5A 2TRSA 1W54A 3LLFA 4JTKA 3B05A 2EKCA 1FBAA 2E5DA 5EL1A 3P61A 3W70A 3P80A 4LV9A 2BLEA 4ZVJA 3EWWA 2EPHA 3O1NA 1OYCA 1Q45A 5U7SA 1TPFA 1R47A 4O52A 2VEIA 3DBPA 3F4NA 1PS9A 2CZDA 2OMAA 1PCKA 1WV2A 3W7NA 4CCEA 1XI3A 6TIMA 2FPVA 3C0JA 4WQ6A 4JD4A 2YFOA 1R2SA 3WK0A 4K8HA 5KMYA 2QDHA 3DHFA 3P7YA 1M7PA 3C2RA 4OV9A 3BO9A 4GXMA 3H54A 2DJXA 4M6VA 2P10A 4R7JA 3L21A 1YPFA 2YW3A 3L9CA 3H53A 3HG5A 4RR4A 3TX9A 1PE1A 4QSHA 3T40A 4TU1A 4H6KA 3HO8A 2A0NA 3L0NA 1VR6A 2H8ZA 4I9AA 2YGYA 3O06A 3FYPA 3GZ3A 3BW2A 4HNNA 1SQ7A 3TSDA 2QR6A 1AL7A 1N8FA 3W71A 3HB9A 3T78A 2B7OA 1VHCA 3OVRA 1WXJA 1LM1A 1EP2A 3ABRA 2E77A 1IXNA 1W5OA 4UTTA 4MFDA 4CNOA 3ZS4A 2HTMA 3CQ0A 3L0GA 3C2FA 4IOTA 3TW7A 5D03A 2ATSA 4LVBA 1LBMA 1M5WA 1X8FA 3S1VA 4N4PA 2RDUA 1YPIA 3UXDA 4FO4A 4LY8A 3W1PA 1CX9A 2CZFA 1W3IA 1D3HA 3NQAA 1L6WA 3SY5A 3FJ6A 5AOUA 4K8EA 2A7PA 2NV2A 3TC7A 3W2JA 2V2DA 4AXKA 3M7WA 2H3BA 5C2XA 2AQWA 1SW3A 3W2NA 1OK4A 4A21A 2B7QA 1AG1O 5BW6A 3U2OA 3QQ0A 1FQ0A 1IIGA 4LNYA 5I3GA 4AEOA 4JTLA 3UWYA 1KM4A 1TCDA 4IQLA 2TSYA 1OJXA 2VEMA 2VEKA 4MYXA 4UTJA 1WYIA 4X3ZA 3IIZA 1KV5A 5F2LA 4EVZA 4AH7A 4UFHA 5AHEA 3LCIA 3T44A 3LHZA 3MO7A 4ZQCA 3LTYA 5CGQA 4O1CA 2E5CA 4QJ1A 5ABTA 4DBEA 2E5BA 4ZL1A 1OG0A 3F1QA 2E6AA 5CZTA 4UR7A 2A21A 3AO0A 1FY6A 3CWOX 1H1YA 3PULA 3VKJA 1FWWA 1G4TA 4U4MA 3G22A 3STFA 3CPRA 4XZ9A 5CZJA 1ME7A 4ICNA 3M5VA 3NGJA 3G0SA 4A29A 2FFCA 3QYQA 1S3HA 3RK8A 3W1AA 1TTIA 4JS3A 3NM1A 2ZRXA 1B4KA 4UR8A 2NWSA 2CLKA 1KBIA 4BFAA 4Y9AA 2Y89A 3W2UA 1UJPA 1W3TA 2YR1A 5TQLA 2C18A 3M47A 1NEYA 1KM3A 3G0UA 1T0OA 3W7OA 3FA5A 2BZNA 4DPPA 2OT1A 3W7JA 4FNQA 1TV5A 1XBZA 3LOTA 1DORA 4RZ5A 1RQHA 1OX5A 5KZDA 2P0OA 3A9IA 3NQ2A 4O11A 3C6CA 3T55A 1KA9F 4LVFA 5CPNA 3USBA 1XCFA 5EPDA 4TMCA 3WK3A 3TMQA 3NL3A 2YZRA 2PRMA 4IPJA 4PFMA 2OT0A 1M6JA 4CCCA 3LV5A 3I65A 3EXRA 1QNVA 3STEA 4K37A 3O16A 4YCOA 5DLCA 3KRZA 4FIRA 3DU0A 1IGSA 4ZQNA 1FX6A 2BXVA 2Q3OA 2TMDA 1L9WA 1KTNA 3MP4A 3PY2A 4P2VA 4KFPA 3C2EA 1F73A 5LHEA 2V0TA 4Z1CA 4NJIA 1TREA 5H2ZA 2FJKA 4UMCA 4RXFA 3SW6A 3M16A 3B0VC 3HGOA 2H6RA 4Q33A 3UY8A 4WZHA 4JICA 3EWZA 2YCEA 3UXAA 4N4QA 3CEUA 1KM2A 3R89A 3INPA 5FEWA 2J88A 5KINA 5DCDA 3HOJA 3EWXA 3RFAA 4EF9A 4LRSA 3TV8A 4N6FA 3LXAA 3I68A 4K6AA 4M19A 2QCDA 2FQIA 4YL2A 4FX7A 4OWGA 3W1QA 1QO5A 3PVFA 4JTGA 2C3ZA 1OF8A 2GVLA 3NYZA 3A24A 2P1FA 4PTNA 1MO0A 3ZR4A 2V9DA 4GNJA 4IMCA 1H7NA 1Q3NA 4UTMA 4NNBA 1VPXA 5BMXA 2ABBA 2V5LA 5AHFA 3W7HA 2VFGA 5AYXA 2ZZ4A 3R2GA 4Y96A 2CLHA 1G69A 3MP5A 4M5PA 4O1AA 5D2XA 3TCEA 3DI0A 1EB3A 1KTCA 4FXSA 3THQA 2X30A 2VKZG 3NR0A 4Z0JA 2NUWA 4UNLA 2NWRA 2RFGA 1S5WA 1LRQA 2ZZ1A 3EX3A 1KW1A 4UFJA 3KVKA 3GXPA 5F2GA 1EPXA 3NXFA 3L5AA 2WOQA 5G5IA 1VYRA 2ISWA 3BLFA 3JRKA 3ZWSA 4BF9A 3PB2A 4WY0F 4GUFA 3CIWA 4NJHA 2LLEA 4HSOA 2QAFA 1FWSA 5D02A 4IX0A 3TSMA 1EWEA 5LKYA 3FJLA 1TPVA 3RLUA 5LGZA 3KVMA 1AK5A 3BG9A 1MSSA 5C54A 3NQ7A 2ZCGA 5FEZA 1RVGA 3SI9A 2JKPA 4O15A 2CU0A 1AW5A 3PB0A 3OIXA 1HL2A 2A4AA 4ONVA 2NX3A 5FF0A 5CSRA 2B7PA 3W72A 2HS6A 5G2HA 3WJSA 2YX0A 3AJXA 5LNVA 2XN1A 1KBJA 1V5XA 2DJLA 3QEZA 4KFOA 2FB3A 3MW7A 4QNEA 3W83A 4A2RA 3MI3A 2NV1A 5MHBA 1FDYA 3EX6A 1XKYA 4AHOA 4MY1A 1Z42A 1H7PA 3C52A 3KAOA 4YLWA 5HWNA 3HPXA 4GJ1A 1FDJA 4MZYA 5AHMA 2QCFA 3R12A 1NFBA 3BG3A 2BX7A 2RKXA 4OT7A 5KZEA 3D0CA 1QR7A 3LI1A 5D04C 5F1UA 5AN7A 3TR2A 4ADSA 3C2OA 1XM3A 3KFTA 4EIVA 3TE9A 3STGA 4IUOA 2XN0A 1TMHA 5AC7A 2NX1A 1FCQA 3L68A 3OHIA 4K39A 1X1OA 3P82A 4MYAA 4JIQA 5I3FA 4JTHA 3M5ZA 1JCXA 3EEGA 4GE8A 5F1VA 1B3OA 2Y6ZA 3O6DA 1H5YA 2QCHA 3HGRA 3CIXA 2WSRA 3MWAA 1ZENA 2A7NA 4IJBA 1GVRA 5AB3A 1PVNA 1K7XA 3KOFA 3WJXA 4DO5A 1R30A 5HR7A 2W0UA 3IGXA 4DO6A 4FNRA 3BGGA 2NLIA 3MYPA 2ISVA 4GWEA 1KTBA 4O50A 5FESA 1FWRA 4DQWA 3PAJA 5DY3A 4JN6A 2DP3A 4LTSA 3HQ1A 3SECA 4ADTA 3G0XA 4WOZA 3KHJA 4IMDA 2WNNA 3OVQA 2QEZA 1KFLA 3LLDA 2B7NA 3W7KA 4MKNA 1TPB1 3DZ1A 3NM3A 3O05A 4O14A 3WJYA 3TFCA 4LT9A 5G1TA 2QCDB 4FF7A 1TTPA 1NAL1 1OX4A 3UD6A 5E0KA 4KWWA 1OABA 2R8WA 1T96A 3QF0A 1ZNNA 5KSWA 4HNVA 3S1XA 3IIPA 3PM6A 3U8GA 2EGZA 2A2IA 5D2YA 2H8XA 5IBXC 3DENA 1XXXA 3BARA 1K03A 1OYBA 1YDVA 1A5CA 3Q2DA 5FI8A 1GPWA 4KWVA 1AW1A 1RV8A 2BTMA 3KX6A 3NPUA 5E1QA 1QFEA 3MYOA 3UWZA 1TPEA 5AHIA 4S2BA 2DU2A 5CG7A 1TSIA 3W74A 3B04A 4LUJA 3QW4B 4UFLA 1XBYA 5GVJA 1FDZA 1KM6A 5FEPA 3I7QA 1ICSA 4RZ4A 1OF6A 1P4CA 1SU5A 1KFKA 2W79A 5IBXA 4MY9A 3PWAA 5CPLA 5FF7A 2BWGA 3ANYA 1SPQA 1J2WA 3PSVA 3B0PA 1SSGA 5CPOA 3TXZA 4O4WA 3G8RA 1LOLA 1UUOA 3P8IA 4GC4A 2DORA 3PG9A 3HG2A 3UWQA 1SFJA 1GYNA 1KM5A 3NQDA 3P67A 4JYFA 1QMLA 3E49A 5K4ZA 3ABOA 3TA6A 2C15A 2DZXA 4ZQPA 3GDKA 3UWUA 4E2DA 1ME9A 1ICPA 2XN2A 4Z1BA 2RDWA 3KXQA 2ZZ7A 3OBKA 1LLWA 4HSNA 3PBWA 4FHAA 3VCRA 4GUHA 4CQAA 3TAKA 1Q6RA 3ABSA 2C14A 2ZQ0A 1DJQA 2VFEA 4LV4A 5K9DA 4E38A 4S2CA 4GFSA 5KITA 4UTKA 4AWUA 4FB7A 4FX8A 3UPWA 1XUZA 2O7SA 2VFFA 2CLMA 3B4UA 3EWBX 3LRMA 4JYEA 1O95A 4X9SA 5HWJA 2YFNA 3DFSA 3S42A 3ZFHA 2Y62A 3PUEA 4MJMA 5AYZA 2WSQA 4CQ9A 3QW3A 1W5NA 2WSYA 3LCFA 1H60A 2CLOA 2C16A 4BR1A 1SSDA 3GXTA 4TIMA 3CB8A 3G3DA 2FTPA 3QMRA 3E9AA 2GQ8A 3N73A 2QJHA 1JR1A 3G1AA 4JDYA 1K8XA 1UUMA 5F4SA 1ZHAA 2G97A 5E93A 1SZEA 3SZ8A 2QUUA 2YDAA 4N9CA 3QH2A 2QUTA 1TPC1 5D2VA 1TIMA 1GQNA 1RQEA 3ATZA 2QUVA 2EF9A 1PIIA 2ZRYA 1LRTA 3MBFA 4X22A 2WO5A 4AMAA 4NQ1A 4I7VA 3N34A 1J5TA 3LX9A 1KFEA 3TSBA 3BLIA 1KLZA 1OFRA 5A5WA 3W7RA 3LDVA 1KM0A 3OVPA 4PL2A 1P0NA 4MUZA 3P60A 3TQ0A 4M7TA 4FXRA 2RH9A 4JXCA 5IM51 3P5ZA 5LNUA 4FNUA 4NNCA 4WUIA 1EX5A 2JKEA 1YADA 3LCHA 3QFEA 3MI2A 1OHLA 2FPYA 3PF3A 3O6CA 4NJJA 1N55A 3C56A 1R2TA 3STCA 1O94A 1I2NA 1WQ5A 1LDCA 2ALDA 1GTEA 2NXIA 2ZA3A 3TJXA 3HMJG 1FCUA 3NPVA 1L2UA 1YDOA 1VHNA 1SZFA 2NXGA 5U4NA 2WKJA 1F5ZA 1JRBA 2ZRVA 4UUIA 1E51A 1W5PA 3HBLA 5I3KA 3QRHA 3A21A 3HG4A 3O6YX 4ZZ9A 3NL2A 3M43A 4O12A 4XBKA 3NNTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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