The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
16
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sequence length |
62
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structure length |
62
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Chain Sequence |
GTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution crystal structures of tyrosine kinase SH3 domains complexed with proline-rich peptides.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
PHOSPHOTRANSFERASE FYN
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| total genus |
16
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| structure length |
62
|
| sequence length |
62
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1995-05-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GBQ A; 1YCS B; 4GLM A; 2YDL A; 1XOV A; 1OPL A; 2QDL A; 5IHN A; 4EIK A; 2FPF A; 4IIM A; 3EHR A; 1NEB A; 2ECZ A; 2M51 A; 3U23 A; 1ZBJ A; 1SRM A; 1NYG A; 2FRY A; 1LCK A; 2L0A A; 1WI7 A; 4J9D A; 4RTT A; 2RF0 A; 1PRM C; 3KFV A; 5IHK A; 4JPB W; 2CRE A; 4LUD A; 1ZX6 A; 2LJ1 A; 4HCK A; 3EG3 A; 1SSH A; 1SEM A; 3RBB B; 1TG0 A; 2KRM A; 3TVT A; 3VS4 A; 3H0H A; 4OMM A; 1UE9 A; 1PKS A; 1FYN A; 2OAW A; 3M0P A; 1RI9 A; 1PHT A; 2A08 A; 2B86 A; 2KRN A; 1GCP A; 4J9C A; 2ROL A; 2GQI A; 2K79 A; 1ABO A; 3UA6 A; 1T3L A; 4X1V A; 3I5R A; 2K7A A; 2YUN A; 4HVV A; 1NLP C; 1HSQ A; 1AEY A; 1VYV A; 2DRK A; 2DL7 A; 2XMF A; 2C0T A; 4ZNX A; 1N5Z A; 1UJY A; 2EGA A; 2EPD A; 3UF4 A; 2EBP A; 4DEY A; 1GFC A; 3H0F A; 1UJ0 A; 1I1J A; 1U06 A; 1IO6 A; 2KEA A; 1K1Z A; 2F2V A; 2OJ2 A; 4F17 A; 4J9E A; 2D0N A; 2DBK A; 1GL5 A; 2A28 A; 2JS2 A; 2RMO A; 3VRY A; 2DE0 X; 4GBQ A; 3H41 A; 2JMC A; 1MV0 B; 1WYX A; 1PKT A; 2GTO A; 2FRW A; 2JTE A; 1KJW A; 4OMO A; 1GFD A; 2V1R A; 2X3X D; 2D1X A; 1K76 A; 2JXB A; 5FWB A; 5EC7 A; 1KSW A; 1G83 A; 2ROT A; 2MIO A; 3I9Q A; 2FO0 A; 2LJ0 A; 4AG1 C; 3VS6 A; 1OOT A; 4HXJ A; 5ECA A; 1X2K A; 4RTW A; 1Z9Q A; 2KYB A; 2YUQ A; 2RQR A; 4E6R A; 4Z8A A; 1YWO A; 2PNI A; 2ABL A; 3SHW A; 3ULR B; 1M3A A; 4JJC A; 1TUC A; 3ZL7 C; 1M27 C; 5FWC A; 3M0U A; 1V1C A; 2LZ6 B; 1G2B A; 2CT3 A; 2J6F A; 1FMK A; 1SPK A; 1AVZ C; 1BBZ A; 4ESR A; 2AZV A; 1S1N A; 2H8H A; 1I07 A; 3QWY A; 2DIL A; 1ZSG A; 2J06 A; 2DYB A; 3M0Q A; 2L3S A; 4F16 A; 4HVW A; 2KGT A; 2DMO A; 2NWM A; 1PWT A; 4OML A; 3GBQ A; 4LUE A; 2DNU A; 1M8M A; 2V1Q A; 3REB B; 3PE0 A; 2KR3 A; 2FEI A; 4RTV A; 2JM8 A; 2JS0 A; 1WX6 A; 4JJB A; 4JZ3 A; 2BZ8 A; 3M0T A; 1K0X A; 4FSS A; 1TUD A; 1WA7 A; 2CT4 A; 2EYZ A; 2D8H A; 2K9G A; 2E5K A; 2CUD A; 3NPF A; 2HSP A; 2I0N A; 2MOX A; 2YUP A; 3EG2 A; 2AZS A; 2KT1 A; 3I5S A; 2KXD A; 2LJ3 A; 2LP5 A; 4CC2 A; 2CH4 W; 3H0I A; 1NG2 A; 1JO8 A; 2YT6 A; 4RTU A; 2KE9 A; 2K2M A; 2DL3 A; 2DL5 A; 2KNB B; 3EHQ A; 1HD3 A; 1PRL C; 1WDX A; 1OEB A; 1QCF A; 2RPN A; 1B3Q A; 4ORZ A; 2O88 A; 4J9I A; 1M30 A; 1HJD A; 1K9A A; 2BTT A; 4Z89 A; 5IXF A; 3VS7 A; 4J9G A; 2HBW A; 4D8D A; 3M0R A; 3TSZ A; 2KT8 A; 3UA7 A; 1MV3 A; 2FPE A; 5IXB A; 2AKL A; 2KYM A; 1JQQ A; 2KRO A; 1WLP B; 1E6G A; 3REA B; 5FW9 A; 1OV3 A; 1QLY A; 2EW3 A; 2D8J A; 1UUE A; 1X69 A; 2YSQ A; 1AD5 A; 1JXM A; 2K3B A; 4DEX A; 2JMA A; 2EYX A; 4M4Z A; 2CSQ A; 2VKN A; 4KRT A; 4RUG A; 2HEQ A; 1X43 A; 5GJV B; 1AZG B; 2O9V A; 1GBR A; 2EQI A; 1UEC A; 1SHF A; 1CSK A; 2FG0 A; 2EKH A; 1T0J A; 3IQL A; 4J9H A; 5L23 A; 2ED1 A; 2W10 A; 1AWX A; 3M0S A; 3THK A; 1UG1 A; 2PZ1 A; 4AFQ C; 3VS3 A; 2DBM A; 3VS2 A; 2LMJ A; 1Y57 A; 2EGE A; 4OMQ A; 2PTK A; 1ABQ A; 2ENM A; 2G6F X; 2CSI A; 4JZ4 A; 2F2X A; 2DL4 A; 1BB9 A; 2EYW A; 2JT4 A; 3EGU A; 4AFS C; 1H8K A; 1W70 A; 1WXU A; 1PNJ A; 2RNA A; 1WXT A; 1JXO A; 1RUW A; 1X2Q A; 3QWX X; 1YNZ A; 4CC4 B; 4AG2 C; 2DA9 A; 1CKA A; 1QKW A; 1K0S A; 4J9F A; 4RTZ A; 1NEG A; 1X6G A; 2P4R A; 2LQN A; 1BU1 A; 1AZE A; 2RQU A; 3NMZ C; 4J9B A; 3UAT A; 2A36 A; 2DL8 A; 1AWO A; 1UDL A; 1UHF A; 3EG0 A; 4CC7 A; 3I35 A; 1GCQ A; 2BZX A; 1QWF A; 1QWE A; 2K6D A; 2DLP A; 1VYT A; 2OI3 A; 2FPD A; 1I0C A; 2F2W A; 3SEM A; 3RNJ A; 2RQW A; 4RTY A; 4D8K A; 1ZUK A; 1U3O A; 3R6N A; 3PVL A; 1WFW A; 1UTI A; 1JEG A; 5HCK A; 1CKB A; 1GCQ C; 2SRC A; 4OMP A; 4WCI A; 2ESW A; 3C0C A; 2L2P A; 4HVU A; 2EVR A; 1YWP A; 3JV3 A; 2GBQ A; 2J7I A; 2X3W D; 1OPK A; 4F14 A; 4K11 A; 1MUZ A; 2MCN A; 1EFN A; 1A0N B; 2ED0 A; 2KRS A; 3A98 A; 1WIE A; 2VVK A; 2J6K A; 1ZUU A; 2DRM A; 2GNC A; 5I11 A; 1GRI A; 2EGC A; 2LX7 A; 2AKK A; 2RQV A; 2NUZ A; 2VWF A; 1RLQ C; 1BK2 A; 2M0Y A; 1H92 A; 1KIK A; 3NHN A; 2L3Q A; 3O5Z A; 1ZUY A; 2CDT A; 2LCS A; 5IH2 A; 3TSW A; 1NM7 A; 1UFF A; 3CQT A; 4Y92 A; 2DF6 A; 4CC3 A; 1H3H A; 2DVJ A; 5I22 A; 1M3C A; 2IIM A; 1NYF A; 2BZY A; 2C0O A; 1SRL A; 2EYY A; 4Z88 A; 1J3T A; 2DM1 A; 1T0H A; 2A37 A; 2LQW A; 1VA7 A; 2CH4 A; 2GGR A; 1W6X A; 1Z9Z A; 1JU5 C; 4JJD A; 1E6H A; 1VYU A; 2SEM A; 1AWJ A; 2W0Z A; 4LN2 A; 4QT7 A; 2CUB A; 2L3P A; 2O9S A; 4LE9 A; 2DJQ A; 2DX1 A; 2RN8 A; 3VRZ A; 1ARK A; 1ZLM A; 1Y0M A; 1QKX A; 4OMN A; 3VS1 A; 4LNP A; 3PVQ A; 2HCK A; 3LH5 A; 1NLO C; 1M3B A; 1SHG A; 4R0K A; 2JW4 A; 2LNH B; 2KXC A; 2O2O A; 1AOJ A; 1T3S A; 4RTX A; 4AFZ C; 3VS5 A; 2YUO A; 2HDA A; 2C0I A; 1WXB A; 1YP5 A; 1W1F A; 1UHC A; 1KFZ A; 1E7O A; 4AFU C; 1RLP C; 1K4U S; 3FJ5 A; 2RQT A; 3VS0 A; 4A63 B; 2O31 A; 1AWW A; 2AK5 A; 1U5S A; 2GTJ A; 5GJW B; 5IHI A; 1X6B A; 2J05 A; 3EG1 A; 2J6O A; 1UGV A; 2KBT A; 4IIO A; 1B07 A; 2JM9 A; 3NGP A; 1YN8 A; 1X27 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YCS B; 2C06 A; 2YLB A; 3QBY A; 2QDL A; 1VQK T; 1QVF A; 4EIK A; 4M78 G; 3OYG A; 4IIM A; 3EHR A; 1MMD A; 1TTH B; 2FRY A; 1YJN T; 2L0A A; 2KI7 A; 3HTR A; 3JRZ A; 1PRM C; 2CRE A; 1ZA1 B; 4LUD A; 3JCM c; 4EMG A; 1LVK A; 3EG3 A; 2CZ7 B; 1SEM A; 4BB7 A; 1TG0 A; 1FX7 A; 1EIF A; 3FEO A; 1VQK A; 2RK2 A; 3VS4 A; 1PKS A; 3OY9 A; 1EX4 A; 1PHT A; 3RMQ A; 2B86 A; 1YJN A; 3JCM f; 4KUD K; 4J9C A; 4MML A; 3CPW A; 1T3L A; 4X1V A; 2K7A A; 3P8B B; 1VQL Q; 1Q7Y U; 1BIB A; 1HSQ A; 2CGH A; 1VYV A; 3CCQ T; 2MI6 A; 1NJI U; 3DB4 A; 2QGG A; 1VQM T; 2C0T A; 5HK0 A; 2EBP A; 4EMH A; 2LQ8 A; 4DEY A; 3H0F A; 2DIQ A; 2QA4 Q; 2KEA A; 3CBO A; 1RAF B; 4F17 A; 2D0N A; 2DYI A; 2A28 A; 2F5K A; 5GAN f; 2A0F B; 4M7D C; 3H41 A; 1OZ2 A; 2JMC A; 4M77 G; 3CCE Q; 1YI2 T; 1WYX A; 3CCQ A; 1X6O A; 2KVQ G; 3J7A F; 3EFO A; 2RA2 A; 1VQM A; 4ELY C; 2V1R A; 4HA8 A; 1IHW A; 2L5Q A; 2D0Q B; 2KAF A; 5EC7 A; 3CCV Q; 1KSW A; 4N4G A; 4LDX A; 2RI2 A; 3G7Z A; 4P5N A; 2MIO A; 1QP2 A; 2EJF A; 3I55 T; 3CC4 Q; 3SFM A; 5A0L A; 1VQ9 T; 5ECA A; 3QJY A; 4RTW A; 2DD4 A; 2KYB A; 4PJO A; 2YUQ A; 3CMA T; 2RQR A; 1VQN A; 2HKN A; 1U8R A; 4Z8A A; 5LJ3 j; 4FT2 A; 2EQM A; 1Y7X A; 3M4G A; 4JJC A; 1TUC A; 3MO8 A; 5FWC A; 1YJW Q; 4M7D D; 3L2U A; 3OMC A; 4M7D F; 1N8R U; 2M9U A; 1AVZ C; 2CZ6 B; 3RIR A; 1BBZ A; 3I55 A; 1VQ9 A; 3QWY A; 3CMA A; 1ZBX A; 1ZSG A; 2J06 A; 3LWH A; 5KYU A; 3M0Q A; 2WSC E; 3RES A; 3MPU B; 1K73 U; 3KUF A; 3OBY A; 2KGT A; 3V7R A; 1QVG S; 3JCM P; 1PWT A; 2DO3 A; 5LJ5 h; 4QW2 A; 2LTO A; 2EYQ A; 2V1Q A; 3PT9 A; 1KG1 A; 3OS2 A; 4JJB A; 1VQ5 T; 4KGZ B; 1UGR B; 3D7S B; 4FSS A; 5C6S A; 1ZQ1 A; 2EYZ A; 2D8H A; 2E3I A; 1QCO A; 2JUF A; 2AZS A; 2KT1 A; 3I5S A; 2JN0 A; 2KXD A; 1NG2 A; 3GNG A; 2ZPI B; 1KD1 C; 1VQ5 A; 4N0A A; 1PRL C; 1OEB A; 2ATC B; 4IUQ A; 3PGG A; 1B3Q A; 2O88 A; 5FRO A; 6AT1 B; 1M30 A; 1HJD A; 1M1K R; 2MWO A; 5IXF A; 3VS7 A; 5GMK j; 3FLG A; 2HBW A; 4NOY A; 3CBM A; 2YLC A; 4XU3 A; 2DXC A; 1MV3 A; 2FPE A; 2X35 A; 5IXB A; 1RI0 A; 2E12 A; 2P4T A; 4A53 A; 1W2B S; 1RAC B; 2AKL A; 5GAM g; 4FW2 A; 2DK3 A; 2IVW A; 2KRO A; 4OGE A; 2RO0 A; 5KYY A; 1KQ2 A; 5FW9 A; 5FRN A; 1WHJ A; 2COW A; 1OV3 A; 1QLY A; 1X69 A; 1VQ6 Q; 5GAM j; 4QQ6 A; 1V29 B; 4KRT A; 5GJV B; 2BE9 B; 1RAG B; 2O9V A; 1GBR A; 4PFP A; 4ATO A; 1UEC A; 2Y4Y A; 3JB9 D; 1K9M U; 3OYY A; 2L89 A; 4L5G A; 2FG0 A; 3JB9 F; 3MP6 A; 3I56 Q; 1LOJ A; 4A4G A; 5L23 A; 2W10 A; 1AWX A; 2QA4 T; 2PZ1 A; 3LWI A; 3CCE T; 4C5I A; 2FZC B; 5GAN 7; 3CD6 T; 2V8K A; 2FZG B; 3QPH A; 3OYM A; 1YIJ Q; 3MEA A; 1ABQ A; 3HL8 A; 4M75 A; 1FMV A; 4XAX B; 2HBP A; 2DL4 A; 1TXQ A; 3A1P A; 3CCV T; 3QDF A; 2QA4 A; 1PNJ A; 3CC4 T; 1B34 A; 1WXT A; 2R5A A; 2XHC A; 3CPF A; 4C8Q G; 1UEB A; 1K0S A; 4J9F A; 3CCE A; 1NEG A; 1X6G A; 4MZP A; 3CD6 A; 2LQN A; 3HSB A; 4DOV A; 4RG2 A; 2DER A; 3CCR T; 3A8O B; 1AWO A; 1UDL A; 3C94 A; 4J5Y A; 1GCQ A; 2BZX A; 3CCV A; 1QVG P; 3LW5 E; 4KH1 B; 1JB0 E; 1VYT A; 3CC4 A; 3SEM A; 4D8K A; 3R6N A; 3EFO B; 4M7D E; 3PVL A; 1WFW A; 4BE1 A; 1Y71 A; 1BCM A; 4OMP A; 1BIA A; 2DXB A; 1VQO Q; 1K8A C; 4HVU A; 3CCR A; 4JRQ A; 5GAO r; 9ATC B; 2HMA A; 2J7I A; 4CI0 C; 4F14 A; 4FYY B; 3OYN A; 4PJO B; 1A0N B; 2GNC A; 1K9M C; 4J7I A; 1GRI A; 4QVD A; 1R8O B; 1BI2 A; 2EGC A; 1BK2 A; 2M0Y A; 1D1A A; 3V8K A; 2IG0 A; 2DJZ A; 5KE2 A; 4M75 G; 2AT1 B; 3CCJ Q; 4IUT A; 2ZCF B; 4OB0 B; 4C5E A; 2DXU A; 3RDV A; 2QTX A; 2YRV A; 4HCB A; 4IUP A; 5KYU B; 4M7A C; 2C0O A; 3A5Z B; 1M90 U; 2X51 A; 1W2B P; 4F7U F; 3G4S T; 1J3T A; 4LDV A; 2CH4 A; 2CZ1 B; 3QG1 A; 2GGR A; 2JTM A; 1VQ4 T; 2DD5 A; 1Z9Z A; 3JAM E; 4LN2 A; 4PJM A; 3NTH A; 4PKC C; 2RN8 A; 2MF2 A; 1X75 C; 3CCS T; 3LLR A; 4AT1 B; 2RB6 A; 2ZPH B; 4XU0 A; 4HCC A; 3QJ6 A; 3OYK A; 2WSE E; 3QZ5 B; 2ZPF B; 1VQ4 A; 4M7A D; 2KK4 A; 5KH6 A; 1VQ6 T; 3VS5 A; 2HQH A; 3CCM Q; 4M7A F; 4R55 A; 2HDA A; 1JJ2 P; 1UHC A; 1KFZ A; 3RMS A; 4AFU C; 4DOW A; 1K4U S; 4NL3 A; 3CCS A; 3VS0 A; 2O31 A; 3GLX A; 2GTJ A; 2X4J A; 2HAX A; 5FRM A; 1X6B A; 2J05 A; 3EG1 A; 3QII A; 2J6O A; 1UGV A; 1VQ6 A; 2DTI A; 2KBT A; 4IIO A; 4HT9 A; 1BYM A; 2X4W A; 1KC8 R; 3CXC A; 4V2S A; 1O75 A; 1YIJ T; 4C0Z A; 1GBQ A; 1SKU B; 5IN1 A; 4GLM A; 1XOV A; 3OS1 A; 5IHN A; 2FHD A; 4D6W A; 2FPF A; 1NEB A; 2ECZ A; 2BE7 D; 2E41 A; 3PNW C; 3HRU A; 1NYG A; 1M5Q 1; 3PFS A; 3G71 Q; 1WI7 A; 2RF0 A; 4PK4 A; 1M90 C; 3KFV A; 5IHK A; 4JPB W; 5LJ3 g; 2RHI A; 1YIJ A; 3NTK A; 2LJ1 A; 4HCK A; 3RBB B; 3T9N A; 1D09 B; 2KRM A; 3WVD B; 1C6V X; 3Q1J A; 3UWN A; 5A0G A; 2HKQ B; 5J3B A; 3M0P A; 1RI9 A; 1ZA2 B; 2P0K A; 4A4K A; 2RJD A; 2ROL A; 2EQJ A; 2QQB A; 7AT1 B; 3I5R A; 2LCL A; 5CIU A; 5D6W A; 1VIF A; 1NPP A; 3JCM b; 3ER0 A; 5GAN j; 1ACM B; 2DRK A; 2DL7 A; 1B34 B; 2NYS A; 2XMF A; 5I21 A; 2RHY A; 4ZNX A; 1PD0 A; 4MZM A; 1D3B A; 4ANJ A; 5KYX A; 1U06 A; 1BI0 A; 4PLL A; 1VQ7 T; 4C92 C; 5CO7 A; 3S3N A; 1VQO A; 2L8D A; 3CCJ T; 3CC7 Q; 1PC0 A; 2GFA A; 3QYG B; 2X3X D; 1K76 A; 3GNF B; 2QI2 A; 1FXX A; 2Y90 A; 4O5V A; 3JCM e; 2PUO B; 5I2M A; 1VQ7 A; 4AG1 C; 1OOT A; 1X2K A; 1OX8 A; 3DLL A; 4E6R A; 4F7U E; 3CCJ A; 3NFC A; 3X24 B; 3MEV A; 3EGX A; 3SHW A; 3ULR B; 1M3A A; 4C92 D; 5CK9 A; 1KHC A; 4C92 F; 1G3Y A; 5D6X A; 2J6F A; 4BY6 C; 2R5M A; 1SPK A; 1PD1 A; 3X26 B; 1Y07 A; 4ESR A; 2AZV A; 2H8H A; 3WVE B; 2RJF A; 1D0X A; 2K5L A; 3GF5 A; 1HK9 A; 2DIL A; 3SD4 A; 2VYT A; 5GAN e; 1OX9 A; 3CCM T; 4RG8 A; 5DLQ E; 5KE3 A; 4HVW A; 4J83 A; 2EAY A; 2DMO A; 2EQU A; 1VUB A; 4OML A; 5GAN 3; 4M7A E; 2X4Y A; 4IUV A; 2EWN A; 3PMI A; 2LX9 A; 5LJ5 f; 1RAD B; 1IZ6 A; 1QQJ A; 3GIB A; 2A7Y A; 2DEQ A; 1VQ8 Q; 1MND A; 3DB3 A; 3FC3 A; 5EG2 A; 2BZ8 A; 4HCZ A; 1RAE B; 3J81 E; 2YHT A; 1K0X A; 3CCM A; 5LJ3 d; 1TUD A; 1WA7 A; 4RCB A; 2K9G A; 4LD6 A; 3NPF A; 2I0N A; 3EGD A; 3FRN A; 2OTL Q; 2X9H A; 1M9S A; 2DXT A; 4CC2 A; 2F1L A; 3TRE A; 2O01 E; 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