1G07A

Crystal structure of t4 lysozyme mutant v149c
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRCITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 61
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g07A00
160LA 3DMXA 1G0KA 3DN2A 216LA 3SB7A 1L81A 187LA 2B6ZA 1G0MA 1XJUA 2O7AA 182LA 1L54A 3FI5A 3G3VA 147LA 226LA 1QT4A 1L96A 167LA 2OTYX 2B74A 2F2QA 217LA 1QTDA 2Q9EA 122LA 1C6LA 1C69A 3DKEX 1SSWA 1L63A 159LA 1CX6A 157LA 1L75A 4DJHA 1L48A 209LA 2B73A 4E97A 2OE7X 1L95A 3RZEA 2B70A 214LA 1L70A 1C61A 1L93A 2B6XA 1D3NA 1C6QA 4LDLA 1SSYA 1L86A 174LA 1C63A 1C60A 1PQDA 225LA 191LA 1LI6A 4PJZA 4W57A 3EMLA 1PQKA 1P37A 163LA 2RBPA 2ANXA 2RAYX 3F8VA 3SB6A 1LYHA 2B6YA 4DAJA 1L65A 3C82A 1G1WA 1C6EA 1G06A 1L18A 151LA 1C64A 4LDEA 3DMZA 2RBRA 1WTHA 3F9LA 178LA 4GRVA 1LGXA 1L58A 220LA 1C65A 1CUQA 3HWLA 1LLHA 1G07A 205LA 3PDSA 3VW7A 2O79A 1L08A 4YX7C 1QUHA 1L40A 3HUKA 2LZMA 1KW5A 7LZMA 1D2YA 212LA 114LA 3G3XA 4EPFA 3SB5A 1L56A 1G1VA 1KY0A 1L85A 2B7XA 211LA 254LA 3GUNA 4OO9A 3OE0A 4ARMA 2OTZX 1L46A 1P3NA 2OU0X 2NTHA 1G0QA 141LA 1CX7A 2RB1X 4I7NA 237LA 3V2YA 1L59A 240LA 1QS9A 1DYGA 188LA 1L45A 261LA 3D4SA 4ARQB 168LA 3OE6A 1G0LA 1KNIA 2OE9X 1L91A 1QTBA 1L49A 3HTGA 2B6WA 1L21A 1C6IA 143LA 3SB9A 3C8SA 1L64A 4YXAC 1C67A 1L01A 3C81A 3SBAA 5LZMA 3V2WA 175LA 1T8FA 177LA 199LA 3HT6A 1L67A 1JQUA 3OE8A 1LI2A 1L92A 3FADA 3HH3A 1C6DA 1EPYA 1L60A 1L25A 3GUKA 1L0JA 3SN6R 1LWGA 3DN1A 222LA 1L77A 2F47A 3HTFA 1P36A 1LYGA 148LE 1ZURA 2LC9A 1L17A 228LA 1C6FA 218LA 1XEPA 219LA 3FA0A 107LA 180LA 1LYIA 1L69A 1L13A 190LA 1CU5A 1L11A 2OE4X 184LA 162LA 1QUGA 235LA 4W56A 108LA 189LA 2RBOA 244LA 1OV5A 238LA 4W53A 2RB2X 3RUNA 4ARPA 3NY8A 181LA 113LA 1QS5A 232LA 1L51A 3L64A 1XJTA 1L14A 3C7ZA 1C68A 1C62A 1QTZA 1CTWA 146LA 3CDRA 2L78A 3CDVA 152LA 1L80A 239LA 3HT7A 1L32A 123LA 4I7JA 1L30A 1PQJA 4I7QA 1DYDA 3CDOA 4EJ4A 1L12A 1KY1A 192LA 223LA 165LA 4I7RA 4I7TA 1LGWA 4DKLA 1C6PA 1P2LA 131LA 1P7SA 1OV7A 213LA 1L90A 1L66A 119LA 138LA 255LA 1CU2A 3LZMA 1L50A 1SX2A 233LA 246LA 262LA 1C6BA 1QT7A 102LA 1L27A 3HTDA 231LA 130LA 2RB0X 3DN3A 4ARMB 4W52A 4W58A 1L89A 1C6AA 206LA 1ZYTA 1LYFA 1CV4A 3CDTA 144LA 258LA 1JTMA 126LA 2F32A 170LA 4ARJA 1QTCA 1L24A 1L28A 1L06A 1QSQA 1C66A 2HULA 3NY9A 185LA 1SX7A 1L74A 1L19A 1L97A 3GUIA 1T8AA 215LA 1L79A 1P2RA 1OYUA 1LPYA 161LA 149LA 1L84A 1KW7A 1LGUA 158LA 253LA 3DMVA 145LA 4K5YA 250LA 1L0KA 1DYAA 1L71A 3HUQA 1L26A 1CVKA 128LA 1CU6A 3NYAA 3UONA 1OWZA 1K28A 1L23A 1L41A 2IGCA 4W51A 1L98A 6LZMA 4EKSA 1G0JA 1OVKA 1C6MA 103LA 1DYCA 3HUAA 1QUOA 1SWYA 3C80A 3DNAA 1L52A 1QTHA 3GUPA 4ARLA 1DYBA 2B72A 3C8QA 2A4TA 1L22A 4EKPA 1L07A 1LYJA 4W55A 1L35A 2Q9DA 4IAPA 4EXMA 1L94A 1L20A 3G3WA 3PBLA 1G0GA 1L33A 3QAKA 4GBRB 1QT8A 1L57A 111LA 2NTGA 3GULA 1L62A 3CDQA 197LA 1TLAA 183LA 3C7WA 1CU3A 1C6NA 3HDEA 4AQNA 3HH5A 242LA 129LA 156LA 247LA 169LA 1B6IA 198LA 140LA 112LA 1L43A 1L39A 150LA 1C6GA 4YXCA 4W59A 1CU0A 4EKQA 4LDOA 1C6TA 1KS3A 3HT9A 1DYEA 260LA 1LWKA 2HUKA 1L02A 1L15A 1CV3A 4I7KA 1L37A 1D2WA 1L44A 1T97A 221LA 227LA 243LA 2RBQA 104LA 2LCBA 1QSBA 1QT6A 2OU9A 1C6CA 5I14A 201LA 3SB8A 3GUOA 176LA 1QT3A 2RBNA 200LA 1L83A 1L03A 1L73A 2ANVA 186LA 1L82A 1P6YA 1QTVA 4I7PA 125LA 4I7MA 1QT5A 3SBBC 2CUUA 2B75A 173LA 1LYDA 155LA 259LA 172LA 2OU8A 1PQOA 137LA 1DYFA 3HU9A 120LA 1L34A 4S0WA 195LA 1JTNA 1SWZA 1L05A 1CV6A 3OE9A 2B6TA 224LA 1P56A 229LA 3DN6A 1C6KA 1CV5A 1L99A 1L04A 127LA 166LA 1L29A 4W54A 109LA 1T6HA 3HT8A 1L09A 251LA 3C83A 1NHBA 3GUMA 3K2RA 1C6JA 1L00A 1L61A 1LW9A 115LA 2O4WA 1ZWNA 3DN0A 1G0PA 1L53A 4EPIA 1D9WA 1D3MA 236LA 257LA 1CV0A 171LA 1L72A 2QB0B 2RH1A 1P46A 3DN4A 210LA 249LA 110LA 1PQIA 3C7YA 2RAZX 4I7OA 196LA 1C6HA 2QARC 1OVHA 1OWYA 1T8GA 3HU8A 1L10A 256LA 164LA 3HH4A 1LI3A 245LA 1OVJA 4I7SA 118LA 1D3JA 241LA 4EKRA 1CV1A 1LYEA 248LA 4ZPUA 1L55A 252LA 3L2XA 3JR6A 2Z6BA 1L36A 3C8RA 234LA 3DN8A 4PK0A 4ARQA 139LA 1QUDA 1D3FA 1L31A 2HUMA 1L42A 1L87A 142LA 4LZMA 1I6SA 3HTBA 1L16A 1L38A 230LA 3HDFA 1P5CA 1CUPA 3GUJA 1L76A 3HH6A 2RBSA 2OEAX 1PQMA 1L88A 4I7LA 1L47A 1P64A 3ODUA 1L68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DQAA 3DN2A 3W6BA 4H93A 1L81A 187LA 2B6ZA 4NHPA 147LA 1QT4A 167LA 3LHMA 1IOCA 1D6PA 2F2QA 1JEFA 1QTDA 4UWUA 3WPKA 157LA 5J7CA 3AZ7A 2LYOA 3D3DA 1IEEA 1L95A 3WXUA 3A92A 2MEEA 3RZEA 1L70A 4DD7A 1L93A 3A3QA 1B5VA 1IP6A 1L86A 4J1AA 1LYYA 3QY4A 4YEMA 1B7MA 2BQHA 4PJZA 1OP9B 2EPEA 5FEKA 2ANXA 1FBIX 2B6YA 1LSAA 208LA 1L18A 2Z2FA 4P2EA 3TXJA 2RBRA 1WTHA 3AGIA 178LA 3HWLA 2Z37A 3AZ6A 1LOZA 205LA 2O79A 1XEJA 3LYMA 1L40A 1GAYA 2LZMA 4WM3A 4NG1A 5T3FA 2EQLA 4EPFA 1GPQC 1KY0A 1L85A 2BQKA 1JSEA 254LA 4OO9A 3WUAA 3OE0A 4ARMA 3TMUA 3W3EA 2OTZX 4KL7A 1BB7A 4OWAA 4QDNA 3V2YA 2YBNA 188LA 3FI7A 4PJ2C 1G0LA 4NIJA 1LSFA 1KNIA 2NWDX 1GF7A 1F0WA 3RW8A 3HTGA 1LZ4A 2BQGA 5AMYA 1DI5A 1GB9A 3C8SA 4HSFA 2BPUA 4YXAC 1C67A 1L01A 2W1MA 2FYDA 1HFZA 3V2WA 4LZTA 5KXSA 2LZ2A 4RW1A 1JQUA 1YL1X 3A90A 3SN6R 1QSWA 1UIDA 4DD9A 4QGZA 4WLTA 148LE 228LA 1OUCA 218LA 5FCPA 1DKJA 219LA 4WOAA 4YOPA 1BVKC 4H9AA 1GHLA 2OE4X 2ZNWY 4W56A 189LA 1CNSA 244LA 4ETAA 1IWZA 1KIRC 2HEDA 1WQMA 3NY8A 181LA 3A95A 232LA 3WYHA 4ETEA 3C7ZA 1HEWA 2XTHA 146LA 3BKHA 3CDRA 2L78A 4Z41A 3CDVA 1L32A 4DDBA 1LMOA 1PS5A 5F81A 223LA 1LZ5A 1LHLA 3ATOA 4DKLA 131LA 1B5YA 213LA 1NDMC 4LFXA 1LSMA 1HENA 1LCNA 1SX2A 233LA 2BQDA 1OUDA 3HTDA 3DN3A 5I53A 1JUGA 1L89A 4HPEA 2CJLA 1V7SA 3CT5A 1CV4A 144LA 1INUA 1JTMA 1DZBX 170LA 1QTCA 1L06A 1QSQA 4NGYA 4WG7A 2HULA 4NSHA 1UBZA 185LA 1SX7A 1L74A 4LT0A 4MSTA 1P2RA 1OYUA 1IWYA 3T6UA 1G7HC 1JISA 1IX0A 1LSPA 1L84A 1AT6A 3TMVA 3CSZA 253LA 3LN2A 2BQCA 145LA 250LA 1I56A 1W6ZA 134LA 1BWJA 3B0OA 1L26A 3NYAA 3P66A 1OUHA 5I5QA 3E3DA 1L41A 1LZDA 4NHIA 6LZMA 2GV0A 4EKSA 5K7OA 1DYCA 4WL6A 3C80A 1LZBA 1QTHA 4R6CA 1VFBC 1L22A 1REXA 1L94A 1H87A 3CSRA 4GBRB 4CFOA 1L57A 2NTGA 3CDQA 197LA 1TLAA 1QUSA 4GN5C 1CU3A 1C6NA 1LJNA 1C43A 4G49A 3WXTA 1LYOA 3EMSA 5DN5A 1L43A 1B7QA 1J1PY 2ZNXY 2MEFA 5LVKA 1C6GA 2MEDA 4GCFA 1CU0A 1EQ4A 1LWKA 2HEEA 1CV3A 221LA 227LA 1CKCA 1CJ9A 1OUAA 243LA 2RBQA 104LA 1AM7A 3SB8A 4NGWA 3CQLA 1LJIA 5FSTA 1YAQA 1WTMA 3LYOA 3N9AA 1LKRA 2Z18A 2CUUA 3LZTA 4DD3A 1HC0A 1GXXA 4G4BA 2OU8A 172LA 1DYFA 3HU9A 1L34A 4S0WA 195LA 1GB7A 2MEBA 2HUBA 2B6TA 5LXWA 4L41A 2D4JA 3P4ZA 3TXBA 224LA 1LHMA 229LA 3DN6A 4NHTA 5APDA 1B0DA 1B7RA 1L99A 1L04A 5HQ1A 1GDWA 4Z98A 4A7DA 4PRUA 3GUMA 1L00A 1BGIA 4XJGA 2DQHY 4TSBA 1UIFA 1B2KA 1L72A 2QB0B 1GB5A 2RH1A 1P46A 1QTKA 249LA 110LA 1QTEA 1PQIA 133LA 2RAZX 4I7OA 1LZAA 1OWYA 4XJFA 1GBOA 1JJ0A 2FBDA 4XJIA 1LYEA 248LA 4ZPUA 4H9IA 3L2XA 2MEIA 5FHWA 4LGKA 1L36A 5A3EA 1D9UA 3DN8A 139LA 1G7MC 3FE0A 142LA 1J1OY 1FLUA 1ZVYB 1I6SA 1REZA 1L16A 230LA 1HEPA 1VEDA 3HH6A 4WM1A 1IR9A 1T6VL 3TXFA 4W96A 3ODUA 207LA 160LA 1YAOA 3DMXA 2HEBA 2G4NA 1XFPL 1ZVHL 1FLYA 1HHLA 3SB7A 1ZV5L 4X3BA 3WPJA 1G0MA 1XJUA 1YAPA 1TBYA 1L96A 4XADA 2YBHA 3B72A 1SSWA 1QDTA 1L63A 1CX6A 1UCOA 5C6JA 1L75A 1WVUA 209LA 2B73A 1XGUC 2MEAA 5E9RA 2OE7X 5ILFA 2MEHA 1CJ6A 2B70A 5APEA 1C61A 2B6XA 1LHIA 4PGJB 1SSYA 174LA 1UACY 2LYZA 4HV1A 5F14A 1JKCA 1LI6A 3EMLA 3TXHA 4LT3A 4YEOA 1GF6A 163LA 1UC0A 1C45A 4J7VA 1IP4A 1LAAA 2CGIA 3C82A 2BAAA 1IWUA 1KIPC 3DMZA 5IELA 4H8XA 1C65A 1CUQA 2BLYA 1LLHA 1G07A 3VW7A 1L08A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2DQA A;  3DN2 A;  3W6B A;  4H93 A;  1L81 A;  187L A;  2B6Z A;  4NHP A;  147L A;  1QT4 A;  167L A;  3LHM A;  1IOC A;  1D6P A;  2F2Q A;  1JEF A;  1QTD A;  4UWU A;  3WPK A;  157L A;  5J7C A;  3AZ7 A;  2LYO A;  3D3D A;  1IEE A;  1L95 A;  3WXU A;  3A92 A;  2MEE A;  3RZE A;  1L70 A;  4DD7 A;  1L93 A;  3A3Q A;  1B5V A;  1IP6 A;  1L86 A;  4J1A A;  1LYY A;  3QY4 A;  4YEM A;  1B7M A;  2BQH A;  4PJZ A;  1OP9 B;  2EPE A;  5FEK A;  2ANX A;  1FBI X;  2B6Y A;  1LSA A;  208L A;  1L18 A;  2Z2F A;  4P2E A;  3TXJ A;  2RBR A;  1WTH A;  3AGI A;  178L A;  3HWL A;  2Z37 A;  3AZ6 A;  1LOZ A;  205L A;  2O79 A;  1XEJ A;  3LYM A;  1L40 A;  1GAY A;  2LZM A;  4WM3 A;  4NG1 A;  5T3F A;  2EQL A;  4EPF A;  1GPQ C;  1KY0 A;  1L85 A;  2BQK A;  1JSE A;  254L A;  4OO9 A;  3WUA A;  3OE0 A;  4ARM A;  3TMU A;  3W3E A;  2OTZ X;  4KL7 A;  1BB7 A;  4OWA A;  4QDN A;  3V2Y A;  2YBN A;  188L A;  3FI7 A;  4PJ2 C;  1G0L A;  4NIJ A;  1LSF A;  1KNI A;  2NWD X;  1GF7 A;  1F0W A;  3RW8 A;  3HTG A;  1LZ4 A;  2BQG A;  5AMY A;  1DI5 A;  1GB9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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