The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VQLSGEEKAAVLALWDKVNEEEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFDSFGDLSNPGAVMGNPKVKAHGKKVLHSFGEGVHHLDNLKGTFAALSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVVVLARHFGKDFTPELQASYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN ALPHA CHAIN
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| publication title |
Interface sliding as illustrated by the multiple quaternary structures of liganded hemoglobin.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
57
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-10-05 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SDL B; 1MLK A; 2ZLX B; 4PQ6 A; 3WFW A; 1OUT B; 1J7W B; 3QJC A; 1NS9 A; 2FAL A; 2BLI A; 1FN3 A; 1RQ4 A; 5MBA A; 5CMV A; 5E29 B; 4N8T A; 1F65 A; 1BAB B; 3O7N A; 4OOD A; 2FRI X; 3D7O B; 1MBS A; 2RAO A; 1A6K A; 3P5Q B; 1AJH A; 4MQH B; 1URV A; 1DWR A; 1HV4 B; 4TWV A; 3BOM A; 5EE4 D; 1QXE A; 3K9Z A; 4ZVA A; 1B86 A; 109M A; 1JP6 A; 1JEB A; 3PI9 A; 1QSI B; 2ZFO A; 2ZS1 A; 1G08 B; 3MYN A; 1XY0 A; 2LH2 A; 3S66 B; 2H8D A; 4PQC A; 1MBA A; 4MQG A; 4C0N A; 1O1N A; 2MHB B; 3QJD B; 1MOA A; 1K1K B; 1M9P B; 3W4U B; 1A3O B; 1DM1 A; 4YU4 A; 5EYJ A; 2VRY A; 3GDJ A; 5CNB A; 1JW8 A; 1BVC A; 1VXA A; 1SHR B; 3WCV C; 1MYF A; 1Y8K A; 2G0Z A; 1ECN A; 5EUI B; 2HBE B; 3QQR A; 4MQK B; 1YOG A; 3D1K B; 1MOD A; 1COH A; 1DXV A; 3HXN B; 3E5I A; 1XXT A; 4IRO A; 1NWI A; 4NK2 A; 3S1J A; 2QSS B; 1HBG A; 1J3F A; 2QMB A; 5B85 A; 3ZJI A; 2DXM B; 2MGM A; 1Y83 B; 1AJG A; 3NMM A; 1YVT A; 4G51 A; 2AV0 A; 1GZX A; 3HEP A; 1LHT A; 2E2Y A; 1F63 A; 3GQP A; 3IA3 B; 3KUN A; 4G1B A; 1LTW A; 1GBU A; 2B7H A; 1C7C B; 2MGL A; 2V1H A; 1YGF A; 1YMB A; 1O1M A; 2M6Z A; 4MPM A; 2FRF A; 1J7S B; 1ABS A; 3UBC A; 1IBE A; 1O1P B; 2ZSS A; 3UHV A; 1Y4Q B; 1BZ1 B; 3BJ1 B; 1MLU A; 1FHJ B; 1VRF A; 1YVQ B; 1HGA B; 2ZSQ A; 3IC2 B; 1LFV B; 2MGC A; 2GTL C; 2GKM A; 3UH5 A; 2PEG A; 1X9F C; 3UHT A; 1MNJ A; 2HBC A; 2D6C A; 1LA6 B; 1FAW B; 1XZ4 A; 2EKT A; 4UUR A; 1V07 A; 108M A; 4WCH D; 3PEL B; 3LR7 A; 1IRC A; 4NI1 A; 1UFP A; 2HCO B; 5CHQ A; 1IWH A; 3BJ3 A; 1YOI A; 1WLA A; 1KR7 A; 5CN5 A; 2R80 A; 2D2N B; 2ZFO C; 5JDO D; 4MBA A; 2FAM A; 1BZ0 A; 1Y7G B; 3VRF B; 5CND A; 5EV5 A; 1TES A; 2H8F B; 1Y35 A; 2BWH A; 1PBX A; 2R1H B; 1CP5 A; 1YFF B; 1SPE A; 4N7N A; 1N9I A; 4H0B A; 1YHU B; 3BJ2 B; 1Y22 A; 5C6E B; 2ZSR A; 1A3N A; 1MNK A; 1A6N A; 1Y4F A; 1FCS A; 1Y0T A; 1CPW A; 1XYE A; 2VYZ A; 2VLX A; 3ZJH A; 2MGB A; 1T1N A; 2R4Y A; 1YH9 A; 1LFZ B; 3RGK A; 2LH1 A; 1NIH A; 3FS4 B; 3SDH A; 3DR9 A; 1J3Y B; 3D17 A; 4AVD A; 2W6X A; 1S5Y B; 1G9V B; 2ZS1 D; 1S5X A; 1XZV A; 2BW9 M; 2D2M B; 2QFN A; 1A0Z B; 3ZH0 A; 1XZ5 B; 3K3U A; 4MQJ B; 1Y4V A; 3ODQ B; 1JP9 A; 4WJG 1; 1XQ5 B; 2ZWJ A; 1DTI A; 1HSY A; 3M3B A; 1Y8W B; 3AT5 A; 3UHB A; 1G0B B; 3PI8 A; 1J52 A; 1A01 B; 3AQ9 A; 1LFY B; 3LQD A; 5SW7 B; 3AQ6 A; 1J3Z A; 3ZJS A; 1RTX A; 3WTG A; 1PMB A; 1M6C A; 2ZSZ A; 3A0G B; 1DKE A; 1LH1 A; 3GQG A; 2AV3 A; 2HBS A; 1YEU B; 1V4X B; 1Y5K A; 1HCO A; 2MGI A; 3OZV A; 3NG6 A; 1YDZ A; 1HLB A; 1Y7D B; 1LJW A; 1CH4 A; 2ZLU B; 1HGB A; 3UH6 A; 2O5T X; 1Y31 B; 2QU0 B; 5E6E B; 3MJU A; 1BZZ A; 3B75 A; 2HHD A; 1RTE A; 3WCW A; 3H58 A; 1XCH A; 3OZW A; 1K0Y B; 2MGD A; 1G09 B; 1YEQ B; 2GL3 A; 1Y5F B; 1UIW B; 1SDK A; 4MQC A; 2OIF A; 2LHB A; 1AJ9 A; 1A4F A; 5CNG A; 2MYD A; 4FH7 A; 104M A; 3MKB A; 3HYU A; 3MN0 A; 1CH9 A; 2MGH A; 1Y8I B; 1BZP A; 3R0G A; 2MYC A; 5EU2 A; 2OH9 A; 3CY5 A; 3QQQ A; 4UIQ A; 3E55 A; 1X46 A; 1BIN A; 2VEE A; 1YE2 A; 3PI2 A; 1L2K A; 3GK9 A; 1VXD A; 3UHN A; 3IC0 A; 1HAC B; 3QJB A; 4NXC A; 1HBB B; 1QSH B; 2ZS0 C; 2MGE A; 1ABW B; 4ODC A; 4F69 A; 1DXU A; 5JDO E; 112M A; 3HF4 A; 1V4W A; 4HHB B; 1V75 A; 1A00 B; 2QSP B; 3ZJP A; 1BJE A; 1YEV A; 5HLX A; 1QXD A; 4NI0 B; 1O1I B; 1UT0 A; 2O5M X; 1BVD A; 5HU6 A; 2MGF A; 1LFT B; 1GJN A; 1MKO A; 1GCW A; 1YHU D; 4U8U B; 3GOU A; 4X0L A; 1FDH A; 1O1K B; 3D1A B; 1Y7C B; 1JY7 B; 1YE0 A; 1GLI B; 3VRE A; 3GKT A; 2D5Z A; 3WR1 B; 2AUQ A; 1KD2 B; 2GRZ A; 1MOC A; 1NZ5 A; 3WCT B; 3WFU A; 2D5X B; 1R1Y B; 3G53 A; 1DXD A; 2DN3 A; 3UHQ A; 4B3W A; 1HDA A; 1JL7 A; 3WCW C; 1CMY A; 2LH6 A; 1J41 B; 1DLW A; 2Z85 A; 4F6J A; 2W72 B; 2DN1 B; 2ZT2 A; 3GYS B; 1QI8 A; 2V1E A; 3WFT A; 3CIU A; 5JGG A; 2HHE A; 1HBR B; 1BBB B; 4O4Z A; 3AQ8 A; 1EBC A; 1WMU A; 1MDN A; 2ZT0 A; 1SI4 B; 1HBI A; 3O89 A; 1MLJ A; 3OO5 B; 1DXT A; 1YIH A; 1GDJ A; 1RPS A; 3ZJQ A; 1S0H B; 1M6M A; 1CG5 A; 2VLY A; 4HSX A; 2EB8 A; 5ILR A; 1CG8 B; 3HHB B; 1BIJ B; 1HGC B; 3DHR A; 4HRR A; 1Y7Z B; 3GKV B; 2V1F A; 3ARJ A; 1DO1 A; 5M3S A; 1N9F A; 2BLJ M; 1GBV B; 1HAB B; 1HHO B; 4ROL A; 3FH9 A; 1Y2Z B; 2MYB A; 3U3E A; 1MYI A; 2D60 A; 3UHH A; 4H2L A; 1LFL A; 4FWZ A; 3NFE B; 1S56 A; 5AZR A; 4M4B A; 4M4A B; 1MYM A; 4XS0 B; 5HLQ A; 1Y0W B; 2HBD B; 3UHY A; 4N7O B; 1J40 B; 1RQA B; 2MGK A; 2ZLW A; 2BK9 A; 3DUT A; 1IT2 A; 1N9X A; 4WJG A; 4HSW A; 5EE4 C; 3QZX A; 1CH7 A; 1UVX A; 5E83 A; 1ECO A; 5KER A; 1NS6 A; 3AT6 A; 1ABY B; 2G0X A; 3WCV B; 3QMA A; 3GQR A; 1SDL A; 3UHX A; 2ZLT B; 1CH1 A; 5HY8 A; 1BZ6 A; 3ZJR A; 1OUT A; 3A2G A; 1LFQ A; 3LB1 A; 3LR9 A; 1UVY A; 1Y85 A; 2GLN A; 1O1L B; 1MLM A; 3ORD A; 3ASE A; 1CH3 A; 3ZOL A; 3BA2 A; 2EVP A; 2VYW A; 3DHT A; 1JWN A; 1HBA B; 1OUU A; 3UHW A; 1CLS A; 1XZU B; 4XDI A; 2MHB A; 2O5S X; 1DUK A; 2OH8 A; 4L7Y B; 1HDS A; 5HBI A; 2GTL B; 3W4U A; 1V4U B; 3ARL A; 1N9H A; 2R50 A; 1X9F B; 4N8T B; 5CHR A; 2ZT4 A; 3HEN A; 1FLP A; 2RAO B; 4KJT A; 3BOM B; 4PQB A; 1QXE B; 2HBE A; 2ZSX A; 2SPL A; 1JP8 A; 1JEB B; 3HXN A; 1A6M A; 4OF9 A; 3WCU D; 2ZFO B; 1A9W E; 1VHB A; 1XY0 B; 1Y83 A; 1Y01 B; 1C7B A; 5D5R A; 4MQG B; 3VHB A; 5B84 A; 4TYX A; 1RVW A; 2WTH A; 4DWT A; 2MB5 A; 1EW6 A; 5ILM A; 5HLU A; 4YU4 B; 2VYY A; 2OLP A; 3GDJ B; 4HRT B; 1Y4G A; 1WVP A; 2EKU A; 1JL6 A; 1O1P A; 5CNE A; 1Z8U B; 1Y4Q A; 3BJ1 A; 3MVC A; 1FHJ A; 1S6A A; 4FC3 A; 1YVQ A; 5CNC A; 5CN8 A; 1HGA A; 4TWU A; 1COH B; 1MBD A; 1YGD A; 1DXV B; 1LFV A; 1XXT B; 4IRO B; 2O5L X; 2MYE A; 5CN9 A; 2QMB B; 1YVT B; 1OFK A; 4G51 B; 1GZX B; 3ED9 A; 3PEL A; 2XKH A; 3GQP B; 3AG0 A; 1GBU B; 2JHO A; 2B7H B; 4GZG A; 1Y5J A; 6HBW B; 3QZZ A; 1YCB A; 1YGF B; 1O1M B; 2M6Z B; 4N7P B; 1YEN A; 1YEO B; 3WCV D; 1IBE B; 1Y7G A; 3VRF A; 1RQ3 B; 1H97 A; 1A6G A; 2R4W A; 2ZS1 C; 1Y0A A; 2KSC A; 1YHE A; 1YFF A; 2PEG B; 1F5P A; 1V9Q A; 1UX8 A; 1YHU A; 2HBC B; 3BJ2 A; 1VXF A; 2R4Z A; 1NEJ B; 1XZ4 B; 5MBN A; 2ZSY A; 3R5I A; 2BNL A; 1IWH B; 3BJ3 B; 1NQP A; 2RI4 B; 2MGA A; 2R80 B; 3AQ5 A; 1MWC A; 3LB3 A; 3G4R A; 1BZ0 B; 3HRW A; 4MQI B; 2AUO A; 1XZ2 B; 1Y35 B; 2LH5 A; 1FSL A; 1SPG B; 1PBX B; 1A0U A; 1MLF A; 3G4U A; 3PT8 A; 2GTL D; 1XZ5 A; 5CN4 A; 3ODQ A; 1UX9 A; 1IRD A; 3S1I A; 4N7N B; 1Y8W A; 2Z6N A; 3EU1 B; 5CNF A; 1O1J B; 1IOP A; 1Y4F B; 3MJP A; 1Y0T B; 2MGJ A; 1XYE B; 1VRE A; 2ZS0 B; 2XYK A; 3MYM A; 1A9W A; 1T1N B; 1Y09 A; 3NML A; 4ESA A; 3D4X A; 1HBS A; 3A0G A; 2DN2 B; 1YEU A; 1C40 B; 1V4X A; 1NIH B; 1NZ2 A; 1Y0C B; 1Y7D A; 2O58 X; 1BUW A; 4PNJ A; 1XZV B; 1Y31 A; 3S65 B; 2QU0 A; 3QJE A; 3M3A A; 1S69 A; 2O5B X; 4C44 A; 1G0A A; 1DLY A; 2W6W A; 1K0Y A; 4DC7 A; 1G09 A; 1OBM A; 1YEQ A; 3PI8 B; 1UIW A; 3PT7 A; 1DO3 A; 3UHU A; 2W6V B; 3A59 B; 3LQD B; 4H07 A; 3UGZ A; 2PGH A; 1J3Z B; 1IT3 A; 1MTJ A; 2ZSP A; 1HBH A; 1B0B A; 1JPB A; 1DKE B; 3GQG B; 1DWS A; 2G10 A; 3ECX A; 1YZI B; 1Y8I A; 3UHD A; 4KN3 A; 3NG6 B; 1YDZ B; 1O1O A; 1V5H A; 1MNO A; 1HGB B; 2ZFB A; 2VEB A; 4O4T A; 4SDH A; 1YMC A; 3MJU B; 1BZZ B; 3B75 B; 1LH5 A; 1HAC A; 2HHD B; 1QSH A; 1EMY A; 1ABW A; 3WCP B; 3WCW B; 3QM5 A; 4DC8 A; 3VRG A; 2ZT1 A; 2QSP A; 1AJ9 B; 1A4F B; 2D2N D; 4O35 A; 4NI0 A; 1JZL A; 3PIA A; 1VWT A; 2QRW A; 5EET A; 1MCY A; 1DWT A; 3UHI A; 3ONZ A; 1Y8H A; 3CY5 B; 1D8U A; 3UBV A; 1X3K A; 5EQM A; 1XZ7 A; 1YE2 B; 1W92 A; 3E4N A; 3IC0 B; 3QJB B; 3K8B A; 3M39 A; 1HLM A; 1HRM A; 4ODC B; 1Y0D B; 5KDQ B; 1GLI A; 1VXH A; 2H35 A; 2WY4 A; 1KD2 A; 4YU3 B; 1OR6 A; 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4M4B B; 1J7W A; 2ZLW B; 3DUT B; 2G12 A; 4MU5 A; 3EOK B; 5E29 A; 1BZR A; 1BAB A; 1CH5 A; 3ZJJ A; 2ZLV B; 1YOH A; 3D7O A; 1SWM A; 1Y4B B; 1MBI A; 5KER B; 1GDI A; 3P5Q A; 5EOH A; 4MQH A; 1HV4 A; 3OZU A; 4U8U D; 1XZU A; 3WCU C; 1MLO A; 4NK1 A; 3GQR B; 3UGY A; 4O2G A; 5KKK A; 3UH7 A; 1ITH A; 4IT8 A; 5HY8 B; 2FRJ X; 2G0V A; 2NSR A; 2VLZ A; 1MOB A; 1QSI A; 3V2V A; 1MNI A; 3LB4 A; 4L7Y A; 1Y46 B; 1LFQ B; 1MYG A; 1G08 A; 2GTL A; 1V4U A; 3S66 A; 3WI8 A; 1X9F A; 1LUE A; 1Y85 B; 1CBL A; 3QJC B; 3QJD A; 1K1K A; 1M9P A; 1A3O A; 1NS9 B; 3UH3 A; 4F6G A; 1FN3 B; 4G1V A; 1RQ4 B; 3WCT D; 1VXB A; 3M38 A; 1MBO A; 3DHT B; 1SHR A; 4NXA A; 1OUU B; 4B4Y A; 4MXL A; 5EUI A; 1CLS B; 3OGB A; 4MQK A; 1B86 B; 3E5O A; 3D1K A; 3G4Q A; 3PI9 B; 4JAC A; 2ZS1 B; 4L2M A; 3V2Z A; 2QSS A; 1HDS B; 4FWX A; 2H8D B; 2DXM A; 2G11 A; 4HRT A; 1O1N B; 1O16 A; 3KMF C; 1C7C A; 1JZM A; 1J7S A; 1Y8K B; 2OHA A; 1BZ1 A; 5JDO C; 1LH7 A; 7HBI A; 1C7B B; 3IC2 A; 4QAU A; 1GVH A; 1RVW B; 1CP0 A; 2ZT3 A; 1LA6 A; 1FAW A; 3NMM B; 6HBW A; 1H1X A; 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