1G0GA

Crystal structure of t4 lysozyme mutant t152a
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITAFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Structural and thermodynamic analysis of the binding of solvent at internal sites in T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g0gA00
1XJUA 3C7WA 240LA 2F2QA 1C6AA 1QUOA 1L82A 3PDSA 197LA 126LA 1L94A 1SSYA 1QUGA 255LA 1L20A 1QTVA 2OU0X 1CV1A 3CDRA 1L0KA 225LA 102LA 262LA 1T8FA 3F8VA 1C6GA 4K5YA 1QTBA 2RB0X 171LA 1LGXA 1CUQA 1CU2A 1L67A 137LA 144LA 1CX6A 2RH1A 1G0QA 229LA 4ARMB 1LYHA 1QS5A 2OE7X 1LLHA 1C6CA 215LA 4I7RA 128LA 1CTWA 161LA 1LPYA 1L32A 2O79A 4ARJA 1C62A 1L14A 1L0JA 1C6JA 249LA 1L50A 1QUHA 1G0MA 2HULA 2OEAX 3EMLA 3DN3A 143LA 181LA 1L59A 172LA 4ZPUA 221LA 1L57A 227LA 5LZMA 2RAZX 1T8GA 258LA 1DYCA 1L33A 1CU0A 4GBRB 188LA 1L48A 141LA 1L00A 1L90A 3HUKA 232LA 1C6EA 2B7XA 1P7SA 3RUNA 1QT4A 1K28A 3FI5A 152LA 2Q9EA 1D2WA 4I7KA 1T6HA 3C81A 1L77A 1C6DA 1L81A 1CV4A 3FA0A 3CDTA 1DYAA 122LA 3HH6A 3NY9A 1LI2A 1JTNA 1L49A 107LA 4PJZA 2RAYX 1ZWNA 1L55A 145LA 2F47A 3LZMA 108LA 1P5CA 2O4WA 250LA 1KY0A 2OTZX 3SN6R 1PQKA 3SB9A 1L72A 175LA 156LA 4E97A 118LA 200LA 1QT8A 2Q9DA 3CDVA 1L42A 2RBNA 2B6YA 3HH4A 237LA 1C66A 138LA 1L01A 1L89A 214LA 206LA 251LA 1L80A 3GUJA 3DN8A 233LA 4W53A 4IAPA 1SX2A 1P37A 245LA 2NTHA 3GUOA 1L26A 1L22A 1L66A 1CUPA 241LA 151LA 2LZMA 1QTZA 3GUNA 120LA 3C7YA 3FADA 4W57A 2QARC 2NTGA 198LA 3HTGA 223LA 201LA 158LA 190LA 155LA 3DMVA 4W52A 3DKEX 3HUAA 1T8AA 187LA 157LA 1KS3A 3GUKA 3L2XA 2B72A 4W55A 1C65A 164LA 4W54A 1L16A 4EPIA 1LYFA 1L58A 1L28A 3C7ZA 1L75A 180LA 1L97A 2O7AA 3DMXA 3UONA 166LA 192LA 252LA 3G3XA 4LDOA 1L51A 2B6TA 4I7PA 4DKLA 1L87A 1CU5A 4YX7C 2LCBA 1OYUA 205LA 1D2YA 226LA 1I6SA 3C83A 238LA 228LA 236LA 4EXMA 4I7MA 1L24A 2OU9A 2HUKA 1LYIA 1SWYA 1CV3A 1L43A 3JR6A 1L08A 189LA 1L23A 1L19A 4I7SA 3VW7A 150LA 1L88A 1D3FA 1L54A 1ZYTA 247LA 4GRVA 1G0GA 103LA 174LA 140LA 1SWZA 1L93A 2IGCA 3SB6A 1PQOA 4EPFA 1C6MA 1WTHA 222LA 3SB7A 2CUUA 1LYDA 2Z6BA 1CV5A 3RZEA 1D3JA 1L76A 3OE8A 1L11A 3HDFA 1P46A 1QT6A 1L92A 182LA 1XJTA 3V2WA 3DN1A 1QSQA 2RB2X 1L39A 4DJHA 1QUDA 1PQMA 1P6YA 3DN0A 3C8SA 1L36A 1ZURA 1L27A 1D9WA 1L85A 1G06A 2B75A 1G1VA 1CVKA 3DN6A 1L86A 209LA 1C68A 3SBBC 1CU6A 1B6IA 3SB5A 4EJ4A 1LWGA 3SBAA 256LA 195LA 109LA 4I7NA 1P64A 110LA 1L02A 2RB1X 3QAKA 3PBLA 1L71A 234LA 1DYGA 3HH3A 4LDLA 1LW9A 3D4SA 1L17A 1L40A 1G0JA 2B74A 2B6WA 3DNAA 1QSBA 4ARLA 1JQUA 1C64A 2OTYX 3C8QA 146LA 1OVHA 1L46A 3HT6A 4OO9A 213LA 4ARQA 1L69A 1QT3A 1KW7A 1L83A 3C80A 1L79A 1OV7A 3HH5A 4I7TA 4DAJA 1L15A 1G0PA 4EKSA 1C6FA 4LZMA 4W51A 1C6LA 1LGWA 111LA 1C61A 113LA 4W59A 1L99A 2ANVA 3GUMA 1P2RA 4AQNA 1C6TA 1L37A 1P36A 4EKPA 1QTHA 1PQJA 131LA 1SSWA 4I7OA 2ANXA 1P2LA 4I7LA 127LA 129LA 125LA 1G0LA 218LA 1CV0A 231LA 4I7QA 259LA 3CDOA 1OVJA 211LA 260LA 1L70A 1LYEA 112LA 170LA 159LA 4EKQA 3HT9A 1L31A 3OE0A 1L09A 3HWLA 1EPYA 1L13A 168LA 1OVKA 1CX7A 1C69A 2B6ZA 1L12A 210LA 178LA 2B70A 130LA 1C6NA 186LA 2HUMA 1L52A 1C67A 1TLAA 1L73A 3OE6A 2B6XA 1L03A 1L62A 1KW5A 1NHBA 3GUIA 2L78A 3HTFA 1L10A 123LA 1PQIA 1L04A 149LA 114LA 3OE9A 3K2RA 3HTDA 1L98A 3ODUA 1L29A 4PK0A 4ARPA 1L53A 3HUQA 1L34A 5I14A 1L65A 254LA 4EKRA 1D3MA 2LC9A 253LA 1PQDA 1C6BA 216LA 244LA 4S0WA 6LZMA 176LA 4ARMA 3DN4A 163LA 1P56A 1P3NA 224LA 3HTBA 1G0KA 242LA 1L61A 1OWYA 3V2YA 1C6QA 1L35A 183LA 2B73A 1LWKA 160LA 142LA 217LA 1L07A 1T97A 1G1WA 1LI3A 3GULA 3GUPA 1L56A 1L74A 1LYJA 2RBPA 199LA 3DMZA 1LI6A 119LA 3G3VA 248LA 169LA 1L91A 1DYFA 1L96A 185LA 1QT7A 4YXCA 1L05A 1L60A 1L84A 165LA 184LA 1L64A 1LYGA 173LA 4ARQB 2OU8A 4W56A 2QB0B 1QTDA 2OE9X 148LE 1DYDA 1L47A 4LDEA 3C82A 230LA 2RBRA 2RBQA 1SX7A 1LGUA 1L30A 243LA 239LA 1C60A 261LA 3HU9A 3SB8A 220LA 1L18A 1L68A 235LA 1CU3A 2A4TA 1C6KA 1L25A 162LA 1C6IA 3DN2A 1L45A 177LA 3HT7A 1DYEA 1DYBA 2RBSA 1JTMA 1L06A 1L63A 1L44A 2OE4X 4YXAC 4I7JA 3C8RA 1L41A 219LA 246LA 257LA 1C6HA 139LA 3HDEA 1KNIA 1G07A 1L95A 3CDQA 1QS9A 1OWZA 1C6PA 1L21A 1QTCA 3G3WA 2RBOA 1OV5A 4W58A 3HU8A 7LZMA 1C63A 1L38A 1QT5A 115LA 3HT8A 104LA 3NYAA 196LA 2F32A 147LA 167LA 191LA 1CV6A 1D3NA 3NY8A 1KY1A 1XEPA 3L64A 3F9LA 212LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1GB2A 1LSEA 4OWAA 1SSYA 2F30A 4H9HA 1PS5A 3CDRA 3TXDA 5LA8A 1JTOL 4OOOA 4ZEEA 1T8FA 3F8VA 1C6GA 3LYTA 1HFZA 1GE2A 2RB0X 171LA 1LGXA 5KXWA 1LKRA 2IHLA 137LA 4TUNA 1DKKA 2EIZC 3A34A 4ARMB 4HJZA 1LYHA 4WM6A 215LA 1HFYA 4I7RA 128LA 2ZYCA 3CSQA 2YVBA 1GF0A 161LA 1LPYA 3AZ5A 3IJVA 1DPWA 3J4GA 5APDA 1OUBA 1L50A 1WTMA 3AZ7A 5HQ1A 1NWGA 1L57A 227LA 4NGVA 1HHLA 5LAFA 3LYOA 1CU0A 4GBRB 1L00A 1IR9A 4NGZA 152LA 1FLUA 1LZ4A 5FELA 1C6DA 3W6DA 1B5YA 122LA 2BQEA 4LZTA 3WULA 4UWNA 1JSFA 5LA5A 1JTNA 1B7NA 1LSZA 5K7OA 4TX7A 1YKYX 1AT5A 2MEAA 4PJZA 2RAYX 1ZWNA 1UIAA 4NFVA 1OUFA 3SB9A 3ZVQB 2Q9DA 5KKJA 1GBZA 1LMOA 2X0AA 1L42A 2RBNA 1FLYA 2LHMA 3HH4A 237LA 2EPEA 3WUNA 3A8ZA 3TXBA 1L01A 193LA 1L80A 3DN8A 233LA 1SX2A 1GF6A 3GUOA 1P37A 1BWJA 245LA 1L22A 1CUPA 241LA 1IX0A 5KXRA 4LYTA 4PHIA 3N9EA 5A3ZA 1IWYA 3GUNA 3CT0A 3C7YA 2Z12A 4N5RA 3FADA 2QARC 198LA 3CSRA 2DQHY 158LA 190LA 2CGIA 4PGJB 2G4QA 3HUAA 1CKGA 4W55A 2XBRA 1L58A 1SQ2L 4XYYA 1GBYA 3WXUA 1NF5A 2Y8PA 4GCCA 1D9UA 1UIBA 1JITA 1LZ1A 5KXLA 4DKLA 4TTDA 1JKAA 226LA 1CKDA 238LA 3A67Y 4QDNA 1CV3A 1C45A 1JJ0A 1L43A 1L54A 103LA 9LYZA 4P2EA 140LA 1SWZA 2C8OA 4ETCA 1GFUA 3HBEX 1WTHA 4NGIA 1GB8A 4BADA 3TXJA 1CV5A 2YBLA 4MCKA 3RZEA 1D3JA 1LAAA 1T6VL 3OE8A 1L11A 5FHWA 4PJ2C 1XJTA 1GDWA 1L39A 1QUDA 3DN0A 1DI5A 3C8SA 4DQ7A 1WQMA 1CVKA 2FYCA 1L86A 209LA 3SB5A 1CKFA 4EJ4A 1EL1A 1LWGA 3WXTA 3CSZA 3TXFA 3B72A 256LA 195LA 4I7NA 1LMNA 1P64A 1LJKA 4CFOA 110LA 1YAOA 1L02A 3WL2A 1XGTC 2RB1X 3QAKA 4XENA 1GBSA 1LHLA 1V7TA 2BQGA 3HH3A 2D6BA 1D6QA 4N9RA 1LW9A 1L17A 1AKIA 5KXXA 1J1XY 2B6WA 4ARLA 3C8QA 1OVHA 4XJBA 4OO9A 1L83A 1OUDA 1UC0A 4DAJA 2BLYA 4I8SA 3SP3A 4ZIXA 1C61A 4DDBA 4H94A 4HV2A 2ANVA 4CFPA 4GLVA 1W08A 3GUMA 2W1MA 3CB7A 5FEKA 1QIOA 3GXRA 8LYZA 1P36A 131LA 1SSWA 4ET8A 2MECA 1IR8A 5I4XA 5KJ9A 1DI4A 1FBIX 3AGIA 1YL1X 2F2NA 1GF3A 3CT5A 2G4PA 260LA 1FN5A 4H9BA 2EKSC 1GEZA 4EKQA 1FLWA 3LYMA 1EPYA 4IASA 1CX7A 2B6ZA 178LA 2HUMA 1L73A 2Z2FA 2XQOA 1KW5A 1IP3A 1B5VA 1LYZA 3WH1A 2L78A 5KXNA 3T6UA 3ZEKA 1PQIA 4KL7A 1HEWA 3HTDA 1LHMA 1KXYA 4ARPA 4XJDA 5B59A 1L53A 5L9JA 1L34A 5I14A 1L65A 1D3MA 4G4HA 1HEMA 2DQCY 4DD1A 3WU9A 1LJEA 2H5ZA 4DQJA 1P56A 4WG7A 1P3NA 3HTBA 1G0KA 5C6IA 3V2YA 4ETEA 1C6QA 183LA 1AM7A 2B73A 3W6CA 160LA 142LA 1T97A 1B5ZA 1LI3A 3IWRA 3GUPA 1WVUA 2YBJA 2FBBA 169LA 1XEIA 2F4AA 4YXCA 1L05A 1UACY 1ALCA 1B5UA 1UIDA 1LYGA 4WLYA 4UWVA 1QUSA 148LE 1L47A 1LJFA 3C82A 230LA 1LGUA 1L30A 1LOZA 243LA 1LZSA 239LA 1C6KA 2Q0MX 1DYBA 2MEEA 1UUZC 1BVXA 1L44A 4EMNA 2DQIY 4RLNA 4I7JA 1L41A 246LA 2HEDA 1C6HA 139LA 4WMGA 3HDEA 2H9KA 3MGWA 4NGJA 4L41A 1C6PA 1L21A 1QTCA 1GF9A 1IWVA 5DL9A 115LA 3HT8A 4LYBA 1XEJA 4PRQA 191LA 1REXA 1LJ3A 6LYZA 4DD0A 4GLAA 3IJUA 1OQMA 3TMXA 4LFXA 2F2QA 2BQBA 126LA 4WL7A 5JENB 1GFRA 4H91A 3P66A 4K5YA 3D9AC 5HLLA 1QTBA 1CUQA 1CU2A 133LA 4NIJA 3W6FA 1G0QA 229LA 1HFXA 4H93A 4YF2A 2OE7X 1LSPA 4NWEA 2MEFA 1IOQA 4C3WA 1HMLA 1GFVA 1C62A 1L14A 1L0JA 1LCNA 4LT0A 1GBXA 1G0MA 2HULA 4AGAA 5L3HA 181LA 172LA 221LA 3RNXA 1IEEA 1T8GA 1L48A 4J0LA 1XSFA 208LA 1CJ9A 3HUKA 4LYZA 1LSYA 3RUNA 3TXIA 2D91A 1UCOA 1LZEA 1YKZX 1J1OY 2A7FA 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4RDSA 1P2RA 2BQCA 2RSCA 3KAMA 1PQJA 1JIYA 4I7OA 3BKVA 4B4IA 2BAAA 1EQEA 2DBTA 127LA 2BQMA 4I7LA 129LA 125LA 4WM3A 3WPKA 1IO5A 1YKXX 3CDOA 2ZILA 5EBHA 3EMSA 1LYEA 1BWIA 3WW6A 1L31A 4PRUA 3HWLA 4W94A 5I53A 1EQ5A 2HU1A 2MEDA 1C69A 1L12A 130LA 1TLAA 4H90A 4NSJA 2B6XA 5AMYA 1UIFA 1RCMA 1NHBA 4U3XB 1L10A 3EO5A 2ZQ4A 149LA 2ZWBA 2YSSC 2D4IA 1FKVA 207LA 3ODUA 2C8PA 3HUQA 2Z18A 4ETBA 2BQJA 4EKRA 1PQDA 244LA 5LVKA 1GAZA 163LA 1JISA 1B2KA 1L61A 1OWYA 1BGIA 2DQFC 4WLDA 2Z19A 217LA 1G1WA 3A3RX 3GULA 1HEPA 2ZQ3A 4M4OA 3TXGA 4R6CA 2LZTA 1LMPA 1ZV5L 2W1LA 1WQOA 4HSFA 1QT7A 4ZFPA 165LA 4HV1A 1OP9B 4MR1A 1QTDA 5KXSA 1RJCB 3G3AB 1LPIA 5I54A 1C60A 3HU9A 4X3BA 1L18A 1L68A 1F10A 2A4TA 3DN2A 5FDJA 1C6IA 1B9OA 1VFBC 1DYEA 1UIEA 1YL0X 4H92A 1L06A 1L63A 2YDGA 4YXAC 1JPOA 2HECA 1OUIA 1HSWA 2HTXA 1KNIA 7LYZA 1JHLA 1LZRA 3HBHA 3CDQA 3G3WA 4DD7A 1OV5A 4W58A 7LZMA 3A96A 1C63A 1BVKC 1QTKA 153LA 4HJYA 1GE0A 2Z39A 4WM4A 1IORA 1F6RA 2Z37A 1XJUA 3C7WA 240LA 1C6AA 1QUOA 1L82A 197LA 3TMUA 2DQJY 1QUGA 1QTVA 3WPLA 1L0KA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GB2 A;  1LSE A;  4OWA A;  1SSY A;  2F30 A;  4H9H A;  1PS5 A;  3CDR A;  3TXD A;  5LA8 A;  1JTO L;  4OOO A;  4ZEE A;  1T8F A;  3F8V A;  1C6G A;  3LYT A;  1HFZ A;  1GE2 A;  2RB0 X;  171L A;  1LGX A;  5KXW A;  1LKR A;  2IHL A;  137L A;  4TUN A;  1DKK A;  2EIZ C;  3A34 A;  4ARM B;  4HJZ A;  1LYH A;  4WM6 A;  215L A;  1HFY A;  4I7R A;  128L A;  2ZYC A;  3CSQ A;  2YVB A;  1GF0 A;  161L A;  1LPY A;  3AZ5 A;  3IJV A;  1DPW A;  3J4G A;  5APD A;  1OUB A;  1L50 A;  1WTM A;  3AZ7 A;  5HQ1 A;  1NWG A;  1L57 A;  227L A;  4NGV A;  1HHL A;  5LAF A;  3LYO A;  1CU0 A;  4GBR B;  1L00 A;  1IR9 A;  4NGZ A;  152L A;  1FLU A;  1LZ4 A;  5FEL A;  1C6D A;  3W6D A;  1B5Y A;  122L A;  2BQE A;  4LZT A;  3WUL A;  4UWN A;  1JSF A;  5LA5 A;  1JTN A;  1B7N A;  1LSZ A;  5K7O A;  4TX7 A;  1YKY X;  1AT5 A;  2MEA A;  4PJZ A;  2RAY X;  1ZWN A;  1UIA A;  4NFV A;  1OUF A;  3SB9 A;  3ZVQ B;  2Q9D A;  5KKJ A;  1GBZ A;  1LMO A;  2X0A A;  1L42 A;  2RBN A;  1FLY A;  2LHM A;  3HH4 A;  237L A;  2EPE A;  3WUN A;  3A8Z A;  3TXB A;  1L01 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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