1G0TA

Dsbc mutant c101s
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
b'DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBC
source organism Escherichia coli
molecule tags Isomerase
total genus 68
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1g0tA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1g0tA02
2VLUA 4NV5A 1GNWA 2B7JA 1ERTA 2EIOA 1DBYA 1V2AA 3LXTA 1A24A 1GTIA 5HR1A 4IP6A 1SL2B 4PQ1A 5ELGA 2V6KA 4JZQA 1XW9A 1KEBA 1YEPA 2WFCA 1OE7A 1YQ1A 3HVVA 1VF1A 4XHMA 1EV9A 1WJKA 5B6NA 4MA9A 3VFIA 2FA8A 3ISOA 3P90A 3CTGA 4AJ7A 1TI1A 2I1UA 1TK5B 4LLRA 4N11A 1Z7PA 2I4AA 4I6XA 1TK8B 10GSA 3IHQA 2C3TA 2YWNA 3E9JB 3F4TA 4OD7A 2H66A 1IYHA 3EC3A 4TXOA 1GP1A 2X8HA 2FWHA 1GNEA 2GQLA 1V58A 2NTOA 4CHSA 4ML1A 2H0IA 4WR4A 4ZB9A 2M72A 2YNXA 2JSZA 2KP2A 3EMPA 3EVIA 3ME7A 5CO3A 2IMKA 2HT9A 4N0VA 3D4TA 2HSYA 3LJRA 5CRGA 5DVBA 4EL1A 3IA1A 3GV1A 5EVOA 4ECJA 1SK2A 1XWAA 4ISDA 4ZBBA 2QKEA 4HZ2A 2DJ1A 2MBTA 4K7OA 4OO4A 1YEXA 1XWBA 3GH6A 7GSSA 6GSSA 4KGIA 4MMMA 2YV9A 1RK4A 3LG6A 3CBUA 1CQGA 3H4KA 1KBNA 2XBQA 3FW2A 3IK9A 3GMFA 1BJXA 1NM3A 1U3AA 3L9SA 1V40A 1K3YA 5FWGA 3HXSA 1QFNA 3PH9A 1EWXA 3VPTA 1GRXA 3F4RA 1EOHA 4IQ1A 3QOUA 5B6MA 1MDKA 3DGQA 2VCXA 1GUKA 3M8NA 1W4VA 1A8LA 1GLPA 1QUWA 3VK9A 6GSUA 2WB9A 3EURA 4HQZA 1TI3A 4ZB6A 4MJBA 5IO0A 4EE0A 3GTUA 4IN0A 4MPFA 5ECKB 1QGVA 5F0GA 4F0BA 1JLVA 2FA4A 2R4VA 1OC8A 4FH8A 4NAXA 1PSQA 3C8EA 4QQ7A 2LNSA 2FCHA 2HZFA 4TN8A 1ERVA 4KE3A 2B3SA 3Q6OA 3MSZA 3DD3A 1K3OA 4I97A 4AF2A 1LU4A 2FLSA 3DMLA 2H01A 1M2AA 3IK7A 5KN1A 2FWGA 2X8GA 5EPFA 2VCQA 4H86A 1J0FA 1VF3A 4IJ3A 3G9BA 4G19A 4ZBAA 3TJKA 4LL4B 3ZL5A 2L5LA 1GSDA 1PL1A 2F9SA 4CW9A 5IPGA 2LQOA 1SL0B 1B9YC 2QC7A 4OCFA 1S3AA 4MF7A 1VF4A 2NVLA 1A0RP 3ZFLA 3HVSA 4E8EA 1QXHA 1O8WA 2ZCTA 4J2FA 2LQQA 3EU4A 2AHEA 3C1RA 1GH2A 2NDOA 1V98A 2AAWA 2YWMA 3M9KA 1PX6A 5IQYA 2J23A 2PBJA 2L5OA 4EDZA 3TRPA 4YAVA 2HRFA 2VCWA 2JZSA 1EGRA 3C1SA 1FB6A 4MF5A 5AIVA 4IBPA 3UIWA 1I5GA 3GKMA 3QFAC 1YJ6A 4MP4A 3V1WA 2PN8A 2PVOC 1BEDA 1XCCA 1A2JA 3FZ9A 4E8HA 1XVQA 4Z7XA 3I9V2 3FZAA 4X43A 4I2TA 2RLIA 2ZUPA 1J9BA 2OE0A 5ECQB 4EUYA 3RHCA 2OA7A 8GSSA 1USBA 2F8FA 2HZEB 1SKRB 2WCIA 1ST9A 1EOGA 1T3BA 4F0CA 1HQOA 1M9AA 3LYKA 2HI7A 2RM6A 2FNOA 1SK1A 2PWJA 2JZTA 1SU9A 1TXXA 1G7EA 3APQA 2L57A 1WIKA 1SYXA 1SJIA 3QAVA 1A2LA 1AUCA 1R7HA 2I3YA 5IM9A 3BOAA 4NHZA 3A3TA 4XTSA 4PURA 2YCDA 2ON5A 4WF5A 3RDWA 5D9WA 5HFGA 2KUCA 2XPDA 4PNFA 5C00A 5GZZB 2V32A 2YV7A 5J4UA 1M7TA 4QL7A 4J56E 4PQIA 3WD6A 1TOFA 1E2YA 1EP7A 1U88A 5J3RA 3WGDA 3C7MA 4NV2A 4AJ6A 3M3MA 3C73A 3KMOA 4GRFA 1LJRA 3DWVA 4HUAA 3DKSA 2HSHA 1G6YA 2DJ2A 3UBLA 2H1DA 3Q19A 1X0RA 3KH7A 2ES7A 5LD0A 1GSQA 2H1GA 1SL1B 2V2GA 3GIXA 5KN3A 2K8VA 5FT3A 4G2EA 2TRXA 2DC5A 4EXJA 1YF0A 1O8XA 1UVZA 2K6VA 1TRUA 1NSWA 3FR3A 4N30A 2O85A 1T8EB 4JEDA 4XRAA 3GUSA 1T00A 2GT6A 2V6OA 2H76A 2X64A 1ERUA 4MH3A 5H5SA 3IRAA 1K0DA 3IAM2 2H6ZA 1Z5YE 2JL4A 1O6JA 3TJGA 1FW1A 1YKCA 4NXIA 1G0TA 3K8NA 4I5QA 5DCGA 2GS3A 2DSAA 3HYPA 4FYCA 4OFNA 1NW2A 5F05A 3BBYA 1QMVA 4MLYA 1EGOA 1TW9A 2YZUA 4V1Ap 5JCGA 3PINA 1Y25A 4J57E 4WETA 3OR5A 1XVWA 2LEGA 1NHYA 3FEUA 5CP1A 1T4ZA 1JZDA 2JZRA 5ECRB 2RUEA 1THXA 3GN3A 1GSUA 4TRXA 2I9HA 3UL3A 4KUNA 2P31A 4LA1A 4K2DA 1SKWB 2HZEA 1VGLA 1R26A 1H4OA 4MZWA 1X5DA 3EU3A 5F07A 1SK0A 18GSA 5JWQB 1TRSA 1FVKA 3CMIA 3QAGA 1KNGA 1W89A 3DXBA 5ECSA 3WGEA 2YN1A 4XS4A 2HFDA 1AW9A 1XWCA 1WPIA 2O7KA 3W8JA 5J9BA 2WZ9A 4NWYA 5D96A 1HYUA 5DJLA 3D0ZA 4XIHA 1NHOA 5HFKA 2LJAA 1Z7RA 2GQKA 3UOMA 1YY7A 3TKSC 2DBCA 2LSTA 2QSIA 4KAEA 3WT1A 1K0OA 2AV4A 3QD9A 1XPVA 3P2AA 2LUSA 2P5QA 4EDYA 5E4WA 4IHUA 4K0NA 2X8CA 4LMWA 5B7CA 4NMUA 2H70A 22GSA 4RUVA 3ERGA 3TRXA 4ILFA 1SENA 4G10A 17GSA 3UAPA 3KP8A 1GWCA 1TRWA 5ECOB 2XPEA 4ML6A 5JWRB 2YANA 4XCSA 2GSTA 5ABRA 3O3TA 5DCHA 1G6WA 1YDKA 1PD21 20GSA 3HJPA 3GYKA 4YAPA 5A4VA 2MMAA 2KHPA 4L8EA 3EYTA 2IPAA 5IOWA 1ZYQB 3LGCA 3O76A 5G1LA 3TJJA 1Z6NA 1SD8A 3TGZA 3BD2A 4XRDA 3NOFA 3TKSA 3GSSA 1LBKA 3QAWA 2IL3A 3MDKA 3GX0A 2QGVA 2YJ7A 3EE2A 3VLNA 1DUGA 2DLXA 2IMEA 3UVHA 4FO5A 3KH9A 1JHBA 3UVTA 1YF1A 2VL9A 2L59A 1FOVA 4IELA 3PGTA 2V1MA 3KZQA 5INYA 2DJ3A 3NIVA 3CXGA 1F3AA 4FYBA 2A4VA 1GTAA 5IMDA 4P3YB 2KP1A 3FYGA 2B1LA 4EKZA 3TCOA 4KSMA 3QMXA 2GGTA 2F51A 1WP0A 1EZKA 3H93A 3F8UA 3JCML 2PMTA 4NHWA 1E6BA 3GL3A 4TXVA 5G5FA 2NBSA 1A2MA 1OC3A 3GSTA 1TKDB 2XHFA 3IPZA 2OE3A 4IKHA 3KD0A 1EEJA 4D73B 5DALB 4ZBDA 1EEMA 1PA3A 2LKUA 3EMXA 3LQ7A 3ZTLA 2VIMA 3KMNA 2VO4A 1B48A 1VRSD 2I81A 2H19A 1XW6A 2IIYA 3F3QA 1O73A 3GHAA 3UJ1A 3ZIVA 4IS0A 1SJZA 2CVBA 4EO3A 2HNLA 2OKAA 2FGXA 4DSSB 2O87A 5F06A 4EF0A 1HNCA 1OYJA 2VAFA 4BPYA 4L0WA 4TVEA 4TKYA 2PU9C 5ENUA 4ZL7A 2CV4A 3LWAA 4TR3A 1EV4A 1FG4A 5J41A 2ON7A 5F8BA 4HI7A 1GUHA 1HD2A 2A2RA 1GL8A 5DQSA 1FAAA 5AISA 3TJFA 1M99A 2MMOA 5G31A 1K0MA 2LRCA 5DQYA 3TRQA 1F2EA 1XWGA 1K0AA 3C71A 3KIJA 2XC2A 3ZIJA 3FHKA 3ZMKA 4G9HA 1ACVA 3N5OA 4ACSA 5CAXA 2CX4A 1Z6MA 5CYYA 5ECMB 5HR0A 3IBHA 2E7PA 2VLVA 1PN9A 2MYGA 3IDVA 4N10A 4AGSA 5AIXA 1GSSA 2LRTA 5LNKe 3DIEA 1K0CA 4KCEA 3E0UA 4PUAA 1C72A 2OBKA 3L4NA 1QQ2A 4GCIA 5IMZA 2PGTA 2VLTA 3KEBA 3Q18A 4OMVA 2H71A 4Q5RA 4BWQA 3NZNA 2VUPA 4OFTA 1N2AA 2O89A 4ID0A 1U6TA 1ZMAA 1MTCA 1T7PB 3EWLA 5H5QA 4F2IA 5HFIA 4IW9A 4KH7A 5IMAA 4ECIA 3HDCA 1OAZA 5AGYA 2K18A 5CREA 2G0FA 3QDNA 3G7JA 1GLQA 2LJKA 2VCVA 2CQ9A 2HXKA 3ME8A 3HHVA 4WBJA 2H1AA 4JU5A 3FR9A 3E3EA 4HEA2 1S3DA 2C0FA 1ZZYA 2IN3A 4O5RA 4V2MA 1Z3EA 2CX3A 1Q4JA 3CSJA 4V2LA 4Q5QA 6GSYA 3ZFBA 4Q5NA 1F9MA 4XS4B 2IFQB 3D6IA 5EL8A 4ULXA 2V41A 4OFMA 4D73A 4KCAA 1OE8A 5DALA 1FO5A 3US3A 3S9FA 5IMCA 2FWEA 4ECCA 3LORA 3VWWA 1KTEA 1URMA 1IYIA 2N5FA 4TR1B 5ID2B 2JU5A 1R4WA 3A2XA 3GKXA 4GXZA 1SJ6A 5G30A 4MPGA 19GSA 4PXOA 4DSSA 3UEMA 1XXUA 4V1Ag 1G7OA 2HE3A 1OVNA 5L71A 2YPMA 2WJUA 1WMJA 1XBSA 4BWSA 3TB2A 3CSIA 5ECLB 2YJHA 6GSVA 3F4SA 2BMXA 4O92A 6GSTA 1ZCPA 3LYPA 5J9CA 4K7IA 2PVQA 5JCUA 1MDJA 3TKPA 9GSSA 5GAND 4BL7A 3TKRA 2H0HA 2GT5A 1ERWA 2VM2A 2VM1A 2IMIA 3N9JA 4GQFA 5DDLA 1M2DA 3GRXA 2OADA 4HDEA 3VWUA 4F82A 2C80A 2GSSA 2B5YA 1VF2A 14GSA 4F03A 3LFLA 5LCZA 1THOA 3GH9A 5B8AA 3O6TA 2NPBA 3H8QA 2YZHA 2AUVA 4K1FA 2IYJA 3M9JA 2JSYA 1AAZA 4JR4A 1XWKA 1TDIA 1ON4A 2PERA 1R5PA 1PL2A 5GSSA 4BVXA 3IE3A 4HQSA 1V9WA 3CSHA 4KW6A 1X5CA 3PR8A 3BCKA 3CRUA 3HJMA 1U87A 1BX9A 3F0IA 4O7HA 4XS6A 4TW5A 1Y6EA 2DJ0A 3W6GA 5G2ZA 4X0XA 2H72A 4JE1A 3P8WA 4I2UA 3IAS2 1Z9HA 1F6MC 1PX7A 6GSWA 2OJLA 3A2VA 4YQMA 3FKFA 2H75A 1MD4A 2LV3A 3GFKA 3LXZA 4L0UA 3ED3A 4IVFA 1GULA 2CVKA 1X9WB 2GZZA 4KDXA 3GX8A 4RI6A 2K9FA 3I6AA 3MAKA 2FUG2 3F6FA 3MWHA 5A4WA 2M46A 2YOIA 2IJYA 1XOAA 4PUFC 3G7IA 4WF4A 2TRCP 2BJXA 13GSA 1ABAA 2G2QA 1MEKA 4TR0A 2B7KA 2Z9SA 3RBTA 1XW5A 2B6MA 1GSEA 5CRWA 4GF0A 4PX1A 2IFQA 4MF6A 5J5NA 2LNTA 4LMVA 3GA4A 3IR4A 1CQHA 3F9UA 1XIYA 3H79A 5D8IA 5ECIB 4OO5A 5A5KA 2WDUA 4RI7A 5DBQA 4K8MA 1F3BA 1A23A 4K6XA 3WYWA 3HZ4A 4MJEA 1U3IA 5AN1A 3ZLPA 3F3RA 2L4QA 1V57A 2E2GA 4TR1A 5ID2A 1JZRA 4DSQA 2DJJA 1Q98A 2VD1A 4QL9A 4WR5A 4L5OA 5CRHA 4IJIA 2N5BA 1HNBA 1GSFA 1GSYA 4POBA 4FIWA 3HZ8A 4POKA 1PGTA 2P0GA 3A2WA 3QFBC 1PMTA 4CDOA 3I43A 2H73A 1AQVA 2P5RA 2VCTA 1B4PA 2A2SA 4HOJA 1TTZA 4MZBA 2C3QA 3HA9A 2H30A 4MH2A 4ZXGA 5G5EA 1YZXA 2BTOT 3VI7A 1ILOA 3UBKA 4KA0A 1RW1A 4X1UA 2C8UA 4EVMA 1ZGNA 2F3MA 1O7UA 1BYEA 4POMA 2AJQB 3HCZA 4K7NA 2VOCA 5IMFA 2YWIA 3IC4A 1XOBA 1F37A 4KX4A 1JZWA 5G1KA 2YWOA 3U5RE 2CAIA 5H5RA 16GSA 2D2ZA 1M2BA 2DJKA 2GTUA 4WBRD 1X9SB 1UC7A 5ECHB 5CRDA 3HVXA 2R2JA 2REMA 3L0HA 3ERWA 1XZOA 5CNWA 5D73A 5KEJA 5IIZA 4YQVA 2FY6A 4DSRA 12GSA 3EINA 2EC4A 1BQ7A 1JLWA 1BG5A 3TOTA 2EIRA 1R5AA 1WE0A 1A0FA 3VI5A 1OKTA 3RHBA 5HQPA 3DVXA 3ERFA 2OE1A 1ZYEA 1EP8A 4ZIJA 2DIYA 3ZMLA 2VCZA 3LEFA 4ZL8A 4MCUA 1S3CA 2GLRA 2H1BA 4PQHA 3QR6A 2H6XA 3FR6A 2GZPA 4ECBA 1YKAA 5B8BA 2L4CA 2C0DA 2CT6A 2MZCA 2KOKA 2B5EA 2C3NA 5JWOB 1AC1A 1JFUA 3TKSE 4KSOA 4MK3A 5GAPD 2VD0A 5HR2A 3DRNA 4MJCA 4JR6A 3A5WA 2IMDA 2H0GA 1GUMA 1FB0A 2AYTA 3J7Yb 5EY6A 5DAKB 3KTBA 1UN2A 4RQRA 1FVJA 3HKRA 1OC9B 1GTBA 3L9VA 1TJDA 2LS5A 4KDUA 1RQMA 1WWJA 2HRNA 4XS1A 2RM5A 3DYRA 1N8JA 1AQXA 5ECPB 2XBIA 3TDGA 3VWXA 4HU9A 4WKWA 2R6KA 4WXTA 3KXOA 1SD9A 2CA8A 5IMVA 1PKWA 4HJ2A 3CTFA 2ALBA 1ZOFA 4EC0A 2LTKA 3KJYA 2GSRA 3I69A 3KM6A 4DEJA 5ELAA 2OBIA 4JRRA 1PQNA 1FHEA 4HJMA 1K0NA 4YH2A 1MDIA 3FK8A 2AB6A 2GSQA 1TP9A 3LSZA 4WEYA 2MBSA 4IQAA 1SKSB 4IGJA 2K8SA 5JCWA 3GKNA 4MJAA 1DE2A 1B4QA 3SWLA 2CZ2A 3ZYWA 3CYNA 3FZ4A 2GDRA 3UMAA 2R5GA 4L5LA 2YP6A 4NPBA 2OACA 2B1KA 4FYUA 3TUEA 4RQXA 1JZOA 3GNJA 2GZYA 4KDYA 4GTUA 4ZB8A 2PPTA 1HNAA 4BVYA 5IPHA 1MD3A 1ML6A 2WS2A 3F63A 2FHEA 3IOSA 1AXDA 5D9TA 3APOA 4GSTA 3BCIA 3FRCA 2CZ3A 5A4UA 2N5AA 4Q5FA 1TK0B 2JADA 1H75A 4TR4A 4AJ8A 2M80A 3ZVJD 2WULA 3M1GA 1BAYA 1PKZA 4DVCA 5D9XA 2IMFA 2ZNMA 2LJRA 4OCEA 3RAZA 4GSSA 4GLTA 2VL2C 2WRTA 11GSA 2CVDA 3MNGA 2EIQA 1UA5A 3M0FA 5HR3A 4KNDA 3BJ5A 4F9ZA 3VURA 3KP9A 5KN2A 1TU8A 4HU7A 2L6CA 2E2MA 3P7XA 3R2QA 2RUFA 3HJOA 3U6VA 1M0UA 2C0EA 3APSA 2MMNA 2C1YA 5ECNB 1J08A 3GURA 5GSTA 3GL5A 3QPMA 4V2NA 1TRVA 3FY7A 5DAKA 2F8AA 5COHA 3RPPA 4ZL9A 2L6DA 1OC9A 4JBBA 1K0BA 1PRXA 3FZ5A 1WOUA 3D21A 2MMZA 4MZCA 4PGTA 3KGKA 3CRTA 4TOPA 2VL2A 2H6YA 2B5XA 3VPQA 5DJMA 2DIZA 1A8YA 1ZL9A 3VWVA 2PUKC 3W8SA 4TXOB 2TIRA 3WGXA 1GTUA 1XFLA 2KLXA 3KCMA 1SYRA 2DMLA 3D22A 3KTLA 4HZ4A 3IXRA 3IV4A 4N0ZA 2JACA 3TOUA 1DE1A 3HY2A 3L78A 3DEXA 2R3XA 4MDCA 4PNGA 4OWYA 5FHIA 3DVWA 2E0QA 2O8VB 5IO2A 1K3LA 1B8XA 2HYXA 4GQCA 1T1VA 5KN0A 2GQMA 1TU7A 2X99A 5E59A 2VL3A 5D93A 4ZILA 2R37A 4K0GA 2IWTA 1AQWA 2H8LA 2H74A 1I9DA 1OKDA 4O32A 3QCPA 3ZZXA 4MABA 2FD3A 3HD5A 3Q74A 2C0GA 1O85A 2GVPA 2J9HA 5IOXA 1T4YA 4POLA 1QK8A 2IY2A 1AIUA 1DSBA 3GKKA 2DMMA 4YQUA 2WGRA 1M9BA 5C04A 3ZITA 3J7Yk 2LRNA 4LL1B 1X9MB 2RIIA 3TKQA 3D5JA 3G7YA 3GTUB 3F6DA 4I8BA 3TJBA 3L9UA 4HS1A 3H1NA 1B9XC 5D9VA 6GSXA 3AY8A 3WT2A 2FWFA 1X5EA 1O81A 1WRYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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