1G0TA

Dsbc mutant c101s
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBC
publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 68
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1g0tA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1g0tA02
3KM6A 2L5LA 4PGTA 5B7CA 1YJ6A 3GV1A 2K8SA 3RHCA 10GSA 4IJ3A 5DDLA 1M99A 2LUSA 3ZL5A 2PVQA 1T1VA 3CXGA 4MDCA 3VFIA 4NMUA 1EWXA 2E2MA 3GURA 5IIZA 2E0QA 1SU9A 4WETA 5IMDA 4PNFA 1NHYA 1TRVA 1ZGNA 5ENUA 3TKPA 3EWLA 4TR1B 4RI7A 1GNWA 1CQHA 4FYUA 2PUKC 3GKKA 1OE7A 1IYHA 1QUWA 3QFBC 3ZVJA 1EGRA 1T3BA 4MZCA 2F3MA 1B8XA 2DJ1A 2VCWA 2ZUPA 1H4OA 5EL8A 3GUSA 2YWMA 4GSSA 2YJ7A 2JZTA 2C4JA 3F3RA 3J7Yk 4JU5A 3PR8A 4ACSA 1JZDA 1XWAA 4OFTA 3UOMA 1TK0B 3ME7A 2HSHA 1SKWB 2E7PA 4MZWA 5C00A 19GSA 4HOJA 3GH9A 2LRNA 2LEGA 3Q18A 1THOA 1K0BA 4TVEA 4KSMA 5DAKA 2HLSA 2DIYA 2AAWA 3NOFA 2WRTA 2L6DA 4NV5A 1EOGA 1K0CA 4KB3A 4G9HA 4ZBDA 3LQ7A 3UARA 3H4KA 4IQAA 1S3CA 5AISA 4V1Ap 2BMXA 1A0FA 1JLWA 1QGVA 2LJRA 4X1UA 3PINA 4OFMA 4MF6A 4IP6A 4POBA 3L0HA 2YJHA 1PKWA 3US3A 3UMAA 2VL2A 1WRYA 2K9FA 2V6KA 1F6MC 3HZ4A 5ID2A 4K6XA 5G1LA 1YY7A 1PRXA 5INYA 1AXDA 4GRFA 5A4WA 1URMA 2YZUA 1A8LA 3HHVA 3FW2A 1TTZA 3BBYA 2MMAA 1O73A 1WIKA 1MDJA 2ON5A 1GSDA 1XBSA 4KDYA 1W4VA 3GYKA 3EU4A 1R5AA 2O85A 2IMFA 3I6AA 1SK1A 4TXOB 2DLXA 4TKYA 4K7OA 2H6YA 11GSA 3M9JA 1XWKA 1M7TA 1YF1A 3QAVA 1SKSB 4BWSA 1TK5B 1G7EA 4HUAA 2X8GA 2FWHA 1U3IA 1SENA 2VUPA 3ZRDA 4IBPA 3A2VA 4ZB6A 1B4PA 4DSSA 1OC9B 1HNCA 3TOTA 2O89A 5IM9A 2K18A 2AJQB 1SD8A 3QAGA 3HDCA 3GMFA 5A4VA 2DSAA 4XS4B 2XHFA 2O87A 4KH7A 3RBTA 1GTIA 2VL3A 2HFDA 1O8WA 4MLYA 4PUFC 4EE0A 4AF2A 3GX8A 3F3QA 2YWOA 1PX7A 2FUG2 3HKRA 4L8EA 3KH9A 2IMIA 2K6VA 1YKAA 3M3MA 4N0ZA 3TKSE 2H6ZA 3DVXA 4ZB9A 1YEPA 3N5OA 2I4AA 4WR4A 4TR3A 2LKUA 5D93A 3VURA 2CX3A 4HJMA 3F0IA 1U88A 3VWWA 4EXJA 1BYEA 2JACA 3ERGA 5F8BA 1W89A 1V40A 2O8VB 3TJJA 4K0GA 3I9V2 1GTUA 2C3NA 4RUVA 2H72A 2WZ9A 1A2LA 3DIEA 1GLQA 3KTLA 1GP1A 5HFGA 1PQNA 2GDRA 4I8BA 3TUEA 1JZWA 1B9XC 5ECKB 1EEMA 2FNOA 3ZFBA 2VLVA 3IK9A 2H76A 4HU9A 5CRHA 4EKZA 2XC2A 2OADA 2H75A 1B9YC 3PH9A 1XVWA 1OYJA 2KHPA 2FY6A 1Z7RA 3IBHA 5DQYA 2H73A 1KBNA 5CO3A 1AQWA 5D8IA 4K0NA 4IELA 3APSA 1TRWA 1DSBA 4WF5A 2OBIA 2B1KA 1NW2A 1X9SB 4LMWA 1PMTA 1FHEA 3NZNA 1UC7A 4DSRA 3UIWA 1J08A 1F37A 4DVCA 4OWYA 1OAZA 3J7Yb 3DWVA 4MZBA 3GHAA 1XWCA 2H1DA 3GA4A 2YWIA 4JE1A 2HE3A 3GKNA 4XS1A 1MTCA 1HNBA 4NHWA 2FWEA 1K0AA 2CAIA 2F51A 3GIXA 2R3XA 2CQ9A 2H71A 1EV4A 2IMKA 4YQUA 1ZL9A 1C72A 1QQ2A 2YN1A 3CBUA 3F4SA 1JHBA 4KDXA 4J56E 1I5GA 3IAS2 4LLRA 2DJ0A 3IRAA 3CMIA 4D73A 5J4UA 2OE3A 2H0HA 4DEJA 3M0FA 1O85A 1V98A 1LJRA 1NHOA 14GSA 4Q5FA 3UBLA 3ZFLA 4ECIA 1PL2A 2OJLA 4E8HA 2C0GA 4G19A 3A3TA 3W8SA 5ELGA 3CRUA 4F0BA 1TI1A 3ZIJA 4YQMA 1U3AA 1V57A 2DJ3A 1HYUA 1MDIA 3C1SA 6GSXA 2GQLA 2N5FA 5DAKB 4I6XA 2J23A 5KN1A 2YV9A 3FHKA 5D9XA 3C8EA 4X43A 2MBSA 2XBQA 4MPGA 3EVIA 5KN2A 1M2AA 1QXHA 3IV4A 4BVYA 1TRUA 2GQMA 4HQSA 3UEMA 1FW1A 2C8UA 4ID0A 1T4YA 2JZRA 1TI3A 1T7PB 3H93A 1YDKA 2XPEA 5ID2B 4QQ7A 2LNSA 4IS0A 3O76A 1X5DA 1THXA 3D21A 2DMLA 2NVLA 3VPQA 3LG6A 3F6FA 3ZIVA 3F9UA 4BA7A 4ZXGA 2FA8A 3O6TA 4X0XA 1X9MB 1N2AA 2NTOA 3D0ZA 1K3LA 3TKSA 3W8JA 6GSSA 4TOPA 1FG4A 3RPPA 3IE3A 3DVWA 2V41A 5COHA 2H1GA 1U6TA 1I9DA 3FR6A 4JRRA 1KEBA 2P0GA 2MMZA 3HZ8A 3KMNA 5HFKA 2LQOA 3APQA 5JCGA 17GSA 5CRDA 1VF2A 1FB6A 3UBKA 4POLA 3GN3A 2HYXA 2WULA 3QMXA 4HEA2 4KNDA 3KGKA 3FZ5A 3WGXA 5L71A 2FLSA 5H5SA 4BL7A 2B7JA 1TKDB 4EDYA 4H86A 13GSA 4OD7A 2L57A 2ZNMA 1SKRB 2KLXA 2G0FA 2PPTA 4DSSB 4BWQA 2HXKA 2IMEA 4EDZA 1SL1B 4ZBAA 3UVHA 3V1WA 1OKDA 4KAEA 3ISOA 2WDUA 2WB9A 3QOUA 1VF1A 1OC8A 2NBSA 3TDGA 2CVDA 1IYIA 4RI6A 1K0OA 3LXTA 2YPMA 2VL2C 3WGDA 5IO0A 3EU3A 2IFQA 4N11A 1FVKA 1WP0A 3GNJA 2GSQA 4KSOA 4V2NA 5CRGA 3GH6A 2PERA 4G2EA 1R7HA 2FHEA 2REMA 2GVPA 1OE8A 2HI7A 4V2MA 1M0UA 4OMVA 3F4RA 4XIHA 1QFNA 3LYKA 4TR0A 1F3BA 1GSYA 2N5BA 1A24A 3TKQA 3MAKA 5B8AA 4MJAA 1ZYQB 5IMFA 4MF5A 5CNWA 5F06A 3GTUA 1SL0B 4GQCA 2YANA 2FWGA 1GNEA 4NAXA 4YAPA 5EY6A 2TIRA 2E2GA 2BTOT 1GSUA 4AJ7A 4E8EA 3QDNA 2LJAA 3FZAA 5IPHA 4I2UA 1SL2B 1GSFA 1K3YA 3TRQA 3G7YA 3QAWA 1WJKA 2V6OA 1ILOA 4PQHA 4OFNA 5IOXA 1BJXA 1Y25A 3VK9A 1XFLA 2H8LA 1K0NA 2EIRA 2F8AA 5J5NA 2AB6A 3L9SA 5H5RA 1XPVA 1TU8A 3EE2A 3C1RA 3D5JA 1V58A 2VO4A 1BQ7A 1Z9HA 6GSVA 4GTUA 3C71A 1FAAA 3CSHA 2D2ZA 1A0RP 3ERWA 4EVMA 1YF0A 4MPFA 2NPBA 1AW9A 1Q98A 4DSQA 4IJIA 3QPMA 1DUGA 5IPGA 4NXIA 1AIUA 4YQVA 2LQQA 3C73A 3L78A 4HZ2A 2DJ2A 2G2QA 4JEDA 3ED3A 4MH2A 4N30A 3IOSA 2H1AA 4WF4A 5IO2A 3ZVJD 2AHEA 2OKAA 3TJGA 4LL4B 5ELAA 3GFKA 1OC3A 2YWNA 4OCEA 1VF4A 1XIYA 2C0EA 2CAQA 2DC5A 2ON7A 4KDUA 2CX4A 1RK4A 2LS5A 4CDOA 5LCZA 1V9WA 5G2ZA 4AJ6A 3LEFA 3KIJA 4IGJA 5G1KA 1Z6MA 4F82A 4EF0A 2QKEA 1USBA 4WBRD 2OACA 2GQKA 4D73B 5HR3A 2R37A 3EYTA 4HU7A 2WCIA 4TW5A 5KEJA 2FA4A 1PN9A 2A4VA 2LRCA 1EV9A 1GL8A 2VAFA 2L5OA 3FZ9A 3IAM2 1VF3A 2LTKA 2KUCA 3P90A 3BJ5A 4KW6A 1G7OA 2H66A 4ECJA 3HA9A 2MYGA 5ECPB 1EOHA 3S9FA 1ZYEA 1UVZA 1ZZYA 2MZCA 1X0RA 1FOVA 1TK8B 4OO5A 3MSZA 4QL7A 1XCCA 5DQSA 4YAVA 3L4NA 5DCGA 3FRCA 1EGOA 4IW9A 4POMA 1GTBA 2EIQA 2N5AA 2VD1A 1LU4A 5A5KA 4KA0A 3H1NA 3KD0A 2LRTA 3VI7A 2XPDA 3DXBA 2C3TA 3NIVA 1T4ZA 2AYTA 2H30A 1AAZA 2L4CA 1TXXA 3ZZXA 5JWOB 2XBIA 5H5QA 2V2GA 3GSSA 4ZL8A 3CYNA 3TGZA 3LGCA 4PNGA 2DBCA 2FWFA 5E4WA 5JWQB 4FH8A 4ZBBA 1J9BA 1GUKA 3WT2A 4F2IA 1GLPA 1HQOA 1F3AA 5B6MA 3HY2A 3UVTA 4ECBA 5EPFA 3KP9A 2I81A 4N0VA 4POKA 3SBCA 4MJCA 3EURA 1TRSA 2ZCTA 3BCIA 3RHBA 1UN2A 3KEBA 4ZL7A 2I3YA 3CRTA 5AIXA 4K1FA 3P2AA 5ECOB 1GH2A 3MWHA 5DALA 5IOWA 3KJYA 18GSA 4YH2A 3GRXA 4HDEA 3UJ1A 2K8VA 1H75A 2IL3A 1DE2A 3MDKA 3FR9A 3U5RE 3IA1A 3TRPA 3DYRA 1SD9A 1YZXA 4HI7A 2AV4A 1Z3EA 5EVOA 3HVVA 1N8JA 6GSUA 1ERUA 3FKFA 1PD21 5HFIA 1ZMAA 1RQMA 3DKSA 4TR4A 2RIIA 1PSQA 2WS2A 3TCOA 4CHSA 1O8XA 1PL1A 1DE1A 1M9AA 5FWGA 2PBJA 3ZREA 2IFQB 22GSA 2IMDA 1MD4A 4K9ZA 4QL9A 3HJPA 3IC4A 4PQ1A 2OE0A 1TJDA 5G5EA 4GXZA 2H19A 1FO5A 3TKSC 4KCEA 1EEJA 3KZQA 1R5PA 4TRXA 1F2EA 1YKCA 1JZOA 1PX6A 2H6XA 3DRNA 3LXZA 2CT6A 3WT1A 2HRFA 2B3SA 5J9BA 1ERTA 1YEXA 1XOAA 4O7HA 2B6MA 5E59A 5LNKe 2L6CA 4JR4A 3HJMA 4IVFA 3RDWA 2HRNA 3GTUB 2GZPA 2Z9SA 2PU9C 3K8NA 2IN3A 1B48A 4EL1A 1SJZA 1Z6NA 2DIZA 4RQRA 1SJ6A 4BVXA 9GSSA 2IWTA 3WYWA 4I5QA 2IY2A 3VWXA 2HT9A 1FB0A 3GX0A 5LD0A 4IP1A 2VCXA 3FEUA 3TJFA 2CZ3A 4HJ2A 2M46A 2H1BA 1JLVA 4PURA 2WFCA 3D22A 3HVXA 4GCIA 1ACVA 1O7UA 5G30A 4NV2A 5IMCA 3F63A 1FVJA 4KUNA 2ES7A 2B5XA 1TW9A 3R2QA 2TRCP 3IK7A 3E9JB 4MK3A 4ZB8A 2H70A 1JZRA 3HVSA 2I1UA 5C04A 2A2SA 1PGTA 5D96A 3KTBA 2MMOA 2FGXA 2DJKA 5GSTA 1A2JA 1XOBA 5FHIA 3Q19A 4L5OA 3GKXA 5ECIB 2PMTA 2PVOC 2CVBA 5JWRB 5KN3A 4IQ1A 1TU7A 2VCZA 4IHUA 2GSSA 5HQPA 2NDOA 3HCZA 1M2BA 2QC7A 3L9UA 1M2DA 2IJYA 3TKRA 4EUYA 4TXVA 5DVBA 3KH7A 4P3YB 3BD2A 3OR5A 3EC3A 4PUAA 3RPNA 3IDVA 2JZSA 1B4QA 2YZHA 4K7NA 2A2RA 4XRDA 1BX9A 2WJUA 20GSA 2CVKA 2CV4A 2X64A 4MJBA 5ECSA 3VPTA 4O92A 16GSA 1Z5YE 2YV7A 1GSSA 2H01A 1X9WB 5FT3A 2I9HA 4FYCA 1VGLA 3IHQA 2VM1A 4FO5A 2PWJA 1G0TA 2GSTA 1VRSD 2HZEA 2YCDA 4NHZA 2V1MA 3ZTLA 1OVNA 2P5QA 1E2YA 4MJEA 4Q5QA 4I97A 1EP7A 5D9TA 1CQGA 1XVQA 2FCHA 1G6YA 3L9VA 1ERVA 1GUMA 4BPYA 1WWJA 5HR2A 2LSTA 3H8QA 2EC4A 2YNXA 3ZITA 3A2XA 3IXRA 4WEYA 3LJRA 1G6WA 5J3RA 1BG5A 3H79A 1EP8A 2GT5A 4GQFA 2TRXA 5F0GA 3U6VA 5D9VA 4ILFA 2YOIA 2OE1A 2BJXA 2V32A 3D4MA 1SK2A 5ECMB 2VIMA 4GWRA 2L59A 3G7IA 2F8FA 3CSJA 4V1Ag 5AGYA 3KP8A 4XTSA 2C80A 1T8EB 4NWYA 1K3OA 3DEXA 2H0IA 1J0FA 2B1LA 1WPIA 2B5YA 1MEKA 5ECQB 1UA5A 3HXSA 1SYRA 2DMMA 4XCSA 2B5EA 4J57E 2VCVA 3GKMA 1QK8A 1S3AA 3LFLA 1AC1A 2OA7A 3TOUA 3LSZA 4L5LA 4XRAA 3A5WA 3Q74A 3APOA 3LYPA 4I2TA 6GSWA 3GL3A 5IMZA 3E0UA 1GSEA 1RW1A 1X5CA 3ZMLA 3WD6A 1R4WA 3FZ4A 5DALB 1PKZA 3VWUA 5CP1A 4TN8A 5ECNB 1ZCPA 3LORA 4HS1A 4ML1A 1XW6A 5G5FA 2R5GA 5J9CA 4GLTA 4JBBA 1ST9A 4Q5RA 3M1GA 1WOUA 5AIVA 2VLTA 3CTGA 3FR3A 5JCUA 2JADA 2L4QA 3GSTA 2J9HA 2VOCA 3EMXA 4TR1A 1X5EA 2X99A 1BAYA 2GTUA 4KGIA 4AJ8A 2X8HA 5ECRB 1SK0A 2RUEA 3EMPA 1MDKA 3P7XA 5CREA 4LL1B 1GTAA 4JR6A 3QCPA 3QFAC 3LWAA 2IIYA 5JCWA 2GSRA 2JU5A 3FK8A 1TDIA 1WMJA 3DMLA 3RAZA 5CYYA 3ZMKA 1HNAA 2M72A 3DGQA 2X8CA 1AUCA 4FIWA 2FD3A 5IMAA 2AUVA 2GZZA 4KE3A 4MABA 4JZQA 1K0DA 2GLRA 5F05A 4HQZA 4PQIA 5ECHB 2LJKA 3D4TA 3ME8A 4G10A 2LNTA 4WKWA 3TJKA 4Z7XA 2EIOA 1R26A 6GSYA 1XXUA 4NPBA 4HZ4A 2JSZA 2RLIA 1BEDA 4F0CA 3F8UA 4OO4A 5GAND 2VCTA 1HD2A 1ON4A 1A23A 4K2DA 1A2MA 5DJMA 2C3QA 5DBQA 1TOFA 1Q4JA 3F4TA 3FY7A 5J41A 4RQXA 1EZKA 8GSSA 1MD3A 2P5RA 1ML6A 5B6NA 2QGVA 3KMOA 3ERFA 5G31A 3CSIA 4MA9A 3N9JA 5IMVA 12GSA 3UAPA 1KTEA 2VCQA 1GRXA 3G7JA 1YQ1A 2KP2A 3M9KA 1A8YA 3ZLPA 4EC0A 1T00A 3QR6A 4MMMA 3JCML 4ULXA 2PN8A 2MMNA 4MF7A 2VD0A 1K0MA 3FYGA 3HD5A 3Q6OA 4TXOA 3MNGA 5B8BA 3EINA 3BOAA 4MCUA 5CAXA 2VL9A 2PGTA 3IR4A 2JL4A 4V2LA 1KNGA 4FYBA 4K7IA 2H74A 2LV3A 2MBTA 3VI5A 2WGRA 1SJIA 3DD3A 3I43A 3C7MA 2YP6A 4LMVA 1M9BA 5AN1A 1OC9A 2CZ2A 3HYPA 3P8WA 4MP4A 1SYXA 2GT6A 3W6GA 1F9MA 3GL5A 5HR1A 4PXOA 4Q5NA 1JFUA 4XS4A 2CA8A 2IYJA 5DJLA 2KOKA 1PA3A 2R6KA 3I69A 1ABAA 4WBJA 5CRWA 4IKHA 4L0WA 3TJBA 3F6DA 2JSYA 1AQXA 1GULA 2ALBA 2RM5A 4KCAA 5D73A 2GZYA 3E3EA 5D9WA 3ZYWA 1NM3A 4ZILA 4LA1A 3AY8A 6GSTA 2C0FA 2R4VA 1GUHA 5GSSA 2KP1A 1XW9A 4XHMA 4MH3A 4J2FA 2HZEB 5ECLB 2H0GA 5KN0A 1E6BA 3A2WA 2O7KA 4PX1A 2R2JA 4K8MA 2P31A 4ML6A 4ZIJA 2OBKA 7GSSA 2GS3A 2DJJA 4XS6A 4O5RA 2HSYA 1AQVA 4F9ZA 2HZFA 3TRXA 1GWCA 4F03A 1XWGA 1XWBA 5GZZB 3PGTA 1TP9A 2F9SA 3KCMA 3BCKA 1O6JA 4WXTA 1ZOFA 4L0UA 3O3TA 3WGEA 3VLNA 5IQYA 5HR0A 4WR5A 1U87A 2C1YA 1NSWA 1V2AA 4ECCA 4N10A 5DCHA 3KXOA 3UL3A 4O32A 2VLUA 5A4UA 5ABRA 2HNLA 3IPZA 1LBKA 1QMVA 3M8NA 3HJOA 2M80A 3SWLA 4KX4A 1ERWA 1Y6EA 2RUFA 1XZOA 3QD9A 2RM6A 4EO3A 1WE0A 1OKTA 1XW5A 1O81A 2B7KA 5F07A 1GSQA 4OCFA 4GSNA 4ISDA 3G9BA 1DBYA 4IN0A 2GGTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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