1G0TA

Dsbc mutant c101s
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
DDAAIQQTLAKMGIKSSDIQPAPVAGMKTVLTNSGVLYITDDGKHIIQGPMYDVSGTAPVNVTNKMLLKQLNALEKEMIVYKAPQEKHVITVFTDITCGYSHKLHEQMADYNALGITVRYLAFPRQGLDSDAEKEMKAIWCAKDKNKAFDDVMAGKSVAPASCDVDIADHYALGVQLGVSGTPAVVLSNGTLVPGYQPPKEMKEFLDEHQKMTSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the protein disulfide bond isomerase, DsbC, from Escherichia coli
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL:DISULFIDE INTERCHANGE PROTEIN DSBC
molecule tags Isomerase
source organism Escherichia coli
total genus 68
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2000-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10411 DsbC_N Disulfide bond isomerase protein N-terminus
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.450.70 Alpha Beta Roll Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, Disulphide bond isomerase, DsbC/G, N-terminal 1g0tA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1g0tA02
5HR1A 2CQ9A 3G7YA 5D96A 3UBLA 1A0FA 2LQQA 4V2NA 2CVBA 4OD7A 1OC9A 4V2MA 2ES7A 4V1Ap 3QPMA 3VWWA 5IM9A 3GNJA 2JSZA 1BX9A 1ERVA 5ECNB 3GURA 5KEJA 1AUCA 2FWGA 2IFQA 2AJQB 1B48A 1YF1A 4I2UA 2JZTA 3DD3A 1T4ZA 1F37A 3VWVA 2OBKA 3JCML 4ZBDA 2HYXA 5DALA 4KAEA 4XIHA 1E2YA 2LSTA 1PL2A 1SYRA 5EPFA 1KTEA 1T4YA 3IAM2 2LRTA 3HXSA 2FA8A 2PVQA 3WYWA 4NHWA 1XWKA 4MMMA 4D73A 3D4MA 3IDVA 3J7Yb 4EUYA 1LBKA 4IJIA 2AB6A 1Z9HA 3VI7A 2CX3A 2HZEA 1XZOA 3MAKA 2J23A 3QAWA 3QFAC 2DJJA 1XW9A 3DRNA 4N10A 2AUVA 2I3YA 2VLVA 4XHMA 4QL7A 2VL2A 2B7JA 2YWOA 1PQNA 3C8EA 1OVNA 1EWXA 3F9UA 1FVKA 2WJUA 1SL2B 5AGYA 5DCHA 1FAAA 5D9VA 1LJRA 2H6ZA 2OKAA 4MPFA 2C80A 2GVPA 2PERA 3GTUA 6GSSA 4RI7A 3M9JA 4P3YB 1TW9A 2VLTA 3TKSE 5AN1A 3RPNA 1FOVA 4OWYA 3G7JA 4V1Ag 2H0HA 1PRXA 4L5OA 2DMMA 2DIZA 5F0GA 3ZIJA 3EC3A 3ZTLA 5CP1A 1T3BA 5DQSA 3FZ5A 1K0AA 4Q5QA 2H72A 3CSHA 5A5KA 3EYTA 1G0TA 4WEYA 5F8BA 1V40A 4GF0A 5A4WA 2H6XA 2O7KA 2DBCA 2KP1A 2A2SA 2ZNMA 2H1GA 3WGXA 2LNSA 1A24A 2P31A 1WJKA 1GUKA 1EOHA 1VF4A 1Z6MA 4ML6A 3LEFA 1K3OA 4GRFA 1F2EA 3TKSC 1HQOA 3H93A 2LJRA 3P7XA 14GSA 2E2GA 3GH6A 4PUFC 3HVSA 1NW2A 3GIXA 1TP9A 5A4VA 1WE0A 6GSUA 3IAS2 20GSA 3GSSA 5ELAA 4I2TA 1PKZA 3E3EA 5IMFA 1U3IA 1YF0A 2OJLA 2LJKA 4GSTA 4O7HA 2C3NA 5GAPD 4PGTA 3GUSA 4ID0A 1R7HA 4BL7A 5IPHA 1JZWA 1O8XA 1ERWA 2YZUA 3VLNA 1GLQA 4MDCA 3WT1A 4QQ7A 2IYJA 2RM6A 5D9XA 1DE2A 2GSRA 1SK1A 1WIKA 2R6KA 5FT3A 3K8NA 3ZREA 1WRYA 4MK3A 3D6IA 2KOKA 3L9VA 4FYCA 1XFLA 2VCQA 1R26A 1MTCA 1HNCA 5B6NA 3ZL5A 2P5QA 4WR5A 2IMFA 1V9WA 2GSQA 2PUKC 3KGKA 1T00A 4POMA 4F0CA 1ON4A 1M7TA 3HJMA 4TN8A 3WGEA 9GSSA 3GL5A 1USBA 1X9WB 3HVXA 1AQWA 3CMIA 4ECIA 4YQVA 4TKYA 5D73A 1X9MB 19GSA 8GSSA 5F07A 2RUEA 4K7NA 1GRXA 3ZZXA 5ID2B 5H5SA 1DBYA 1MDJA 1J0FA 1TU8A 4GWRA 4N0ZA 3UIWA 2QSIA 3ZIVA 2HLSA 3TOTA 4XS1A 1K3YA 2JADA 4WBRD 2DJKA 2NBSA 1T7PB 4WF4A 4HU7A 3VWUA 1F6MC 4G10A 1O73A 3Q6OA 4JBBA 1VF1A 1O7UA 3KP8A 3KMNA 2V2GA 4HUAA 5L71A 2LUSA 3HZ4A 4WETA 4ZL7A 5IOWA 3FZAA 3H1NA 2DJ0A 3IR4A 4MPGA 1F9MA 3DVXA 2ON7A 3FRCA 1SYXA 2MMAA 3GYKA 1EP7A 2C0DA 4HU9A 2YJHA 5CREA 3ED3A 1FB0A 5HFIA 1K0NA 3I43A 1V58A 5IIZA 1GULA 5ECQB 5DAKA 1SK2A 1TK5B 5GAND 4FYUA 2BJXA 1OC9B 3C71A 3UARA 1YEPA 2I81A 4WKWA 4PQHA 2XPEA 5AIXA 2F8AA 4PQIA 1ACVA 4IQ1A 2IFQB 4TW5A 3N5OA 3HZ8A 3H79A 2WZ9A 4GSNA 2B5YA 5J9BA 3A2XA 3GSTA 1J08A 1A8LA 4EDYA 4PNGA 4XS4A 3L9UA 4EDZA 3TJGA 1ERUA 5ECSA 3GHAA 1ZGNA 4BVYA 5DALB 5F06A 5G2ZA 4K8MA 4NAXA 1QMVA 2H0GA 4EKZA 1WWJA 3QAGA 2A4VA 4ZILA 3US3A 1NHYA 4D73B 3DVWA 4AGSA 1XW5A 4Q5NA 1H4OA 2HZEB 2XBIA 2ALBA 2NVLA 1NHOA 3LGCA 1XVQA 4TXOA 2RM5A 1I5GA 2IMIA 5IPGA 3MSZA 1AW9A 1SL1B 2L59A 1S3AA 2L4QA 3IV4A 4AJ7A 3L9SA 1THXA 3ERWA 3FR9A 1XWAA 2PN8A 2WS2A 2FNOA 2P5RA 3CSIA 1GSFA 4BVXA 3WT2A 3VWXA 2H71A 1TTZA 3A2WA 2V6KA 1TI1A 1X5CA 4K2DA 1C72A 1GSEA 3DYRA 2IMEA 3SWLA 5DVBA 1TK8B 3GTUB 1TU7A 4ZXGA 3J7Yk 1X0RA 2LJAA 5DJMA 5B6MA 3Q19A 4CHSA 1RK4A 2VO4A 3D5JA 3EU3A 4GCIA 1A2JA 1TI3A 3KEBA 1OKTA 3HVVA 3FR6A 2C0GA 4I6XA 4MABA 1OYJA 2E2MA 4NV5A 4IP1A 2R4VA 1XCCA 1F3AA 3Q18A 3F3RA 3BJ5A 2P0GA 2DJ1A 1U6TA 2FUG2 3DMLA 7GSSA 4K0NA 3S9FA 1YQ1A 2CVDA 3PR8A 2LEGA 1KBNA 2YWIA 3ZMLA 3TKRA 2ZCTA 3UBKA 3LWAA 2H75A 4IQAA 2NTOA 2JZRA 3I9V2 3GX0A 4RQXA 1TRSA 2ON5A 17GSA 4PQ1A 1IYHA 3LJRA 2C3QA 1B9XC 2HSYA 3DKSA 4ECBA 3W8SA 4GXZA 1J9BA 5G5EA 1XOBA 2CVKA 3P8WA 2VOCA 2H6YA 3GX8A 1RW1A 2HFDA 2C3TA 1VGLA 5ECHB 1MD3A 2O8VB 2I4AA 1T1VA 5D8IA 2L57A 4MF5A 3KP9A 2RIIA 3IRAA 1SJZA 2GQKA 4J2FA 4XCSA 3FEUA 4XRAA 5ECOB 1PX7A 1B4PA 2L5LA 3TB2A 5EVOA 2OE3A 2L6CA 4L5LA 3MNGA 2E7PA 3F4SA 1WPIA 2FGXA 1KNGA 2L6DA 1F3BA 2REMA 3APSA 4PX1A 4X43A 2B1LA 2E0QA 3FY7A 4IELA 1ML6A 4K6XA 4I5QA 1E6BA 4IJ3A 4KSMA 3F0IA 2K6VA 1ILOA 1GUMA 1V57A 2PBJA 2FWFA 4HZ2A 2HZFA 5J41A 3GA4A 1X5DA 4HS1A 3L0HA 4CDOA 4XTSA 3KTLA 1M2AA 4EXJA 5CRDA 5IMVA 1UA5A 4HQSA 2H66A 4ECCA 1A2LA 3O76A 5KN1A 2MMOA 2YWMA 3QDNA 1AQVA 3CTFA 2AYTA 3FKFA 4MF6A 5H5QA 3IHQA 4XRDA 1NSWA 2G0FA 1U88A 3FYGA 3IPZA 2K8VA 2CAIA 3LYKA 2AV4A 2QC7A 3IE3A 2TRCP 4Z7XA 2EIQA 2MBTA 1XOAA 1M2BA 3I69A 4K9ZA 1HNBA 1I9DA 4IN0A 4ZB6A 2VCXA 3QOUA 3LQ7A 1TRWA 1X9SB 1GTIA 1XWCA 3G7IA 3PGTA 1URMA 2H30A 1V98A 2WULA 3GKMA 5F05A 1K0DA 2X8GA 4YH2A 1SU9A 5LNKe 1UN2A 1S3CA 3GFKA 3VI5A 3HA9A 3UL3A 4KSOA 4NPBA 2GTUA 1CQHA 1GL8A 2GGTA 2IMKA 2AAWA 2FD3A 2IWTA 1QUWA 4POLA 2YNXA 1TRVA 3TDGA 1ZOFA 1EV4A 1TKDB 4MZBA 2VL9A 3VK9A 2HSHA 2L4CA 3KTBA 4EVMA 5H5RA 1EGOA 5DAKB 3LG6A 4IP6A 3IK9A 2EIRA 4H86A 5J5NA 5G1LA 1B4QA 5B8AA 1YY7A 5HR2A 3F4TA 1SD9A 5ECMB 5B8BA 4MF7A 5DJLA 1K0MA 5ECRB 1Q98A 3APOA 2TIRA 3KCMA 4E8EA 1QXHA 4TXVA 3KXOA 2C1YA 4XS4B 3TKPA 5GSSA 3D4TA 1GSUA 3MWHA 4AF2A 2IJYA 1A8YA 1ABAA 4MH2A 2IL3A 2J9HA 4LMWA 3RPPA 3KJYA 2B3SA 2FHEA 3GH9A 5FHIA 3HD5A 3TGZA 4BWQA 1H75A 2VIMA 5JWOB 1S3DA 5EY6A 4TVEA 1M0UA 4XS6A 5IO0A 1DUGA 4WF5A 2B7KA 4HI7A 2H19A 3BOAA 3F6FA 5HQPA 4HJMA 3VFIA 3ISOA 4TXOB 3UMAA 1AIUA 4N30A 1FB6A 2QGVA 5HFGA 4EL1A 3G9BA 3ERFA 3FZ9A 4PUAA 4TR1A 1TOFA 3QMXA 5CYYA 3V1WA 5D93A 1GSYA 1N8JA 3MDKA 1JLWA 1PGTA 5HR0A 4F03A 1TXXA 4K7IA 5JCWA 1R5AA 4PURA 2H70A 3W6GA 1K0CA 4DSRA 1XPVA 3RHCA 2MMZA 2DIYA 4MH3A 5JWRB 3DIEA 1ZZYA 3F3QA 1EGRA 3UEMA 3QR6A 3E0UA 2IN3A 1PMTA 1MDKA 2LTKA 2M80A 3LFLA 4ULXA 3E9JB 4OO5A 3L4NA 4HZ4A 4YAPA 1EEJA 2V6OA 2EIOA 2FCHA 3IBHA 5INYA 3O6TA 1TDIA 2ZUPA 2X99A 1YKCA 2GSTA 4L0WA 3TCOA 3ZLPA 1B9YC 3M8NA 2YANA 1JZDA 1SD8A 2VL2C 2VUPA 5DBQA 3ZMKA 5EL8A 3BBYA 4AJ8A 2YWNA 4N0VA 3TKSA 4ACSA 4PXOA 4QL9A 3EINA 3KIJA 4POKA 5DCGA 1GSSA 3DXBA 3M3MA 3UVHA 1THOA 3TUEA 2X8HA 5AIVA 1XIYA 2CT6A 1MDIA 4KCEA 3ZYWA 4KW6A 1ZYEA 5D9TA 1AXDA 3FR3A 4MLYA 4TR3A 3EWLA 4I8BA 4KCAA 2FWHA 1GSQA 4OCFA 3NIVA 2JACA 3QD9A 4EE0A 2FA4A 2C0FA 4MP4A 4ZL8A 3TJFA 4GQCA 2AHEA 4ZB8A 3DEXA 4BA7A 3WGDA 1Y25A 2X8CA 3IK7A 1QQ2A 1PSQA 2GS3A 2WFCA 5IMDA 6GSTA 1Z3EA 2R5GA 4HDEA 2CAQA 1A23A 4MJEA 5ELGA 4EO3A 4MZWA 2D2ZA 1DE1A 4DSQA 3IXRA 3IOSA 3A5WA 1O6JA 1GH2A 2JU5A 2WRTA 2CZ2A 2MBSA 1SENA 2N5AA 1K0OA 1O81A 1CQGA 2YV7A 1SKWB 1FW1A 4OMVA 5C00A 3CBUA 2GQMA 5D9WA 5ECLB 2OADA 4KDXA 1GSDA 3WD6A 3W8JA 2C0EA 2H73A 1GTAA 3QCPA 2H76A 2VCWA 1GTUA 1UC7A 2NPBA 3C73A 2FWEA 1VRSD 1PA3A 3VURA 4FO5A 1BAYA 5DDLA 1ERTA 4OFMA 1TJDA 1GTBA 4EF0A 1V2AA 4IVFA 2PVOC 2MMNA 2VCZA 3RDWA 5G1KA 1W4VA 1BYEA 1Z7PA 3LXTA 3HJPA 2EC4A 3O3TA 4FYBA 1BJXA 3CRTA 3A3TA 3TOUA 5JCUA 4JR4A 1Z5YE 4MA9A 1EZKA 3RBTA 3C1SA 4KUNA 4EC0A 2YP6A 4DSSB 1SL0B 1G7EA 4HOJA 1AC1A 3M1GA 3RAZA 2PPTA 3KM6A 1ST9A 4PNFA 3HHVA 3LXZA 1MEKA 3UOMA 4J56E 2HT9A 3ZFBA 4NHZA 3Q74A 1GNEA 2RUFA 3FK8A 2LKUA 4ECJA 4LLRA 1M99A 2VLUA 2OA7A 3KH7A 5JWQB 5IMZA 4J57E 4ISDA 1EOGA 1AAZA 1OC3A 3CYNA 1PD21 4HJ2A 1QFNA 1SKSB 4TR4A 1XW6A 13GSA 3ZVJD 4KB3A 5HFKA 1ZYQB 4Q5FA 4JZQA 1XVWA 2N5FA 4E8HA 3CRUA 5A4UA 4WBJA 1OC8A 2RLIA 2VD0A 2M46A 3KD0A 4GTUA 4FIWA 1XWGA 2B5XA 5IO2A 2JSYA 3HJOA 3IC4A 1OAZA 2H1AA 3QAVA 4YQUA 2O87A 4ZL9A 2OE1A 2R37A 3D21A 1OE8A 5G30A 2JZSA 4OCEA 5GSTA 5CRGA 4K7OA 3F63A 3UAPA 2I1UA 2Z9SA 1VF3A 1OKDA 2F9SA 5IQYA 4JE1A 3I6AA 4TRXA 2WDUA 3CXGA 4N11A 4KA0A 3FW2A 2YN1A 4GLTA 4I97A 2VL3A 1BQ7A 4KNDA 1XBSA 1YZXA 1U87A 3LORA 3FHKA 1PKWA 3IA1A 12GSA 4K1FA 1IYIA 2MYGA 1JFUA 1K3LA 3KMOA 1T8EB 2KLXA 2B6MA 2GDRA 4Q5RA 1M2DA 2GZYA 3GKNA 4DSSA 2LQOA 4KDUA 4LL4B 4IHUA 3HCZA 3UVTA 2N5BA 5E4WA 2LV3A 2WB9A 4O92A 2BMXA 3CSJA 4MZCA 4DVCA 4LMVA 3H4KA 4MJBA 2DJ2A 3N9JA 2VCVA 2A2RA 1G6WA 1GWCA 4TR1B 4ZB9A 5HR3A 2O89A 3PINA 3HY2A 2HXKA 2KP2A 2LRNA 2K18A 1VF2A 4MJAA 2V1MA 4BPYA 2OE0A 2L5OA 2WGRA 3KH9A 5CO3A 2CX4A 1HD2A 2DMLA 3PH9A 5ENUA 4DEJA 3TKQA 3UJ1A 4FH8A 4F0BA 1RQMA 3NOFA 1SJ6A 4NV2A 3U6VA 5G5FA 5DQYA 4X1UA 4KGIA 6GSYA 1Z7RA 3EE2A 3TRXA 1U3AA 4V2LA 2WCIA 3CTGA 1BEDA 2VAFA 3BCIA 1Q4JA 2GLRA 1MD4A 1ZL9A 4RUVA 5C04A 1HYUA 3HKRA 4HQZA 1TK0B 1OE7A 2H74A 1HNAA 2K9FA 4IKHA 3VPTA 3VPQA 2LNTA 5COHA 3GKXA 2H0IA 3D0ZA 2XPDA 2B5EA 2HRNA 2FLSA 1JZRA 2GT6A 5LCZA 4F9ZA 4BWSA 4JEDA 2GZPA 1SKRB 1UVZA 2YPMA 3M0FA 3NZNA 4WR4A 1YDKA 2VD1A 4KX4A 3P90A 1LU4A 5ECIB 1FG4A 3ME7A 2V41A 2G2QA 1DSBA 2PU9C 1B8XA 4YAVA 3TJBA 5KN2A 3EURA 2PWJA 5G31A 1ZCPA 3SBCA 1BG5A 1YEXA 3ZFLA 4OO4A 3GKKA 2MZCA 2PGTA 1M9AA 5GZZB 1R4WA 3EU4A 3QFBC 2CV4A 2B1KA 4JU5A 2O85A 3TRQA 2I9HA 2LS5A 4GQFA 4GSSA 1Z6NA 1JLVA 4NMUA 5JCGA 1G6YA 3ME8A 2H1BA 3APQA 2M72A 1FVJA 3KZQA 4KE3A 2CZ3A 3LYPA 3OR5A 4JR6A 2DLXA 4L0UA 4IGJA 2R2JA 2C8UA 3P2AA 4NWYA 4LA1A 1GUHA 2YCDA 5CAXA 3DWVA 4IBPA 4HEA2 2OBIA 2XBQA 2FY6A 3H8QA 2X64A 4KDYA 2TRXA 2LRCA 3EVIA 4ML1A 5B7CA 3DGQA 3RHBA 4IS0A 1QK8A 2F3MA 2IMDA 1Y6EA 1R5PA 5J9CA 2YZHA 3HYPA 1M9BA 4MJCA 1SJIA 2VCTA 3F6DA 3C1RA 2GQLA 4MCUA 6GSXA 1JZOA 10GSA 4KH7A 5ABRA 1O85A 1JHBA 4F82A 4NXIA 2VM2A 3AY8A 3ERGA 3GMFA 4OFNA 4ZIJA 2F8FA 4AJ6A 1ZMAA 1QGVA 2GSSA 5LD0A 1FO5A 1EP8A 2H1DA 2YJ7A 2DJ3A 5FWGA 2HNLA 4ILFA 5IMAA 4TR0A 3LSZA 4X0XA 2DC5A 3ZVJA 2BTOT 4CW9A 1K0BA 1SK0A 5IOXA 3GV1A 5J3RA 4F2IA 4TOPA 4RI6A 2F51A 2IPAA 2OACA 2XHFA 4G2EA 2KHPA 3F4RA 3ZITA 2V32A 2GT5A 2C4JA 2DSAA 3U5RE 1XXUA 1TRUA 11GSA 2QKEA 2K8SA 16GSA 1X5EA 6GSWA 1N2AA 1PN9A 1G7OA 1AQXA 4G19A 3TRPA 1WMJA 2HRFA 4K0GA 5CNWA 1EEMA 3EMPA 4LL1B 2HI7A 2VM1A 5E59A 5ID2A 1A2MA 1YKAA 2CA8A 3BCKA 3C7MA 2XC2A 2IIYA 1W89A 1EV9A 4O5RA 3GN3A 2H01A 3M9KA 5ECPB 4JRRA 4OFTA 1YJ6A 5KN0A 18GSA 2JL4A 2IY2A 5CRWA 3L78A 5AISA 4O32A 3TJKA 2PMTA 1WOUA 1A0RP 4YQMA 1WP0A 3HDCA 5J4UA 1PL1A 2YV9A 3GL3A 2NDOA 4IW9A 6GSVA 2KUCA 4WXTA 3D22A 1PX6A 3F8UA 3TJJA 3EMXA 4L8EA 5IMCA 3GRXA 22GSA 4ZBBA 3R2QA 1NM3A 1GNWA 4G9HA 3BD2A 1GP1A 3FZ4A 1GLPA 2YOIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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