1G69A

Thiamin phosphate synthase
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
226
structure length
226
Chain Sequence
HGIRMTRISREMMKELLSVYFIMGSNNTKADPVTVVQKALKGGATLYQFREKGGDALTGEARIKFAEKAQAACREAGVPFIVNDDVELALNLKADGIHIGQEDANAKEVRAAIGDMILGVAAHTMSEVKQAEEDGADYVGLGPIYPTETKKDTRAVQGVSLIEAVRRQGISIPIVGIGGITIDNAAPVIQAGADGVSMISAISQAEDPESAARKFREEIQTYKTGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Bacillus subtilis
publication title Structural characterization of the enzyme-substrate, enzyme-intermediate, and enzyme-product complexes of thiamin phosphate synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIAMIN PHOSPHATE SYNTHASE
total genus 79
structure length 226
sequence length 226
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.3: Thiamine phosphate synthase.
pdb deposition date 2000-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02581 TMP-TENI Thiamine monophosphate synthase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1g69A00
4JD4A 3RU6A 1O5KA 3DAQA 3I65A 5K2ZA 4UTMA 3G1HA 1G4TA 2DORA 3N9SA 5HWJA 1KTCA 1B57A 1TV7A 1Z44A 1ZCOA 4UNLA 1O94A 4NXKA 2NUWA 2JBMA 3BW4A 3L5MA 1F7BA 4MYAA 1DJNA 4M6VA 2Q3RA 1WQ5A 1PV8A 4IMEA 3HPXA 5U7SA 4JTIA 1IGSA 1VLIA 3HPZA 5J5DA 2Q8LA 3UD6A 1PVNA 3FLUA 1U83A 3G1FA 1A5AA 2A5HA 1WXJA 1HO1A 1F73A 4DPQA 2H90A 1TREA 2ZA3A 1TPEA 4QITA 1I2NA 3LCXA 2Y6ZA 3NZRA 3G0XA 3M5XA 2GPTA 2Y7FA 1I2RA 3NM1A 4HSOA 1ME9A 3B04A 3MUXA 2VFGA 3KAOA 5LHFA 2Z0IA 4BF9A 2CLFA 3ZWTA 5LNVA 4XWUA 5F4SA 1TJRA 2BTMA 1FWNA 1H7XA 3G24A 4PODA 3L9CA 3U8GA 4QISA 2QCHA 1R2RA 1W3NA 5FF4A 3QMSA 1JUKA 1OX5A 4YLWA 1W0MA 1GVFA 2VELA 1KM6A 4Q32A 3HG5A 3CEPA 1KFBA 1X8FA 3LCFA 4MFEA 3S1UA 3TKFA 5CG7A 2A6NA 1KM0A 4NNBA 1QDSA 1F74A 1I45A 1XDLA 3GNNA 2X1TA 3DKLA 1B4EA 1L6SA 3NPUA 2PCQA 4HHPA 4ONVA 1NEYA 1TTJA 4JTUA 4KWWA 1RQEA 1EP3A 3WJZA 5LSMA 2WKJA 2VFFA 3NQ2A 4NX5A 1WOBA 1XBZA 1OK4A 1GG1A 1GYNA 2ZQ0A 2GVGA 3F03K 5H91A 2JKEA 1WYIA 1H50A 2V8ZA 4JXCA 1ADOA 2VOMA 3HOJA 4DBEA 3S6DA 3MI3A 3G1YA 3QEZA 1TTPA 2FB3A 5G1TA 3F4NA 1WX0A 3PUDA 3WK1A 3NQEA 2I9EA 5E93A 3PY2A 5F2IA 1GVRA 4O4WA 3PVFA 4KFNA 2A2IA 3QMTA 4K8EA 3EWXA 1OHLA 3S5OA 1WV2A 1FUYA 2FJKA 1GQNA 4YL2A 3UWUA 3CTLA 1Q45A 4ORIA 3T7VA 1RD5A 2WSRA 1TV5A 3FJLA 3T78A 4GUFA 4Z0SA 3GX9A 4RR4A 5KTLA 4CQ8A 1KM1A 1GVSA 3S5ZA 1FXQA 3RNDA 4FNRA 2HTMA 1SFLA 1GTHA 1JCYA 2Z2UA 3LRLA 5LNRA 1GVOA 1ZAJA 4I7VA 2ZZ7A 5CGQA 1FCBA 1TPH1 2A4AA 2D73A 3BARA 1SUXA 4NJJA 3MJYA 2ISSA 1SO6A 3BG5A 3JS3A 3HB9A 1IXQA 3M5VA 2B7OA 3HG4A 1K7FA 2H6RA 2X30A 5K9CA 5LNUA 3RF9A 5CSRA 3LCIA 4NUWA 3HO8A 2NX9A 3MHUA 2NV2A 3DFSA 1JRCA 5CPOA 4DEFA 3EXTA 2OMAA 5G1YA 3W1TA 3PG9A 4DO6A 2CFFA 1ZNNA 2RHGA 5L6UA 3L0NA 4N9BA 5DN1A 5LKYA 3W2UA 1C9DA 1K3UA 1OVDA 3TFXA 1Q6OA 2TPSA 1LZOA 3G1SA 2Y7DA 5TBOA 3HJZA 1IIHA 1KLYA 1WBJA 1OFPA 1H7RA 3MP3A 1KM5A 2CLEA 1OX4B 4O1AA 3GDMA 4BWLA 5C54A 2ZTJA 1OYCA 1R2SA 2Y88A 3UZJA 3DFOA 3ABOA 5KINA 2GUUA 3IIOA 1VYRA 2ABAA 1OFAA 1K03A 2FTPA 3ANYA 5HULA 1XBYA 4GC4A 3TC6A 3PM6A 1A5BA 1QWGA 5D05A 4M6PA 1H7NA 1F05A 3T44A 3UWZA 1TPWA 2BLEA 3B0VC 4Z1AA 4JTTA 1YTDA 3P80A 4JDYA 4LY8A 4AH7A 3B8DA 3EWWA 3QPYA 1H7PA 3PAJA 1BTMA 2YFNA 1EUAA 4UIOA 5DY3A 3UZ5A 1DV7A 4KWVA 3TQKA 1B4KA 3LB0A 2JK2A 3B05A 2OJPA 4OBTA 2P10A 3RLUA 1BKSA 4O1DA 3TX9A 4JTLA 1YADA 1FY6A 3KFTA 1QNVA 4PEKA 3WJYA 1PL9A 1F2JA 2ZZ2A 5A5WA 1Z48A 3LRMA 5CZSA 3G22A 1VPXA 3HF3A 3M6YA 5G4WA 1SZEA 2PC4A 3ZR4A 3GXTA 3QYQA 1D3GA 4OU1A 4RXGA 2X1UA 1QPOA 3BG9A 1TIMA 4Z0JA 1W54A 1JR1A 3DU0A 3DFNA 5DBTA 3LHUA 1W3TA 4EOUA 5F4WA 3VFLA 3W84A 4LT9A 4JTJA 3SR7A 3R8RA 3TK7A 5G2HA 3S1VA 2R94A 1BWLA 2A0NA 4EIVA 3OG3A 1EP2A 4Z1DA 1GT8A 3GDRA 3DBPA 1C29A 1G6CA 3IRDA 3S5YA 1LOSA 4IMDA 4EF9A 3BW3A 1EUNA 2A7PA 3TMLA 4DBDA 2CU0A 3C52A 3C2RA 4O17A 3NNTA 2NXIA 4K39A 2WOQA 3L66A 3LDVA 1M7OA 3GXNA 2DJXA 2ZRZA 3O6YX 1XL9A 3V1PA 2YDAA 3UQNA 1OG0A 5AYXA 2CWNA 3GLCA 3WJSA 1DQWA 1NFBA 4KFPA 3TROA 2ZA1A 2NZLA 4GUIA 3GAYA 1NSJA 2XN1A 3W7LA 1DL3A 3S8HA 4UNKA 1FXPA 4AWSA 5DXYA 1D9EA 3W1PA 2J9XA 5D03A 3JR2A 4IMGA 3SGUA 5D2TA 4FIQA 2BWGA 3T40A 4ZQRA 1OK6A 2QAPA 3HGRA 4WJEA 4AF0B 2E77A 4O28A 4LS2A 3LXAA 4OGZA 1HTIA 4LWWA 3OEXA 1TRDA 2YCEA 3CWNA 3HPSA 4PCFA 1TRIA 2DP3A 3KVJA 5D30A 5BOOA 4JX6A 1Z42A 2PRMA 1THFD 3WJXA 3C2EA 4E2DA 1SFJA 3BO9A 3O63A 2J24A 5K9DA 3H55A 3SECA 5BMXA 2WSYA 1M6JA 4ZL1A 1XC4A 1XBXA 4JTGA 3IVTA 1JCMP 4WY0A 4XBKA 1LTDA 4FO4A 3ZS4A 3L2IA 4RJEA 4UFHA 4JR5A 2NUXA 1LOQA 2YGYA 3L65A 1LRQA 3M5ZA 3FKKA 3VKJA 1TO3A 4RZ4A 3N73A 1KFJA 5LZLA 2B7NA 1ML1A 3LHWA 4YCPA 1FWTA 4NT0A 3STEA 4NJKA 4DO4A 3SFKA 2RDWA 1DHPA 4BFAA 5AYZA 2J27A 4X22A 1RPXA 2YW3A 1DJQA 2ZFAA 4BI6A 4ZZ9A 3B06A 4KFOA 2VKZG 1G7UA 1A5CA 3O1NA 4LUJA 2ZZ5A 3VE9A 5FESA 1GG0A 2E6DA 5AN7A 2H8XA 3LTSA 3NZ1A 4O16A 5TQLA 4DELA 4FNSA 4JDBA 4O8RA 3FJ6A 1XUUA 1W37A 3CWOX 1OX4A 1L6YA 3GDLA 3G1XA 3H54A 4NQ1A 3W1RA 3TC7A 1IF2A 3MP5A 2IQTA 3EX3A 1G4EA 3ATYA 5DELA 3HG3A 1UUOA 3LBCA 3MHGA 1X6UA 3BW2A 4K8HA 2RDTA 4QSHA 5DCEA 2CLKA 3LCHA 5U4NA 2R8WA 4MY1A 3W22A 5LNSA 1IXPA 2TRSA 1XM3A 2BXVA 4RKAA 1AW1A 8TIMA 2V2CA 2ISWA 3M1ZA 4RV8A 3NPXA 1CX9A 3DI1A 2Q8ZA 4UFIA 4O19A 3W86A 2Y89A 4G1KA 5HUPA 1FWRA 3T55A 3L0GA 4R33A 1JRBA 4QIUA 2GJNA 1YPFA 5AHNA 3P84A 3TW6A 1PCWA 3W07A 2DZTA 3PF3A 4AEOA 2NXGA 1QCWA 3L0KA 3EX4A 3NM3A 3GR7A 2YW4A 4ADTA 4YCOA 1W31A 1JCNA 3N2MA 3DFPA 3PSVA 2UV8G 3TW7A 4C1LA 5AC7A 3KRSA 4Y90A 1GWJA 2HSAA 3VNDA 1F5ZA 4ICNA 1K7XA 5G2IA 1RVGA 3TXZA 3KVKA 2ZRWA 1GVQA 4UUIA 1TPFA 3MO7A 3SY5A 4A2RA 2Z6IA 4N9CA 2Y7EA 2ZRVA 2FPVA 4LS1A 4P2VA 4AAJA 3S1XA 1JUBA 4QQ3A 1RR2A 3R13A 5AC6A 5ABTA 7TIMA 4XKYB 1ALDA 3W2MA 1J2WA 5K4XA 3BGGA 4JNMA 3DZ1A 3W7KA 4OE7A 4A22A 3Q94A 3FEMA 1VGAA 3LHVA 4PTNA 3TSDA 3C2OA 1I2OA 3NG3A 1LROA 1W5MA 3CB8A 1SO3A 4JTKA 3G0UA 4IXXA 2VEKA 5EL1A 4GE8A 5J5RA 3OVPA 4FXSA 3MI2A 4UTLA 2PRHA 3MI6A 3OVRA 5D02A 3W7MA 3DENA 3W2NA 4GFSA 3A5VA 1SSGA 3EX6A 3PUEA 1JULA 4RXFA 2VFIA 2YX0A 3LHZA 3QC3A 1TTQA 4IPIA 3O6DA 4NU7A 2QUUA 3SJ3A 4MJZA 1O5XA 5BNKA 2V81A 5DBUA 1IIGA 2BZNA 3LGEA 1P5BA 1TMHA 4DQWA 1W5OA 5I3HA 2P0OA 3LHTA 1D3HA 4LVBA 1FQ0A 1TQJA 1H60A 4HKPA 3TSMA 4AF0A 1V7YA 2ZCGA 1ZAIA 2G97A 4XQ6A 1LP6A 3CIXA 5EBUA 4J9JA 4IOTA 2GQ9A 1PE1A 1XI3A 2E6AA 3USBA 2AGKA 2FIQA 4FNTA 4JN6A 1PCKA 3F1QA 4O1BA 1ZFJA 1ME7A 1K7EA 3MHFA 1Q6RA 3WFAA 1P0KA 2BX7A 3N14A 4JTEA 4LV4A 3MYOA 1L9WA 3UWVA 4LS0A 3G1AA 5AOUA 3W7PA 1ME8A 1AW5A 3BLEA 2DJLA 4N2YA 2ABBA 4IMFA 1KM4A 2OCZA 4R7JA 1OJXA 4OQVA 3UXAA 3W72A 1P0NA 2WJZA 1L6WA 1HL2A 4RZ6A 1OFBA 1B3OA 2FPTA 5F2GA 3W1LA 4IGHA 1FDZA 3L5AA 1ZALA 3C4UA 1SU5A 3C2VA 3PG8A 4CQ9A 3WK3A 1T96A 2C1HA 1KFEA 3MBDA 2ISVA 2ZYFA 3U2OA 3CHVA 2E5DA 3NQGA 4BI5A 1S5VA 3VCRA 1SZFA 5CZJA 3FYOA 4FB7A 4AHQA 2VEMA 5AB3A 3TXVA 3W3OA 3C61A 4LVDA 3QZEA 5D2VA 3NR0A 4NJGA 1ONRA 3TIMA 3QM3A 5I3FA 4FIRA 5AFDA 5EKYA 1JUEA 2C15A 2B7PA 1UCWA 1BEUA 4JGDA 4OT7A 3LXCA 4P61A 4MIMA 2V30A 1LOLA 4IUOA 4O52A 3W76A 3W7OA 4DF1A 1NVMA 1YPIA 1OF8A 2V2HA 1W8SA 3TQVA 5HJLA 4WY0B 4N4PA 4LC8A 2G96A 4O18A 1VHCA 1A50A 2JKPA 3C6CA 2ATSA 1EWDA 4ALDA 5C55A 5CPLA 5K3VA 4M5PA 1WDWA 4Q4KA 5I3JA 1OYBA 1GPWA 3W1QA 2ZTKA 3HGSA 4A29A 3EKZA 1HFBA 3GXPA 2WQPA 3G3MA 3LCLA 3SI9A 2ZA2A 1V5XA 1K8XA 4O10A 5HINA 1TPC1 4HNNA 1H61A 5TIMA 1G7VA 1MEWA 3MWAA 4LV9A 3P62A 4CLMA 1KTBA 3HBLA 4L4LA 1H1ZA 4D2JA 1H7OA 3GDTA 3R12A 2A1YA 1SPQA 5HUOA 2QUVA 1H63A 1LBLA 4IWWA 3TAKA 1RQHA 1AW2A 3L21A 4XTDA 4KKXA 1NAL1 3W87A 3SIZA 3LERA 4WD0A 3IIVA 1IXOA 2WNNA 2H8ZA 3QH2A 3GYEA 1VC4A 1DQXA 2O7QA 4Y6GA 1JQVA 2XFWA 3Q37A 4BR1A 1K02A 4NXSA 3R89A 3NL5A 4XKYA 4ADSA 3LCWA 5FF0A 2F84A 4ZQCA 4MZ1A 4RCXA 4UFKA 3KHJA 4GNJA 3TAOA 3EXRA 2EGZA 1YLVA 4LNYA 1Q6QA 2GQ8A 2Q3OA 2VENA 4ZQOA 1OX6A 5MHBA 3YPIA 1P1XA 4AWTA 3PBYA 1QOQA 3CQ0A 3GZ3A 4MZ8A 1LYXA 3DH7A 2DZUA 2RFGA 2NX1A 4UR7A 3IV3A 3UPBA 5KZDA 1EWEA 1TB3A 4GRSA 3KRZA 4LUIA 2I14A 2YYUA 3QSRA 4QNWA 5H2ZA 1EB3A 2WNZA 1O60A 1KW1A 1H1YA 2QF7A 2H3BA 2ALDA 4DF0A 3DHFA 5IBXC 5LGXA 3V75A 5AC8A 3PBWA 1FBAA 4FNUA 3LM7A 3NL2A 3EX1A 2VEIA 3PSWA 4HPJA 3U6WA 4LC6A 3G18A 3I7SA 3A9IA 1G4SA 4LRTA 3W70A 2PRLA 3CU2A 4A2SA 1MSSA 1KTNA 4UTUA 4UTKA 3LI1A 4JYEA 1FWWA 1N8FA 4OWGA 5DLCA 4MY8A 5I3IA 3G8RA 1EP1A 3M41A 3BVJA 4ZMGA 3P5ZA 3FYPA 1TSIA 3QMRA 2C0AA 1KV5A 1RQBA 3CPRA 5HNRA 5D37A 1JQXA 1NF7A 2YZRA 3RMJA 3TUUA 3WJWA 4UFJA 3W23A 1VCVA 3QQ0A 3UYCA 2FDSA 3FIGA 1OYAA 4AHOA 4NZFA 3L67A 4FEZA 1UUMA 2R14A 4AXKA 1LBFA 5LGZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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