1G7IC

Crystal structure of hen egg white lysozyme (hel) complexed with the mutant anti-hel monoclonal antibody d1.3 (vlw92f)
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
molecule keywords ANTI-HEN EGG WHITE LYSOZYME MONOCLONAL ANTIBODY D1.3
publication title Estimation of the hydrophobic effect in an antigen-antibody protein-protein interface.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 51
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g7iC00
1D6PA 1IP3A 1AM7A 1OQMA 2I6ZA 5B07A 1LSFA 4NHIA 1CJ8A 1PZYA 1LZ8A 1IIZA 2RSCA 1F10A 4H9BA 4ETEA 4OOTA 1YKYX 1RI8B 1LYOA 3CT5A 2HECA 2Z2EA 4Z41A 5APCA 1C45A 4DC4A 4CFOA 1B5WA 1OUFA 1UACY 3WVXA 5LVJA 4CGEA 1G7MC 4ET9A 1N4FA 1YL0X 4HPIA 4R6CA 5II3A 4J7VA 2ZNXY 4NGKA 4GLVA 5F81A 1REYA 3F6ZA 3M3UA 1VFBC 2AUBA 5B1GA 1LZ5A 1J1PY 1B7SA 4G49A 2W1XA 1IWUA 1GF9A 1LSEA 2BQHA 3EBAB 5KXNA 154LA 1XEIA 1IC7Y 1QQYA 1DZBX 4HJVA 4QGZA 1KIQC 3A34A 4NG1A 3WH1A 1LSCA 153LA 1JTPL 1YILA 3LZTA 4DWXA 5HMVA 4NGIA 5FELA 1GDWA 3CB7A 5L3HA 1XFPL 2CWIA 2BQOA 2H9KA 4WM3A 1D0LA 3WXUA 5LIOA 1GFVA 1B9OA 2WARA 1I20A 5IDDA 1IO5A 1FLWA 3AZ4A 3TXIA 2HUBA 3A94A 4NHTA 1D9UA 2BQJA 5HNCA 4NSIA 4J1AA 2HEAA 2BQMA 4OWAA 4NSHA 2IFFY 4OWBA 4OWEA 1GHLA 1PS5A 5B05A 1B0DA 1TEWA 3TXKA 1GFEA 2MEFA 3B0KA 3HBHA 2Y8PA 1VDTA 1NKHA 4WLXA 3WU8A 1O23A 2F2NA 1LHKA 4H8YA 2ZYCA 5LVGA 1LPIA 1D0MA 1B7QA 1DKJA 3IWRA 3TMUA 5L9JA 2PC2A 4NGZA 2G4NA 2EKSC 3N9EA 4GN5C 4Z3MA 2LZ2A 5KXTA 3LYTA 2YVBA 1HC0A 3E3DA 3WU9A 1MELL 2F30A 1WVVA 1CJ6A 1SQ2L 1IC4Y 3AGIA 1ZV5L 4AXTA 4G9SA 3A3RX 4WG1A 1J1XY 2G4QA 3D9AC 4NGYA 1QUSA 2HEEA 4OWHA 5LYZA 9LYZA 1CKDA 3HBDA 1YAQA 134LA 3P66A 4XJIA 4B1AA 4FDYA 4CJ2A 2Z2FA 4G4CA 1JJ0A 4NY5A 4XJGA 4NHPA 1IVMA 1NBZC 5FSTA 4NSGA 2D4IA 1EL1A 1GXXA 1LJ3A 2Z37A 1FDLY 1D6QA 3CQLA 4H9IA 4NSJA 4P2EA 3B0OA 5I53A 1IC5Y 5I4WA 2GV0A 1GB5A 3WPLA 1JJ3A 3WMKA 1GE4A 4H9CA 2H9JA 5EBHA 4WL7A 1Z55A 3IJUA 1WTMA 4GCDA 4XYYA 5LXWA 1BB5A 3G3BB 4TSBA 3A96A 1SLYA 1IX0A 4ZIXA 1EQEA 1I1ZA 1LAAA 2CGIA 1JKDA 3AYQA 1IP2A 2DQGY 3WXTA 1LSBA 3P65A 4II8A 5APEA 2Z39A 6LYZA 1LYZA 1QTKA 3A6CY 1GE2A 4U3XB 2Z19A 1GBSA 2BQCA 5KXMA 1IOSA 1YROA 4PRUA 1DPXA 4XJDA 4WL6A 1E8LA 1IWWA 4NGOA 1HERA 1UIEA 4GCCA 1OUDA 4HJZA 1DPWA 1QIOA 4LFPA 5E4PA 4OOOA 5IHGA 5L3IA 2MEGA 3HBEX 1JPOA 1KIPC 4KT3A 1LYYA 1UIHA 3AGGG 1B7RA 1F6RA 2YDGA 5C6IA 1OUBA 1INUA 1YIKA 2ZQ4A 3ATOA 2XJWA 4PPOA 5KXRA 1RJCB 2FYDA 3TXHA 1GFTA 2DQAA 1IP6A 4LT3A 1CJ9A 3QNGA 3WW5A 1JUGA 4DDBA 1DI3A 1HFZA 1CJ7A 1IR7A 1LMPA 4H93A 4M6DA 1LMAA 4L41A 4TSCA 5F9XA 194LA 1LZNA 4GCBA 1GEZA 1GB3A 1B7OA 1LZBA 1GD6A 2XBRA 5C6JA 4D9ZA 1LZ6A 2BQBA 4FJRA 5KXYA 5A3ZA 4HV1A 4LT0A 3A6BY 1QSAA 1JITA 3TMXA 5FHWA 1GEVA 3WPJA 5JENB 1HELA 1LZYA 1LTMA 1FN5A 2B5ZA 1REXA 3AW7A 5HLLA 3G3AB 1HF4A 3ATNA 5DM9A 3T6UA 6LYTA 3M18B 1LZSA 3N9CA 2BQLA 4BAPA 3QE8A 2BAAA 1IP5A 1YAOA 4MR1A 2W1MA 3W6DA 1YKXX 4KL7A 1GBXA 3WYHA 5LA5A 4NGWA 3W6EA 1VDQA 5DLAA 1DI5A 5A3EA 1HEMA 4KPMA 5D5FA 4TWSA 1G7IC 4ZEEA 5LVHA 1C08C 4WOAA 1LHMA 1OP9B 4Z98A 2BQNA 1NMMA 4RLNA 3VWOA 4BS7A 1LJJA 1HMKA 4A7DA 2LHMA 1GBOA 135LA 1GE3A 3TXGA 1QDRA 3A95A 1GF0A 4NGJA 1DKKA 1GFGA 1HSXA 2FYCA 5HQ1A 3WULA 3AZ7A 5KXWA 1LMOA 1F6SA 3ZEKA 4EOFA 4TUNA 3W3EA 4H8ZA 2YBIA 4NGLA 1QDTA 4LYMA 1JISA 1UIBA 1VAUA 5I4YA 1GBZA 1WQQA 1IR9A 4RW2A 5KY1A 4OW1A 4G4HA 1LHJA 2ZNWY 4NHQA 3FI7A 4WLTA 1IWZA 2VB1A 1CKHA 1UUZC 3CSQA 4IJ4A 4UWVA 3TXBA 5I4XA 1IP1A 4XADA 3K3TA 1LJFA 1JSEA 1VEDA 4WM1A 1J1OY 2MEIA 1JEFA 1OUEA 2NWDX 3EMSA 1GF7A 1IORA 1KXXA 1BQLY 1HFXA 4QY9A 5AMYA 1WQMA 1BWIA 4GCEA 1BB7A 1IY4A 4MSTA 3WUNA 1IP7A 3AZ6A 2LYMA 4NHSA 4O34A 1BWHA 1AKIA 4H9HA 3W6FA 5IELA 2ZYPA 1V7TA 3T36A 2MEDA 4C5FA 4WM4A 3LYZA 1B5VA 4G4BA 4H91A 4KXIA 4B0DA 3RNXA 1LSAA 1GE1A 1LSMA 3CSZA 2FBBA 3LZ2A 2W1YA 2CDSA 4N9RA 4WO6A 1JIYA 1NF5A 2MEAA 1REZA 4TX7A 3AB6A 4ETBA 4BAFA 3LYMA 3LHMA 1FKVA 1LHHA 2YSSC 1GF6A 1GFUA 1YL1X 3OJPA 4DDCA 1BGIA 1WQOA 4HSFA 1LZ9A 1B7MA 4DDAA 1GFRA 4ETCA 2D91A 5ILCA 5LVIA 1T6VL 1GE0A 2MECA 2LZTA 4RDSA 1NDGC 2H5ZA 1LOZA 4GN4A 2BQIA 1LZEA 3A92A 3AJNA 2MEHA 4ETDA 1B2KA 2DQJY 2D4JA 3TXJA 1WQRA 2FBDA 3J4GA 3W6BA 4GN3A 1UIFA 5APFA 1AT5A 1REMA 3HFMY 2YBLA 1VDSA 1LSNA 4NWHA 2DQEY 1OUHA 3B72A 1IR8A 3P64A 3TXEA 1B5UA 1LCNA 1IWXA 1LKRA 2EPEA 4HTKA 208LA 4WG7A 4XN6A 3IJVA 4C3WA 1GF8A 5KKJA 3WL2A 1D0KA 1JKAA 4AGAA 3AW6A 1GB8A 1LJHA 4H1PA 4IASA 3AGHA 1GB2A 1NDMC 2MEEA 1LZTA 4GCFA 1JWRA 2A7DA 1G7LC 4QDNA 5KXZA 1IWTA 1OUIA 1OUCA 4N1EI 1HEQA 2LYOA 1TDYA 1LSZA 1RE2A 5LAFA 1GB7A 1VATA 3ULRA 3WW6A 3A67Y 4PJ2C 1BB3A 4GLAA 3P68A 2HU1A 1NQIA 4J1BA 2Q0MX 1HENA 5KKIA 1LJEA 193LA 4DD0A 4LYBA 3WPKA 1GAZA 4ANRA 1LJKA 2BPUA 3OK0A 2BQDA 2BLYA 4I0CA 3SP3A 3A90A 1GDXA 3WUAA 1UIGA 1FLUA 1YANA 4DD3A 3W6CA 5KXKA 4TTDA 4CHXA 2ZIKA 2C8PA 1LSPA 2Z12A 1GPQC 3WVYA 1HSWA 1JTTL 3CT0A 4E3UA 1YAPA 1HFYA 3LN2A 4XJFA 4ET8A 1EQ4A 1CNSA 1HEWA 1IY3A 5LINA 5LAGA 5FEKA 1TBYA 5B1FA 1WQNA 4Z46A 2C8OA 5HMJA 1IOTA 5LYTA 1IEEA 1WTNA 4RLMA 1C46A 5DN4A 4IATA 1B7PA 3ZVQA 4NG8A 5FDJA 5DN5A 1B5XA 1LZ1A 1OUGA 2DBTA 2DQFC 4ZFPA 4YEOA 4OWCA 1KXWA 1NBYC 5LVKA 5J7CA 1GB6A 2BQAA 4H90A 4ETAA 1B5YA 1AZFA 5LA8A 4EMNA 4YEMA 2EIZC 1TAYA 1LSGA 4QEQA 1XEKA 2G4PA 4NGVA 1G7HC 4LGKA 3CT1A 4LYOA 1LMNA 2YBNA 4WLYA 3A93A 1A4VA 207LA 3EO5A 2BQEA 3KAMA 4LZTA 5B06A 1BWJA 5B59A 2DQIY 2I26L 1JHLA 4DD2A 1HEOA 1IOCA 1JKBA 2N5ZA 5HNLA 5I5QA 1C43A 3BKHA 1XEJA 1LZDA 3TMWA 1IWYA 3ZVQB 1G7JC 3EXDA 2BQFA 4W94A 2BQGA 4YENA 4J0LA 1T3PA 1FLYA 2D6BA 4WLDA 4B49A 1F0WA 1LZ4A 4ML7A 1LSYA 5FCPA 5E9RA 2Z38A 1BB4A 1H6MA 2HEBA 1C10A 1KIRC 1YQVY 3RU5A 4HJYA 4DYGA 1UIDA 1CKGA 3RZ4A 1P2CC 4RW1A 4M4OA 5ILFA 4DD9A 2ZIJA 3GXRA 5F16A 1EQ5A 5C6LA 1A2YC 1XGUC 4WM5A 1BHZA 1OUJA 4PHIA 4HP0A 2Z18A 1HHLA 8LYZA 1UIAA 4DD1A 2BQKA 1GWDA 4H92A 4LYTA 2XBSA 1RFPA 2BLXA 1QUTA 4H9FA 1GFHA 2DQHY 4WM2A 4YOPA 5KXOA 4PGJB 4N8ZA 133LA 5LYMA 1GF5A 3GXKA 1LMCA 4LT2A 1FBIX 2HU3A 4LYZA 5D5CA 5DL9A 4N1CC 1GBWA 1DQJC 1LZAA 1V7SA 2F4AA 4XJHA 5KXSA 1LZRA 3CSRA 1LMTA 3P4ZA 1NWGA 1XGQC 4DD7A 3TXDA 2DQCY 2YBMA 1IP4A 4NIJA 1UCOA 5T3FA 1AT6A 1LZCA 2W1LA 1XGRC 5KXXA 1GF4A 1JKCA 1LJ4A 1GBYA 1LHLA 1YKZX 1NHEA 3D3DA 2HTXA 4LT1A 4N0JA 4H9AA 1QTEA 4H94A 4XJBA 5F9UA 1GXV2 1LJIA 1LJGA 1ZVYB 2CJLA 1HMLA 2DQDY 4X3BA 7LYZA 2MEBA 1BB6A 1CKFA 1H87A 3B6LA 3TXFA 3LYOA 3A91A 1TCYA 1DXJA 2XTHA 3MGWA 5KJ9A 4H8XA 4YF2A 3FE0A 1XGTC 1W08A 1B7LA 1JSFA 4DT3A 5F14A 1LMQA 1CKCA 2D4KA 2X0AA 1ZMYL 4WMGA 3W6AA 4HTQA 4XENA 5KXPA 1UC0A 1UICA 1HNLA 3AZ5A 1YAMA 4W96A 3QY4A 1GFAA 1RCMA 4LFXA 1OUAA 3WU7A 1IWVA 1GAYA 1XSFA 1UA6Y 1BVKC 4BADA 1LYSA 1JJ1A 1WQPA 1ALCA 1MLCE 132LA 1UBZA 4UWUA 4WO9A 1B7NA 4WM6A 4LYCA 4B4IA 1GB9A 1B5ZA 2I25L 4CFPA 4HTNA 3TMVA 5M1YA 3BKVA 2HEFA 1WVUA 4H9EA 1C7PA 4YM8A 1GB0A 1JTOL 2ZWBA 1XGPC 1VDPA 5I54A 2YBHA 1ZVHL 5APDA 3A3QA 1LKSA 2YBJA 1W6ZA 5KXLA 4PRQA 4NWEA 3RT5X 2DKVA 2HEDA 1I56A 4HPEA 3J6KA 1FLQA 2F4GA 1GFKA 4MCKA 4R0FA 1LHIA 3A8ZA 1IOQA 1QSWA 2ZILA 4NFVA 1GF3A 1KXYA 2EQLA 1LSDA 2IHLA 3B0IA 1FKQA 2A7FA 1LJNA 4HV2A 4B4EA 2ZQ3A 3RW8A 5K7OA 2LYZA 4I8SA 4NEBA 4UWNA 4N5RA 4B4JA 3WUMA 1HEPA 3N9AA 1LZGA 1BVXA 1GFJA 1DI4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP3A 2I6ZA 5B07A 1LZ8A 2RSCA 109LA 256LA 3C7ZA 3CDRA 1XEPA 230LA 1L13A 3CDTA 1B5WA 1OUFA 5LVJA 1G7MC 1YL0X 199LA 5II3A 1L54A 4YX7C 4G49A 1LSEA 4EJ4A 1XEIA 1G07A 161LA 1DYFA 255LA 3WH1A 1PQOA 1L48A 1YILA 153LA 1GDWA 4EPFA 2WARA 1FLWA 3AZ4A 3DN4A 1D9UA 5HNCA 4EKPA 4OWAA 4OWEA 5B05A 3TXKA 1GFEA 2MEFA 1QS9A 262LA 1LPIA 1DKJA 4NGZA 1CTWA 2LZ2A 201LA 4DJHA 3LYTA 1CX6A 2A4TA 3WU9A 3QAKA 1IC4Y 1J1XY 2G4QA 1P3NA 3DN8A 4GBRB 3DMZA 1L40A 4FDYA 1CU6A 4NSGA 4P2EA 1IC5Y 1GB5A 2H9JA 187LA 4WL7A 3IJUA 1WTMA 4GCDA 1CX7A 226LA 1I1ZA 3AYQA 1QTZA 1IP2A 1LSBA 3P65A 1L17A 2Z39A 3JR6A 6LYZA 3A6CY 2BQCA 5KXMA 1YROA 1E8LA 4WL6A 1OUDA 4HJZA 5IHGA 4KT3A 1L22A 2ZQ4A 3ATOA 1L99A 3HT6A 3TXHA 4LDLA 1GFTA 2DQAA 1IP6A 4LT3A 1L58A 2Q9EA 1LMPA 1IR7A 5F9XA 1L31A 1LZNA 4ARQB 2XBRA 4FJRA 4HV1A 3A6BY 3TMXA 3AW7A 1HF4A 152LA 5DM9A 3T6UA 151LA 3QE8A 164LA 251LA 4KPMA 4ZEEA 1CU0A 2BQNA 2B6WA 4BS7A 216LA 135LA 1QDRA 1GF0A 1L15A 2FYCA 5HQ1A 3WULA 2O7AA 3AZ7A 1F6SA 1L49A 1UIBA 1VAUA 205LA 1GBZA 4K5YA 4I7KA 4UWVA 4ARMB 1J1OY 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1D6P A;  1IP3 A;  1AM7 A;  1OQM A;  2I6Z A;  5B07 A;  1LSF A;  4NHI A;  1CJ8 A;  1PZY A;  1LZ8 A;  1IIZ A;  2RSC A;  1F10 A;  4H9B A;  4ETE A;  4OOT A;  1YKY X;  1RI8 B;  1LYO A;  3CT5 A;  2HEC A;  2Z2E A;  4Z41 A;  5APC A;  1C45 A;  4DC4 A;  4CFO A;  1B5W A;  1OUF A;  1UAC Y;  3WVX A;  5LVJ A;  4CGE A;  1G7M C;  4ET9 A;  1N4F A;  1YL0 X;  4HPI A;  4R6C A;  5II3 A;  4J7V A;  2ZNX Y;  4NGK A;  4GLV A;  5F81 A;  1REY A;  3F6Z A;  3M3U A;  1VFB C;  2AUB A;  5B1G A;  1LZ5 A;  1J1P Y;  1B7S A;  4G49 A;  2W1X A;  1IWU A;  1GF9 A;  1LSE A;  2BQH A;  3EBA B;  5KXN A;  154L A;  1XEI A;  1IC7 Y;  1QQY A;  1DZB X;  4HJV A;  4QGZ A;  1KIQ C;  3A34 A;  4NG1 A;  3WH1 A;  1LSC A;  153L A;  1JTP L;  1YIL A;  3LZT A;  4DWX A;  5HMV A;  4NGI A;  5FEL A;  1GDW A;  3CB7 A;  5L3H A;  1XFP L;  2CWI A;  2BQO A;  2H9K A;  4WM3 A;  1D0L A;  3WXU A;  5LIO A;  1GFV A;  1B9O A;  2WAR A;  1I20 A;  5IDD A;  1IO5 A;  1FLW A;  3AZ4 A;  3TXI A;  2HUB A;  3A94 A;  4NHT A;  1D9U A;  2BQJ A;  5HNC A;  4NSI A;  4J1A A;  2HEA A; 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 1FLY A;  2D6B A;  4WLD A;  4B49 A;  1F0W A;  1LZ4 A;  4ML7 A;  1LSY A;  5FCP A;  5E9R A;  2Z38 A;  1BB4 A;  1H6M A;  2HEB A;  1C10 A;  1KIR C;  1YQV Y;  3RU5 A;  4HJY A;  4DYG A;  1UID A;  1CKG A;  3RZ4 A;  1P2C C;  4RW1 A;  4M4O A;  5ILF A;  4DD9 A;  2ZIJ A;  3GXR A;  5F16 A;  1EQ5 A;  5C6L A;  1A2Y C;  1XGU C;  4WM5 A;  1BHZ A;  1OUJ A;  4PHI A;  4HP0 A;  2Z18 A;  1HHL A;  8LYZ A;  1UIA A;  4DD1 A;  2BQK A;  1GWD A;  4H92 A;  4LYT A;  2XBS A;  1RFP A;  2BLX A;  1QUT A;  4H9F A;  1GFH A;  2DQH Y;  4WM2 A;  4YOP A;  5KXO A;  4PGJ B;  4N8Z A;  133L A;  5LYM A;  1GF5 A;  3GXK A;  1LMC A;  4LT2 A;  1FBI X;  2HU3 A;  4LYZ A;  5D5C A;  5DL9 A;  4N1C C;  1GBW A;  1DQJ C;  1LZA A;  1V7S A;  2F4A A;  4XJH A;  5KXS A;  1LZR A;  3CSR A;  1LMT A;  3P4Z A;  1NWG A;  1XGQ C;  4DD7 A;  3TXD A;  2DQC Y;  2YBM A;  1IP4 A;  4NIJ A;  1UCO A;  5T3F A;  1AT6 A;  1LZC A;  2W1L A;  1XGR C;  5KXX A;  1GF4 A;  1JKC A;  1LJ4 A;  1GBY A;  1LHL A;  1YKZ X;  1NHE A;  3D3D A;  2HTX A;  4LT1 A;  4N0J A;  4H9A A;  1QTE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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