1G7MC

Crystal structure of hen egg white lysozyme (hel) complexed with the mutant anti-hel monoclonal antibody d1.3 (vlw92v)
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
molecule keywords ANTI-HEN EGG WHITE LYSOZYME MONOCLONAL ANTIBODY D1.3
publication title Estimation of the hydrophobic effect in an antigen-antibody protein-protein interface.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1g7mC00
1YAMA 1LSYA 1BB4A 2Q0MX 1IC4Y 1LZSA 4TSCA 5KXMA 1HC0A 2LYOA 1BGIA 3D3DA 4X3BA 1B7LA 4N0JA 1LOZA 1IWUA 4WOAA 4TWSA 1WVVA 2ZIKA 3AW6A 1UICA 3B0OA 4DD2A 1LMQA 2DKVA 2D4JA 5APFA 1JUGA 1HEOA 4AGAA 4R6CA 2Z2FA 3F6ZA 5ILCA 1DZBX 1OUBA 3AJNA 4WMGA 1QUSA 5D5CA 3TXDA 1AT5A 3WW6A 1IVMA 1HNLA 2MEFA 1GFKA 2Z19A 4HJYA 2BQCA 4LFXA 4H9IA 5LVJA 3RU5A 5A3ZA 1LMNA 4Z98A 5B05A 1DI4A 4WO9A 1IORA 1GF0A 4IJ4A 4XADA 4XJBA 1IWWA 4L41A 5APEA 1GB2A 4PRQA 7LYZA 1LYYA 4GCDA 4IATA 3CT1A 4YEOA 1LSCA 2F4AA 1OP9B 5HNLA 5L3IA 1F10A 1UIDA 2BQEA 4PJ2C 1JSEA 3ATNA 2LYMA 1IWVA 1HEWA 5LA5A 3CQLA 3BKVA 3W6DA 153LA 4GCFA 1LHHA 3RNXA 4ETEA 3A3RX 3AW7A 1GE3A 4LT0A 4H9AA 1PS5A 1YKZX 4WM4A 3WXTA 4WLXA 5FCPA 1OUJA 3RW8A 1HFXA 1DPWA 2LYZA 5HQ1A 4XENA 1FLQA 3LYTA 4NHSA 2XTHA 5I5QA 1GFJA 1CNSA 3LHMA 1XGQC 1LMTA 2DQJY 3AZ5A 4XJDA 6LYZA 1UC0A 2YBMA 5LVHA 4H93A 1V7TA 5KXRA 5FEKA 1GPQC 1B7NA 1TBYA 1LZGA 5IELA 1JKAA 4H90A 2YBLA 4FJRA 4H9BA 1B5ZA 2BQKA 3LZ2A 4H8YA 2Z38A 5LYZA 4NWHA 3WPLA 134LA 1UA6Y 4ET9A 1C08C 2HU1A 4GCCA 1YAPA 3D9AC 3LN2A 1IY4A 1OUCA 3IWRA 194LA 1ZV5L 4H8ZA 1LTMA 3TXEA 2YBIA 4M6DA 2C8PA 4HTQA 2CGIA 1LSDA 2BQJA 4NGJA 1BVXA 4UWVA 4Z41A 5B59A 1IP2A 1ZMYL 1B9OA 4H9EA 2ZQ4A 3G3BB 4DDBA 4ETAA 2ZWBA 4YEMA 3CB7A 3TMWA 4B4JA 1B5UA 4W94A 4WLDA 4CHXA 1JTOL 4CJ2A 1NWGA 2WARA 4RDSA 1VFBC 1FN5A 3RT5X 4LZTA 4D9ZA 4EOFA 2FBBA 3WPKA 1VEDA 4NFVA 1ALCA 4O34A 2F2NA 4NG8A 4BS7A 5HMVA 1LMAA 3QE8A 8LYZA 3IJVA 2EIZC 2HEAA 5HNCA 2LZ2A 1IOTA 4HV2A 3A6BY 1KIQC 2AUBA 3AGHA 4G49A 4NGYA 1HSXA 3TMUA 4XYYA 1LJGA 1YL1X 1C10A 1YANA 1LZDA 2BPUA 3ULRA 5KKIA 3MGWA 5B07A 3WYHA 2W1YA 1XSFA 4RW1A 1CJ6A 1LZNA 1YKXX 2BQHA 4HTKA 3TXIA 5FSTA 1IOSA 1BB6A 1BWHA 4J1BA 2HEDA 4KT3A 1LZ9A 1BB5A 1LHKA 1OQMA 2VB1A 4G4CA 3CSQA 4WM1A 4WM2A 2GV0A 4WO6A 2CWIA 5F81A 3WUAA 2XJWA 1GDXA 1INUA 3EMSA 3A90A 3WULA 1XEJA 5EBHA 4H92A 1OUDA 3WVXA 1UACY 1YILA 2DQEY 4NGZA 4YF2A 1LSGA 3K3TA 2H5ZA 1GB6A 4TTDA 3J6KA 1H87A 3TXFA 1GBXA 3QY4A 5DN5A 5APDA 1REYA 1XGPC 5FDJA 1LHIA 1LYOA 2MEEA 1GE1A 4ANRA 3ZVQB 1E8LA 1DXJA 2H9KA 4H9HA 4NSJA 2HU3A 4BADA 4G4HA 2IFFY 5F14A 5LVIA 5LYTA 1CJ9A 2I6ZA 4P2EA 3GXRA 1CKCA 1A4VA 1GBOA 4UWNA 1REXA 1NQIA 1XGTC 4LFPA 4ZFPA 5APCA 1GWDA 2Z37A 5LINA 1VDQA 3SP3A 1JHLA 1GFVA 3TMVA 5K7OA 5T3FA 2XBRA 1GFEA 4N9RA 3HBHA 1LJFA 1IP5A 4RW2A 3LYOA 4MSTA 5LAFA 193LA 4MR1A 4NGWA 1GE0A 1LJEA 4B4EA 1LZCA 2YBNA 3LYMA 1LMCA 1LZAA 1JTTL 1D0LA 1LYZA 5FHWA 5II3A 4PGJB 5KXZA 3P4ZA 4ETBA 1T6VL 1BHZA 1LZ1A 1H6MA 1GB3A 1FKQA 4NHPA 1DI3A 4LYZA 2BQNA 1HEPA 3A96A 4H9CA 5LVGA 3B72A 4DDCA 3W6EA 3RZ4A 4DD0A 2BQIA 2D4IA 4U3XB 4NGOA 1CJ8A 1FLWA 1YAQA 2BQGA 5KXWA 1WQQA 5B1FA 2YSSC 1WQRA 4E3UA 3WUNA 1HEMA 4LYOA 1UIFA 132LA 3HBEX 4XJFA 5DM9A 2LZTA 4CFPA 1LSBA 4PHIA 4DD7A 1LZBA 1GB9A 2MEAA 4HJZA 2BAAA 4TUNA 1BB7A 1GF5A 4WLYA 2PC2A 1CKGA 1HENA 1UBZA 3BKHA 2DQCY 1XEIA 4HTNA 4H1PA 1LHMA 3A95A 4B0DA 4LYCA 1QQYA 2HEEA 1FKVA 3AB6A 4GN3A 4KXIA 2FBDA 2Z2EA 3M18B 2G4PA 1WTNA 3A6CY 4NGVA 4FDYA 1F6SA 1AKIA 1J1PY 1LSZA 4I8SA 4DWXA 4WL6A 2ZIJA 4G4BA 5I4XA 1CKFA 1I20A 4NHIA 1Z55A 1W08A 1LSNA 1G7IC 2BQAA 1YL0X 4WM6A 1LZ4A 1B7MA 5FELA 1GBSA 1LHLA 1IO5A 1N4FA 2ZQ3A 1GAYA 1GD6A 4LYMA 1B7OA 4B4IA 1C45A 1LZ6A 3W3EA 3N9EA 5AMYA 1VAUA 1B5XA 1GB7A 1TCYA 2BQDA 2HEBA 1GBWA 4OW1A 4OWBA 1IP7A 1XFPL 2EQLA 2X0AA 3P65A 1W6ZA 1OUHA 1B7RA 5KXLA 1GFRA 1REZA 4HSFA 1GEZA 3W6BA 4ET8A 1GB0A 2DQAA 4Z3MA 1LHJA 2ZILA 4DC4A 4DYGA 4II8A 5L3HA 1GFHA 2ZNXY 3LYZA 3EBAB 1OUEA 1CKHA 1P2CC 2HEFA 1C43A 1GB8A 4H8XA 4WG7A 1J1OY 2MEBA 1GDWA 2HTXA 5I54A 1DI5A 1LAAA 1B7QA 1SLYA 6LYTA 3ATOA 1BQLY 4W96A 4LYBA 4ZEEA 1CJ7A 4XN6A 1DQJC 5M1YA 1IP4A 1BB3A 1UIGA 2D4KA 1JPOA 2FYCA 4CGEA 4KPMA 1JTPL 1NF5A 1WQOA 1QTEA 2ZYCA 3AGGG 4J7VA 1GXV2 1LJ3A 1IWZA 1FDLY 1JEFA 1LJ4A 5KXNA 3WXUA 4DDAA 3W6CA 4HP0A 2HECA 2FYDA 4IASA 1GFGA 1UUZC 1LZEA 1OUAA 1LMOA 208LA 1JJ3A 2N5ZA 4MCKA 1VDSA 1FLYA 1LSMA 1NBYC 2D91A 2MEIA 4OWHA 5DLAA 1LZRA 4XJGA 2HUBA 5B06A 1JISA 3WMKA 1QIOA 3HFMY 1KXWA 4GN5C 1YROA 1GXXA 1IWTA 1AT6A 2G4NA 3KAMA 4NEBA 5JENB 5KXTA 1GAZA 4ETCA 1B5VA 5KXYA 1HEQA 1V7SA 3EO5A 2ZYPA 4NGIA 4RLNA 5L9JA 1RI8B 1LSPA 2MEDA 2DQGY 3A93A 1HERA 1PZYA 2A7DA 1MELL 3A8ZA 135LA 3P66A 3EXDA 1ZVYB 1DKJA 1GBZA 2CDSA 3A34A 4GCBA 4GCEA 4HPEA 1KXYA 4OWAA 3TXGA 1ZVHL 3WVYA 5LXWA 1JKCA 1IWXA 5LIOA 1YQVY 1HELA 1GF6A 4C3WA 5A3EA 4TX7A 1T3PA 3FI7A 3GXKA 4H94A 1JIYA 1GF4A 4BAFA 1BWJA 4H91A 4AXTA 4OOTA 2DQIY 5LA8A 1LCNA 1D0KA 3A92A 4OWCA 1DKKA 4CFOA 1G7LC 5KXXA 1IR8A 2H9JA 3N9CA 3E3DA 4M4OA 1I56A 4NG1A 1AM7A 1IWYA 1OUGA 1IIZA 1B2KA 2EPEA 2DBTA 1JJ0A 2C8OA 4I0CA 4HV1A 2G4QA 5J7CA 1WQPA 2B5ZA 1D9UA 1MLCE 2Z18A 5F16A 4A7DA 1LZYA 3QNGA 4B1AA 4ZIXA 4OOOA 1RJCB 4BAPA 5I4YA 4GLVA 4QY9A 1GB5A 3W6FA 1REMA 4ML7A 1LZ8A 1UCOA 4XJIA 3TXHA 4PPOA 1UIBA 5DL9A 1IOQA 5KKJA 1QSWA 2CJLA 1UIAA 4PRUA 1WQNA 4J1AA 1XGUC 3WU8A 1BVKC 5KJ9A 1TDYA 3CT0A 4WM5A 4N8ZA 1A2YC 1EL1A 2Z39A 2MECA 3T36A 4B49A 4DD9A 1UIHA 2EKSC 3FE0A 4UWUA 1NMMA 3M3UA 1D0MA 5KXKA 4NGLA 4EMNA 4NWEA 5B1GA 1OUFA 1IY3A 4NHQA 3A3QA 4Z46A 2BQBA 5HMJA 5HLLA 1QSAA 2DQFC 3OJPA 3B6LA 3WH1A 2IHLA 1NBZC 1YKYX 1LPIA 1D6PA 1C46A 4GN4A 2Y8PA 1JSFA 2BQFA 1GF8A 3IJUA 4WLTA 5E4PA 5KXSA 3N9AA 1D6QA 1HMLA 3B0KA 4XJHA 3T6UA 1EQ5A 3P68A 3TXBA 4DT3A 1HFZA 1O23A 1LZTA 1QTKA 4WG1A 133LA 3LZTA 5E9RA 4ETDA 1LJHA 3B0IA 4N1EI 1UIEA 1IX0A 3G3AB 1J1XY 1EQ4A 1IP3A 3CSZA 4LT3A 4N5RA 3WU7A 2MEGA 2A7FA 5KY1A 1VDTA 2DQDY 2F30A 4NY5A 1NDMC 1LJKA 1GE2A 4J0LA 3J4GA 4N1CC 1TAYA 4NGKA 1EQEA 4LT1A 5LVKA 1NDGC 2BQMA 4QDNA 5C6JA 1HF4A 3AZ6A 3AGIA 5IDDA 3TXJA 4WM3A 2DQHY 4NIJA 1LMPA 1GBYA 1NHEA 207LA 1B5YA 1IC5Y 5KXOA 4WL7A 1LZ5A 2F4GA 1LSFA 1B7PA 1JKDA 1WVUA 4H9FA 2W1XA 2XBSA 2BQLA 4HJVA 1LKRA 1GE4A 3TMXA 1GFTA 1KIRC 4KL7A 3CT5A 5C6IA 1C7PA 1LKSA 5KXPA 3W6AA 2RSCA 1QDTA 2BLYA 3P64A 1CKDA 5ILFA 1NKHA 1GF7A 1HHLA 1GF9A 1YIKA 2YDGA 3WW5A 1I1ZA 2W1MA 1RFPA 3WUMA 1JWRA 4C5FA 1XGRC 2Z12A 1IR7A 1YAOA 1GF3A 2BLXA 1JITA 1VATA 4QGZA 4G9SA 3VWOA 3CSRA 3OK0A 1FBIX 1LYSA 3A94A 3AYQA 1SQ2L 5IHGA 4NSGA 3HBDA 1GFUA 4LGKA 1DPXA 1LSEA 1IC7Y 1JJ1A 1LSAA 1RCMA 4NSHA 5C6LA 4YOPA 1WTMA 1RE2A 3TXKA 1KIPC 4LYTA 2ZNWY 1B5WA 3WPJA 154LA 4DD1A 4TSBA 4LT2A 3ZVQA 5I4WA 4R0FA 3A91A 1F6RA 4OWEA 5LAGA 2NWDX 4HPIA 1G7MC 1KXXA 3ZEKA 2W1LA 5F9XA 1HSWA 1GFAA 5DN4A 5I53A 3WL2A 2LHMA 3AZ7A 3A67Y 2D6BA 1HFYA 1TEWA 1XEKA 1IOCA 1B0DA 2YVBA 4NHTA 1QUTA 1WQMA 5LYMA 1JKBA 1FLUA 4YENA 1IEEA 1OUIA 1VDPA 4GLAA 1F0WA 1IP1A 4QEQA 1G7JC 1GEVA 1LJIA 1LJJA 2I26L 2YBJA 9LYZA 1BWIA 1GHLA 4DD3A 4YM8A 2I25L 2MEHA 1LJNA 5F9UA 1QDRA 1IR9A 4NSIA 1IP6A 1B7SA 2YBHA 2BQOA 5D5FA 3AZ4A 1AZFA 4RLMA 3WU9A 1HMKA 1G7HC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0MX 3SN6R 1C67A 1B7LA 1WVVA 2ZIKA 3AW6A 1UICA 4R6CA 2Z2FA 4W51A 143LA 169LA 2MEFA 3PBLA 4LFXA 2BQCA 4H9IA 1LMNA 3OE0A 5B05A 4L41A 1DYAA 1L12A 1CTWA 1L27A 3CT1A 2F4AA 1OP9B 5L3IA 1L40A 3DMXA 2LYMA 4I7RA 1C6FA 2OU9A 3WXTA 1L84A 3HTBA 1FLQA 3LYTA 1C62A 3AZ5A 2YBMA 4H93A 5FEKA 1JKAA 4H90A 3HTGA 261LA 4H9BA 3LZ2A 104LA 3G3VA 1L03A 1ZV5L 3TXEA 2YBIA 4M6DA 2C8PA 4EKSA 4HTQA 1C64A 2CGIA 3FI5A 1L02A 4DDBA 2ZWBA 4B4JA 3C8QA 1L42A 4CJ2A 1NWGA 4RDSA 2NTHA 212LA 1L61A 3RT5X 4LZTA 240LA 2FBBA 3WPKA 1C68A 2F2NA 125LA 4BS7A 1LMAA 3IJVA 5HNCA 2LZ2A 4HV2A 3TMUA 1LJGA 1L43A 3ULRA 4IAPA 3MGWA 2HULA 1XSFA 1YKXX 3C7YA 3DMVA 1BWHA 3GUIA 2HEDA 1SSWA 1LHKA 2VB1A 2GV0A 1QT4A 4AQNA 3A90A 4H92A 1OUDA 1QUDA 1LSGA 3K3TA 3DN1A 4TTDA 1H87A 3TXFA 1GBXA 5APDA 1XGPC 1E8LA 1GE1A 4ANRA 4H9HA 2F47A 5LVIA 1C6DA 2I6ZA 4UWNA 1REXA 1NQIA 1XGTC 5LINA 3D4SA 1VDQA 3SP3A 5K7OA 2XBRA 3HBHA 1LJFA 193LA 1LZCA 2YBNA 1JTTL 5FHWA 3HH5A 4ETBA 1BHZA 1FKQA 4LYZA 3LZMA 4DD0A 2BQIA 2D4IA 1OVJA 4U3XB 1CJ8A 4EXMA 1L29A 2BQGA 1WQQA 1UIFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1YAM A;  1LSY A;  1BB4 A;  2Q0M X;  1IC4 Y;  1LZS A;  4TSC A;  5KXM A;  1HC0 A;  2LYO A;  1BGI A;  3D3D A;  4X3B A;  1B7L A;  4N0J A;  1LOZ A;  1IWU A;  4WOA A;  4TWS A;  1WVV A;  2ZIK A;  3AW6 A;  1UIC A;  3B0O A;  4DD2 A;  1LMQ A;  2DKV A;  2D4J A;  5APF A;  1JUG A;  1HEO A;  4AGA A;  4R6C A;  2Z2F A;  3F6Z A;  5ILC A;  1DZB X;  1OUB A;  3AJN A;  4WMG A;  1QUS A;  5D5C A;  3TXD A;  1AT5 A;  3WW6 A;  1IVM A;  1HNL A;  2MEF A;  1GFK A;  2Z19 A;  4HJY A;  2BQC A;  4LFX A;  4H9I A;  5LVJ A;  3RU5 A;  5A3Z A;  1LMN A;  4Z98 A;  5B05 A;  1DI4 A;  4WO9 A;  1IOR A;  1GF0 A;  4IJ4 A;  4XAD A;  4XJB A;  1IWW A;  4L41 A;  5APE A;  1GB2 A;  4PRQ A;  7LYZ A;  1LYY A;  4GCD A;  4IAT A;  3CT1 A;  4YEO A;  1LSC A;  2F4A A;  1OP9 B;  5HNL A;  5L3I A;  1F10 A;  1UID A;  2BQE A;  4PJ2 C;  1JSE A;  3ATN A;  2LYM A;  1IWV A;  1HEW A;  5LA5 A;  3CQL A;  3BKV A;  3W6D A;  153L A;  4GCF A;  1LHH A;  3RNX A;  4ETE A;  3A3R X;  3AW7 A;  1GE3 A;  4LT0 A;  4H9A A;  1PS5 A;  1YKZ X;  4WM4 A;  3WXT A;  4WLX A;  5FCP A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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