1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
b'TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
4E93A 2DX1A 2L2PA 3VROA 2CIAA 3CD3A 1UJ0A 2GBQA 2O9VA 2KRSA 1D4TA 1JYRA 2GTJA 1GCQC 2A08A 2NWMA 3BKBA 2P4RA 2K6DA 3U23A 1R1QA 3GBQA 2DLPA 3LH5A 1SEMA 2EYZA 2MIOA 2K79B 1XOVA 1MILA 3S8LA 1GBRA 2DBKA 2DL3A 4J9FA 4RTVA 3PLFB 1RUWA 3I9QA 2DVJA 1FYNA 3BUMB 3VS1A 3H41A 3S9KA 3M0UA 1M3CA 4EIKA 1BMBA 1WX6A 2YUQA 4J9DA 1PICA 2MRJA 2FPDA 4JPBW 3TL0A 1R1PA 4FBNA 1TZEE 2L3QA 2SHPA 1UHCA 2GNCA 1UFFA 1ZUYA 2RMOA 1AYBA 3IMDA 1NM7A 4EIHA 3EHRA 1AVZC 1TG0A 2JW4A 2KE9A 1W6XA 1FU5A 2XP1A 1T0JA 2E5KA 4OMPA 1M3AA 2ED1A 1M3BA 2RF0A 2AZVA 4GLMA 1UUSA 1NYGA 3VS7A 2LCSA 4AFSC 4K2RA 3PSKA 1RQQC 4CC3A 4FL2A 2DF6A 1ZX6A 4OHIA 4AFUC 1X6GA 2RPNA 2HBWA 3CWGA 1X69A 2CT4A 2KYBA 4IIMA 1BHFA 1YCSB 1NEBA 1WIEA 2YSXA 2JMAA 3OB1B 1LUNA 2JMCA 1YNZA 1B3QA 2F2WA 2B3OA 2FCIA 1QWFA 2EO6A 5J3XA 2O88A 2AUGA 2EQIA 3N84A 4P9VA 4J9EA 1Y57A 4LNPA 4AFZC 2LJ1A 5GJIA 3GQIB 2QDLA 5BO4A 1ABOA 2ABLA 1SPSA 2MCNA 2M51A 1JYQA 3HHMB 1FMKA 2CUBA 1A0NB 1O4FA 4JEGA 3VRRA 4J9GA 1AWOA 1O4RA 1O4CA 1B47A 3SHWA 1K4US 4OMLA 1E6HA 1QCFA 4DGXA 2A37A 2LJ0A 1H9OA 2IUHA 5IHIA 1NEGA 3NGPA 5EHPA 2RQTA 1X27A 1CJ1A 3PVLA 2J06A 3EG2A 1O4LA 2KT8A 1IS0A 1YN8A 2KRNA 1XA6A 2MC1A 3PE0A 1E6GA 4HCKA 4Z8AA 1J3TA 3I5RA 1O43A 1TCEA 2SRCA 2VKNA 2KGTA 2CI9A 1UHFA 1WFWA 3IMJA 4EY0A 2ED0A 1N5ZA 3PVQA 3UA6A 2DBMA 2J6KA 2K9GA 3H0HA 5I11A 1YVLA 2I0NA 1D4WA 2BZ8A 2CREA 2PNAA 1SHGA 3SEMA 1X6CA 2Y1MA 1O4PA 5FWBA 1QLYA 5IH2A 1CKBA 2EKHA 1UG1A 1GRIA 1O41A 2PLEA 5L23A 2HSPA 3M0PA 2DCRA 4GPLB 4L1BB 2LQWA 4Z88A 1SHAA 3OV1A 1WQUA 2DL4A 2KRMA 2D0NA 2LZ6B 1SHBA 1TUCA 2VIFA 4A63B 1M8MA 1B07A 3REBB 2KBTA 2ROLA 1WXUA 3I5SA 1JWOA 3VRQA 4F5BA 2CS0A 3IN7A 1OO4A 4CC2A 1O4BA 1O48A 2LP5A 1O4EA 1SHFA 4GL9E 3M0SA 4H34A 2K79A 5EC7A 1HCSB 1RLQC 4DGPA 1Z9ZA 2LNXA 3RBBB 2YT6A 2KROA 1WI7A 2YU7A 1A09A 5EELA 2LMJA 1BLKA 1U3OA 5KAZA 1QKXA 2G6FX 1WA7A 2SEMA 1M61A 2YUOA 1YWPA 1BHHA 4OMOA 3PQZA 1O44A 2FRWA 1O4DA 4DEXA 2L3PA 2OI3A 3EG1A 3TSZA 1SRMA 4D8DA 1KJWA 3QWYA 1BFJA 1EFNA 3MAZA 4RTUA 5DC0B 2DLZA 2BTTA 1W1FA 1P13A 1NLOC 1ABQA 2KXDA 3EHQA 2K7AB 4GWFA 3REAB 1PKTA 1CSKA 4OHEA 2EYYA 3O5ZA 2KK6A 1ZUUA 2L3TA 1A1AA 3C7IA 1SPKA 1BKMA 3US4A 1YVHA 4IIOA 1BK2A 1GFDA 4NWFA 1A1BA 2O31A 1T3LA 1D1ZA 5FW9A 1O45A 2MOXA 1K0XA 1GHUA 1U5SA 2HDXA 2A36A 1BLJA 5IXBA 1K76A 4TZIA 2PNIA 3HCKA 1H3HA 4F59A 3VGOA 2LQNA 2H46E 3KFVA 2YUPA 1X2QA 3ZL7C 3MXYA 1KC2A 5HCKA 1CKAA 3WA4A 3VS2A 1WXBA 2VWFA 3S8NA 1GBQA 2B86A 4J9BA 2LNHB 2DM0A 2HDAA 4JJCA 1UE9A 2JYQA 1F1WA 4DEYA 1OO3A 2F2VA 2GGRA 5IBSA 4F14A 1PKSA 2DL8A 3K2MA 1V1CA 2OJ2A 2JS2A 2C9WA 3ZNIA 4JJDA 2X3XD 3PJPA 1AEYA 4NWGA 4OHDA 1VYVA 4WCIA 1CWDL 3VRZA 2PNBA 4F5AA 2J6OA 3EGUA 1FBZA 2CSQA 2CUDA 5ECAA 1QADA 2EGEA 2CSIA 2D1XA 1VA7A 1A08A 4U1PA 1NLPC 3NHNA 1HD3A 4AG1C 3VS5A 1M30A 4LN2A 4RTWA 2CH4W 2PTKA 2L6KA 5HKWA 1UECA 2EW3A 4A4BA 1ZBJA 1LCJA 3R6NA 4JGHA 1KIKA 2V1RA 1JYUA 2ROTA 4HVUA 1I1JA 1BM2A 3VRNA 3VS4A 1OV3A 2H8HA 3CQTA 4OMQA 5GJVB 4KRTA 1O4IA 2CBLA 1AWJA 4J9CA 2GSBA 2RMXA 3GXWA 1YP5A 1BFIA 1SPRA 1UTIA 2DMOA 1BG1A 1UURA 4JJBA 1A07A 1UDLA 2D8JA 2PZ1A 4J9HA 1FU6A 2HUWA 2W10A 1ZFPE 2IZVA 2DRKA 4OHLA 1CSZA 1VYTA 2RN8A 3H0IA 4XZ1A 2DE0X 1GCPA 1RJAA 4E6RA 1AYCA 1FYRA 5AXIA 5GJHA 2A28A 2JTEA 1I0CA 1SHDA 1LCKA 2IUIA 1T3SA 4P9ZA 2DJQA 1HJDA 4RTYA 2CH4A 2RQRA 2L3SA 1AZEA 2OAWA 1O4MA 1I07A 1H92A 1BB9A 2ENMA 1A1EA 1IO6A 3EG0A 2BBUA 2CRHA 5I6VA 1MUZA 4H1OA 5CDWA 2EBPA 4M4ZA 2L4KA 1SSHA 4GBQA 2EU0A 3A98A 1PHTA 2IUGA 2EYXA 2RVFA 3CXLA 3THKA 1VYUA 2AKKA 2RNAA 4AFQC 5D0JA 1AOUF 2K7AA 3IQLA 1KA6A 3CBLA 3M7FA 2J6FA 1JO8A 2DRMA 4OMMA 2EKXA 2DM1A 4QT7A 2GTOA 1R1SA 5IHNA 4Y92A 2DYBA 2C0OA 1SKJA 4K45A 1ARKA 1MW4A 1WDXA 3TVTA 1K1ZA 1KA7A 1O4AA 1QWEA 2AOBA 2RSYA 1T0HA 4ZNXA 2DA9A 2AOAA 3UATA 3M0TA 2YUNA 2V1QA 2H5KA 1Y1UA 1WYXA 2EYWA 2KR3A 2HMHA 3UYOA 4F16A 2PLDA 1JU5A 2BZYA 3NMZC 4ROJA 4OHHA 2JM8A 1AWWA 5EG3B 2MQIA 1ZLMA 4OMNA 1MV0B 4LUDA 2CI8A 1FHSA 4LUEA 1CWEA 1SRLA 1JEGA 1IJRA 2XMFA 3BUNB 3PS5A 3UA7A 3N7YA 1Z9QA 1UGVA 1WXTA 4HVWA 1NYFA 1O47A 4J9IA 1LKLA 1QG1E 1H8KA 1RI9A 3VS6A 3FJ5A 3H0FA 4RUGA 1LKKA 2EPDA 2YSQA 4R0KA 2CDTA 2LNWA 2EVRA 3OP0A 4RTTA 2O9SA 2LX7A 1BHHB 1LUIA 3UF4A 1O49A 3IN8A 2FO0A 4ORZA 2DL5A 3EACA 1NZLA 1BF5A 1O4KA 1BU1A 2J7IA 1O4OA 4CC4B 4U17A 2K3BA 1O4JA 5EEQA 3T04A 1UUEA 2Y1NA 2DNUA 1Y0MA 3EG3A 1KSWA 1WLPB 2AK5A 2C0TA 2KXCA 5DC4A 1AD5A 2LCTA 2HDVA 2RQVA 4X1VA 3TKZA 2ECZA 4WWQA 1RPYA 2JT4A 1JXOA 1O46A 2ETZA 1U06A 1AOJA 2VVKA 1GFCA 2FPEA 2OZOA 2ESWA 2HCKA 2GQIA 3N8MA 4JZ4A 2MK2A 2FG0A 1E7OA 2AZSA 1W70A 2EGCA 2L0AA 1AYAA 4K11A 1K0SA 5AULA 4XZ0A 5DF6A 4HVVA 3EAZA 2DILA 3HIZB 2QMSA 4LE9A 4AG2C 4F17A 1JU5C 1UJYA 2KNBB 5IXFA 2DX0A 3MXCA 2W0ZA 1G83A 2JM9A 1OEBA 3ULRB 4RTXA 4K44A 1FBVA 2KYMA 2LJ3A 1M27A 1O4NA 2EL8A 2RQUA 1Z3KA 4CC7A 3KFJA 1AZGB 2KT1A 4RTZA 1PWTA 1I3ZA 1CSYA 1O4GA 2NUZA 1JQQA 5EHRA 2EOBA 1O4QA 1A81A 5GJWB 3BUWB 1NRVA 2EO3A 1TUDA 2JXBA 3NPFA 1F2FA 1LUMA 5FWCA 1RLPC 1OPLA 3M0QA 4HXJA 2J05A 1HSQA 5IHKA 2Y3AB 1X2KA 1X6BA 2CT3A 4JZ3A 1JXMA 3BUXB 5DC9A 1GCQA 3OVEA 5HKZA 2D8HA 2JS0A 5I22A 2MRKA 4E68A 3QWXX 1PRLC 1YWOA 1HCTB 1AOTF 4D8KA 1ZSGA 3PFVA 2BZXA 2RORA 2FEIA 4A4CA 2KNOA 3VS0A 1BBZA 2EYVA 2F2XA 1KFZA 3PSJA 1AYDA 1LUKA 2K2MA 3BUOB 2IIMA 3VS3A 2FPFA 1BKLA 1O4HA 2EGAA 3I35A 2M0YA 1K9AA 1S1NA 2X3WD 2DLYA 2YDLA 2OQ1A 3OB2B 3TSWA 4QSYA 3S8OA 1NG2A 4X6SA 1A1CA 1ZUKA 1X0NA 2DL7A 2KEAA 1NZVA 2CR4A 3RNJA 3VRPA 1PRMC 4JE4A 1AB2A 1MV3A 4FL3A 4FSSA 1OOTA 4ESRA 2C0IA 3JV3A 2HEQA 1G2BA 1GL5A 5IBMA 1M27C 2GE9A 3GXXA 2ECDA 2FRYA 3VRYA 1O42A 5HKYA 1AWXA 2RQWA 1PNJA 3M0RA 4Z89A 1X43A 1OPKA 1QKWA 2AKLA 2O2OA 3C0CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OB2B 4PK4A 3QHSA 4M7DE 2HKQB 1UJ0A 2GBQA 4FYVB 1VQ7A 2QK0A 2OTJQ 1R1QA 3CMET 4J6YA 1VQ6Q 4OGCA 2K79B 4A53A 2JUFA 1LPLA 1N8RC 3S8LA 2YRCA 1M1KU 2XHCA 1VQNQ 2QA4Q 4AMCA 3CC7T 3I9QA 3J80E 1NPPA 3S9KA 1M3CA 4KGXB 1FWZA 1WX6A 2YUQA 2DEUA 4LDVA 4EMGA 2L3QA 2D9TA 2GNCA 3DLMA 1UFFA 5CK9A 3CCJT 4EIHA 1AVZC 1I8FA 3RIRA 4CRIA 1VQKT 1UUSA 2AZVA 1NYGA 4AFSC 2OTLA 2DF6A 1NZ9A 1ZX6A 2JTFA 2CP2A 3CWGA 5FLXE 1X69A 2C06A 1NEBA 1WIEA 1YNZA 2FCIA 4ZN3A 4M78B 4C92A 1G8XA 3A8HB 2AUGA 3E1SA 2ZPHB 3N84A 3JRZA 1Y57A 3SWNB 5GJIA 2XDPA 2QDLA 4M78F 3V8LA 1ABOA 5BO4A 4RG2A 1JYQA 2M1HA 3HHMB 2CUBA 1A0NB 1O4RA 2XK0A 2L8DA 4N4GA 3SHWA 3GNFB 4MDXA 3G6EA 4OMLA 5GAN8 2A37A 2KK4A 2IPOB 5GAN5 1H9OA 5IHIA 3NGPA 4E47A 3I56A 4F04B 1IS0A 2DZ9A 1PSFA 5HKCA 1TCEA 2VKNA 2KGTA 3G71A 1JRIA 2EKOA 1Q81C 1OI1A 1UHFA 4E7KA 4M7AB 4PJOB 4PNOA 3UA6A 3PIOA 1RI0A 2EYQA 4D6WA 1D4WA 1K9MC 5CKHA 2CZ7B 2BIVA 1VQ9A 4M7AF 2QAZA 4GLKA 2RD1A 2EKHA 1YFNA 2A3LA 2E41A 4GPLB 1M2OA 4E7ZA 4M78G 4KH1B 5A0DA 2KMTA 4A63B 1M8MA 1B07A 2ROLA 1JWOA 4F5BA 4HT8A 3CD6A 3RERA 3ZFJA 2FYKA 5EC7A 1RLQC 4DGPA 2DXBA 2LNXA 4ELYC 1WI7A 2YU7A 3UWNA 1YHQA 4FYWB 4KGZB 3OQ5A 4C8QC 1KQ1A 3OMGA 2X4YA 3G4SQ 4BUGA 2QQBA 3CC4Q 3TSZA 4M7AG 5CQYA 4PJOD 1P13A 4GWFA 3MEAA 1UGRB 5CQXA 3REAB 1S72T 4OHEA 1M2VB 2F5TX 3O5ZA 1ZUUA 1SPKA 3CMAA 1OX8A 4KUDK 3TREA 2DIGA 1YJ9A 3I55Q 2ZPGB 4JJNK 3OYCA 2R5MA 3L2UA 3UT1A 2DK3A 3M55A 4A4KA 3OYHA 4IKFA 4M7DB 3ZL7C 1N9SA 2X35A 1LOJA 1DJ7B 3NTHA 5HCKA 3S8NA 4FT4A 2DVEA 2B86A 3T9NA 4M7DF 2JYQA 4XU0A 3L2RA 1V29B 2DL8A 2JS2A 3PNWC 4JJDA 3PJPA 5C0MA 1Y07A 4DOWA 2CUDA 2XICA 1UB4A 2VYTA 2FHDA 2O4XB 4U1PA 1HD3A 1RABB 2CZ0B 2DIQA 1M30A 4RTWA 2CH4W 2K3XA 2LCLA 4A4BA 3FLGA 1OQKA 1MMDA 3JCMV 2V1RA 2B8AA 2ROTA 4HVUA 3CCMQ 3JB9J 3VS4A 1JJ2P 1Q7YC 3GXWA 1YP5A 1UTIA 3CPWP 2Y90A 4BACA 4JJBA 3JCMb 4HCCA 2M16A 3GNGA 2DRKA 4M7DG 4XZ1A 4M7DD 1RJAA 1VQOQ 1QCOA 1VQ7Q 3LWIA 1VQ4A 1SHDA 4MZPA 4P9ZA 2R57A 3BY7A 2RQRA 1QVFS 1VIEA 4M75E 2BBUA 1IO6A 3CC2Q 4FW2A 2CYZB 1U1TA 3HRUA 2OTLT 3LX7A 1VQMT 1K73R 1NJIC 1BCMA 4KUIA 4PLLA 2EYXA 2YHTA 2RVFA 3THKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 4E93 A;  2DX1 A;  2L2P A;  3VRO A;  2CIA A;  3CD3 A;  1UJ0 A;  2GBQ A;  2O9V A;  2KRS A;  1D4T A;  1JYR A;  2GTJ A;  1GCQ C;  2A08 A;  2NWM A;  3BKB A;  2P4R A;  2K6D A;  3U23 A;  1R1Q A;  3GBQ A;  2DLP A;  3LH5 A;  1SEM A;  2EYZ A;  2MIO A;  2K79 B;  1XOV A;  1MIL A;  3S8L A;  1GBR A;  2DBK A;  2DL3 A;  4J9F A;  4RTV A;  3PLF B;  1RUW A;  3I9Q A;  2DVJ A;  1FYN A;  3BUM B;  3VS1 A;  3H41 A;  3S9K A;  3M0U A;  1M3C A;  4EIK A;  1BMB A;  1WX6 A;  2YUQ A;  4J9D A;  1PIC A;  2MRJ A;  2FPD A;  4JPB W;  3TL0 A;  1R1P A;  4FBN A;  1TZE E;  2L3Q A;  2SHP A;  1UHC A;  2GNC A;  1UFF A;  1ZUY A;  2RMO A;  1AYB A;  3IMD A;  1NM7 A;  4EIH A;  3EHR A;  1AVZ C;  1TG0 A;  2JW4 A;  2KE9 A;  1W6X A;  1FU5 A;  2XP1 A;  1T0J A;  2E5K A;  4OMP A;  1M3A A;  2ED1 A;  1M3B A;  2RF0 A;  2AZV A;  4GLM A;  1UUS A;  1NYG A;  3VS7 A;  2LCS A;  4AFS C;  4K2R A;  3PSK A;  1RQQ C;  4CC3 A;  4FL2 A;  2DF6 A;  1ZX6 A;  4OHI A;  4AFU C;  1X6G A;  2RPN A;  2HBW A;  3CWG A;  1X69 A;  2CT4 A;  2KYB A;  4IIM A;  1BHF A;  1YCS B; 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