1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
5DF6A 4OMMA 2C0OA 2EGAA 4IIOA 1ABQA 1AOTF 3CQTA 3EG3A 1JXMA 3RBBB 1IJRA 4D8DA 1CWDL 2RQUA 1I07A 2NUZA 1RUWA 1MV3A 4JJDA 2B3OA 3VS4A 2EYXA 5IXBA 1BKMA 1CSYA 3S8LA 5GJVB 3VRQA 5IH2A 1AWWA 2K6DA 2ECZA 1YVLA 3HHMB 3UA6A 1AYBA 3UF4A 3M0QA 4M4ZA 2DVJA 1AB2A 3GXXA 4Y92A 2LMJA 1X2QA 1QWEA 2ED0A 2AK5A 4HVWA 1JYUA 2CDTA 1LUNA 1M8MA 2GNCA 2KXDA 1QWFA 2QDLA 2X3XD 2O88A 2DX0A 2AOBA 4K11A 1HD3A 2CH4A 1A81A 2EL8A 2L3TA 2YSXA 1X2KA 3ZL7C 1GL5A 1NLOC 2K7AA 5I11A 1YP5A 2MRJA 2EYZA 1N5ZA 1BLJA 1D4TA 4GLMA 1A1CA 5FW9A 3M0RA 2JT4A 3OB2B 5ECAA 1WI7A 3S8NA 2DA9A 1FMKA 1BG1A 2SRCA 3H41A 2HEQA 2K3BA 3PSKA 1H92A 3THKA 1SHAA 4AFZC 2CH4W 1ZUYA 2RORA 1WDXA 4X1VA 2MOXA 3H0IA 1CKBA 1X6GA 1K0SA 1PHTA 3FJ5A 2RMXA 2CS0A 2LQNA 2P4RA 1H3HA 5AULA 1JYRA 5I6VA 1WFWA 2PNAA 2ESWA 3RNJA 1X27A 4EIKA 2GQIA 2DMOA 2RQRA 2EGEA 4OHLA 3IN8A 4J9DA 2DL7A 2KRSA 2LQWA 1KA6A 2DX1A 2HDAA 4LE9A 1KIKA 3M0PA 1AZEA 4NWGA 5CDWA 1H8KA 1O4QA 1Z3KA 4TZIA 2DRKA 2YUOA 1O41A 2H46E 2K7AB 2DL8A 1K0XA 4E6RA 1FYRA 1OO3A 1A08A 2L0AA 1O49A 1GFDA 2GTOA 4CC3A 1UTIA 4AFUC 1R1PA 3US4A 2GBQA 2LJ1A 4LUEA 1BFJA 3VRRA 4EY0A 5IBSA 3PE0A 3UA7A 4FSSA 5IXFA 4QSYA 1PRLC 2MC1A 3EACA 2DF6A 2OAWA 1QKWA 2NWMA 3BUNB 1BBZA 2O9SA 2L2PA 2A37A 4DGPA 3IMDA 1TG0A 2JTEA 3EHQA 1BLKA 1A09A 1A1EA 4HVUA 2IUHA 3OVEA 4GWFA 3MAZA 1UDLA 2J06A 2VVKA 4OMNA 5EEQA 2ENMA 1O4KA 1E6GA 1RLPC 3M0TA 1O44A 2KE9A 1B47A 2BZXA 1JQQA 2J6OA 3BUXB 3GBQA 5IHNA 1KFZA 1I0CA 1CSKA 1AWOA 2OQ1A 1D1ZA 2HMHA 1G2BA 2BTTA 3C7IA 3CBLA 3IMJA 2ABLA 4J9IA 4R0KA 3QWXX 1Y0MA 5EELA 1SHBA 1W6XA 1O4IA 2KXCA 2QMSA 4H34A 1GCQC 4J9GA 1UJYA 2AKLA 1AOJA 3M0SA 2CUBA 1M3BA 1YNZA 2G6FX 4JGHA 3NHNA 4AFQC 1SPKA 4XZ0A 2K9GA 3REAB 1SKJA 3VS5A 2EVRA 2O2OA 1U5SA 2RVFA 4RTZA 2KR3A 4J9EA 4LUDA 2CIAA 2DRMA 2SHPA 2ROTA 3CXLA 1M27C 1NG2A 2DNUA 3NGPA 1K1ZA 1ZFPE 2PLDA 1AD5A 1O46A 1X0NA 2W0ZA 5BO4A 3I5RA 4JZ3A 1O4OA 1SRMA 1PNJA 3UYOA 1NYGA 1JYQA 4P9VA 4F16A 3PJPA 2DLYA 1SPRA 2Y3AB 2JYQA 1PKSA 2D8HA 3EG2A 2DL4A 2YT6A 1FU5A 1O43A 4IIMA 1LUMA 1KSWA 2JMCA 3TSZA 4JJBA 1ZUKA 3JV3A 4QT7A 1M30A 1K4US 2RQTA 2OI3A 3I5SA 1PICA 2LNXA 2YUPA 1M3CA 3H0HA 2YDLA 1HCSB 2DLPA 4OMLA 2H5KA 1MILA 2AZVA 2YSQA 2A08A 4RUGA 2L3PA 2ETZA 1T0HA 1NYFA 2EKHA 2CT4A 1YN8A 2J6FA 4GBQA 2JS2A 1O4DA 2KGTA 1X6BA 2O31A 2V1RA 3PSJA 4NWFA 1RQQC 1SHFA 1CJ1A 1VYUA 1UE9A 4L1BB 1HCTB 1NRVA 3C0CA 1Y57A 1YCSB 2DBMA 2A36A 4JZ4A 2EO3A 1O4BA 1BF5A 3EGUA 1OO4A 1K9AA 2L3SA 4DEYA 1QKXA 4KRTA 3N7YA 4Z89A 1SRLA 1WXBA 2FPDA 1SPSA 4RTXA 3PFVA 1M3AA 2CBLA 1AYAA 5EHRA 5I22A 3EG0A 5HKWA 3S9KA 4FBNA 1OV3A 1O4RA 4DGXA 2DBKA 4U1PA 1YWOA 1O4MA 2DCRA 1SEMA 3KFVA 3HIZB 3OP0A 1VYVA 4JPBW 1SSHA 2K2MA 2SEMA 2CR4A 4A63B 4OHDA 1FHSA 2LNWA 2CUDA 3WA4A 2PZ1A 3EG1A 4JE4A 3MXYA 3TKZA 4E93A 3IQLA 1I3ZA 1NEBA 1CKAA 3EAZA 2KT1A 1X43A 3TL0A 1UHFA 2I0NA 3BUMB 1W1FA 4D8KA 1UECA 2KYMA 2CT3A 4RTUA 1ZSGA 1U06A 4OHIA 4A4BA 2EKXA 2PNIA 1XOVA 2HDVA 2KEAA 4K45A 4J9HA 1Y1UA 2IUGA 2EBPA 1UHCA 4OMPA 1AWXA 1GBRA 2B86A 1UJ0A 1SHDA 1GRIA 1GFCA 5FWBA 1AYCA 1RJAA 2ED1A 1ABOA 2EGCA 4F14A 3M0UA 3H0FA 1TZEE 2LCTA 1IS0A 1ZLMA 1V1CA 1BMBA 4ESRA 2EOBA 2FPFA 4OMOA 1T3LA 1LKLA 4RTVA 1SHGA 1QG1E 1LUIA 2OZOA 1ARKA 3A98A 1TCEA 1TUDA 2DLZA 4F17A 2DYBA 4AG2C 1A0NB 2DJQA 2L4KA 2KBTA 1VYTA 2LP5A 4ZNXA 2AZSA 4XZ1A 1PWTA 2IUIA 1T3SA 4LN2A 4AFSC 2BZ8A 3REBB 1WLPB 1O4LA 1QADA 5GJIA 1Z9ZA 2LZ6B 2EYVA 4J9FA 1A1BA 2BZYA 2YUNA 2YUQA 5DC9A 2PNBA 2AOAA 4F59A 3I35A 2XMFA 1P13A 2HDXA 2L6KA 3OB1B 1O4CA 4ORZA 5DC0B 3VS2A 3OV1A 3SHWA 3TVTA 1BKLA 2MRKA 5IHKA 2FRYA 2D1XA 4Z8AA 1BHFA 5IHIA 1E7OA 3R6NA 1R1SA 3I9QA 1O4AA 1O45A 1NZLA 2XP1A 4J9CA 1Z9QA 1D4WA 1M61A 2HBWA 2ROLA 1OPLA 1O4PA 2AKKA 1RI9A 2W10A 1QCFA 1WX6A 2RMOA 2KRNA 3LH5A 1O4JA 1G83A 1WQUA 1YVHA 2DM0A 2AUGA 4Z88A 1X6CA 3VS1A 1KJWA 3MXCA 5GJHA 5GJWB 3VRPA 2JXBA 2KT8A 1WA7A 4OHHA 4GPLB 4RTYA 1JXOA 3PS5A 3VS7A 3PLFB 1YWPA 4P9ZA 2FEIA 1MV0B 2FPEA 2RSYA 3T04A 1AOUF 1AYDA 5L23A 1MUZA 1O47A 4U17A 4F5AA 3K2MA 2D8JA 3VS0A 1B3QA 1CWEA 1OPKA 2RN8A 2JS0A 4FL2A 2V1QA 2EYYA 4DEXA 2CRHA 1NZVA 2L3QA 5IBMA 2EO6A 2E5KA 2Y1MA 2HSPA 1FYNA 4WWQA 2EU0A 3BUOB 2LCSA 4HVVA 2D0NA 1WIEA 2X3WD 1NEGA 3NPFA 1A07A 1UURA 2CSQA 2EQIA 2K79A 1WYXA 3VROA 2LNHB 2DILA 1BHHA 2YU7A 5HCKA 5HKZA 1JU5A 1UG1A 1KC2A 1NM7A 1JWOA 3CWGA 1PRMC 1BB9A 4J9BA 2J05A 4RTWA 2MCNA 2CI8A 1LCJA 4F5BA 1LKKA 1U3OA 1EFNA 2GTJA 2RF0A 3QWYA 2HUWA 3VS3A 2JM9A 2LX7A 2M51A 1ZBJA 1GCPA 2JM8A 3ULRB 3VRYA 3BKBA 2O9VA 1JU5C 3M7FA 2J6KA 4OMQA 1X69A 2CI9A 1OOTA 1XA6A 2DM1A 1AZGB 4CC7A 3GXWA 3VRZA 2FRWA 2BBUA 3S8OA 1GBQA 1B07A 3VRNA 1IO6A 2RNAA 4E68A 1E6HA 2OJ2A 1O4GA 3CD3A 1MW4A 2LJ0A 1VA7A 2CSIA 5J3XA 2F2WA 3IN7A 1I1JA 4LNPA 1O48A 2DE0X 2K79B 2RQVA 3N8MA 3VS6A 1BHHB 4CC4B 1A1AA 2LJ3A 2VKNA 4AG1C 1RPYA 4JEGA 1LCKA 4A4CA 2EW3A 1FU6A 2C0IA 2IIMA 2A28A 4OHEA 3ZNIA 4CC2A 1FBVA 1O42A 1GHUA 1AVZC 2GGRA 3PVLA 2IZVA 2C9WA 2MIOA 1UGVA 1WXUA 2F2XA 5KAZA 1S1NA 2H8HA 2EYWA 1OEBA 1UUSA 4K2RA 1HSQA 1H9OA 1ZX6A 4EIHA 3HCKA 1J3TA 1T0JA 1FBZA 1BU1A 3PVQA 2JW4A 2DL5A 1AEYA 1CSZA 5EC7A 3SEMA 4GL9E 2RPNA 1W70A 1O4EA 2MK2A 1RLQC 4FL3A 3U23A 3GQIB 1K76A 5AXIA 1TUCA 4HCKA 3UATA 2PLEA 5EHPA 4JJCA 1GCQA 3BUWB 5D0JA 3VGOA 1AWJA 4X6SA 1WXTA 3NMZC 1LUKA 2J7IA 3KFJA 1O4FA 1F2FA 1QLYA 1F1WA 1KA7A 2RQWA 3N84A 2CREA 2KROA 3EHRA 1JEGA 2KRMA 1UFFA 2JMAA 4HXJA 2GSBA 1BFIA 2EPDA 3TSWA 4K44A 2HCKA 2KK6A 2MQIA 4RTTA 2VWFA 5HKYA 1R1QA 2Y1NA 1NLPC 1M27A 2C0TA 5EG3B 2DL3A 2KYBA 1O4NA 1UUEA 2FCIA 4ROJA 1BM2A 2KNOA 5DC4A 2FG0A 3PQZA 2F2VA 2M0YA 4WCIA 2GE9A 3O5ZA 2FO0A 2ECDA 4H1OA 1O4HA 2VIFA 1BK2A 2KNBB 1HJDA 1ZUUA 5FWCA 1PKTA 1JO8A 2PTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E4HA 3CC4Q 3EG3A 1JXMA 3OMGA 1CWDL 2NUZA 1RUWA 2B3OA 5IXBA 1CSYA 1Q82R 3HRSA 2ECZA 1PD0A 4F04B 1IREB 1WQWA 3QO3A 2FHDA 3M0QA 1YHQQ 1RAHB 2QQBA 1WNLA 2NUTA 1X2QA 2QQRA 2DETA 1D0YA 1M8MA 2GNCA 5IN1A 1QWFA 2O88A 2DX0A 2AOBA 4NL2A 5I21A 3CC4T 4PFZA 1QQJA 5KYWA 4FCYA 1NJIR 1NLOC 2K7AA 3FC3A 1OULA 2EYZA 4HKEA 1D4TA 1MMGA 3OB2B 5GAN3 4RG8A 5ECAA 1WI7A 5AYFA 2DA9A 2SRCA 3X25B 2K3BA 4AFZC 1CKBA 1V29B 3FJ5A 4XU0A 2RMXA 3LX7A 2LQNA 1H3HA 2EQUA 3OYHA 2PNAA 4PLLA 2NUTB 2QA4Q 4OHLA 1TXQA 4PK4A 2ZPFB 3RESA 3M0PA 2RK2A 5KYWB 2AHJB 2LRAA 1M1KU 2DRKA 2K7AB 1OO3A 2L0AA 3X24B 1O49A 2GTOA 4CC3A 3CCEA 1WPYA 4DOWA 3PE0A 1RACB 5LJ5h 4FL6A 2RJCA 2O9SA 4E7IA 1Q7YC 1TG0A 3CC2A 1A1EA 4Y28E 4GWFA 3G6EA 1H3ZA 2J06A 3CCRA 5EEQA 2KAFA 3GPLA 1O44A 2KE9A 5J26A 1M1KC 1VIEA 2J6OA 2P84A 5CVIA 3KXTA 1I0CA 4E7JA 1D1ZA 2HMHA 2E64A 3CBLA 4BDZA 3URGA 1W6XA 1N27A 2C06A 3NTIA 2QMSA 3JCMP 3CC7Q 2CP7A 4JGHA 1JJ2A 2LQKA 3REAB 3QYHB 4KGZB 3VS5A 4FM4B 2JOYA 2EVRA 2O2OA 1RAFB 2MK5A 2KR3A 4LUDA 2DRMA 5GMKi 2SHPA 3DLMA 1IGUA 3BY7A 1K1ZA 3L2WA 1O46A 5KE2A 4O5VA 1JYQA 4IUPA 5I2SA 1PKSA 2D8HA 3EG2A 1O43A 4IIMA 4JJBA 4HT9A 1ZUKA 3JV3A 4J6XA 1K4US 2RQTA 1B34A 2HMAA 4M7AF 2RHXA 3H0HA 2YDLA 2A0FB 2AZVA 2OTJA 1VQ5A 9ATCB 2RHZA 2EAYA 2JS2A 4DOVA 3M58A 1S72Q 3OS1A 3CCMA 3ZBDA 2HKQB 1CJ1A 3C4SA 4L1BB 1VQ7Q 2DBMA 2EO3A 3A8MB 2K57A 1OO4A 1OU8A 1ZA1B 2EQJA 1K9AA 2CP0A 2M02A 1VQLT 3EG9A 1W4SA 1C1AA 1WXBA 4RTXA 5LL6S 3V7SA 5GAN5 5I22A 4VUBA 4EMGA 1OV3A 1B34B 2PVGB 4L6V5 4LDUA 2DBKA 3LH0A 2DCRA 3D7SB 1LOJA 3RKXA 3OP0A 1VYVA 2ZPEB 4JPBW 3WA4A 4E7SA 3EG1A 4M7AC 1VQPQ 1N8RU 5DLQE 3CCQQ 4E93A 3IQLA 3J81E 3CCJQ 1X75C 5D7UA 1I3ZA 3OSVA 3BUMB 1W1FA 4D8KA 2KYMA 2YRDA 1ZSGA 1U06A 4L5GA 3DB4A 2PNIA 2A3LA 4KBMB 2KEAA 4K45A 1Y1UA 2CZ6B 1QVFP 3JCMQ 2EBPA 3EG9B 3INZA 5GAN4 3OY9A 2K5FA 4FYXB 4OMPA 3QDRB 3JB9F 3EAEA 1IGQA 3NTKA 4HA8A 1ABOA 2RI3A 3CCQT 3HPWA 1EZZB 3NTHA 2QQ9A 2EOBA 1ZLMA 1BMBA 1VQ7A 1N8RC 3EH1A 5D6YA 4RTVA 1SHGA 1LUIA 2OZOA 3A98A 4QKUA 2DYBA 3O8VA 1VYTA 3E1SA 1PWTA 3CXCP 4LN2A 2NUPA 4AFSC 3CMET 1FX7A 1Z9ZA 4F59A 2XMFA 1K8AU 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5DF6 A;  4OMM A;  2C0O A;  2EGA A;  4IIO A;  1ABQ A;  1AOT F;  3CQT A;  3EG3 A;  1JXM A;  3RBB B;  1IJR A;  4D8D A;  1CWD L;  2RQU A;  1I07 A;  2NUZ A;  1RUW A;  1MV3 A;  4JJD A;  2B3O A;  3VS4 A;  2EYX A;  5IXB A;  1BKM A;  1CSY A;  3S8L A;  5GJV B;  3VRQ A;  5IH2 A;  1AWW A;  2K6D A;  2ECZ A;  1YVL A;  3HHM B;  3UA6 A;  1AYB A;  3UF4 A;  3M0Q A;  4M4Z A;  2DVJ A;  1AB2 A;  3GXX A;  4Y92 A;  2LMJ A;  1X2Q A;  1QWE A;  2ED0 A;  2AK5 A;  4HVW A;  1JYU A;  2CDT A;  1LUN A;  1M8M A;  2GNC A;  2KXD A;  1QWF A;  2QDL A;  2X3X D;  2O88 A;  2DX0 A;  2AOB A;  4K11 A;  1HD3 A;  2CH4 A;  1A81 A;  2EL8 A;  2L3T A;  2YSX A;  1X2K A;  3ZL7 C;  1GL5 A;  1NLO C;  2K7A A;  5I11 A;  1YP5 A;  2MRJ A;  2EYZ A;  1N5Z A;  1BLJ A;  1D4T A;  4GLM A;  1A1C A;  5FW9 A;  3M0R A;  2JT4 A;  3OB2 B;  5ECA A;  1WI7 A;  3S8N A;  2DA9 A;  1FMK A;  1BG1 A;  2SRC A;  3H41 A;  2HEQ A;  2K3B A;  3PSK A;  1H92 A;  3THK A;  1SHA A;  4AFZ C;  2CH4 W;  1ZUY A;  2ROR A;  1WDX A;  4X1V A;  2MOX A;  3H0I A;  1CKB A;  1X6G A;  1K0S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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