1G83A

Crystal structure of fyn sh3-sh2
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
b'TLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSEGDWWEARSLTTGETGYIPSNYVAPVDSIQAEEWYFGKLGRKDAERQLLSFGNPRGTFLIRESETTKGAYSLSIRDWDDMKGDHVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFETLQQLVQHYSERAAGLSSRLVVP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The role of the Src homology 3-Src homology 2 interface in the regulation of Src kinases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTO-ONCOGENE TYROSINE-PROTEIN KINASE FYN
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2000-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00018 SH3_1 SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.30.40 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 Domains 1g83A01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 1g83A02
1AB2A 1VYTA 1JQQA 1YCSB 1T0JA 2GTJA 1WYXA 4JPBW 1A81A 3I5SA 2YUOA 3SEMA 2DLPA 2FPFA 1O43A 3PJPA 3M0RA 3S8OA 2KRMA 2CS0A 2GBQA 1JXMA 1ZUUA 5GJIA 3RNJA 1UE9A 1W6XA 2K9GA 4J9FA 1QKWA 1X0NA 1M30A 1H92A 1Z9QA 1O4LA 2DL5A 1X6GA 1OEBA 3KFVA 2DA9A 1MW4A 2HCKA 2L3QA 1SHGA 2A37A 3CQTA 4GLMA 1NEGA 4F16A 2LCTA 3BUMB 2V1QA 3VS7A 2FRWA 4ORZA 1O4DA 2RMOA 1CWDL 1O4BA 2LX7A 1KC2A 2J7IA 1I3ZA 2PLEA 1KFZA 1U06A 1TZEE 2VIFA 1K1ZA 2EQIA 1D1ZA 4QSYA 2LZ6B 4QT7A 2J6KA 1A1BA 1F2FA 1JEGA 2EGEA 1YWPA 2LNWA 4GWFA 2KE9A 1CWEA 2K2MA 2L3PA 2P4RA 2MCNA 2GQIA 4J9CA 5IHKA 1NLOC 3VGOA 1NYGA 4EIHA 1GL5A 4JJDA 1LUKA 2MRJA 2RQTA 1PNJA 1VA7A 5AULA 4J9IA 1IJRA 3OB1B 1TCEA 2FG0A 1CKBA 2CR4A 1ZX6A 1BLKA 5I6VA 1R1SA 1O4GA 2JW4A 2QMSA 1AWXA 2V1RA 1CSYA 2Y3AB 3US4A 1OPLA 1O4OA 1MILA 1WXTA 4OMPA 2RQRA 2X3XD 2AZVA 1HCSB 2ECDA 4OHEA 2H46E 2K6DA 4RTXA 1X43A 3HCKA 4F59A 2GNCA 2YU7A 4IIOA 1AVZC 1N5ZA 4AG1C 2H5KA 4WWQA 2LJ3A 1TUCA 1AWJA 1PRMC 2C9WA 2DL8A 2EGCA 2EKHA 1OV3A 3BUXB 3VS2A 2OJ2A 1AYDA 1O4AA 2KYMA 5J3XA 5BO4A 4F5BA 1E7OA 4K11A 1K0SA 1O49A 1FYNA 1M8MA 3M0TA 1JU5A 2EO6A 1T0HA 2G6FX 1H3HA 2XP1A 3IMDA 2M51A 4H1OA 3C0CA 1SKJA 2ESWA 2IUHA 1SHFA 4RTUA 3HHMB 1B47A 2Y1MA 5IBMA 3I9QA 2DM0A 2ROLA 5IXBA 2FPDA 3A98A 1KA6A 1SRMA 3KFJA 4NWFA 2A08A 1A07A 1FMKA 1HJDA 2SEMA 3PSJA 2HEQA 2YSQA 2J05A 2LQWA 2A36A 2M0YA 2GSBA 2L6KA 2DBMA 1NZLA 3BKBA 4M4ZA 5FWBA 2HMHA 1HSQA 1S1NA 3VS1A 3OV1A 2CH4W 1RUWA 1X2QA 1JWOA 4P9VA 1UG1A 1UJYA 4JJBA 1O4NA 3H0FA 1X2KA 3IQLA 1KJWA 3N7YA 4RTVA 5EHPA 2DYBA 1FYRA 4K2RA 3TKZA 3M0UA 2AOBA 4CC2A 2RN8A 3EGUA 2Y1NA 1SEMA 3FJ5A 2FCIA 1NYFA 2KBTA 4CC7A 4GPLB 2MC1A 1O4RA 2ENMA 1CKAA 2YUQA 3H0IA 1O4QA 2CDTA 2RQUA 1AYBA 1BB9A 2C0TA 1GRIA 4FSSA 2VKNA 3EG2A 1M3BA 4RTYA 1W70A 1SHBA 2NUZA 1ZLMA 1JXOA 1R1PA 3PSKA 3REAB 3VS6A 2EYWA 5L23A 3MAZA 2KT8A 3EHQA 4J9EA 1FU6A 1ZBJA 1Y0MA 2HSPA 4F14A 1M27A 2RMXA 2KEAA 1JYRA 3EACA 1NEBA 1RI9A 2J6OA 3NMZC 1IS0A 1UECA 2X3WD 4A63B 2QDLA 1GCPA 5I22A 2LMJA 2HDXA 2MK2A 2O2OA 3QWYA 3N84A 4FL2A 1LUNA 1BF5A 2DF6A 1K0XA 4EY0A 2AK5A 4J9HA 1ZFPE 2LJ1A 1AOJA 2RPNA 3PS5A 5IBSA 1UTIA 4JJCA 4LE9A 1XOVA 1ARKA 2K7AA 1QADA 4L1BB 4HVVA 2JMCA 4AFUC 4GBQA 4K44A 3EG3A 3NPFA 1PICA 1ZUYA 1QWEA 2PNBA 3EAZA 1UHCA 1O48A 1BBZA 1A1EA 2DJQA 2EBPA 2JYQA 2CSQA 5D0JA 4OHIA 2B3OA 2OZOA 1UGVA 2HDVA 1IO6A 1ZUKA 1BHHB 5GJVB 4RTZA 2IUGA 1UJ0A 3OP0A 3OB2B 2KYBA 2AZSA 1E6GA 1OPKA 2YT6A 1JU5C 1J3TA 1WI7A 3WA4A 2CBLA 2DX0A 3T04A 3UA7A 1O4KA 3ZNIA 2O88A 3IN7A 2VWFA 2MRKA 4U17A 1OO4A 1WA7A 5IH2A 1G2BA 2D8HA 1ABQA 1R1QA 4U1PA 1ABOA 1PHTA 2RF0A 4DEYA 1RJAA 1X6BA 1AWOA 2JMAA 2EL8A 1MV0B 1I0CA 4DEXA 4EIKA 3BUWB 2J06A 1A08A 1LCKA 4HVUA 3VRQA 5GJWB 3M0SA 1NM7A 1HD3A 1UFFA 1GFCA 2BTTA 4OMLA 5EHRA 2PLDA 3UF4A 5DF6A 1H8KA 1BK2A 2CREA 3M7FA 2AUGA 2EYXA 2FEIA 2EW3A 3S8NA 3CD3A 1PWTA 2LP5A 2CI8A 3BUNB 3K2MA 1Z3KA 4Z8AA 1BG1A 2HUWA 2LNXA 4JE4A 4HXJA 1K9AA 1K4US 1SPRA 3IN8A 2CT3A 3CWGA 2MIOA 4IIMA 2LCSA 2CUBA 2EO3A 1BU1A 2RORA 5IXFA 2DLYA 2EGAA 5HKZA 1WLPB 4LUDA 2KNBB 1QKXA 1W1FA 4F5AA 1AYCA 4J9BA 1LKLA 1O47A 3ZL7C 1RPYA 1BMBA 2SRCA 1SHAA 4OMOA 2FO0A 2DX1A 2PTKA 1O45A 2SHPA 1WDXA 4E68A 4K45A 1AZEA 2HDAA 2KR3A 1FBZA 2YSXA 4JZ3A 1MUZA 2EVRA 1M27C 4LUEA 3I5RA 2L4KA 2BZ8A 3SHWA 1EFNA 3TSZA 1GCQA 4X6SA 2C0OA 1AEYA 3RBBB 4Z89A 3N8MA 4OMQA 3C7IA 1YVHA 2BZXA 3BUOB 2LQNA 2LNHB 2NWMA 1AOUF 1TG0A 2CH4A 4ROJA 3H0HA 1T3SA 4Z88A 2OAWA 3LH5A 1X69A 4NWGA 3VS0A 2F2XA 1A0NB 3REBB 4J9DA 2K3BA 1JYUA 1BM2A 1F1WA 3NHNA 3GXXA 4FBNA 3QWXX 1YP5A 2DMOA 2GTOA 3VS4A 1LUIA 1O4CA 2PNAA 2F2WA 2ROTA 4CC3A 4E6RA 1V1CA 3H41A 1O44A 1NLPC 2XMFA 1UUSA 5EELA 2DILA 5DC0B 2HBWA 1U3OA 4P9ZA 4OMNA 2DVJA 2BBUA 4J9GA 3GXWA 5HCKA 1GHUA 2RVFA 4HCKA 2EPDA 4A4BA 2CUDA 1D4WA 1FBVA 3TSWA 1GBRA 3VRZA 4R0KA 1CSKA 4AFQC 1WQUA 1LUMA 2KRNA 3UATA 2JM9A 4H34A 2DL4A 1QG1E 5KAZA 2YUNA 2JS2A 1SPSA 5HKYA 2GE9A 2J6FA 1LCJA 2L3TA 1BFIA 1B07A 2MOXA 1A1CA 2DLZA 4TZIA 3VS3A 1NG2A 2ECZA 2JXBA 1AWWA 4E93A 2ED0A 1YVLA 2O9SA 2DL3A 2KT1A 2E5KA 2KXCA 3S8LA 1WX6A 3CXLA 2CRHA 2IIMA 1M3AA 3VRRA 1O4EA 1Z9ZA 4JEGA 2DL7A 3PLFB 1PRLC 4A4CA 1X27A 2B86A 3MXCA 2ETZA 5IHNA 3EHRA 1JO8A 1O4FA 2RQVA 4WCIA 2L2PA 1BKLA 4LN2A 3PFVA 2EU0A 4RUGA 2K79B 2I0NA 2C0IA 3MXYA 2PNIA 1UHFA 2KNOA 2DRMA 4FL3A 1O4JA 1YWOA 2L3SA 5IHIA 1T3LA 3PE0A 3TVTA 3PVLA 1VYUA 1O4MA 1I1JA 4OHLA 2JTEA 3EG0A 2DRKA 4JGHA 3VRNA 1O4IA 4ZNXA 1O4HA 2CIAA 1O46A 3UA6A 5CDWA 4OMMA 1M3CA 2YDLA 2KRSA 1O41A 2EOBA 2AKKA 2O9VA 3EG1A 3R6NA 4Y92A 1E6HA 3S9KA 1BLJA 4KRTA 3U23A 2W0ZA 1O42A 1GBQA 1GCQC 2OI3A 1P13A 4JZ4A 5I11A 1RQQC 1MV3A 2D8JA 1KSWA 1WXBA 1OO3A 3PQZA 4RTWA 1M61A 2MQIA 5FWCA 2AOAA 4X1VA 1VYVA 4OHHA 1QWFA 2DE0X 2K7AB 2D1XA 2BZYA 2KROA 1SPKA 1QCFA 1U5SA 2L0AA 1FU5A 2D0NA 3VS5A 3IMJA 2JS0A 1SSHA 2CI9A 1SRLA 1BKMA 3VRYA 1RLPC 1H9OA 2AKLA 2EYYA 1CJ1A 1NZVA 1X6CA 2ED1A 1QLYA 4CC4B 1AD5A 4LNPA 2W10A 2H8HA 3HIZB 4D8KA 1HCTB 1JYQA 1WFWA 2PZ1A 2CSIA 2EYVA 2YUPA 1G83A 2KGTA 2JT4A 5AXIA 4DGXA 2A28A 5HKWA 1UDLA 1Y1UA 1D4TA 5EEQA 3CBLA 1B3QA 1CSZA 1OOTA 2KK6A 4DGPA 2KXDA 2VVKA 1YNZA 3M0QA 5DC9A 1GFDA 4OHDA 1FHSA 2FRYA 4D8DA 5EG3B 1A09A 2DNUA 2LJ0A 2O31A 1WIEA 3JV3A 3TL0A 3UYOA 2JM8A 3O5ZA 5EC7A 4AFSC 1PKSA 1Y57A 2DBKA 2EKXA 2OQ1A 1TUDA 2FPEA 2ABLA 1WXUA 5DC4A 3PVQA 1UURA 1AYAA 4HVWA 3OVEA 1BHHA 1AZGB 3NGPA 1RLQC 3GQIB 2IZVA 2GGRA 5FW9A 1ZSGA 1BFJA 2DM1A 1XA6A 1LKKA 3VROA 4F17A 4GL9E 2F2VA 1K76A 2K79A 5GJHA 2RNAA 2RQWA 4ESRA 1AOTF 4RTTA 3THKA 2RSYA 3M0PA 2DCRA 2EYZA 1SHDA 1NRVA 5ECAA 1UUEA 1PKTA 3ULRB 3VRPA 2CT4A 1KIKA 3I35A 1A1AA 1O4PA 1I07A 1KA7A 4XZ1A 4XZ0A 4AG2C 1YN8A 1BHFA 4AFZC 3GBQA 2IUIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3INZA 1HXDA 2GTJA 5KYYB 3PJPA 2FPFA 3X25B 3CCVT 2KRMA 1U1SA 1ZUUA 2DIQA 1W6XA 2K9GA 3GNGA 2QXFA 1Z9QA 5LJ5h 1O4LA 2DL5A 4HA8A 3OBWA 4E7KA 3KFVA 2DZCA 4A4EA 2A37A 2JJ9A 3CQTA 4GLMA 4KUIA 2V1QA 3VS7A 2FRWA 4J8OA 3CC4A 1O4BA 4QQ6A 2MK5A 2J7IA 3AT1B 1U06A 2LX9A 1K1ZA 3OQ5A 1D1ZA 1FMVA 2J6KA 3EFOA 4QT7A 1VQPA 1X01A 2EGEA 1YWPA 2LNWA 1FMWA 2K2MA 1CWEA 4F7UG 1NLOC 3QYHB 3RIRA 4EIHA 4JJDA 5KYUA 2MRJA 3E19A 1PNJA 1VA7A 2K4YA 2QI2A 2EJGA 5AULA 4J9IA 4FYYB 1IJRA 1UGPB 2OTLT 1R1SA 1O4GA 1WHKA 3CCLT 3RKYA 4M7DC 2KY9A 3US4A 2MWPA 1UEBA 1WXTA 5GAOn 3EG9A 2ECDA 3JCMf 2K6DA 2HSEB 5GANd 1AVZC 1N5ZA 1TUCA 3P8BB 2KMTA 5D6WA 4FYWB 3OW2P 4PKCC 1OV3A 1KC8R 5J3XA 5BO4A 1E7OA 4XU1A 3OSSC 2DTIA 1M8MA 2D0QB 1T0HA 3GLXA 2M51A 2GQVA 4ZTFA 1OZ2A 4A4HA 1KQSS 1B34B 5LJ5g 3OSVA 4XQ3A 2DM0A 3M53A 3A98A 4XTVA 1KA6A 2L5QA 4M78E 2R5MA 4B9XA 4NWFA 1YJ9A 2A08A 1HJDA 5KYYA 2GSBA 2M1HA 4BI8B 1M90U 1YITQ 5FWBA 1VQKA 1HK9A 3G4ST 4M75B 3TU4K 5GMKe 1RAFB 2YLBA 4LDYA 5GMKl 3JCMW 1JWOA 5I21A 4P9VA 1IGQA 5GAN3 4KH1B 3IQLA 1KJWA 4RTVA 4E7JA 1YJWT 5EHPA 3TKZA 3OYAA 3CC2Q 4CC2A 3GP8A 3SDZA 2XU8A 2VV5A 1Q82U 2YRDA 1R8OB 4LDVA 1VQ6Q 3FJ5A 4L6V5 5GMKm 1NYFA 2QQ9A 2BIVA 4GPLB 3LX7A 1CKAA 3M58A 2HD0A 2RQUA 1AYBA 4ME7A 3QBYA 2VKNA 1W70A 2DZ9A 3HFNA 1R1PA 4C5IA 3VS6A 2E6ZA 2QQBA 5L23A 1BFIA 3EHQA 1FU6A 1M27A 1K9MC 2RMXA 3EACA 1KQ2A 1RI9A 3NMZC 2X3WD 2ZPEB 5KYXA 2HDXA 1GCPA 3NTHA 1LUNA 4BY6B 1K0XA 4EY0A 4CRIA 4MMLA 4J9HA 1BI2A 2RPNA 5IBSA 5GMKh 3LLRA 3JB9G 1QADA 5C0MA 3EG3A 4PJOG 3CCEA 4JS4A 3G71A 3GIBA 1VQ6T 1UHCA 1BBZA 5GANf 4X9DA 2JYQA 2B3OA 1UGVA 2HDVA 4B9WA 2L3RA 3RMSA 4J5YA 3OP0A 2AZSA 2KYBA 1OPKA 4PNOA 1JU5C 1J3TA 2RJCA 3VYGA 1Q86U 3IN7A 1OO4A 2D6FA 1R1QA 1G2BA 1YJNQ 3DB3A 1VOMA 3I55T 5LJ3d 1X75C 2RF0A 1OX8A 2H3JA 2ZPIB 2EL8A 2LQ8A 1MV0B 3TEEA 1ZSZC 4M75A 1LCKA 3CCUQ 4HVUA 4BACA 2KGYA 3C95A 4MMKA 3CCMA 4OMFB 1FXXA 2LT1A 4M78C 1H8KA 1N9SA 2CREA 3RR6A 1M8VA 2VUBA 5GAOq 3CD3A 1LPLA 1PWTA 3G4SA 1C1AA 5GAN2 3BUNB 1Z3KA 1N8RU 4Z8AA 2R57A 4JE4A 1TS9A 1K4US 1SPRA 1R77A 3CCJQ 2CUBA 3L2WA 1BU1A 2RD1A 2EO3A 5IXFA 5KH6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1AB2 A;  1VYT A;  1JQQ A;  1YCS B;  1T0J A;  2GTJ A;  1WYX A;  4JPB W;  1A81 A;  3I5S A;  2YUO A;  3SEM A;  2DLP A;  2FPF A;  1O43 A;  3PJP A;  3M0R A;  3S8O A;  2KRM A;  2CS0 A;  2GBQ A;  1JXM A;  1ZUU A;  5GJI A;  3RNJ A;  1UE9 A;  1W6X A;  2K9G A;  4J9F A;  1QKW A;  1X0N A;  1M30 A;  1H92 A;  1Z9Q A;  1O4L A;  2DL5 A;  1X6G A;  1OEB A;  3KFV A;  2DA9 A;  1MW4 A;  2HCK A;  2L3Q A;  1SHG A;  2A37 A;  3CQT A;  4GLM A;  1NEG A;  4F16 A;  2LCT A;  3BUM B;  2V1Q A;  3VS7 A;  2FRW A;  4ORZ A;  1O4D A;  2RMO A;  1CWD L;  1O4B A;  2LX7 A;  1KC2 A;  2J7I A;  1I3Z A;  2PLE A;  1KFZ A;  1U06 A;  1TZE E;  2VIF A;  1K1Z A;  2EQI A;  1D1Z A;  4QSY A;  2LZ6 B;  4QT7 A;  2J6K A;  1A1B A;  1F2F A;  1JEG A;  2EGE A;  1YWP A;  2LNW A;  4GWF A;  2KE9 A;  1CWE A;  2K2M A;  2L3P A;  2P4R A;  2MCN A;  2GQI A;  4J9C A;  5IHK A;  1NLO C;  3VGO A;  1NYG A;  4EIH A;  1GL5 A;  4JJD A;  1LUK A;  2MRJ A;  2RQT A;  1PNJ A;  1VA7 A;  5AUL A;  4J9I A;  1IJR A;  3OB1 B;  1TCE A;  2FG0 A;  1CKB A;  2CR4 A;  1ZX6 A;  1BLK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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