1G99A

An ancient enzyme: acetate kinase from methanosarcina thermophila
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
398
structure length
398
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACETATE KINASE
publication title Urkinase: structure of acetate kinase, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
molecule tags Transferase
total genus 139
structure length 398
sequence length 398
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A02
2P9LB 3MK6A 2CGJA 2D0OA 3GOIA 5BRHA 2P9SB 5KPRA 3A5OC 1GLBG 4ISGA 1TYQA 1E4FT 3WQTA 1BA0A 2V52B 3H3OB 3ENHA 3U9ZA 3ZX2A 5JMVA 5EXWA 2YCHA 3MN7A 3VF4A 4BC2A 4BREA 4B1UB 4M63C 2P9UA 3C0BA 1X9JA 4BRIA 3ZX0A 2QXLA 1T6DA 2Q0RA 3GE1A 3SJHA 2E2OA 3A0IX 2Q1NA 2QWOA 3CJ7A 3M6GA 2GTDA 2Q31A 1S22A 3ENOA 3EN9A 1KAXA 5KQDA 5EY4A 3A8YA 5FPEA 2E8AA 1BO5O 3SMSA 4CZJA 3VESA 3EO3A 1HJOA 4B1VA 3L0QA 4EAHD 4CZMA 1JCEA 4CBUA 1YXQA 3C7NB 4H0TB 5AR0A 3A5MC 4H0YB 4CZIA 2IIRA 4B9QA 2A41A 5BPMA 4CJ7A 2QM1A 2P9PB 4BRCA 2P9PA 4PKGA 1MDUB 3WT0A 3HSCA 3AAPA 1IJJA 1QZ6A 4FWPA 4FOIA 1NGBA 3CJCA 1DGKN 3DAWA 1JCGA 2YJEA 3O08A 4MO5A 5AQKA 2J4RA 3CQXA 1NGCA 1MA9B 2F9WA 4O5FA 2W41A 4H5NA 1ATNA 3WQUA 3VEOA 5AQUA 1SZ2A 2FSNA 2IVOA 3HM8A 3LM9A 3VEVA 4A2AA 4BR0A 4B1ZA 1HPMA 3DWLA 5FPMA 5FPDA 2FSJA 1XUPO 1LOTB 1SQKA 3L4IA 4MLEA 3R6MA 5AQYA 2QWNA 4CZEA 4FPAA 3ID8A 1U6ZA 4CZFA 1GLJO 3MN5A 3ZX3A 4JHDB 5E84A 3R8EA 1KXPA 1Y64A 4FL9A 1NLVA 3FZMA 1T6CA 2ITMA 4CD1A 4YDUA 3ATUA 1XC3A 4EIAA 2NLXA 2GUPA 4CZLA 5AQRA 3VEWA 2GELA 3CQYA 2I7PA 3QDKA 3QICA 1NGFA 4JD2B 1NGJA 4JD2A 1GLEG 3GDQA 2BUPA 5F2RA 5AQGA 5FPNA 2PAVA 4Z94A 4K41A 3ULEA 4BQLA 2AP1A 3H46O 4PKIA 2CGKA 2P9KB 5AZJA 3O4WA 2VYPA 2GWKA 3WXIA 4BRLA 2GEMA 2NRHA 2W40A 5I9EB 3MN6A 3I33A 4K43A 3FZHA 1U2VA 3KHYA 5BPNA 2PBDA 3KVGA 3DXMB 3DXMA 4CD3A 3QMLA 3ZEUB 3UKUA 3ZEUA 2V7YA 1V4TA 3KZBA 3H1QA 5AQHA 3RSEB 5E26A 4BR7A 2V7ZA 2YHXA 5LY3A 5BRFA 1HKGA 3EKSA 4A61A 4BR2A 4H5TA 2QWQA 3CETA 2QWPA 2WUSA 3BEXA 1EQYA 2IVPA 1TYQB 3IUCA 4BG9A 4L3QA 2VWBA 2V51B 2E2PA 4BR5A 5AQXA 4YDUC 3FZFA 3QBXA 2FXUA 4EHUA 3A5NC 2P9UB 3LDLA 5AQMA 3SMPA 4DB3A 4F9OA 5AQSA 4HWIA 4BRNA 1J6ZA 4DQ8A 3LDQA 1WOQA 1X3NA 4NO7A 3VPZA 2D1KA 4LC9B 5TKYA 2Q97A 1ZXOA 3HZ6A 4M7YA 1MWKA 4FWLA 4M7XA 5KQ8A 3LDNA 3LDOA 3EKUA 3VGMA 1WUAA 3O8MA 4H0OA 2E1ZA 1GLAG 1NGDA 5AQLA 3DJCA 5AZIA 5BN9A 3I8BA 3BF3A 5ADXA 1BU6O 1BDGA 3BUZB 4CBWA 1V4SA 1BA1A 1QZ5A 4XEIA 5EVZA 4BRGA 1RFQA 3FLCO 4IO8A 2A40A 3SK3A 3M3ZA 4QS7A 4CBXA 4XH5A 3VEZA 3VETA 2YJFA 3AY9A 1TUYA 3MCPA 4I6MA 4J8FA 1HUXA 4JN4A 1Z05A 2YI1A 4FWNA 3FZLA 3AAQA 5EX5A 3OHRA 3JS6A 3VEYA 2D4WA 4AM7A 2ZF5O 2ASPA 1LCUA 3UB5A 2AA4A 3TU5A 4PL8A 1OKJA 2Q0UA 4QS9A 3LL3A 4FWQA 4DCHA 2FSKA 1KAYA 4BRHA 1DKGD 3D2EA 2QWRA 4CZGA 4CZHA 1BOTO 4B1WB 5AQPA 2BTFA 3VF2A 3IFRA 4RWTA 4A2BA 3U8XA 4KBOA 4IWVA 4PKHA 4PL7A 5KPZA 3WXJA 2E88A 4B1YB 3CI5A 3LM2A 2E2NA 4H0VB 1NM1A 4BRMA 3L6QA 5AFUA 2CH5A 3SLCA 4BRQA 1ATRA 2HF4A 3LDPA 1E4GT 3DXKB 4FWRA 3DXKA 4NB4A 4Y0WA 3ULEB 4FPBA 2EWSA 2NZTA 4IJAA 5AZJB 3VERA 1JCFA 2HF3A 4H0PA 1NBWA 4IJNA 2E20A 4WQ5A 1MWMA 3BF1A 3M1FA 1SAZA 3VEXA 3QFPA 4ISEA 2A5XA 4K25A 1U2VB 2QW9A 5AQZA 3FE1A 4BRDA 3CJAA 3P4IA 5BRDA 2E2QA 4FOEA 5ADXH 3UKUB 1RGIA 4B1XB 2P9NB 4AM6A 2P9NA 1ATSA 2DPNA 2FF3B 1QQOA 3O6WA 3O1WA 4H5RA 4C23A 2A6AA 3MMVA 4FWMA 3S41A 3F9MA 1YUWA 3FFKB 1D4XA 4BGAA 4BRAA 4XH4A 4BC3A 5AQIA 3AARA 1P8ZA 3IDHA 4HTLA 1HX1A 1T44A 5JLFA 1TUUA 4BC4A 3CERA 5AQQA 5LJWA 3VOVA 1C0GA 5AQWA 2P9IA 3UKRA 4E1JA 3MDQA 3EZWA 5AQJA 4BR9A 4IXCA 5EOYA 3CJ1A 3CHWA 2P9LA 2P9SA 3CJBA 4O8KA 4A62A 4BVOA 3HI0A 5ELZA 3CJ9A 3H3NO 5F1XA 4WQ5C 3FZKA 5AZIB 4BG8A 3A5LC 4BR4A 3H6EA 4IZ9A 4CI6A 5LJVA 3BP8A 3B8AX 3J8AA 2H3GX 4EFHA 4WYBA 2YHYA 3QBWA 3GL1A 2CH6A 1GLFO 1DEJA 2GWJA 1QQNA 2HOEA 4I6MB 3VGLA 5AFUH 2A3ZA 4FO0A 4BRPA 3UE5A 4K42A 1BUPA 2F9TA 4H5WA 4RCHA 1ZC6A 1RDWX 1QQMA 3TPQA 3O80A 4BGBA 3U4LA 4FWKA 1NMDA 5BR9A 1ESVA 3VF6A 1HLUA 1GLDG 3C7NA 3MN9A 1K8KB 1K8KA 2FF6A 5AQVA 2E1YA 1CZAN 4BQZA 1YAGA 1XQSC 1NGEA 1G99A 1R59O 4MLHA 1HKCA 4MO4A 2UYTA 2ZWHA 2VCPA 2YHWA 3HTVA 3D2EB 1YVNA 3HBTA 3GG4A 5AQFA 4BROA 2QWMA 2KHOA 4H03B 2FLOA 1NGAA 3WXLA 1H1VA 1BG3A 1QHAA 2I7NA 2HMPA 5AQNA 3U9DA 1IG8A 4WQ4A 4RTFD 3D2FB 3D2FA 3GBTA 1GLCG 2QWLA 4FWOA 1NGIA 3VENA 3QB0A 4JNEA 4EHTA 1NGHA 3VGKA 4ISFA 4JAXA 4QS8A 4JHDA 5KPTA 1KAZA 1S3XA 5AQOA 5JICA 1HKBA 4DHYA 3O5BA 1BWFO 5BREA 5BPLA 3FGUA 4GNIA 4FWSA 4BRKA 2ZGYA 5JLHA 4H0XB 5BN8A 3D7EO 3CIPA 2ASOA 3G25A 4FSVA 3WXKA 2ZGZA 3H1VX 3EL2A 3O1BA 3QFUA 1X3MA 1NWKA 5F0XA 4BVPA 2A42A 4CZKA 2D0PA 2ASMA 5B8HA 3ZETB 4BC5A 1ZBSA 3ZETA 2P9KA 2IVNA 3R9PA 3ATVA 3W0LA 1Z6RA 3IMXA 1C0FA 4H5VA 2OANA 3JXUA 4XH1A 5AQTA 5CE3A 3WEEB 3WEEA 3H45C 4WQ4C 2P9IB 1GLLO 2Q2RA 2Q36A 3RSEA 3UKRB 1Q18A 4GY2B 3W3DA 3FR0A 3WUHA 4BRFA 2CGLA 1NGGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RW6A 2HNDA 4Q5VA 2CGJA 5I42A 3SUNA 3A5OC 3OJUA 5CR4A 1NK9A 1E4FT 1BA0A 2IGIA 3ENHA 4E1MA 3T19A 3THYB 1KFSA 4B3TK 4FJNA 4GW6A 3PX0A 1UWBA 3ZX0A 3PX6A 3SQ0A 4DTUA 3GE1A 1JXBA 1GOCA 4O55A 5SWMA 4CF9A 1D8YA 4Z4EA 2GTDA 1S22A 3OYDA 5C10A 5KQDA 3A8YA 2VWJA 3HPOA 4LFAK 5C12A 4DR5K 1JLFA 4Z4IA 4O5BA 3VESA 4CFBA 4EAHD 1ITGA 4WCEL 3RTVA 4CZMA 4CBUA 3OYHA 5I3UA 4H0TB 4KB1A 3P1GA 1KRPA 2FC0A 4H0YB 4B9QA 5BPMA 3DOLA 3R1XA 4BRCA 4JKFA 3WT0A 2BGGA 1QVFM 1GOAA 3AAPA 1X9MA 1IJJA 1QZ6A 4JK9A 3J80O 1YI2N 4K0KK 4CJVA 4KFBA 4FZXC 2O4GA 4CK1A 2D0BA 1WLJA 2P1JA 4FK2A 5C2FA 3O08A 2ZJRL 4H5NA 1ATNA 4CHYA 3WQUA 5AQUA 2E6LA 5DK5A 3HM8A 4BR0A 1HPMA 3S3NA 1XHXA 1RNHA 5FPDA 3R6MA 4DSFA 4FM1A 2PYLA 3MN5A 4GVEA 3ZX3A 1J5OA 4RW7A 3HJFA 3VQCA 1Y64A 4FL9A 3ZT3A 3FZMA 1B9FA 2HVIA 2HHQA 3QNNA 2ZQBA 3T69A 4EIAA 1TKDA 2BANA 3AVNA 2ZM6K 4OKEA 3CQYA 3QICA 4FJLA 1NGJA 4HTUA 5AQGA 2PY5A 1IBLK 5CYQA 5LMUK 3H46O 2P9KB 4BDZA 2VYPA 2GWKA 2B4JA 3SCXA 5I9EB 1ZBIA 3I33A 4CESA 5JS2A 4DFJA 2O8FB 1LWCA 3ZEUB 4DR4K 4R5PA 4JI3K 1BCOA 1QSSA 3AA5X 5E26A 4BY9C 1KTQA 3V81A 2YHXA 4A5BA 3L2UA 3EKSA 4A61A 2UUCK 3OYGA 2QWQA 1KC8O 4CIFA 4BDPA 1HQEA 3BEXA 3CCRN 2IVPA 1A5XA 2UXBK 3RMBA 4L3QA 2VWBA 3CF5L 5LMNK 1NK6A 2Z1IA 5GIOA 4YDUC 2FXUA 2P9UB 3BGRA 3EEQA 5AQMA 3VA0A 3SMPA 4JI8K 2FBYA 1X3NA 3VPZA 1NMNA 5M1FA 1M90O 2Q97A 1ZXOA 3AGKA 4FWLA 5KQ8A 1VQKN 3EKUA 3HSTB 2G8WA 3AO2A 1HRHA 3DJCA 5AZIA 5BN9A 4NYNA 3BF3A 1BU6O 2Z1HA 4DV3K 4OGCA 5EVZA 4B9VA 4IO8A 2GUIA 3SK3A 3D0PA 4QS7A 4CBXA 2F8SA 1FKOA 4DG1A 3MXJA 1RTHA 2NRWA 2YJFA 3AY9A 3KK1A 1J53A 2G8VA 4DQPA 4O4GA 4J8FA 3AVCA 2YI1A 2OCEA 4FJ8A 1RT5A 3OS1A 4YOWA 1U47A 3PV8A 2VG6A 4LF7K 3MWTA 4CJPA 1N5YA 4BACA 1JLEA 2O8CA 2DFHA 3K0SA 1NJZA 3E01A 3TAPA 1T05A 3TAMA 4CJFA 3EZ5A 3ZSVA 1IV0A 2UU9K 5HBMA 2QWRA 4HVJA 5HOOA 2QKBA 4CZHA 4HCCA 1D9DA 2W42A 2G8HA 5AQPA 1RTJA 3VF2A 4RWTA 3CXCM 4CGFA 3QIOA 4PL7A 2YNFA 4G1QA 4CHPA 1C1CA 4B1YB 4DWIA 4IEEA 4H0VB 1SS6A 1S1WA 4JLHA 1NJIO 3L6QA 3SLCA 1RTIA 1VK0A 3LDPA 3NF9A 3DXKB 4FPBA 3QEWA 1JCFA 1RT3A 1MWMA 4OJRA 4DMNA 3O3GA 4U7BA 1SAZA 1REVA 1JKHA 2QW9A 5KGWA 4LSLA 4JI5K 4B9UA 2XY5A 3AA3A 2W6LA 3UKUB 3VQQA 3PO5A 2FF3B 4CJ3A 3ZSQA 3SAGA 3ENBA 1J9AA 3MAQA 1N34K 4W5RA 4MDBA 4B9LA 4N56A 1OH7A 3HPHA 4LSNA 5FRMA 5GAGP 3ZT4A 4JKGA 4DTNA 1UOCA 3I0RA 4XH4A 4BC3A 5J2QA 1ZBLA 1YITN 4W5NA 3C6TA 1P8ZA 3IDHA 4HTLA 3QO9A 1IKVA 1HX1A 1MU2A 1LAVA 4BC4A 4CF2A 5AQWA 3S9HA 3EZWA 3CJ1A 4X65K 4M3RA 4JI7K 4ELTA 1Q7YO 4A62A 4GVMA 1WAFA 3K5MA 5ELZA 3MXMA 1RDUA 4JI4K 3FZKA 1UAXA 3LZJA 3JAMO 4DS5A 3PSFA 4BR4A 3H6EA 3G10A 3J8AA 1S9EA 3BZKA 4B8CA 4NYFA 2YHYA 3QBWA 4CW7B 4DTMA 2GWJA 1QQNA 3MEEA 3M8PA 4O44A 1BUPA 4FJMA 2IC3A 4H5WA 1L3UA 4FWKA 1NMDA 1U04A 5BR9A 1ESVA 3OS2A 3VF6A 1HLUA 2NRVA 2HW3A 5AQVA 3LAMA 3QEIA 1CZAN 1XQSC 4FLTA 3ZLJA 1G99A 1KSPA 3IRXA 2VCPA 4CJTA 3D2EB 4IOXA 4MQ3A 1S1UA 3VMFB 3G6EN 1Y97A 1S72N 3MCAB 4DUYK 2Z1GA 4BROA 4H03B 4FJ7A 4CIGA 4J2EA 4IG0A 2HMPA 3NF6A 1NK7A 1W7AA 1IG8A 3AVGA 1GLCG 2QWLA 4M3XA 1NGIA 4QAGA 1C1BA 3QB0A 4JNEA 4YOYA 2P5OA 3OYIA 3VQAA 4C8MA 3HRGA 4DR1K 5JICA 1HKBA 3NMUA 3O5BA 2HSTA 4IEIA 4GV9A 1IG9A 1LWFA 1T3VA 2HB5A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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