1G99A

An ancient enzyme: acetate kinase from methanosarcina thermophila
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
398
structure length
398
Chain Sequence
MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVET
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords ACETATE KINASE
publication title Urkinase: structure of acetate kinase, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
source organism Methanosarcina thermophila
total genus 139
structure length 398
sequence length 398
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A02
3KZBA 4B1ZA 4CZIA 3LDQA 3EZWA 5BN9A 3D2FA 5AZJA 2QWRA 2KHOA 2V7YA 2E2PA 3SLCA 1GLDG 4JD2A 3BEXA 3QMLA 4K42A 1GLEG 1MWMA 2FSKA 3A8YA 2A5XA 2W41A 2FXUA 2HOEA 3TU5A 4H5NA 1WUAA 3ENHA 1NGCA 4ISGA 2GTDA 5AZIB 5KQDA 4K25A 3ZX3A 4EHTA 3MMVA 3U9DA 4Y0WA 2P9SB 2FF6A 2DPNA 2GWJA 5BPMA 2FF3B 3LM2A 3A0IX 1Y64A 2P9KB 4H03B 4BRLA 3O1BA 3A5LC 5AQHA 4QS7A 2QXLA 2A6AA 3W0LA 3C7NB 1HLUA 3HZ6A 2P9PB 3VEVA 3QB0A 5JICA 2IIRA 3CHWA 4DHYA 1GLJO 4BGAA 1NGEA 4B1YB 1C0GA 4MO5A 3MK6A 1LOTB 3O8MA 4A62A 1OKJA 5AFUA 4MLEA 3U9ZA 1QZ5A 5EOYA 5JMVA 4EHUA 2YCHA 1IJJA 2E2NA 4FOIA 4JHDA 3WXKA 3LDNA 4H0OA 4A61A 4BROA 3VENA 3UKUA 4CZMA 4BR2A 4O8KA 1X3NA 1HKBA 3HM8A 4AM6A 3VF2A 3WXIA 3O5BA 1QQMA 2P9NA 3DXKB 3QICA 1X9JA 4FWNA 4KBOA 4BR0A 2QWPA 1ZBSA 2V51B 2D4WA 4H5RA 4YDUA 3ZEUB 2QWMA 4FWMA 4K41A 4H5VA 1BOTO 1ATSA 1K8KA 1KAXA 4BR9A 4BR7A 3D2EA 3VGLA 2J4RA 2E2OA 4HWIA 3FZFA 2CH5A 3VF6A 4BREA 3QFUA 3VGMA 3F9MA 3WEEA 2V52B 2GEMA 1BWFO 4IJNA 5KQ8A 4E1JA 3QBWA 3JXUA 3GG4A 4FPAA 3SK3A 1WOQA 2H3GX 2E2QA 4WQ4A 1BA0A 4RWTA 4H5WA 3MN6A 2E1YA 3RSEB 4CI6A 2P9IB 1NGAA 5LJVA 4RCHA 4M63C 5AQVA 3VESA 4BVOA 1NGJA 2E20A 4H0VB 2Q1NA 5AQZA 5AQOA 4BRHA 2QWNA 1NGHA 3VETA 2GUPA 5FPEA 2ASOA 5ADXA 3MN7A 3ID8A 3H3NO 4BRAA 1SAZA 2IVPA 1GLCG 3VEXA 3EL2A 2A3ZA 4FWQA 4F9OA 1JCEA 1MDUB 4YDUC 5F2RA 4AM7A 3O4WA 4BRCA 1BUPA 2QWLA 1NGBA 1ZC6A 2GWKA 5AQNA 2VCPA 3VPZA 3CIPA 3QDKA 4BR5A 2ITMA 2GELA 2P9LB 3ZX0A 3GL1A 1QQNA 4BRKA 2HF3A 4O5FA 3W3DA 4FWLA 2FLOA 3CQYA 3ZETB 5F1XA 4I6MA 1IG8A 5I9EB 3AARA 1Q18A 3SMPA 4CZGA 1NGGA 5JLFA 4WQ4C 5AQMA 5F0XA 1Z6RA 4ISFA 3LDPA 4B1XB 1T6CA 1GLBG 4H0XB 3S41A 2A40A 3GDQA 5AR0A 4PKIA 5JLHA 4CZHA 1YXQA 3FZMA 3R6MA 1YUWA 2PBDA 3FLCO 2P9UB 3L0QA 1GLFO 4XH1A 5ELZA 2Q2RA 3A5OC 1ATNA 5AQLA 3DXMB 3H3OB 1T44A 2VWBA 2YJFA 1QQOA 3SMSA 3CETA 1HX1A 3G25A 3FGUA 1TYQB 1S22A 1X3MA 3MN5A 3VOVA 3WT0A 3UKRA 3ULEA 4CD3A 3VGKA 2BTFA 4B1UB 3VEOA 4H5TA 1LCUA 2NZTA 3C0BA 5AQPA 3A5NC 4B9QA 1HPMA 1XUPO 3I8BA 3UE5A 1P8ZA 1YVNA 3FZLA 2E8AA 2ASPA 2E88A 3KHYA 2HMPA 3WXJA 1BO5O 3EN9A 2YI1A 3H6EA 4BR4A 2QW9A 3D2FB 4IO8A 5AZJB 4CJ7A 4BRPA 4FPBA 3GOIA 2A42A 4FWSA 1TUUA 4BC5A 5B8HA 4JD2B 3GE1A 1U2VA 2QM1A 1NGIA 1QZ6A 4BC3A 2QWOA 3H1QA 4CZLA 4IJAA 2AP1A 3CERA 5AQYA 3VERA 5AQJA 4CD1A 5BN8A 3ATVA 4CZKA 4BRIA 1Z05A 5BPLA 2V7ZA 4CZFA 1S3XA 5AQIA 3CJCA 4BC4A 3OHRA 3BUZB 2YHXA 4QS9A 4DCHA 3L4IA 5AQKA 3R8EA 1BU6O 3VEZA 4ISEA 1YAGA 5BRHA 4H0YB 4H0PA 5TKYA 3VF4A 1E4GT 4CZJA 4MO4A 4WYBA 1ATRA 3CI5A 4BVPA 4GNIA 4EAHD 4FWKA 2D1KA 3O6WA 3WQTA 1CZAN 3O1WA 3QFPA 2UYTA 1D4XA 3WQUA 3MCPA 2D0OA 3UB5A 2CGKA 4JHDB 3AY9A 3U4LA 3P4IA 2VYPA 4PKHA 5AZIA 4PL7A 5LJWA 2EWSA 1NGFA 3FR0A 2P9SA 5AQTA 3R9PA 3IUCA 3UKUB 3ZX2A 2IVNA 1G99A 1R59O 1T6DA 4PKGA 2CGJA 2P9KA 5AQGA 4CZEA 2NLXA 2P9NB 5EX5A 5FPMA 2OANA 5AQUA 3SJHA 1BG3A 3C7NA 2BUPA 1ZXOA 3HTVA 5EY4A 4BG9A 2P9PA 1U6ZA 2D0PA 4CBWA 2FSNA 1DEJA 1GLLO 1K8KB 1JCFA 2I7NA 3QBXA 5KPRA 1NWKA 3A5MC 3HBTA 1MA9B 2IVOA 3DJCA 3IDHA 3D2EB 4K43A 2A41A 3D7EO 4B1VA 3J8AA 2E1ZA 3CJ9A 4RTFD 3WEEB 3O80A 4M7XA 3CJ7A 4EFHA 3VEWA 5KPZA 1SZ2A 2NRHA 3H1VX 3HSCA 1XQSC 3FZKA 5BPNA 3M6GA 1NM1A 1TUYA 1H1VA 4FO0A 3FFKB 1HKGA 3LDLA 3DXKA 2Q0RA 3ATUA 2I7PA 4PL8A 2Q31A 4L3QA 3U8XA 3MN9A 5BR9A 3ZEUA 4BQLA 3CJAA 1MWKA 3CQXA 1XC3A 1GLAG 3MDQA 1BDGA 4FWRA 4H0TB 4WQ5A 4CBUA 3H46O 2CH6A 3EKSA 1BA1A 4BRFA 4BGBA 1KAYA 1V4TA 4B1WB 2YJEA 5FPDA 3LL3A 3B8AX 3DAWA 3GBTA 3RSEA 2P9IA 4I6MB 5BRFA 5LY3A 1HJOA 2Q0UA 5AFUH 4FOEA 2ZGYA 3M3ZA 5CE3A 2F9WA 1SQKA 5AQWA 3DWLA 1JCGA 3O08A 3WXLA 4BC2A 3JS6A 1EQYA 3CJBA 5BRDA 4XEIA 4FWPA 1RGIA 4BRDA 4BRNA 3EO3A 1V4SA 4MLHA 1ESVA 5AQRA 1RFQA 1NLVA 2W40A 3M1FA 3AAPA 2AA4A 1DGKN 4GY2B 4DB3A 3FE1A 3TPQA 2FSJA 4BG8A 3HI0A 4CBXA 1RDWX 4M7YA 5AQQA 5FPNA 4JAXA 4IZ9A 3UKRB 3ULEB 5BREA 1KAZA 1HUXA 5AQFA 4JNEA 4A2BA 1HKCA 2P9LA 2Q97A 4QS8A 4WQ5C 5EVZA 4BRMA 3ZETA 3I33A 4FWOA 4EIAA 4LC9B 4Z94A 1J6ZA 4NO7A 2Q36A 4BQZA 1KXPA 3AAQA 4XH4A 3IFRA 4J8FA 1NBWA 3LM9A 3IMXA 3L6QA 2HF4A 4A2AA 2PAVA 3LDOA 3VEYA 3BP8A 2P9UA 3BF1A 5EXWA 1E4FT 2ZWHA 5AQXA 3BF3A 3H45C 4HTLA 4XH5A 2QWQA 5E26A 5KPTA 3DXMA 4IXCA 1U2VB 2YHYA 4C23A 1C0FA 1QHAA 4NB4A 4DQ8A 4IWVA 1TYQA 2WUSA 4FL9A 4BRGA 1NGDA 3WUHA 4FSVA 4JN4A 2ZGZA 3EKUA 1NMDA 4BRQA 5ADXH 3KVGA 2ZF5O 5AQSA 5E84A 3CJ1A 2YHWA 3ENOA 1DKGD 2F9TA 3FZHA 2ASMA 2CGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KZBA 1QHTA 1WSJA 2GX9A 4WFAL 4CF0A 1LWEA 4O5BA 4H4MA 3MWTA 1JLCA 1GLDG 4KKOA 2G8HA 1BIUA 4K42A 2VQEK 4RW8A 3SI6A 3T3FA 3VTIA 3A8YA 3O4NA 5HBMA 3OJSA 3TU5A 3AO4A 4H5NA 3HYFA 4DTRA 4HHTA 4FJ8A 4EHTA 5LMNK 4I7FA 2P9SB 3HOTA 4LF6K 2FF3B 4F4KA 2P9KB 3U3YA 4BRLA 3O1BA 1NOZA 3D45A 1RT1A 4MDBA 3T69A 3W0LA 3BGRA 2P9PB 4OGEA 4I2PA 4JK7A 3ULDA 3CHWA 3LPUA 3AVAA 4DV1K 1LOTB 1WBDA 1Z26A 5AFUA 4MLEA 5EOYA 3CD6N 2RHKA 4JHDA 1VQNN 1BCOA 5GINA 4IEIA 3LDNA 3QEPA 1GOBA 2BDPA 5C10A 5FROA 3VENA 1BI4A 4K8ZA 4BR2A 4HTUA 4DV5K 1BHLA 4CF9A 1J5OA 1X9JA 3C95A 1N6QA 4KBOA 4BR0A 3VQ8A 2ZJQL 1RCHA 3ZEUB 5J2NA 1BOTO 3NH1A 1KAXA 2ETJA 4OJRA 1SL1A 3VGLA 4CJSA 3VF6A 4BREA 3VGMA 3VQ6A 2GEMA 3F9KA 1BWFO 5A2QO 4IOXA 2IGIA 1HYSA 5DM6L 3HXMA 3GG4A 4FPAA 2E2QA 4WQ4A 4RWTA 4H5WA 1RTJA 4X66K 4FLTA 2P9IB 4RCHA 3VQAA 2HHVA 4M3RA 4LSNA 4C8LA 4CHNA 2Q1NA 1RT2A 1W7AA 5AQOA 4IFVA 2QWNA 3KLIA 3THYB 4CJ3A 1IH7A 3VETA 3P31A 1S1TA 2X6NA 1RTDA 4CHOA 3ID8A 3H3NO 4DKWA 1SAZA 2IVPA 3IRXA 3RVCA 4CGHA 4Z4CA 2YHBA 1OH8A 4KRFA 1ASUA 1RDAA 1VQ4N 4BRCA 5BR8K 4HVJA 2QWLA 3AV9A 4DR4K 3C6HA 3SV3A 4CW7B 1J54A 5FLXO 4BRKA 5GIOA 3CCQN 3CQYA 1IG8A 2HBMA 2VG7A 3QNOA 4CZGA 5JLFA 4KV8A 4WQ4C 3ENBA 4BWMA 3VQPA 4ZHRA 4YHHK 5F0XA 1Z6RA 3LDPA 4H0XB 4FYDA 3GDQA 4PKIA 3THVA 3ID6A 1DTTA 3TSPA 5CZ1A 3FLCO 2DTUA 4XH1A 3NBPA 3A5OC 4B9LA 1ATNA 1HNVA 4CJWA 4ILHA 4JI4K 4MQ3A 4AHUA 4DV0K 3VQ5A 2IS3A 2LSNA 3SBGA 1VQON 1TYQB 4JI3K 3MN5A 1A5XA 1BIZA 3TAEA 4DR1K 5KRTA 1N34K 3VGKA 4DMNA 5D3GA 3CC7N 3RWUA 2NZTA 3C0BA 5AQPA 4DV6K 3F5TA 3I8BA 3FZLA 3MEEA 3EY1A 3QLHA 2WTUA 3WNGA 3ZSQA 1BO5O 3LWLA 1B9DA 4KHSA 1XI1A 3H6EA 4BR4A 3D2FB 5AZJB 4B8AB 4AF1A 2ZJPL 3ZSXA 1UWBA 2DFFA 1HR0K 1RT7A 2XRIA 1RBSA 4M3YA 3VQ9A 3GE1A 3LAKA 2UUBK 3OBWA 3EYZA 4NCAA 2UUAK 4YOXA 3L2UA 4B9NA 2AP1A 1CZ9A 3AO3A 3VERA 5HRRA 2G8VA 3QEWA 4BRIA 2E4LA 3CJCA 4BC4A 3BUZB 4WF9L 2YHXA 4GW6A 4KHNA 2F4VK 2PYJA 4H0YB 1JLQA 2G8KA 4IKFA 3DLHA 4AHSA 4CZJA 2XY8A 4YORA 4WYBA 1EKEA 1ZBHA 4GNIA 1RT3A 3KWGA 3O6WA 3E01A 1RDUA 3LP2A 3U3GA 3WQUA 3EE8A 4F2SA 4DFMA 3RRGA 4DU3A 4YFUA 3CCJN 3ZLJA 1U04A 3I0RA 4CERA 3UB5A 3U4LA 3P4IA 2VYPA 4DR3K 4JI0K 1IBKK 1X1PA 2FBYA 2EWSA 2P9SA 3V1OA 5CY4A 3O9UA 2HHQA 5LMUK 5EU7A 4E89A 2CGJA 4OKEA 4K8XA 2P9KA 3R3LA 4KH5A 3J7AP 1IKXA 1C0UA 3AVBA 3SJHA 5C15A 1ASWA 1VQ6N 2P9PA 4NCGA 4CJRA 2FSNA 1GLLO 4OPJA 2YV0X 3OYCA 3BZKA 3HBTA 1I94K 1MA9B 1NJXA 2XY7A 4GKJK 4JI2K 3T1HK 3L8BA 4U7BA 3O80A 3AO5A 2OTJN 4JI6K 4CK3A 2W42A 1S72N 5BPNA 1KRPA 1VSJA 3CC2N 2WOMA 4HUEA 3R1XA 3SCXA 4N41A 4O0IA 2Q0RA 3ATUA 2Q31A 3CCUN 4DSKA 4CESA 3TSQA 3KK3A 3LZJA 4KHPK 1RILA 5BR9A 3O3FA 4JKAA 3ZEUA 3Q7BA 4JKHA 4CCHA 2YKMA 2IC3A 3CJAA 3DLKA 4W5QA 1MWKA 3DLRA 2AJQA 3CQXA 3NMUA 1U49A 3V1RA 3TTDA 3G71N 4H0TB 4Q0BA 5J2QA 2PYLA 1CXQA 2KZZA 4FJNA 4BGBA 1KAYA 2JWLA 4FVMA 3L2WA 1HNXK 1NJIO 3DAWA 2P9IA 4I6MB 3AGKA 4LF4K 3JYTA 4JV5K 2ZGYA 4FJKA 5CE3A 4DFKA 3THYA 1C6VA 1JCGA 1HYZA 1XWLA 1QE1A 2ZQBA 3WXLA 4FM0A 2O8DB 1TKTA 4YOYA 4FCYA 3O9TA 3K0SA 1YITN 4CJQA 3EO3A 1M90O 1ESVA 2UXCK 3AAPA 1U47A 2AA4A 3G4SN 4ICLA 3LP1A 3TPQA 5GAGP 1JLAA 4BG8A 1VSEA 2HBJA 1RDWX 3CPEA 3UKRB 5BREA 1KAZA 2F96A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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