1G99A

An ancient enzyme: acetate kinase from methanosarcina thermophila
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
398
structure length
398
Chain Sequence
b'MKVLVINAGSSSLKYQLIDMTNESALAVGLCERIGIDNSIITQKKFDGKKLEKLTDLPTHKDALEEVVKALTDDEFGVIKDMGEINAVGHRVVHGGEKFTTSALYDEGVEKAIKDCFELAPLHNPPNMMGISACAEIMPGTPMVIVFDTAFHQTMPPYAYMYALPYDLYEKHGVRKYGFHGTSHKYVAERAALMLGKPAEETKIITCHLGNGSSITAVEGGKSVETSMGFTPLEGLAMGTRCGSIDPAIVPFLMEKEGLTTREIDTLMNKKSGVLGVSGLSNDFRDLDEAASKGNRKAELALEIFAYKVKKFIGEYSAVLNGADAVVFTAGIGENSASIRKRILTGLDGIGIKIDDEKNKIRGQEIDISTPDAKVRVFVIPTNEELAIARETKEIVET'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Urkinase: structure of acetate kinase, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACETATE KINASE
source organism Methanosarcina thermophila
molecule tags Transferase
total genus 139
structure length 398
sequence length 398
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.1: Acetate kinase.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1g99A02
4H5RA 4B9QA 5AQHA 4L3QA 4BG9A 1NGGA 3VEYA 2V7YA 5AFUA 1BOTO 3O6WA 5EVZA 4EHUA 3QBWA 3CIPA 3A8YA 3TPQA 1H1VA 3LDQA 4IZ9A 4YDUA 3GDQA 3A5OC 1YUWA 3R6MA 4M7YA 4BRCA 1Q18A 3ZX0A 2QWNA 1XC3A 4H0XB 3I33A 3EKUA 3U9ZA 1HX1A 2H3GX 4K43A 1E4FT 3H3OB 2DPNA 1KAXA 3S41A 3FZLA 2NRHA 3SLCA 3CERA 4H0PA 4O8KA 4BROA 4FOIA 3WXLA 1BG3A 4EAHD 5AQMA 5FPDA 4H0OA 4K41A 4BRNA 3JS6A 2ZGZA 5EOYA 2OANA 1K8KA 4FWLA 4K42A 3BF1A 4BRPA 1Z05A 4CZGA 2ZWHA 1QHAA 1ATRA 2P9SA 4BREA 3CJAA 4FL9A 4MLEA 4JN4A 5EX5A 1WOQA 3VF2A 3RSEA 1GLEG 1DKGD 3EKSA 4PKGA 1GLDG 1JCGA 3C7NA 5AQFA 1IJJA 3WQUA 3AAPA 1TUYA 4B1VA 3MCPA 1K8KB 5AQJA 4EHTA 4IJAA 4BRAA 4XH5A 4CZFA 3O8MA 2CH5A 2P9SB 4A2AA 1OKJA 5AQUA 3P4IA 3VEZA 4F9OA 3RSEB 2GWKA 2UYTA 2Q2RA 1IG8A 3MDQA 4Z94A 2YCHA 2E2QA 1ZBSA 2P9PA 4DB3A 3CJBA 3C7NB 3QICA 3KZBA 3L6QA 4IXCA 2QWMA 5EY4A 5KPZA 4BR2A 2QWQA 4HWIA 1GLJO 1NM1A 3VENA 5BN8A 2E88A 3ENOA 4BVOA 2E2PA 4BRLA 3CQXA 3DXKA 2YJFA 4QS7A 1TUUA 3VESA 4BRKA 2Q31A 3H45C 2VCPA 4BC3A 3U9DA 3VERA 3MMVA 4BRGA 1BA1A 5BPLA 5F1XA 5AQLA 2YHWA 3VETA 5KPRA 1D4XA 3GL1A 2FSJA 1MDUB 3VGLA 3WXKA 2P9PB 2IVNA 3LDOA 2E1ZA 1QQOA 2CGLA 1SZ2A 5BRDA 1GLCG 2FF3B 2QWOA 1KAYA 3J8AA 4GNIA 5AR0A 3UKUA 1V4TA 3O08A 1NGEA 3F9MA 2E2OA 3DXKB 4CI6A 2AP1A 1V4SA 3FGUA 3VF4A 2FXUA 5F0XA 4CBUA 3UE5A 2ASOA 5FPMA 1S22A 3IFRA 2A5XA 5BRHA 3VEXA 4HTLA 3D2FA 4H5NA 4PKIA 1LOTB 3ID8A 3WUHA 4A2BA 1KXPA 3AY9A 5AQNA 4B1ZA 2BTFA 1TYQA 2FSNA 5LJVA 2D0PA 3BF3A 3UKUB 3ULEA 1BO5O 2HOEA 1ZXOA 5AQPA 3A5LC 5AQSA 4BQLA 1NGBA 4CBXA 4CZJA 4IWVA 3CETA 2A40A 5AQYA 3SK3A 1X3NA 4PL8A 2E1YA 3O80A 4CZEA 3SMSA 5BRFA 3MN9A 3D2FB 3M1FA 4H0VB 1T6DA 1NLVA 2QXLA 2V7ZA 1NBWA 1TYQB 1MWKA 1DEJA 1RFQA 3O1WA 2FF6A 3CI5A 1C0GA 2QWRA 3GBTA 3HBTA 3IMXA 3ULEB 5BREA 5BN9A 2CGJA 1E4GT 4DCHA 4RWTA 3MN6A 3B8AX 4WQ4C 1QQNA 1BWFO 5KPTA 4LC9B 4BRFA 3HTVA 4BR5A 1P8ZA 2NLXA 3MK6A 4FWPA 4QS8A 4BR7A 4CJ7A 3CJ1A 4O5FA 4BC5A 4CZHA 1GLFO 4KBOA 3LM2A 1DGKN 1X3MA 3FFKB 4BRIA 4DHYA 3KVGA 1LCUA 5AZJA 4BR9A 3EN9A 4BGBA 4CBWA 1NMDA 3QFUA 1XQSC 5AQWA 5AQRA 4BRDA 4ISEA 3FZFA 2YJEA 2F9TA 5AQOA 3UKRA 5AQIA 2CGKA 2YHXA 3FZMA 4BG8A 1GLAG 2FLOA 3I8BA 2P9NA 3U4LA 4A62A 3GG4A 4B1XB 4XH4A 3EL2A 3IUCA 4B1WB 2HF3A 1ATNA 3C0BA 3H3NO 4XEIA 3CJ9A 5AZJB 1WUAA 2E20A 2W41A 4JAXA 2A3ZA 3BEXA 5JLFA 3W3DA 3D7EO 3U8XA 3H6EA 3VOVA 1JCEA 2VWBA 5AQKA 4FWKA 3UKRB 2QW9A 3LL3A 1NGIA 4JHDA 2GELA 1T44A 1QZ6A 2Q0RA 3GOIA 4MO4A 3VEOA 3VPZA 1NGDA 4FWSA 2PBDA 1T6CA 1BDGA 2P9NB 3EZWA 5JMVA 1ZC6A 3WEEA 2ITMA 1U6ZA 2KHOA 4WQ5C 5ELZA 5AQQA 4PL7A 5AQTA 2F9WA 3QB0A 4J8FA 4NB4A 3TU5A 3H46O 4ISGA 4QS9A 2FSKA 1NGCA 1BA0A 5LY3A 3D2EA 4B1YB 3FE1A 3QDKA 4FWMA 1J6ZA 4CD1A 5E84A 3AARA 3FZHA 3GE1A 4FSVA 4JHDB 3WQTA 4WQ4A 2Q97A 3L0QA 4IO8A 4JD2A 3VEWA 4BVPA 4CZMA 3ZX2A 3HI0A 4FPBA 1HJOA 3FLCO 3WEEB 2I7PA 1S3XA 1CZAN 2YHYA 2A42A 2QWPA 4CZIA 5AQVA 4FOEA 2ZF5O 5AQGA 2EWSA 2J4RA 3KHYA 2CH6A 4MO5A 1YVNA 4BRMA 2D1KA 4BR0A 3D2EB 4FO0A 2GUPA 1RGIA 4XH1A 3VEVA 2HMPA 1XUPO 3MN7A 2Q1NA 4FWQA 3CJ7A 4AM6A 2HF4A 3WT0A 3A5NC 3EO3A 2GEMA 4JD2B 4RTFD 3UB5A 1NGFA 3VGMA 2ZGYA 3QBXA 5B8HA 3WXIA 5KQ8A 1MA9B 5BR9A 2ASMA 1U2VA 2WUSA 4B1UB 4M63C 2GWJA 1ATSA 4BRQA 3ZX3A 2AA4A 3A0IX 3M3ZA 5ADXA 5AQXA 4BQZA 2GTDA 3W0LA 2VYPA 5LJWA 4H03B 4ISFA 2Q36A 4H5WA 2ASPA 4H0YB 1EQYA 1GLLO 5AQZA 3FR0A 5E26A 1KAZA 4EIAA 2V51B 3H1VX 1U2VB 2V52B 4A61A 2D0OA 4BR4A 2BUPA 4WQ5A 5AZIA 1HKGA 3MN5A 3LDPA 4BC2A 2IIRA 4PKHA 3DXMA 3WXJA 4GY2B 5FPEA 3M6GA 2E2NA 4H5VA 5EXWA 4DQ8A 5JICA 3R8EA 3LDNA 1NGJA 1BU6O 1R59O 3OHRA 4BC4A 1QZ5A 1YAGA 1YXQA 1NGHA 2Q0UA 3H1QA 1Y64A 4FPAA 4H0TB 1HKCA 3FZKA 5AFUH 5F2RA 4C23A 4BGAA 3DWLA 5CE3A 3HM8A 3CHWA 5AZIB 1HLUA 1BUPA 2YI1A 4EFHA 2IVPA 1NWKA 3A5MC 3O5BA 3DXMB 4YDUC 2NZTA 1NGAA 1X9JA 3SJHA 3SMPA 1HPMA 3L4IA 4IJNA 5ADXH 1GLBG 2P9KA 5FPNA 5TKYA 4AM7A 2P9LA 5BPMA 1QQMA 1SQKA 3LDLA 3CQYA 3VF6A 2P9IA 4CZLA 3AAQA 4JNEA 3ZETA 4K25A 3ZEUA 4MLHA 1JCFA 2I7NA 4WYBA 3DAWA 3HZ6A 3BP8A 3R9PA 3VGKA 3DJCA 1G99A 1RDWX 2A41A 2QWLA 5BPNA 5KQDA 1HUXA 3CJCA 2D4WA 4I6MA 3HSCA 4H5TA 1Z6RA 1ESVA 3ENHA 2P9KB 2P9UA 4Y0WA 3IDHA 4FWRA 2P9LB 2PAVA 2A6AA 4RCHA 4NO7A 3G25A 2E8AA 2P9IB 3O1BA 4CZKA 5JLHA 2IVOA 2W40A 3ATVA 3ZETB 3ZEUB 4M7XA 3JXUA 1HKBA 3LM9A 1MWMA 3QMLA 1C0FA 4FWNA 5I9EB 3O4WA 3ATUA 4FWOA 3BUZB 4CD3A 1SAZA 2QM1A 4BRHA 3QFPA 4I6MB 4E1JA 2P9UB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5J2NA 1XWLA 3PSIA 3MWPA 4L3QA 1W2BM 5AFUA 1KSPA 3OYFA 3O6WA 3CCSN 3AVKA 1TK0A 5EU7A 4EHUA 4OPKA 3THVA 1KC8O 3QBWA 4NLCA 4FW1A 1RNHA 3RMBA 3AA2A 3LANA 4B3RK 3TPQA 1S1XA 1NK8A 2IGIA 3VQ9A 3SQ0A 1JLQA 4DR6K 3DLGA 4H0XB 3I33A 4KHWA 3TARA 1U4BA 3H3OB 3NF7A 3FZLA 4CJUA 3EEQA 4EAHD 4JS5A 1RBVA 4WFAL 1C1BA 4OKEA 3OYDA 3LP3A 4JKGB 2F8TA 1P90A 4DSJA 4JKEA 4B9MA 5M1OA 2PYLA 1QTMA 4MLEA 3KKSA 2O8DA 2G8WA 1TGOA 4JEPA 2QTDA 4Z0UA 3RSEA 3AVJA 1GOAA 3EKSA 5AQFA 4E19A 4CF9A 3AAPA 4DSLA 4B1VA 3HP9A 1K8KB 1M1KO 4EHTA 4IJAA 5JVGL 1BISA 3U6FA 4K8ZA 2X78A 4KHSA 3NH0A 1OKJA 3HPOA 5AQUA 3VEZA 2YV0X 3V1RA 2GWKA 2UYTA 3AVAA 3NVMA 2D0BA 1C6VA 2E2QA 1QSLA 2P9PA 1TKTA 3E1YA 3KZBA 4CJLA 4KRFA 4HWIA 3QEPA 4DLGA 3T1YK 3M8PA 4CEDA 2PY5A 5BN8A 3ENOA 4KHPK 3MCAB 3CQXA 2JWKA 4QS7A 3CFOA 3VESA 4HVJA 1VQ4N 1T05A 4E1NA 3CCUN 3T1AA 5BPLA 5C2DA 4HUEA 1ASWA 3OYHA 3VGLA 1T3VA 2YHBA 3O9RA 3CM5A 1SZ2A 5BRDA 3NF9A 4YOVA 3UKUA 5HRRA 1V4TA 4O55A 4B3TK 2OPSA 1YTAA 3ZSOA 4FJJA 3DXKB 3VF4A 4CJVA 5J2PA 5FPMA 1C1CA 2A5XA 3OS0A 4CW7B 5BRHA 3VEXA 1NOZA 3I0SA 4O4GA 4H5NA 2W42A 4ID1A 3ID8A 4A2BA 1KXPA 3AY9A 1NG9A 3HP6A 2BTFA 2I5JA 2FSNA 3JYTA 4YOUA 4AHTA 3AO5A 1BO5O 2BANA 3OYJA 3S3MA 4DTSA 5AQSA 3CMEN 1NGBA 4JKAA 5HROA 4C8OA 5AQYA 4N5SA 4JI1K 4GMJB 1HPZA 3O80A 3KD1E 3D2FB 4KAZA 2F4VK 1T6DA 3TSUA 4NXMK 4CEOA 2F96A 2HHWA 1RFQA 4KFBA 3CI5A 4FJ9A 3ULEB 5BN9A 3VQ8A 1LWCA 4M3YA 2JGUA 4CEQA 3F2KA 3OYEA 2RHKA 3HOTA 3MK6A 4CF8A 4CJ7A 3QNNA 1EKEA 3D0PA 1Q7YO 2LSNA 2FC0A 1GLFO 1RBRA 3Q7CA 3SBTA 1DGKN 1X3MA 3FFKB 3IRXA 2NRVA 2HHXA 4BR9A 4BGBA 2OPQA 3O4NA 1NMDA 5AQWA 4MQ3A 2HHVA 1WSHA 2B4JA 3CC7N 2CGKA 3V1QA 2YHXA 1VHXA 1W97L 4BG8A 1OH8A 4BACA 3MXIA 4XH4A 2HF3A 1TKXA 3V81A 2ITGA 3CJ9A 1WSFA 2E20A 2W41A 2A3ZA 2HMIA 2YHAA 3U8XA 3H6EA 2ETJA 2W6LA 3VOVA 5M1PA 4X65K 3KLIA 1IKYA 3CCRN 1FW6A 1K73O 1RDDA 2Q0RA 3VPZA 4DV2K 4CVNE 2PBDA 1T6CA 1T03A 2P9NB 5JMVA 4DSEA 3ID6A 2Z1GA 1J54A 4J8FA 4NB4A 1VQON 3TU5A 4DFKA 1LAVA 1QHTA 4ISGA 3BZKA 1X9WA 1BA0A 4JK7A 5FRMA 3VQ5A 2OYQA 3D2EA 3ALYA 3P39A 4QCLA 2O4IA 4CD1A 4DWIA 3FZHA 1REVA 1I3AA 4FSVA 3V9SA 2Q97A 3L0QA 4IO8A 4E7KA 3D45A 4OPAA 3ZX2A 2A1RA 2XY7A 4W5NA 2I7PA 1CZAN 2A42A 3NDKA 3SUNA 2ZF5O 3OVNA 4IFEA 4J2EA 2J4RA 4M3RA 4MO5A 1Y97A 1JJ2M 4BRMA 2PYJA 3LP2A 1VQ9N 2GUPA 1RGIA 3VEVA 5KRTA 2OTLN 3OYBA 4AM6A 4DFMA 2BDPA 4JI7K 1VSKA 3EO3A 4JKDA 4RTFD 1NGFA 1BCOA 4I2PA 3QBXA 3LALA 3I0RA 4B9SA 4O0JA 1MA9B 1G15A 2WUSA 4CGJA 2X6NA 4Y1DA 3K5MA 4FJLA 4BRQA 4O44A 4YOWA 4Z4FA 1N5YA 1CZ9A 2Q3SA 2BGGA 2Q36A 4H5WA 4DLEA 2DFEA 2OCEA 5E26A 2OA8A 4EIAA 4DV1K 4FJ5A 3RRHA 4BR4A 5LMNK 3MN5A 3LWLA 3LDPA 2IIRA 4DG1A 3DXMA 3TR8A 4GY2B 1R59O 2OTJN 3OS1A 4Z4GA 2Q0UA 3H1QA 2WTUA 3G71N 2XRIA 2G8FA 3FZKA 4WF9L 3E66A 3DLLL 4ZTFA 4OVLA 2IC3A 3AVFA 3HM8A 5AZIB 4DFPA 3DRRA 2G8UA 1RTHA 5I3UA 2YI1A 1HQUA 2O8FA 3VN5A 1HNXK 1X9JA 4DUYK 3SJHA 3SMPA 2ZJRL 1DLOA 4IJNA 4DTRA 5ADXH 1VQ8N 1GLBG 2P9KA 4AM7A 4CE9A 5BPMA 3MAQA 5C0YA 3LDLA 3VF6A 1YJNN 2UUAK 2P9IA 4NXNK 2DTUA 3V4IA 4K25A 4AHCA 3HVRA 2YKNA 2I7NA 4WYBA 3BP8A 3O9TA 3OYNA 1U45A 2RPIA 3C6AA 2GX9A 1RDWX 5DMRA 4M3XA 3RVCA 2QWLA 1KFSA 4B3OA 1HUXA 3SPYA 4I6MA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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