The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MTYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immunoglobulin binding protein
|
| source organism |
Streptomyces griseus
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| publication title |
A novel, highly stable fold of the immunoglobulin binding domain of streptococcal protein G.
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
PROTEIN G
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| total genus |
10
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1991-05-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF01378 | IgG_binding_B | B domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PGX A; 3UI3 A; 2KWD A; 1HZ5 A; 1C9F A; 1P7E A; 5HG2 A; 5JXV A; 1GB1 A; 2KN4 A; 1JML A; 1EM7 A; 5HFY A; 3FIL B; 2RPV A; 2LGI A; 3GB1 A; 2JU6 X; 4WH4 A; 2QMT A; 1HEZ E; 1GB4 A; 1IBX B; 4OZB A; 2PLP A; 1K53 A; 4OZC A; 1UWX A; 2JSV X; 2RMM A; 1IGD A; 4GLS C; 1MVK A; 2IGH A; 2ZW0 A; 1FCL A; 2N9K A; 1F2R I; 1XCT L; 5HHD G; 2N9L A; 2I2Y A; 2KQ4 X; 5BMH A; 4IOI E; 2PW9 A; 1MHH E; 1F2R C; 1Q10 A; 2PTL A; 5BMG A; 4IKG A; 2ZW1 A; 2K0P A; 2IGD A; 2OED A; 2ONQ A; 2N7J A; 2QSD A; 3MP9 A; 2I38 A; 1IBX A; 5BMI A; 1XCQ L; 4KGR A; 4HJG E; 2NMQ A; 1XF5 L; 1MPE A; 1MI0 A; 5HI1 A; 2KDM A; 2GI9 A; 2J53 A; 1HZ6 A; 1MHX A; 1D4B A; 1K51 A; 1K50 A; 3FIL A; 1P7F A; 2IGG A; 4HKZ E; 2GB1 A; 1PGA A; 2ON8 A; 2LHE A; 1PGB A; 4OZA A; 1FD6 A; 1K52 A; 1YNT E; 2JXT A; 1KH0 A; 4KGT A; 2LHD A; 1IGC A; 1QKZ A; 2EEL A; 4KGS A; 2JZP A; 2J52 A; 4MAC A; 4D2K A; 2KAC A; 1FCC C; 3V3X A; 1YMH E; 2JWU A; 2LUM A; 1ZXH A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1OQR A; 3RNE C; 2C7H A; 3X0W A; 2HDE A; 1SJH D; 5D3I B; 1VD2 A; 1JRO A; 1V1P A; 4ZRJ A; 5JHA A; 5CTR C; 1ET6 A; 4HEA 1; 1HTQ A; 2K9X A; 2ZCB A; 4BBN C; 5D3D A; 2L8J A; 1NYQ A; 1IBX B; 1EWC A; 2CR5 A; 3PLV A; 4S0R A; 3TUO A; 2A4Z A; 1L4D B; 2ZCC A; 3NZS A; 3VR8 B; 5LNK 1; 4P7I A; 1FPY A; 1DOX A; 1D5M C; 1ZGU B; 2ZW0 A; 4N59 A; 4II3 B; 1JRU A; 2SAK A; 3JW0 X; 2SEB D; 1M94 A; 5AZH A; 3K9O B; 4JL9 A; 4FN2 A; 4AQ7 A; 4LLG M; 4J3O D; 1JWB D; 1H8C A; 2KJH B; 4MM3 A; 4E74 A; 2KHW B; 1NDD A; 2JZ3 B; 3HM3 A; 4NQL B; 1HXY D; 4W9I A; 2WNM A; 4JQW C; 4LNK A; 3RMK C; 2IYD B; 1XCQ L; 1R4M B; 3L16 A; 2JX5 A; 1C77 A; 4C80 A; 1E90 A; 3A1Q B; 3VR9 B; 1D5Z C; 3A4R A; 2KDM A; 1WWT A; 2PEA A; 4KDI C; 1SSN A; 3HHM A; 4HRO A; 3RCZ A; 3FIL A; 4GIV A; 1SXT A; 3KUC B; 1V1O A; 1KJT A; 1TJE A; 1V1P B; 4JX1 C; 2KDE B; 3BY4 B; 4PYZ A; 3RT3 B; 2W9N A; 4KGT A; 3VTW A; 1N61 A; 3L13 A; 4ICU A; 2DX5 B; 2DYB A; 1TS3 A; 3U8Z A; 1DOI A; 4UDU C; 2KK8 A; 1ZW7 A; 3ZIM A; 1V9J A; 3V61 A; 2LUM A; 2LXA A; 3UI3 A; 2C9W B; 1WR6 E; 3AEB B; 3TBL D; 2E3T A; 1H4R A; 2RPV A; 2N4F A; 1RAX A; 2RDH A; 3Q3M C; 1HTO A; 4NJC A; 2INN E; 4EZL A; 2KDB A; 3O65 B; 4HLE A; 4FJY A; 3FKY A; 3AE3 B; 1R4N B; 2V4L A; 4HXD A; 4G0N B; 3VAW A; 3I9V 1; 4WWM A; 3AB5 A; 5HHD G; 4FJZ A; 3SEB A; 1Q10 A; 2N0S B; 4IKG A; 3AU5 A; 3I57 A; 3SU8 X; 4HPL B; 1MJD A; 3RNC C; 3QA8 A; 3N1X C; 5BMI A; 4CQN A; 2EMS A; 3AMZ A; 4ZRQ A; 3TL5 A; 1LO5 D; 3BVG A; 3BYY B; 3RFZ B; 4XDC A; 3VFK A; 2DYO A; 4DXA B; 1L5P A; 4A55 A; 3QX1 A; 2Q5W D; 1PUT A; 1E7U A; 1WXM A; 4WWN A; 3ML9 A; 1FFU A; 2Y5B B; 1SIJ A; 4IM0 A; 2N1W A; 1L7Y A; 1P0R A; 1F9J A; 2AQ2 B; 3M95 A; 2YLM A; 3URY A; 4ANX A; 2KTR A; 2V9H A; 1T0R C; 3ZTC A; 3SD5 A; 3APC A; 1WX7 A; 4LDT D; 1T0Q C; 2NPT B; 3QWZ B; 1BXT A; 2QIL A; 1WGD A; 3C0R B; 1E8X A; 4W9H A; 4M00 A; 1I35 A; 2DZJ A; 3JSV B; 1WGK A; 2G4D B; 2KFK B; 2YEP F; 3R7R A; 1N6Z A; 4URK A; 2IPK D; 5AZG A; 3KQ4 A; 1P98 A; 1WXV A; 1C79 A; 3Q69 A; 1JML A; 4DHJ D; 1UGJ A; 2QCZ A; 1J8C A; 2HTH A; 3BVM A; 3N1Z C; 4WH4 A; 1A70 A; 1HEZ E; 2IY1 B; 3RNA C; 2PLP A; 2WXH A; 2DHZ A; 2NS5 A; 1B9R A; 2K8C A; 2RMM A; 4QAY A; 2KVR A; 3TCA A; 1MVK A; 1KM7 A; 5KHO A; 3TEY A; 1YD8 U; 3MTN B; 5D6J B; 3M63 B; 4YTN B; 2MHJ A; 1TGZ B; 3V60 A; 1S1Q B; 2W3S A; 2NCN A; 4HK2 A; 2L83 A; 3NG0 A; 3AE9 B; 4NJ6 A; 1SJE D; 3VTU A; 2BYF A; 2KXJ A; 1V2Y A; 3DBH B; 1WY8 A; 3T8M A; 4AS1 A; 3U4E G; 3TMP B; 3ZDM C; 1QOA A; 2WS3 B; 1FXT B; 3ONS A; 1D4B A; 4BKS A; 1P7F A; 4IWO A; 1V86 A; 4MEM A; 2CU3 A; 4DHZ B; 1FRR A; 4M01 A; 1YN3 A; 3PRE A; 2YEP B; 3A33 B; 2IJ0 A; 2K1F A; 2Z0D B; 1HQR D; 4XDD A; 1TS5 A; 1WFY A; 4ANV A; 1IPG A; 1JWU D; 1I42 A; 3UGB B; 2M1M A; 4TQ1 A; 1M4V A; 1XXG A; 2VZK B; 3OG5 A; 4B0M A; 2KDF B; 2VRR B; 2LAS A; 1BUI C; 4BVU C; 1ZXH A; 4B0E A; 2HD5 B; 1FNW A; 4OVZ A; 3DBS A; 2QJL A; 3GE3 C; 4AJY B; 4ZYN A; 2CHX A; 1AWD A; 1ZPS A; 3H1U A; 1SE2 A; 2XK5 B; 4PS7 A; 1XD3 B; 3PZD A; 1L6V A; 1UWX A; 2J42 A; 4K1R B; 4W9K A; 3EC8 A; 1GJZ A; 3AE8 B; 3Q6B A; 2MRP A; 1SB3 C; 4HVB A; 2K25 A; 3DBR I; 1ISN A; 2KKC A; 1J19 A; 1EUV B; 3DVG X; 1TKG A; 3RNB C; 4B9K A; 1C3T A; 1XT9 B; 4FUL A; 4GN1 A; 4RF1 A; 3KUZ A; 1YJI A; 1F2R C; 3GOE A; 1OEY J; 2CHZ A; 2WHI A; 3AE2 B; 1WE6 A; 3FAH A; 2LVP A; 5GXG B; 5E6P A; 1QQR A; 2IO0 B; 4TSS A; 1NYR A; 5AUK A; 4ZHP A; 1V5O A; 1MPE A; 2Z0E B; 3DVN V; 4GGQ A; 4JE3 B; 1C4P A; 3DOW A; 2H89 B; 5E6N A; 1WGY A; 4MDK E; 1UNS A; 3MC8 A; 1V8C A; 5LLI A; 1IUE A; 3ZKJ C; 4C7Z A; 2WXL A; 3SFE B; 1YJ1 A; 2WXK A; 3DHH C; 1VCB A; 3H9D A; 1VZ7 A; 5H92 C; 1PDX A; 3KYC D; 1WYG A; 2BB6 A; 4XX5 A; 2WWZ A; 3V6E B; 1N5W A; 2FCS A; 3V05 A; 4MAC A; 1I7H A; 1YOV B; 1KRH A; 4JLC A; 4NPN A; 2Y5P A; 2VZK D; 4MJS A; 4RMA A; 1JCK B; 4BKT A; 1Q1O A; 3DVG Y; 2D3B A; 3IBE A; 3OJ4 B; 4ZRK A; 2PKO A; 1IYF A; 5T8I A; 3CWI A; 1C1Y B; 3GB1 A; 2JU6 X; 3L10 B; 3UIN B; 4YTP B; 2AWT A; 3B2G A; 4GDK A; 2ZPN A; 3L0W B; 4OZC A; 4ZDV A; 1CMX B; 3X23 A; 2TSS A; 1P3Q U; 1AAR A; 3MC9 A; 1HA5 A; 1JQ4 A; 1WGR A; 3C8Y A; 2BTE A; 2WXQ A; 1NEK B; 2HJ8 A; 2DZM A; 2ZJD A; 1E7V A; 3TEW A; 3Q3N C; 4MSQ B; 2PW9 A; 2QDF A; 3NOB A; 4WUR A; 3WAL A; 2KD0 A; 1B1Z A; 2PTL A; 4NQK E; 1TTN A; 3CMM B; 2WXO A; 2LRU A; 3QIJ A; 2K39 A; 2L05 A; 2X38 A; 5AZF A; 4PK1 A; 3BWU D; 1PFD A; 3B1L X; 4HCN B; 3VUY A; 1XF5 L; 2RDG A; 2L1A A; 1D6E C; 2J0K A; 2L3Z A; 5G5G A; 2J53 A; 3GS2 A; 3WAO A; 2MSE D; 4WWO A; 4YT0 B; 3ETR A; 1ACC A; 2ZEQ A; 1SE3 A; 4B95 A; 4FHK A; 5EE1 A; 3L54 A; 1T5X D; 3AI5 A; 1KF6 B; 1G6J A; 1V49 A; 3PGE A; 1NBF C; 2N1V A; 3GZN I; 4GDK B; 2K6Q A; 1GAQ B; 3I3T B; 1DOY A; 3Q3J A; 4TQ0 A; 4KVG B; 2KAC A; 2D11 A; 3EEC A; 3ZUN A; 5BYQ A; 4H2A A; 1DYQ A; 4DXF A; 3UQB A; 2MBH A; 4RGN A; 4A9A A; 4K3C A; 4B6W A; 3A4S C; 4HPP A; 4Q2J A; 2DAF A; 1WRI A; 2EKE C; 3AEE B; 2WXI A; 3DDC B; 2Z59 B; 3Q14 C; 2PPH A; 3U7Z A; 3A1Q A; 4DDI D; 3IAS 1; 4NAM A; 4FA6 A; 4GXB A; 1GG3 A; 4LCD E; 3WA0 A; 2MP2 B; 2KLG A; 3TIX A; 4HPM B; 1FCL A; 3DBR B; 2N9L A; 2HJ1 A; 4K3B A; 5MPO A; 2BKR B; 2NVU I; 2AX5 A; 3H8H A; 3IT6 B; 2WQY B; 5BO4 B; 1L0X B; 3ZRC A; 3VTV A; 1UBI A; 4CO7 A; 5LXH A; 2W82 A; 1I4H A; 3PZ7 A; 2XN9 C; 1L0V B; 3AE6 B; 1YX5 B; 2IGD A; 4A90 A; 2KOX A; 2V3N A; 4G50 A; 4FAD A; 1KFY B; 3N9Y C; 2FCM A; 2M56 B; 1JWS D; 2C60 A; 4KKI A; 2WLB A; 2XEW A; 3RN9 C; 5E6O A; 1GPX A; 2QHO A; 1ZKH A; 3KWL A; 3H6N A; 1ENF A; 2GI9 A; 2ZNV B; 5FR6 A; 4LK0 M; 1ROE A; 2IGG A; 3QJZ A; 4C00 A; 2DZK A; 4YXD B; 4HWI B; 2XNA C; 3DBH I; 2L7R A; 1Z5S B; 3PRM B; 4XC2 A; 3EA6 A; 1XLP A; 4IG7 B; 3T9L A; 3BZD B; 2ICI A; 3ABV B; 1SE4 A; 4G11 A; 5G55 A; 3DHG C; 1OQY A; 1CQV A; 3IT4 B; 3KVF B; 3W1S A; 4LDT B; 1CJE A; 2O6V B; 1X1M A; 1L0Y B; 1VDV A; 2V4I B; 3P4S B; 4J6I A; 4WQM A; 2KX0 A; 3DQV A; 1TZO A; 4P6V F; 4DHJ B; 5J18 A; 1RYJ A; 2B76 B; 3QHT A; 4ZYS A; 4RNA A; 4BBN F; 2PJH A; 3MJ5 A; 3ALB A; 3IFW B; 4IOI E; 4TMA B; 2L00 B; 5HKH A; 1UGM A; 1OFF A; 1TYG B; 3DWG C; 2CU1 A; 2MLB A; 1AN8 A; 2NPT A; 3MP9 A; 4F1S A; 3NUH B; 3AEF B; 4DK5 A; 4EEW A; 4C4V B; 2D3A A; 1K8R B; 2MBE A; 3DVN U; 3JSV A; 4I6P A; 1E6E B; 1D3Z A; 2KFK A; 3ZRF A; 3Q8C A; 3RI7 C; 1WM3 A; 3LDZ E; 4ASW C; 3KUD B; 3U7D A; 4DDG D; 1FNU A; 3ML8 A; 2LD9 A; 3IAM 1; 1XLN A; 1TY0 A; 1PGB A; 2G45 B; 3VUW A; 4E3C A; 2JXT A; 4JIO U; 3ZXR A; 4BKG A; 4YL8 A; 2LHD A; 1IGC A; 2IY0 B; 1F77 A; 2JZP A; 3GZN B; 3ZLZ A; 5BYR A; 1FCC C; 3RUL A; 1YMH E; 1WSP A; 3O13 A; 4W9L A; 5IA7 A; 2B3A A; 4TKN A; 1WF9 A; 4BOS C; 1F1H A; 2LZ6 A; 1JRP A; 1GB1 A; 5CX3 A; 2WDQ B; 1N62 A; 1VJK A; 2LGI A; 1N63 A; 2O6V D; 3L17 A; 3ZNZ B; 1IP9 A; 1WMH B; 1DGJ A; 3T3O A; 5AEK B; 3PRZ A; 2EKI A; 2RSU A; 3W9C B; 1ESF A; 3VVW B; 3AXC A; 3P63 A; 1ZE3 D; 4WQO B; 3PZ8 A; 1XEE A; 4GLS C; 1FRD A; 1XCT L; 4RM8 A; 5IN7 A; 3ZJT A; 4NAW B; 2JY6 A; 5JHB A; 1CZP A; 1J0G A; 4W9C A; 2G9H D; 2GBM A; 3UQA A; 1VZ8 A; 2IBI B; 3IG3 A; 3ZW3 A; 2ZW1 A; 2KN5 A; 5J2R A; 4I6L B; 1UD7 A; 2KC1 A; 2HE7 A; 1NVI D; 3ZTD A; 2LJ5 A; 3IHP C; 3WAP A; 1WJ6 A; 1OTR B; 2V3S A; 4OHJ A; 2MW5 A; 1ZDX A; 4K81 A; 4AWJ A; 3KYD D; 3NJT A; 2FIF A; 2WDT B; 4PS3 A; 2LMC A; 2XK5 A; 4W9J A; 2GRI A; 4NJ7 A; 4O1N A; 4DBG A; 3ZGZ A; 1T6B X; 3ZJV A; 1PGA A; 5BYS A; 3VRB B; 2WXR A; 1V81 A; 3HVZ A; 1I4Q A; 1RFA A; 2AYO B; 2WDV B; 2DNF A; 3HVD A; 2C7M B; 1E8Z A; 4A3O A; 4N6E B; 1LQB A; 3N30 A; 3V6C B; 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3ZNI D; 2GBK A; 2JXX A; 1WIA A; 2KMM A; 4MGI E; 3AE1 B; 2JSV X; 4MT5 A; 2LGD A; 3RNG C; 4PYU A; 1XLQ A; 1RLF A; 4YTM B; 1NI3 A; 2JPH A; 2KT7 A; 5IO9 A; 1L6U A; 1D5X C; 2BT6 A; 4XWT A; 5D7G A; 2CJO A; 4MGZ E; 3AUL A; 3B08 A; 3EFC A; 2ONQ A; 2M0X A; 3AH7 A; 3AE5 B; 2MEK A; 4M0W B; 2JUO A; 4WJQ A; 2WP9 B; 4HRS A; 4HJG E; 3BII D; 4WAA A; 1TKE A; 1GC6 A; 2AL3 A; 3NY5 A; 3OJ3 A; 2N9E B; 1PQS A; 1WX9 A; 3RPF C; 3T3N A; 1K51 A; 3DWM A; 2FCQ A; 2LGX A; 4OW0 A; 4OZA A; 3I63 C; 3ECI A; 4GU2 A; 3E56 A; 2PE6 B; 4KZ0 A; 2DYM A; 4LNF A; 1WZ0 A; 2HTM E; 2MP2 A; 4FJV B; 2INP E; 2WU5 B; 3PTF C; 2LVQ A; 2EMT A; 4KIK B; 2GBR A; 3APD A; 2MBO A; 2FUH B; 2KX3 A; 2AQ1 B; 3RZW C; 4ANW A; 4KDL B; 1MG4 A; 1UWM A; 1L2N A; 1E7P B; 4LJP B; 3PO0 A; 4K7W A; 5C3J B; 2KN4 A; 1KOT A; 4JPS A; 3ZXV A; 3ZJU A; 3PHX B; 2PMV A; 2LVO A; 1ZDV A; 2G1E A; 3VH3 B; 3KW5 B; 1JWA D; 3APF A; 5CHW A; 2K5P A; 1WJN A; 1K53 A; 4RH6 A; 4XWW A; 2WU2 B; 3HIZ A; 3VHT C; 3LB8 C; 2L0T A; 4RF0 A; 3U52 E; 2KLC A; 3A9K B; 3KH0 A; 3PLU A; 2IDY A; 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