1GEVA

Buried polar mutant human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCETARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
publication title Contribution of polar groups in the interior of a protein to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1gevA00
2C8PA 1JWRA 2BQCA 2ZWBA 5LYTA 1C46A 2AUBA 4OWEA 5APCA 5LIOA 1HFYA 4YEMA 5B06A 5KXLA 3J6KA 3W6EA 4WG1A 1B7LA 1EQ5A 2DQGY 3A96A 1IOSA 3CSRA 4GCCA 4H1PA 1JTTL 2BQHA 3A6BY 3WUMA 2BQDA 1IVMA 4UWVA 1WQOA 1LJ4A 1V7SA 3A3QA 3WU8A 4GCEA 4BS7A 4NHQA 1GB0A 4H9BA 5FELA 2W1MA 4NGLA 1HSWA 2MEDA 3A34A 4PPOA 3CT0A 1LHHA 1HNLA 2HECA 1UIEA 3B0OA 5I4XA 1LSPA 3EO5A 5KXMA 3IJVA 2XJWA 1BGIA 4DWXA 4G4CA 4GCFA 4QGZA 2BQBA 4CJ2A 7LYZA 4RLNA 4H90A 4WM5A 2G4QA 1DXJA 1RCMA 1ZVYB 1J1OY 2YBNA 2ZQ4A 3BKVA 5A3EA 1CJ7A 1OUDA 3WW6A 1I20A 3TMXA 4YEOA 2Z39A 4Z41A 1XGRC 5FCPA 1C08C 1HERA 4ETEA 4G49A 1YAOA 2C8OA 1LZGA 1LJNA 5KJ9A 5F81A 3B6LA 4XJIA 4OWBA 1WQQA 2W1XA 1LMAA 1HEMA 3WMKA 193LA 4TWSA 1GEVA 3WYHA 1GD6A 4NHTA 3ATOA 4X3BA 3IJUA 5KXOA 4LT3A 1GEZA 4NG8A 4W96A 4TX7A 4CHXA 4HPIA 5DL9A 2F4AA 2Y8PA 5F9UA 207LA 5LINA 1B5XA 3ATNA 1IP4A 1B0DA 1IWWA 3ULRA 4GCDA 1GB7A 3G3BB 4WM4A 1GFEA 2BQOA 3FE0A 1WQPA 2D6BA 5EBHA 1EL1A 1GBYA 5KY1A 1LZAA 1LJKA 1LMQA 3RW8A 1W08A 4NEBA 2MEIA 1GF4A 1GE1A 1HFXA 3A91A 3TXHA 5APDA 1B5YA 3TMWA 1DKJA 1H6MA 1A4VA 1IWVA 1GBWA 1UC0A 5L3HA 4Z46A 1GFHA 1XFPL 3TMUA 2MECA 2EPEA 4XJBA 3N9CA 4H94A 2ZQ3A 4N8ZA 4IATA 1BWHA 1IR7A 3W6CA 4I0CA 1GFAA 2HEEA 4HPEA 1VDSA 4B4JA 1BWJA 1YL1X 2YBIA 1HC0A 1IP1A 1ZMYL 3P66A 4NGIA 2ZYPA 4R0FA 5DN4A 1VAUA 2XBSA 1GDXA 1OUJA 4WL6A 2G4NA 1UIHA 5HNCA 4BAFA 1QUTA 4ZFPA 4WLDA 1KIRC 2BQKA 1B7PA 1JEFA 1REMA 1FN5A 3CQLA 1BB5A 4HV1A 1PS5A 1WVVA 3HBEX 1JKDA 1GWDA 2H5ZA 3WW5A 1YILA 3P68A 4LFPA 4DDBA 5IELA 2BQJA 1UACY 1OUAA 1GB8A 2W1YA 1GF6A 4OOTA 1LYZA 1LSFA 5LVKA 3IWRA 5F9XA 2NWDX 3AW6A 1CJ9A 1UIBA 5J7CA 4ET9A 1GFRA 2DBTA 4TSBA 2DQDY 1NBZC 1GXXA 132LA 4PRUA 1NWGA 1LJIA 1EQEA 3M3UA 3N9EA 1AKIA 2FBDA 5I5QA 4NGOA 4XJHA 1HEPA 1BB7A 4OWCA 1B5WA 4LT2A 1F0WA 4AGAA 5I53A 1F6SA 3OK0A 2MEBA 2HEAA 3SP3A 4NGYA 2BQNA 4YENA 4D9ZA 1JKCA 1AT5A 1G7MC 1IC5Y 1JPOA 1UIFA 4A7DA 1LYSA 1JJ3A 3G3AB 4LT1A 1NBYC 4MR1A 4PRQA 4M4OA 4XJDA 1GFGA 4XADA 3WUNA 3CT1A 4M6DA 1UIAA 1B9OA 5KKIA 1QIOA 3MGWA 153LA 2GV0A 1JITA 1LJFA 5B1GA 4YM8A 1C45A 1LZNA 3QNGA 1BB4A 4NG1A 1GF5A 1JISA 4KPMA 5KXYA 4TUNA 3AYQA 3W6DA 2DQCY 4G4HA 1LZ4A 1VDPA 3P64A 1GB2A 5KXKA 4HSFA 1GAYA 1CKHA 2RSCA 1D6PA 3TXKA 1OUEA 1WTMA 1XEJA 3GXRA 2H9JA 2ZIJA 2W1LA 4WG7A 1LHKA 1CKGA 4WO6A 5L9JA 2DQHY 3A95A 3LZ2A 1OUHA 5DN5A 3AZ7A 1MELL 5IHGA 2H9KA 1DZBX 8LYZA 4EOFA 2ZNWY 1SQ2L 1LJGA 1GF8A 1JJ0A 1LSCA 1REZA 1NHEA 3AB6A 2DQFC 5LVGA 1B7SA 5KXSA 1H87A 4LFXA 4II8A 3RNXA 5D5CA 1A2YC 1GF0A 2MEFA 4I8SA 2MEEA 1GE0A 1TEWA 5HNLA 1UUZC 2MEAA 1CJ6A 2I6ZA 1NDGC 1DI4A 1LMCA 2HEBA 1WQNA 3FI7A 1NKHA 4LYZA 3RZ4A 1WVUA 4DD2A 4WLTA 4E3UA 3ZVQB 1LJEA 3A93A 5LAFA 1LMOA 1TCYA 1YKYX 2ZILA 2Z38A 1IOCA 2G4PA 2HUBA 3K3TA 4DD9A 2ZIKA 1WQMA 5B59A 1DPXA 1O23A 2F4GA 5HMJA 4IASA 5LVIA 1KXYA 1UA6Y 1AT6A 4LYOA 3AZ5A 1FKVA 4WL7A 5B07A 1W6ZA 1LYOA 1NF5A 1XEKA 1YIKA 1HEWA 1JUGA 3P4ZA 4NHIA 5I54A 1HEQA 1GF3A 1YAQA 2YDGA 4QEQA 1TAYA 1LMTA 2F30A 1GBOA 1IP5A 6LYTA 4HTQA 1FLQA 1GF7A 1B5UA 2IHLA 1GFJA 1DQJC 1JJ1A 5HQ1A 1LZ6A 4H9IA 1QDRA 2YBMA 4ZIXA 4NFVA 1IP6A 1T6VL 5E4PA 1VFBC 3RT5X 134LA 4NWHA 2Z37A 1G7JC 4RW1A 1YROA 4HP0A 4PHIA 4UWNA 2BLXA 4N0JA 1INUA 1YAMA 1FLUA 1HENA 4Z3MA 1QUSA 1DPWA 3GXKA 4XN6A 1BB3A 1C10A 1LZ8A 2BQMA 5APEA 2BAAA 1GB6A 4WO9A 2F2NA 4B0DA 1IO5A 1D9UA 2BQLA 4DYGA 5LAGA 3RU5A 1DI3A 1LAAA 2Z2FA 1REYA 3WXTA 3CSQA 1BVKC 1LSNA 1YKZX 4J7VA 4DDAA 2FBBA 2LYOA 4BADA 1KIPC 1IWTA 4XJFA 1B5ZA 1RFPA 5HLLA 1IR8A 1RJCB 1OUIA 3WPJA 4DD3A 2N5ZA 1LHIA 4EMNA 4LYBA 5KXTA 1YAPA 1E8LA 133LA 2YVBA 5KXWA 3TXIA 3AGHA 1N4FA 5C6LA 3EMSA 4OW1A 4WMGA 1TBYA 1RE2A 1LSAA 1D0MA 4H9EA 4PGJB 4NWEA 4WOAA 4FDYA 2XTHA 3TXEA 3P65A 5DM9A 1BQLY 1VEDA 3CT5A 1D6QA 5FEKA 1JIYA 1I56A 4CGEA 154LA 5F14A 1SLYA 4LZTA 4AXTA 4CFOA 1OUCA 3N9AA 1LPIA 2X0AA 5C6JA 4Z98A 1GHLA 4J0LA 1V7TA 4H93A 5APFA 5II3A 4OWAA 1NQIA 4GN3A 3W6AA 1IWYA 2DQIY 5LYZA 1LHMA 1IORA 1MLCE 1GBXA 2BQAA 4B4EA 6LYZA 2BLYA 2CGIA 1XEIA 4O34A 1VATA 4G9SA 3ZEKA 5KXRA 3HBDA 1UICA 2A7DA 1CJ8A 3HBHA 1B7MA 2D4IA 5I4WA 2Z2EA 1J1PY 4ETCA 5LVJA 2XBRA 3WVXA 1XSFA 1UIDA 2ZNXY 3QY4A 5FSTA 1IOTA 2VB1A 5K7OA 4HV2A 4LT0A 5E9RA 3A92A 3WPKA 4DDCA 2D4KA 5FDJA 1NMMA 4H9AA 5DLAA 1GFUA 1UCOA 3CB7A 4KT3A 4H92A 4W94A 1XGTC 4DD0A 4PJ2C 1CNSA 3AJNA 1HELA 2DQAA 2Q0MX 2EKSC 1LHLA 2YBLA 3LYMA 1CKFA 1LCNA 1LTMA 1GAZA 1IR9A 3TXBA 5LVHA 1WTNA 2LZTA 4QDNA 1IEEA 5B05A 1FBIX 2YSSC 1D0LA 3WH1A 4NGKA 3TXGA 4KXIA 2D91A 4YOPA 5ILFA 1D0KA 1JKAA 1HSXA 1JTPL 4MCKA 4WM3A 5M1YA 1LKSA 5C6IA 2Z18A 1LZDA 4P2EA 1C7PA 1QSWA 3QE8A 1F10A 5AMYA 1IP2A 4ETBA 1KIQC 1IP3A 2BPUA 4J1BA 1B2KA 3E3DA 3LYZA 4H8XA 1LJJA 3B0IA 1AZFA 1IX0A 4DD7A 3EXDA 1VDQA 1GB5A 1LSEA 3CSZA 4KL7A 4NY5A 3ZVQA 3KAMA 1PZYA 1GFVA 2DKVA 1WQRA 4RDSA 3W6BA 5L3IA 4DT3A 1LZRA 1LYYA 5KKJA 1QTEA 4L41A 1C43A 1YL0X 3AGIA 1XGUC 3AZ4A 5KXXA 1YANA 4NSHA 1LZBA 3HFMY 1GE2A 1LSDA 3BKHA 5A3ZA 2BQIA 3WU9A 4TTDA 1YKXX 4NGWA 1GDWA 4XJGA 194LA 1F6RA 4HTNA 1GB3A 4RLMA 3WUAA 3WULA 1GFTA 2CJLA 4J1AA 4WM1A 2LYMA 1CKCA 4DD1A 1HMKA 1LZYA 3A67Y 4G4BA 1BWIA 2LZ2A 1KXWA 4N1EI 4WLXA 1QSAA 5LA8A 1GBZA 3D3DA 5KXPA 1B7RA 4H8YA 4XENA 2HEFA 2ZYCA 5JENB 1IWUA 2LYZA 1QDTA 4HJYA 1HMLA 2HTXA 3TXJA 1LZ5A 4NHPA 2I25L 4WM2A 1IWXA 1B7NA 3LN2A 4UWUA 1G7HC 1AM7A 2Z19A 1DI5A 4GLVA 2A7FA 1LSBA 1LSGA 1QQYA 2HU3A 1RI8B 3A90A 2HU1A 4XYYA 1LZTA 4BAPA 3M18B 3A6CY 4H9CA 4YF2A 1Z55A 1OP9B 4NSGA 1IP7A 2CDSA 9LYZA 4GLAA 1G7LC 1BVXA 3WVYA 5T3FA 1ZV5L 1GPQC 1REXA 3A3RX 4H8ZA 2FYCA 5FHWA 2CWIA 1HEOA 1LSZA 3B0KA 5I4YA 1IY3A 1HHLA 4B1AA 1GXV2 4NHSA 1OUBA 3AW7A 2WARA 2I26L 3J4GA 4NSIA 1OUFA 3TXDA 1GE3A 3B72A 4LYMA 1OQMA 5LXWA 1IIZA 3LZTA 3D9AC 1G7IC 1JKBA 1HF4A 1TDYA 3LYOA 4HJZA 2IFFY 4LYCA 4ZEEA 3VWOA 1GB9A 2B5ZA 3AGGG 2MEHA 5KXZA 4OWHA 4H9FA 4B49A 2DQEY 4N5RA 4GCBA 4GN4A 2MEGA 3A94A 3TXFA 2Z12A 4RW2A 5ILCA 1EQ4A 1J1XY 1OUGA 2DQJY 1JSFA 4IJ4A 1YQVY 4NGZA 4ETDA 1P2CC 4R6CA 1FLYA 5D5FA 1LJ3A 3W3EA 4C3WA 4CFPA 2YBJA 4H91A 1LKRA 1UIGA 3A8ZA 4NIJA 4QY9A 2PC2A 1LZSA 2HEDA 2EIZC 1LSYA 4NGVA 4ETAA 1IY4A 4LGKA 1LJHA 3W6FA 4U3XB 1GE4A 208LA 1GFKA 3AZ6A 4HTKA 1FDLY 4NGJA 1DKKA 2BQGA 1LZEA 4H9HA 1LMPA 1LZCA 1CKDA 3OJPA 3WL2A 4HJVA 4B4IA 1KXXA 1IC7Y 1B7OA 1GF9A 5F16A 3WXUA 5LYMA 5HMVA 2YBHA 1GBSA 4C5FA 4ML7A 4NSJA 5B1FA 1IOQA 1LZ9A 4OOOA 2BQEA 3EBAB 1NDMC 1ALCA 1ZVHL 1HFZA 2EQLA 4ANRA 1LZ1A 3LYTA 1VDTA 1FKQA 5KXNA 3LHMA 1I1ZA 1UBZA 3T6UA 1B5VA 4N9RA 1BHZA 1LOZA 1LSMA 1JTOL 2D4JA 4ET8A 2FYDA 3TMVA 1IC4Y 1XGPC 2BQFA 3T36A 4DC4A 4LYTA 3WU7A 1JSEA 2LHMA 1IWZA 4N1CC 1T3PA 1XGQC 5LA5A 1JHLA 1FLWA 1QTKA 1LMNA 4GN5C 4TSCA 4WM6A 3F6ZA 5IDDA 135LA 4FJRA 1B7QA 4MSTA 1BB6A 1LHJA 3WPLA 4WLYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2C8PA 2AUBA 5APCA 1CU2A 2LC9A 3OE0A 1IOSA 1JTTL 1L58A 3A6BY 1LGWA 3WUMA 2HUKA 1WQOA 3NYAA 4H9BA 1LYFA 4NGLA 1HSWA 2MEDA 3A34A 3CT0A 3B0OA 1LSPA 1G1VA 1PQDA 3IJVA 2XJWA 4DWXA 4GCFA 152LA 262LA 3BKVA 4W59A 3TMXA 1C08C 1LJNA 4OWBA 1HEMA 4ARJA 4NHTA 3ATOA 4X3BA 3IJUA 4NG8A 4W96A 2B72A 5DL9A 2F4AA 2Y8PA 155LA 1B5XA 3ULRA 1PQKA 1GB7A 231LA 1WQPA 149LA 1GBYA 3RW8A 1W08A 3TXHA 1HFXA 3A91A 1JTMA 3TMWA 1DKJA 5LZMA 1IWVA 1GBWA 4Z46A 2MECA 3N9CA 4H94A 2ZQ3A 4N8ZA 3DNAA 1BWHA 1L33A 1GFAA 4B4JA 1D3FA 3P66A 1GDXA 1OUJA 3HT6A 5HNCA 4ZFPA 2BQKA 1JEFA 3CQLA 1L53A 1WVVA 221LA 3WW5A 4LFPA 5IELA 197LA 1OUAA 2W1YA 7LZMA 4OOTA 1NHBA 3IWRA 3AW6A 3V2YA 1QTZA 4TSBA 1SWZA 1L96A 1DYDA 5I5QA 1HEPA 4PJZA 4DAJA 1F0WA 2MEBA 2HEAA 4NGYA 2BQNA 4YENA 1IC5Y 1L91A 1UIFA 4A7DA 1LYSA 3G3AB 4LT1A 4M4OA 4XADA 3WUNA 236LA 1L88A 1LZNA 4NG1A 5KXYA 256LA 2RSCA 3TXKA 2W1LA 5L9JA 2DQHY 1C63A 4W53A 1LWKA 1LJGA 3AB6A 225LA 2DQFC 139LA 5D5CA 1A2YC 2OU0X 2MEEA 2MEAA 2I6ZA 253LA 1C6CA 2A4TA 2HEBA 4LYZA 1WVUA 1LMOA 2Z38A 1P6YA 4DD9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2C8P A;  1JWR A;  2BQC A;  2ZWB A;  5LYT A;  1C46 A;  2AUB A;  4OWE A;  5APC A;  5LIO A;  1HFY A;  4YEM A;  5B06 A;  5KXL A;  3J6K A;  3W6E A;  4WG1 A;  1B7L A;  1EQ5 A;  2DQG Y;  3A96 A;  1IOS A;  3CSR A;  4GCC A;  4H1P A;  1JTT L;  2BQH A;  3A6B Y;  3WUM A;  2BQD A;  1IVM A;  4UWV A;  1WQO A;  1LJ4 A;  1V7S A;  3A3Q A;  3WU8 A;  4GCE A;  4BS7 A;  4NHQ A;  1GB0 A;  4H9B A;  5FEL A;  2W1M A;  4NGL A;  1HSW A;  2MED A;  3A34 A;  4PPO A;  3CT0 A;  1LHH A;  1HNL A;  2HEC A;  1UIE A;  3B0O A;  5I4X A;  1LSP A;  3EO5 A;  5KXM A;  3IJV A;  2XJW A;  1BGI A;  4DWX A;  4G4C A;  4GCF A;  4QGZ A;  2BQB A;  4CJ2 A;  7LYZ A;  4RLN A;  4H90 A;  4WM5 A;  2G4Q A;  1DXJ A;  1RCM A;  1ZVY B;  1J1O Y;  2YBN A;  2ZQ4 A;  3BKV A;  5A3E A;  1CJ7 A;  1OUD A;  3WW6 A;  1I20 A;  3TMX A;  4YEO A;  2Z39 A;  4Z41 A;  1XGR C;  5FCP A;  1C08 C;  1HER A;  4ETE A;  4G49 A;  1YAO A;  2C8O A;  1LZG A;  1LJN A;  5KJ9 A;  5F81 A;  3B6L A;  4XJI A;  4OWB A;  1WQQ A;  2W1X A;  1LMA A;  1HEM A;  3WMK A;  193L A;  4TWS A;  1GEV A; 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 3VWO A;  1GB9 A;  2B5Z A;  3AGG G;  2MEH A;  5KXZ A;  4OWH A;  4H9F A;  4B49 A;  2DQE Y;  4N5R A;  4GCB A;  4GN4 A;  2MEG A;  3A94 A;  3TXF A;  2Z12 A;  4RW2 A;  5ILC A;  1EQ4 A;  1J1X Y;  1OUG A;  2DQJ Y;  1JSF A;  4IJ4 A;  1YQV Y;  4NGZ A;  4ETD A;  1P2C C;  4R6C A;  1FLY A;  5D5F A;  1LJ3 A;  3W3E A;  4C3W A;  4CFP A;  2YBJ A;  4H91 A;  1LKR A;  1UIG A;  3A8Z A;  4NIJ A;  4QY9 A;  2PC2 A;  1LZS A;  2HED A;  2EIZ C;  1LSY A;  4NGV A;  4ETA A;  1IY4 A;  4LGK A;  1LJH A;  3W6F A;  4U3X B;  1GE4 A;  208L A;  1GFK A;  3AZ6 A;  4HTK A;  1FDL Y;  4NGJ A;  1DKK A;  2BQG A;  1LZE A;  4H9H A;  1LMP A;  1LZC A;  1CKD A;  3OJP A;  3WL2 A;  4HJV A;  4B4I A;  1KXX A;  1IC7 Y;  1B7O A;  1GF9 A;  5F16 A;  3WXU A;  5LYM A;  5HMV A;  2YBH A;  1GBS A;  4C5F A;  4ML7 A;  4NSJ A;  5B1F A;  1IOQ A;  1LZ9 A;  4OOO A;  2BQE A;  3EBA B;  1NDM C;  1ALC A;  1ZVH L;  1HFZ A;  2EQL A;  4ANR A;  1LZ1 A;  3LYT A;  1VDT A;  1FKQ A;  5KXN A;  3LHM A;  1I1Z A;  1UBZ A;  3T6U A;  1B5V A;  4N9R A;  1BHZ A;  1LOZ A;  1LSM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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