The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
59
|
structure length |
59
|
Chain Sequence |
GSTYVQALFDFDPQEDGELGFRRGDFIHVMDNSDPNWWKGACHGQTGMFPRNYVTPVNR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
Solution structure and ligand-binding site of the carboxy-terminal SH3 domain of GRB2.
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Adaptor protein containing sh2 and sh3
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source organism |
Homo sapiens
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molecule keywords |
GROWTH FACTOR RECEPTOR-BOUND PROTEIN 2
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total genus |
8
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structure length |
59
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sequence length |
59
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ec nomenclature | |
pdb deposition date | 1994-06-13 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GBQ A; 4J9H A; 4Z89 A; 1OV3 A; 1ABQ A; 1W70 A; 1NYG A; 1AD5 A; 2AK5 A; 3H0H A; 1SHF A; 1HSQ A; 4CC4 B; 1NG2 A; 2C0I A; 2KRN A; 1RLP C; 2LJ3 A; 2KEA A; 4OML A; 2J6O A; 2ROL A; 2W0Z A; 2L0A A; 4LE9 A; 5IHK A; 2RNA A; 1PHT A; 2OI3 A; 2FPF A; 3I5S A; 1JXM A; 3M0Q A; 2HCK A; 2V1R A; 4GBQ A; 4RTZ A; 4AFQ C; 2FRW A; 2J06 A; 1OOT A; 2ENM A; 1M27 C; 3ZL7 C; 2W10 A; 2DF6 A; 1WIE A; 5IXB A; 3ULR B; 1PNJ A; 2K2M A; 3H0I A; 1AWJ A; 4AFZ C; 1K0S A; 1HJD A; 2H8H A; 2LZ6 B; 1KFZ A; 1YP5 A; 2AKL A; 4CC3 A; 3CQT A; 3EG1 A; 2DL5 A; 2DX1 A; 2DL8 A; 1X6B A; 1B3Q A; 2JS0 A; 3FJ5 A; 3U23 A; 1X2K A; 1CKB A; 2B86 A; 4D8K A; 2ED1 A; 3VS7 A; 4F14 A; 4J9E A; 2O9V A; 4J9C A; 1GL5 A; 2KT8 A; 1BB9 A; 1QKX A; 2A37 A; 4Y92 A; 4GLM A; 4JZ4 A; 1V1C A; 3M0P A; 1WXB A; 4EIK A; 2DIL A; 3I9Q A; 4ORZ A; 1VYU A; 2X3X D; 1H3H A; 1WXT A; 1MUZ A; 5I11 A; 2YT6 A; 3VS5 A; 4AG1 C; 2EGA A; 2IIM A; 2CH4 A; 2RMO A; 2DMO A; 1X69 A; 2K3B A; 3M0T A; 1NLO C; 2CSQ A; 2AZV A; 2DLP A; 4JJB A; 1AVZ C; 2LX7 A; 1SPK A; 5FW9 A; 3VS6 A; 1HD3 A; 4RTT A; 2LQN A; 3A98 A; 1CKA A; 2PTK A; 4DEX A; 2K7A A; 1FMK A; 1Y57 A; 1JXO A; 1UHF A; 1WX6 A; 2DYB A; 1E6H A; 1ZX6 A; 4LNP A; 1E7O A; 4HVU A; 2DNU A; 4OMN A; 2CT4 A; 1EFN A; 4OMP A; 2L3Q A; 1PKT A; 1T3S A; 1WI7 A; 1Y0M A; 2JMC A; 5EC7 A; 1RI9 A; 1SRM A; 4J9F A; 1IO6 A; 1GFD A; 1T3L A; 4J9B A; 1GBR A; 2M0Y A; 1Z9Q A; 4AG2 C; 2KRO A; 4ZNX A; 3EG0 A; 2RQU A; 4LUE A; 1GRI A; 4D8D A; 2QDL A; 4RTU A; 2D8H A; 1G2B A; 2DJQ A; 4Z8A A; 2KE9 A; 2CRE A; 2YUQ A; 1E6G A; 2JW4 A; 4RTY A; 3UF4 A; 2KRM A; 1UJ0 A; 1N5Z A; 3EHR A; 1UTI A; 1BBZ A; 1WXU A; 5IHN A; 1X27 A; 1K0X A; 1X2Q A; 2KXD A; 2MOX A; 1WDX A; 3UA7 A; 4KRT A; 4RTW A; 1T0J A; 1MV3 A; 4J9I A; 1LCK A; 2JXB A; 2JT4 A; 2L2P A; 2DL7 A; 2KNB B; 4HCK A; 5FWC A; 1SHG A; 4OMM A; 2J7I A; 1QLY A; 2YUP A; 3RBB B; 2PZ1 A; 1SSH A; 2RQW A; 2KYM A; 2CT3 A; 5IHI A; 2HDA A; 1BU1 A; 2LP5 A; 2VWF A; 1ZUK A; 1I07 A; 3UA6 A; 4AFS C; 1TG0 A; 1I0C A; 2BZ8 A; 4RUG A; 2AKK A; 2KBT A; 2KYB A; 3REA B; 4J9D A; 2A08 A; 1PKS A; 3NGP A; 4OMQ A; 5IH2 A; 3H0F A; 2EKH A; 1I1J A; 1JU5 C; 4X1V A; 2D8J A; 1AZE A; 1W1F A; 2F2W A; 1UEC A; 3EG3 A; 1M3A A; 1VYT A; 2BZY A; 1VA7 A; 2O9S A; 2EPD A; 5GJW B; 1PWT A; 2KGT A; 2KXC A; 1K76 A; 1S1N A; 2ECZ A; 4M4Z A; 1UHC A; 3QWX X; 4IIO A; 3H41 A; 4OMO A; 2DE0 X; 2DRK A; 1PRM C; 1OPK A; 2VVK A; 2J6K A; 1AEY A; 3SHW A; 2I0N A; 2D0N A; 4IIM A; 3EGU A; 2YUO A; 2FG0 A; 1UDL A; 2ESW A; 2YDL A; 1GCQ C; 3LH5 A; 4Z88 A; 1ZLM A; 1UGV A; 2DM1 A; 1BK2 A; 1AWW A; 4K11 A; 3I35 A; 1M3C A; 1U3O A; 3NHN A; 1ZSG A; 2DRM A; 1K9A A; 1B07 A; 3M0R A; 1Z9Z A; 2DL4 A; 5HCK A; 1AZG B; 2JS2 A; 4QT7 A; 2C0O A; 2OJ2 A; 2HEQ A; 2M51 A; 1J3T A; 1AWO A; 2GTJ A; 2K6D A; 2X3W D; 3M0U A; 2BZX A; 1M30 A; 1WA7 A; 3VRZ A; 4CC7 A; 1KJW A; 5L23 A; 2NUZ A; 2XMF A; 4HVW A; 1NEG A; 1X43 A; 2O2O A; 5I22 A; 1JO8 A; 1KSW A; 1MV0 B; 4JJD A; 1TUC A; 2CSI A; 2FRY A; 1RUW A; 2V1Q A; 1H92 A; 1YNZ A; 2RPN A; 1U06 A; 1ABO A; 3THK A; 4HVV A; 1UG1 A; 2P4R A; 2LJ1 A; 2JM9 A; 2ABL A; 2YSQ A; 2EGC A; 2DVJ A; 2L3S A; 1H8K A; 1T0H A; 4F17 A; 4LN2 A; 2EYY A; 1XOV A; 5ECA A; 2BTT A; 2HSP A; 2YUN A; 2LMJ A; 1UE9 A; 2J6F A; 4R0K A; 2J05 A; 2CDT A; 2RN8 A; 3VS2 A; 2EBP A; 2OAW A; 1JEG A; 2CUD A; 2KT1 A; 2DBK A; 3TSZ A; 1M3B A; 4JPB W; 2GTO A; 2NWM A; 2SRC A; 2O31 A; 4WCI A; 2DL3 A; 3EHQ A; 2FEI A; 2ED0 A; 1UUE A; 1OEB A; 2KR3 A; 2F2V A; 1SEM A; 1GFC A; 2EVR A; 3VS1 A; 1UFF A; 4HXJ A; 2F2X A; 2FO0 A; 3PVL A; 1K4U S; 4JJC A; 2A28 A; 2ROT A; 2L3P A; 3NPF A; 4J9G A; 2VKN A; 3R6N A; 4ESR A; 4A63 B; 2LNH B; 2MCN A; 2LJ0 A; 3PVQ A; 1A0N B; 1GCP A; 3VS4 A; 1QKW A; 1TUD A; 1JQQ A; 1OPL A; 1U5S A; 2JMA A; 3KFV A; 2O88 A; 2RQV A; 2GGR A; 2FPD A; 2A36 A; 4RTV A; 1ZBJ A; 2EYZ A; 1KIK A; 3QWY A; 5GJV B; 1NLP C; 2JTE A; 1WFW A; 4F16 A; 2EQI A; 1G83 A; 1AOJ A; 1NM7 A; 3PE0 A; 2C0T A; 2CH4 W; 2KRS A; 3TVT A; 2EW3 A; 2DBM A; 2LQW A; 3VRY A; 4JZ3 A; 3UAT A; 2GBQ A; 1QWE A; 2E5K A; 1ARK A; 1W6X A; 1X6G A; 3VS0 A; 1M8M A; 4DEY A; 4FSS A; 2GQI A; 2EYW A; 2K79 A; 1FYN A; 4LUD A; 2SEM A; 1NEB A; 2LCS A; 1YWO A; 2K9G A; 1WLP B; 1CSK A; 3C0C A; 2MIO A; 4AFU C; 2EYX A; 2HBW A; 3NMZ C; 5FWB A; 2CUB A; 2AZS A; 2JM8 A; 1K1Z A; 2GNC A; 3REB B; 3JV3 A; 1PRL C; 2G6F X; 4E6R A; 2EGE A; 3EG2 A; 1AWX A; 3GBQ A; 1YCS B; 2FPE A; 1WYX A; 1QCF A; 2DA9 A; 4CC2 A; 5IXF A; 2D1X A; 1YWP A; 1GCQ A; 3RNJ A; 3TSW A; 1ZUU A; 1QWF A; 3SEM A; 2PNI A; 3VS3 A; 1UJY A; 3M0S A; 2RQR A; 3I5R A; 1ZUY A; 2RQT A; 4RTX A; 2RF0 A; 1NYF A; 1SRL A; 3IQL A; 3O5Z A; 1VYV A; 1YN8 A; 1RLQ C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1V29 B; 1JJ2 A; 1QVG P; 1OV3 A; 3GPL A; 1NYG A; 4M77 B; 4XU3 A; 2JJ9 A; 2GQV A; 4ME7 A; 5J3B A; 3FIF A; 3ME9 A; 5GAN g; 4ZN3 A; 2KEA A; 4XTZ A; 1YHQ T; 2NLU A; 3OS2 A; 5CQY A; 1D1C A; 2RNA A; 1BYM A; 3G71 A; 2IG0 A; 3I5S A; 4GBQ A; 2QGG A; 1EZZ B; 2E4H A; 4N4G A; 1YJ9 A; 1WIE A; 1D1A A; 4KH1 B; 3ULR B; 3G4S A; 4QVC A; 2QA4 A; 3CCS Q; 2K2M A; 1K0S A; 2RB6 A; 4PJO E; 1YP5 A; 3L2V A; 2AKL A; 3CQT A; 1KC8 U; 2ZAE A; 4O6J A; 1B3Q A; 3FJ5 A; 1V76 A; 2B86 A; 1KQ2 A; 3VS7 A; 1M1K C; 2F5T X; 2O9V A; 1GL5 A; 1QKX A; 1K9M U; 1VQK A; 4C0G A; 1V1C A; 2VC8 A; 2WSF E; 4DBF A; 4XU0 A; 4J6X A; 1LOJ A; 3AHU A; 1H3H A; 1F1B B; 1WXT A; 2YT6 A; 2EGA A; 5I21 A; 2C06 A; 1X69 A; 1EIF A; 1Y96 A; 3M0T A; 1NLO C; 1N6A A; 2CSQ A; 4NL2 A; 2WSC E; 1AVZ C; 1M9S A; 4JJB A; 5GAN h; 3JCM g; 4C8Q E; 3I56 T; 1N8R R; 2M16 A; 1UHF A; 4C92 G; 2DYB A; 1E6H A; 3OSV A; 2DVE A; 4EMK A; 2MI6 A; 2EJG A; 2G3R A; 2RHZ A; 3G6E Q; 2K5L A; 4X9C A; 1PKT A; 3JCM J; 3GNG A; 3CC2 T; 3CCU A; 3QII A; 5DLO A; 5HK3 A; 2X4Y A; 3CCL Q; 2EQU A; 2X4X A; 1Z9Q A; 2RH2 A; 4AG2 C; 3CCE Q; 3EG9 B; 3SWN B; 4M7D F; 4NOY A; 1P92 A; 3MP1 A; 4MMK A; 3EGD A; 4RTU A; 1OYX A; 1WZO A; 4B6M A; 1VQ8 Q; 1MMD A; 1G2B A; 3HSB A; 4Z8A A; 4TVR A; 5C0M A; 2YUQ A; 4ZGD B; 3QYG B; 4C92 F; 3L2Z A; 4LDV A; 1N5Z A; 2VYT A; 4F7U F; 2HSE B; 2FYK A; 4J6W A; 1VQ6 T; 1K0X A; 4JS4 A; 2NYS A; 4KRT A; 4RTW A; 2OAU A; 4BAC A; 2M02 A; 2JT4 A; 5KYN A; 4BUG A; 1SHG A; 4DBQ A; 4OMM A; 2O01 E; 5I2M A; 3GOX A; 2XI9 A; 2YUP A; 1FMW A; 2ZPB B; 1K9M C; 5A2Q E; 3OMG A; 2RJD A; 2LRQ A; 3CCS A; 2KYM A; 4RG8 A; 1BU1 A; 1N9S A; 3JCM h; 2HD0 A; 3E9F A; 3P8D A; 1I07 A; 4OP0 A; 4J8O A; 1QVG S; 1MNE A; 2DD4 A; 1TS9 A; 1BIA A; 1PKS A; 2VGM A; 1IZ6 A; 1OX9 A; 3KUF A; 2DTO A; 2EKH A; 1I1J A; 1JU5 C; 2IVW A; 2OTL Q; 4NS5 A; 4Q5W A; 5HK0 A; 1TSF A; 1VUB A; 3DB4 A; 4C8Q C; 2BZY A; 1VA7 A; 3VU3 C; 3EH2 A; 3FJP A; 4GLK A; 1K76 A; 3V7S A; 3CXC A; 3RMQ A; 5FRN A; 3QWX X; 4IIO A; 3H41 A; 2DE0 X; 2DAQ A; 2DRK A; 1KHI A; 1B34 B; 1I5L A; 1LVK A; 2J6K A; 3FDR A; 1AEY A; 3SHW A; 1YIJ Q; 2I0N A; 2YUO A; 3PT9 A; 1UDL A; 2ESW A; 3OW2 P; 2ZZD A; 1VQ5 Q; 1BK2 A; 3UDC A; 3ER0 A; 3GP8 A; 2RO0 A; 1M90 R; 5GAN e; 1M3C A; 4M78 C; 3NHN A; 1K9A A; 3DLL A; 2OJ2 A; 3CCE A; 2M51 A; 1J3T A; 3KXT A; 1AWO A; 2Z0W A; 3VRZ A; 4CC7 A; 4RG2 A; 1D0Z A; 1YFN A; 5L23 A; 3EFS A; 4BE1 A; 2NUZ A; 2CZ6 B; 3QBY A; 3RER A; 4IUV A; 5I22 A; 1JO8 A; 4JJD A; 3VV0 A; 1W2B P; 2FRY A; 1RUW A; 2QEX Q; 1U06 A; 4WTO B; 1VQO T; 3NTK A; 2DO3 A; 1UG1 A; 1WJR A; 2JM9 A; 2YSQ A; 6AT1 B; 1WJQ A; 3OYB A; 1T0H A; 2X51 A; 3CCV Q; 2EYY A; 2V8I A; 5ECA A; 2LQK A; 2BTT A; 3CD6 Q; 2QAZ A; 2A3L A; 4FYV B; 3QJ6 A; 2EBP A; 2COZ A; 3A5Z B; 5CQX A; 5CKB A; 1M1K R; 4F7U B; 2QI2 A; 4PJO F; 1UGR B; 2NWM A; 2OTJ T; 2EQJ A; 2O31 A; 1K8A C; 3C4S A; 3RR6 A; 2FEI A; 1VQP Q; 3QHS A; 1UUE A; 2KR3 A; 4M7D D; 2F2V A; 3VS1 A; 5GAN f; 2E64 A; 4FYY B; 4HXJ A; 4OGE A; 2DIG A; 2F2X A; 2KK4 A; 4KUL A; 3OYD A; 5AYF A; 2XK0 A; 3TEE A; 3FEO A; 3BE3 A; 2L3P A; 2OTL A; 4J9G A; 2VKN A; 4E7H A; 3JCM e; 3C12 A; 2E65 A; 3OQ5 A; 2K2V A; 2QAS A; 4C92 D; 2LT1 A; 5LJ3 e; 4B9W A; 3PVQ A; 2E41 A; 3S6W A; 3VS4 A; 3JB9 J; 1OPL A; 3HL8 A; 2JMA A; 3URG A; 3KFV A; 3OYG A; 2RQV A; 2GGR A; 2FPD A; 5GAM j; 2A36 A; 3BFM A; 1VQ4 Q; 1ZBJ A; 3PIO A; 1KIK A; 5J26 A; 5L8R E; 1YJN T; 2A0F B; 1KQS A; 4M78 G; 3HTR A; 1LNX A; 2EQI A; 5D7U A; 4C8Q F; 1AOJ A; 3GNF B; 1Y7X A; 1VQM A; 5KYW B; 3UPU A; 4V2S A; 4JLI A; 2NUP B; 2CH4 W; 3FB9 A; 4EMK C; 3OYJ A; 3SB2 A; 1M2O A; 1ZSZ B; 1TH7 A; 4GY5 A; 3UAT A; 2GF7 A; 1LJO A; 1UGQ B; 2RI2 A; 1M8M A; 4A4H A; 4HKE A; 2K79 A; 1S72 Q; 2R5M A; 2P0P A; 1FYN A; 1Q7Y R; 2DK3 A; 2SEM A; 2K3X A; 1NEB A; 3JB9 I; 8AT1 B; 4JRQ A; 4E7I A; 2MIO A; 2EYX A; 1WNL A; 3NMZ C; 4IUQ A; 4M77 G; 1IRX A; 2GNC A; 2H3E B; 2RHI A; 1PRL C; 2VXF A; 1YCS B; 5GAN 7; 2DA9 A; 4J83 A; 3EAE A; 3JCM f; 5FU7 C; 2LNV A; 4X34 A; 3TSW A; 2QEX A; 5LJ3 f; 4UC4 A; 1QWF A; 1YI2 Q; 4J7F A; 2KI7 A; 2PNI A; 3VS3 A; 1Y07 A; 4C0D C; 3OW2 S; 2ZGW A; 2RQT A; 2RF0 A; 2EFI A; 2HKN A; 3CCV A; 2DXU A; 1YN8 A; 5FWC A; 2DET A; 2RHU A; 5CK9 A; 4C5I A; 1W70 A; 5GMK j; 5A0D A; 4N4H A; 5GAN 5; 2MK5 A; 5KE2 A; 3CCR T; 2RJC A; 3RES A; 2RJF A; 4PFP A; 2KRN A; 2COY A; 4L59 A; 4M75 B; 4OF1 A; 3HRU A; 4PLL A; 1VQP A; 4OML A; 2JOY A; 1BCO A; 3CME Q; 2ROL A; 3QZ9 B; 3CCQ Q; 5KYU A; 2HQE A; 5AT1 B; 1YJ9 T; 4AT1 B; 2FPF A; 1N9R A; 4DOV A; 3RMS A; 2J06 A; 1OOT A; 3VYG A; 5GAO l; 3MP8 A; 1W2B S; 2JTF A; 5I2S A; 1K73 U; 2DF6 A; 4IUR A; 3CBP A; 3M4Y A; 1PNJ A; 2CS7 A; 5LJ5 d; 4BDZ A; 3JB9 G; 3H0I A; 4M7A B; 3OYM A; 5IT9 E; 2LZ6 B; 2EQK A; 1SF9 A; 3OS0 A; 1Q81 C; 3OYH A; 2DL5 A; 2DL8 A; 2JS0 A; 1VQK T; 1WHM A; 1RAF B; 2XDB A; 2E1H A; 2ED1 A; 3LGL A; 4Y92 A; 4ZGE B; 3HP9 A; 4GLM A; 5GAN 4; 3MEU A; 2CZ1 B; 1Q95 G; 1YIT Q; 1VQ7 Q; 2X3X D; 3A8O B; 1S72 A; 2IIM A; 5GAN 8; 4YTL A; 2LQ8 A; 1UGS B; 3M55 A; 2DLP A; 3NFC A; 3WVE B; 4QQD A; 5FW9 A; 2ZPH B; 1HD3 A; 2LQN A; 1CKA A; 2DD5 A; 2PTK A; 3LH0 A; 2K7A A; 2QTX A; 5GMK l; 1RAH B; 4Y28 E; 1Y57 A; 3JRZ A; 1WX6 A; 4CI0 C; 1XJW B; 1Q86 U; 1ZX6 A; 3R6O A; 4HVU A; 3GLX A; 3CCU T; 4OMN A; 2CT4 A; 3LYI A; 4JDS A; 3V8K A; 4PLI A; 2L3Q A; 4OMP A; 2QQR A; 1T3S A; 1YJW Q; 1RI9 A; 2YLB A; 1SRM A; 2K57 A; 3ZFJ A; 1G8X A; 2PUO B; 1RAD B; 2E70 A; 1VQN Q; 1GBR A; 2M0Y A; 1K8A R; 4BI4 A; 4M78 A; 1KG1 A; 3EG0 A; 3H8Z A; 3PIP A; 2HQH A; 4D8D A; 3MEA A; 1WQ7 A; 4EMH A; 3GIB A; 4Y91 A; 1VOM A; 1FWZ A; 2JW4 A; 1K73 C; 4RTY A; 4FYW B; 3M57 A; 2KRM A; 1UJ0 A; 3CME A; 3EHR A; 2MMP A; 1BBZ A; 1ZA2 B; 2ZPF B; 1X27 A; 1XNI A; 4FT4 A; 4FCY A; 4M78 D; 5KYY B; 2MOX A; 3UA7 A; 1FXX A; 5KE3 A; 4E7K A; 1T0J A; 4MZM A; 2YRC A; 1R0C B; 3MPU B; 2DZC A; 3A8L B; 2DL7 A; 2KNB B; 3JCM c; 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