1GHLA

The three-dimensional structure of pheasant and guinea-fowl egg lysozymes
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
GKVYGRCELAAAMKRMGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTGATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCHIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRKHCKGTDVNVWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords PHEASANT EGG WHITE LYSOZYME
publication title Crystal structures of pheasant and guinea fowl egg-white lysozymes
pubmed rcsb
source organism Phasianus colchicus
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ghlA00
1JTPL 1QTKA 2W1MA 5FSTA 1B5YA 5F81A 1HMKA 2RSCA 6LYTA 1QUSA 1CJ9A 4IATA 5B06A 3HBHA 1WQOA 3CT1A 1TDYA 4DD2A 194LA 4H9CA 4IASA 2DBTA 1IEEA 2BQLA 1CKGA 1LJHA 2MEEA 1CJ8A 4WM1A 1GF7A 4Z41A 1BGIA 1IWTA 2CDSA 2HEEA 5APFA 1B2KA 1IP1A 1GFVA 2EIZC 1HNLA 1UCOA 4FDYA 4H92A 4WL7A 3ZEKA 4C5FA 5KXWA 4MCKA 1LZTA 4NIJA 1JKAA 5I54A 2YBLA 1KXXA 3P4ZA 5I4YA 5KXOA 4GLVA 1FN5A 1LJ3A 4ML7A 1IY4A 2BQJA 4P2EA 2I25L 4J1BA 5C6LA 1LJKA 2LYOA 3TMWA 1B5VA 4H8YA 1IP4A 1B5UA 1OUJA 4NHTA 4OWAA 1CKFA 3TXHA 1FDLY 2NWDX 3WUNA 1LSFA 3WXTA 1QTEA 4H91A 1OQMA 1TBYA 3N9CA 1B7OA 4GCEA 4B1AA 1F0WA 4B4JA 4R6CA 1LKRA 1IP7A 1RFPA 1JWRA 4E3UA 4G9SA 5IELA 2D91A 2N5ZA 1B7LA 5K7OA 1KXYA 1KXWA 1WQRA 1IOSA 5B1GA 1UBZA 1YANA 4C3WA 3G3BB 3CT5A 4OWBA 5LVKA 2BQNA 3ZVQA 1REYA 1YL0X 3TXGA 4ETDA 2DQCY 1LZ4A 2ZQ4A 3A95A 3AGIA 2F30A 5FELA 3B6LA 2LYMA 5L3IA 3A3QA 2HEDA 1J1XY 3BKVA 4NGWA 3LZ2A 5IHGA 4N8ZA 1HMLA 1XGPC 4H9IA 1B7MA 1XSFA 5FHWA 1G7MC 5APDA 4DYGA 1WQPA 1B9OA 1C43A 2WARA 1B7NA 2BQOA 2MECA 135LA 1DZBX 1JJ1A 1NQIA 1ZVYB 3LYMA 1HENA 2YBJA 4NGIA 6LYZA 5DN5A 5E4PA 2GV0A 3WXUA 5FCPA 5HMJA 4GCFA 5LYTA 4LYCA 2C8PA 1G7JC 1GB7A 1LZEA 5LAGA 1GAZA 1DI4A 3HBDA 1HEMA 1GE0A 2HEBA 2W1YA 3WU8A 1LYSA 1WTMA 3CQLA 2DQEY 2G4QA 4W94A 5FEKA 4BAFA 1T6VL 4TUNA 5FDJA 1JKDA 1UA6Y 4N1EI 2I26L 4NGOA 1LSPA 1VDTA 1QQYA 3P66A 3TMVA 2XTHA 1BWHA 5KKIA 5EBHA 5ILCA 1BB3A 3N9AA 4OW1A 3AGHA 4LT2A 5APEA 1LSAA 1N4FA 1GE1A 2ZILA 1VDQA 2Z37A 3E3DA 4YEOA 2HUBA 1LHLA 2F2NA 2AUBA 3LZTA 1KIRC 1GFEA 1HSWA 1LZBA 2ZNXY 4NG1A 4QEQA 9LYZA 208LA 5II3A 1LMNA 1JTOL 1LMPA 1BWIA 1VDPA 2YBIA 1HF4A 1YROA 4X3BA 4NGKA 1F6SA 1INUA 4OWHA 1H6MA 1UIHA 4CFPA 2DQHY 1GB2A 134LA 1GF3A 4H8XA 1LZGA 4NHSA 3VWOA 4GCCA 1HELA 1EQ4A 3M3UA 3RNXA 5KXXA 1LZSA 3A93A 1FLWA 4YEMA 2BQFA 1LYZA 4NSJA 1LMAA 1RJCB 4HTKA 2D6BA 1YKYX 4RLMA 5LYZA 3AB6A 4ETCA 4H8ZA 1DI3A 1KIQC 1OUIA 2H5ZA 5E9RA 3W6FA 4GN3A 4RDSA 5KXKA 1GBYA 1B0DA 1NDGC 4WM2A 1QIOA 2LHMA 1NF5A 3D3DA 1LSYA 2YBNA 3CB7A 2Z19A 1FKVA 1HEOA 4KXIA 1IP3A 1P2CC 4LGKA 4PPOA 1IWWA 5HNCA 2EPEA 4U3XB 1LYYA 5D5CA 1GFUA 1LHMA 1BB7A 4O34A 1GE3A 1E8LA 1GXXA 5KXLA 2MEAA 4HJYA 1UIDA 2BPUA 2HECA 4NHQA 4B4EA 1LZYA 3A91A 1IWVA 5LXWA 1IP5A 1GBOA 1WQMA 1LMOA 3AZ5A 4ANRA 1IC4Y 4YF2A 1LJ4A 1C08C 1QSAA 4H9EA 1XGTC 2ZIJA 1IP2A 1KIPC 4MSTA 4H90A 3WULA 132LA 3A6CY 1YIKA 4YOPA 1LSNA 3FI7A 1GWDA 4QY9A 4HSFA 1XEKA 5LAFA 4NHPA 3TXFA 4ET8A 1GEVA 1IOTA 1LJNA 1WTNA 4GN4A 4GN5C 2D4JA 4B49A 2VB1A 3RW8A 2BQGA 2C8OA 2CWIA 1GB0A 5F9XA 2BQEA 1RCMA 1LZ5A 4CJ2A 3ATNA 1OUDA 4WG1A 1B7QA 1LJGA 4TTDA 1DPWA 1HEQA 1HFYA 4DD1A 2A7DA 4GCDA 4XJIA 1VEDA 1IIZA 1LJJA 1D6PA 1HC0A 1OUGA 4N9RA 1GB8A 1LCNA 4BS7A 4PGJB 3TXDA 2MEDA 3A67Y 3AW7A 1TEWA 2DQIY 5HNLA 1GBXA 3T36A 1D0KA 1D6QA 4Z98A 1GB5A 1YKXX 1JPOA 1JSFA 1MLCE 2PC2A 3LYOA 5LINA 1NMMA 4BADA 3A96A 3M18B 3AJNA 3KAMA 4DT3A 4HTQA 2EKSC 1IWXA 1LZ1A 1VATA 3A6BY 4XYYA 3LN2A 2MEFA 4WLTA 1REXA 1LOZA 4NHIA 1IVMA 1LYOA 1ZV5L 4CHXA 1IR7A 4WO9A 4XJBA 3W6EA 1BHZA 2LZ2A 4I8SA 3LYTA 4EOFA 1UIEA 1CKCA 1HHLA 1LJEA 1LSGA 1UUZC 2BQHA 1GDXA 2X0AA 2ZIKA 1GF9A 1GXV2 1UIFA 1ZVHL 4ZEEA 1AKIA 1DKKA 1WVUA 1YAPA 2ZYCA 3WW6A 5F9UA 4NGZA 1HSXA 2FBBA 1JITA 2YBMA 4RW1A 5J7CA 4WL6A 1GBWA 5I5QA 1FLYA 4WM4A 4WLXA 5M1YA 2MEBA 3AGGG 4AGAA 4DD0A 1B7PA 1GDWA 2YVBA 2F4AA 2Z38A 4XJFA 3OJPA 2HTXA 1REMA 2HEFA 4WG7A 4G4CA 1LSBA 3IJUA 4QGZA 3CSZA 4HV1A 4HTNA 4M4OA 2DQFC 4G4HA 5JENB 1RE2A 1SQ2L 1NBZC 4H93A 1DPXA 3A3RX 4UWUA 1JISA 2BQDA 3AZ4A 4NFVA 3EXDA 1V7SA 1GE4A 4NGVA 1NKHA 1Z55A 1EQEA 2XBRA 2I6ZA 4DDAA 2Z39A 1JKBA 5KXYA 2DKVA 1BB5A 1QUTA 1EL1A 1IC7Y 4A7DA 1C46A 1TCYA 1XEJA 3CSQA 1LHJA 4IJ4A 2G4NA 4TSCA 1OUFA 1EQ5A 4H9AA 1D9UA 3A34A 1LZDA 5F16A 4B4IA 5A3EA 5ILFA 3WMKA 1MELL 1A4VA 1C45A 1LZCA 1PZYA 1GBSA 2DQDY 5LA8A 1CJ6A 4NGLA 1YAMA 3IJVA 4DDCA 3ULRA 4D9ZA 4DD3A 1IOCA 1JJ0A 3A94A 1GB9A 4ETEA 4ETBA 1YAQA 1XGRC 1AM7A 1HERA 4TSBA 5KXMA 3B0KA 4EMNA 1H87A 3A8ZA 2LZTA 1B5ZA 5KY1A 3QY4A 4LYBA 1JUGA 1G7LC 4WOAA 1LHIA 1JIYA 3W6BA 1JJ3A 1XEIA 1LZ8A 1J1OY 1IWUA 1LAAA 1BQLY 3J4GA 4WM5A 1OUCA 5HQ1A 5KXSA 3RT5X 1OUAA 1J1PY 1IWZA 133LA 1BB4A 1LMQA 2XJWA 1IO5A 2IFFY 2Y8PA 2BLXA 1F10A 1YILA 2Z18A 3K3TA 3LYZA 1JTTL 1V7TA 4LT3A 4WO6A 4WM6A 1NWGA 3EBAB 4NGJA 5KXZA 4ET9A 1WQQA 1LPIA 5KXPA 5IDDA 5T3FA 3TXIA 3MGWA 4HJVA 1JKCA 1BVKC 4GLAA 1IWYA 2BQMA 4W96A 4H9BA 4XENA 4HJZA 1GD6A 2BQKA 2W1LA 193LA 1GE2A 4M6DA 1LTMA 4OWEA 1HFXA 2DQJY 1UACY 4XJDA 5F14A 4GCBA 1OUEA 3WVXA 5B07A 4J0LA 3ATOA 1LSEA 4UWNA 4HPEA 4QDNA 5LVIA 1LSZA 3B72A 5L3HA 3WH1A 5LYMA 4N5RA 2D4KA 4MR1A 3RZ4A 5I4WA 1AZFA 4CGEA 2BQBA 4AXTA 1QSWA 1HFZA 1YKZX 4PHIA 4LT0A 3TMXA 1AT6A 1QDTA 2Z2FA 1DQJC 3EO5A 1LMTA 3TXEA 4XJHA 1GFAA 3WPLA 3LHMA 5D5FA 5HLLA 2G4PA 1YQVY 1REZA 4LT1A 2HEAA 2DQAA 5L9JA 1GFHA 2BQAA 1A2YC 3J6KA 2Q0MX 4R0FA 4RW2A 1I56A 4CFOA 4LFPA 1GBZA 3WPJA 2YBHA 5APCA 3ZVQB 3W3EA 3D9AC 3WYHA 1GFTA 1CKDA 4NGYA 2DQGY 3N9EA 4OOTA 3TXJA 4Z3MA 4G4BA 1GF0A 3QE8A 1UICA 1XFPL 2LYZA 4TX7A 1PS5A 4NSHA 4XJGA 4DD9A 3FE0A 4WMGA 1F6RA 2CJLA 1C7PA 2ZQ3A 4NWEA 1JEFA 1GF4A 4HP0A 3AYQA 1IR9A 1G7IC 4PRQA 3P64A 4NY5A 4ZFPA 5AMYA 1CJ7A 5LVHA 1ZMYL 4LYTA 4KT3A 4J1AA 3CSRA 5DL9A 1OUHA 3WUAA 1CKHA 2H9JA 5B05A 4LFXA 4DD7A 2YDGA 4I0CA 5C6JA 1C10A 1D0MA 2MEGA 3BKHA 4XN6A 4LYMA 3RU5A 2EQLA 3AZ6A 1IR8A 2W1XA 1B7RA 1IORA 1W6ZA 3P65A 1FBIX 4DWXA 1JSEA 1I20A 4WM3A 4N1CC 4H9HA 1LMCA 1IX0A 1LSDA 1OUBA 1XGQC 5KXNA 1OP9B 2BQCA 1IOQA 4L41A 4YENA 5DN4A 3A92A 5KKJA 1VDSA 154LA 1B7SA 1BB6A 1LZAA 4PJ2C 1XGUC 1LHHA 1DKJA 1TAYA 5I4XA 5KXRA 1GHLA 4ZIXA 4B0DA 4OWCA 3GXRA 4XADA 1BWJA 1LSMA 3WW5A 5I53A 4KPMA 5LA5A 2Z12A 2HU3A 3B0IA 1AT5A 4BAPA 3B0OA 1HEWA 1UIAA 2XBSA 1W08A 1FKQA 1G7HC 1GFRA 1VFBC 1YAOA 1IC5Y 1T3PA 3CT0A 1LHKA 3HFMY 3WL2A 3AZ7A 4FJRA 2IHLA 2ZNWY 4J7VA 4HV2A 5A3ZA 5LIOA 1GPQC 4H9FA 5C6IA 1NDMC 1UC0A 2MEIA 4H1PA 5LVGA 3WU9A 1GAYA 4WLDA 5HMVA 3WPKA 3TXBA 1BVXA 1LZNA 2ZYPA 3WVYA 1GF5A 1IY3A 1JHLA 4DC4A 1CNSA 3QNGA 3W6DA 4RLNA 3WU7A 2MEHA 1UIBA 4PRUA 1DXJA 2Z2EA 1GFGA 3T6UA 1ALCA 1GB3A 2FYDA 4OOOA 4UWVA 3WUMA 1GF6A 2CGIA 5B59A 3OK0A 3TMUA 1HEPA 1B5WA 2ZWBA 1RI8B 1WVVA 4NG8A 3W6CA 8LYZA 3AW6A 4WLYA 2BAAA 4NWHA 2D4IA 1LSCA 3GXKA 1I1ZA 4KL7A 207LA 5KXTA 3SP3A 3G3AB 1NHEA 2YSSC 3EMSA 2A7FA 4YM8A 1VAUA 2B5ZA 2BQIA 2F4GA 4LZTA 1D0LA 1FLUA 1GFJA 1SLYA 1LZ9A 5LVJA 4NSGA 2BLYA 1LJIA 1WQNA 1LJFA 2HU1A 3F6ZA 4G49A 4II8A 153LA 3P68A 3HBEX 4ETAA 7LYZA 1LZ6A 1GF8A 1NBYC 2FYCA 3TXKA 3A90A 1DI5A 2H9KA 1GFKA 2FBDA 5B1FA 4NSIA 1GEZA 4TWSA 1QDRA 1GB6A 4NEBA 4LYOA 1LKSA 4DDBA 4H94A 4N0JA 1UIGA 4HPIA 1FLQA 4LYZA 5KJ9A 1YL1X 5DLAA 3IWRA 5DM9A 1O23A 3W6AA 1B5XA 1LZRA 1IP6A 4Z46A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HMKA 194LA 3FI5A 1L52A 2MEEA 1CJ8A 3NY8A 197LA 2CDSA 2HEEA 5APFA 1IP1A 128LA 2EIZC 1L81A 4WL7A 176LA 3ZEKA 1KY1A 1LZTA 4NIJA 1L74A 111LA 1LYGA 2BQJA 2I25L 4J1BA 115LA 1B5VA 1B5UA 181LA 4OWAA 3TXHA 1L26A 3WXTA 1QTEA 3N9CA 1L51A 4GCEA 4B1AA 1F0WA 4R6CA 3L64A 2XQOA 1C6HA 4YXCA 3C8RA 2O79A 4OWBA 4E97A 2BQNA 3ZVQA 3TXGA 1L93A 4W59A 1LZ4A 2ZQ4A 4I7QA 5IHGA 3LZ2A 1XGPC 1B7MA 1G0KA 1XSFA 5APDA 112LA 7LZMA 2WARA 1B7NA 211LA 135LA 1DZBX 1D3MA 4GCFA 1G7JC 1DI4A 2HEBA 3WU8A 5FEKA 2DQEY 2G4QA 1T6VL 3JR6A 5LZMA 223LA 160LA 1LSPA 3UONA 5KKIA 2XTHA 1BWHA 5EBHA 3N9AA 240LA 1LSAA 1N4FA 2F2NA 4NG1A 4W57A 3OE8A 5II3A 1LMNA 1JTNA 4NGKA 1H6MA 1UIHA 1GB2A 1L76A 1LZGA 4NHSA 3CDRA 4GCCA 1EQ4A 2RBNA 1CU0A 1QUHA 252LA 3A93A 1FLWA 1L82A 4YEMA 4NSJA 5LA5A 1LMAA 1RJCB 4HTKA 4ETCA 1OWYA 5E9RA 1OUIA 3W6FA 1C67A 1T8FA 1B0DA 258LA 4WM2A 229LA 2Z19A 1HEOA 4DQJA 1IWWA 2EPEA 1C6AA 114LA 1GFUA 1GE3A 5KXLA 2MEAA 4HJYA 1P37A 1UIDA 167LA 183LA 2B6YA 1GBOA 4ANRA 1WTHA 2ZIJA 1G0LA 1L22A 1LSNA 1GWDA 4AQNA 1L50A 3TXFA 1IOTA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JTP L;  1QTK A;  2W1M A;  5FST A;  1B5Y A;  5F81 A;  1HMK A;  2RSC A;  6LYT A;  1QUS A;  1CJ9 A;  4IAT A;  5B06 A;  3HBH A;  1WQO A;  3CT1 A;  1TDY A;  4DD2 A;  194L A;  4H9C A;  4IAS A;  2DBT A;  1IEE A;  2BQL A;  1CKG A;  1LJH A;  2MEE A;  1CJ8 A;  4WM1 A;  1GF7 A;  4Z41 A;  1BGI A;  1IWT A;  2CDS A;  2HEE A;  5APF A;  1B2K A;  1IP1 A;  1GFV A;  2EIZ C;  1HNL A;  1UCO A;  4FDY A;  4H92 A;  4WL7 A;  3ZEK A;  4C5F A;  5KXW A;  4MCK A;  1LZT A;  4NIJ A;  1JKA A;  5I54 A;  2YBL A;  1KXX A;  3P4Z A;  5I4Y A;  5KXO A;  4GLV A;  1FN5 A;  1LJ3 A;  4ML7 A;  1IY4 A;  2BQJ A;  4P2E A;  2I25 L;  4J1B A;  5C6L A;  1LJK A;  2LYO A;  3TMW A;  1B5V A;  4H8Y A;  1IP4 A;  1B5U A;  1OUJ A;  4NHT A;  4OWA A;  1CKF A;  3TXH A;  1FDL Y;  2NWD X;  3WUN A;  1LSF A;  3WXT A;  1QTE A;  4H91 A;  1OQM A;  1TBY A;  3N9C A;  1B7O A;  4GCE A;  4B1A A;  1F0W A;  4B4J A;  4R6C A;  1LKR A;  1IP7 A;  1RFP A;  1JWR A;  4E3U A;  4G9S A;  5IEL A;  2D91 A;  2N5Z A;  1B7L A;  5K7O A;  1KXY A;  1KXW A;  1WQR A;  1IOS A;  5B1G A; 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 1YAO A;  1IC5 Y;  1T3P A;  3CT0 A;  1LHK A;  3HFM Y;  3WL2 A;  3AZ7 A;  4FJR A;  2IHL A;  2ZNW Y;  4J7V A;  4HV2 A;  5A3Z A;  5LIO A;  1GPQ C;  4H9F A;  5C6I A;  1NDM C;  1UC0 A;  2MEI A;  4H1P A;  5LVG A;  3WU9 A;  1GAY A;  4WLD A;  5HMV A;  3WPK A;  3TXB A;  1BVX A;  1LZN A;  2ZYP A;  3WVY A;  1GF5 A;  1IY3 A;  1JHL A;  4DC4 A;  1CNS A;  3QNG A;  3W6D A;  4RLN A;  3WU7 A;  2MEH A;  1UIB A;  4PRU A;  1DXJ A;  2Z2E A;  1GFG A;  3T6U A;  1ALC A;  1GB3 A;  2FYD A;  4OOO A;  4UWV A;  3WUM A;  1GF6 A;  2CGI A;  5B59 A;  3OK0 A;  3TMU A;  1HEP A;  1B5W A;  2ZWB A;  1RI8 B;  1WVV A;  4NG8 A;  3W6C A;  8LYZ A;  3AW6 A;  4WLY A;  2BAA A;  4NWH A;  2D4I A;  1LSC A;  3GXK A;  1I1Z A;  4KL7 A;  207L A;  5KXT A;  3SP3 A;  3G3A B;  1NHE A;  2YSS C;  3EMS A;  2A7F A;  4YM8 A;  1VAU A;  2B5Z A;  2BQI A;  2F4G A;  4LZT A;  1D0L A;  1FLU A;  1GFJ A;  1SLY A;  1LZ9 A;  5LVJ A;  4NSG A;  2BLY A;  1LJI A;  1WQN A;  1LJF A;  2HU1 A;  3F6Z A;  4G49 A;  4II8 A;  153L A;  3P68 A;  3HBE X;  4ETA A;  7LYZ A;  1LZ6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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