1GHLA

The three-dimensional structure of pheasant and guinea-fowl egg lysozymes
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
GKVYGRCELAAAMKRMGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTGATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSKNLCHIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRKHCKGTDVNVWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Phasianus colchicus
publication title Crystal structures of pheasant and guinea fowl egg-white lysozymes
pubmed rcsb
molecule keywords PHEASANT EGG WHITE LYSOZYME
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ghlA00
4QDNA 4X3BA 1NF5A 5KJ9A 3CSRA 1I20A 4M6DA 3CT1A 2MEEA 4G4BA 4R0FA 3A34A 3TMVA 3AZ6A 4O34A 4BAPA 1XEJA 1WTNA 1LHIA 2BQNA 1BGIA 2LZTA 4WM5A 5HNLA 1IOQA 2Z37A 1QUTA 2D91A 4D9ZA 4C3WA 3E3DA 1OUFA 4J7VA 4XENA 1JJ1A 4ZEEA 4DD9A 5M1YA 1OUBA 4NHQA 5LVKA 2DQHY 1GE2A 5HMJA 4IATA 1JPOA 4PRQA 5B59A 1BWIA 3WULA 4YEMA 1GEZA 2XTHA 1YKXX 1HSWA 1UIGA 3W6BA 1RE2A 1IEEA 1DI5A 1G7HC 3IJUA 5B1FA 3RZ4A 4NSIA 2A7DA 1XGUC 5K7OA 5KXTA 5HQ1A 5HLLA 1IORA 2BQMA 3WVYA 2BQLA 1GF0A 1LMQA 1UIHA 1LHKA 1FKVA 5B07A 1GWDA 3D3DA 3N9AA 4I0CA 4NHTA 5ILFA 1OUCA 1LZTA 3ZVQB 4B4EA 1UC0A 1GXXA 1LAAA 5C6JA 5LINA 5FSTA 1BB5A 2W1MA 1YIKA 4HPIA 5APFA 2MEFA 4N9RA 1GE0A 1VATA 2ZYCA 1GBYA 1IC7Y 2HUBA 2DKVA 1LHLA 4H9CA 4LT2A 4XJBA 4PJ2C 4OW1A 5DM9A 2A7FA 1GBOA 1NHEA 1IWWA 4OOTA 4WL7A 1IP2A 1C10A 1HEOA 2DQAA 5KXOA 3WVXA 5D5CA 1IOTA 2LYOA 5I54A 1N4FA 1OUEA 4LZTA 5L9JA 4IJ4A 1P2CC 4NHSA 1JTTL 3AGGG 4GN4A 4NGLA 1IP7A 1IR7A 2ZQ3A 5KXNA 3A91A 1BVKC 1GAYA 1VDQA 2CGIA 4XYYA 1GBXA 1B5ZA 1LMOA 3WL2A 4DWXA 2ZWBA 4HP0A 1EQ5A 1B7OA 1B7RA 5IHGA 1GDWA 1GF9A 5ILCA 4G4CA 4NGOA 5D5FA 3WPJA 4IASA 1F6SA 3EBAB 1LZYA 1REZA 1JKDA 4HJVA 1RJCB 2MEGA 1LSZA 3ZVQA 1FDLY 1D0LA 2LHMA 1C08C 4WM3A 4RLMA 4CFOA 3WW6A 3G3AB 1GFVA 2HU1A 5KXRA 4H8ZA 1VDPA 4KT3A 1TAYA 4ML7A 4NEBA 3B0OA 2ZIKA 1QDTA 3VWOA 1KIQC 2DQCY 1AZFA 3TXEA 2MEIA 3IWRA 3WYHA 1OP9B 3A3QA 1B7QA 1GF8A 1Z55A 3AYQA 4CHXA 1B7LA 4NG8A 3ATOA 4H9IA 1LSMA 1KIRC 4H94A 4DD7A 3QE8A 3B6LA 1NDMC 1GB2A 4NG1A 1LTMA 2GV0A 1WQOA 1KIPC 2DQFC 3AJNA 4YENA 3FE0A 1LSCA 2YBJA 3WXUA 2H9KA 1LZ6A 1LYYA 3M3UA 1LJ4A 1ZMYL 5FCPA 1OUHA 2EPEA 4GLAA 1BB7A 3TXFA 4BS7A 2XBSA 4TSCA 2N5ZA 3J4GA 1NDGC 1GF5A 4GLVA 1GD6A 1LZ5A 1B9OA 3EMSA 2DQIY 5B06A 1VDSA 1LKSA 5EBHA 3ATNA 1LYSA 4RDSA 1WQNA 1GB6A 1GF4A 3A6BY 2YBNA 2XBRA 2YVBA 1YAOA 4J1BA 3RT5X 2G4PA 2MEAA 1WTMA 3WMKA 1LJEA 4E3UA 2B5ZA 1JHLA 4H9AA 4DC4A 1B5XA 4NHIA 2C8OA 5IELA 1REMA 4WM4A 5FDJA 153LA 5LAFA 5FHWA 3ZEKA 2WARA 1HSXA 2LYMA 1ZV5L 4WLYA 3P66A 3BKHA 5LAGA 1E8LA 1ALCA 4AXTA 1LJJA 1UICA 4CGEA 2MECA 3BKVA 5B1GA 4NWHA 1A2YC 1CJ9A 1LJGA 2H9JA 2XJWA 3CSZA 1PS5A 1WVUA 5KKJA 4NGJA 1B7NA 2Z18A 2Q0MX 1HERA 3OK0A 2BQDA 1GB9A 1IY4A 3OJPA 3WUNA 4ETAA 4HJYA 3AZ7A 4MSTA 4CJ2A 1DKKA 2NWDX 3SP3A 3WW5A 5KY1A 1DI4A 1LSPA 1XGRC 3EO5A 1XEIA 4WOAA 3WU9A 3EXDA 3M18B 3W6DA 1NBYC 1QIOA 1QSWA 1WQMA 1B7MA 1JKBA 2HEAA 1INUA 1EL1A 4W94A 1C7PA 2H5ZA 1XGTC 1JTPL 4RW2A 4LT1A 1LPIA 3CB7A 4H92A 3P64A 3TXJA 4U3XB 2Y8PA 4YF2A 5APDA 2BPUA 1YQVY 4NWEA 132LA 1LOZA 4LYMA 5LIOA 1XEKA 1LMAA 2ZYPA 1G7LC 1GE4A 5L3HA 1G7IC 5LVGA 4OWBA 1WVVA 4TSBA 1IR9A 3LHMA 5LA8A 1B5UA 5KXLA 2W1LA 1UIAA 2BLYA 2F30A 4C5FA 1D0MA 1EQEA 4WMGA 4EOFA 1DKJA 1GE1A 3LYOA 1IR8A 1FN5A 1F0WA 6LYZA 1LZNA 1FKQA 1UA6Y 5I5QA 1JJ3A 1JTOL 1GBSA 1YL1X 2Z39A 5A3EA 1HMLA 1WQRA 1LMCA 2D6BA 1IOCA 2HEFA 3J6KA 5LVIA 4G49A 3HBEX 1GFTA 1UBZA 5L3IA 1B7SA 1B7PA 4LGKA 207LA 4NFVA 4WG7A 1FLQA 4EMNA 5LVHA 1LSBA 4GN5C 4WL6A 1IWZA 5F9UA 1HEMA 2BQEA 1HEPA 4HTQA 7LYZA 5J7CA 5E9RA 1JKAA 4ZIXA 4A7DA 1IP1A 4N0JA 2BQFA 1O23A 2Z12A 5I53A 1LHJA 4N8ZA 4PGJB 5LYTA 1LZSA 1GDXA 1W08A 4ETBA 2DQDY 4GCBA 4OWHA 1GE3A 1DPXA 4NGKA 2BQJA 1CNSA 2CDSA 4PHIA 4H8YA 4I8SA 1YAMA 1YKYX 4XADA 2EIZC 1HEWA 1OUAA 1LZ1A 1SQ2L 4H9FA 1IC5Y 4BADA 1IWVA 4LT3A 2EQLA 1NWGA 5FEKA 5LYZA 1TEWA 4NGWA 4TWSA 5JENB 1LSDA 1LZBA 2FBBA 1TCYA 1KXWA 1HHLA 1A4VA 3TXDA 2DQGY 5KXXA 5F81A 1RCMA 2FBDA 4XN6A 1JEFA 1DQJC 4GCCA 4UWVA 3AZ4A 4Z3MA 4DD3A 5APCA 1OUIA 5T3FA 3B0IA 3TMWA 1LZDA 5I4YA 5KXSA 3CSQA 1VDTA 4H90A 2ZILA 4OOOA 3QY4A 3WXTA 135LA 3T36A 2BQBA 3TXGA 1IO5A 1LHHA 4TUNA 1BWHA 1OUGA 2BQIA 4NSJA 1UIFA 1PZYA 3W6FA 3WU8A 2BQGA 5LVJA 4M4OA 4G4HA 1OQMA 1DPWA 8LYZA 4LYBA 134LA 4H8XA 1C43A 4KL7A 4NGVA 4ZFPA 1QDRA 1CKHA 1V7TA 4TTDA 4FDYA 5F16A 4KXIA 5KXZA 4GCDA 3A3RX 4FJRA 1TDYA 5B05A 3B72A 5IDDA 5DN5A 2DQEY 4NGIA 5E4PA 3CT5A 4NHPA 4UWUA 2G4NA 1G7JC 1C45A 1GB8A 1REXA 4XJDA 1J1PY 4J0LA 133LA 5I4WA 1LJNA 2LYZA 1IP3A 3QNGA 2BQOA 1WQQA 1XFPL 1BHZA 1YAPA 4B0DA 1GEVA 1D6PA 1NMMA 1CKFA 2I25L 6LYTA 4KPMA 1GF6A 1B0DA 1GFUA 1DXJA 1OUDA 1XGQC 2HEEA 4WM6A 1GAZA 1HFXA 4WO9A 1AKIA 3A67Y 1CJ8A 1QSAA 1LZRA 3TMXA 4XJHA 4Z41A 1VAUA 1H87A 2AUBA 3LYZA 1BB3A 1GFGA 5DL9A 3A96A 1QTEA 3LYMA 4QY9A 2BQCA 3TXBA 1YAQA 1UIEA 3HFMY 4XJFA 1MELL 1RI8B 4B1AA 2C8PA 5APEA 3N9CA 1RFPA 3ULRA 1LYZA 4YM8A 1GB3A 2I26L 1F10A 4AGAA 5HMVA 4RLNA 1REYA 1UIBA 1JIYA 1IP5A 2MEBA 3LYTA 4HV2A 3B0KA 4RW1A 4DD0A 4ET9A 4R6CA 1KXYA 3HBHA 5C6LA 3TXIA 1NQIA 2HEDA 4WLXA 1JSEA 1FBIX 4OWEA 1JKCA 3LN2A 1GFEA 2Z38A 2LZ2A 5LA5A 1LJHA 4NSGA 4DYGA 4TX7A 1UACY 2W1YA 1CJ7A 4LYTA 1FLYA 4H91A 5LYMA 1LZ9A 1NKHA 1D0KA 1HENA 3N9EA 4W96A 1LMTA 2IFFY 9LYZA 1GFKA 1LCNA 1LSNA 1MLCE 3MGWA 4B4IA 2YDGA 1BWJA 1ZVYB 1J1OY 1V7SA 4WLDA 4G9SA 1GFHA 1H6MA 3WU7A 1IWYA 2ZIJA 4GN3A 4MCKA 4NY5A 1HC0A 4QGZA 4DT3A 2Z2EA 4ETEA 1T6VL 1LJFA 1EQ4A 4L41A 3AGHA 1JISA 1GB0A 5F9XA 1CKDA 5KXPA 3A8ZA 2F4GA 4H1PA 4NGYA 5KXMA 1NBZC 4DD1A 3A92A 1CJ6A 4WM1A 2F4AA 1FLUA 1LSAA 5FELA 1KXXA 1YROA 1LYOA 3FI7A 3P4ZA 3W3EA 4LFPA 1HELA 1IX0A 1LKRA 4NIJA 3WPLA 4LYZA 3AW7A 5HNCA 3GXKA 4HV1A 1GBWA 5KXWA 1BQLY 2YBHA 1DI3A 1IOSA 5A3ZA 4N1CC 2D4JA 2HU3A 2PC2A 3IJVA 2BQHA 2Z2FA 3P65A 1GFJA 4WLTA 4H9EA 1GHLA 2FYDA 3A93A 4QEQA 5DLAA 5I4XA 1LMNA 1JITA 3A6CY 1LJKA 1YKZX 2X0AA 5KXYA 3AB6A 4P2EA 3W6EA 2HEBA 1HNLA 2YSSC 1OUJA 2RSCA 3RU5A 5LXWA 1J1XY 1LZEA 3WPKA 3K3TA 4LYOA 194LA 1GB5A 3CQLA 4XJGA 4DDAA 1IWUA 1C46A 1LSGA 1W6ZA 2F2NA 1IIZA 1JUGA 1JJ0A 4HSFA 4BAFA 2FYCA 4CFPA 4HPEA 2VB1A 4II8A 1I1ZA 1BB4A 1LZAA 4OWCA 3P68A 1DZBX 1GPQC 5C6IA 4LFXA 2ZQ4A 4B49A 1VFBC 1LZ4A 2BQKA 2IHLA 3WH1A 2CJLA 1QQYA 3TXHA 5DN4A 4OWAA 3T6UA 3KAMA 1LJIA 3RNXA 1B2KA 1TBYA 2CWIA 4DD2A 1WQPA 1F6RA 1LJ3A 1LZCA 2W1XA 2D4IA 2ZNXY 4MR1A 5KXKA 1UUZC 1LSFA 1G7MC 3D9AC 4NSHA 3TXKA 4H93A 154LA 4N5RA 4XJIA 2YBIA 1LMPA 1IVMA 4WG1A 3F6ZA 1GBZA 1AT6A 1ZVHL 5AMYA 2DBTA 2HECA 4YOPA 4NGZA 1XSFA 4B4JA 5II3A 1JWRA 1GFRA 1YILA 4LYCA 3AW6A 2Z19A 4GCFA 4ETDA 4H9HA 1AM7A 1IY3A 1VEDA 1YANA 2MEDA 2ZNWY 1D6QA 3CT0A 3G3BB 4PPOA 4ETCA 4Z98A 1D9UA 1FLWA 3W6AA 5KKIA 3AZ5A 4Z46A 4H9BA 193LA 1QTKA 1HFYA 4HJZA 4HTKA 4LT0A 1I56A 2MEHA 1LSYA 1B5VA 1GXV2 1B5WA 2BLXA 3LZ2A 1HMKA 3A94A 1IP4A 2D4KA 1LHMA 2EKSC 3TMUA 1YL0X 1GF3A 4WO6A 1XGPC 3GXRA 2BQAA 3AGIA 1BVXA 1LSEA 1LZ8A 1GB7A 2DQJY 2I6ZA 4HTNA 2YBLA 2G4QA 1IWTA 1CKCA 4DDBA 3A95A 1IC4Y 1SLYA 208LA 1HF4A 4GCEA 4YEOA 4DDCA 5F14A 4WM2A 1HFZA 4ET8A 3LZTA 2HTXA 1B5YA 1GFAA 3WUMA 1CKGA 3A90A 1IP6A 1AT5A 3HBDA 2YBMA 4PRUA 1IWXA 1HEQA 1UCOA 4J1AA 4N1EI 3W6CA 2BAAA 1T3PA 3RW8A 3WUAA 1UIDA 4ANRA 1LZGA 4UWNA 1QUSA 1BB6A 1JSFA 1GF7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4X3BA 1LW9A 2B6XA 139LA 1I20A 3CT1A 3HU8A 4G4BA 1L23A 4BAPA 1P36A 1L47A 2BQNA 5HNLA 170LA 1JJ1A 4ARQA 3GUIA 4GRVA 2HUKA 4YEMA 2XTHA 1HSWA 3W6BA 2A7DA 1OWYA 1L0JA 1C6FA 1CV6A 5B07A 1FKVA 3D3DA 3N9AA 1OUCA 1KW7A 1UC0A 1L30A 1LAAA 1CV3A 238LA 3VW7A 4ARLA 4H9CA 1CU6A 1IWWA 4OOTA 233LA 1L77A 4LZTA 4EKRA 4IJ4A 1P2CC 4NHSA 1JTTL 3AGGG 3V2YA 3A91A 108LA 4XYYA 245LA 1GBXA 1L45A 3WL2A 1PQOA 2ZWBA 1B7RA 5IHGA 1GDWA 1GF9A 1T8FA 1JKDA 1DYGA 3ZVQA 1FDLY 4DJHA 2HU1A 2ANVA 4KT3A 4NEBA 2DQCY 1AZFA 3TXEA 1OP9B 217LA 1Z55A 4CHXA 1L70A 2CUUA 3QE8A 1NDMC 3DMVA 1C6QA 218LA 3WXUA 2H9KA 1LZ6A 1LYYA 1L53A 1ZMYL 5FCPA 241LA 3J4GA 1GF5A 1B9OA 5B06A 3DKEX 4RDSA 1WQNA 1QTDA 3A6BY 3NY9A 4J1BA 2G4PA 1D3FA 244LA 4H9AA 5IELA 5FHWA 3ZEKA 3C7ZA 2WARA 1QSQA 1HSXA 1L16A 5LAGA 175LA 4AXTA 4CGEA 5B1GA 5LZMA 3FADA 2XJWA 1B7NA 1GB9A 4I7TA 1IY4A 1T97A 3OJPA 4HJYA 2RBOA 3FI5A 1WQMA 4W94A 2H5ZA 1L64A 2RAYX 256LA 4U3XB 4YF2A 5APDA 132LA 1XEKA 1L69A 5L3HA 131LA 2NTHA 1L61A 1G0MA 1GE1A 4EPIA 6LYZA 1FKQA 2B70A 1LMCA 213LA 3J6KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4QDN A;  4X3B A;  1NF5 A;  5KJ9 A;  3CSR A;  1I20 A;  4M6D A;  3CT1 A;  2MEE A;  4G4B A;  4R0F A;  3A34 A;  3TMV A;  3AZ6 A;  4O34 A;  4BAP A;  1XEJ A;  1WTN A;  1LHI A;  2BQN A;  1BGI A;  2LZT A;  4WM5 A;  5HNL A;  1IOQ A;  2Z37 A;  1QUT A;  2D91 A;  4D9Z A;  4C3W A;  3E3D A;  1OUF A;  4J7V A;  4XEN A;  1JJ1 A;  4ZEE A;  4DD9 A;  5M1Y A;  1OUB A;  4NHQ A;  5LVK A;  2DQH Y;  1GE2 A;  5HMJ A;  4IAT A;  1JPO A;  4PRQ A;  5B59 A;  1BWI A;  3WUL A;  4YEM A;  1GEZ A;  2XTH A;  1YKX X;  1HSW A;  1UIG A;  3W6B A;  1RE2 A;  1IEE A;  1DI5 A;  1G7H C;  3IJU A;  5B1F A;  3RZ4 A;  4NSI A;  2A7D A;  1XGU C;  5K7O A;  5KXT A;  5HQ1 A;  5HLL A;  1IOR A;  2BQM A;  3WVY A;  2BQL A;  1GF0 A;  1LMQ A;  1UIH A;  1LHK A;  1FKV A;  5B07 A;  1GWD A;  3D3D A;  3N9A A;  4I0C A;  4NHT A;  5ILF A;  1OUC A;  1LZT A;  3ZVQ B;  4B4E A;  1UC0 A;  1GXX A;  1LAA A;  5C6J A;  5LIN A;  5FST A;  1BB5 A;  2W1M A;  1YIK A;  4HPI A;  5APF A;  2MEF A;  4N9R A;  1GE0 A;  1VAT A;  2ZYC A;  1GBY A;  1IC7 Y;  2HUB A;  2DKV A;  1LHL A; 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 1TBY A;  2CWI A;  4DD2 A;  1WQP A;  1F6R A;  1LJ3 A;  1LZC A;  2W1X A;  2D4I A;  2ZNX Y;  4MR1 A;  5KXK A;  1UUZ C;  1LSF A;  1G7M C;  3D9A C;  4NSH A;  3TXK A;  4H93 A;  154L A;  4N5R A;  4XJI A;  2YBI A;  1LMP A;  1IVM A;  4WG1 A;  3F6Z A;  1GBZ A;  1AT6 A;  1ZVH L;  5AMY A;  2DBT A;  2HEC A;  4YOP A;  4NGZ A;  1XSF A;  4B4J A;  5II3 A;  1JWR A;  1GFR A;  1YIL A;  4LYC A;  3AW6 A;  2Z19 A;  4GCF A;  4ETD A;  4H9H A;  1AM7 A;  1IY3 A;  1VED A;  1YAN A;  2MED A;  2ZNW Y;  1D6Q A;  3CT0 A;  3G3B B;  4PPO A;  4ETC A;  4Z98 A;  1D9U A;  1FLW A;  3W6A A;  5KKI A;  3AZ5 A;  4Z46 A;  4H9B A;  193L A;  1QTK A;  1HFY A;  4HJZ A;  4HTK A;  4LT0 A;  1I56 A;  2MEH A;  1LSY A;  1B5V A;  1GXV 2;  1B5W A;  2BLX A;  3LZ2 A;  1HMK A;  3A94 A;  1IP4 A;  2D4K A;  1LHM A;  2EKS C;  3TMU A;  1YL0 X;  1GF3 A;  4WO6 A;  1XGP C;  3GXR A;  2BQA A;  3AGI A;  1BVX A;  1LSE A;  1LZ8 A;  1GB7 A;  2DQJ Y;  2I6Z A;  4HTN A;  2YBL A;  2G4Q A;  1IWT A;  1CKC A;  4DDB A;  3A95 A;  1IC4 Y;  1SLY A;  208L A;  1HF4 A;  4GCE A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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