1GHSA

The three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
IGVCYGVIGNNLPSRSDVVQLYRSKGINGMRIYFADGQALSALRNSGIGLILDIGNDQLANIAASTSNAASWVQNNVRPYYPAVNIKYIAAGNEVQGGATQSILPAMRNLNAALSAAGLGAIKVSTSIRFDEVANSFPPSAGVFKNAYMTDVARLLASTGAPLLANVYPYFAYRDNPGSISLNYATFQPGTTVRDQNNGLTYTSLFDAMVDAVYAALEKAGAPAVKVVVSESGWPSAGGFAASAGNARTYNQGLINHVGGGTPKKREALETYIFAMFNENQKTGDATERSFGLFNPDKSPAYNIQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Hordeum vulgare
publication title Three-dimensional structures of two plant beta-glucan endohydrolases with distinct substrate specificities.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1,3-BETA-GLUCANASE
total genus 100
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 1993-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1ghsA00
4PRWA 3ECQA 4HMCA 1YQ2A 5IFTA 2X2YA 4H8HA 1WDRA 1NOFA 1UWTA 1HT6A 4URIA 2EJ1A 3OG2A 2UY4A 1H4PA 2IXVA 3VPLA 3CMJA 5I23A 5E09A 1QBAA 4MDOA 2W91A 3GM8A 5DF0A 4GI8A 3ARPA 1WE5A 4LPCA 4M8UA 3UR8A 3WNNA 3II1A 2J47A 4LXFA 7A3HA 1JI1A 1KR0A 3ZMRA 3QHOA 1MQPA 2PF0A 5EBAA 3FHAA 1CBGA 5CQ1A 1EO5A 2F8QA 2PWEA 3HN3A 4GZJA 2EQDA 4DWSC 2WLYA 2W61A 4P8WA 3WBEA 3WH6A 3ZJ8A 3A4XA 1G0CA 1LQ0A 4EKJA 2XWEA 4A3HA 3ARRA 1OSEA 4PTWA 3WUFA 3B8SA 1K6AA 3VD5A 1WDSA 1BAGA 1WCGA 2FHFA 3VVGA 2J77A 3VDHA 2WPGA 1CGXA 3VMNA 1H3GA 1US2A 1HIZA 2ZWZA 2ZUTA 5KEZA 3CHDA 4UFMA 2J7CA 1JDAA 5ABFB 2BY0A 4HPHA 3PTKA 3TTYA 1ODUA 1E43A 1PX8A 1VAHA 2YA1A 1GVIA 3L2MA 2CKRA 4W8BA 3WN6A 2VZVA 3KL5A 3U5YA 3F5LA 2WLZA 4V2XA 1TE1A 3ZR5A 2YIHA 2D0GA 2VUYA 3N17A 5D4YA 4TVUA 2OSWA 3UR7A 1V0KA 5CGTA 2WMIB 3A47A 3SCRA 3AS2A 1FP9A 1UD8A 4U31A 5BRQA 3T2PA 4W93A 5I77A 3ZR6A 3GBEA 1C7TA 1W9XA 4U3AA 3W38A 1QNOA 3TOPA 4JHZA 4D72A 1HJQA 1PEZA 2VOTA 1GHRA 1JDCA 1JF5A 3AOFA 3SCUA 2XSBA 2WVVA 2GK1A 2G3NA 5FOOA 3VIJA 3K8LA 1JAKA 4HA4A 4WJXA 1CECA 1DHKA 1PX4A 3GYCA 5CSUA 5BXRA 4IISA 3CZEA 2XWDA 3AHVA 3B9EA 1CWYA 1AQMA 3K4DA 2XIBA 4RL3A 3T08A 3SCSA 1Q6EA 1V3JA 2D0FA 2OLHA 4QAWA 3ZO9A 4M82A 3HJEA 1QHZA 4Q22A 3WSUA 1CGYA 2D22A 5AYBA 2RGMA 2VR5A 3AS0A 1H1NA 3VM5A 2WVTA 5D9OA 5FCZA 5F7UA 1W9UA 3W6MA 1MQRA 1JZ3A 5CGMA 1JZ4A 1AQ0A 4Y7EA 1LG2A 2J25A 3VIOA 2JE8A 3VDBA 5A6KA 2DT1A 4EANA 5AY7A 3W28A 1M53A 1UQZA 3TTOA 2E8ZA 2PWFA 1MW0A 2CPUA 1R85A 2HVMA 3CUJA 3VD4A 3VU2A 1UKQA 3GZAA 2VJXA 4BCEA 1HVXA 4W5UA 1US3A 2DIJA 2W92A 1BHGA 4GKLA 1C8QA 4J7RA 2OWWA 3M07A 3VNYA 2WAGA 1E4LA 2F2HA 4LX4A 1BF2A 2E9LA 4GI6A 4TOQA 2DT2A 1M03A 2YLAA 3CUGA 3VTRA 4PCTA 1OCQA 1NWSA 2W66A 4F66A 3JUGA 2ZIDA 3AXIA 4FLSA 4BQ3A 1E73M 1NOUA 3GDBA 3BH4A 1JG9A 1XSJA 4WLCA 2MANA 4L4PA 3VIHA 4C7DA 1ISWA 5JBDA 5I79A 2ZICA 2XFRA 2J62A 5C71A 1W3HA 1BVNP 1GQJA 4D71A 1V3HA 2X1IA 3SUSA 4CN1A 1W3LA 2VTFA 3VMPA 3WDHA 3QGVA 3VDCA 3BGAA 3ZJ6A 4HZ8A 2DSZA 4NRRA 3W27A 3THDA 2DH3A 4B3KA 3BLPX 1OIFA 1C91A 3ZQ9A 4WIWA 3L4TA 1TA3A 2C0HA 3VUPA 4U5KA 5C70A 4AW7A 3RCNA 3KL3A 3U7BA 3VX1A 2VT0A 1E1FA 4AISA 1IZKA 1LG1A 2BHYA 4H04A 4BA0A 3WL0A 1QNQA 2JEPA 3A4AA 1E15A 5CLTA 1W9DM 2A3BA 1WP6A 4ZE4A 2D3NA 1PJ9A 3BLKA 4D6CA 1B2YA 1M04A 4P8XA 1E0XA 4P8UA 2OYLA 4PMUA 3SURA 1I75A 1HF6A 5LA1A 4K68A 2J78A 1RH9A 3TONA 3AIVA 2UWFA 3WF0A 3M46A 3WMSA 1RP8A 4B16A 1E6RA 4M1RA 4ZE5A 3NIYA 2WB5A 2V3FA 2AMGA 3GXIA 4D6JA 4GQRA 1CDGA 1ZJAA 1J0IA 2QPUA 3QOKA 4PYSA 3RM8A 3UCQA 4JHOA 4P8VA 3W37A 1R8LA 2WKLA 3BSHA 3W82A 2BNJA 3AZRA 1MYRA 3FAXA 1G9HA 3BMVA 4QLLA 2VX6A 1L0PA 3LMYA 3S2CA 5CPSA 1WNOA 4X9YA 3KL0A 2EPOA 2EPNA 2D0HA 1BLIA 3AROA 3ZT7A 4OIFA 2J4GA 5A3HA 1ZBCA 4HU0A 1OB0A 3O6AA 4JFUA 5CZKA 4L4OA 3BCDA 4PMRA 4TTGA 5M17A 1V6VA 2VCCA 3VMOA 3WD0A 4KMQA 1BYCA 3TP4A 4D6GA 1VF8A 4W85A 2C7FA 5EMYA 3NSMA 1FOBA 1DWIM 1KXVA 2OSYA 1HJSA 3LPOA 2E3ZA 2E4TA 4XUYA 2ZWYA 2YDQA 1UD2A 1CTNA 3PZIA 3EDDA 3MUIA 3U57A 2WC3A 1A47A 4GIAA 3AHYA 2WK2A 2V5DA 5E70A 4A4AA 4UQDA 3ALGA 3BAIA 2WSKA 1CXLA 2PBOA 4B15A 2NSXA 4XB3A 1V08A 1FA2A 4PMOA 3PZNA 2ZUUA 1E0WA 5I2UA 1WZMA 4B9YA 2VRKA 4PMDA 3MV11 1H49A 1I1XA 1W9PA 1UKTA 2VRQA 1JYNA 3AIUA 1B31A 3CMGA 1B3WA 1YHTA 1OT1A 2DSWA 3PTQA 3ARWA 2DSVA 1W3JA 4Z2GA 4CD7A 1E6QM 1A3HA 2ZUVA 2ZUSA 2O9RA 4Z2KA 1UD5A 1J0KA 3T09A 3L2LA 4MJ4A 4HPGA 1HJXA 2J7GA 1CGVA 5A69A 2CITA 3PZVA 4ACYA 3MV01 4GPNA 1GOWA 2DQXA 1KQZA 1IV8A 3SIMA 5A6JA 3TA9A 1TUXA 2UY3A 3A3HA 3CBWA 1C3FA 1V02E 4ZFMA 3OGVA 1V3LA 4BZYA 4A3YA 1ITCA 2CIPA 1V3IA 3ARSA 2VO5A 2WZIA 3WDRA 2TAAA 4J3XA 2YBUA 1HP5A 4PMVA 1EQCA 3NSNA 1ZBWA 1J01A 3VGEA 4OUEA 4CD6A 4TVDA 2D3LA 2PBGA 4U3CA 2VZOA 4DWSA 5LYRA 5A2BA 5M5DA 5KZ6A 2HISA 1JZ2A 2G3IA 1W1PA 3MO4A 4QDMA 3WIJA 4E8DA 1PZ2A 1UD4A 1FP8A 3SUVA 2XVPA 1H41A 4GINA 5IXEA 2CHNA 1GCYA 1WZLA 2VL4A 3EDKA 4WSJA 3SCTA 2ESCA 3AZSA 5FD0A 4NSBA 1VFFA 3WD4A 1UKPA 1JYVA 4MPKA 1E5NA 3VGBA 3MUZ1 5I24A 1E4NA 3MS8A 1J18A 1UA7A 4PTXA 5JBFA 2XVLA 8CGTA 2CKSA 1EOKA 1EQPA 4U2ZA 1EGZA 1E0VA 4RE4A 3CZLA 2ZE0A 2DT3A 3B9AA 1EDGA 3AJ7A 1E6SM 1KGUA 5CJ5A 3WH5A 1ISYA 4PSRA 2ZUNA 3O2LA 2E8YA 4IPLA 4UTFA 3SCNA 3ARQA 2YKKA 5FL1A 1UH3A 5EFDA 1DWAM 4LGXA 2CERA 5GQBA 2FH8A 3AHTA 4PMNA 5HNNA 2GJXB 2J7DA 4J28A 4AZ6A 4ML4A 1GORA 4DM2A 4ACZB 3VGFA 5CPQA 5BWFA 3ZJKA 3WL1A 3MMUA 2EPKX 1FH8A 4V27A 3RMEA 5A8PA 1SR0A 5FL0A 2Z1KA 1VIWA 2WWDA 1QPKA 2RGLA 3WNPA 3RIKA 3WDQA 3NSXA 3VIKA 2YDSA 1JNDA 2JF7A 5IDIA 7TAAA 3VNZA 4UQ9A 2GDVA 5I3DA 1E72M 2ZXAA 4W8LA 1C8XA 3W29A 2VZSA 1J0YA 4JKLA 2J79A 5CPTA 5E9AA 3QHMA 1XYFA 3AIBA 4UFKA 3VGGA 5AYIA 1ECEA 5FIPA 5D9NA 4CU8A 2Y4SA 1QVBA 4YPJA 1NARA 4AZCB 4PMZA 1B3VA 5BXTA 2VRJA 4BQ5A 3FAWA 4EAMA 1QI3A 4ZXLA 4F9DA 5ABGA 2WANA 3WNMA 4GQQA 2WM0A 1UA3A 2OYKA 3CGTA 1XH1A 2XHYA 4C7FA 2J74A 2WMIA 4JCLA 1AVAA 1HL8A 1HX0A 1VJSA 1U33A 1GZJA 3WDIA 3T2OA 2PB1A 2D23A 2W5FA 3KE0A 4W7WA 3GNPA 2YL6A 3UESA 3CZKA 1TMQA 3RM9A 1OWQA 4AZBA 3PZMA 3QOMA 3TTQA 3AMCA 5BXPA 2V3DA 3WDPP 3ZT6A 5A8QA 5D9PA 1TFVA 4KRTA 1WZAA 3ARYA 1GONA 1Z32X 1Q6FA 1PBGA 2ZX5A 1KXTA 2ZX6A 1KXQA 1KXHA 4CN6A 5CSYA 2YA0A 1CGUA 4UFHA 3SCPA 2OSXA 1G01A 1B3XA 1JFHA 4WSKA 2BVDA 2J8FA 1CXHA 1OGBA 3LPFA 5HXMA 3UG3A 2YL5A 5DMYA 1GVYA 1WKYA 1W1TA 2FHBA 2J8GA 2ZX9A 1L8NA 1KQYA 3THCA 3WEMA 2Y8KA 1BGGA 2WWCA 2X0YA 3MSDA 1GQKA 4MNMA 1E6NA 3G6LA 4PUEA 1X6NA 4MJ2A 2F61A 2A3HA 3IAPA 2OYMA 4HZ6A 4DUWA 4B9ZA 4M29A 1LLOA 3LPGA 4KWUA 3OGSA 3UG4A 1OGGA 3J7HA 2C8NA 4CCDA 1NWRA 2X09A 3VX0A 4HZ7A 1JF6A 1ESWA 1TR1A 4ZENA 3TTSA 1OD0A 5DT7A 1JNEA 2VCAA 3AYRA 1KB3A 1P6WA 1VEMA 2XM2A 2VX5A 2IXUA 1HN1A 4KRUA 1KWKA 1GOIA 1JZ8A 2DSUA 1J11A 1GQIA 4JL1A 1CXFA 1CXKA 1B9ZA 4JL2A 5A6BA 1UR0A 3PZTA 2WVVB 4ATDA 3LPPA 3WF4A 1NOWA 5EB8A 1OD8A 1HKJA 1SFSA 3WD1A 1EHNA 2YOCA 1EDTA 1AQHA 3EMQA 1VENA 3T0DA 1BG4A 3L4XA 3WMBA 2PWHA 3N18A 1QI0A 2ZX8A 1BVZA 3PZUA 4UOQA 6TAAA 5JBEA 3VGDA 1UR1A 4PUDA 3WQWA 2WHMA 4JCMA 2YBTA 1BYDA 1GOQA 1UHVA 3NCOA 4MNLA 5D8ZA 1J0HA 3W6LA 3AYSA 3ZJ7A 1XRVA 1W2VA 1V6XA 1TG7A 1W1VA 3CZ8A 1D3CA 1QHOA 2VMFA 1E56A 1QI5A 4Q7NA 3GTNA 1VRXA 1HKMA 1K9DA 5A6AA 1V6UA 5A94A 2BXYA 4X0VA 3WUEA 4AWEA 1GQLA 2JEQA 1MQQA 3AICA 3GH5A 4W84A 4PMXA 1KFWA 3ARVA 2VQTA 3N12A 1PZ3A 4DUVA 4UZSA 2VQUA 1OBAA 5A6MA 2CEQA 2J7BA 4H8VA 3OZPA 2D24A 5A2CA 3PZQA 3VM7A 4AD3A 4E4PA 3AMDA 5DFAA 1W32A 4UFJA 2QF8A 4OOZA 4UOJA 5D9MA 2VURA 2V3EA 1CZ1A 2WBGA 1Q6DA 3WUGA 2A3AA 2DGAA 3NYDA 2D2OA 1LJYA 1QI4A 2GJRA 4TX8A 4C7GA 4LYQA 5A8MA 3APGA 3AS3A 2PI6A 3CO4A 2WXDM 4BQ4A 4UOZA 3CUHA 2V3GA 5E0FA 4AC1X 4F8XA 2EPLX 1X1NA 1QNSA 4GI9A 4DUXA 1F4HA 1JI2A 1E4MM 1XD0A 1MW1A 4QCEA 4ZXOA 2BHUA 5LA2A 2WC7A 3K46A 3WFLA 4CVUA 1UR9A 3AIWA 1UWQA 1UWUA 1RPKA 2BVTA 4OOUA 2XM1A 3AS1A 3M7SA 1MWOA 1UYQA 1FFQA 2WMHA 5IHRA 1LL4A 3EDEA 4HP5A 3AZTA 4YHEA 4GZIA 1UKSA 1CPUA 4KGJA 3SCVA 3ARUA 4WKHA 1H11A 3VD7A 4UFLA 2XSAA 2WCAA 4H2CA 1QNRA 4FF5A 2BY3A 2WSPA 3DHUA 4JZ5A 4HU8A 4M80A 4M56A 2AOSA 4TXEA 1GW1A 2BXZA 1HXJA 1M7XA 3VIIA 5I6SA 2DT0A 2CBVA 1WPCA 4WKFA 5HDRA 2CBJA 4FMVA 1GUVA 1VFOA 2CBIA 2ZXBA 1UWIA 3OLEA 2CXGA 5A6LA 3VD9A 3MU7A 4N42A 3W24A 3OIHA 3WMCA 3F4VA 1EHAA 3AQUA 2XIIA 1D7FA 4UR9A 4F79A 2WYSA 1V02A 2Y2WA 4S3JA 4TX6A 4JFTA 3NDYA 1J12A 1E55A 4AXNA 4WK9A 4D6IA 1E70M 4AY1A 1UKOA 1C7SA 3L4YA 4D6FA 1X6LA 2CYGA 3M6DA 2JFEX 3QHNA 1G94A 2WZEA 2A3CA 3WQ8A 4D1IA 3RILA 3ZSTA 3UG5A 3T2QA 1ZJBA 3GNOA 1WO2A 4AZGA 3WKZA 4CD4A 5A1AA 3AMGA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4PRW A;  3ECQ A;  4HMC A;  1YQ2 A;  5IFT A;  2X2Y A;  4H8H A;  1WDR A;  1NOF A;  1UWT A;  1HT6 A;  4URI A;  2EJ1 A;  3OG2 A;  2UY4 A;  1H4P A;  2IXV A;  3VPL A;  3CMJ A;  5I23 A;  5E09 A;  1QBA A;  4MDO A;  2W91 A;  3GM8 A;  5DF0 A;  4GI8 A;  3ARP A;  1WE5 A;  4LPC A;  4M8U A;  3UR8 A;  3WNN A;  3II1 A;  2J47 A;  4LXF A;  7A3H A;  1JI1 A;  1KR0 A;  3ZMR A;  3QHO A;  1MQP A;  2PF0 A;  5EBA A;  3FHA A;  1CBG A;  5CQ1 A;  1EO5 A;  2F8Q A;  2PWE A;  3HN3 A;  4GZJ A;  2EQD A;  4DWS C;  2WLY A;  2W61 A;  4P8W A;  3WBE A;  3WH6 A;  3ZJ8 A;  3A4X A;  1G0C A;  1LQ0 A;  4EKJ A;  2XWE A;  4A3H A;  3ARR A;  1OSE A;  4PTW A;  3WUF A;  3B8S A;  1K6A A;  3VD5 A;  1WDS A;  1BAG A;  1WCG A;  2FHF A;  3VVG A;  2J77 A;  3VDH A;  2WPG A;  1CGX A;  3VMN A;  1H3G A;  1US2 A;  1HIZ A;  2ZWZ A;  2ZUT A;  5KEZ A;  3CHD A;  4UFM A;  2J7C A;  1JDA A;  5ABF B;  2BY0 A;  4HPH A;  3PTK A;  3TTY A;  1ODU A;  1E43 A;  1PX8 A;  1VAH A;  2YA1 A;  1GVI A;  3L2M A;  2CKR A;  4W8B A;  3WN6 A;  2VZV A;  3KL5 A;  3U5Y A;  3F5L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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