1GLBG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
b'KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphotransferase
total genus 155
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG01
1SZ2A 3QFUA 3VEOA 5EY4A 2CH6A 5AQHA 1TYQA 1BA0A 1KXPA 2GEMA 3BF3A 1LCUA 5AQPA 2P9UB 3H46O 3TU5A 4JD2A 3H3OB 4CBXA 2YJEA 3ZETA 4FWOA 4EIAA 3O8MA 3L4IA 3LDOA 4AM6A 1H1VA 2P9IA 3C0BA 1IJJA 1J6ZA 1GLCG 1ZC6A 3D2FA 3DWLA 3VGKA 4MO5A 3HTVA 1BWFO 2QWOA 4BVOA 5AQVA 2V51B 1HX1A 1BOTO 3H1QA 3M1FA 1T6CA 3VGMA 5KQ8A 2YHWA 2FSKA 4KBOA 4FWPA 3EKSA 4FL9A 2YJFA 3BF1A 4DB3A 4NB4A 3ID8A 2P9UA 3VETA 4FWRA 4GY2B 3FFKB 4H0XB 2QWLA 2Q1NA 4BRHA 3QMLA 4O5FA 2A6AA 4K43A 5AR0A 2NRHA 3OHRA 2HF4A 4CZIA 3CJBA 4EFHA 1YUWA 2UYTA 3GE1A 2Q0UA 4BRFA 3CIPA 2E2QA 4FWQA 1NGHA 3LL3A 4WQ5C 2FLOA 2PBDA 3O4WA 3WXLA 3EZWA 5FPNA 1T44A 4PKIA 3B8AX 1JCGA 1ATNA 3FGUA 3L0QA 4JNEA 4MO4A 5AQSA 5TKYA 4B1UB 5BRHA 3MN7A 4PKGA 3M3ZA 2ITMA 5KPRA 2PAVA 4RCHA 4M63C 4Y0WA 4M7XA 3ZX2A 5I9EB 4BRPA 2P9KB 3IMXA 2F9WA 4I6MB 5EXWA 2P9SA 3FLCO 4B1ZA 3QB0A 3VERA 2F9TA 3DJCA 4BR5A 5FPMA 3BEXA 4A2BA 1HPMA 1U2VB 4BR7A 1QQOA 2J4RA 1GLDG 1HLUA 3FZKA 5AFUH 2Q97A 3O5BA 2GWJA 2P9PB 1DEJA 1OKJA 2YI1A 3D7EO 3QBWA 1BG3A 3U9DA 5F1XA 2E1YA 3LDLA 3WQTA 1P8ZA 3VEYA 4H0YB 4BR9A 5AQNA 2V7ZA 4BG9A 5AQKA 2GUPA 2KHOA 4QS8A 3GBTA 1GLBG 4BRGA 4BRDA 1RFQA 4JD2B 3KVGA 4I6MA 3VEXA 5LJWA 4GNIA 1GLAG 4H5TA 2Q36A 3UE5A 4MLHA 4WQ4A 4DQ8A 1QQMA 1MA9B 2HOEA 3I8BA 1Z05A 1Q18A 1NGGA 2A3ZA 2A5XA 3ATVA 4A62A 4BR2A 2P9IB 4PL7A 3D2FB 1U2VA 3GL1A 5BN8A 2HMPA 3O1BA 4CZMA 3O1WA 2P9PA 4DCHA 2AA4A 3J8AA 1KAZA 1X9JA 5AQJA 1GLJO 3MK6A 4BROA 3SLCA 5E26A 1NGDA 5BREA 1RGIA 2FF6A 2QWNA 3GOIA 3LDPA 2E20A 4WYBA 2A41A 4BG8A 5ADXH 2AP1A 4PKHA 1K8KB 2Q31A 4BGAA 2FSJA 3QBXA 2DPNA 1ESVA 4CD1A 1JCEA 4H5RA 4FWLA 3AAPA 4L3QA 4A2AA 4H5WA 1C0FA 1U6ZA 5CE3A 3WUHA 4E1JA 1ZBSA 4C23A 3CJ9A 1KAYA 2GWKA 2I7PA 3ENHA 2EWSA 3A5OC 3IDHA 2P9NB 3MN5A 4EHTA 4BRNA 2FSNA 4CD3A 1NGJA 1SQKA 3M6GA 4FPBA 3IUCA 1K8KA 3WEEA 4H03B 2WUSA 4ISFA 4B1VA 1R59O 1ATRA 4BC2A 5AQXA 2E2PA 3ENOA 3WT0A 2QWPA 4BRKA 3CQYA 4ISEA 2ZF5O 3ATUA 5AQGA 1NGIA 1LOTB 2P9SB 4BREA 4FSVA 1QZ5A 3I33A 4FWKA 4H5NA 4BQLA 2E2NA 4H0PA 3KHYA 4CZHA 4JN4A 4BC5A 2D0PA 5AQZA 3W0LA 4IO8A 1MWKA 1NMDA 5AFUA 2QWMA 1NM1A 3GG4A 2ZGZA 1NGCA 3FZMA 2IVNA 3AY9A 4CZLA 5BPNA 1G99A 2P9NA 4IJNA 2NLXA 3U9ZA 4K41A 1D4XA 3CHWA 1NLVA 5LY3A 5AQOA 3BP8A 4FO0A 3AARA 4CZJA 3CJ7A 2ASPA 1HKCA 4XH1A 2V7YA 1TUUA 1C0GA 5AQLA 2E1ZA 4B1WB 2VYPA 3CI5A 3MN6A 2CGLA 1DGKN 3QICA 4IWVA 2QM1A 2VCPA 3VENA 2FXUA 3H6EA 3BUZB 3A5NC 3F9MA 3W3DA 5AQIA 1JCFA 3WQUA 5AQUA 3C7NB 3HI0A 3ZX3A 3FE1A 4NO7A 4RWTA 2CGJA 5EX5A 3D2EB 5AQFA 3S41A 3AAQA 2QXLA 3VF2A 3L6QA 4QS7A 4BC3A 2D0OA 5BPMA 5F0XA 3UKRA 3UKUA 5AZJB 3SK3A 2V52B 3LM9A 4YDUA 1IG8A 2P9LB 4ISGA 3A0IX 5BRFA 3WXJA 5ADXA 2E88A 3FZFA 5BR9A 3R6MA 1ZXOA 3WXIA 2QWRA 3WXKA 3VF4A 3O08A 4B9QA 1X3NA 1XQSC 1ATSA 3U4LA 4K25A 3VESA 3GDQA 4O8KA 2E2OA 4CZFA 1BO5O 3C7NA 1V4SA 3HZ6A 4BRQA 4H0VB 4DHYA 1T6DA 4F9OA 5KPTA 2W41A 2NZTA 3DXMA 5F2RA 4CBWA 3D2EA 4J8FA 1YAGA 4H0OA 1TUYA 3CETA 2BUPA 2ZGYA 2FF3B 3ULEB 5AZJA 1BA1A 5FPEA 2W40A 3FR0A 2P9LA 4CZKA 3H3NO 4BR0A 4EAHD 5BRDA 2YHYA 3O6WA 2QWQA 4MLEA 3WEEB 1V4TA 5B8HA 3U8XA 4CI6A 3LDNA 4XH4A 3LM2A 1KAXA 4RTFD 2GELA 3MDQA 3DXKA 3VOVA 1GLLO 4FWNA 1S22A 2A40A 3MN9A 3ZEUB 1BUPA 4FWMA 4BC4A 2IVOA 5AQYA 1X3MA 1E4GT 2YCHA 4WQ4C 2ASMA 3UB5A 3ULEA 5AQMA 5AQWA 4WQ5A 4B1XB 3LDQA 1NGFA 5BPLA 1QZ6A 5LJVA 1MWMA 4K42A 5JICA 2ZWHA 4FWSA 3G25A 2ASOA 3QDKA 4BGBA 1Z6RA 1HUXA 1NWKA 3HM8A 4XEIA 4BRCA 3H1VX 3H45C 3R9PA 3JS6A 3ZEUA 4HTLA 4H0TB 1YXQA 1S3XA 3R8EA 2Q2RA 4IZ9A 3EL2A 3HBTA 1WOQA 5JLHA 4B1YB 3SJHA 3ZX0A 5FPDA 4IJAA 3VEZA 5AQQA 3UKRB 3UKUB 3P4IA 3VEVA 4XH5A 4H5VA 3VF6A 3A8YA 3CJCA 1NBWA 3VPZA 4JHDB 3RSEB 5EVZA 5AQRA 3KZBA 4BQZA 3TPQA 1RDWX 2YHXA 4BRAA 3EO3A 3VGLA 3SMPA 5JLFA 4Z94A 5E84A 1QHAA 2QW9A 2IIRA 3DXMB 4BR4A 4FOEA 1NGBA 1XUPO 3JXUA 3FZLA 1CZAN 3QFPA 3CJAA 2OANA 4IXCA 1HKBA 4CJ7A 4BRIA 3DAWA 5AQTA 4JHDA 4AM7A 3CERA 3RSEA 5ELZA 2D4WA 1HKGA 3CJ1A 1YVNA 3VEWA 5EOYA 2E8AA 3FZHA 2D1KA 4FOIA 3EKUA 1BDGA 5AZIB 4A61A 4BRMA 3MCPA 4BRLA 5JMVA 4CZEA 1DKGD 4PL8A 4CBUA 2IVPA 3A5MC 3MMVA 4CZGA 1BU6O 3DXKB 4HWIA 1TYQB 4QS9A 1GLFO 3EN9A 1XC3A 4M7YA 2HF3A 1MDUB 5KPZA 3A5LC 4FPAA 2VWBA 1WUAA 2P9KA 2A42A 3ZETB 2Q0RA 4LC9B 1QQNA 3SMSA 3IFRA 2CH5A 1EQYA 1NGEA 2BTFA 2GTDA 1NGAA 5KQDA 1GLEG 2I7NA 5BN9A 3O80A 4BVPA 1SAZA 2CGKA 1HJOA 4JAXA 5AZIA 3CQXA 1E4FT 1Y64A 3HSCA 2H3GX 4EHUA 4YDUC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4A5AA 4HCCA 3THXB 3U3GA 3H46O 3TU5A 3CXCM 3L3UA 2UXBK 3ZETA 2B5JA 4O44A 1C6VA 3M8RA 4BE2A 3VQBA 1YJWN 2P9IA 3C0BA 3M8PA 3DWLA 4C8MA 4FCYA 2Z1IA 2F8SA 3RRHA 1KCFA 3V9WA 1KVCA 1VSFA 1KC8O 1TKDA 5AQVA 3NCIA 4HUFA 3S3NA 2OPRA 4N76A 1BOTO 3M1FA 3TTFA 3KJVA 2YHWA 3CG7A 1JLCA 4JI7K 4E89A 1YHQN 2XY5A 1N5YA 4JK7A 4DB3A 1VQMN 2QKKA 4FWRA 2UUCK 1ZBFA 4IEEA 1HYVA 4H0XB 3TAQA 4BRHA 2A6AA 1QSSA 2HF4A 1O13A 1EP4A 2OA8A 3O9RA 2UYTA 4KH6A 3CIPA 4LF8K 4WQ5C 3ZYYX 1DTQA 4IDHA 5KGWA 4CJVA 2PBDA 3L2UA 1WSEA 4GVMA 4XIUA 1WSIA 3J7AP 1T44A 2RPIA 3B8AX 3BY5A 4LH5A 3L0QA 3OYBA 1T7PA 4B1UB 1ZBHA 4ID5A 1P90A 4M63C 4Y0WA 4OPJA 4F3OA 4CHYA 3I55N 3PV8A 2P9SA 4Q5VA 3DJCA 3VQCA 4FW1A 3HOSA 4B9SA 3O4QA 1HPMA 3AO2A 3LPTA 3NGIA 3OS0A 1U2VB 1LAVA 4JKBA 3HK2A 3OY9A 2D0CA 1HLUA 4NLBA 1D9FA 5AFUH 2KZZA 3C6HA 1OKJA 3D7EO 4DSLA 3QBWA 1VSDA 5E41A 2DY4A 2E1YA 3LDLA 3L3VA 4Z4GA 1HNWK 2BH1A 4JKHA 4H4OA 5AQNA 1JLQA 5CR4A 3J80O 2XO7A 2GUPA 4CECA 2HNZA 3CC4N 1GLBG 4BRGA 4LF5K 4GV6A 1GLAG 2P51A 4MLHA 1WNSA 4WQ4A 3DLKA 4H4MA 1RTHA 5CYMA 5BN8A 4AHCA 1YITN 4WFBL 3HM9A 4CZMA 3VQ5A 4DCHA 3J8AA 3MK6A 4CJ5A 1Z26A 2FBXA 1G15A 3IKMA 5BREA 5FRNA 2E6MA 3MWPA 2IAJA 3GOIA 5AJ3K 4DSKA 3G0ZA 4PKHA 1CLQA 1K8KB 4B3RK 4KHQA 4BGAA 5C2DA 2DPNA 3TSUA 1ESVA 4CD1A 3KD5E 4FWLA 4H5WA 4ELTA 2KTQA 3HRGA 1QVGM 3WUHA 4CFCA 4E1JA 4CJRA 1GOCA 1ZBSA 3O9UA 4DQRA 1VQ4N 1SL0A 3AVNA 4PQUA 1KAYA 1KD1O 2I7PA 1NK5A 1S1WA 5J1EA 1JXEA 1RDAA 2WBNA 3MN5A 1NK6A 3ZT4A 3M6GA 1Q82O 4JKGB 4KHUA 1XC9A 2HSTA 3WEEA 4H03B 3SUPA 2O8EB 4GW6A 5AQXA 3ENOA 3DOKA 1VAZA 3CQYA 3SV3A 1VQ9N 1QSLA 3I33A 4H5NA 4H0PA 3AV9A 3SBTA 4CZHA 3SUNA 3LZIA 1MWKA 5C2FA 4NXMK 2QWMA 4OX9K 3AY9A 1TK0A 1G99A 2NLXA 2XRIA 4HTUA 5LY3A 2KZMA 3DLRA 2P1JA 4CZJA 2XY7A 3KKSA 1ASVA 3CJ7A 3P31A 3OBWA 1BCOA 3QIOA 2HHVA 4O8UA 4N5SA 4NCBA 1C0GA 4G9ZA 4DV7K 4CF0A 4B1WB 4FJKA 2QM1A 2VCPA 3LP1A 3CPWM 5AQIA 5AQUA 4M3RA 1X9MA 3HI0A 4E19A 3QLHA 3ZX3A 3DYAA 2E4LA 4WF9L 3DOLA 3D2EB 3VF2A 1X1PA 4M3YA 1RBVA 4FYDA 5H1SQ 3SK3A 2V52B 3QNOA 3OJUA 2P9LB 3KLIA 3PX6A 1U49A 4F4KA 2QWRA 4JKFA 5C42A 3VF4A 3SQ4A 3T3FA 3E9LA 1QHTA 2YKNA 4O8KA 2E2OA 1RTJA 1N6QA 3OS2A 3J7ZO 5HRNA 5GAEP 3DXMA 4CBWA 4J8FA 1YAGA 3MWTA 1TUYA 3I0RA 3CFRA 2LSNA 4CGHA 3DI6A 3E1YA 4FLTA 4OVLA 1RT3A 3PUFA 2HB5A 4RW8A 1DT9A 2X6NA 4MLEA 3SI6A 1V4TA 5B8HA 2HBLA 4AH9A 2PYLA 4DTRA 3LM2A 4E7IA 1KVAA 2O8DA 2UU9K 3MX2A 4CFDA 3VOVA 4R79A 2A40A 3ZEUB 4CCHA 4BC4A 2IVOA 5AQYA 4RW4A 4WQ4C 4JI0K 3UB5A 5JVGL 4LSNA 1W9HA 5AQWA 1TL3A 1N8RO 2HBJA 1QZ6A 1UWBA 4CK3A 3OYJA 4CK1A 3OYFA 4JRPA 3OJSA 3JAMO 4C8LA 5A2QO 4FWSA 2ASOA 3QDKA 1HUXA 1RDBA 1TGOA 4X64K 3BDPA 3TSPA 5HRPA 2WONA 3D6RA 3G10A 4HTLA 4FJHA 4FM1A 3C65A 1VQ6N 2JLEA 3EL2A 4LF7K 1WOQA 3SQ0A 4B1YB 1NK7A 3O3FA 5JS2A 4L8RB 4JYAK 3CCMN 3UKUB 4CERA 3QERA 3T19A 1F21A 1SV5A 4DV4K 1SKRA 2YKMA 5EVZA 5TKWA 3VQEA 4BQZA 1WB9A 1RDWX 4B9UA 3WNHA 4FK2A 5KTQA 4FJIA 3EO3A 3VGLA 3SBGA 1BHLA 5JLFA 3QETA 3RVCA 3NAEA 1B9FA 4M41A 3OYNA 1XUPO 4CJQA 2YV0X 2PYJA 5HL7L 3QFPA 4AHSA 4K8XA 2DFEA 2OANA 3O9QA 3NGYA 4FLVA 1FK9A 4IXCA 1FW6A 4DR6K 4DTXA 4JHDA 4YY3K 1JLAA 2E8AA 4JI3K 4A61A 1BDGA 3BZKA 4CHNA 1DKGD 3SAGA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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