1GLBG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
total genus 155
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG01
3SLCA 2E1ZA 1MWKA 3B8AX 5FPEA 3A8YA 5EY4A 3VESA 5AQSA 1IG8A 5AQOA 1TUUA 1YXQA 4CZHA 4BG8A 4WQ4C 2P9UB 2V7YA 4IXCA 3UB5A 3CJ1A 1SZ2A 2DPNA 4O5FA 2D4WA 2IVPA 3ZEUB 5AR0A 3KZBA 1NGBA 2CH5A 3HI0A 4CZEA 4BG9A 2GWJA 1S22A 1U2VA 4HTLA 3U9DA 4PL7A 1QQMA 4FO0A 4B9QA 4CBWA 4E1JA 3U4LA 3DWLA 2E2PA 5AQRA 3ZX3A 3QMLA 1GLAG 5AQZA 3IDHA 4I6MA 4MLHA 5FPDA 2BUPA 3QB0A 4NB4A 4BQZA 2PAVA 1DEJA 2FF6A 3VERA 4A2AA 3QICA 4K43A 4BVOA 4BRCA 1D4XA 4HWIA 4B1UB 1XQSC 2P9SB 4NO7A 3DAWA 3H1VX 3AAQA 4M7YA 3HZ6A 5I9EB 3GBTA 2P9PB 2E1YA 2NZTA 3EO3A 1QQOA 5BPMA 2E8AA 2FLOA 2KHOA 1OKJA 4A2BA 2FSNA 1V4TA 2D0PA 2HMPA 3CERA 3O1WA 4CZIA 3BP8A 3O1BA 2YHYA 1HX1A 2YJEA 4FPBA 3TPQA 4H5VA 2YCHA 4BRIA 1NMDA 2Q1NA 4IWVA 5F1XA 2Q0UA 3UKRB 2CGKA 3R8EA 3BF1A 3VGKA 3O4WA 1LCUA 1NGAA 5AQHA 4FWSA 4DHYA 3J8AA 4BRHA 4BR2A 3KHYA 4BVPA 5KPZA 2F9WA 4H0XB 3LL3A 5BRFA 4FWNA 3VEWA 4FPAA 3SK3A 2AP1A 3WUHA 3KVGA 5F2RA 3UKRA 3FZKA 4CZFA 2CH6A 3H6EA 3O8MA 3VETA 4LC9B 1C0GA 4FWRA 4B1WB 2QW9A 3CJ7A 4O8KA 3FR0A 2E2QA 4JHDB 2QWLA 5AZJB 1JCEA 5AQXA 1LOTB 4B1ZA 3CIPA 5AFUH 3A5NC 3A5OC 3A0IX 5EXWA 3ATUA 3DXMB 2QXLA 3R6MA 4JHDA 4JD2A 2UYTA 2YJFA 5ADXH 5AZJA 1BWFO 4H03B 2IIRA 1BOTO 1BU6O 2Q36A 4H5RA 3O80A 4MO5A 5AQYA 3H45C 5AQKA 3DJCA 2GWKA 1KXPA 1RGIA 5AQLA 3MCPA 3HSCA 1ZXOA 4CI6A 2OANA 3SJHA 3DXMA 3R9PA 3QBWA 4QS8A 2YI1A 4PKGA 4JNEA 1WOQA 1R59O 1X3NA 2NLXA 4EFHA 3O6WA 3WEEB 3BF3A 2ASMA 4H0OA 3GL1A 3W0LA 4RWTA 2F9TA 4QS9A 3IUCA 1XUPO 4WQ4A 2EWSA 3VEYA 5EX5A 3WEEA 1Y64A 1U2VB 3L6QA 3LDNA 3FZHA 2HF4A 4XH1A 2P9NA 1SAZA 3FE1A 1RFQA 5LJVA 1BDGA 1QQNA 2A5XA 3WXIA 4CZGA 1NM1A 4I6MB 5TKYA 2ITMA 3ULEA 2FF3B 2CGLA 3UKUA 3ATVA 1ATSA 3VF2A 3HBTA 1MWMA 1V4SA 4BC2A 4CJ7A 3CJCA 4YDUA 4B1VA 4YDUC 2A40A 5BREA 4FL9A 3D2EA 3RSEB 5AQPA 4Z94A 2BTFA 3WQUA 2QM1A 4FWMA 4PL8A 1BA1A 5AQMA 4BRDA 1ZC6A 3CJAA 5AQNA 4BRQA 4BRGA 4H0YB 2QWMA 3EKUA 2WUSA 3F9MA 2ZWHA 5FPMA 3JXUA 3RSEA 1HKGA 4K41A 3IFRA 2Q2RA 1NWKA 4CZKA 4EHTA 3FZMA 4BR4A 3GDQA 4BR0A 1E4GT 4MLEA 1BUPA 1GLBG 3H1QA 3QBXA 3VF4A 5BRHA 3M6GA 4C23A 4CBXA 4PKIA 1JCGA 1Z6RA 1J6ZA 2ZF5O 3IMXA 5AQUA 3VEOA 4KBOA 5AQVA 5FPNA 1MA9B 2A3ZA 1NGHA 4MO4A 1RDWX 4BGBA 3VEZA 1JCFA 3LDLA 2A41A 5JLHA 2YHXA 4M7XA 3U9ZA 3DXKA 3WXKA 2V52B 3ENHA 4IO8A 4H5TA 4EHUA 4XH4A 4BC3A 2W41A 5E84A 1BO5O 4FWKA 1TYQA 4H0VB 4H0TB 4RCHA 4K42A 3G25A 2QWQA 1KAYA 2A6AA 4CD3A 5LY3A 1K8KB 4JD2B 5BN9A 5ADXA 3M1FA 5AQGA 4RTFD 3CJBA 3BUZB 1IJJA 1DGKN 3O08A 2GEMA 3MN5A 1DKGD 4DB3A 1K8KA 4BRAA 1T6CA 2QWRA 4FWPA 2E20A 3A5MC 4BR9A 4FOEA 1NGCA 1ESVA 3O5BA 3ZX0A 3VOVA 5EVZA 3VPZA 3LDPA 3CJ9A 3CHWA 2H3GX 3H46O 2V51B 3CQYA 1GLDG 4F9OA 3MN9A 1E4FT 2P9IB 3BEXA 2E2OA 3EKSA 5AQTA 1QZ6A 1GLJO 4EIAA 3C7NA 2CGJA 2VWBA 2P9NB 3LDQA 4BREA 5E26A 3ULEB 2P9IA 4FOIA 5KPRA 4IJAA 3UKUB 1NGJA 3EZWA 4EAHD 4BRMA 5CE3A 3VENA 5JLFA 1CZAN 4XEIA 1EQYA 1ATRA 3MN6A 3QDKA 4BRLA 3QFUA 3U8XA 2AA4A 4IJNA 4GY2B 3AARA 1HLUA 3D2EB 1HUXA 2I7NA 4CZLA 2IVNA 3WT0A 4B1XB 3ZETB 3ZX2A 4J8FA 4BQLA 5JICA 1NGGA 4ISEA 1HKBA 2ZGYA 3GE1A 1BG3A 4ISFA 5KQ8A 3LM2A 4DQ8A 1T6DA 3ENOA 5JMVA 2GELA 5AQIA 3D2FB 2ASOA 3ZETA 1KAXA 2PBDA 1HPMA 1S3XA 2P9UA 5BPNA 1Q18A 3L0QA 1P8ZA 2IVOA 1GLEG 1X9JA 3M3ZA 4CZMA 5BRDA 2QWPA 2W40A 3FFKB 3ZEUA 3A5LC 3ID8A 2ZGZA 4AM6A 3FZFA 3LDOA 3D2FA 4XH5A 1T44A 4FSVA 3L4IA 2ASPA 3UE5A 4CD1A 3WXLA 1NGDA 4Y0WA 4BR5A 4A62A 4FWOA 1NGEA 5AQJA 4GNIA 3DXKB 1G99A 4BRNA 1NGIA 2D1KA 4M63C 4DCHA 4PKHA 3FGUA 1ATNA 3HM8A 1XC3A 5BN8A 1X3MA 4BROA 3MN7A 1BA0A 1TYQB 4WYBA 2E88A 1C0FA 2VYPA 4L3QA 1HJOA 3D7EO 2GUPA 4IZ9A 3VGMA 2P9SA 2QWOA 5AQWA 2E2NA 3GG4A 5AQFA 2FXUA 3MDQA 1NBWA 5AZIB 2P9PA 2Q31A 3VF6A 2Q0RA 5F0XA 3OHRA 4QS7A 5AFUA 2D0OA 1H1VA 2VCPA 4FWQA 3HTVA 4K25A 1KAZA 4H0PA 2HF3A 4BGAA 1U6ZA 5AZIA 2P9KB 2YHWA 4B1YB 1GLCG 4FWLA 5BR9A 3FLCO 5KPTA 3CETA 2FSKA 3CQXA 1WUAA 4WQ5A 3TU5A 3W3DA 3WQTA 4WQ5C 2P9KA 4JAXA 2QWNA 4H5NA 1QZ5A 3MMVA 5LJWA 3H3NO 3C7NB 1NGFA 2A42A 3EN9A 2J4RA 4BRKA 3LM9A 2P9LB 2HOEA 5AQQA 4H5WA 3MK6A 4BRPA 1GLFO 2V7ZA 3H3OB 3QFPA 4ISGA 5EOYA 3VGLA 3VEVA 5KQDA 4CBUA 3C0BA 2Q97A 4BR7A 3AAPA 5BPLA 3I8BA 3VEXA 2GTDA 2P9LA 3WXJA 1QHAA 2I7PA 4A61A 4BC4A 1GLLO 3I33A 5B8HA 1HKCA 3AY9A 1NLVA 3GOIA 1Z05A 3S41A 3SMSA 3JS6A 1YVNA 4BC5A 1YAGA 1YUWA 2FSJA 1MDUB 4AM7A 1SQKA 1ZBSA 3SMPA 4BRFA 3EL2A 3FZLA 2NRHA 4CZJA 3P4IA 5ELZA 1TUYA 4JN4A 3CI5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NE6A 5FPEA 4FXDA 3OW2M 3A8YA 4NCGA 3VESA 4DSKA 5AQOA 3ZT1A 5C12A 4FLWA 1XWLA 3CJ1A 4O55A 3K59A 1VQ8N 3ZLJA 2DPNA 2PYLA 1KTQA 3OYMA 1JXBA 3HPOA 4CZEA 1B9DA 4HTLA 4WFAL 3AVGA 1WSEA 4BDPA 4CBWA 4B9QA 4E1JA 4CJTA 3TSQA 3L2VA 3S3OA 1GLAG 1HNXK 3KWIA 4ID5A 3IDHA 4I6MA 4F3OA 4BQZA 4IFYA 3QNNA 3AVIA 2IS3A 3QICA 2JWKA 4K43A 1HNIA 4BVOA 1T7PA 4BRCA 2FBXA 4O8UA 4JS5A 3QERA 2P9SB 4OVLA 4FLZA 4DSJA 4AQYK 1EWQA 2P9PB 1GOAA 2NZTA 4H8KA 1QQOA 4FLVA 3HP6A 2D0AA 1E3MA 3OS1A 2HMPA 4CZIA 3BP8A 2YJEA 1K73O 2IGIA 1JKHA 4E89A 2G8FA 1HJRA 3NH2A 2Q1NA 3V81A 3VTHA 2WFBA 4Z4FA 4WFBL 2VGNA 5F1XA 3D0PA 2VQEK 4C1NI 3E9OA 2CGKA 2UXBK 5LMUK 1LCUA 1RT3A 1T8EA 5KPZA 2F9WA 2WBNA 4H0XB 4GV3A 3HPHA 1OH7A 3KVGA 4L8RB 2WC9A 1TV6A 3ZSQA 4DFMA 1S9GA 2RKIA 3AVMA 3K58A 3O8MA 2X74A 3EZ5A 4JRQA 1BISA 1XMOK 2QW9A 4X66K 4O8KA 3FR0A 2E2QA 2IC3A 2PYJA 1C0MA 4Z4CA 1U49A 1LOTB 1JLGA 5CZ1A 4DUZK 3A5NC 1D9DA 3A5OC 4DQRA 4CE9A 3TAGA 5ADXH 1BOTO 2Q36A 4MO5A 5AQYA 1FXXA 3H45C 4B9SA 3TSPA 4HUFA 2GWKA 5AQLA 3HSCA 5J2NA 1JL1A 3CC2N 3KWGA 3PX6A 1X3NA 2JWLA 3WEEB 1NK4A 1KLMA 4C8MA 2OTLN 4KHQA 2F9TA 1VQ7N 4QS9A 1XUPO 4WQ4A 2ZJQL 4M3TA 2EWSA 4E7HA 3WEEA 1X9SA 3OBYA 3VQ6A 3E66A 4RW7A 4I2PA 3FZHA 1VRTA 2HF4A 3DYAA 4CHQA 1RFQA 1RILA 2D0BA 3CCVN 4CJRA 2CGLA 3KK1A 2KZMA 3ULDA 4DR4K 2Z1IA 3Q7CA 4B8AB 1MWMA 4BC2A 4CJ7A 4JK7A 4PUOA 2Z1GA 4DR6K 4H4OA 1IKXA 3WQUA 4X62K 5AQMA 4YFUA 5EU7A 3V9ZA 3EKUA 4DR3K 3F9MA 5FPMA 1HKGA 4K41A 5HLFA 1N33K 4AHCA 4BR0A 4MLEA 5I3UA 4B3TK 5BRHA 5J2MA 1S1XA 4GW6A 4PKIA 3CXCM 1OH5A 1Z6RA 1C6VA 1NJWA 5C15A 3ISNC 4KBOA 5AQVA 3ZT2A 3VA0A 5LL6Z 5A2QO 1KVAA 4BGBA 3VEZA 5M1QA 1JCFA 4I2QA 4JI5K 4W5RA 2F4VK 3DXKA 1VSKA 4DWIA 2V52B 3ENHA 3PV8A 4XH4A 1R0AA 2W41A 5E84A 3RMAA 3JAMO 1KRPA 4Y1CA 2HHWA 4DU4A 4H0VB 4JV5K 1P90A 1IO2A 4LFBK 4K42A 3O9SA 3PSIA 4CD3A 3TARA 2QEXN 4DR5K 3J81O 4KHUA 4RTFD 4CJQA 4B3SK 2HHQA 1IJJA 1DGKN 3I56N 1WSIA 5HRRA 1A5WA 2Z1JA 2HHSA 1L3TA 4KKOA 3O5BA 3ZX0A 3KKRA 3VOVA 5EVZA 3SPZA 4AHSA 3VN5A 3CHWA 1QS4A 3H46O 2V51B 3CQYA 3CCMN 3TSUA 1GLDG 4A57A 4F9OA 3MN9A 5D3GA 3MCAB 4DSIA 2YNIA 3BEXA 3EKSA 1EP4A 5AQTA 3IKMA 2JLEA 3C7NA 1SS6A 1YTAA 3M5RA 1BQNA 1I94K 4J2AA 4CFAA 3E01A 4CEFA 1CZ9A 2RN2A 3LPUA 3V9UA 2YX6A 5E26A 4FOIA 2HW3A 1VSMA 3UKUB 2QA4N 5JVHL 3EZWA 4EAHD 5KRTA 5CE3A 1CZAN 1HYVA 3PX0A 1BCMA 3T1YK 1ATRA 3VQPA 1S1WA 3M8SA 4GY2B 2KQ2A 3AARA 4Y1DA 2OPPA 1RDDA 3R1XA 3WT0A 4B1XB 4FK4A 2O4GA 3ZETB 1TVRA 4J8FA 3HP9A 1NGGA 2Z1HA 3NF9A 4M3WA 1HNZK 5M1NA 3DM2A 2X78A 3D2FB 3NVKA 3ZETA 2PBDA 4QCLA 4Z4IA 4OLAA 3SYZA 4PWDA 1LW2A 3AVNA 4C8LA 1ASUA 2O8EB 1BI4A 3M3ZA 3T1HK 4CGJA 2W6LA 3DMJA 1XHXA 3LDOA 3D2FA 4FSVA 3DLBA 2ASPA 4CD1A 4M3RA 5SWMA 4DR1K 3WXLA 3NF6A 3PUFA 4Y0WA 2O8EA 4KB0A 4DFPA 5AQJA 2OYQA 1NGIA 4DV0K 4A5BA 3J80O 4DCHA 3FGUA 3CD6N 2G8HA 3LWMA 1HRHA 3BDPA 1X3MA 1RT7A 4KREA 3VQ7A 1BA0A 3K9KA 1HR0K 4Q5VA 4L3QA 5C0YA 1YVUA 4KB1A 3AVAA 2FXUA 4KHWA 1NBWA 4LSLA 2Q31A 5AFUA 2OCEA 1H1VA 1JLAA 3NH1A 3OY9A 2HBMA 3HTVA 1YJNN 4LFAK 4DV1K 1A5VA 1RBUA 5FDLA 1KAZA 3TABA 4CF2A 4FJ5A 3B6PA 1FKPA 3T1AA 4CF8A 1N5YA 3V6DA 3FLCO 3SPYA 1VK0A 3HVTA 4ID1A 3ZYYX 5KPTA 1VQMN 1YTUA 1IH7A 5J2PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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