1GLBG

Structure of the regulatory complex of escherichia coli iiiglc with glycerol kinase
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
496
structure length
489
Chain Sequence
b'KYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSSTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of the regulatory complex of Escherichia coli IIIGlc with glycerol kinase.
pubmed rcsb
molecule keywords GLUCOSE-SPECIFIC PROTEIN IIIGlc
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphotransferase
total genus 155
structure length 489
sequence length 496
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1992-10-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
G PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
G PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1glbG01
1KXPA 3SJHA 3LDPA 4FWKA 2I7NA 4BR7A 4CD1A 2I7PA 4K43A 2A5XA 3GOIA 2E2OA 4BGAA 4BRFA 4BREA 4FOEA 1X3NA 3ID8A 1HKBA 3DXKA 3CETA 4J8FA 1NGGA 2A42A 1NWKA 4FWPA 5AQUA 1TUUA 2CH5A 4NB4A 1K8KA 3CI5A 4BRLA 3R8EA 5BRDA 3A5OC 5BN8A 4FWSA 4FOIA 5BRFA 2FF6A 1G99A 3A8YA 1WUAA 4BGBA 4DCHA 2IVPA 1Y64A 1X3MA 2ZGYA 1X9JA 2GELA 3VEZA 1ZBSA 3WEEA 1BOTO 4H0VB 4H0YB 1TUYA 1E4GT 4K41A 1U2VA 5AQGA 1T6CA 4ISGA 5AQZA 2V51B 3FZLA 3UKRB 4BROA 4RTFD 4IWVA 1D4XA 1HKCA 2W40A 2YI1A 2QWPA 2VCPA 3A5LC 2GUPA 4BG9A 1BA0A 1R59O 1K8KB 1DKGD 2ASPA 5ELZA 4CI6A 5JMVA 3WQTA 5AQXA 3QB0A 4XH4A 4CBWA 4MLEA 4CZMA 4IZ9A 1S22A 3O08A 3ULEB 2P9KB 3HSCA 3ENOA 2IVOA 4M7XA 5AR0A 2H3GX 2D1KA 1BA1A 3U9DA 1SAZA 2J4RA 4O5FA 3MCPA 1U2VB 4A61A 3WUHA 3CJ7A 5B8HA 3ZX2A 5AQRA 4B1WB 4PKGA 1XC3A 3VEOA 5BPNA 1S3XA 3H1QA 2Q36A 4CJ7A 1QZ5A 1XUPO 4JHDB 3VPZA 1Q18A 1KAYA 1ATSA 1BG3A 1KAXA 2E1ZA 5JICA 1NGJA 4BR5A 4CBUA 2QWMA 3SK3A 2CGLA 4FL9A 5LJWA 5AQKA 4FWLA 1T44A 4BG8A 2VWBA 4B9QA 1QQOA 4CZLA 2E2PA 1HKGA 4EIAA 4I6MB 4EHTA 2E2QA 5BREA 1NGAA 3CIPA 3EKSA 3O5BA 4AM6A 2ZWHA 4BC5A 4PKIA 3JS6A 4YDUC 3MDQA 3EN9A 5ADXA 4H0TB 2BTFA 3H6EA 3H46O 2P9UA 3B8AX 1NGHA 3BP8A 4H0OA 3R6MA 3C7NA 3LL3A 5AQNA 3SLCA 4H5WA 5AQLA 1Z05A 2P9NB 4WQ5A 4BR4A 3GBTA 3VESA 4JAXA 4BRNA 4BRDA 3FGUA 1QQNA 3VENA 5AZJA 2YHYA 3L0QA 2A6AA 4BRQA 5KPRA 3S41A 4B1XB 3LDLA 3VGKA 5KPTA 2FLOA 1YUWA 3IFRA 5FPDA 2IIRA 3EL2A 3D2EA 4DQ8A 3KZBA 4BQLA 1P8ZA 4C23A 2GWKA 4FWNA 3WXKA 3VEVA 3MK6A 2ZGZA 5EVZA 3G25A 4CZGA 4H0XB 1RGIA 2YHXA 4JD2A 3TPQA 3C7NB 2P9SA 4K25A 1LOTB 3ZX3A 5E84A 3CHWA 3MN9A 5KPZA 3QBXA 1TYQA 4BR0A 3ZEUA 3AY9A 4HTLA 3AARA 4IJNA 3RSEB 5AZJB 5E26A 3BF3A 1DGKN 4NO7A 2V7YA 4BC2A 2E2NA 3VGLA 2P9IA 4BRGA 5F0XA 1GLEG 2FSJA 3L6QA 4XEIA 5BRHA 2HF4A 3AAPA 3CJAA 1CZAN 3D2EB 3P4IA 4BVPA 4BRPA 4LC9B 1NGDA 1MWMA 4A2AA 4JD2B 2P9SB 3DXKB 4FWOA 3U9ZA 3R9PA 4DB3A 1NGBA 4MO4A 4CZIA 3HZ6A 3SMPA 4BC3A 1IG8A 1QZ6A 3ZEUB 3H1VX 3VF2A 3A0IX 4BRKA 5JLFA 1C0FA 2P9PA 3QBWA 3EO3A 3GG4A 2E88A 2AP1A 1ZC6A 5EXWA 3EZWA 4FPBA 2F9TA 2Q1NA 3WEEB 2NZTA 2QW9A 3FLCO 3ZETA 1EQYA 3CJBA 4A62A 4FWMA 1HPMA 4BQZA 1GLCG 2CGJA 5FPNA 3O80A 2P9LA 1T6DA 3ATVA 3CJCA 5AQIA 2ITMA 3UE5A 4MLHA 1U6ZA 1BU6O 4BRCA 5AFUH 2GEMA 4H5RA 5EOYA 3GE1A 2HF3A 4RCHA 1NLVA 4EHUA 3FZKA 2GTDA 5KQDA 4FPAA 2A41A 2GWJA 3FE1A 2Q31A 2A40A 4BC4A 1HUXA 4EFHA 3ZETB 4BRAA 4WQ5C 2Q0UA 4DHYA 1JCEA 5TKYA 1HJOA 3W0LA 2P9LB 3LDOA 4IJAA 2FXUA 5AQPA 4BVOA 4PL8A 4H0PA 3SMSA 5EY4A 2CH6A 1QQMA 1BDGA 4IXCA 4H5TA 5AQHA 1YAGA 4CZJA 3CJ1A 4HWIA 3MMVA 5AQVA 3VF6A 4WYBA 1MWKA 3IDHA 3F9MA 3ENHA 3ATUA 3QFUA 4CZFA 1NGIA 5AQQA 4AM7A 3D2FA 3H45C 3DJCA 3LDNA 2CGKA 2DPNA 5BPMA 1SQKA 2E8AA 3EKUA 2QXLA 2PAVA 4XH1A 3UB5A 2YJEA 4B1ZA 4ISEA 1YXQA 1ATRA 3D7EO 4BRIA 1JCGA 2EWSA 3O1BA 4CBXA 5LY3A 5AQMA 3IMXA 1NGFA 2OANA 3ZX0A 2NLXA 4PL7A 5AQFA 3WXLA 1V4SA 1ZXOA 2P9UB 2ASMA 3VOVA 4IO8A 3VERA 4EAHD 3HI0A 4GY2B 2Q2RA 3U4LA 3A5MC 1RFQA 3DAWA 1GLBG 2BUPA 2D4WA 3LM9A 3GL1A 3FZFA 3QDKA 3D2FB 4B1VA 2D0OA 3OHRA 4FWQA 1E4FT 1NMDA 1GLDG 4FWRA 1GLFO 1HLUA 2F9WA 4H03B 5KQ8A 4Y0WA 4QS7A 3H3OB 4QS9A 3VGMA 2QWOA 3C0BA 3UKRA 4JNEA 2AA4A 3CERA 3IUCA 3I33A 3KVGA 3TU5A 4K42A 1GLAG 1BO5O 3DWLA 4L3QA 3KHYA 4M63C 4GNIA 5CE3A 2HMPA 5I9EB 2FSKA 2NRHA 2FSNA 1C0GA 1GLLO 3A5NC 1IJJA 3MN7A 1TYQB 2QWRA 3WXJA 3ULEA 3VEWA 2P9KA 1XQSC 4CZKA 3HTVA 2QWQA 3MN6A 1LCUA 3BUZB 2A3ZA 2P9IB 2E20A 4O8KA 4BR2A 1NGEA 3CQXA 2KHOA 3JXUA 2VYPA 2V7ZA 5AQJA 3WT0A 4BRHA 2Q0RA 2UYTA 3L4IA 4JHDA 1MA9B 3LDQA 3VETA 5ADXH 5AQSA 1QHAA 4A2BA 1WOQA 1MDUB 3U8XA 1V4TA 5F1XA 3VEYA 3O8MA 1SZ2A 2E1YA 5F2RA 1NGCA 3AAQA 2QM1A 3QFPA 5AQWA 4H5VA 5AZIA 3UKUA 4I6MA 2QWNA 3BEXA 3M3ZA 3QICA 5LJVA 4QS8A 1ATNA 3O6WA 2P9PB 4MO5A 5AQOA 3QMLA 3O1WA 4B1YB 4F9OA 3WQUA 3FR0A 3GDQA 4RWTA 3FFKB 2Q97A 3BF1A 4E1JA 4M7YA 1OKJA 3VEXA 4B1UB 4JN4A 3CJ9A 2PBDA 4CD3A 3I8BA 4CZEA 3HM8A 1DEJA 1NBWA 3VF4A 5EX5A 2P9NA 3FZHA 4PKHA 1BWFO 1YVNA 2W41A 2YCHA 3H3NO 5AZIB 3DXMA 4FO0A 4BR9A 3UKUB 1JCFA 5BR9A 5FPMA 5JLHA 1KAZA 3W3DA 3MN5A 4WQ4C 4Z94A 2V52B 2WUSA 2FF3B 1HX1A 3CQYA 4KBOA 1BUPA 3J8AA 1Z6RA 2D0PA 5AQYA 3M1FA 2ASOA 3LM2A 5BPLA 1GLJO 4FSVA 5AFUA 3O4WA 4ISFA 2IVNA 1RDWX 2YJFA 5AQTA 3M6GA 4XH5A 1J6ZA 4WQ4A 3WXIA 4BRMA 2YHWA 3DXMB 4YDUA 3FZMA 4H5NA 1ESVA 2QWLA 3RSEA 3HBTA 2ZF5O 4CZHA 5BN9A 1NM1A 5FPEA 1H1VA 2HOEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FWKA 4F3OA 4BR7A 3S3NA 1K8AO 1YJ9N 2I7PA 4PQUA 4IKFA 4LF7K 1ITGA 1C0UA 4BRFA 4EZ9A 1X3NA 3ID8A 4IG3A 1TKXA 4B9MA 4FM1A 3CCUN 4DUYK 1NWKA 5CYMA 3C65A 2XY6A 3CI5A 4KH4A 2PYLA 5M1KA 1RDAA 4O0IA 3NGIA 1IV0A 2FF6A 1G99A 4R5PA 4BGBA 5EU7A 1X3MA 2ZGYA 4GV9A 3VEZA 4H0YB 5AQGA 5TKWA 2KFZA 4RTFD 4AQYK 4IWVA 1HKCA 4IO9L 2W40A 1IBKK 2YI1A 2ETJA 3B6PA 2VCPA 3QESA 2HHHK 4FVUA 2GUPA 2ASPA 4KI6A 4CI6A 5JMVA 4JKHA 4C8MA 4DTUA 3WQTA 1CLQA 3NHGA 3AA2A 1FW6A 4KTWA 4AF1A 3EZ5A 5GAHP 4CZMA 4HVJA 2RPIA 1VQPN 3HSCA 3ENOA 3LAKA 4DFJA 1KSPA 4LF9K 1BA1A 4DTRA 3AO3A 3U9DA 3SAHA 5C42A 3MCPA 4A61A 1NK8A 5FRMA 1BIZA 3WUHA 2Z1HA 1BQMA 4PKGA 1XC3A 5BPNA 4JRQA 4DS4A 4CJ7A 2XY8A 3QERA 3KTQA 1T8EA 3K5NA 1NKEA 4U7BA 1QSYA 1G15A 2E1ZA 2HHWA 1OH8A 1NGJA 4HTUA 3CXCM 4CVNE 3SUNA 5AQKA 4RW4A 5SZTA 3HO1A 4EP4A 3LZJA 4ILJA 4EHTA 4EIAA 4I6MB 3HJFA 3KJVA 1QQCA 4FJ5A 1NGAA 3EKSA 3NF9A 4M3TA 2ZWHA 3ASMA 4B9TA 4PKIA 3TR8A 4CESA 4DU4A 3MDQA 4HUFA 3OYJA 5A2QO 2ZD1A 1RCHA 3H6EA 3H46O 1J54A 4H0OA 4KRFA 2KTQA 1LW0A 3AVCA 4Z4HA 4JS5A 4ILHA 4H5WA 1ZBIA 2HNYA 2XHBA 4GMJB 1BCMA 4JAXA 4BRNA 5HROA 1EO1A 3MEGA 3M8RA 3N4PA 4DTNA 1RT5A 3HYFA 5AZJA 3O9TA 2YHYA 1JL2A 1KVBA 4E89A 3S41A 5KPRA 3LDLA 5LMUK 3DLGA 4OGCA 5KPTA 2IS3A 5KTQA 3EL2A 2DFHA 4IFYA 5KRTA 1T03A 4DQ8A 1TK5A 3KZBA 3RMCA 4BACA 4C23A 2GWKA 4FWNA 2UUBK 1X9SA 4F4KA 4EP5A 1SUQA 3NFAA 4RW6A 2NRXA 1W0HA 1JLQA 2P9SA 4EZ6A 4CIFA 4FJXA 3ZX3A 4YFUA 4B3TK 1GOCA 5KPZA 2OPQA 4BR0A 3F73A 1HPZA 4FW2A 3NGYA 3AARA 4CF2A 4IJNA 3PO5A 5AZJB 3TTCA 2B4JA 3SJJA 3PY8A 4NO7A 4BC2A 4BRGA 2FSJA 4JKEA 2HF4A 3OYKA 3P4IA 4JS4A 4LC9B 3DLBA 4E3SA 2GBZA 2P9SB 1QSSA 1TK8A 4BE1A 2VGNA 1Q7YO 1SL2A 3K9KA 3HZ6A 1IG8A 1QZ6A 4CGFA 4BRKA 3J7YP 1UA0A 5JLFA 1GOAA 4JK7A 2E88A 1C0TA 2UXDK 2F9TA 3WEEB 4AHSA 1W2BM 4IEIA 4CECA 1EQYA 3CJBA 4A62A 4FJ9A 3LP1A 4FLYA 4DFKA 4BQZA 1WSGA 4BDZA 3E9LA 1VSDA 2ITMA 4M45A 1WBDA 4NCBA 4FLWA 5DK5A 1HNVA 5AFUH 4H5RA 2RHKA 2HHVA 3RRGA 4K8ZA 4DTXA 1TK0A 2GTDA 4KREA 3LP3A 3QETA 1VSLA 3NH2A 3CCSN 4Z4IA 1A5XA 4BC4A 4IOXA 1HUXA 1RTJA 1ZBUA 4GW6A 4KTZA 1JCEA 5AQPA 1Q9XA 1EWQA 1DLOA 4H0PA 2E6MA 2CH6A 5EY4A 4CIGA 1BDGA 4KHYA 2G8HA 4DU1A 4G1QA 3CJ1A 1KC8O 5AQVA 1L3UA 3LWLA 2WTUA 2HNDA 4CZFA 3CCMN 3SQ1A 3CPEA 3TAPA 1VQ8N 1HRHA 5AQQA 3P1GA 3DJCA 4CJLA 2UUAK 4XH1A 4DQSA 3G71N 4GVMA 1ATRA 1C6VA 3D7EO 1NK7A 1JLGA 1RBVA 5LY3A 2IC3A 5T7BA 5AQMA 1XC9A 3OYDA 3ZX0A 3MX2A 4PL7A 1V4SA 4IO8A 2XRIA 3T1AA 4GY2B 3CC7N 3DYAA 1RFQA 4RW8A 3CPWM 3DAWA 3MWTA 2D4WA 4LF5K 3WXMB 4FM2A 4CJTA 4E7LA 4DR7K 3OYIA 4QS9A 3AV9A 3CERA 1IKXA 3IUCA 3O9SA 2E6LA 4LD0A 3MXMA 4B8AB 1BO5O 2A1SA 4JKCA 3QEVA 4GNIA 5CE3A 5I3UA 4AHTA 4WFAL 3HP9A 2HHQA 2HB5A 4YY3K 3NF8A 4DQPA 1IJJA 3CFOA 1TYQB 2QWRA 1VQ7N 4CHYA 1LWEA 1J53A 1KQSM 3BUZB 3I0RA 4YORA 4RW7A 4CHZA 2A3ZA 1TGOA 1VQNN 4O8KA 1CXQA 1DTQA 1RNHA 2V7ZA 4A59A 1J5EK 4JRPA 1NKBA 4NCAA 1YJWN 1MA9B 3LDQA 1KFSA 4W5TA 4R79A 1RBTA 4A2BA 1NG9A 3DMJA 3TAMA 2G8KA 1S72N 3N4QA 2QWNA 3AVAA 2YHAA 1ATNA 2P9PB 5AQOA 2QEXN 4DV2K 2W6KA 5JS2A 2GV9A 5C2DA 4RWTA 1S1UA 1OKJA 2NNWA 2G8UA 4CHQA 3IKMA 1NJXA 4CD3A 3OYFA 3HVRA 4CZEA 5C10A 4CGJA 1N33K 4PKHA 1BWFO 4DR1K 2W41A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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