1GPQC

Structure of ivy complexed with its target, hewl
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structure and Evolution of the Ivy Protein Family, Unexpected Lysozyme Inhibitors in Gram-Negative Bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords INHIBITOR OF VERTEBRATE LYSOZYME
molecule tags Hydrolase/inhibitor
source organism Escherichia coli
total genus 48
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-11-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1gpqC00
4KT3A 1DXJA 1GF0A 1LSAA 2MEDA 5B07A 2MEFA 1C46A 1FKQA 1LSDA 1F6RA 2G4PA 3W6BA 4D9ZA 1FLYA 4P2EA 3EO5A 1CKCA 4PHIA 5KXNA 4LYCA 3ZEKA 1LJGA 3WXTA 5HMVA 2LZ2A 1IP1A 4WLYA 154LA 4H9BA 1GE1A 3WPJA 1LMPA 2ZYPA 132LA 3A94A 1GD6A 4ZIXA 1JJ3A 1V7TA 3LHMA 5B06A 5LYZA 4AXTA 1LZEA 1J1XY 1LZCA 1ZV5L 3A92A 1DI4A 1HENA 1XGUC 2IFFY 4NGIA 1AKIA 4R0FA 2D4KA 4XADA 1B7MA 1N4FA 1IORA 1YKZX 4BADA 4BS7A 4Z41A 5C6LA 3WULA 4Z3MA 1HHLA 1HERA 2IHLA 4NHSA 4W94A 1REZA 3TMUA 2W1YA 3CT5A 1B5WA 4LYZA 4NSIA 5IHGA 1MLCE 1UBZA 1XGQC 1YANA 4NGVA 1AZFA 4L41A 1CKGA 1KXWA 4H9CA 2BQOA 3N9AA 4LFXA 4DD3A 2YBLA 3AB6A 5DL9A 1OUHA 2G4QA 2XTHA 3FE0A 1LZAA 2ZILA 4H8YA 4OWAA 1LZ4A 1LZ9A 3IJVA 5DN5A 9LYZA 1HEQA 4OWHA 2BQLA 4TTDA 1IWVA 4M4OA 1KIQC 1IY4A 1HELA 3AZ6A 2D4IA 1VATA 1GFVA 4LGKA 4WLTA 4J0LA 2EKSC 2EPEA 3AW7A 1T3PA 4RLMA 2HU3A 5APDA 1JSFA 4LYBA 1V7SA 5T3FA 5LVJA 1GXXA 1C43A 2HEDA 1G7IC 4H9IA 3GXRA 4WOAA 1G7MC 2BQEA 2LHMA 3LYTA 1UIFA 6LYTA 1LSPA 5JENB 1G7LC 1A2YC 3B72A 1JIYA 4G49A 1F10A 3LYZA 1KIPC 3A90A 1LKRA 4EOFA 2I26L 1B7RA 1DQJC 1HFXA 194LA 1BB4A 5KXYA 4LYOA 1GEVA 1FBIX 1FLQA 2DQDY 3LZ2A 1UIAA 1GE4A 3WVYA 3P68A 1LSNA 2A7DA 4WM6A 1IP6A 1LYYA 4HV1A 2HU1A 4LYMA 4UWNA 2I25L 5F9UA 1LZ1A 1B5UA 1B5XA 1RCMA 2DQHY 4FDYA 4LT3A 4NHPA 1UIGA 2H9KA 1QDRA 2BAAA 3AYQA 3A3RX 4G4BA 4NIJA 3TXKA 5A3EA 1H87A 1W6ZA 4MSTA 1NKHA 1XEKA 1YILA 2ZNXY 3D3DA 4J1AA 6LYZA 1CJ7A 1GAZA 3LN2A 4WM3A 3TXIA 5F14A 4XJDA 1XGRC 1H6MA 2X0AA 4HPEA 5B1FA 4NSJA 1KXXA 1I56A 5E4PA 4C5FA 3QY4A 4W96A 4XJBA 1GE2A 1KIRC 3CSZA 4PRQA 1GE3A 1WTMA 4ET8A 5APFA 1VAUA 1HFYA 1CKFA 1DPWA 1D0LA 3W3EA 1LMNA 4NGKA 1GHLA 1VDTA 3T36A 2CJLA 1B9OA 1GB6A 1IP3A 4ETEA 2BQJA 5I4XA 1IP5A 1GFRA 2CDSA 1IP7A 1LSFA 1GB8A 3A91A 4LT0A 2H9JA 5F81A 5B1GA 4WM4A 3BKHA 3CT0A 1REYA 1JUGA 1UIHA 2MECA 4MCKA 1IWTA 2LYZA 4HSFA 3WUNA 1LZ5A 4H91A 4AGAA 1GB0A 1C10A 1GB7A 1UICA 2MEIA 4QGZA 3A96A 5LAGA 4N0JA 3WUMA 4LT1A 3T6UA 4GCBA 4G4HA 4G4CA 4HJVA 4WO9A 2DQJY 5ILFA 1OUBA 4DDCA 1QUTA 1WQMA 3A6CY 4WO6A 4U3XB 2MEEA 4HV2A 1BB6A 5I4WA 1B0DA 1LJIA 1BWJA 2BQBA 3MGWA 1FLWA 1I20A 4CFPA 5KXSA 4GN3A 1TCYA 5D5FA 4H9AA 1WQPA 1JISA 1LMQA 5HNCA 3A34A 4UWVA 3WMKA 1JHLA 5I54A 3WW6A 1O23A 3AGIA 3G3AB 4WG7A 1PZYA 1LKSA 4KPMA 4NGZA 1REMA 2YBNA 1JKCA 1MELL 1GB3A 3WU7A 1LZBA 1SLYA 4XJGA 4CGEA 4Z98A 1OUGA 4NY5A 2HEBA 1IWWA 2DQCY 2BQNA 3GXKA 5K7OA 2DBTA 2BQDA 1WQNA 2DQAA 1QDTA 1NBYC 1LJFA 1QUSA 1GWDA 1KXYA 2A7FA 4OOOA 3W6EA 1BGIA 1GFEA 1OQMA 2B5ZA 4G9SA 3AW6A 2BQHA 4YOPA 1IR7A 1IP2A 5KXKA 1B7QA 1IOTA 4RW1A 4XJHA 2Z2EA 5KXZA 1IOSA 1IO5A 4R6CA 1IOCA 2DQEY 4YF2A 1GBOA 1QSAA 2HEFA 2Y8PA 3SP3A 5KXOA 1YAQA 1WVUA 3WL2A 2XBRA 3BKVA 1C45A 4Z46A 2LYOA 3TXJA 4BAFA 5II3A 1DI5A 1LMAA 3WW5A 1VDSA 4GCEA 1GF5A 2FBBA 4OOTA 3ULRA 5KXLA 4O34A 5HMJA 4LT2A 1JTPL 1G7JC 1XGTC 5LVIA 1TAYA 1LHLA 2HUBA 4NWEA 4DC4A 3HFMY 1TEWA 4GCFA 5LVGA 1I1ZA 1JJ0A 4NGOA 3VWOA 2HEAA 4N5RA 1QQYA 4DYGA 1BWHA 1XEIA 2Q0MX 2W1MA 2F4AA 1GF7A 5APCA 1EL1A 5LAFA 1LPIA 4RDSA 1LMTA 3WVXA 3ZVQA 1UCOA 8LYZA 1YKYX 3A93A 4H92A 1JKAA 1WQRA 2ZWBA 4II8A 1LJ4A 4J7VA 1IWXA 1WTNA 1NMMA 1GFJA 2DQIY 1IP4A 4WM5A 5L3HA 4N9RA 1LHMA 5KXWA 1NDGC 4NWHA 2BQGA 4H94A 4H93A 1JSEA 1LSCA 2ZYCA 1UIBA 2EQLA 4XJIA 2BQAA 4YEMA 1LHHA 1HFZA 1HMLA 1NQIA 4XENA 2HEEA 3CB7A 4NHQA 4CFOA 4OWCA 5KY1A 1GFHA 5F9XA 3FI7A 1GFUA 1FN5A 3AZ7A 2F4GA 4DD1A 3B6LA 4H1PA 4H9FA 1LJHA 1LZNA 2D91A 5APEA 2D6BA 3E3DA 1JTOL 3W6CA 1GBWA 1OUIA 4DD2A 2CWIA 1C08C 3P65A 3RZ4A 3M18B 4NEBA 4DDBA 1RFPA 4M6DA 4FJRA 3TMWA 3TMVA 1IIZA 2BQIA 2NWDX 4DDAA 5LA5A 1B5YA 4HP0A 3A3QA 3WU9A 3TXEA 1OUAA 3W6FA 3WH1A 4NHIA 1WQOA 1IWYA 2MEGA 4KL7A 4NG1A 1GF9A 3CSRA 1VDQA 4NHTA 1INUA 1OUJA 1IC4Y 5FCPA 1HEOA 1LSYA 3CQLA 4TUNA 1GBZA 2MEBA 1REXA 2YBMA 3P4ZA 3ZVQB 2XBSA 1LZGA 2HECA 2ZQ3A 4IJ4A 2YDGA 1LZ8A 4WMGA 1GBSA 1HC0A 1BVXA 4YEOA 2G4NA 5IDDA 5LIOA 2FYDA 5I4YA 2MEAA 1JPOA 4ZFPA 1LJKA 3OJPA 1HEPA 1GF8A 1LZYA 1IOQA 1GF4A 1QTEA 135LA 1XSFA 3B0IA 1GAYA 3A67Y 1SQ2L 5DM9A 1DPXA 1LJNA 1Z55A 3HBHA 5M1YA 1UIEA 1IR8A 1GEZA 4H90A 1FKVA 1ZMYL 5E9RA 1NF5A 1LHJA 1QTKA 1DI3A 1BB7A 1YIKA 5I53A 1ALCA 1UUZC 2Z37A 2Z39A 1LTMA 1HMKA 4IASA 4LYTA 3CT1A 2PC2A 4XN6A 1OUCA 2DQFC 5LVKA 1HSXA 1D0KA 3WPLA 2BQFA 3AGHA 1LZRA 1GBXA 1LMOA 1GBYA 1B7PA 2H5ZA 4XJFA 1UC0A 1LMCA 1IC7Y 5HNLA 5HQ1A 1WVVA 3N9CA 5L9JA 1LYSA 4I0CA 4B4JA 1GDXA 3IJUA 5F16A 3RU5A 1JEFA 1GB2A 1YAOA 1LSMA 4N1CC 4NGWA 4B4EA 3RNXA 3P64A 4WM1A 1LJJA 1B7SA 4PPOA 1RE2A 208LA 1D6QA 2YBJA 4H8XA 1FLUA 2FBDA 2ZIKA 4LZTA 1JTTL 1CJ9A 1D6PA 1LAAA 1F0WA 3J6KA 5LVHA 1E8LA 1G7HC 1CJ6A 1LYOA 1HSWA 2Z12A 4B4IA 1JJ1A 1HF4A 4NGLA 5FSTA 133LA 4GCDA 1BQLY 1YKXX 2HTXA 4H9EA 4B0DA 1OUFA 4HTKA 4WLXA 1GF3A 4LFPA 5J7CA 1LJ3A 1W08A 1AT6A 4GN4A 5C6JA 1VDPA 3RW8A 3TXFA 2XJWA 3HBDA 4ETCA 1B7LA 3A8ZA 3CSQA 2BLXA 1RJCB 2YBIA 4YENA 1YAPA 4PGJB 4H9HA 4DD9A 5B05A 5ILCA 4A7DA 1HEWA 2RSCA 1HNLA 3AZ4A 3W6DA 4DT3A 1A4VA 5KXRA 1VEDA 4NSGA 3K3TA 4QY9A 3ATOA 5LYMA 5D5CA 4NGYA 1WQQA 2YVBA 4NFVA 5EBHA 2BQMA 2FYCA 4E3UA 1DZBX 2D4JA 4N8ZA 3N9EA 1HEMA 1LZTA 1JITA 2AUBA 4HTQA 4ZEEA 4HJYA 1ZVYB 3LZTA 3KAMA 1NHEA 1XFPL 2W1LA 1FDLY 1B2KA 1B7OA 1GXV2 1GFKA 2N5ZA 5HLLA 4TSCA 4DD7A 1C7PA 1CNSA 3AZ5A 1EQ5A 4B1AA 1J1OY 1UACY 1GFGA 5KKIA 2C8PA 4QDNA 1B5VA 2W1XA 4C3WA 3TXBA 4CJ2A 1YQVY 4GCCA 3TXDA 4BAPA 4TWSA 1LSZA 3WXUA 3OK0A 1OUDA 5LA8A 2CGIA 1JKBA 1NBZC 1IY3A 4X3BA 5LXWA 4NG8A 4EMNA 4HTNA 4HJZA 3W6AA 4IATA 1OUEA 4ANRA 1GDWA 1F6SA 2YSSC 2WARA 1DKKA 3EBAB 3F6ZA 1GB9A 3M3UA 1AT5A 2Z18A 2ZNWY 3TXHA 5FHWA 1EQEA 207LA 5LINA 1CJ8A 3P66A 3HBEX 1XGPC 3G3BB 1GFTA 4XYYA 4CHXA 1ZVHL 3B0KA 1RI8B 1LOZA 4YM8A 4TSBA 1CKDA 5AMYA 4I8SA 1B7NA 1TBYA 4PRUA 3TMXA 4ET9A 1YL1X 3IWRA 1BWIA 1BB5A 5KXMA 4PJ2C 2MEHA 3J4GA 4GN5C 4TX7A 1JWRA 4DWXA 4UWUA 1UA6Y 3WU8A 3WYHA 1B5ZA 1IX0A 2EIZC 3A95A 3QE8A 5DN4A 5KXXA 1OP9B 4WLDA 5IELA 4KXIA 1IWZA 3AGGG 5A3ZA 2F30A 1CKHA 1EQ4A 1IWUA 4HPIA 3WUAA 153LA 7LYZA 1YROA 1LYZA 3A6BY 4NSHA 3EMSA 3AJNA 1QSWA 4OWBA 3LYMA 1LZDA 1D9UA 2C8OA 2DQGY 2BPUA 5L3IA 1GB5A 1NDMC 1XEJA 2Z2FA 3LYOA 2VB1A 1YL0X 193LA 5B59A 1LZSA 4N1EI 2GV0A 3WPKA 4ETAA 2ZQ4A 1NWGA 1GF6A 3TXGA 1GE0A 1LHKA 4ETDA 3EXDA 4B49A 1IVMA 5KXTA 5KKJA 4J1BA 4WL7A 3B0OA 2Z19A 2LZTA 5KJ9A 4GLVA 2Z38A 1UIDA 4QEQA 1VFBC 2BQCA 1JKDA 1LSEA 1GFAA 1AM7A 2F2NA 2BQKA 2I6ZA 2LYMA 2YBHA 5DLAA 5C6IA 1PS5A 4MR1A 1LSGA 1IEEA 4WL6A 2ZIJA 5FDJA 3D9AC 5KXPA 1DKJA 2DKVA 5FELA 4GLAA 4H8ZA 1T6VL 1YAMA 4RLNA 4DD0A 4ETBA 1QIOA 5FEKA 3QNGA 134LA 1BHZA 1LHIA 1LCNA 1LJEA 1J1PY 4RW2A 1LZ6A 1P2CC 3RT5X 1IR9A 4OW1A 4OWEA 5LYTA 5I5QA 1D0MA 4NGJA 3ATNA 1LSBA 1GPQC 1IC5Y 1BB3A 1BVKC 4WG1A 4WM2A 4ML7A 1TDYA 2BLYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QS5A 1GF0A 3NY9A 3VW7A 1LSAA 2MEDA 5B07A 1C46A 3W6BA 3V2YA 5KXNA 3WXTA 2LZ2A 1L41A 1L99A 1L85A 5B06A 1XGUC 4Z3MA 3C82A 3TMUA 4LYZA 1B5WA 4NSIA 4NGVA 248LA 1AZFA 4L41A 2BQOA 5DL9A 2G4QA 2XTHA 1LZAA 4H8YA 5DN5A 1LZ4A 9LYZA 1HEQA 4TTDA 1P5CA 3AZ6A 4GBRB 1CX7A 4LGKA 4WLTA 4J0LA 4RLMA 4LYBA 5LVJA 1C43A 1G7IC 4H9IA 3LYTA 1JIYA 4G49A 3A90A 4EOFA 1C6MA 3DMZA 5KXYA 1CVKA 243LA 1UIAA 1LSNA 4WM6A 1P64A 4UWNA 1B5XA 2H9KA 1QDRA 2RB1X 1P3NA 215LA 148LE 141LA 1CJ7A 1GAZA 4WM3A 1L51A 4XJDA 1XGRC 1H6MA 4C5FA 4W96A 4XJBA 4ET8A 4PRQA 1WTMA 1LMNA 1LLHA 1IP3A 4ARJA 3NY8A 109LA 1GFRA 2F2QA 146LA 1LSFA 1GB8A 3A91A 1SWYA 3BKHA 256LA 1CU6A 3WUNA 4H91A 1GB7A 206LA 2MEIA 1SSWA 197LA 3CDVA 205LA 3T6UA 4G4CA 5ILFA 137LA 1BB6A 1I20A 5KXSA 4GN3A 3DN2A 227LA 3WMKA 1L57A 1PZYA 2OU9A 1JKCA 1MELL 1CV3A 1LZBA 1C6CA 2B73A 4XJGA 4W53A 4Z98A 4NY5A 1XJTA 2BQDA 1WQNA 166LA 2A7FA 1KXYA 1BGIA 5KXZA 4R6CA 2DQEY 1QSAA 2HEFA 1YAQA 2LYOA 3SB9A 4BAFA 5II3A 1VDSA 1L88A 4LT2A 1PQIA 1TAYA 3SB6A 3HFMY 1D2WA 1C68A 1I1ZA 1L13A 1SX7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4KT3 A;  1DXJ A;  1GF0 A;  1LSA A;  2MED A;  5B07 A;  2MEF A;  1C46 A;  1FKQ A;  1LSD A;  1F6R A;  2G4P A;  3W6B A;  4D9Z A;  1FLY A;  4P2E A;  3EO5 A;  1CKC A;  4PHI A;  5KXN A;  4LYC A;  3ZEK A;  1LJG A;  3WXT A;  5HMV A;  2LZ2 A;  1IP1 A;  4WLY A;  154L A;  4H9B A;  1GE1 A;  3WPJ A;  1LMP A;  2ZYP A;  132L A;  3A94 A;  1GD6 A;  4ZIX A;  1JJ3 A;  1V7T A;  3LHM A;  5B06 A;  5LYZ A;  4AXT A;  1LZE A;  1J1X Y;  1LZC A;  1ZV5 L;  3A92 A;  1DI4 A;  1HEN A;  1XGU C;  2IFF Y;  4NGI A;  1AKI A;  4R0F A;  2D4K A;  4XAD A;  1B7M A;  1N4F A;  1IOR A;  1YKZ X;  4BAD A;  4BS7 A;  4Z41 A;  5C6L A;  3WUL A;  4Z3M A;  1HHL A;  1HER A;  2IHL A;  4NHS A;  4W94 A;  1REZ A;  3TMU A;  2W1Y A;  3CT5 A;  1B5W A;  4LYZ A;  4NSI A;  5IHG A;  1MLC E;  1UBZ A;  1XGQ C;  1YAN A;  4NGV A;  1AZF A;  4L41 A;  1CKG A;  1KXW A;  4H9C A;  2BQO A;  3N9A A;  4LFX A;  4DD3 A;  2YBL A;  3AB6 A;  5DL9 A;  1OUH A;  2G4Q A;  2XTH A;  3FE0 A;  1LZA A;  2ZIL A;  4H8Y A;  4OWA A;  1LZ4 A;  1LZ9 A;  3IJV A;  5DN5 A;  9LYZ A;  1HEQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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