1GUKA

Crystal structure of murine alpha-class gsta4-4
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
b'PKLYYFNGRGRMESIRWLLAAAGVEFEEEFLETREQYEKMQKDGHLLFGQVPLVEIDGMMLTQTRAILSYLAAKYNLYGKDLKERVRIDMYADGTQDLMMMIAVAPFKTPKEKEESYDLILSRAKTRYFPVFEKILKDHGEAFLVGNQLSWADIQLLEAILMVEELSAPVLSDFPLLQAFKTRISNIPTIKKFLQPGSQRKPPPDGPYVEVVRIV'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of a murine alpha-class glutathione S-transferase involved in cellular defense against oxidative stress.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE A4-4
source organism Mus musculus
molecule tags Transferase
total genus 78
structure length 215
sequence length 215
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1997-12-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1gukA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gukA01
2O87A 5F06A 3C7MA 3VWWA 4PX1A 4ECIA 1AAZA 4OFMA 1TU7A 1SYXA 3HD5A 5HR1A 3VURA 3D4TA 3UARA 2K6VA 3F4SA 1YKAA 5AISA 1ON4A 4V2MA 4KCEA 4G0KA 5LCZA 2GGTA 5CRDA 3GHAA 2PVOC 3A2VA 4KCAA 4IS0A 3FRCA 5DJLA 1A24A 4MH3A 4MZBA 2JL4A 2AB6A 4RQRA 4X0XA 3RBTA 5IO0A 5ECMB 3LSZA 4TN8A 2GT5A 4J56E 3WD6A 2FA4A 4HEA2 5FT3A 1H75A 3APSA 3L4NA 2QSIA 2KLXA 3ZREA 1GP1A 1WE0A 2V41A 5F0GA 4I2TA 2DJ1A 1M2BA 2DMMA 3E3EA 4FH8A 1X9MB 4WF4A 2H72A 1R26A 5D73A 1ZOFA 3D21A 2ZUPA 4I6XA 2C3TA 2FUG2 5HFGA 2CV4A 5IMAA 1BAYA 4DEJA 3KD0A 2K8VA 2XPEA 5DALA 2JADA 2D2ZA 2GZPA 1JLWA 2GSQA 4YAPA 2H6ZA 1T4YA 3ZMKA 2HE3A 3W8SA 3F0IA 2LEGA 4ZILA 5A4WA 5DQYA 5CAXA 5FWGA 1XWAA 1OKTA 1RW1A 4KGIA 3PH9A 1SYRA 3TDGA 4K2DA 2AUVA 2F9SA 1BX9A 1ZMAA 2CVKA 5IPHA 3QAVA 2CAIA 1A8YA 3Q18A 4P3YB 3TRXA 3FYGA 1GSYA 2FNOA 4OCFA 1K3LA 3TJBA 3F3RA 3A3TA 2HQTA 2B6MA 2L59A 1GL8A 4LMVA 4TVEA 1EGRA 4I5QA 3UOMA 1V98A 1VF4A 4K0GA 3TGZA 2G2QA 2J23A 5GSTA 4JRRA 1TJDA 1U3AA 5ECKB 3GH9A 3VFIA 1FB0A 2HZEA 5KEJA 3D6IA 2B7KA 20GSA 4GCIA 5DAKB 3FR3A 4XS4B 2FWGA 2EIQA 1G6WA 1M9BA 2KUCA 1OKDA 3A2XA 1XZOA 5AN1A 2LQOA 3SWLA 2YP6A 3MWHA 4MA9A 3RAZA 2OJLA 2X99A 1O8XA 3FZ4A 3DWVA 1E6BA 3HJPA 1AQWA 4MF7A 3RDWA 3CRUA 4OWYA 3GH6A 3RHCA 2C0EA 3CBUA 5IMVA 1M2DA 4KNDA 2WCIA 3KMNA 5DCHA 5IIZA 1Z7RA 3EMPA 1QFNA 2IMDA 4O92A 4GXZA 3CMIA 4IBPA 1AQVA 2C80A 5EPFA 2DIZA 2LRTA 2MMAA 4TR1B 3AY8A 5H5SA 3TJFA 2FCHA 1GTUA 2JZRA 3BOAA 2IWTA 1ZCPA 3IA1A 3EVIA 1YEXA 1USBA 1Z5YE 1EV9A 2IMEA 1QK8A 4X1UA 3FZ9A 4XS1A 1V57A 1JFUA 1AW9A 1BJXA 4IKHA 1O8WA 2C0DA 2X8HA 3WT2A 3GNJA 3IBHA 3F6DA 3UVHA 4K7NA 2WULA 3TJGA 3L9VA 1K0OA 5ECLB 1K0MA 3KIJA 2O8VB 2R5GA 3EU3A 3IC4A 2LV3A 1GTAA 1KBNA 2CZ3A 1SK2A 3APOA 1N2AA 2I1UA 3M0FA 5G1KA 5IM9A 1FG4A 3NZNA 4RI6A 5D93A 5AIXA 1MD3A 1OVNA 4YQUA 2HLSA 4ZL8A 10GSA 4ECJA 5J3RA 2LTKA 1OAZA 4TOPA 1FW1A 1PRXA 6GSSA 2OKAA 1PN9A 2KP1A 1U88A 2CAQA 3R2QA 3RHBA 1HQOA 2TRCP 1X5CA 1SD8A 2RIIA 2VOCA 5E59A 1TOFA 2GLRA 3GKXA 2H76A 3TOTA 3F9UA 2JZSA 2LRNA 2P0GA 2IFQB 3FEUA 2CA8A 2XC2A 2K9FA 1F3BA 2OACA 2VCXA 5IMCA 1U3IA 1K3OA 4MJAA 2WB9A 1XWCA 1AXDA 1WRYA 3GX8A 4FYUA 1FB6A 2MMOA 2KP2A 2R37A 22GSA 2VM2A 1XBSA 2IPAA 1B9YC 5DJMA 3ISOA 4YAVA 4AJ7A 4K9ZA 2JACA 4OMVA 3GUSA 2RM6A 4PQ1A 3M1GA 1I9DA 2CVDA 4TW5A 2YWIA 4ECCA 2YZHA 3ERFA 4PNGA 1F9MA 4MLYA 4Q5RA 3PINA 3LJRA 4V2LA 4TXVA 1ERWA 2VIMA 4NMUA 3GKMA 5IMZA 3M9KA 3IR4A 4IP1A 1K0DA 3ZFBA 4TR3A 3EE2A 2IMIA 4LA1A 3ZVJA 1U87A 2GSRA 4DSRA 2GQLA 1IYIA 4HZ4A 4N0VA 2LNSA 2I81A 5CREA 4J2FA 1F6MC 1S3DA 1O81A 5D9WA 2WRTA 4YQVA 1R4WA 4PURA 2L6DA 3TRPA 1THOA 4J57E 4BVYB 4ULXA 5JWQB 2PMTA 2PPTA 1XVQA 5HFIA 1G7OA 4BVXB 3G7IA 4TR1A 4BWQA 4EO3A 1O85A 3D22A 3GN3A 1C72A 5L71A 1JLVA 1OC3A 3ZTLA 2VL2A 4MP4A 5FHIA 1M9AA 3EYTA 2GSTA 1O7UA 3NOFA 2YCDA 3IOSA 1TRUA 1K3YA 4IQAA 3US3A 3PGTA 1T3BA 3KM6A 5LD0A 2ALBA 3I9V2 4ZXGA 1LU4A 5IOXA 4DSSB 4IP6A 3PPUA 2WJUA 1NHOA 2LRCA 5D8IA 4L5LA 6GSYA 2YOIA 4RI7A 8GSSA 1XW6A 4XIHA 1HNAA 4WR5A 1QQ2A 1YF1A 5IOWA 3P2AA 5B8BA 3C8EA 2YPMA 2VL3A 1V9WA 2VCVA 3VI5A 3W6GA 3LYKA 1J08A 4PQIA 2PU9C 1EOGA 3GL5A 2RM5A 3W8JA 3QDNA 4GWRA 4V2NA 2YV9A 1XIYA 17GSA 5HFKA 13GSA 5G30A 3I6AA 2YZUA 3N5OA 5ELAA 4F03A 3KMOA 4ZBDA 2E7PA 3IAM2 2V2GA 3LXZA 2DC5A 1MTCA 3O3TA 5COHA 3KH9A 4WETA 1TK8B 1EEJA 5C00A 3TKSA 1PQNA 5ID2B 2O7KA 2OE1A 5EL8A 1DUGA 3U5RE 5HR0A 3ZIJA 4G2EA 3LG6A 5CRWA 2QKEA 1RK4A 5F05A 3HZ4A 1WMJA 4TR4A 4HUAA 1ZL9A 3QCPA 5KN0A 1X9SB 2ZNMA 4NPBA 3D0ZA 4PUAA 2FWFA 5AGYA 1LJRA 2OE0A 5F8BA 1E2YA 4HZ2A 1WIKA 2ON7A 3BCIA 3IRAA 1GRXA 6GSWA 1TI3A 3HVSA 2HRNA 4JEDA 5HQPA 4JR4A 4XRDA 2V6OA 3IV4A 1PX7A 1R5AA 2L4CA 2IMKA 1PSQA 1Z7PA 4HJ2A 4ILFA 1HNBA 1GSQA 1T7PB 5BMUA 6GSUA 3DRNA 4GTUA 5DBQA 1ZYEA 3HY2A 2H74A 1V40A 4MDCA 1XPVA 5ECSA 1VF3A 2VL2C 4QL9A 2B3SA 1PA3A 3WGXA 1JHBA 1O6JA 4EE0A 3EU4A 2RLIA 3ZMLA 3UIWA 1DE1A 2PN8A 2GQKA 3EC3A 3APQA 3N9JA 2VLVA 2JZTA 3TUEA 1XXUA 3GKNA 3K8NA 3D4MA 1TK0B 2DJJA 4MZWA 4KB3A 1PL2A 4KSOA 4MJCA 4ZBAA 2H71A 2VCWA 2C0GA 4MK3A 1TI1A 2VUPA 5CP1A 4H86A 1GSFA 4AJ8A 2LUSA 3F6FA 2HFDA 4BVYA 2I4AA 4JR6A 1G7EA 3GSSA 3ME8A 2NDOA 3GYKA 4FIWA 4ZL7A 4KX4A 1F2EA 2J9HA 3KP8A 1QXHA 5J9CA 2F51A 2V6KA 3GV1A 2HSMB 3KXOA 1A8LA 1MDJA 1HD2A 4YH2A 1SU9A 4XHMA 2OE3A 3G9BA 4RUVA 4WBRD 2OA7A 5KN1A 5CO3A 2DJKA 2VL9A 5DDLA 5H5RA 4FYBA 5J41A 2O89A 2MZCA 1K0BA 2H0HA 1TU8A 1Z3EA 3ZLPA 2R3XA 2GS3A 3O6TA 2H6XA 3HXSA 5D96A 4O32A 3TKSC 4NHWA 4BWSA 2P31A 4ZB9A 2AV4A 3TJKA 1T4ZA 3HJMA 3VWUA 4IW9A 5JWRB 2VM1A 4POLA 4N11A 3VLNA 3BCKA 1GUMA 2I3YA 3IPZA 1EOHA 1TDIA 2Z9SA 4MF5A 4PTSA 2DBCA 1B8XA 3LFLA 3KH7A 2LS5A 1JZRA 2DIYA 5F07A 2XHFA 3HZ8A 4K8MA 5LNKe 1CQHA 4E8HA 3TCOA 2M46A 4JE1A 4WXTA 3DVXA 1YEPA 1PKWA 3GFKA 4JZQA 2DJ3A 1WPIA 4PGTA 1Z9HA 1HYUA 4KDUA 3CRTA 5D9XA 1V58A 3KJYA 16GSA 2A4VA 1TXXA 2V1MA 4EF0A 3G7JA 4F2IA 4TKYA 3OR5A 4KE3A 2H1DA 2C8UA 2VCZA 1B4PA 1GLQA 2JU5A 1A23A 5J4UA 4XTSA 1XOBA 3IE3A 2H01A 4FQUA 2HI7A 2K8SA 3FHKA 4K7OA 5GZZB 3D5JA 2GT6A 1YKCA 1HNCA 3MAKA 4PNFA 4OO4A 2H0IA 1JZOA 4IGJA 1SJ6A 2R6KA 1EGOA 3QFAC 4EVMA 3UEMA 2NBSA 2VLTA 3C73A 4WBJA 2MMNA 2N5BA 4NV2A 4KDXA 1UN2A 1NSWA 4NAXA 2LKUA 2CT6A 1THXA 1ERTA 2TIRA 2VCTA 4MCUA 1JZDA 4KUNA 1A0FA 1SL0B 3VI7A 3DKSA 2WDUA 1PGTA 1K0AA 2L5OA 1XWKA 3HKRA 4OFTA 2HT9A 1J0FA 1X5EA 1VGLA 1GSSA 1FVKA 3LEFA 2YN1A 1YQ1A 2B5XA 3F63A 1AQXA 1U6TA 4NWYA 3LXTA 2K18A 4G0IA 4POBA 1W4VA 2MYGA 1NW2A 2CX3A 2LJRA 1IYHA 2PGTA 3GL3A 4N0ZA 3DGQA 3QD9A 3ZZXA 4PXOA 5A4UA 2NTOA 2YANA 4OD7A 2FLSA 4ZIJA 1NHYA 1KTEA 2GSSA 2OBIA 4LLRA 5ECRB 4IQ1A 2E2MA 2VAFA 3UJ1A 2YV7A 4NHZA 2WFCA 3ZITA 2WS2A 1ST9A 1TRSA 3LGCA 4KF9A 5DAKA 2H8LA 5GSSA 4XS4A 5CNWA 4O5RA 1SD9A 5ECNB 4EC0A 4EL1A 4MMMA 2GDRA 2YWMA 12GSA 4L0UA 2YWNA 3GTUB 4I2UA 5ECOB 4G10A 2H1BA 5B6MA 5IMFA 1S3CA 4IJIA 3KZQA 4Z7XA 3H93A 5DALB 4POMA 1ZZYA 1O73A 1Q4JA 3U6VA 2QGVA 1URMA 1ILOA 3TOUA 3LQ7A 3F3QA 2L6CA 1WOUA 3UVTA 3FR9A 1M0UA 1G0TA 3CTGA 1QMVA 3IDVA 3KP9A 2P5QA 3GA4A 4HJMA 1XW9A 3I43A 5IO2A 3HVXA 1B4QA 1VRSD 4F0CA 4KSMA 5IQYA 2EC4A 1BQ7A 1XVWA 2EIOA 1PL1A 4RQXA 3GX0A 4WEYA 2GQMA 2MBSA 2C0FA 1BYEA 1R5PA 2C1YA 1SL2B 2H30A 1H4OA 2HZFA 4O7HA 3H4KA 3KTBA 1SJIA 1R7HA 2RUFA 2EIRA 2AAWA 4Q5QA 4HQSA 1GULA 3E0UA 1FHEA 1SKSB 3VK9A 4TXOB 1TK5B 5IMDA 1I5GA 3VPQA 1KEBA 1GSEA 2YJHA 1FO5A 3CSIA 2IJYA 2LJKA 1Y6EA 5ECPB 3L78A 3UBLA 1GWCA 3IK7A 3BD2A 3P90A 2AHEA 2H1AA 1XFLA 2PWJA 1XW5A 3F4RA 2G0FA 2FA8A 5KN3A 3WGEA 3ZFLA 2HRKB 2VO4A 2CVBA 4KA0A 1YJ6A 2HXKA 4CHSA 1OE7A 3KCMA 4MJEA 1BG5A 3ZVJD 1FOVA 3F4TA 1M99A 3H8QA 4ACSA 3CSHA 3GMFA 2H70A 4LMWA 2LNTA 5B6NA 3DD3A 4YQMA 3GKKA 4WR4A 2IFQA 4GQCA 4ISDA 1GNWA 4ID0A 3S9FA 4D73B 4V1Ag 4ECBA 1A0RP 2E2GA 3UMAA 1GSUA 1Y25A 5E4WA 4L8EA 4ZB6A 1K0NA 3A5WA 3WGDA 4QL7A 4V1Ap 2C3NA 2L5LA 3ERWA 2WGRA 1XCCA 3O76A 3LWAA 4K1FA 3Q6OA 1TRVA 4XS6A 4IVFA 3C1SA 3F8UA 3VPTA 3V1WA 5JCGA 1Q98A 2OBKA 4FYCA 5GAPD 3E9JB 2ZCTA 1TRWA 2VCQA 3Q19A 2E0QA 2M80A 2X8GA 2R4VA 1WWJA 1QGVA 3TRQA 3UAPA 4AJ6A 2HNLA 3GTUA 3P7XA 1RQMA 3HVVA 2HSYA 5ECQB 2OADA 1ZGNA 3GSTA 4EUYA 5G5EA 2DJ2A 2QC7A 1XOAA 4GF0A 1VF2A 1GLPA 3SBCA 6GSVA 2B5YA 3Q74A 1DBYA 1F3AA 1AC1A 3EMXA 3FW2A 2YWOA 1B9XC 4KH7A 4POKA 4PUFC 19GSA 4N30A 3GIXA 4Q5FA 2R2JA 2H66A 1T8EB 2FWHA 5D9VA 3FY7A 1PX6A 4TR0A 2DMLA 2V32A 4HI7A 2MMZA 1TTZA 3LYPA 1FVJA 3TJJA 4BVXA 1T1VA 2PBJA 5DVBA 2ES7A 4HQZA 1SENA 1ERVA 3HHVA 1DSBA 3FZ5A 3FZAA 1M7TA 3ED3A 4IN0A 1NM3A 5KN2A 3TKPA 3DVWA 1JZWA 1UA5A 3WYWA 2IIYA 2MBTA 5G2ZA 2IL3A 4DSSA 4NV5A 4IJ3A 1EV4A 4EKZA 3GRXA 1PMTA 1ACVA 4TXOA 3L9UA 3DIEA 3IC8A 5EVOA 3CYNA 1Z6NA 2F8AA 3MSZA 4IHUA 3IAS2 7GSSA 4HDEA 5DCGA 5EY6A 2H6YA 3MDKA 2FD3A 1AUCA 2DJ0A 3IHQA 4ZB8A 3QAWA 2NVLA 3HJOA 3FKFA 3M3MA 4NXIA 5ECHB 2FGXA 5B8AA 4MABA 1OC9B 2HRKA 2YNXA 4L0WA 3PR8A 4GSTA 4I97A 2L57A 2O85A 2X8CA 4IELA 2DLXA 2HYXA 3CXGA 3I69A 2KHPA 3ZL5A 1EWXA 1GH2A 2CZ2A 5ECIB 1X9WB 2NPBA 2AYTA 4HU7A 1MDKA 2YJ7A 4OFNA 2C4JA 2B1LA 1AIUA 5B7CA 4LL1B 4GSNA 5ID2A 4MF6A 2P5RA 5A4VA 4EDYA 1GTIA 3QR6A 3KTLA 3R3EA 2GZYA 4L5OA 4ZL9A 4D73A 3KGKA 3WT1A 4WF5A 4JU5A 4EDZA 4BA7A 2IN3A 1TKDB 2GZZA 4X43A 3HCZA 1GUHA 1A2JA 2XPDA 4GQFA 2JSYA 5J9BA 1GTBA 2H75A 5A5KA 1WP0A 3TKSE 3UBKA 2JSZA 1ERUA 1KNGA 4MH2A 1SKWB 4DVCA 5DQSA 1YDKA 3M8NA 1X5DA 5IPGA 3J7Yb 1MDIA 3ZRDA 4K7IA 4GLTA 5G5FA 5HR3A 3NIVA 3DMLA 2REMA 1LBKA 4KDYA 4F9ZA 1TW9A 2H1GA 4JBBA 1K0CA 4XCSA 3DXBA 1A2MA 1CQGA 3TB2A 2HSNB 5JCWA 3UL3A 5J5NA 2FY6A 3C71A 2PVQA 3QMXA 4K0NA 4BL7B 2B1KA 4XRAA 3EURA 4ZBBA 2H0GA 5ABRA 3L0HA 1XWGA 1TP9A 3LORA 2CX4A 2UZ8A 2XBQA 1Z6MA 4LL4B 1YY7A 2C3QA 2X64A 4CDOA 1UVZA 2B7JA 1ZYQB 1MEKA 3CTFA 5JWOB 3TKQA 3TKRA 4HS1A 4E8EA 3C1RA 2HSMA 4KAEA 2PERA 1YZXA 3QOUA 3HYPA 5G31A 3EWLA 1PKZA 4AF2A 2VLUA 2TRXA 4GSSA 2A2SA 14GSA 5D9TA 3HA9A 1EZKA 5GAND 4OO5A 5CYYA 1ABAA 3VWVA 3DEXA 2GVPA 1MD4A 1OYJA 4QQ7A 5HR2A 2RUEA 2LJAA 3JCML 3ZIVA 3ERGA 2M72A 3G7YA 1EEMA 9GSSA 4F82A 4G0LA 1GUKA 2HRAA 3BJ5A 4N10A 6GSTA 4ML6A 2HSHA 2IMFA 3KEBA 3GURA 4GRFA 4MPGA 2N5AA 4HOJA 1G6YA 3L9SA 2L4QA 2WZ9A 1GNEA 2AJQB 3M9JA 3J7Yk 2LQQA 1OC9A 18GSA 1QUWA 1SK1A 3BBYA 1XWBA 2KOKA 1EP8A 2BMXA 2BTOT 4G9HA 1A2LA 3HDCA 3QPMA 2H73A 1B48A 11GSA 1ML6A 1WJKA 3P8WA 4HU9A 1T00A 5ENUA 4MZCA 2FHEA 6GSXA 5H5QA 2GTUA 1SKRB 3FK8A 1SK0A 4EXJA 2HRFA 5AIVA 4DSQA 3QFBC 2CQ9A 1SL1B 1OC8A 3ME7A 2BJXA 4G19A 2FWEA 1OE8A 4Q5NA 1PD21 3RPNA 2PUKC 4TRXA 1VF1A 4ML1A 5C04A 2N5FA 4MPFA 4I8BA 3FR6A 2DSAA 4USSA 2LSTA 4BPYA 2I9HA 1GSDA 1V2AA 3A2WA 3EINA 2H19A 2HZEB 2XBIA 3IXRA 5INYA 1UC7A 4AGSA 2A2RA 4K6XA 2VD0A 3VWXA 3QAGA 3CSJA 1J9BA 1F37A 5JCUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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