1GUMA

Human glutathione transferase a4-4 without ligands
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
RPKLHYPNGRGRMESVRWVLAAAGVEFDEEFLETKEQLYKLQDGNHLLFQQVPMVEIDGMKLVQTRSILHYIADKHNLFGKNLKERTLIDMYVEGTLDLLELLIMHPFLKPDDQQKEVVNMAQKAIIRYFPVFEKILRGHGQSFLVGNQLSLADVILLQTILALEEKIPNILSAFPFLQEYTVKLSNIPTIKRFLEPGSKKKPPPDEIYVRTVYNIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Human glutathione transferase A4-4 crystal structures and mutagenesis reveal the basis of high catalytic efficiency with toxic lipid peroxidation products
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
molecule keywords PROTEIN (GLUTATHIONE TRANSFERASE A4-4)
total genus 79
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1998-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1gumA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1gumA01
2K18A 2CA8A 3RHCA 2A2SA 4ZILA 1M9BA 2FGXA 4L0WA 2H66A 1ON4A 1N2AA 1XOAA 3HVXA 4HOJA 1FVJA 1EZKA 3F4SA 3D4TA 2YANA 1M0UA 1PD21 4IP1A 1Y6EA 2HSMB 2XPEA 5CYYA 4V2MA 3MAKA 5D93A 1SU9A 1FO5A 2BJXA 6GSYA 3ZFLA 3TKPA 2B5EA 1DE2A 2PN8A 4WBRD 3F4TA 4FYUA 3CRUA 5ECRB 2FD3A 1R7HA 1VF3A 5ENUA 1U3AA 2JZRA 1X0RA 2HYXA 5EY6A 3F6DA 2OE0A 5GAND 3HHVA 1XPVA 4G0IA 5DALA 2ON7A 4NV2A 2HRKA 1Z6MA 5IO2A 5D9XA 2C0GA 3F6FA 3RHBA 3P7XA 4TR0A 2ES7A 4EO3A 1TU8A 3VI5A 2B7KA 3OR5A 4MK3A 3PH9A 4G19A 5EVOA 2VCTA 1F3AA 5IMDA 1DBYA 1TXXA 4I6XA 2HRAA 2VCZA 4GXZA 2CAIA 5EPFA 3TKQA 1PKZA 5ECMB 1C72A 4MJAA 4KNDA 5IMCA 2DJJA 2KHPA 4MH3A 1PL2A 4ZIJA 4O7HA 4K6XA 1A2LA 2RM5A 4Z7XA 1TI1A 3APQA 4OD7A 2H71A 1GLQA 3E3EA 1Q4JA 1VF1A 1Y25A 1F3BA 4EVMA 1ABAA 2EC4A 3GN3A 3IE3A 4ZL9A 3IXRA 4D73A 4LL1B 5KN2A 4LA1A 5J3RA 5H5SA 4KE3A 4OMVA 3A2VA 4TVEA 2H6XA 4FO5A 3J7Yb 5IOWA 1WWJA 3DIEA 4ULXA 4TXOB 2C4JA 2ALBA 5HFGA 4KUNA 3VWUA 3SWLA 2MMAA 1SK0A 1O8WA 2DIYA 4K9ZA 2YWMA 2ZUPA 4RI6A 2OE1A 2BMXA 3GH6A 4USSA 4WR4A 4ML6A 1K3OA 4ZXGA 2I4AA 5GAPD 2GLRA 2CV4A 4OFNA 5JWOB 3QR6A 3TDGA 4POKA 3TOUA 4HU9A 5J9CA 2IMFA 4WEYA 1OYJA 3ZFBA 3IR4A 3UMAA 2I81A 1XIYA 3U6VA 5G1KA 2HRNA 4JU5A 4LMVA 2MMZA 2VAFA 2GSQA 4GTUA 3ZIVA 2FWEA 2AV4A 1XFLA 3FZAA 2OJLA 1M2BA 3IAS2 3F4RA 3KEBA 4BWQA 2REMA 4ISDA 3MNGA 2V1MA 5IMAA 2C0DA 4OFMA 4KF9A 2O87A 2O89A 3TJJA 1V57A 3E9JB 1JZRA 2V6KA 1XVWA 1W89A 3CSIA 2DMLA 1Z3EA 5ECHB 2VM1A 2CQ9A 1GUKA 5AIXA 2V32A 2FCHA 5DAKA 2D2ZA 3FKFA 4ID0A 3KP9A 2MBSA 2H6ZA 3F3QA 2H6YA 1K0AA 3WGEA 1HD2A 3EU4A 3C7MA 3DYRA 2LS5A 3SBCA 4O92A 3ERWA 1E2YA 4ZL7A 1V2AA 1EEJA 4TOPA 2PERA 4KCEA 3GH9A 1CQGA 3HDCA 4MA9A 1YEXA 5G30A 1GULA 4ZB6A 3D0ZA 1TTZA 4AJ8A 1B48A 3V1WA 2F3MA 1MDJA 5FT3A 1DSBA 5D96A 3FR9A 3FK8A 1R26A 1B4QA 2LJKA 2PMTA 2P5RA 2YWIA 2HLSA 4MF5A 5G5EA 1TRSA 4XRDA 2DBCA 3UBLA 11GSA 3RPPA 4GQFA 5IMFA 2DJ0A 2N5BA 1PSQA 2KP2A 2M72A 1TKDB 2F8AA 3EMPA 2C0FA 3RAZA 4V1Ap 1K3YA 1R5AA 2FA8A 3H79A 2FLSA 4MH2A 4L5OA 3DEXA 3IPZA 3BCKA 5CNWA 3FR6A 1YJ6A 1AAZA 1S3AA 4HJMA 4MLYA 2H75A 2C3NA 3LYKA 4XTSA 3VWVA 3KZQA 1LBKA 3CYNA 4MP4A 3UVTA 2JSYA 2B6MA 4F2IA 2UZ8A 2LRTA 1FB6A 1G6YA 13GSA 5D73A 1SJ6A 3DWVA 1J9BA 3IOSA 1WE0A 2VL2C 1H4OA 2B1LA 4TXVA 3K8NA 1PN9A 2IMKA 1G7EA 3LJRA 1XWAA 5ID2A 1T1VA 2VCXA 3C1SA 4X0XA 1K0DA 3TJKA 2MYGA 5ECOB 1BX9A 3BJ5A 3QMXA 4I8BA 3LXZA 3BCIA 4IVFA 4ZB9A 3KM6A 1W4VA 3G9BA 3H4KA 2HZEA 1OAZA 5J41A 4EF0A 3TUEA 2IFQA 4NHZA 1KNGA 4GRFA 4DSSA 2GVPA 3D21A 1YKAA 4TW5A 5A4VA 4QL9A 2CVKA 1O73A 4MMMA 7GSSA 1BQ7A 3GL5A 2YCDA 2TRXA 5C00A 1K0CA 5AN1A 4RQXA 1Z7RA 3GYKA 3IHQA 5ABRA 4KA0A 2VL2A 2AYTA 2FWGA 4CDOA 1GTBA 18GSA 2HI7A 4FQUA 5CRDA 3DVWA 4CHSA 2CT6A 4XCSA 1BYEA 3MDKA 2NPBA 3RBTA 2DSAA 1OVNA 3L78A 1XOBA 3WT1A 2H1DA 3JCML 3F8UA 1VRSD 1A2JA 4IJIA 4ZBBA 1GNWA 3GNJA 1EOHA 4TR1B 1TRWA 4XS4B 3WT2A 4JBBA 4MJCA 4N10A 2J23A 2E2GA 2C0EA 4JEDA 3LYPA 5F8BA 1SL0B 1QXHA 2VLTA 2IMIA 4K1FA 1ZZYA 4OCEA 2R2JA 1WP0A 5ECIB 3WGDA 1GL8A 1ERUA 3VWWA 2LKUA 2CX4A 5JCWA 1KTEA 5A4WA 2PU9C 3GMFA 1GSFA 5D9TA 4K0GA 2G0FA 2LEGA 2NBSA 3M9KA 2B3SA 2RIIA 1K0OA 5GSSA 2I9HA 3GSSA 2R4VA 2VCWA 3LORA 4O32A 5CRHA 2H70A 1G7OA 1URMA 3M8NA 3HVVA 2KUCA 3BOAA 1R5PA 2L6CA 3S9FA 4AGSA 3PINA 1HQOA 3E0UA 4E8EA 1B9YC 3CXGA 4GCIA 3RDWA 3EE2A 2X8HA 3HCZA 1TP9A 3R3EA 3LXTA 5B8BA 3QPMA 2H0HA 4AJ7A 2N5AA 4POBA 4OO5A 5ELGA 1AW9A 1V58A 5F07A 2WJUA 2VOCA 1RW1A 3GX0A 1PGTA 4BPYA 1AIUA 4IQ1A 4L8EA 4OWYA 1S3DA 3HJPA 4G2EA 2LJRA 4JRRA 3FZ4A 1EV9A 1GTUA 4AF2A 4N0VA 16GSA 1N8JA 3Q19A 5KN1A 5A4UA 4PQIA 2FHEA 2WULA 1GSQA 2OA7A 1JZWA 3ZREA 1FVKA 2C3TA 4PQ1A 3VFIA 5IPGA 2N5FA 1GTAA 1IYHA 3EVIA 2H01A 4BL7B 2CX3A 6GSWA 3CTFA 3UIWA 3GKKA 4KW6A 2HZFA 3VURA 5KN0A 3FR3A 4HEA2 2VL9A 3DRNA 5ELAA 5JWQB 1XWBA 3I43A 5CP1A 1USBA 1EWXA 5IIZA 4MZBA 4WETA 2V41A 1EGOA 5IMZA 4IGJA 1VGLA 1O81A 4QL7A 4IHUA 1ZCPA 4JZQA 2DJ2A 4BVYB 1V98A 2HQTA 4PUFC 2J9HA 3MWHA 1X9SB 5CRGA 4XIHA 4XS6A 1YKCA 3L9UA 3VWXA 1X9WB 3L0HA 2H1BA 2V6OA 1EGRA 1WRYA 3P2AA 4V2LA 5B6NA 3IV4A 4ILFA 5B7CA 4QQ7A 2HSYA 3ERFA 1BJXA 1YQ1A 1ERWA 2TIRA 3EC3A 3C73A 4TR1A 3A2XA 3TRQA 3GKXA 2F8FA 4EKZA 8GSSA 4XS4A 3QAVA 1RQMA 1F37A 3BD2A 3FHKA 5AIVA 4IELA 1SD8A 2GQKA 3O76A 3HKRA 5HR2A 3KH7A 1GNEA 3EWLA 2H73A 3PGTA 1V9WA 3P90A 2GZPA 4IKHA 1OC9B 4J2FA 2K9FA 3FZ5A 2FWHA 1WMJA 2WGRA 1M2AA 2DIZA 2IMDA 2ZCTA 3VPQA 5H5QA 3QDNA 3KP8A 1YF0A 1WPIA 5DJMA 2FUG2 2DC5A 4L5LA 2FA4A 4J56E 4WF5A 1GP1A 5J4UA 3F9UA 4BVXB 1AXDA 1B4PA 4EE0A 5HR3A 1SL2B 2OBKA 1GSEA 3CRTA 1OE8A 4KDXA 2L4QA 1F6MC 2XPDA 4NMUA 2DJKA 2TRCP 2WS2A 2GSTA 4HQZA 2L5OA 2WCIA 3ERGA 5ECPB 2OE3A 2GZYA 2O7KA 2HSMA 1Z6NA 2LUSA 2IJYA 3N5OA 1R4WA 3TKSE 4TKYA 3WYWA 4PNGA 1ZGNA 3NIVA 2LNSA 2QKEA 1ILOA 4POLA 3FYGA 2R6KA 12GSA 1SD9A 2Z9SA 3L9VA 4DVCA 2O85A 2CZ3A 4I2TA 4V2NA 3ZIJA 3A2WA 4FH8A 4IP6A 1A0FA 2YWNA 1KEBA 1SYRA 3PPUA 1QQ2A 4IQAA 3ZTLA 4EL1A 1T00A 5HFKA 2WFCA 2PUKC 5LNKe 2AHEA 5D9WA 4DEJA 2FNOA 2GDRA 3D4MA 3IC4A 2QSIA 2LJAA 1IYIA 4G0LA 3QD9A 4XRAA 3ZLPA 2XBIA 3GA4A 4GSNA 1PRXA 3GFKA 4HJ2A 3QCPA 2RUEA 2H19A 3ME8A 4LLRA 3WD6A 2LNTA 3W6GA 4O5RA 5EL8A 1T4ZA 1MD3A 1O7UA 2I3YA 5ECLB 2OADA 4ECBA 3UEMA 4N0ZA 1FG4A 4BVYA 1YDKA 3HJMA 1A23A 5G2ZA 4HQSA 4POMA 4KDUA 5HR0A 2HSNB 1J0FA 1XXUA 4X43A 4GF0A 5INYA 4K2DA 4DSQA 2F51A 4TRXA 3GUSA 5C04A 1WIKA 1ACVA 3M3MA 3DGQA 5F05A 3VK9A 1JLWA 4TXOA 2YWOA 4YAVA 4GWRA 3KMNA 3TJBA 4PQHA 3AY8A 1XWCA 2QGVA 4NXIA 3ZYWA 5H5RA 2I1UA 1VF4A 1DUGA 2XC2A 2OACA 3ZMKA 1ZYEA 3UOMA 2EIRA 10GSA 4DSRA 4F03A 4LL4B 2OKAA 2VD1A 4FYCA 4MJBA 5DALB 4EDZA 5BMUA 2HRKB 3EYTA 3GL3A 2VUPA 2C3QA 4MPGA 1XW9A 1I5GA 2WDUA 19GSA 1K0NA 1SL1B 2JU5A 1I9DA 1K0MA 4IJ3A 1PX7A 2VLUA 3F63A 4G0KA 2X8GA 5G31A 4PUAA 2YJ7A 2P31A 1JLVA 1LU4A 3GIXA 3TRPA 4PXOA 1M9AA 1TW9A 5L71A 2CZ2A 3H1NA 5DCGA 4E8HA 2YJHA 4WXTA 5AISA 3I6AA 4MCUA 1FW1A 1XZOA 3QAGA 4G10A 4KSOA 4N11A 2M46A 4ZB8A 3QFAC 1EV4A 4K7IA 4N30A 3HZ8A 2B5YA 3W8JA 3ZITA 2HXKA 3MSZA 4BA7A 1BAYA 2C80A 3HVSA 5E59A 4D73B 4MJEA 2GT6A 3BBYA 1EEMA 6GSSA 1T4YA 3LFLA 3TRXA 1XW6A 4KCAA 3H93A 2HNLA 4IN0A 1NM3A 4NHWA 4IBPA 3UAPA 4H86A 5B6MA 4IS0A 1B8XA 3VI7A 3CTGA 1GWCA 3TKSA 4TR3A 4HDEA 2LQQA 4KSMA 2JACA 2LQOA 5COHA 3UBKA 1Q98A 1GUMA 4G9HA 1GSDA 5IMVA 4P3YB 3VLNA 2A4VA 4PTSA 1X9MB 2H30A 1FAAA 1PX6A 3C71A 3KMOA 3EU3A 3IRAA 3TJFA 1H75A 3EINA 5D8IA 1NSWA 2MBTA 4KB3A 4X1UA 17GSA 2VL3A 4XHMA 4WKWA 4EUYA 2WZ9A 3IBHA 5DQSA 1THOA 3Q6OA 6GSUA 4F9ZA 4YQMA 4ZBAA 2WB9A 5ECKB 2K8VA 2P0GA 4TR4A 2H76A 2JZTA 2CVBA 3GSTA 1FOVA 2DLXA 2GS3A 3A3TA 1TK5B 3O6TA 1QK8A 1CQHA 2H0IA 5GSTA 3EMXA 1SJZA 3WGXA 2YP6A 3IA1A 2GTUA 1F9MA 2GSRA 4Q5NA 1HNAA 1OKTA 3KH9A 1SK1A 3HA9A 3TKRA 4PNFA 3H8QA 2H8LA 2VLVA 3FRCA 4GQCA 5CO3A 2L59A 2L57A 5DAKB 1PKWA 5D9VA 5JWRB 1DE1A 4NPBA 1MDIA 5CRWA 2QC7A 3R2QA 4WF4A 4YQUA 1SJIA 4ECCA 1M99A 5B8AA 2LTKA 3ME7A 3CSJA 3M1GA 2C1YA 4TN8A 3M9JA 3GKNA 4GSTA 3FEUA 1XWKA 4ZL8A 1V40A 3CMIA 2AJQB 2IPAA 1HNCA 3LSZA 1MDKA 4JE1A 4CW9A 2RM6A 2JADA 3GV1A 1K0BA 3ISOA 1TI3A 22GSA 1YEPA 3F0IA 1X5CA 2GZZA 4NWYA 5IPHA 3HXSA 4MPFA 3QFBC 3TGZA 1YY7A 2L6DA 2HFDA 3FZ9A 2CAQA 1F2EA 1A0RP 1UA5A 1OE7A 3VPTA 3UJ1A 1EP7A 2GQLA 6GSVA 1A2MA 3APOA 1WJKA 2F9SA 2MMOA 5A5KA 1T8EB 5ECQB 2AB6A 3GTUB 4BWSA 4YH2A 1SKWB 6GSXA 4AJ6A 3C1RA 2LRNA 1SENA 3DVXA 2YPMA 1M7TA 3IK9A 1ZMAA 3GKMA 4HUAA 3G7JA 1ERTA 2OBIA 1UC7A 9GSSA 2NDOA 3Q74A 1THXA 1X5EA 4NAXA 2B1KA 1SKSB 2X8CA 5DBQA 3RPNA 2DJ3A 1JHBA 4GLTA 5IO0A 4EC0A 1UVZA 3F3RA 3KXOA 2JSZA 1XCCA 5KN3A 4MDCA 3HJOA 2L5LA 5IM9A 2JZSA 4Q5QA 5ID2B 5HFIA 1OC8A 1GUHA 5JCUA 1U87A 4FIWA 2HRFA 3HYPA 1U3IA 1TRVA 1OKDA 2HZEB 2KP1A 1G6WA 4I97A 2IFQB 3KGKA 4DSSB 1S3CA 2ZNMA 2B5XA 5F06A 4F0CA 3G7IA 4KDYA 2VO4A 3NZNA 3TOTA 5JCGA 2H0GA 5FWGA 4MZWA 3UVHA 3QOUA 3DMLA 1AUCA 1XBSA 1YF1A 4OFTA 1GTIA 2RUFA 5ECSA 3GRXA 5DQYA 4MABA 4I2UA 2EIOA 3GHAA 5FHIA 1NHYA 3KJYA 1FHEA 2B7JA 3KIJA 2LSTA 2H1GA 3L9SA 5LD0A 1ZL9A 4I5QA 1QMVA 2ON5A 1TRUA 2XBQA 3LG6A 1JZOA 5CREA 4KH7A 5GZZB 4Q5FA 2PPTA 1MEKA 1K3LA 4MF6A 1QFNA 3GURA 2VIMA 1ZYQB 1SYXA 5LCZA 1RK4A 4OO4A 6GSTA 5CAXA 4HI7A 2IMEA 1PA3A 1SKRB 2X64A 3TJGA 3KTBA 1T3BA 4BL7A 3P8WA 5IOXA 2E0QA 1M2DA 4HZ4A 4PGTA 3UARA 2K6VA 3KTLA 4F82A 20GSA 4J57E 5HQPA 4MF7A 3ZZXA 3FY7A 2R37A 2R3XA 2NTOA 4OCFA 3ED3A 4RI7A 2PWJA 2H72A 2HT9A 2IWTA 4GSSA 2VM2A 4WR5A 3LQ7A 4HU7A 5DDLA 1FB0A 3ZMLA 4K7OA 1AQXA 4HZ2A 1AC1A 2VCQA 3CBUA 1MTCA 1A8YA 4KX4A 1ST9A 3IK7A 2YZUA 2H1AA 4ECIA 2V2GA 3ZVJA 1EP8A 3HZ4A 1PL1A 1GSUA 1TJDA 4WBJA 3LGCA 4ECJA 4PX1A 2KLXA 2AUVA 1ZOFA 4MZCA 14GSA 1B9XC 2YZHA 2R5GA 1EOGA 4LMWA 3HD5A 5J5NA 5IQYA 1MD4A 3GTUA 4Q5RA 2PVOC 3FW2A 1O6JA 2GQMA 4PURA 2IIYA 4K8MA 2PVQA 3D6IA 1XW5A 4RUVA 5DVBA 4K7NA 4K0NA 2IN3A 3A5WA 3D5JA 2P5QA 2PBJA 3IAM2 2YOIA 2L4CA 2MZCA 3LEFA 5E4WA 1HYUA 1E6BA 1Z9HA 3ZRDA 3GX8A 3DKSA 4FYBA 3I69A 1TOFA 3U5RE 1X5DA 2A2RA 2GSSA 4YAPA 1O8XA 2DMMA 2DJ1A 2M80A 2YNXA 3QAWA 2FY6A 1BG5A 1GH2A 1OC9A 2E7PA 5DJLA 2JL4A 1PMTA 1TU7A 4ML1A 1T7PB 2GT5A 2HSHA 3HY2A 2YV7A 1G0TA 2VD0A 1GSSA 1TK8B 2XHFA 1U6TA 3DXBA 1VF2A 2X99A 4JR6A 4KAEA 3IC8A 3APSA 3KD0A 4BVXA 5ECNB 1LJRA 4XS1A 1QUWA 3TKSC 1GSYA 2WRTA 1XWGA 2PGTA 4F0BA 2VCVA 4NV5A 5G1LA 2C8UA 1ERVA 1AQVA 1NW2A 3LWAA 4V1Ag 5KEJA 3ZL5A 2YV9A 1A8LA 1TDIA 3UL3A 1U88A 2LRCA 3US3A 3Q18A 3J7Yk 1QGVA 3CSHA 2E2MA 1PQNA 2AAWA 4HS1A 3ZVJD 2G2QA 1KBNA 3PR8A 3TCOA 2KOKA 2MMNA 5F0GA 4EXJA 3O3TA 1BEDA 4L0UA 2K8SA 2GGTA 3EURA 2CVDA 4RQRA 1J08A 3C8EA 3TB2A 1O85A 1GRXA 2H74A 1AQWA 2FWFA 1ML6A 3KCMA 1Z5YE 4KGIA 4ACSA 1YZXA 3W8SA 3G7YA 4YQVA 3N9JA 1TK0B 1GLPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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