1H44A

R210l n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFILESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 322
sequence length 322
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A02
3OO9A 3PUWE 1IUDA 2YJPA 2AYSA 1O64A 1LCTA 3HPIA 1B3GA 3MUQA 4GFRA 1M5DA 3CIJA 3PPRA 3KN8A 2I3VA 1AH5A 1PB9A 4IO2A 1N7XA 4AB6A 2QJEA 1B5IA 4PFUA 3MVZA 4GXAA 1IXIA 1UQWA 5I2KA 5HM4B 2QPQA 2O51A 4YICA 3TELA 1I6AA 1R6ZA 4DXCA 1CB6A 3KN7A 4ONYA 5FHNA 1OIBA 4H8JA 3EF7A 4DCYA 4ND9A 1FTOA 3GXAA 3OMBA 2Z22A 3G7WA 1Y3PA 3T9UA 3MP1A 4HCWA 3DP8A 2RC8A 4P11A 1SI1A 3K00A 2V3TA 1JVYA 1MG1A 4RPNA 1JW1A 3FUZA 1SYIA 4H1XA 1QKBA 3RTWB 3K02A 4BDOA 3V89B 4G68A 3TYHA 3BFTA 3TODA 4NF8B 1LAFE 2ZYNA 3TCHA 5B70A 4ZEKA 3PUXE 1IQ7A 2PMSA 1RYXA 1FQEA 3LSLA 1GGGA 3KN3A 4L17A 3GZGA 1DSNA 4XKPA 1MY2A 3O6GA 3RY3A 2E1SA 3TTNA 1Y1MA 4GWOA 1MDP1 1IEJA 2F6PA 4QFKA 3IL1B 3G3IA 3TKDA 4TOZA 3FJ7A 5CMMA 1FW0A 3IO4A 2ZYOA 4JDFA 4YKKA 4OYVA 4YKPA 2ZXTA 1TFDA 2DVCA 4F29A 4GOTA 2F97A 3LUYA 3ILUB 1ELJA 4NF8A 2B65A 2M8CA 2Y7IA 2XX7A 1P1OA 5M2VA 1EU8A 3IOWA 3S2VA 2PX1A 3O97A 1A8FA 2VOZA 2ABHA 4NF6B 4IO6A 3N6UA 4X1DA 4BDMA 1TWYA 2Z8DA 5DYHA 2NXOA 3U72A 2R71A 3K01A 4IO3A 2GH9A 2ZNTA 2OZZA 3S4UA 1B2HA 1JW4A 1MXVA 3FASA 2I48A 1B3EA 1B0LA 3FV2A 2DXRA 4G68C 3FZVA 4KI0E 3IAZA 2AIXA 3LSWA 4KYSA 4H5FA 3HSTA 4BDLA 3FGSA 3L6HA 3PPOA 4XKNA 4NF6A 5I59A 4PETA 1FTJA 4K3FA 2F35A 1FTLA 2HXWA 1MXXA 3KG2A 1US4A 3O6IA 3H6UA 4QF9A 1NH8A 3JV9A 1S50A 3QYTA 2RKMA 1RKMA 3V83A 2I49A 1EH3A 2GRVA 5TP9B 4YKJA 3B7DA 3B6TA 2Q9TA 3L6GA 2Y7WA 3MP6A 3SEYA 1M5BA 2GHBA 2RCBA 3HHFA 3H06B 1ZIUA 4X9TA 2Q88A 1DOTA 1ANFA 1SW5A 3P7IA 1NNKA 5AA4B 2YPNA 4G4PA 5LOMA 4KYEA 3PUZE 4MBPA 4P0IA 3T9XB 3PPPA 4EXLA 2X7QA 4M1VA 4FEBA 3V8XB 5CBRA 4ESXA 4YMAA 3ECRA 3LSFB 4DZ1A 4NMYA 2I0CA 2XXRA 1B7HA 3PD9A 3Q29A 2XXWA 1XT8A 1XC1A 3KOTA 1MY0A 4R72A 3OXNA 3ZSFA 2REGA 5TP9A 1LFIA 1D9YA 4R74A 4Q0CA 1FQDA 4YAHX 4BDRA 3N26A 4YB6A 2UVJA 4MH5A 3UP9A 5J1DA 5EHSA 4FECA 1UTBB 2Q89A 4PE5B 1PC3A 1PBPA 4IO7A 4F19A 5AA4A 2Y84A 2V25A 1FTKA 3BBRA 4RK9A 4OMBA 2G29A 5H8HA 3C9HA 3VLVA 3ODBA 4LONB 5JTYA 1H76A 3VXCA 3THIA 1OVBA 1XHYA 1NL5A 4NE4A 4JWOA 1P1WA 5CC2A 2Q8JA 3WAEA 4XKRA 3MVXA 1MS7A 2Y7RA 3MWBA 2PT2A 4U1OA 2DQVA 3T22A 4F3BA 2E0SA 3TQWA 4LUBA 3IOTA 3LBSA 2DWIA 3EHUA 3VFJA 3C4MA 4IB2A 4H5GA 1J1NA 5CRYA 5H8FA 3KGCA 1UTBA 2Z23A 4RA1A 2OLBA 3C32A 4JWXA 3T9HB 5B7DA 4OERA 3LSXA 3OSQA 1UIVA 1M5FA 4F2QA 3KFMA 3VLUA 4LQ2A 1B0HA 5L9SA 3DELB 3UN6A 4GQOA 1JW5A 3A3CA 4EQ7A 2BJJX 1B5JA 1NH7A 2D3IA 4U2RA 4MF3A 5AA2B 4TLLB 3K6VA 2CMOA 3N6TA 1N04A 4F3GA 3GBBA 3R7XA 3H6TA 3FVKA 1QULA 1JETA 2XXQA 3VVFA 1POTA 5TPAB 1AMFA 4RPOA 2GFEA 2F78A 5BWJA 1D3KA 3CI8A 3MVYA 2V3UA 2ALUA 2QMWA 4LVQA 4ZEBA 1B6HA 4ELRA 3SERA 4TQUQ 3M3LA 4ELQA 1B1HA 1RYOA 3HV1A 3RUMA 2O69A 1USYH 5K2YA 5AE4A 3EHTA 4O3AA 3RN8A 4YU0A 4R75A 4R6KA 1Q35A 5H8SA 1A54A 3QK6A 4NEDA 4PP0A 2O1LA 5AA2A 1MY1A 1IZ1A 1BKAA 3TQLA 3TZAA 1AL3A 1Z7ME 3FVOA 4R6HA 4EQBA 3PGFA 5I84A 3FXQA 3TDJA 1MXYA 1IXGA 4POXA 5TPAA 3T66A 4GL8A 3C31A 3U92A 4R9GA 1MPCA 4WKMA 1DTGA 2ZNUA 3CG1A 4PFYA 5I58B 3RQTA 3UK4A 4RJZA 2FA7A 3VXBA 3TUSA 3A09A 5I56B 3RPWA 1B7ZA 2HQ0A 5FHOA 2HAVA 3TCGA 2H98A 1GV8A 3S9LC 3G3FA 1QUJA 4KHZE 1YTVA 4FAJA 3PPQA 1HSLA 2XXTA 3HCQA 5DT6A 3N94A 3O9PA 1Y1ZA 3MBPA 3IJOB 2UYFA 1BP5A 2HZKA 4C0RA 3O28A 1MY3A 2DWJA 4PFWA 2QL3A 3SDFA 5KZTA 1QVSA 1P1NA 3FJGA 3MAMA 5DVIA 1OQHA 2H99A 3HN0A 4JBZA 4F1UA 1B32A 4ZDMA 1TXFA 3F11A 5I58A 2O68A 5CMCA 4FE8A 1SYHA 2F7CA 2XHDA 2B3FA 4F31B 2UVIA 3JZJA 3TCFA 1EZ9A 1B3HA 1ZBMA 3I3VA 4X48A 4OXVA 3FD3A 4R2BA 1JQFA 1OLAA 3T93B 2DWHA 4JSOA 5L9MA 2THIA 2W7YA 3K6WA 4QSEA 4R6YA 2DVZA 1P1UA 1GR2A 2D21A 3CFLA 3IK6B 4H6DA 5L9OA 1N0TA 4ECFA 1B3LA 4OQOA 4G8MA 2QS2A 4RYAA 3VLWA 5L8DA 3TTLA 1WODA 1P99A 3Q26A 4ZECA 3G3HA 1QKAA 2ONRA 3VE1B 3MJNA 1SW4A 1OVTA 4KFQA 3QSLA 4EDPA 1H44A 1JEVA 2NOOA 1DMBA 1VSOA 4O3BA 5KCJB 2VGQA 2RINA 1UIUA 2A5TB 4LZ5A 4Q5TA 4LZ7A 3RNNA 3FVGA 1FQFA 3H6WA 2DE3A 2DOJA 1OMPA 3USDA 4QFOA 3TTRA 2I3WA 2DSFA 3K4UA 3SEVA 4GLIA 1TFAA 4XXUA 1B46A 3OD7A 4KPTA 1LBBA 3K1MA 1Y20A 4GXSB 1MXZA 3IX1A 1LAGE 1I6BA 4QFPA 3SETA 1OQGA 3B6QA 2XXIA 3VDFA 1S9TA 1FTMA 3M8UA 2FYIA 3FV1A 1NNFA 3TEPA 1UTHB 5KCJA 4GF8A 1SD3A 2VD3A 1OLCA 4YB7A 3AXFA 1L5TA 2VD2A 4AB5A 4WEDA 4GRKA 2AL4A 4MLVA 4C1TA 1QUIA 5CMBA 3TTKA 3QUFA 4M4GA 5TU0A 1B3FA 1VE4A 4C1UA 5DEXB 5ITOA 2DS9A 5AA1A 2QS3A 3U8QA 4GVOA 1SBPA 1NFTA 1A55A 1B5HA 4NWDA 2Z8EA 3VVDA 1B58A 3HHGA 3U94A 2F8DA 2X26A 1HSJA 3WAFA 4G77A 1YCJA 4OHNA 1URGA 2NUVA 4BLAA 5JEIA 2XXVA 4PFTA 1XVYA 2ONSA 5AA2D 1H45A 1H43A 3EQ1A 3H6VA 3PPNA 1YAEA 2Y7PA 3SEXA 1UTHA 3RGYA 1BIYA 3KZGA 1LB8A 3KBRA 5HPQA 1WDNA 4YKIA 2XXUA 1POY1 2H9BA 3G3JA 4RK2A 1FQBA 1LSTA 3OO8A 2Q2AA 3KSXA 3R6UA 4F1VA 5JK4A 2O7UA 4KQPA 4HTGA 1B4HA 2P0SA 1QW0A 3D4CA 3MP8A 2F7BA 4THIA 3MZ9A 4QHQA 5AA3A 3W9VA 2DE4A 3RLFE 2F34A 1Y4TA 2Y7KA 4NF4B 4ZEFA 2DYXA 3V5AA 3CSGA 2OCUA 3UGWA 1O63A 2HFBA 4DXUA 1N7WA 4HS7A 5ICTA 4ESWA 2O84X 5KDTB 3H3GA 4BDNA 3C36A 3K0VA 1URSA 3KOSA 3T96B 4P0GA 1VFEA 4U4SA 1IXHA 2VP1A 3R26A 1LBCA 2QMXA 1MXUA 3B6WA 3KJ7A 1ZLQA 4LATA 3IO6A 3QXMA 1F9BA 1MQJA 4FEDA 4R73A 1VR5A 4KCDA 5H8NB 1B1XA 3MQ9A 4HCYA 4MLQA 3MW0A 5DVFA 1SVXB 4ZZEA 4EXKA 1BLFA 5EYFA 4R2FA 1R1NA 4NF4A 3E9XA 4I1DA 4QSCA 3C34A 1XVXA 3RT6B 2LAOA 1T0KA 2OJTA 4XKQA 3CFXA 1A8EA 3GBAA 1GVCA 4OENA 2AL5A 5FHMA 1B4ZA 4GIZA 4U22A 1SI0A 4EF1A 5KDTA 5ICQA 2B3BA 2PVUA 4OETA 1FQCA 1LAXA 3W15C 1HSEA 1PEBA 1CE2A 1ZTYA 1ATGA 2XD3A 2QS1A 1II5A 2HCAA 2V93A 1AOVA 4DCXA 1B51A 2P1SA 4JSDA 1R9QA 3CFZA 4WXJA 2H4IA 1B52A 1BTJA 1MH3A 3IORA 1IIWA 5H8NA 3MVWA 2A5SA 1NKXA 4F3SA 3CVGA 3TTMA 3Q28A 1PBQA 2O7IA 3PMXA 1XS5A 3MZBA 1EZPA 2IA4A 4NTLA 3E3KA 4WEPA 1MQGA 4U21A 4IO4A 2OWTA 1A7LA 1ZJLA 3FJMA 4QRZA 3KJTA 4LQ5A 3ZKLA 4OEVA 1FCKA 4Z7EA 1IITA 2XXYA 1MPDA 1B7UA 4G68B 1SW1A 2XXXA 3TPAA 4FATA 5HBCA 3PUVE 4EQ9A 2HAUA 1M5EA 2V3QA 1QUKA 3IB1A 4U4XA 3JYRA 3QAXA 1JEUA 4LZ8A 1MQIA 3OO6A 4RXLA 1NNPA 1MQHA 3H03A 4KR5A 4ISUA 2H25A 3PMWA 3Q27A 3C33A 2UVGA 1PDAA 4OFJA 5K2XA 4RY1A 5IAIA 3PUYE 2O6AA 1WVJA 1MM7A 2F7AA 5ELVA 4QSDA 1DPEA 3OELA 4FORA 4DLDA 2PT1A 4IO5A 4ELPA 4DIGA 4F39A 4IGRA 4YMBA 1MY4A 1EZOA 3FXUA 5I57B 1TT1A 3TAJA 3C35A 1SQYA 3IB2A 1O7TA 3KEIA 1PB7A 2YLNA 5CMKA 3G3KA 1KWHA 3DP6A 3CRBA 3MPKA 3TMGA 1XOCA 4IY6A 5I56A 4ZEIA 3MZ1A 4G2ZA 4EF2A 1ZU0A 4OTEA 2Z8FA 2OBGA 1AIVA 4TLMB 1MM6A 3SKPA 1DTZA 4DDDA 2IEEA 3IOVA 3M3FA 4F18A 5H8QB 5F1QA 4YZZA 1LAHE 3U1OA 1PB8A 2F36A 3DP4A 2DP8A 4NWCA 1LLSA 4I8CA 1MXWA 4UA8A 5I57A 4ZE9A 1IXCA 4UACA 4OVJA 3PV0E 1B9JA 1US5A 2NVUB 1R9LA 5DVJA 3ZS6A 1GTKA 2HEUA 1DPPA 3UIFA 2X7PA 3LC8A 4I9DA 1N3XA 2GHAA 3SESA 1N84A 5I59B 3Q25A 1LFGA 3GLBA 3H7MA 5FTIA 5H8QA 3ONMA 3BFUA 2PBWA 1MDQA 3PU5A 2XXPA 4G8HA 3T9VA 2PYYA 2ESNA 2ZMBA 2ZYKA 4FIMA 3N5LA 5EHMA 4X1BA 4OFLA 3IOUA 3FIRA 4H65A 2G93A 2ANJA 4KCCA 5F7VA 3K6UA 2I4BA 5CI5A 1A99A 3DLNA 4I62A 3W9WA 3K6XA 1Y3QA 3VVEA 4ZZAA 3S9MC 3OENA 4RNSA 2I58A 2R6GE 4OZ9A 1Z7NE 3QUJA 4KD5A 4OEUA 3CG3A 3ILTB 4QFLA 4LA9A 4JWYA 2A5TA 2ZNSA 2I4CA 4OESA 3A3UA 1USYE 1B40A 3RTFB 2UVHA 4NF5B 2V84A 1VFDA 1N3WA 1FQAA 5ITPA 2F5XA 3OOAA 1A40A 2ZYMA 1JNFA 3M3KA 2H5YA 4POWA 4XIGQ 5FTHA 3FXRA 4ELOA 1MPBA 2DXYA 4Q30B 4DXBA 1JVXA 3IB0A 3EHSA 4JXIA 2I0BA 4AQ4A 3O66A 1P1QA 5H8HB 5I2NB 3EN3A 2P2AA 4JB7A 4EUOA 3K2DA 4IGTA 5JTYB 1Y9UA 4H8IA 3G3GA 2O1MA 3I5OA 3O29A 4PQJA 4G8NA 5A5XB 4E0XA 4LP2B 2HZLA 4NF5A 1MH4A 1B05A 4N6PA 4XTCQ 2OK2A 5DEXA 2RCAA 2R9JA 4GD5A 3K1PA 2RC9A 2REJA 5ISUA 5H8FB 5BUUA 1Q1KA 3RT8A 4R9FA 4QFNA 1S7YA 3MPLA 1SW2A 2DE2A 3IJXB 4ZEDA 2ONKE 2QRYA 3OEMA 3FATA 4DE8A 4YB5A 3ZKKA 1LFHA 1MRPA 1QJMA 5I2NA 3H4ZA 4N07A 1D4NA 2QS4A 3MC2A 3S9EA 3QIMA 1YPNA 3KSJA 5A5XA 1Y4CA 3CSBA 4HW8A 3PD8A 3IR1A 4H67A 2FNCA 4U23A 1SDXA 2RF1A 1LGBC 5CM6A 3UA8A 4F2OA 4MFIA 3EPEA 1NNTA 1MQDA 2XX9A 4FJPA 2UYEA 4GL0A 4ZS9A 4F22A 3D4GA 1Y3NA 4O3CA 3BKIB 4Q8RA 1LB9A 1D9VA 3E4RA 4KYDA 4ZE8A 2CZLA 4Z0IA 3SEUA 1NMUA 3U93A 1N76A 3DM0A 4F3PA 1URDA 3LR1A 3O2AA 3S9NC 2DWAA 3OSRA 3O6HA 2RC7A 5CBSA 4F1YA 4U1ZA 3FVNA 3SEWA 2XX8A 3I6VA 1H3DA 2D5WA 2F6GA 4IY5A 2QSXA 2WKYA 1I6QA 3CR9A 2Q2CA 1M5CA 4H0WA 1ZMGA 2VHAA 2I6EA 3E13X 3VV5A 5DTBA 5I2KB 4OFOA 3TFLA 2XD2A 3K1NA 2NWJA 3HO7A 4OWDA 1ZKBA 4N13A 4E0WA 1LCFA 2UXAA 5IKBA 3OEKA 2KLFA 3PMVA 3OO7A 1I69A 3UORA 2XXHA 2OWSA 4BDQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3OO9A 3PUWE 1IUDA 2B4MA 2YJPA 2AYSA 1O64A 1LCTA 3HPIA 1B3GA 3MUQA 2V4CA 4GFRA 1M5DA 3CIJA 3PPRA 2FBPA 3KN8A 2I3VA 1AH5A 5ESYA 1PB9A 4IO2A 1N7XA 4AB6A 2QJEA 1B5IA 4PFUA 3MVZA 4GXAA 1IXIA 1DK4A 1UQWA 2WBDA 5I2KA 5HM4B 2QPQA 2O51A 4YICA 2CEYA 3TELA 1I6AA 1R6ZA 1NV0A 4DXCA 4HE0A 1CB6A 3KN7A 4ONYA 5FHNA 1OIBA 4H8JA 3EF7A 4DCYA 1EYJA 4ND9A 1FTOA 3GXAA 3OMBA 2Z22A 3G7WA 4GWUA 1Y3PA 3T9UA 3MP1A 4HCWA 3DP8A 2RC8A 4I3YA 4P11A 1SI1A 3K00A 2V3TA 1JVYA 1MG1A 1NI9A 4RPNA 1JW1A 2QVRA 3FUZA 1SYIA 4H1XA 1QKBA 3RTWB 3K02A 4BDOA 5ET5A 3V89B 1FPDA 4G68A 3TYHA 3BFTA 5EQ7A 3TODA 4NF8B 1LAFE 2ZYNA 3TCHA 5B70A 4ZEKA 3PUXE 1IQ7A 5I5PA 2PMSA 1RYXA 1FQEA 3B8BA 3LSLA 1GGGA 3KN3A 5IZZA 1AWBA 4L17A 3GZGA 1DSNA 3FBPA 4XKPA 4N8YA 1MY2A 3O6GA 3RY3A 2B4LA 2E1SA 4PBHA 3TTNA 1Y1MA 4GWOA 1MDP1 1LBWA 1IEJA 2F6PA 4QFKA 3IL1B 3G3IA 4XF5A 5FBPA 3TKDA 4TOZA 3FJ7A 5CMMA 1FW0A 3T0JA 3IO4A 2ZYOA 4JDFA 4YKKA 4OYVA 4YKPA 2CEXA 2ZXTA 4MAGA 1TFDA 2DVCA 4PAIA 4F29A 4GOTA 2F97A 3LUYA 3ILUB 1ELJA 4NF8A 4MNCA 2B65A 2M8CA 2Y7IA 2XX7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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