1H44A

R210l n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFILESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal transport
total genus 99
structure length 322
sequence length 322
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A02
4XKNA 3T93B 4GVOA 4IGTA 3VLUA 2UVHA 4NEDA 1QUIA 4FIMA 3CR9A 1N3WA 3CIJA 1MPDA 1MPBA 4F39A 4YKJA 4OTEA 4U21A 4N07A 4DXBA 1S7YA 1RYOA 3MQ9A 3B6WA 1JEUA 2ZYOA 1VFDA 3TCGA 4C1TA 1N84A 1FQDA 3FGSA 1Y4TA 1NNFA 5EHSA 3PUXE 3EHTA 1A7LA 3UN6A 5K2YA 3EN3A 4Q5TA 3LSXA 2FYIA 3MUQA 2OK2A 2HFBA 3D4CA 3LBSA 2NVUB 4BDQA 4EUOA 5CBSA 4DCXA 3HHGA 3OO6A 3GLBA 1HSLA 2RINA 4N6PA 4OMBA 1XC1A 5TU0A 1D9YA 3MP1A 5L9OA 3T66A 3IJXB 3H6VA 3N5LA 3GBBA 4F1VA 4G2ZA 1LAGE 1LFGA 2I4CA 3SEXA 1NH8A 1B9JA 1NNPA 2ONRA 3VV5A 5DT6A 4YMBA 3SEVA 5ICTA 3FJMA 4KHZE 4ELRA 1MQJA 1B46A 3C36A 3TMGA 3KN3A 1B3EA 3VDFA 1D3KA 2O84X 4R74A 3IO6A 2O7IA 1MQIA 3CRBA 1ZMGA 1B5IA 5TPAB 4DE8A 5L8DA 1S9TA 4QHQA 3FVOA 2X26A 1ATGA 3K01A 4JWOA 2Z23A 2OLBA 1QW0A 1NFTA 1N7WA 3USDA 5BUUA 4Z7EA 1LLSA 4GL0A 4RNSA 2PX1A 4P0IA 2UVJA 1WODA 1I6BA 1VSOA 1QVSA 3TTLA 1AIVA 1EH3A 4KR5A 2V25A 1FQCA 5I2KA 3FATA 1LBBA 1EU8A 2RCAA 3EHSA 4GXAA 1YPNA 3PU5A 1O7TA 5I59B 5H8HA 4H8IA 1P1NA 4I8CA 3DP4A 3TYHA 4H67A 3M3LA 2DYXA 2HEUA 3H3GA 3C32A 4NF8A 3B7DA 5TP9B 2YPNA 1LAFE 1ZBMA 4KYEA 3FUZA 1P99A 5EYFA 2I4BA 4ESXA 4RYAA 2PT2A 1YCJA 3TTRA 1LCTA 4YB7A 3M8UA 3IOVA 2A5TA 3U94A 1H43A 2PMSA 1GR2A 2VHAA 3PPOA 4R9GA 4X1BA 2DVZA 2RC9A 4MFIA 3MC2A 4ND9A 2F97A 3CFZA 3RT8A 1MQDA 3VFJA 2NXOA 4F29A 4G68A 1ANFA 1Z7NE 3ZKLA 3RNNA 3G3FA 4MF3A 4ONYA 3QSLA 1MXVA 4HCWA 1QKBA 4GD5A 4JDFA 1YAEA 1B1XA 4X9TA 2DWJA 5BWJA 4OHNA 2DE3A 1XVXA 1JW5A 3CG3A 2O6AA 1N0TA 4ELQA 3MJNA 5B7DA 5L9SA 5JTYA 4GF8A 4HTGA 3FV2A 4DDDA 2F34A 1MRPA 4ELOA 3VXCA 4NTLA 1OLAA 4R72A 2F36A 1YTVA 1XT8A 4YKIA 3TPAA 1ZTYA 4IO4A 2DE2A 5ISUA 3R7XA 3G3HA 2DQVA 3OD7A 1MXUA 2F7CA 4LZ7A 3PPNA 2UVIA 2XX7A 3OO7A 3IK6B 5LOMA 3T9VA 2F5XA 3LC8A 1OIBA 5I58A 3T96B 1B1HA 1JQFA 3O6HA 4PETA 3E4RA 4FE8A 3GBAA 4DZ1A 5FHMA 4I1DA 3S9MC 5L9MA 3Q25A 1P1QA 3OO9A 1LFHA 3RN8A 5EHMA 4BDNA 3S9LC 1MXZA 2R6GE 2REJA 3LSWA 4U1ZA 5HBCA 5FTHA 3IAZA 4M1VA 1B7UA 3HHFA 4UACA 4R6YA 4Q0CA 2QSXA 5DEXA 5K2XA 2OJTA 4FECA 4F31B 3OXNA 3FJ7A 1FTMA 3TELA 1IXCA 4YKPA 4XKQA 1B5JA 3AXFA 1XVYA 4HS7A 2HAUA 1IXGA 1JEVA 4KI0E 2F7AA 4IO3A 1FTOA 4KD5A 2ZMBA 1IIWA 2ONKE 3FASA 1NMUA 3H7MA 1DTGA 3K1NA 3VLWA 4R75A 1B3HA 1QUKA 1R9QA 5H8FA 3O97A 3FZVA 2Q89A 4PFYA 5I2KB 1JETA 4WEPA 5B70A 1T0KA 2DVCA 3OENA 3LR1A 2QS1A 4IY5A 2XXQA 5H8HB 1B7ZA 1M5DA 1ZLQA 3KEIA 2I3VA 1MY4A 4NF8B 4EQ9A 1J1NA 3IB1A 3K6VA 2I0CA 2I6EA 2Y7WA 1ZIUA 4OESA 1H45A 2PYYA 3SESA 3SERA 2E0SA 2D21A 1DSNA 3M3KA 2G29A 3L6HA 4WXJA 3QAXA 3MZBA 3TEPA 4NF5A 4PQJA 1F9BA 2QS2A 3MW0A 2GH9A 3C31A 2GHBA 1H76A 3OSRA 3THIA 2O1LA 4TLLB 3N94A 4XTCQ 4TQUQ 3RTFB 1USYE 4G68B 4Z0IA 5HPQA 4GIZA 1DOTA 3A09A 2O69A 1TT1A 1MPCA 1LCFA 2DWHA 2DSFA 4IO7A 5KDTA 3U93A 3V8XB 4FORA 1BTJA 4X48A 3IR1A 4YKKA 3G3JA 4OFOA 2PT1A 1UTBA 5JTYB 3FXRA 4ZE8A 1JW4A 2THIA 1ELJA 3IB2A 3H03A 4F22A 3T9XB 2QS3A 5AA1A 3KFMA 1HSEA 2QMWA 3SEYA 3O29A 1SI0A 1OVTA 2QRYA 1MM7A 1POTA 3KSJA 2GFEA 3S9NC 3KOTA 3FVNA 3I6VA 3T22A 4QFKA 2HZLA 4OFLA 1PC3A 2UYFA 2D3IA 3MP8A 3O9PA 2H9BA 3E13X 1QUJA 3MWBA 5I58B 1R1NA 1D4NA 4QSCA 4XKPA 2Z22A 5I2NA 4ZS9A 4P0GA 3G7WA 4F2OA 1FTJA 3V5AA 1SYHA 1US4A 4DXUA 1GV8A 2V3UA 4LQ2A 2DS9A 2KLFA 3C34A 1MH3A 1PB8A 3C35A 3RPWA 3KN8A 3MPLA 3M3FA 3U8QA 2LAOA 3O28A 2I49A 1SD3A 3MPKA 1B40A 2XD3A 3CFLA 4IO5A 2H99A 3FVGA 4H5FA 5DEXB 3DELB 3UA8A 1M5CA 1A55A 1R9LA 5CI5A 2XXPA 4KFQA 3OMBA 3ONMA 3ECRA 2RKMA 3HN0A 3R6UA 4BDOA 4F3SA 3PUVE 4KPTA 4ZE9A 5H8QA 3SEWA 3CVGA 3CG1A 4ISUA 4RK9A 4TLMB 5M2VA 3ILUB 2F78A 3KN7A 1B5HA 5DVFA 1N3XA 1PB9A 2BJJX 3K1PA 5F1QA 3UGWA 5CMCA 2XXXA 5H8FB 3SKPA 1H44A 2XD2A 3K6UA 4NE4A 3FV1A 4IO2A 3OELA 3RTWB 3VXBA 3P7IA 5I57A 5IKBA 4F18A 1WDNA 2Z8DA 3BBRA 4FEBA 3JV9A 4F1UA 1L5TA 1Q35A 2RC8A 1IXIA 3QUFA 3N6UA 1JVYA 1IITA 3JYRA 4GOTA 1VR5A 3BKIB 3V89B 4GXSB 4G68C 1DPEA 1SW1A 1TFDA 2DXYA 3O2AA 4RK2A 4H5GA 4BDMA 1HSJA 1B3GA 2QJEA 2A5SA 1Z7ME 3BFUA 4NF5B 3S4UA 1MDP1 3O6IA 3K4UA 4POWA 3L6GA 2D5WA 4U4XA 2OWTA 2XXVA 1PBQA 4LUBA 4IY6A 4F3PA 4EQBA 1PDAA 3TDJA 5H8SA 5KDTB 1RKMA 1QULA 1A54A 1PB7A 5FTIA 4LVQA 1IQ7A 3PV0E 4LA9A 4MLQA 4QFOA 2UVGA 1Y3NA 3TTNA 3MZ9A 3B6QA 3MVZA 3T9UA 3WAEA 1AMFA 1UTBB 2GRVA 3ODBA 2NOOA 3OO8A 3TQLA 2P0SA 1LAHE 1NNTA 2ZNTA 2DE4A 1IUDA 4IGRA 1R6ZA 3F11A 2XHDA 4MLVA 5ITOA 2B65A 4F2QA 1B4HA 4E0WA 2Q9TA 1IXHA 3MAMA 4IB2A 1SYIA 2YJPA 3ZSFA 4E0XA 1SQYA 4DIGA 1ZJLA 5HM4B 1MXWA 5CMMA 4QRZA 4PFTA 5I2NB 2V3QA 3K00A 1SVXB 1PBPA 2ONSA 4G4PA 5FHOA 1UQWA 4OVJA 1I69A 2IA4A 4GFRA 2VOZA 4QSDA 4GL8A 1NNKA 1DMBA 1B0HA 4OZ9A 3TTKA 1B32A 2VP1A 1JW1A 3W9VA 3S2VA 2ABHA 3IJOB 4R2BA 4XXUA 2X7QA 4R2FA 3TCFA 4EXLA 3FJGA 2DOJA 4JSOA 4NWDA 2F8DA 2Z8FA 1CB6A 2XXWA 1NKXA 1P1WA 3PMVA 3K2DA 4PFWA 3DLNA 3I5OA 4NF4A 4THIA 2O68A 2H5YA 3QYTA 4F1YA 4OERA 4RXLA 3KZGA 1UIUA 3Q28A 2H25A 3Q27A 3O6GA 1AOVA 1KWHA 1P1OA 4TOZA 5H8QB 2R71A 1TWYA 1LSTA 1Y1ZA 5CMBA 4Q30B 1XOCA 2O7UA 2M8CA 3PPPA 4RA1A 2W7YA 2ZXTA 1URDA 2R9JA 5I84A 3PUYE 4H65A 1MH4A 5F7VA 2ZNSA 4AQ4A 3RUMA 3B6TA 4P11A 1EZ9A 4Q8RA 4EF2A 1FQAA 2XXRA 1VE4A 3VVDA 5I57B 3BFTA 4LATA 1OQGA 3LUYA 2AIXA 2OBGA 4PE5B 3TFLA 2V93A 3LSLA 1N7XA 4FEDA 4QFLA 3G3IA 4LONB 3A3UA 3IX1A 2A5TB 3K6XA 4R6HA 3TCHA 2VD3A 2QPQA 3E9XA 4JB7A 1FQEA 1M5EA 4OEVA 1MQHA 1JNFA 3EF7A 4H1XA 3U92A 4MBPA 3PGFA 2IEEA 1NL5A 3JZJA 3OEMA 3PPQA 4JWYA 3FXUA 4UA8A 2V3TA 3C4MA 1BIYA 1JVXA 3FD3A 4YZZA 3TQWA 4F3BA 4KYDA 3PUZE 2HXWA 4OETA 5I56A 1DTZA 1PEBA 2P1SA 1SW5A 4H0WA 1Y1MA 4I62A 4FAJA 2F6PA 2X7PA 3HSTA 3R26A 4K3FA 1AL3A 3TTMA 1TXFA 5CRYA 3MZ1A 3PUWE 1LAXA 4U2RA 1MM6A 2E1SA 3C9HA 1IZ1A 3MVYA 4RPNA 1LB8A 4JXIA 4QFPA 3H6UA 5CM6A 2I48A 3PPRA 5ELVA 3D4GA 4LQ5A 1BKAA 1S50A 4LZ8A 3HO7A 3PMXA 4WKMA 2OZZA 2UXAA 3QIMA 3N26A 4ZEDA 1GGGA 3TZAA 2RC7A 5AA2A 4O3CA 4O3AA 3OEKA 2OWSA 2I58A 2ANJA 4EDPA 3H6TA 4H6DA 1Y3QA 3W15C 1POY1 4YICA 4EXKA 3Q29A 4ZEIA 1VFEA 4XIGQ 4G8NA 1B05A 4NF6A 1US5A 2H4IA 3N6TA 3RLFE 1UTHA 4F3GA 2Y7RA 4RPOA 1SDXA 3C33A 4N13A 4ZECA 3SEUA 3LSFB 3KBRA 4OENA 5DTBA 1B58A 4YAHX 3CSGA 3U72A 5DVIA 2Y7IA 5A5XA 4YB5A 4EF1A 1IEJA 3DP6A 2DWIA 1MY3A 1D9VA 1MQGA 1MS7A 2XXHA 1M5FA 2Q8JA 1M5BA 1LB9A 2UYEA 4JWXA 5KCJA 3K02A 3KJTA 2ALUA 2XXYA 4KCCA 4NF4B 4H8JA 1LBCA 5H8NA 4LZ5A 1FW0A 3UIFA 3K1MA 2XXIA 2DP8A 1GTKA 3UORA 4X1DA 2Q2CA 5DVJA 4R73A 2QL3A 3OSQA 3MP6A 2V84A 4OEUA 2YLNA 2QMXA 4FATA 2Y84A 1FQBA 1EZOA 3ZKKA 4R6KA 3HPIA 4OXVA 4ESWA 3W9WA 2HZKA 4QF9A 4U23A 3IORA 3FVKA 3KG2A 4RY1A 1BLFA 1URGA 4L17A 4R9FA 2Z8EA 3K6WA 1B0LA 2HQ0A 4DXCA 1P1UA 4BDLA 5CBRA 4C0RA 2B3BA 1B4ZA 3U1OA 2I0BA 2CMOA 2VD2A 4QSEA 3Q26A 3KOSA 2B3FA 1OMPA 2PBWA 2XXTA 1MY2A 1LGBC 1MG1A 5AE4A 1B7HA 5AA4A 5AA3A 4GLIA 4ZEFA 3DM0A 3HCQA 2QS4A 1EZPA 1OLCA 2AL5A 3T9HB 2AYSA 4OYVA 3S9EA 4ECFA 3WAFA 1AH5A 3UK4A 2XXUA 3MVXA 2ZYMA 1B2HA 1ZU0A 1SW4A 3IB0A 2Q88A 5ICQA 3G3KA 2G93A 4BLAA 1Y4CA 2NWJA 5AA2D 4YMAA 4JBZA 5CMKA 3PMWA 1QJMA 4GQOA 1XS5A 2XX8A 4U1OA 1FCKA 1FTKA 4XKRA 3ILTB 2XX9A 2F35A 3QXMA 5I56B 2REGA 2RCBA 4KQPA 1MXYA 2I3WA 4HCYA 4U22A 3TKDA 3GXAA 4EQ7A 1Q1KA 3KSXA 4U4SA 3QUJA 1I6QA 1B3FA 1URSA 4POXA 4MH5A 4QFNA 5DYHA 4IO6A 1A8EA 2Y7PA 4G8MA 1Y3PA 2F7BA 2O1MA 2ZNUA 3I3VA 1OVBA 4ZDMA 2OCUA 2CZLA 1NH7A 3VVEA 1Y9UA 3IL1B 3GZGA 4I9DA 2O51A 1I6AA 3CSBA 3HV1A 2DWAA 3IO4A 2ZYNA 1FTLA 2PVUA 3OOAA 4ELPA 1FQFA 3IOWA 5AA2B 1XHYA 2FNCA 5JK4A 4AB6A 2HAVA 1RYXA 1CE2A 3H6WA 5KZTA 3IOUA 3FXQA 4YU0A 4HW8A 3TAJA 2WKYA 4G77A 3SDFA 4AB5A 4PP0A 3RT6B 3MVWA 1WVJA 2FA7A 3K0VA 1A40A 1MDQA 4BDRA 3UP9A 3EPEA 2RF1A 4NF6B 1QKAA 4C1UA 1UTHB 4G8HA 4DLDA 1O64A 4NMYA 5J1DA 2H98A 3A3CA 3TUSA 1H3DA 5A5XB 4KCDA 3PD9A 4DCYA 4O3BA 5TPAA 3VVFA 1B6HA 1MY1A 1MY0A 4ZZAA 1N76A 3QK6A 1B3LA 1MXXA 2ESNA 5KCJB 1GVCA 1SI1A 3G3GA 4GWOA 4ZEBA 5H8NB 4OQOA 3E3KA 3VE1B 4ZZEA 3V83A 3MBPA 3RY3A 1A99A 3PD8A 3H06B 4JSDA 2NUVA 3O66A 4NWCA 4WEDA 1UIVA 3TODA 1TFAA 4LP2B 4YB6A 1ZKBA 2HCAA 5I59A 1SW2A 1BP5A 4OFJA 5ITPA 5CC2A 3KJ7A 4ZEKA 3H4ZA 5FHNA 3CFXA 4OWDA 1Y20A 1OQHA 5TP9A 1B52A 2AL4A 3CI8A 4KYSA 2Y7KA 4PFUA 3EQ1A 3RGYA 3IOTA 4FJPA 1SBPA 5AA4B 2VGQA 2F6GA 1DPPA 1USYH 2Q2AA 3KGCA 5JEIA 4GRKA 4M4GA 4RJZA 5IAIA 1O63A 3SETA 3DP8A 1A8FA 1N04A 1B51A 2DXRA 3VLVA 3EHUA 3FIRA 1LFIA 2P2AA 1II5A 3RQTA 2ZYKA 3ZS6A 4F19A 2GHAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XKNA 3T93B 4GVOA 4IGTA 1FTAA 3VLUA 2JJKA 2UVHA 4GWWA 4NEDA 1QUIA 4FIMA 3CR9A 1N3WA 3CIJA 1MPDA 1MPBA 4F39A 4YKJA 4OTEA 4U21A 4N07A 4DXBA 1S7YA 4PFRA 2L5VA 1RYOA 3MQ9A 4XF5A 2KQZA 3B6WA 1JEUA 3T1BA 2ZYOA 1FBDA 1VFDA 2QFLA 3TCGA 4C1TA 1N84A 1FQDA 3FGSA 1Y4TA 3ISPA 1NNFA 2PCRA 5EHSA 3PUXE 3EHTA 1A7LA 3B8BA 3UN6A 5K2YA 3BIGA 3EN3A 4DI3D 4Q5TA 4JVDA 3LSXA 2FYIA 3MUQA 2OK2A 2HFBA 3D4CA 3LBSA 2NVUB 4BDQA 4EUOA 5CBSA 4DCXA 4I3YA 3HHGA 5DW8A 3OO6A 3GLBA 1HSLA 2FIXA 5F24A 2RINA 4N6PA 4OMBA 1XC1A 5TU0A 1D9YA 3MP1A 5L9OA 3T66A 3IJXB 3H6VA 3N5LA 3GBBA 4F1VA 2OWZA 4G2ZA 1LAGE 4GWSA 1LFGA 2I4CA 3SEXA 1NH8A 4HE0A 4OVQA 1B9JA 1NNPA 2ONRA 3VV5A 5DT6A 5EQAA 4YMBA 3SEVA 2FHYA 5ICTA 3FJMA 4KHZE 4ELRA 1MQJA 1B46A 3C36A 3TMGA 3KN3A 1B3EA 3VDFA 1D3KA 2P3NA 4N6KA 2O84X 1NV6A 4R74A 3IO6A 2O7IA 1MQIA 3CRBA 4GWYA 1ZMGA 1B5IA 2WEFA 5TPAB 4DE8A 5L8DA 1S9TA 4IR8A 4QHQA 3FVOA 2X26A 2WX9A 1ATGA 2XWIA 3K01A 4JWOA 2Z23A 2OLBA 1QW0A 1NFTA 1N7WA 3USDA 4OVPA 5BUUA 4Z7EA 1LLSA 4QBAA 1IMFA 2ZZWA 4GL0A 4RNSA 2PX1A 4P0IA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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