1H44A

R210l n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFILESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
molecule keywords LACTOFERRIN
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 322
sequence length 322
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A02
1CB6A 4BLAA 3K02A 1TFAA 3W9VA 4OYVA 1OMPA 5A5XB 4ESXA 5JTYA 2H99A 3VXBA 1YTVA 1Y4CA 3UP9A 3IJOB 2LAOA 4KCCA 3SKPA 1JQFA 3K6WA 3IAZA 3QIMA 1XC1A 1B46A 5H8HB 5F7VA 1UQWA 4QSCA 2XXQA 1S9TA 4YKKA 2VHAA 4Z7EA 1DSNA 2ONRA 1N04A 3TFLA 3HN0A 1ATGA 2P1SA 3C35A 2Q9TA 1URDA 1B5JA 3RY3A 3FUZA 1IXGA 2B65A 1QVSA 4GL8A 2P2AA 3FJGA 3FJMA 1B6HA 1II5A 1Y3NA 3C36A 5KDTB 3IR1A 5EHMA 4JBZA 4F3GA 3VVDA 3EF7A 3VLUA 4GIZA 2OZZA 3IB0A 4O3CA 2XXXA 4FORA 3FD3A 4IO7A 3DELB 4PFUA 2THIA 1VFEA 4F3BA 1NH7A 2NVUB 4QFKA 3TCHA 1MXVA 3KBRA 2HXWA 3N5LA 4XKPA 3CIJA 3KGCA 4R2FA 3T22A 5ICTA 1MXYA 3Q26A 3IX1A 4OQOA 3P7IA 4EDPA 4KD5A 4YB6A 3H6WA 4IO6A 5FTHA 2ZNSA 4C1TA 4ELQA 5AA2B 3MQ9A 4PFWA 3HHFA 2F7CA 4OFOA 3IB2A 5I57A 1A8FA 1JEVA 3IOVA 5I2NA 1P1WA 2GHAA 1US5A 3Q25A 3U1OA 1N7WA 1MQGA 3UA8A 4R2BA 1BIYA 3SEWA 3PUWE 4BDQA 2OK2A 3K2DA 4ELOA 4IO2A 2KLFA 1FCKA 4U1OA 1MRPA 3AXFA 5TPAB 3EHTA 3S2VA 3R26A 1LGBC 3LR1A 3O6IA 4F1UA 1FQEA 4ZEBA 2X7QA 3T9VA 1Q1KA 1SI1A 4F3PA 2RCBA 4Q30B 2HFBA 2R6GE 4G4PA 3VVFA 1EZPA 4H67A 2AL4A 4KYDA 4ZE8A 2YLNA 3M3FA 2H25A 4XKQA 1MPBA 4X1DA 1UIVA 3IL1B 3IORA 4GD5A 1B7ZA 2V3UA 1FTOA 3C31A 4YAHX 4ISUA 1R9QA 2WKYA 3H06B 1TFDA 2DWHA 4KHZE 2FNCA 2V84A 2I48A 4IO5A 3GBAA 1SDXA 1B0LA 3N6UA 1VE4A 3PPPA 4PETA 5I2KB 1SBPA 3JZJA 1PC3A 3QUJA 3OO8A 4AB5A 3ZKLA 3B6WA 4RPOA 1L5TA 3V83A 1A54A 4ZEDA 4YB5A 4Q5TA 1B3GA 1URGA 4LQ5A 1M5CA 4ZECA 4THIA 2O6AA 3LC8A 2F35A 4N13A 3MVXA 5I56B 3FXUA 3QYTA 2Q88A 1B52A 3S4UA 5DVIA 3VXCA 5CBSA 2DVCA 4OEUA 4XIGQ 1QULA 1FTKA 2QRYA 3E13X 1PB8A 5K2XA 4OZ9A 3IOUA 3KEIA 3MP8A 1I69A 5DEXA 1O64A 3EQ1A 4EXKA 1PDAA 2D3IA 3MC2A 3H6TA 4H5FA 2HCAA 2Z8FA 3GLBA 2Y7RA 3M3KA 3C9HA 1B3FA 1B7UA 2DE4A 4ZS9A 1SYIA 1OLCA 3U92A 1Q35A 1Y3QA 5BUUA 2REJA 4LZ5A 4NE4A 2FA7A 3G3GA 5EHSA 3TEPA 3PPRA 3TZAA 2F97A 3TCGA 3RN8A 1H43A 4QRZA 2O7IA 2DXRA 2XXUA 4LZ7A 2M8CA 3OO6A 3OD7A 4KI0E 2F8DA 3OENA 3FIRA 1MY3A 2Z22A 4UA8A 3PD9A 2Y84A 4MLQA 1A55A 4LVQA 4LONB 2Q8JA 1URSA 1JEUA 3TQLA 1USYH 1N3WA 3SERA 2XXIA 2DP8A 5AA4A 4DXCA 2Z8EA 3ZKKA 4LATA 4WXJA 1B5IA 1O7TA 1LBBA 4FEDA 3THIA 2NOOA 4BDOA 3UIFA 5BWJA 2A5TA 1B9JA 1D9VA 3PPOA 4HCWA 3UORA 3TUSA 4O3BA 4EF2A 3TPAA 1WDNA 3PMVA 4IO4A 5IKBA 3DM0A 4MF3A 2I3VA 4NF5B 3QSLA 2QPQA 3FV2A 5I58B 4NF6A 1XHYA 1HSLA 1P1UA 3PPNA 4POWA 3LBSA 1D9YA 2XX7A 3H3GA 1SVXB 1UTHA 3VDFA 5HPQA 3UK4A 4E0WA 3OXNA 4I9DA 1MXZA 4NEDA 1MQHA 3FZVA 1DTGA 3E3KA 4DXBA 4ESWA 5HM4B 1P1OA 4ZEFA 1QKAA 3ODBA 2QMXA 4LQ2A 4YZZA 3DLNA 3CI8A 3MUQA 3A09A 5AE4A 1LFHA 2AL5A 3SEVA 1OVTA 2F7BA 2CMOA 3RT6B 4F29A 1TWYA 3W15C 3KFMA 4NWCA 3IO4A 1R6ZA 4RJZA 2PYYA 3C32A 1B1HA 3T66A 4LUBA 4ZEKA 4H1XA 3VV5A 3EPEA 4R73A 2ZNTA 4RY1A 1JNFA 2B3FA 4YU0A 4E0XA 4P0IA 2UYFA 3MAMA 5JK4A 2ZYNA 5H8FA 1NKXA 2RC9A 2OWSA 4DIGA 1IUDA 1ZBMA 2OCUA 3FVNA 3G3KA 4UACA 4ECFA 1SW4A 3I6VA 3C4MA 1AL3A 3F11A 2HAVA 1MY4A 3SEXA 1B3HA 5DTBA 3M8UA 1M5EA 2OLBA 2ZYKA 1Y1MA 1BP5A 2F36A 3PMXA 1MXUA 4KYEA 1NNKA 5TU0A 3KSJA 4F19A 3W9WA 2V93A 4YICA 1B4ZA 1MDQA 2F34A 4R9FA 3BFUA 1JW4A 1N3XA 4BDMA 5KCJA 5FHOA 4ZZAA 3OEMA 3PUZE 3H4ZA 1BTJA 2DE3A 4JB7A 4GFRA 2XXPA 1NNFA 2R71A 1B05A 1MXXA 3H6VA 5LOMA 3OOAA 4I62A 4OENA 4RNSA 5JEIA 4P0GA 1IITA 2XHDA 4BDLA 3KSXA 4G77A 3T9XB 1R9LA 2ZYMA 4OETA 1US4A 4HW8A 1MH4A 3Q27A 3VFJA 4IY6A 3CRBA 1JVYA 3VVEA 3UN6A 4U1ZA 1QUIA 1IQ7A 1AOVA 2DWJA 1Y1ZA 3K4UA 3PD8A 2QS3A 4I1DA 2HEUA 2XXWA 1B40A 4JWOA 1N84A 1AIVA 5CI5A 4PQJA 2NUVA 4X1BA 2UYEA 1B7HA 4GXAA 1PBQA 3PMWA 2UVGA 2HZKA 3ECRA 4QHQA 5TP9A 2DE2A 1HSEA 4YKJA 3RQTA 2ZMBA 3MJNA 1JETA 4POXA 3RNNA 3U72A 2UVJA 4NF4A 1EZ9A 2OJTA 1UTBA 4OXVA 3K6VA 4GQOA 3LUYA 4R6YA 1IZ1A 3MVWA 1P99A 2Q2AA 3K6XA 2O7UA 3DP4A 2F5XA 2ESNA 4IB2A 1QUJA 3MBPA 4EQBA 4BDNA 2FYIA 1LCTA 1H44A 1B4HA 1ZTYA 1SI0A 1B1XA 2D5WA 3M3LA 4I8CA 5ITOA 1VSOA 3LSXA 2QS2A 1ZLQA 3IB1A 3TAJA 4TLMB 4NF8B 1QW0A 5DT6A 3CR9A 3S9NC 2XXHA 4DCXA 3ONMA 2I58A 2A5TB 3FJ7A 1M5BA 1WVJA 1GTKA 4QF9A 4JWYA 4PFTA 3CVGA 3UGWA 4GRKA 1ZU0A 2H98A 4GL0A 4GVOA 5H8NB 5DVJA 3WAFA 4NF6B 1OIBA 1UIUA 1Y4TA 3MP6A 5H8HA 1UTHB 3FATA 1LAGE 1LFGA 1GGGA 2DVZA 3T93B 1B3EA 3A3UA 2UVIA 3KN8A 3RLFE 2RCAA 1RYOA 1LB9A 4GF8A 4G2ZA 4G68A 1FTJA 2XD2A 1Y20A 3L6GA 1JW5A 3IOWA 4QFOA 3RUMA 2F6GA 5KDTA 1LAHE 4RPNA 1DTZA 4Q8RA 2V25A 4ELRA 1XVXA 3MP1A 1POY1 3O29A 2ZNUA 1WODA 2HQ0A 3KN7A 4QFNA 3Q29A 3FASA 5M2VA 4YKIA 5ICQA 1ZMGA 2Z23A 1S50A 2BJJX 2F6PA 3IOTA 2DOJA 3ILTB 2YJPA 3TELA 3RT8A 1PB7A 3N6TA 3D4GA 5AA2A 1BKAA 1ELJA 3TTMA 2Y7KA 3G3HA 2F78A 3K00A 5CRYA 3K6UA 4G8NA 1NL5A 3D4CA 4TLLB 3N26A 4H8JA 5JTYB 2PT1A 5CMBA 1A40A 2PX1A 3O6HA 3MZBA 4RA1A 5CBRA 1R1NA 3E9XA 5TPAA 4YKPA 4MH5A 4R74A 3I5OA 3QUFA 1B51A 3E4RA 2H4IA 4AQ4A 4ZEIA 3OEKA 4MLVA 2ANJA 1IXHA 4IGTA 4RXLA 1S7YA 3S9MC 3CFLA 1ANFA 3PPQA 3FVGA 1VR5A 1EZOA 2GHBA 4M1VA 3RGYA 2R9JA 5L9SA 4ZE9A 4JWXA 2OWTA 1J1NA 4MBPA 5AA2D 4LZ8A 3G3JA 2E0SA 1LAFE 4IGRA 1N76A 2XXYA 1LCFA 1XT8A 1A7LA 1JW1A 4M4GA 5I84A 1MY1A 5H8QA 5I2KA 4PP0A 3TDJA 4C0RA 2QMWA 3R6UA 3CG1A 1FTMA 3L6HA 2YPNA 4FJPA 2A5SA 1MS7A 1NFTA 2F7AA 3LSFB 3FGSA 1XS5A 3SDFA 1MPCA 4EF1A 3HV1A 2QSXA 4WEDA 3PUYE 3LSWA 4DZ1A 3G3FA 2DWAA 5FHMA 4R9GA 3ILUB 1D3KA 1Z7NE 3IO6A 3PGFA 4H8IA 4HS7A 4YMAA 2O69A 5I57B 3O2AA 1H76A 3CSBA 5I2NB 3VLVA 1GR2A 4ZDMA 1P1QA 1RYXA 1ZIUA 5B7DA 3JYRA 4TOZA 3IJXB 4F18A 4OESA 2IEEA 4JSDA 2G29A 1Z7ME 3QAXA 5J1DA 3C33A 2AYSA 4F2QA 4FEBA 4H6DA 2QS1A 3B6TA 4HCYA 2O84X 4U23A 3MZ9A 3OSRA 1MH3A 1B58A 1IXCA 1A99A 2HZLA 2Y7IA 1FQCA 1MDP1 5F1QA 1FW0A 4H0WA 3LSLA 4F1YA 1B3LA 4OEVA 3C34A 2AIXA 4ND9A 1OLAA 3HHGA 3RTWB 1FQAA 2XX8A 4N07A 2I49A 3V5AA 3MWBA 2UVHA 3EHSA 4YMBA 4NTLA 1PB9A 1T0KA 1H45A 3O97A 4XXUA 1B5HA 4G68C 2Q2CA 1TXFA 4OWDA 3O9PA 4DCYA 3OELA 2I4BA 2O51A 1DPPA 3U93A 2UXAA 4O3AA 1MQDA 4KCDA 3TYHA 4FECA 3O28A 4HTGA 4G68B 2GH9A 1YAEA 5I59A 5IAIA 5DEXB 2ALUA 5DYHA 1YPNA 1LBCA 3H03A 4BDRA 4NF5A 5I58A 2VD2A 4DXUA 3TQWA 1NH8A 2XX9A 3EHUA 4EXLA 2RF1A 3OSQA 2I4CA 2Q89A 2I3WA 5CMMA 1SW5A 4G8HA 2DYXA 4NMYA 3O66A 2REGA 3SEUA 4AB6A 1I6QA 1H3DA 4H65A 5KZTA 3TMGA 4GWOA 3GZGA 4PE5B 3HSTA 1N7XA 1MQJA 1JVXA 5B70A 2GFEA 1MG1A 5AA3A 4RYAA 1M5FA 4DDDA 2GRVA 5AA1A 4QSDA 3HO7A 4F22A 3USDA 2ONSA 3PU5A 1GVCA 4Z0IA 2DQVA 3H6UA 3V8XB 1POTA 1MQIA 2D21A 1Y3PA 4LA9A 1SW1A 4ONYA 5EYFA 2P0SA 4YB7A 1FQDA 3KN3A 4KR5A 2VGQA 4WEPA 5AA4B 1SW2A 3MPLA 1AMFA 1I6BA 1Y9UA 2PT2A 4FAJA 2DXYA 2PVUA 4OHNA 4OFLA 3K1MA 3QK6A 2Y7PA 1I6AA 1AH5A 1EU8A 3JV9A 1GV8A 3A3CA 4R6HA 3FV1A 1B32A 2W7YA 3TCFA 2NXOA 2O1LA 2X26A 2NWJA 3VE1B 3BKIB 1PBPA 3KJTA 4KYSA 3TODA 1F9BA 1HSJA 3FXRA 5A5XA 4G8MA 3S9LC 4OFJA 1FQBA 4EQ7A 1LLSA 2XXVA 1QKBA 1OQHA 3K01A 2RINA 3B7DA 3TTRA 5CC2A 1MM7A 1OVBA 3ZS6A 1B0HA 5H8QB 1XOCA 3O6GA 4U4SA 2O1MA 1D4NA 1RKMA 3EN3A 3N94A 3SETA 2O68A 4OERA 2ONKE 4RK9A 2H5YA 3T96B 1LFIA 2ZXTA 1MPDA 5H8SA 2H9BA 2I0CA 4IO3A 2G93A 3SEYA 1LB8A 1MXWA 3K1PA 4OVJA 5L9MA 5ISUA 4RK2A 1B2HA 4QFPA 1DMBA 2PMSA 3R7XA 4GLIA 3KOSA 3OO7A 3PV0E 3S9EA 1M5DA 3T9HB 3FXQA 2QJEA 1O63A 3HPIA 5H8FB 1IXIA 4F31B 1A8EA 3FVKA 1NNPA 3KG2A 3TTLA 4JXIA 3MW0A 1YCJA 2OBGA 4QSEA 3U94A 5L9OA 2DS9A 3BBRA 1BLFA 3T9UA 4JDFA 3K1NA 2V3QA 4N6PA 1MY2A 4TQUQ 3TKDA 1QUKA 3PUXE 5ITPA 2B3BA 4X9TA 2V3TA 2HAUA 3CFXA 1LSTA 1ZJLA 3OMBA 3VLWA 1NMUA 1FQFA 3CG3A 3GBBA 3I3VA 4L17A 4U4XA 4P11A 2X7PA 5CMCA 3DP8A 3G7WA 1IEJA 4DLDA 2I6EA 1FTLA 3OO9A 3U8QA 2DSFA 5ELVA 1PEBA 2QS4A 5KCJB 4WKMA 1EH3A 2DWIA 2RC8A 1SQYA 2Z8DA 4OMBA 4GOTA 4KQPA 3CSGA 3K0VA 2IA4A 1TT1A 3MZ1A 5CMKA 2RC7A 4F3SA 3DP6A 4EUOA 4NF8A 1CE2A 2I0BA 3MPKA 2E1SA 2Y7WA 4R72A 3BFTA 1N0TA 4XTCQ 2XXTA 4XKNA 2VOZA 3IK6B 3MVZA 4XKRA 5I59B 2ZYOA 1NNTA 3H7MA 4Q0CA 2XXRA 1DOTA 4ELPA 3FVOA 1IIWA 1QJMA 4QFLA 3G3IA 4ZZEA 2PBWA 5H8NA 4U22A 1ZKBA 3SESA 2CZLA 4KFQA 4OTEA 1OQGA 3MVYA 1DPEA 2VD3A 1SD3A 4C1UA 1SYHA 5K2YA 5I56A 3V89B 1LAXA 5HBCA 3KZGA 3TTNA 4KPTA 2XD3A 5TP9B 1P1NA 3RTFB 4R6KA 4JSOA 1MM6A 3B6QA 4PFYA 4MFIA 2ABHA 3HCQA 3KOTA 5FTIA 4NF4B 3Q28A 1UTBB 4FIMA 4H5GA 4FE8A 3GXAA 2QL3A 3KJ7A 5CM6A 3QXMA 4EQ9A 4GXSB 3ZSFA 1XVYA 2RKMA 4U21A 1VFDA 3WAEA 5DVFA 4NWDA 4LP2B 3PUVE 4F39A 1USYE 3CFZA 4IY5A 4F1VA 4K3FA 5L8DA 4F2OA 1KWHA 4R75A 4U2RA 5FHNA 4X48A 2VP1A 3TTKA 1MY0A 3RPWA 4FATA 4DE8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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