1H44A

R210l n-terminal lobe human lactoferrin
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
RSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFILESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal transport
molecule keywords LACTOFERRIN
publication title "Dilysine Trigger" in Transferrins Probed by Mutagenesis of Lactoferrin: Crystal Structures of the R210G, R210E, and R210L Mutants of Human Lactoferrin
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 99
structure length 322
sequence length 322
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1h44A02
3Q25A 4LQ2A 4TLMB 1B1XA 3QXMA 4PQJA 4DIGA 4C0RA 4IO7A 2Z8EA 3QUFA 3FVKA 1BLFA 3DP6A 2QRYA 1BTJA 3KGCA 3ZSFA 5EHSA 1DSNA 4DZ1A 3H6WA 1NNPA 4XTCQ 2XX8A 4IO6A 3M3LA 1UTHA 3H6VA 3SEYA 1LFIA 4H67A 3I5OA 4ISUA 3H03A 4GLIA 2DVCA 4EXKA 1NH8A 1T0KA 3U1OA 4R9FA 3IL1B 4LUBA 1KWHA 1N0TA 3SETA 3HO7A 1B52A 3KSXA 1LGBC 2Y7KA 3CFXA 3C4MA 3LUYA 3RNNA 3HPIA 1ZIUA 4JWOA 5K2YA 3A3CA 4EQ7A 3TMGA 3TQLA 2ZYOA 1QKAA 3CFLA 3DP8A 1UTBA 3QAXA 3OSQA 3FGSA 4GL8A 4Q5TA 4ZEIA 5KDTB 1B51A 2THIA 3VVDA 1B3GA 2I3WA 3KG2A 1B0HA 2HEUA 4R75A 5L9MA 3L6HA 2RC8A 4P0IA 1MS7A 1H44A 4H5FA 4R6KA 5J1DA 1MXXA 2BJJX 3OOAA 4OESA 1USYH 1ZJLA 3U72A 3WAEA 1N7XA 1A54A 1R6ZA 3QYTA 5HM4B 4PETA 3IO4A 4YZZA 3FV1A 4ZE8A 2H25A 3UA8A 3KN3A 1MDQA 4PP0A 2Z22A 3RLFE 4Q8RA 1BKAA 3U93A 3IOVA 1ZMGA 4M4GA 1JVYA 3FJGA 4BDMA 5H8QB 4GQOA 1SYIA 3IR1A 4F3PA 4MH5A 2R6GE 3Q29A 2R71A 4G68A 4JWXA 3RTFB 3MPKA 2O68A 4H6DA 2DS9A 2F78A 2P2AA 5ITPA 4QSCA 3CVGA 1NMUA 2V3TA 2PX1A 4LA9A 5L9OA 3KEIA 3N94A 3MP8A 4OWDA 4Q30B 3QSLA 4KI0E 4FEBA 1FCKA 4P11A 4HW8A 1XVXA 4OMBA 2XXWA 5DYHA 4YKPA 4ELOA 2FNCA 5I56A 1I6AA 5TPAA 3IOUA 1UIUA 3K1PA 5H8HB 3FV2A 2RCBA 3K0VA 2HZLA 4FORA 2V3QA 3FJMA 4G4PA 3UN6A 1IXCA 4U23A 1B3LA 3GLBA 4QSDA 2QJEA 4R6HA 2OBGA 1Y1ZA 2R9JA 3VVFA 1NNKA 2OJTA 4OZ9A 3W9VA 1FQFA 2XX9A 1TFDA 1VE4A 3HHGA 2F7CA 3PV0E 4KYDA 4LATA 1MXUA 2P0SA 4YU0A 4R9GA 3CRBA 2YJPA 1GGGA 1PBQA 1MQDA 3T9VA 2ZXTA 4R72A 5L9SA 2VOZA 3THIA 4JSDA 3SEUA 1DMBA 5TP9B 1IUDA 4ELQA 5I2KB 2DSFA 4C1TA 1QUKA 4GRKA 4KPTA 2NXOA 3CSBA 3O66A 3SDFA 1LB9A 3A3UA 1MPBA 2CZLA 1AH5A 2XXVA 1QUJA 3JV9A 4AQ4A 2UVIA 4DE8A 2RF1A 4I8CA 2RKMA 3PPPA 1ANFA 3PD9A 4N07A 4EXLA 3TTLA 4Q0CA 4KFQA 2B65A 3PPOA 4QRZA 2G93A 4L17A 2UYEA 4GF8A 4XKPA 4LZ7A 3UK4A 4BLAA 1MM7A 3IB2A 4BDLA 4ZEFA 5I59A 3D4GA 2OCUA 4EQBA 3PU5A 2ONSA 4ZE9A 1MRPA 4K3FA 3S9LC 3B6WA 2RINA 4F18A 4RPOA 1MY4A 1H43A 2QS3A 2O84X 2XXTA 3RGYA 5FTIA 1I6QA 1Q1KA 1SI1A 1USYE 2NWJA 3M3KA 4R73A 4OXVA 1IITA 2X7QA 3TCGA 3Q27A 2ANJA 4FJPA 3EQ1A 2ONKE 4HCYA 2DXYA 3BKIB 3MUQA 4YKJA 4MFIA 4PFWA 1B3EA 3GBAA 2AL5A 3OELA 4RA1A 1UQWA 1MQGA 4MF3A 4X9TA 1VFEA 4I62A 1XS5A 4IY5A 1B46A 1DOTA 4EQ9A 4POWA 2AL4A 3S9NC 3CSGA 2DE4A 3W15C 1TT1A 2I4CA 1LAGE 3GZGA 1BIYA 5JTYB 3KZGA 3G7WA 3SKPA 1M5BA 4YB7A 1FTOA 1BP5A 2QMXA 3KN7A 1WODA 5F1QA 2PMSA 4QFPA 3G3IA 1B6HA 1MH3A 2H9BA 4XXUA 2HCAA 2GRVA 3MAMA 3PMWA 3ZKKA 1JEVA 3TTKA 1PDAA 2ZYNA 4G68C 3GXAA 2PT1A 3USDA 1URSA 2PT2A 1I69A 4YKIA 2F35A 3PPRA 4TLLB 4H0WA 4EUOA 5JK4A 5KDTA 2I3VA 3FVNA 3T96B 4G8HA 2XXPA 4OERA 1P1QA 4NF4B 2H5YA 4F2QA 2DE2A 3E9XA 4F22A 2XXUA 4QSEA 5TU0A 1D3KA 3I3VA 3T66A 3PUWE 4BDQA 1FTMA 1DTGA 4GIZA 5CMMA 4F1VA 2DWJA 3LSWA 1MXZA 4MLVA 1SYHA 4PFTA 2Y7PA 5HBCA 1Y3PA 2M8CA 5H8QA 1MQIA 3MVZA 1LBCA 5HPQA 4H8JA 5F7VA 2O7IA 4KYSA 4YAHX 2DWHA 4IGTA 2GFEA 5AA4B 4OFLA 1B3HA 2Z23A 1MDP1 1GV8A 2DQVA 1OQHA 3IOTA 1B32A 4KCDA 1Y1MA 3P7IA 3R6UA 3MP6A 3O2AA 1B9JA 4QFLA 1XT8A 4IO5A 5H8HA 3H6UA 5B7DA 5EYFA 2O1MA 1Y9UA 1EZOA 5DVIA 1L5TA 3TYHA 1ATGA 2UVJA 5H8FB 4NF5B 4TOZA 5AA3A 1Y20A 3O29A 4O3AA 3RUMA 2ESNA 1Y3QA 3FD3A 4HTGA 4KR5A 4R74A 2DYXA 4X48A 4OEUA 4ECFA 3HCQA 4YICA 1OVTA 4GXSB 4RK9A 3TCFA 2Q2AA 4OQOA 4OENA 4ZDMA 1LFHA 4N13A 2YPNA 5CMBA 1A8EA 4THIA 3PUVE 4MBPA 3ECRA 5AA2B 2DE3A 1B0LA 2ZMBA 2VD3A 1MY1A 3BFUA 2O69A 5TP9A 3BBRA 5I2KA 1JW5A 4M1VA 3FUZA 4WEDA 1Y4CA 2HAUA 1M5FA 3OO7A 3G3JA 2G29A 1B7ZA 4TQUQ 2F34A 1JQFA 5DT6A 4F3GA 1B5IA 3VLVA 1H76A 1XHYA 3EF7A 3DP4A 3M3FA 3CI8A 4F31B 3E4RA 4ELPA 1FQEA 1PEBA 3OEKA 3DLNA 3G3GA 2HFBA 4NF8B 3RPWA 4QFNA 1QUIA 2F6PA 5FHNA 1M5DA 1A55A 3OO6A 3IB1A 5ELVA 2ALUA 3N26A 3TKDA 3VVEA 1SW2A 3V89B 2H99A 1P1OA 4LONB 1SW5A 4C1UA 1DPPA 4G8MA 3K01A 1SD3A 2QPQA 3VXCA 3MPLA 1PBPA 3C9HA 1HSEA 1LLSA 2REGA 1IIWA 4G8NA 3LSLA 2FA7A 5K2XA 1SDXA 3K02A 3MP1A 3TPAA 4RY1A 4QHQA 3C31A 4RYAA 4WEPA 1FTLA 1HSJA 1NNFA 1N84A 1VSOA 2OZZA 4DXBA 2X7PA 5DVFA 2QL3A 4UA8A 2HAVA 3TEPA 4H8IA 4PFUA 3U8QA 2Y7IA 1TXFA 5JTYA 3PUXE 3MBPA 2O51A 2DXRA 2DOJA 4GOTA 4I9DA 2IEEA 1S50A 1MY3A 3C36A 4UACA 1N3XA 2OWTA 3K1NA 3BFTA 4ZS9A 3V83A 3VV5A 4DCXA 1AIVA 2OWSA 3B7DA 2I48A 1LBBA 3SEWA 3S9EA 2X26A 2VD2A 3HN0A 3KSJA 1JETA 3TCHA 2Q9TA 1LFGA 3K1MA 5CC2A 3C35A 1POY1 3AXFA 1A8FA 3O6GA 3K6WA 4RJZA 2GHBA 2V84A 2FYIA 1A40A 4KCCA 3FIRA 3K4UA 1P1UA 2ZYMA 4AB6A 3EPEA 2UVGA 3T9HB 4NF4A 3JZJA 3HHFA 3G3KA 3O28A 2UVHA 1D4NA 1P1NA 2V3UA 1MG1A 4KD5A 2I49A 5BWJA 5H8NB 4JSOA 4OVJA 1N7WA 3TTNA 4GWOA 3I6VA 3VLWA 2F36A 3KOSA 5LOMA 3CG3A 3CIJA 1WDNA 4OEVA 4PE5B 5AA2D 4EF1A 3M8UA 4JB7A 5DEXB 4F1UA 2OLBA 5AA4A 1SW1A 3TUSA 3SERA 3D4CA 4KHZE 3U92A 5EHMA 4U21A 1QULA 2NOOA 5H8SA 1R1NA 2HZKA 4WKMA 1MXVA 2I6EA 4RNSA 4G77A 4QF9A 4U4XA 1EZPA 3VFJA 1JNFA 4JDFA 4RK2A 1AOVA 3MW0A 4P0GA 5CM6A 3C34A 1YTVA 3V5AA 2F97A 3OMBA 1XOCA 4O3CA 1OVBA 4HCWA 5H8FA 4LQ5A 2VGQA 4NF5A 4BDRA 1SW4A 4JXIA 4NEDA 4NWDA 1YCJA 4R2FA 2ZNSA 4DXUA 3O97A 1JEUA 3UIFA 2ONRA 1VR5A 2PYYA 4IB2A 5CRYA 3ONMA 2V93A 3H06B 3RT6B 3QK6A 4O3BA 5I2NB 4IO3A 4XIGQ 2XXYA 3EHTA 1TFAA 1FQCA 3LSFB 2V25A 3PPNA 5AA2A 4IO4A 4U4SA 3T9XB 1B05A 2VP1A 4ESXA 1TWYA 3HV1A 2O7UA 1A7LA 1NNTA 2QS1A 1S9TA 4RPNA 1NKXA 2Q8JA 1ZBMA 1B4HA 4GVOA 1SI0A 3VDFA 1ELJA 5BUUA 3OEMA 3RQTA 3VE1B 2A5SA 3OO9A 1SQYA 2KLFA 1B58A 4R2BA 2DP8A 1IXIA 2IA4A 2XXXA 4NF8A 3KBRA 3OXNA 1FW0A 1B7HA 2XHDA 1POTA 1Q35A 1DPEA 1MPCA 1H45A 3MZBA 4OFJA 1Y3NA 4QFOA 4F19A 4F3SA 2E1SA 1OMPA 1OLAA 4DDDA 5DTBA 1LAHE 3C33A 3MVXA 3OO8A 4E0XA 3OSRA 5KCJB 4BDOA 3KJTA 2QS2A 4X1DA 4U2RA 3PMVA 4MLQA 4F29A 1ZKBA 1JW4A 4XKQA 1XVYA 5ISUA 3FXUA 1O7TA 3H3GA 3H4ZA 4OETA 1II5A 2ZNTA 3E3KA 1ZTYA 2RC9A 4BDNA 5CMKA 1B2HA 2P1SA 4DCYA 4ZECA 2CMOA 1J1NA 4NF6B 4Z7EA 4IO2A 3B6TA 2RC7A 1FQDA 1FTKA 5JEIA 4EF2A 3N6UA 3MQ9A 4KYEA 3ILTB 5A5XB 1PB9A 2H98A 1MQHA 4H1XA 4F3BA 2E0SA 4NE4A 3FJ7A 5I57B 2A5TB 3UP9A 4H5GA 1M5CA 3FZVA 2XD2A 1YAEA 3IOWA 1N3WA 3IO6A 5FTHA 1EZ9A 1QVSA 4F39A 1GVCA 5DVJA 4HS7A 4ZEDA 3MZ9A 5CBSA 5FHOA 3DM0A 2HQ0A 1MPDA 1FTJA 3MC2A 1O63A 3QUJA 1FQBA 3S4UA 1GTKA 1M5EA 3PUYE 1VFDA 3F11A 4Z0IA 4KQPA 3TZAA 4GXAA 2Y84A 3H7MA 1R9LA 2Q88A 3CR9A 2Y7WA 2W7YA 5KZTA 3KJ7A 2DWIA 2WKYA 3LR1A 2D21A 2GH9A 1B4ZA 5IAIA 2AIXA 3LC8A 3IJOB 3VLUA 1GR2A 1IXGA 5H8NA 3UGWA 3JYRA 3EHUA 1NFTA 3IB0A 1AMFA 3MVWA 3IORA 2O6AA 3EHSA 3TTMA 4XKNA 2RCAA 3VXBA 1AL3A 5I58B 1WVJA 1Z7NE 1ZLQA 1A99A 4OTEA 4U1ZA 3WAFA 4WXJA 3IAZA 1MM6A 3S9MC 3KN8A 1B3FA 5DEXA 5B70A 1RYXA 4LZ8A 4IGRA 1OIBA 4ZZAA 4ESWA 3H6TA 4DLDA 1S7YA 1LAFE 1B7UA 3R26A 2UYFA 3FVGA 4R6YA 1D9VA 4U1OA 3K6XA 4GFRA 1MY0A 1LCTA 1RKMA 4QFKA 2XXIA 1OQGA 3Q26A 1D9YA 2B3FA 4E0WA 3O6IA 1B1HA 1LCFA 1PC3A 2VHAA 3FVOA 3IX1A 2XX7A 5AE4A 2B3BA 4FATA 4OHNA 1MY2A 5I2NA 3PUZE 2H4IA 5M2VA 1LAXA 4POXA 1UIVA 1N04A 2ZNUA 3RY3A 1P99A 2GHAA 2AYSA 4ND9A 1QKBA 4DXCA 4IY6A 2PVUA 1UTHB 2ABHA 2HXWA 4F1YA 3MJNA 3U94A 1JW1A 2Q89A 1EH3A 2QMWA 3T22A 2Z8DA 1RYOA 3R7XA 3N5LA 4JBZA 1MH4A 2F5XA 4JWYA 3TDJA 5L8DA 3O9PA 4N6PA 5IKBA 5CMCA 1URGA 1IEJA 1SVXB 1F9BA 1UTBB 3GBBA 4ZEKA 3UORA 3OENA 4FE8A 1N76A 1PB8A 1B5JA 3W9WA 1MQJA 4ZZEA 4LZ5A 3K6UA 4X1BA 5KCJA 1O64A 4NMYA 2NUVA 2QSXA 3N6TA 3TTRA 4NTLA 3ILUB 1ZU0A 3C32A 1MXWA 3A09A 1EU8A 3TQWA 2LAOA 4ELRA 2PBWA 1Z7ME 1OLCA 2I0CA 3PD8A 4G68B 2I0BA 4XKRA 1LSTA 2XXHA 4NF6A 3L6GA 2YLNA 1QJMA 2DWAA 4FEDA 4YB5A 4OYVA 4I1DA 1NL5A 5A5XA 3RN8A 2XXQA 1US4A 3Q28A 4FAJA 3FXQA 3ODBA 4YB6A 5I56B 5TPAB 2NVUB 5I57A 2A5TA 3PGFA 4U22A 5AA1A 5I84A 3SESA 1US5A 3TELA 5ICQA 3EN3A 3SEXA 2ZYKA 3ZS6A 3MVYA 5FHMA 4GD5A 1B40A 2F6GA 2UXAA 3MWBA 1PB7A 4RXLA 3HSTA 3IK6B 3K2DA 4LP2B 2F8DA 4GL0A 3B6QA 4YKKA 3RT8A 3DELB 3E13X 4G2ZA 3O6HA 3IJXB 1XC1A 4ONYA 1JVXA 3G3FA 3PMXA 3OD7A 1B5HA 3T93B 1NH7A 3TFLA 3T9UA 2O1LA 4AB5A 1DTZA 4PFYA 4EDPA 2D3IA 2XXRA 2I4BA 3V8XB 1MXYA 3K6VA 2OK2A 2F7BA 1Y4TA 3QIMA 4YMAA 3CG1A 5ITOA 2DVZA 4ZEBA 3KOTA 1HSLA 1CE2A 3KFMA 3LSXA 5CBRA 5I58A 4H65A 4OFOA 1IXHA 3RTWB 2QS4A 2I58A 3FATA 3K00A 3TODA 1YPNA 3CFZA 3MZ1A 4LVQA 3FASA 3PPQA 1I6BA 1FQAA 5I59B 1SBPA 1IZ1A 2Y7RA 1R9QA 2REJA 5ICTA 2D5WA 3SEVA 2XD3A 1CB6A 4FECA 1URDA 3TAJA 3S2VA 1P1WA 4F2OA 5CI5A 3FXRA 2Z8FA 4YMBA 3ZKLA 4NWCA 3LBSA 2Q2CA 3G3HA 4FIMA 1IQ7A 1H3DA 1LB8A 1QW0A 2F7AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q25A 4LQ2A 4TLMB 4PCDA 1B1XA 3QXMA 4PQJA 4DIGA 5ET8A 4JVDA 4OVPA 4C0RA 4IO7A 2Z8EA 3QUFA 2CZKA 3FVKA 1BLFA 3DP6A 2QRYA 1BTJA 3KGCA 3ZSFA 2ZZWA 5EHSA 1DSNA 4DZ1A 3H6WA 4PTKA 1NNPA 4XTCQ 2XX8A 4IO6A 3M3LA 1UTHA 1KZ8A 3H6VA 3SEYA 1LFIA 4H67A 3I5OA 5IM2A 4ISUA 3H03A 4N8GA 4GLIA 4XFEA 2DVCA 4PFBA 4EXKA 1NH8A 1T0KA 3U1OA 4R9FA 3IL1B 4LUBA 1KWHA 1N0TA 3SETA 3HO7A 1B52A 3KSXA 1LGBC 2Y7KA 3CFXA 3C4MA 3LUYA 3RNNA 3HPIA 1ZIUA 4PGNA 4JWOA 5K2YA 3A3CA 4EQ7A 3TMGA 3TQLA 2ZYOA 4KXPA 1QKAA 3CFLA 3DP8A 1UTBA 3QAXA 3OSQA 3FGSA 4O94A 4GL8A 4Q5TA 1IMCA 2KQZA 4ZEIA 5KDTB 1B51A 2THIA 2Y5KA 1B3GA 3VVDA 2I3WA 3KG2A 1B0HA 2HEUA 4NQ8A 4R75A 5L9MA 1NV7A 1FPDA 3L6HA 1RDXA 2RC8A 4P0IA 1MS7A 1H44A 4H5FA 4R6KA 5J1DA 1MXXA 2BJJX 3OOAA 4OESA 1USYH 1ZJLA 3U72A 3WAEA 1N7XA 1A54A 1R6ZA 3QYTA 5HM4B 4PETA 3IO4A 4YZZA 3FV1A 2P3NA 1NUYA 4ZE8A 1SPIA 2H25A 3UA8A 3KN3A 1MDQA 4PP0A 2Z22A 3RLFE 4PE3A 4Q8RA 1BKAA 3U93A 3IOVA 1ZMGA 4M4GA 1JVYA 3FJGA 4HE1A 4BDMA 5H8QB 4GQOA 1SYIA 3IR1A 4F3PA 4MH5A 4QBAA 2R6GE 3Q29A 2R71A 4G68A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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