1H4OA

Monoclinic form of human peroxiredoxin 5
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
b'APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Human Peroxiredoxin 5, a Novel Type of Mammalian Peroxiredoxin at 1.5 A Resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 49
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2001-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1h4oA00
3TJGA 2EIRA 4TVEA 3HVXA 2FLSA 4ML1A 1K0NA 1SL0B 2N5FA 1ERUA 3TKSC 4XRAA 3GTUB 1TI1A 5AISA 2MMAA 1RQMA 2JSYA 5IMVA 2H66A 5EL8A 1SJIA 4ULXA 2XBQA 4WBJA 1RW1A 4MJCA 4WXTA 4TR4A 1TK8B 2VL9A 3ZMLA 2Z9SA 2QKEA 1TI3A 5ECPB 1WRYA 1SK0A 4KDUA 1WE0A 1BYEA 1OC9A 1W4VA 1JZWA 2WULA 2YWNA 4P3YB 1F3AA 4OWYA 2HXKA 2YNXA 4GSSA 2PBJA 3TDGA 4ZBDA 1XIYA 5CRWA 4ECJA 2JL4A 3FZ4A 3C1SA 2GSRA 5ENUA 5J9BA 1OC9B 3GH9A 1GSQA 3D6IA 2ON5A 2X8GA 4G19A 3D22A 5KN0A 2YWIA 5ECIB 3A2VA 2YJHA 5ID2A 1XBSA 5CO3A 2LJKA 2H0HA 3EU3A 3S9FA 1GNEA 4TXOA 1AW9A 1U6TA 3P7XA 4PGTA 3ZL5A 4MZWA 1PKWA 1XWKA 4IJ3A 5J9CA 3UVHA 3F6FA 4TOPA 2FNOA 3GA4A 3BOAA 1B48A 5IMZA 5ID2B 1K0DA 4WEYA 2RLIA 5H5RA 1ZOFA 2H70A 3QMXA 5B8AA 2LRCA 1GUKA 4KA0A 2FWFA 4HOJA 3CSJA 4LL1B 2H6XA 3FYGA 4PURA 1LJRA 2MBSA 2YWOA 5DJMA 2ES7A 4K7OA 4IQ1A 2LSTA 3EU4A 3ED3A 1TXXA 3FW2A 4MCUA 5G1LA 2HT9A 1GLQA 2VIMA 1ILOA 3KP8A 4Q5RA 2YV7A 3GSTA 3QAVA 1FG4A 1AUCA 3JCML 1NSWA 5IPGA 2AJQB 2G2QA 1EV4A 2KLXA 5KEJA 4MH3A 1V57A 2BTOT 1Z3EA 1O8XA 2DMLA 4BL7A 2L5OA 1ZL9A 1A8LA 1XWAA 1ON4A 3ZVJD 3EURA 1M7TA 3QFAC 1Y6EA 11GSA 4BWSA 2A4VA 2VL3A 4V2NA 3US3A 1OC8A 5IQYA 5DAKB 5DCHA 1TU7A 4GTUA 3LYPA 2C0FA 1YKCA 3A2WA 2AUVA 3DMLA 3VLNA 4EE0A 1M9AA 3VFIA 2B5XA 3IK9A 6GSUA 5JCUA 1T00A 3ERFA 4MF5A 2N5BA 2X64A 3KJYA 5GSTA 4K1FA 2NDOA 2OA7A 4J56E 2GT6A 3TGZA 2FWEA 1SKSB 4KH7A 2GZPA 1N2AA 4ECCA 2DJJA 1EWXA 2NPBA 2XC2A 2B1KA 3R2QA 4XTSA 2WGRA 4L8EA 2PGTA 1GUMA 3ZVJA 2HSHA 4XCSA 4PNFA 3ME7A 4RQXA 4BPYA 2R4VA 2LS5A 4EKZA 1PL1A 4ZXGA 2YOIA 3FEUA 4KX4A 3PINA 2LQOA 2YCDA 1EOGA 1XVWA 2AV4A 4IP1A 1IYIA 2H6ZA 3KMOA 3WGXA 5LCZA 2GSQA 1UVZA 1GSDA 4FYUA 5C00A 3TKSA 18GSA 2K6VA 4JE1A 2LNSA 1VF2A 4G2EA 3RBTA 1PQNA 2FGXA 2H1BA 3BCIA 2O85A 4KB3A 5ABRA 3N5OA 4JU5A 4NPBA 20GSA 2LV3A 1H75A 5HR0A 4ZB9A 3QFBC 4DSSA 1N8JA 3IOSA 4EUYA 1BQ7A 3I9V2 1EEMA 2XPDA 4O92A 2LRNA 4OFTA 4DSQA 1ZCPA 2OADA 2G0FA 2FHEA 2MZCA 2VUPA 1JHBA 4DSSB 2YPMA 2V6OA 1A0FA 5ECOB 3HY2A 16GSA 5H5SA 1NHYA 2JACA 5JCGA 4ZB6A 3HHVA 1GSFA 1NW2A 1SD9A 5GAPD 4MPGA 5DBQA 4HQSA 4IQAA 3APSA 4FH8A 2IN3A 1X9MB 4NAXA 1XW9A 4JR4A 3KTBA 3FKFA 1MEKA 1YEXA 6GSYA 2FCHA 4IP6A 3ZZXA 3DD3A 5AIVA 3G9BA 3KCMA 2FA4A 3KZQA 2VLTA 4J57E 5IMCA 2JZSA 4HS1A 3GKMA 5JWRB 1O73A 5DJLA 2K9FA 5FWGA 3IAM2 1SD8A 5A5KA 4NXIA 2J9HA 8GSSA 2IMEA 5L71A 3HJOA 1Z6NA 3VWUA 3I43A 1GTAA 10GSA 2F3MA 1FB6A 1YDKA 4KUNA 1R4WA 1GH2A 5D9XA 5F06A 1MDIA 5HR2A 3ZREA 3APOA 2R37A 1S3DA 1PD21 1I5GA 1OE7A 2FY6A 3LWAA 1SK1A 1KNGA 1FVKA 1M2BA 4TR0A 2BJXA 2E7PA 2PVOC 2R3XA 1VGLA 3NOFA 2QSIA 1O85A 2H71A 1U87A 1GNWA 4HJMA 2OE3A 1VF4A 5LNKe 2P31A 1SK2A 3CBUA 4H86A 1THXA 4TW5A 3UVTA 1XPVA 2OACA 4RQRA 2ZCTA 5HFGA 3A2XA 4K2DA 3HVVA 2DIZA 3PR8A 4KDXA 3GH6A 5ECRB 3DKSA 2IMKA 2V32A 4XHMA 3ZLPA 2R2JA 2C80A 5AIXA 2HRNA 1ZGNA 3FZ5A 2H0GA 2J23A 4OMVA 2CVKA 2NTOA 5HFIA 1TOFA 1FB0A 3WYWA 3M3MA 3GKNA 1F9MA 3BBYA 3QCPA 4JR6A 3KMNA 3F3RA 1B4PA 1X5CA 3GV1A 3H93A 3EMXA 3I6AA 3W8SA 4QL7A 3GFKA 2F51A 1AC1A 4EL1A 1AQXA 5J4UA 2CZ3A 3HA9A 3QD9A 3GX8A 4POKA 5CNWA 1Z5YE 2FWGA 1NHOA 4MZCA 4I2TA 3MDKA 2L6CA 2JU5A 1O8WA 2X8CA 3WGDA 4HU9A 5GSSA 4V2LA 1UA5A 3DRNA 3APQA 2OE1A 4HDEA 3L9VA 2GS3A 4KGIA 1G7OA 5C04A 1EGOA 1TRVA 3LGCA 1DE1A 2X8HA 3TRXA 1YKAA 2PWJA 2B3SA 2H1GA 5D96A 1YEPA 2GT5A 1JLWA 2I1UA 3IC4A 2I81A 3HDCA 2R6KA 1J9BA 1EV9A 4XRDA 2CQ9A 2AHEA 2YZUA 4PQHA 3C1RA 4BWQA 3E9JB 2HZEA 2L5LA 1GLPA 1QQ2A 3L9UA 2H75A 1XWGA 2KHPA 3UL3A 2FUG2 3TUEA 1UN2A 2L4CA 3EYTA 3FHKA 2LJAA 2IWTA 5B8BA 2ON7A 2FA8A 2GTUA 1V2AA 4LA1A 3N9JA 1QGVA 3ZYWA 1TK5B 3AY8A 2HZEB 5B6MA 3EC3A 4IGJA 6GSSA 3VWWA 4F0BA 2IL3A 3GYKA 4MH2A 3VPQA 4ZBBA 4MZBA 1ABAA 4G9HA 4TXOB 3CRTA 5COHA 5ECQB 3TCOA 2H30A 1K3YA 4N30A 4G10A 1S3AA 1V58A 1TW9A 4KDYA 4YQUA 2LRTA 1GTIA 2LTKA 3UMAA 5IPHA 2C3QA 2JZRA 4MF7A 3F4RA 1A24A 2GLRA 3P8WA 1WP0A 3UBLA 5B6NA 4ZIJA 2M80A 4FIWA 1ZYQB 2I3YA 3F63A 3KH9A 4TR1A 1O81A 3O3TA 3LJRA 3F4TA 3CYNA 4KE3A 3J7Yk 4K7NA 4MF6A 1A8YA 2DC5A 2CV4A 3DGQA 4PUAA 2VL2C 3TRPA 2HE3A 3D21A 1G6WA 1Q4JA 2CX3A 1WOUA 5IO2A 4ML6A 4TR1B 5F07A 3DEXA 3SBCA 2A2RA 4XS6A 3F4SA 1QFNA 2VCWA 3CTFA 5ECMB 3BJ5A 2O8VB 1TDIA 2RM5A 4AGSA 4EO3A 3GNJA 4ACSA 2YN1A 5J5NA 1SYRA 2P0GA 1WIKA 3EWLA 3M8NA 1K0CA 3QPMA 1YY7A 1PRXA 1AIUA 3P90A 3IXRA 5GAND 3RPNA 1R5PA 3A3TA 1T7PB 2HFDA 4YAPA 4JZQA 3L9SA 1USBA 2WZ9A 2XBIA 3G7YA 2C1YA 1B8XA 1M2AA 3E0UA 2HLSA 2LNTA 5CRDA 3ZIVA 1ZYEA 2NVLA 1VF1A 4N0VA 3VWVA 3VURA 3M1GA 3J7Yb 1Z7PA 3CTGA 4JEDA 4AJ8A 4WF5A 2E2GA 3O6TA 1B4QA 1OYJA 3IR4A 4L5OA 1KTEA 4LL4B 2M46A 3DYRA 3Q6OA 2OBKA 3RPPA 4LMWA 4XIHA 3LXTA 3IDVA 3VI7A 4FYBA 1XVQA 1URMA 2IMFA 2IMDA 3HVSA 2H73A 1YJ6A 2WCIA 2OBIA 5CREA 1K0MA 3KH7A 2IFQA 3F8UA 4AJ7A 2MMZA 1EZKA 3ZIJA 1EP7A 3A5WA 4MPFA 3IK7A 2GQKA 3ERWA 3MWHA 1TTZA 1GSUA 5CYYA 3WT2A 4DVCA 4KCAA 4FO5A 4F82A 4IS0A 1VF3A 2WS2A 4OO4A 3UBKA 2H6YA 1TK0B 4X43A 1ML6A 3KTLA 2L57A 1JZRA 2H0IA 1EEJA 5INYA 4RUVA 2IPAA 3L0HA 3HXSA 2HYXA 3QAWA 2VLVA 5CRHA 3GKKA 3W6GA 3QOUA 1M9BA 1E2YA 4MJBA 4KSOA 3FY7A 1HNCA 4YAVA 3LG6A 2F9SA 5HR1A 5CRGA 4ILFA 2GSTA 2HNLA 1X9SB 1XXUA 4TKYA 3HD5A 5ECNB 4I5QA 1J08A 1SJ6A 4BVYA 5J41A 14GSA 1T4YA 2V2GA 3DXBA 5ECLB 1YZXA 1YQ1A 1MD4A 1GULA 4DSRA 4YQVA 2DSAA 2X99A 3KEBA 1PKZA 4POMA 1GL8A 5DALA 1SJZA 5JWQB 2K8VA 1SL2B 1AXDA 1EP8A 3QR6A 5ELAA 5KN3A 3OR5A 2BMXA 1I9DA 4MMMA 4F03A 1YF0A 3ISOA 3CXGA 5DQSA 2JSZA 3HKRA 1X9WB 3TJKA 5HFKA 1TKDB 2N5AA 4KNDA 5DALB 5CP1A 2F8FA 1DUGA 1K0OA 5CAXA 3C73A 4D73A 5F05A 1HQOA 2DLXA 4WETA 5J3RA 1WPIA 4YQMA 2YP6A 1JZDA 4ZB8A 3HYPA 4HUAA 4OFNA 4RI6A 3F6DA 1MD3A 5AN1A 2VM2A 5B7CA 1PMTA 1EOHA 1XCCA 4PNGA 1ERWA 3Q19A 1AQVA 3LEFA 5G30A 1MDJA 3GSSA 1A23A 1Z7RA 3CSHA 4WKWA 3QDNA 3LSZA 3QAGA 5IMDA 1JFUA 3NIVA 3KP9A 1FHEA 1LBKA 3PGTA 1AAZA 2PPTA 2VL2A 1B9XC 3HCZA 2DJ3A 4HI7A 1T4ZA 4OD7A 3KM6A 4ID0A 3Q74A 1GWCA 4E8EA 2AB6A 2O87A 5ELGA 4TRXA 5JWOB 2PN8A 1TRSA 2LJRA 2TIRA 4EXJA 5ECSA 1GTBA 4NHZA 3RDWA 4DEJA 4MLYA 2PERA 3FR3A 1PN9A 4ZL7A 1M2DA 1VRSD 3ZFBA 2RIIA 1BX9A 2YANA 2VLUA 5DCGA 3O76A 1OC3A 2GZYA 4ECBA 2VO4A 1Q98A 2PVQA 1O6JA 2VCXA 4GCIA 2HZFA 1ERVA 4XS1A 2IMIA 1T3BA 1K3OA 7GSSA 4PQIA 1WWJA 3F3QA 3LORA 3TKSE 2V41A 4IHUA 5F0GA 1FO5A 1X0RA 4ZILA 4HEA2 1QUWA 2AAWA 4CW9A 2C0DA 1W89A 4O32A 4EVMA 4GWRA 3LFLA 3WD6A 1ST9A 13GSA 4OO5A 4ISDA 1Z9HA 3GURA 1OKTA 1G0TA 4MP4A 1XWCA 1ZMAA 2CAQA 3L78A 3IHQA 3IA1A 3EINA 3IV4A 5DVBA 1BEDA 1SU9A 3V1WA 2VD1A 1TRUA 2VAFA 5H5QA 1PX6A 4F0CA 2C8UA 3C8EA 4EDZA 3EVIA 1UC7A 2DJ1A 12GSA 4AJ6A 2LKUA 4POLA 4GSTA 17GSA 1U3IA 1PL2A 1GSEA 2VCZA 3FRCA 5G5EA 3LQ7A 3TJFA 2WRTA 1PA3A 1V40A 2I4AA 4X0XA 3LYKA 3UIWA 3BD2A 3TKQA 1TJDA 4EDYA 1WMJA 2WDUA 19GSA 3TKPA 2L4QA 3VPTA 1G7EA 3RHBA 2O89A 4LLRA 3VI5A 3D4TA 2E0QA 2WJUA 4GXZA 4HZ2A 5D9WA 1A2LA 3H79A 2CT6A 1R5AA 2C0EA 1OE8A 4ZL8A 5IOWA 5KN2A 1MDKA 3GMFA 3M9JA 2GQMA 5AGYA 3ME8A 4L0WA 2KP2A 3UEMA 2RUFA 4AF2A 2K8SA 5A4WA 5D93A 5D9VA 1C72A 2CVBA 1T1VA 1GSYA 3FK8A 3IE3A 1U3AA 4NWYA 2QGVA 2IJYA 1SL1B 2EIOA 2M72A 1THOA 4MJEA 4HZ4A 1XOBA 1B9YC 4HU7A 2PU9C 2VD0A 1M0UA 1J0FA 3TJJA 2NBSA 4GQFA 2H72A 2CAIA 3D0ZA 2H19A 3HJMA 5FHIA 4V1Ap 5KN1A 2V6KA 5G5FA 2TRXA 1V9WA 4K0NA 2LQQA 3ZFLA 3ZITA 3UJ1A 1OKDA 2B5EA 2H01A 2YZHA 3U5RE 3L4NA 4L0UA 1R7HA 5IOXA 1XWBA 4L5LA 3DWVA 2WFCA 1SKRB 3EMPA 4V1Ag 1WJKA 9GSSA 2CX4A 3KD0A 4X1UA 1A2JA 3VK9A 2CVDA 3W8JA 1BG5A 4HJ2A 4GQCA 3E3EA 4IELA 4I97A 5DAKA 1GP1A 1BAYA 3M0FA 1CQGA 1E6BA 4Q5NA 1PX7A 4PX1A 2C3NA 3PH9A 2O7KA 1ERTA 1O7UA 1QXHA 1NM3A 2LEGA 3ZTLA 3KXOA 4O7HA 2QC7A 4MK3A 4MA9A 2HSYA 2DJ0A 2H76A 1XFLA 4J2FA 1X5EA 2CA8A 6GSTA 3GN3A 2KP1A 1XOAA 2K18A 4IVFA 2YV9A 3K8NA 3RAZA 3TRQA 5JCWA 1AQWA 1LU4A 1R26A 1ZZYA 4O5RA 2XPEA 2H74A 1MTCA 22GSA 4BA7A 2GGTA 3NZNA 4IN0A 1HNBA 1PGTA 4NMUA 5A4VA 4F9ZA 4KSMA 2P5RA 4KW6A 3DVWA 5FT3A 2FD3A 3IPZA 5IM9A 3IAS2 4I8BA 4WR4A 1Y25A 2OKAA 3VWXA 5IMAA 2H8LA 5G2ZA 1FW1A 2IFQB 4GRFA 1HYUA 1SYXA 2TRCP 4QL9A 3U6VA 3FZ9A 3TKRA 2REMA 4N0ZA 5D8IA 4LMVA 1FVJA 5IO0A 1KBNA 2C0GA 3I69A 1GSSA 5HQPA 1FOVA 1XW5A 5EY6A 3ZMKA 2OE0A 3TOTA 1DBYA 1A2MA 1XZOA 2HRFA 2MMNA 5GZZB 4NV5A 2RM6A 1T8EB 4QQ7A 4JRRA 4BVXA 5G1KA 2WB9A 3HZ8A 3F0IA 5DQYA 3WT1A 2L6DA 1CQHA 2OJLA 2ZNMA 4OCFA 3GRXA 3UARA 5HR3A 2VCVA 1SKWB 5EPFA 1V98A 5IIZA 2DIYA 1DE2A 4RI7A 4K0GA 2CZ2A 2B7KA 4MDCA 5DDLA 5IMFA 3GL5A 1OVNA 4IBPA 1RK4A 1JLVA 4Z7XA 3WGEA 4FYCA 4E8HA 2GDRA 3BCKA 4K7IA 3FZAA 3CSIA 3CMIA 1QMVA 4TXVA 1K0BA 2C3TA 4NV2A 1BJXA 2IIYA 3LXZA 2H1AA 6GSWA 4IW9A 2ALBA 2B6MA 4OFMA 4TR3A 4WF4A 2C4JA 5G31A 3ZRDA 2FWHA 1HNAA 6GSVA 3HJPA 1ACVA 2B5YA 2YJ7A 4ZBAA 2EC4A 4I2UA 2B7JA 2I9HA 3G7JA 1GUHA 3GX0A 3P2AA 4PUFC 1XW6A 2VM1A 3SWLA 4EF0A 3Q18A 2DJ2A 5D73A 2AYTA 4KCEA 4D73B 2MBTA 4IJIA 2F8AA 5ECKB 2VCTA 4GSNA 4Q5FA 5D9TA 2DJKA 1F2EA 2VCQA 1SENA 1F6MC 4V2MA 3C71A 4MJAA 3UOMA 3KIJA 1KEBA 2JZTA 2A2SA 1EGRA 2L59A 2XHFA 2B1LA 4N11A 1F37A 4K9ZA 4OCEA 5LD0A 3MNGA 6GSXA 1HD2A 4HQZA 1H4OA 4Q5QA 4PXOA 2H1DA 1TP9A 1PSQA 2KUCA 3RHCA 2VOCA 3GUSA 4ECIA 3D5JA 1K0AA 2PUKC 3IBHA 3FR6A 2KOKA 2E2MA 2HI7A 4IKHA 4N10A 4TN8A 4YH2A 4K6XA 1S3CA 1GTUA 2LUSA 4K8MA 3HZ4A 5E4WA 5A4UA 1FAAA 3H4KA 3TOUA 3ERGA 2R5GA 3H1NA 4GLTA 1A0RP 3GIXA 3UAPA 2P5QA 2V1MA 3M9KA 2GVPA 3F9UA 4GF0A 4I6XA 3MAKA 5ECHB 4CHSA 3C7MA 1OAZA 2ZUPA 5E59A 1IYHA 2DMMA 3IRAA 1QK8A 4POBA 1TRWA 2MYGA 1YF1A 1JZOA 3GHAA 3GKXA 2JADA 4PQ1A 3MSZA 4NHWA 2MMOA 1Z6MA 3EE2A 4KAEA 3GL3A 3KGKA 1M99A 4WR5A 4XS4A 3DVXA 3TJBA 4EC0A 1GRXA 2PMTA 3FR9A 4JBBA 4ZL9A 2EIQA 3DIEA 2GZZA 3TB2A 2YWMA 3G7IA 3H8QA 2D2ZA 2GSSA 3CRUA 1TU8A 1X5DA 2GQLA 1U88A 3GTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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