1H4OA

Monoclinic form of human peroxiredoxin 5
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of Human Peroxiredoxin 5, a Novel Type of Mammalian Peroxiredoxin at 1.5 A Resolution
pubmed doi rcsb
molecule keywords PEROXIREDOXIN 5
total genus 49
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2001-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1h4oA00
2I81A 4MF7A 1M9BA 3CMIA 3CTFA 3EWLA 2XBIA 4EE0A 1M9AA 4MF6A 4V2MA 3Q19A 5ECPB 1KTEA 5G30A 2RUEA 2OADA 4XS6A 1S3AA 4I97A 1YEPA 1RW1A 4JE1A 3KZQA 1QK8A 2VCTA 2LSTA 3PGTA 1UVZA 3L9VA 2CAQA 3DIEA 4FYUA 1V9WA 1AAZA 1EWXA 1U87A 1G6WA 2HZFA 1XFLA 4L8EA 4NV5A 2PMTA 4JU5A 1ACVA 1X9WB 4OD7A 2JSZA 2PBJA 4N10A 5EY6A 1SK1A 1A0RP 5DJLA 4NMUA 5DQYA 3IV4A 3F4TA 1K3LA 2DJKA 1K3OA 5D96A 5ECQB 6GSVA 4RUVA 5EVOA 1FG4A 3QFAC 4KDYA 4MF5A 4HU9A 2WRTA 1M0UA 2TRXA 1JFUA 1AQWA 2DMMA 3QCPA 2OE1A 2VIMA 1PGTA 3TJJA 4ZB6A 1FO5A 3C8EA 3ERGA 3F6DA 1SYXA 6GSTA 5J4UA 2OE3A 2VL2A 3PR8A 3TJFA 2GDRA 2RM5A 5HR3A 2GZYA 5FT3A 2JU5A 2YCDA 1R26A 2A2RA 4ZL7A 5ECIB 5DALA 2E2MA 2H71A 2I9HA 3H8QA 3IE3A 4X1UA 2CZ3A 3RPNA 4TR1A 4BVXA 2YJ7A 2YOIA 3C73A 1IYIA 2DLXA 2WULA 2DSAA 5IOWA 2EIRA 1A8LA 2CVKA 2DIYA 1AQXA 3QD9A 2IN3A 3FZ4A 2WB9A 4WKWA 1V57A 5JWQB 4MJBA 1Z5YE 3ZYWA 2PWJA 3FR3A 2PUKC 3LSZA 1QQ2A 3IR4A 1TI3A 3ZIVA 2FUG2 3F4SA 2WDUA 2LJAA 2C3QA 3VFIA 2VLTA 4HEA2 1NM3A 2HFDA 2YZHA 3DEXA 1OYJA 3HVXA 4OO4A 3LJRA 2CT6A 4YAVA 4ZBBA 4ECBA 22GSA 4XTSA 3LGCA 5ECMB 2ON7A 1ZOFA 3GH9A 1GWCA 4ZXGA 4IP6A 1PD21 4F9ZA 1EV9A 1TI1A 4KDXA 4LMVA 4BA7A 1E2YA 3GA4A 4XIHA 1AUCA 1BG5A 3F3RA 4YQUA 4HZ4A 2B1LA 4G9HA 3HZ4A 5IQYA 3EMXA 4MABA 3GKMA 3IAM2 1R5PA 2H1AA 5HFKA 2WCIA 1SK0A 5DALB 2G2QA 2PU9C 2XPEA 1GSQA 5E4WA 5D93A 5D9VA 3ZZXA 4JRRA 4TR1B 2YWNA 1GSDA 4WEYA 2H73A 2L57A 3HJPA 1NW2A 2H6YA 2IMIA 5HR1A 3WYWA 1K0CA 4D73B 4IBPA 1YEXA 3MWHA 1H4OA 1VRSD 1I9DA 1LU4A 4WR5A 2GVPA 1XWAA 3R2QA 4F2IA 1WWJA 3VWXA 2VM1A 4G2EA 4BVYA 1GTAA 2VAFA 3PH9A 2XBQA 3RBTA 4MMMA 4IELA 4TRXA 2L6DA 4QQ7A 1QGVA 5CRGA 2O89A 4KCAA 4V2LA 3UBLA 3HXSA 3APQA 2HYXA 2C0DA 2FWHA 1HNBA 4KCEA 2MBTA 1WOUA 2IFQA 3FK8A 3APOA 2H6XA 4L5LA 3D22A 4K0GA 1BX9A 3TB2A 1X0RA 3EVIA 2YWOA 2F8FA 3IDVA 4DSSA 2N5AA 2O87A 2H0IA 3ZFLA 5J3RA 4ZL9A 4ECJA 1GSSA 1XXUA 3KGKA 1X5CA 1F9MA 4KA0A 3GTUA 3ERFA 4EDYA 2IMKA 3GKKA 4TXOA 3ZTLA 4TXVA 1LBKA 2FWEA 4NXIA 5D9TA 3CRTA 1JZOA 5J5NA 4I2TA 4MZBA 2DJ3A 4XS1A 4PQ1A 2CVDA 2YV9A 1PA3A 5FWGA 1TU8A 5F8BA 5ENUA 2V2GA 4MPFA 3FZ5A 2R37A 1GTUA 1M2BA 2LRNA 1AW9A 1SK2A 2OKAA 2YJHA 1AIUA 2QGVA 4I8BA 5IO2A 3H93A 1XPVA 3IAS2 1EOGA 2KP1A 2DIZA 3F0IA 2DJ0A 4V1Ag 2I3YA 2REMA 20GSA 4PUFC 3IXRA 2X8HA 5B7CA 2L5OA 2B1KA 2IFQB 3GH6A 4MP4A 1ZL9A 2H1DA 3VPQA 4LL4B 1SJIA 1N2AA 3KTLA 1W4VA 3A2VA 4DSSB 2LS5A 2O8VB 2VD0A 3GMFA 1HNCA 6GSXA 3KXOA 2PVQA 3TKSC 3NIVA 1RQMA 5GSTA 2GTUA 2MMOA 1R5AA 3F4RA 5HFIA 3NOFA 3GTUB 2GLRA 4MJAA 4KAEA 4ML1A 4O5RA 4CDOA 3TJGA 5ECHB 2H76A 4TXOB 5CO3A 4BL7A 1GP1A 3BCIA 1ZCPA 3TRXA 4K1FA 18GSA 2CAIA 4TR0A 3LORA 4XS4A 4HZ2A 2MZCA 3GRXA 5DDLA 2TRCP 2RLIA 3EU3A 3WGXA 3UBKA 3ZMLA 3VI5A 4HJMA 4IVFA 3BCKA 1XW5A 3KMNA 4MJCA 1K3YA 2AJQB 4MLYA 2F3MA 3M3MA 3ZITA 4HDEA 4MDCA 4HQZA 3KH7A 1QUWA 1ZZYA 1SL1B 1YKAA 2DMLA 3FHKA 2VUPA 4PX1A 5CRHA 4KDUA 2H1BA 1A0FA 3FY7A 3EC3A 3WD6A 2AYTA 2JZTA 2LRTA 1UA5A 2YV7A 2WFCA 3VWVA 4IQ1A 2KUCA 2IMFA 4NWYA 2IIYA 2EIQA 1SD9A 3P90A 4DVCA 1U6TA 2JSYA 2KOKA 2VM2A 3LWAA 2MMAA 4WETA 3IC4A 3UJ1A 1TKDB 1OC9B 2JZSA 2K8SA 1K0OA 3D21A 4PQHA 3A2WA 1TK0B 4TOPA 2M80A 2HRNA 1A23A 3RPPA 5KN0A 5C04A 1MTCA 1O8XA 4JR4A 1K0DA 1ZMAA 1EEJA 1JHBA 2QKEA 3GN3A 4ISDA 1OC3A 2IL3A 3N5OA 5DVBA 4XRAA 2J9HA 4DSQA 1WIKA 1YF1A 3ERWA 5GAPD 4XS4B 4I6XA 1A2MA 1XZOA 2H74A 3WT1A 4AJ6A 4EC0A 3M0FA 1PKZA 5ID2A 4QL9A 3K8NA 5JWOB 3ZVJD 4MCUA 2VL9A 2X99A 4IW9A 5B8BA 3KJYA 3SBCA 3JCML 4G10A 1R7HA 3C1SA 1ZGNA 4WF4A 2JADA 2AHEA 1CQHA 3L0HA 3UMAA 2NVLA 1GSUA 2WJUA 3GURA 4HUAA 4N0VA 4ML6A 5LNKe 1SJ6A 2DJJA 5IMDA 5IO0A 4ECCA 3KEBA 1H75A 2FHEA 4IS0A 2LEGA 3DVXA 1PL2A 4YQVA 3MSZA 2IMDA 2F8AA 4WBRD 5DCHA 5COHA 3F3QA 3BD2A 1O85A 2X8CA 2I4AA 1VF3A 5AIVA 3LG6A 4E8HA 1THXA 4FO5A 5F07A 1B9XC 1OKDA 4POLA 3E9JB 5L71A 3HJMA 3QPMA 4KB3A 3HVVA 3CXGA 4X43A 4GSSA 2VCWA 4KX4A 2B7KA 2PVOC 1K0BA 5IMVA 2C80A 5F0GA 2C0GA 2R3XA 2K6VA 3F63A 1TRUA 4F0CA 3DRNA 1O7UA 2K9FA 3QFBC 3QAWA 5ID2B 4P3YB 1DE1A 1B9YC 2ES7A 1B8XA 1OKTA 2C0FA 2GSQA 3VURA 1VGLA 4IP1A 3ME8A 1V40A 5INYA 2E2GA 4FIWA 2L59A 1C72A 2C8UA 3G7JA 4J57E 2DBCA 4LA1A 5ELGA 3UEMA 3EURA 2H19A 4MZWA 2HNLA 2IJYA 1EV4A 2XC2A 3C1RA 1XWKA 5G1KA 5IPGA 3LYPA 4GF0A 2WGRA 2JZRA 4K7IA 2M72A 2LV3A 4KSOA 1JZRA 1A8YA 1U3IA 2BJXA 4X0XA 3CRUA 2H66A 4POMA 2GZZA 3DKSA 4PNFA 2OBKA 2NTOA 2OE0A 3UL3A 1BYEA 4AF2A 2E7PA 1SENA 4TR3A 1PRXA 5CNWA 3TOUA 1M7TA 2RM6A 1THOA 4WF5A 3EINA 1GUMA 2OACA 4HQSA 1RK4A 3HHVA 5D8IA 2GZPA 3IRAA 1HD2A 4ILFA 2VD1A 1PQNA 3I9V2 1XCCA 4NHZA 2HE3A 3G7YA 1SL2B 5A4WA 5GZZB 4F82A 1YY7A 5DAKA 2GS3A 2HI7A 2FLSA 3GKNA 4GWRA 1G0TA 4Z7XA 2KHPA 3NZNA 2A2SA 3M8NA 2DJ1A 4F0BA 5G5FA 4K2DA 4O7HA 4GCIA 2H72A 3CBUA 3VLNA 1HYUA 2PGTA 2GT6A 1XOBA 3IBHA 3VK9A 4MA9A 1GNEA 4AJ7A 5EPFA 2L4QA 1XVQA 5J9BA 5D9XA 4L5OA 3GSSA 3FRCA 2GQMA 1OE8A 2OJLA 3L9SA 1O81A 4XCSA 5A5KA 5GAND 2IWTA 4PNGA 3P8WA 1GTIA 1ZYQB 2PERA 1BAYA 3E0UA 2VO4A 2C1YA 1T3BA 5B6NA 1SU9A 1ML6A 1MEKA 1NSWA 3FEUA 1HNAA 3IOSA 5ECLB 2HT9A 3ED3A 4DEJA 3RAZA 3PINA 1SKRB 2AV4A 4EO3A 4EF0A 1M2AA 1AC1A 4N11A 3GL3A 4NPBA 6GSYA 1F2EA 1V2AA 1LJRA 5LCZA 2P5QA 1SKSB 4L0UA 1GRXA 1SD8A 4OCFA 2C4JA 3IK9A 1W89A 3WGDA 3CTGA 3IK7A 5IMAA 1TTZA 5H5QA 2VCZA 2VOCA 3APSA 3EE2A 4O32A 5ABRA 2FGXA 5D73A 3TKQA 5A4UA 3KTBA 2H75A 5DAKB 3F8UA 3HVSA 5F06A 3CSJA 3KMOA 3DMLA 1A24A 2LNSA 2R4VA 2NPBA 17GSA 4N30A 4TVEA 3P7XA 2R5GA 4GQFA 3MAKA 1GH2A 3QR6A 2VLVA 5FHIA 3A3TA 2O7KA 3ZMKA 1E6BA 1B48A 1WE0A 1GTBA 1T4ZA 3RHBA 3KCMA 3TRQA 1EGOA 1KEBA 4ZB9A 1Q98A 3CSHA 1VF4A 4F03A 5CRWA 1FHEA 3J7Yk 4FH8A 2H0HA 3O6TA 5C00A 2GQKA 6GSUA 3W8SA 3ZREA 1YZXA 2HZEA 2K8VA 3BOAA 1T1VA 5KN1A 3QAGA 2FWGA 5H5SA 2C0EA 3HD5A 4JBBA 2MMZA 5CRDA 1VF2A 5HR0A 5KEJA 2F51A 3D4MA 4CW9A 3KIJA 5ELAA 3GV1A 3N9JA 2H8LA 4ECIA 2YWIA 2LJRA 2MMNA 4K9ZA 2KP2A 3D4TA 2GSTA 1WPIA 3AY8A 4Q5NA 4POBA 1FAAA 4J2FA 1BQ7A 1XVWA 4IKHA 4OFTA 2L4CA 2P0GA 4IN0A 2C3NA 1ERVA 1NHYA 1PMTA 5IPHA 1T8EB 2FA8A 3W6GA 4N0ZA 7GSSA 1A2JA 2YZUA 3A5WA 3VWUA 12GSA 1QMVA 2QC7A 3S9FA 2BMXA 1TW9A 5J9CA 4AJ8A 11GSA 3Q6OA 2LQQA 2VCVA 4ID0A 2R6KA 2RUFA 1TRVA 2FD3A 4PURA 1A2LA 2H01A 2VCXA 2J23A 1K0NA 2GQLA 4G19A 1U88A 1S3CA 3TKSA 2HSYA 4AGSA 2E0QA 4K7NA 1TK5B 4GXZA 1S3DA 3G7IA 1EOHA 1FB0A 1Z3EA 5CYYA 3WT2A 4GQCA 1EP7A 2V6KA 2LUSA 2B6MA 5IMFA 4GSNA 3GL5A 4RI7A 2JACA 3UVHA 2GGTA 3LXTA 4L0WA 5G5EA 1I5GA 2H6ZA 13GSA 1PL1A 1DBYA 5ECSA 2HZEB 3H79A 1GLQA 4PUAA 1MD4A 3I6AA 4OFNA 2DJ2A 19GSA 1DUGA 3IPZA 3U6VA 1M2DA 1XOAA 2CX4A 2H1GA 3RDWA 3QDNA 1J9BA 1SJZA 3DGQA 4KE3A 1Q4JA 5AISA 3D5JA 2OBIA 4IQAA 3M9KA 5B6MA 4YAPA 2MBSA 5JCWA 4MK3A 2O85A 3ZL5A 1TDIA 1SL0B 16GSA 1TXXA 2VL2C 1ABAA 1T7PB 2V1MA 2ZUPA 14GSA 3BBYA 2YWMA 1JZWA 2P31A 1G6YA 4LMWA 4ZBDA 1Z7PA 3TUEA 3L4NA 1TRSA 4IGJA 5IMZA 1T4YA 3GHAA 1ON4A 1V98A 1XW9A 4QL7A 2V41A 2QSIA 2HXKA 1DSBA 1FB6A 3QOUA 4GSTA 5DJMA 2M46A 3FW2A 4BWQA 3VPTA 1VF1A 2GSSA 2NDOA 2B3SA 3KH9A 4JR6A 3FR9A 4EXJA 2WZ9A 4FYBA 3TKSE 3IA1A 4ACSA 2LQOA 4FYCA 4OO5A 1XIYA 1M99A 1XBSA 2VCQA 4WXTA 1F6MC 2FCHA 3FZAA 1TK8B 3O76A 1Y6EA 1EP8A 1B4PA 4EVMA 3HKRA 3HDCA 3ZIJA 1EEMA 1PKWA 1FW1A 3QMXA 3TKRA 3GYKA 4GRFA 1UN2A 4IJ3A 3HJOA 1EZKA 2B5EA 4PGTA 1ERUA 2WS2A 3DD3A 2FA4A 3SWLA 4XHMA 1PN9A 3DXBA 2IPAA 1WP0A 4PQIA 3OR5A 1V58A 4CHSA 2EC4A 2XPDA 1WMJA 1K0MA 3GX8A 2B5YA 4YQMA 3H4KA 5D9WA 3TJKA 4D73A 1AXDA 2KLXA 4H86A 3W8JA 3HYPA 1TOFA 4I2UA 2H30A 3D6IA 1J0FA 4EL1A 2PN8A 1WRYA 5CAXA 1X9SB 3F9UA 4GLTA 1DE2A 4Q5FA 4KH7A 1GSFA 3GSTA 2ZCTA 2CX3A 1T00A 2N5BA 4MZCA 4ZB8A 5ECNB 4KNDA 3UAPA 1QFNA 2CA8A 4ZBAA 5AN1A 2FY6A 3IHQA 4IHUA 2FNOA 3GX0A 4EDZA 1ERTA 5KN2A 5IMCA 4OMVA 4KGIA 5DBQA 3I43A 1XWBA 1OAZA 2C3TA 5ECOB 2I1UA 1FVJA 2CQ9A 3U5RE 4OFMA 4NHWA 5ECRB 4EUYA 1PX6A 6GSWA 5H5RA 5HQPA 5CP1A 2YP6A 2L5LA 2FWFA 4KSMA 5J41A 1O73A 4I5QA 4NAXA 2ZNMA 2HSHA 3LFLA 3VWWA 1XW6A 3GNJA 1Y25A 3HZ8A 3VI7A 2ON5A 4MJEA 2CV4A 6GSSA 4MH2A 3TJBA 4BWSA 4JEDA 1Z9HA 3BJ5A 3LYKA 3H1NA 4POKA 2IMEA 4K6XA 2A4VA 2LJKA 4WBJA 3O3TA 5ECKB 1GSYA 3A2XA 5IOXA 1USBA 3TDGA 1TP9A 3GKXA 3HA9A 1FOVA 1MDJA 1TJDA 4V1Ap 4IJIA 4ZIJA 1SYRA 3MNGA 2D2ZA 2GSRA 3UIWA 5GSSA 2NBSA 5HFGA 4XRDA 1MDIA 1YJ6A 3EMPA 3LEFA 4OWYA 2PPTA 3UARA 3FKFA 4E8EA 1OVNA 2LNTA 1KNGA 3P2AA 2CZ2A 2GT5A 2AAWA 5IIZA 9GSSA 4BPYA 1F3BA 3KM6A 5JCGA 3I69A 4NV2A 3ISOA 1R4WA 3M1GA 1UC7A 2AB6A 3GUSA 1TRWA 1KBNA 4MPGA 2H0GA 3FR6A 1YKCA 4Q5QA 4TKYA 1FVKA 2V6OA 2YNXA 3D0ZA 4TW5A 1EGRA 3V1WA 3EU4A 2X64A 1JZDA 3Q18A 2V32A 3UVTA 1JLVA 3QAVA 3UOMA 4TN8A 1MD3A 5G31A 3CSIA 4K8MA 3L78A 2AUVA 3Q74A 4O92A 2F9SA 5JCUA 5JWRB 5AIXA 2EIOA 1QXHA 4HS1A 2HRFA 1ERWA 3ZFBA 1XWCA 3G9BA 1IYHA 1U3AA 2N5FA 1XWGA 2Z9SA 3ZRDA 2L6CA 4J56E 1ST9A 4K7OA 3WGEA 2ALBA 5CREA 4LLRA 2HLSA 10GSA 2X8GA 3HY2A 4HJ2A 3ME7A 1X9MB 2YANA 1OC8A 1X5DA 3DVWA 1YF0A 1CQGA 2JL4A 2VL3A 1TU7A 1WJKA 1ZYEA 4HI7A 2LRCA 3C7MA 1G7OA 2K18A 3LXZA 3GIXA 1GUKA 3KD0A 3C71A 3DWVA 4OCEA 4V2NA 4RQRA 3TOTA 1Z7RA 1SKWB 1GNWA 1OC9A 1K0AA 1N8JA 4JZQA 1GLPA 3CYNA 5LD0A 1BEDA 4ULXA 2LKUA 1B4QA 5F05A 4ZL8A 4HU7A 1X5EA 1JLWA 2G0FA 3LQ7A 5KN3A 4MH3A 5DCGA 1GULA 3TGZA 1ILOA 4WR4A 2BTOT 1HQOA 2CVBA 2DC5A 3J7Yb 4K0NA 5G2ZA 4KW6A 3KP8A 3RHCA 1G7EA 3L9UA 3FZ9A 5EL8A 3HCZA 2B7JA 1YDKA 4GTUA 3KP9A 1Z6NA 4RQXA 4LL1B 2LTKA 3US3A 1F37A 4PXOA 3MDKA 5E59A 3GFKA 1GSEA 3ZVJA 4DSRA 3F6FA 4HOJA 3EYTA 1O6JA 2OA7A 2B5XA 2XHFA 3TCOA 2RIIA 5IM9A 5HR2A 1MDKA 3ZLPA 3FYGA 1NHOA 1PX7A 1URMA 3M9JA 4YH2A 2H70A 8GSSA 1F3AA 1GL8A 4TR4A 1J08A 2YPMA 2MYGA 1Z6MA 1BJXA 4RI6A 2P5RA 4Q5RA 4EKZA 5AGYA 2YN1A 1AQVA 4KUNA 5DQSA 2TIRA 3E3EA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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