The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
245
|
sequence length |
753
|
structure length |
752
|
Chain Sequence |
MKRIFEVQPWNVITHTFDPKDKRLQESMTSLGNGYMGMRGDFEEGYSGDSLQGIYLGGVWYPDKTRVGWWKNGYPKYFGKVVNAVNFIKLPIEINGEPVDLAKDKISDFTLDLDMHQGVLNRSFVVERGAVRVALNFQRFLSVAQPELSVQKVTVKNLSDAEVDVTLKPSIDADVMNEEANYDRFWDVLATDQQADRGSIVAKTTPNPFGTPRFTSGMEMRLVTDLKNVAITQPNEKEVTTAYTGKLAPQASAELEKRVIVVTSRDYDTQESLTAAMHQLSDKVAQSSYEDLLNAHTAIWAQRWEKSDVVIKGDDESQQGIRFNLFQLFSTYYGEDARLNIGPKGFTGEKYGGATYWDTEAFAFPVYLGITDPKVTRNLLMYRYKQLDGAYINAQEQGLKGALFPMVTFDGIECHNEWEITFEEIHRNGDIAFAIYNYTRYTGDDSYVLHEGAKVLTEISRFWADRVHFSKRNNQYMIHGVTGADEYENNVDNNWDTNMLAQWTLKYTLEILGKVDQDTAKQLDVSDEEKTKWQDIVDRMYLPYDKDLNIFVQHDGFLDKDIEPVSSIPADQRPINQNWSWDKILRSPYIKQGDVLQGIWDFIDDYTPEQKKANFDFYEPLTVHESSLSPAIHSVLAADLHYEDKAVELYSRTARLDLDNYNNDTTDGLHITSMTGAWIAVVQGFAGMRVRDGQLHYAPFLPKTWTSYTFRQVFRDRLIEVSVHADGPHFKLLSGEPLTIDVAGAAAAAAAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of Maltose Phosphorylase from Lactobacillus Brevis: Unexpected Evolutionary Relationship with Glucoamylases.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Hydrolase
|
| molecule keywords |
MALTOSE PHOSPHORYLASE
|
| total genus |
245
|
| structure length |
752
|
| sequence length |
753
|
| chains with identical sequence |
B
|
| ec nomenclature |
ec
2.4.1.8: Maltose phosphorylase. |
| pdb deposition date | 2001-05-18 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF03632 | Glyco_hydro_65m | Glycosyl hydrolase family 65 central catalytic domain |
| A | PF03633 | Glyco_hydro_65C | Glycosyl hydrolase family 65, C-terminal domain |
| A | PF03636 | Glyco_hydro_65N | Glycosyl hydrolase family 65, N-terminal domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha/alpha barrel | Glycosyltransferase | Glycosyltransferase | ||
| Mainly Beta | Sandwich | Maltose phosphorylase, domain 3 | Maltose phosphorylase, domain 3 | ||
| Mainly Beta | Distorted Sandwich | Beta-galactosidase; Chain A, domain 5 | Glycoside hydrolase, family 65, N-terminal domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KFG A; 1XWQ A; 1FBW A; 2GZ6 A; 3GZK A; 3W7W A; 1KRE A; 3S4A A; 1CEM A; 2CQS A; 4WU0 A; 1DL2 A; 4JJJ A; 3QXF A; 1WU6 A; 4XUV A; 3QFZ A; 1G87 A; 1DOG A; 2ZBL A; 1X9D A; 4CE7 A; 4ZG8 A; 5DGQ A; 3ANK A; 3ACS A; 3E6U A; 1FO2 A; 3WKI A; 3WKH A; 3GLY A; 2AHG A; 2DRQ A; 3H7L A; 4FUS A; 4WVB A; 1NC5 A; 1XWT A; 3E73 A; 3K11 A; 1H13 A; 2DRO A; 1F9O A; 2D5J A; 1H54 A; 4Z4J A; 4Z4L A; 1KWF A; 2DRS A; 1FAE A; 3ON6 A; 2FBA A; 3S4C A; 3S4B A; 1K72 A; 2GH4 A; 3TF4 A; 1HCU A; 1G6I A; 1G9J A; 3QRY A; 4AYP A; 2OKX A; 4EL8 A; 2EAD A; 3A3V A; 3H2W A; 1XW2 A; 2JG0 A; 3ACT A; 3EZ8 A; 1V5C A; 3RRS A; 1FBO A; 4WVC A; 5CD2 A; 2FV1 A; 1LF9 A; 5KKB A; 2EAB A; 3W5M A; 1KS8 A; 5M7I A; 3W5N A; 3WC3 A; 1WU4 A; 1KSC A; 4L6X A; 3WIW A; 1GAH A; 5GY3 A; 2B4F A; 2JF4 A; 2RGK A; 1F9D A; 1FP3 A; 1RQ5 A; 3W7U A; 4AYO A; 4L0G A; 5E2J A; 1LF6 A; 2A8Z A; 3QG0 A; 1ULV A; 2ZZR A; 3S4D A; 4J5T A; 1KKT A; 3WIR A; 4TF4 A; 1WU5 A; 3VW5 A; 3RX5 A; 1IS9 A; 2D8L A; 2FV0 A; 2WYN A; 3QXQ A; 2XFG A; 3QFY A; 5CA3 A; 3W7X A; 1JS4 A; 2DRR A; 3P2C A; 2FUZ A; 3QPF A; 2JJB A; 1IA7 A; 4Q88 A; 2RI9 A; 5DGR A; 2Z07 A; 2AHF A; 1UG9 A; 1V7X A; 3ANJ A; 3EQA A; 1FO3 A; 3AFJ A; 1GAI A; 4CJ1 A; 3X17 A; 2NVP A; 1FCE A; 1L1Y A; 5CZL A; 5M7Y A; 4DOD A; 3VXD A; 2RI8 A; 1AYX A; 4WVA A; 1KSD A; 1G9G A; 1H14 A; 1H12 A; 1TF4 A; 4TXT A; 3WIQ A; 1KRF A; 2YIK A; 3D3I A; 4ZH5 A; 3RX7 A; 4CJ0 A; 3QSP A; 4AYR A; 2QNO A; 1UT9 A; 1CLC A; 4DOE A; 3CIH A; 1FMI A; 2CQT A; 2VN4 A; 3H3K A; 3WUX A; 3PMM A; 2EAC A; 1V5D A; 3T33 A; 2EAE A; 3RX8 A; 1V7V A; 1L2A A; 3W7S A; 3WKF A; 4KTR A; 1V7W A; 1VD5 A; 3GT5 A; 1GA2 A; 3RSY A; 2AFA A; 1GLM A; 2P0V A; 4Q2B A; 3QWT A; 3ANI A; 5GW7 A; 5MEH A; 1NXC A; 1WZZ A; 3W7T A; 3QDE A; 3QT9 A; 1AGM A; 3REN A; 4AYQ A; 2F6D A; 4KTP A; 3WKG A; 3QT3 A; 2VN7 A; 1IA6 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3T0B A; 1KFG A; 1XWQ A; 2JKP A; 1FBW A; 5GZK A; 1S64 B; 2XQW A; 3SEP A; 4WU0 A; 1WU6 A; 1FT2 B; 5FO8 B; 2FUT A; 1OJM A; 2ZBL A; 1X9D A; 3EJT A; 4MBG B; 2ONH A; 2W0Q A; 5AGD A; 1N1B A; 3E6U A; 2ZIR B; 4YCR A; 1O79 A; 3GLY A; 5C05 A; 3H7L A; 4FUS A; 4WVB A; 2XWB B; 1HM3 A; 1H13 A; 2CFW A; 2BED B; 1RKY A; 4MU9 A; 4Z4L A; 2DRS A; 3DYO A; 3ON6 A; 2FBA A; 2WOF A; 3T0U A; 1TNO B; 1TN8 B; 2V8I A; 3M77 A; 2D73 A; 3KSQ B; 1MMZ A; 4EL8 A; 1W5Z A; 5FO9 B; 1QAK A; 3DPY B; 3KII A; 2F1B A; 4DUX A; 3ACT A; 3NBB A; 3PGB A; 1UMP A; 1O7D D; 4WVC A; 3J7H A; 3PYA A; 1PX4 A; 4OK4 A; 1SPU A; 5KKB A; 2F7O A; 3D52 A; 4RNL A; 3T2Q A; 1O6Q A; 4GTT B; 1US1 A; 3WC3 A; 2WOH A; 1C82 A; 4L6X A; 3WIW A; 2E2U A; 1D8D B; 4V1R A; 1HWW A; 3D50 A; 4M76 A; 2F7R A; 1LVN A; 3W7U A; 1AVL A; 1LF6 A; 2A8Z A; 1MMY A; 1CB8 A; 1HMW A; 2X03 A; 4FJQ A; 3EJQ A; 5IK6 A; 2CFK A; 3VD7 A; 4D4D A; 4TF4 A; 1W6K A; 1HZF A; 1OJP A; 1NSM A; 1GXM A; 1LD8 B; 2BRP A; 3OS7 A; 3QXQ A; 3KSL B; 1NL4 B; 3A0O A; 3KN4 A; 3SDR A; 1QWN A; 3BVX A; 1X1H A; 4Q88 A; 2WII B; 4D4C A; 1L7K A; 1TQW A; 3M72 A; 2YFN A; 3MV0 1; 1KZO B; 1RJO A; 1LXM A; 2NVP A; 4FNV A; 3X3Z A; 5CZL A; 4DOD A; 3LVT A; 3VXD A; 2RI8 A; 3HXF B; 1O6H A; 4ZRQ A; 3VD4 A; 4WVA A; 3PZ1 B; 1D6Z A; 1H12 A; 2F0Y B; 1SQC A; 2YIK A; 4V1S A; 2BB6 A; 4FXG B; 3HXC B; 2F7Q A; 4FNU A; 1NS4 A; 4DOE A; 1SIH A; 2CQT A; 2VN4 A; 3K5T A; 1V5D A; 2FUQ A; 1HTY A; 4BOJ A; 1L7J A; 1L2A A; 5IKH A; 5EAU A; 5IL8 A; 1NS2 A; 3WKF A; 1W2Z A; 3LZ9 A; 2E2T A; 1PS3 A; 1V7W A; 1GXO A; 3RSY A; 3E37 B; 2AFA A; 1N22 A; 1RWC A; 2C10 A; 1GLM A; 1QX1 A; 3DSV B; 3QWT A; 3NBJ A; 3CZS A; 3X3Y A; 4L9P B; 3E30 B; 2D1W A; 3QT9 A; 3PYB A; 3REN A; 1PU4 A; 2F6D A; 3X40 A; 2XN1 A; 2VN7 A; 1HXC A; 2WYH A; 2B39 A; 4DI5 A; 3M00 A; 4F10 A; 3M74 A; 1QSJ A; 2XN0 A; 4KKI A; 2ZL8 A; 2GZ6 A; 4D4A A; 5FOB B; 1KRE A; 1N95 B; 3S4A A; 1CEM A; 4JJJ A; 3SFX B; 1LUR A; 2OQE A; 3QXF A; 1N4P B; 1HXA A; 5JPN B; 1NSX A; 1EKM A; 4XUV A; 2ZQ0 A; 3QFZ A; 1G87 A; 1DOG A; 4CE7 A; 1N4R B; 5EAT A; 1FT1 B; 3SQC A; 2WVX B; 4AQ0 A; 1FO2 A; 3EJP A; 5FO7 B; 2AHG A; 3SAE A; 3BVU A; 1JZ8 A; 1XWT A; 3E73 A; 3K11 A; 1NSS A; 5E1Q A; 1NI1 B; 3D4Y A; 3VDB A; 4KFF A; 1R34 A; 1H54 A; 1N24 A; 3M7E A; 3S4C A; 3P5R A; 2CG0 A; 2GH4 A; 3EUV B; 4DUV A; 1QAL A; 3M71 A; 1G9J A; 2EAD A; 2OOV C; 1XW2 A; 1FPP B; 2YFO A; 1TNB B; 2CIS A; 1FBO A; 3Q1N A; 3T0D A; 1HN0 A; 4BOK A; 2F7P A; 1TQV A; 1TNY B; 5A1A A; 1X1J A; 2EAB A; 3W5M A; 3N0G A; 5M7I A; 4K3A A; 5JPM B; 4EV2 A; 1NS7 A; 5GY3 A; 1LD7 B; 3T08 A; 2B4F A; 2JF4 A; 2XN2 A; 3AMO A; 1F9D A; 2E2V A; 4L0G A; 2V8K A; 1KZP B; 1LTX B; 3QG0 A; 1ULV A; 2CFL A; 2H6F B; 3S4D A; 3BLB A; 4J5T A; 1KKT A; 4GTQ B; 2H6G B; 3E32 B; 1HN1 A; 3BUQ A; 3CU7 A; 1F1S A; 3DX2 A; 1W7C A; 3SXX A; 1IVW A; 1H3A A; 4ONT A; 1W6G A; 1RW9 A; 2XFG A; 1IVX A; 3M76 A; 3NRE A; 2PNC A; 2RDY A; 1JS4 A; 3NFV A; 3KLS A; 4GTS B; 3BVW A; 3P2C A; 1JZ7 A; 1MN0 A; 3P5P A; 3ANJ A; 1DYU A; 3MUZ 1; 3T2P A; 3BLC A; 1TN6 B; 3NJX A; 1JZ6 A; 3Q7A B; 1FCE A; 3N9H A; 3WA2 X; 1L1Y A; 3D5S A; 4YDO B; 3T0A A; 3NJV A; 3BGA A; 1W3Y A; 1J0N A; 1DCE B; 1JYV A; 1GXN A; 1KRF A; 2JKA A; 2H6I B; 3D3I A; 3RX7 A; 1AVK A; 3ECQ A; 1A2V A; 1N1Z A; 1JRQ A; 1H37 A; 1UT9 A; 4GTR B; 3M73 A; 4D94 A; 3VDC A; 4BZH A; 3CIH A; 3WUX A; 3K7X A; 3OBA A; 2EAC A; 3E34 B; 2A73 B; 1HX9 A; 2CG1 A; 2I07 B; 3RX8 A; 1V7V A; 1LOH A; 3I3E A; 1VD5 A; 2WW0 A; 3HXB B; 1GA2 A; 1SA5 B; 4Q2B A; 5GW7 A; 3I3B A; 3Q78 B; 1C3D A; 1GHQ A; 2Y74 A; 3MWX A; 3W7T A; 3Q75 B; 5EAS A; 1X1I A; 1N7Q A; 3M7B A; 3PZ3 B; 4KTP A; 1JOV A; 2BRW A; 1D6Y A; 3X3X A; 3DX3 A; 1MMU A; 3E1F 1; 3WA3 A; 2CQS A; 3BVV A; 3DDG A; 3T2O A; 1WMN A; 1TQS A; 1D6U A; 3M7C A; 3ANK A; 1H3B A; 3SDT A; 1QBQ B; 3RJ3 A; 4BZG A; 3ACS A; 1R76 A; 3WKI A; 1NSR A; 4EHM B; 3G4D A; 3EU5 B; 4OK2 A; 3WKH A; 3HII A; 3TY1 A; 2V3N A; 1OAC A; 1NC5 A; 1O1R B; 3CV5 A; 1JCQ B; 1SA4 B; 2WZS A; 4LNG B; 2XHN A; 4BZF A; 1PX3 A; 1F9O A; 2D5J A; 3G6J B; 3S9V A; 1O6R A; 3AFL A; 4Z4J A; 2CWT A; 1KWF A; 2F1A A; 4FNS A; 3S4B A; 3M7L A; 3TF4 A; 1IQY A; 1G6I A; 3DYP A; 4AYP A; 1MZC B; 3DSS B; 1WMP A; 1N7R A; 3A3V A; 3H2W A; 5ILY A; 1N7P A; 2HTB A; 2WW1 A; 3Q73 B; 2JG0 A; 1NKG A; 3EZ8 A; 1H3C A; 1N7N A; 3RRS A; 5JMD A; 3K25 A; 1N4Q B; 4GTM B; 5DHI A; 5ILI A; 3VD3 A; 1LF9 A; 1X81 B; 3KQ4 A; 1KS8 A; 2XWJ B; 1TXK A; 1JCR B; 3EU8 A; 4KKJ A; 4LIX A; 1KSC A; 1OJO A; 2FYV A; 1GAH A; 3DEC A; 1O1S B; 3D4Z A; 2C11 A; 4OJZ A; 1IQX A; 2JKE A; 5E2J A; 3Q79 B; 1HXK A; 2BT3 A; 2CFD A; 1JCS B; 3BUD A; 2CIQ A; 1TNU B; 2PN5 A; 3NNB A; 4K35 A; 3N0F A; 4GTP B; 1W6J A; 2WYN A; 4FNT A; 4BZE A; 5CA3 A; 1N20 A; 3W7X A; 2DRR A; 2HTA A; 3BVT A; 4DUW A; 2FUZ A; 3QPF A; 2ALW A; 2JJB A; 3MUY 1; 3D51 A; 1IA7 A; 3M78 A; 3OED A; 4FXK B; 5DGR A; 3BUB A; 2Z07 A; 4ZH1 A; 1V7X A; 3EQA A; 1H35 A; 1FO3 A; 4D4B A; 3AFJ A; 3IAP A; 4CJ1 A; 1YGA A; 4BTX A; 3PZ4 B; 5M7Y A; 3C72 B; 2OQE C; 3DSX B; 1TQU A; 1AYX A; 1KSD A; 1G9G A; 1H14 A; 3E33 B; 1TF4 A; 2Q1F A; 3WIQ A; 2WO0 A; 3G4F A; 4ZH5 A; 1AV4 A; 1N4S B; 1QQF A; 4AYR A; 5IM1 A; 1CLC A; 4YDE B; 1FMI A; 3H3K A; 4FNP A; 1TU5 A; 1R33 A; 3T33 A; 1O5M B; 3BS6 A; 3HIG A; 3SFY B; 4E1Y A; 2SQC A; 4MMH A; 3HXD B; 3EJU A; 2CWU A; 2WY8 A; 1IVU A; 3CZN A; 3DSW B; 1HMU A; 4TTG A; 3VD9 A; 1KSI A; 5MEH A; 1WZZ A; 4GL3 A; 3T09 A; 3QDE A; 1AGM A; 4AYQ A; 3WKG A; 5IK9 A; 1IVV A; 1TNZ B; 1JYW A; 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