1H5VA

Thiopentasaccharide complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradharens at 1.1 a resolution in the tetragonal crystal form
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
publication title Atomic Resolution Structure of Endoglucanase Cel5A in Complex with Methyl 4,4II,4III,4Iv-Tetrathio-Alpha-Cellopentoside Highlights the Alternative Binding Modes Targeted by Substrate Mimics
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus agaradhaerens
total genus 123
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2001-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h5vA00
1VJZA 3VX0A 2J62A 1GOIA 4UQEA 1C7SA 1HT6A 1XC6A 3ARTA 3PZVA 5CQ1A 1BGAA 1EQPA 4JIEA 4AYSA 4MJ4A 3A4XA 3FNDA 2J7HA 3VKKA 1G0CA 1TA3B 2ZICA 1JZ6A 3VD3A 3VUPA 1JXJA 4WSKA 4ZE5A 3MKKA 4W88A 3WDIA 3TA9A 3NSMA 5A2CA 3W26A 4X0VA 4PUDA 5AYIA 4AZCB 2WHKA 4JHOA 2BV9A 2XSBA 2VVNA 4CGTA 1CGWA 1HVQA 4AIUA 4IM4A 3W27A 4NZCA 2VX4A 2VURA 1J0KA 4J28A 2VOTA 3MUIA 4ZE4A 4CU6A 2F8QA 1FFRA 3QHNA 4ATLA 2VT0A 4LQ1A 2VZOA 3CBWA 1XCWA 2J74A 1PJ9A 4MNLA 3UCQA 3VDHA 3WF2A 1UR1A 3PZNA 2G4FA 1QI4A 1XYZA 4A3HA 2J7FA 1PPIA 3TTQA 2VCAA 1UA7A 3WQWA 4D6IA 4GQQA 1V08A 2BFGA 3LPFA 3M7SA 2ZUVA 3AZSA 1UR0A 2D23A 2EPOA 2OWCA 4Z2JA 1I1XA 4B16A 3WQ5A 4ZEPA 2PI6A 4W84A 1V3MA 4ACYA 3OZPA 3VGEA 2CCRA 1EOKA 1JZ8A 4W5ZA 4MAVA 3WNPA 3OLGA 4DUVA 4JKMA 1CXHA 4P8XA 2AAAA 4QLLA 5BXTA 5AYBA 1IZJA 1JNDA 3VIMA 5I24A 2WCSA 4URIA 1JF6A 2XVNA 4GI9A 4MPKA 4AD3A 4NI3A 3T0AA 1GQIA 3BMWA 3VDBA 2NW0A 4S3JA 1MW1A 1CXIA 1QBAA 1PIGA 5EB8A 3VMPA 5DEZA 5HNNA 4HOZA 1SMDA 2CBJA 1E6SM 4W93A 3UG4A 3ARQA 1A47A 2OYLA 1PEZA 1UWTA 1JI1A 1Y7VA 3WELA 1LG2A 4ACZB 3WD1A 1HNYA 4AIEA 4PRWA 1HL9A 3W6MA 3RM9A 1XSIA 3WEOA 2G3IA 3DECA 1UD5A 3GXMA 1N82A 1UKQA 4MAZA 3WBAA 4AEEA 1VEOA 1HF6A 2GSJA 2W61A 1HL8A 3PZOA 3ZOAA 2Z1KA 1W3LA 5HPOA 1H5VA 3SCWA 3MU7A 5EMYA 2X1IA 3SURA 2J7DA 1CGVA 1KGXA 2Y8VA 2UY2A 1GOKA 1JAKA 1JYVA 2DQXA 1E4IA 3FAXA 4M8UA 4H7VA 4MB3A 4HPHA 5DF0A 2GJPA 3T2PA 4AZHA 5A6MA 1C8QA 1WDSA 2XVPA 2G8ZA 3EDJA 1HP4A 4AEFA 3QHOA 1X1NA 3GXDA 3LPGA 4MB4A 2YA0A 4V27A 2XFFA 1I75A 2E0PA 2WBGA 5AC5A 5M3WA 1OSEA 1E4NA 1CIUA 1H09A 1D2KA 4PMOA 4AD0A 3VD4A 1E6NA 2ZX8A 3UG5A 3VVGA 5AC4A 1EO7A 1ITCA 1PBGA 2ZX6A 2ZXQA 3GH7A 3ZJ6A 3AQUA 2XGIA 4M29A 3IJ7A 5BROA 3RM4A 3TTSA 1QNOA 3AICA 2OSWA 3KL3A 4W87A 3ARYA 3T2QA 3VNYA 2B31A 3L4WA 3CZ8A 4AZ6A 3SUSA 1FP8A 2FHFA 2BVDA 3MS8A 4CUCA 1QW8A 3GYCA 4XUYA 1NOFA 4AZGA 4J3SA 1WZMA 3WEZA 1J18A 2XPKA 5D4YA 2JFEX 2GJXB 4PMVA 3K8MA 2BXYA 5FD0A 2OSXA 1QPKA 2VVSA 4N0RA 1Q6CA 4HA3A 1E43A 1B0IA 4QCEA 1OGSA 4QLJA 1HN1A 1KGUA 3VMNA 4CKQA 5A95A 4M56A 4J3XA 4V28A 4Z2GA 2E4TA 1TA3A 4XX6A 1JZ4A 4JFTA 3EYPA 2QLYA 2D0FA 1G01A 5CPTA 3AIEA 3SCVA 1KB3A 3VM7A 2D0HA 2FHCA 3OLDA 7A3HA 5ABFB 4UR9A 1GJWA 1QHPA 2YBUA 2E8YA 3M07A 4KGLA 1JYWA 1DWJM 4H2CA 4CD7A 2WZHA 2XTKA 1JZ5A 4XB3A 1TVNA 1WDQA 3AHZA 3BAYA 1B3ZA 4PBGA 2GDVA 3RPMA 1UWQA 2D3NA 2WVUA 2X0HA 1QI5A 1EOMA 1UWSA 4YN5A 2V3GA 4IPNB 4W8BA 3U5UA 1ZBCA 1XHGA 2XIBA 3WF3A 4JL1A 5A8OA 1G9HA 2VL4A 1ZS2A 2XIIA 2PWHA 1UR4A 3BAIA 2OWWA 4OZOA 2WBKA 1HKJA 1BG9A 1O6IA 4PTXA 3RDKA 1J0JA 4R27A 2D0GA 4J3WA 1BPLB 3KEHA 5HPCA 1J10A 4TVDA 3U57A 4RE2A 1MQPA 1U33A 2PBOA 4PMRA 2WHJA 4GI6A 4CN1A 4OBSA 1GZJA 2C7FA 4CD5A 4HA4A 2BY3A 2W62A 2J4GA 4D71A 4OBRA 4E8CA 3CZJA 3WNKA 3CLWA 4JL2A 1AQ0A 2WCAA 1GCYA 3N04A 4UOQA 4ZXOA 2WVVA 1JF5A 4QP0A 3CUJA 5CSYA 3MO4A 3MSGA 3L4UA 3VMOA 1BYBA 1DHKA 4PMNA 2ZE0A 2X2YA 4KRUA 4QCFA 3VX1A 1WAWA 3W28A 2YA2A 4BQ5A 2J75A 4MB1A 1B3XA 5KZ6A 3I3BA 1UH4A 3L4ZA 1PX8A 3CZLA 1V0LA 2Y5EA 1VEMA 1B3VA 1FH7A 4F66A 2XFRA 1XD0A 3AROA 2VQUA 1JDDA 1KQZA 3AIVA 1D7FA 3L4VA 2E3ZA 2ZUTA 3DHPA 4UTFA 2UY5A 5HXMA 1TFVA 2DT2A 1V6VA 3AIRA 1CGXA 4CD4A 3VU2A 3PZ9A 3PZQA 3II1A 4BQ3A 2VUYA 1K9DA 4LYQA 3VGFA 4PMUA 5E9AA 3VGGA 1B90A 1W9BM 1XH1A 2XVKA 3WSUA 1H41A 3NYDA 2CBVA 6CGTA 3WDHA 3IAQA 3A47A 2VX7A 2BNJA 4B3KA 3VD9A 3FW6A 3ARXA 1UD3A 3GM8A 3M6DA 4AD4A 1QI3A 1V3HA 2W91A 3AS3A 3ZSTA 1B9ZA 3POHA 1JXKA 1VIWA 2ZUUA 3QR3A 2WPGA 3PTKA 3VIOA 3SCUA 3O2LA 3DYPA 3VGHA 1U30A 5A2BA 2G3NA 2XHYA 1C93A 1HJSA 3N17A 4CD6A 2ZUWA 1DTUA 1XV8A 2ESCA 4B9YA 3PTMA 4GXPA 2RGLA 3CUIA 5GNZA 3W81A 1E0VA 3WFLA 3WUGA 2GK1B 3CUGA 1JYXA 4QAWA 5C71A 3AZRA 1Q6FA 1MWOA 4OUEA 2YOCA 2DSWA 4GO8A 5CPQA 1GPFA 3BGAA 4P8VA 4ML4A 1W2VA 2DH3A 5I5RA 3AHVA 4KRTA 2O9TA 1V3IA 2ZUNA 2YL5A 4LYRA 1KQYA 3RJYA 1WCGA 2ZXBA 1EDGA 3WH9A 1M7XA 3RM8A 1IT0A 2DIEA 1ECEA 3A6OA 2EO7A 1UWUA 1WKYA 4D6JA 2E9BA 1RH9A 1CBGA 4YHEA 1SMAA 5A6SA 1XSJA 1NOUA 4U2ZA 1V3JA 2IXUA 1EHNA 2ZXAA 1VBUA 2G41A 1ISZA 1E56A 4HTYA 4CU7A 5A6KA 2YL8A 2D3LA 4UQBA 2CITA 4JFUA 1JFHA 4YHGA 1LWHA 3WUFA 4CU8A 5TD4A 4JFSA 3WF4A 2TAAA 1E1FA 3SIMA 4JHZA 1F4HA 2VMFA 2X8RA 5BXPA 3VIFA 4OIFA 3RCNA 2C8NA 3SCNA 4Y7EA 1KBKA 1PX3A 3PZTA 1NOWA 4C7GA 5HOSA 4GQRA 1LQ0A 4TTUA 1UD6A 2WHMA 1E70M 1B30A 2Z1SA 2W67A 3WUBA 5A94A 2WXDM 3N15A 5D8WA 2WSPA 1EGZA 5BRPA 2VRJA 1TVPA 1XGZA 4HZ6A 1E0XA 1MQQA 2YL9A 3MSDA 5LA2A 1DWAM 1B1YA 4DUXA 2C0HA 1OIFA 1JD9A 2ZIDA 2PWEA 5I79A 1NWSA 3CUFA 4CCEA 2VCBA 1QI0A 3UEQA 1CXEA 1NQ6A 2BHYA 2Y2WA 4UZUA 2FDMA 3BMVA 2FGZA 2Y4SA 5DFAA 4N42A 3ZO9A 5JBFA 1HIZA 2CERA 1RP9A 1V3LA 2J25A 4PTVA 4K68A 3WMBA 1QOXA 2JF7A 1CXKA 3HMCA 3FN9A 3OIHA 4W7WA 4AW7A 2E40A 3SEPA 1ZU8A 1BSIA 2D20A 4PTWA 1B2YA 1NP0A 1CZ1A 1ZL1A 2J79A 2V38A 5F7UA 3NIYA 2FGLA 1DWHM 1V3KA 3FY1A 4EAMA 2DDXA 3W25A 2WWCA 3CMJA 4C7DA 1L0PA 5D9PA 1E15A 5CGTA 2OSYA 5I78A 4F9JA 2V5CA 1GOOA 3ZR5A 2WMIB 1C7TA 3AXXA 1BAGA 1W1YA 3GXIA 1SFSA 2QV4A 2AMGA 3VIHA 1UH3A 1UR2A 1UKTA 3SUVA 4W86A 3ARZA 5DT5A 1GQKA 7CGTA 1JI2A 4OOZA 2O9PA 4ATDA 4B9ZA 2CBIA 3RIKA 3SCQA 3WBEA 3QOMA 4KWUA 1EDTA 1HJWA 3K46A 1GUVA 2BS9A 1RP8A 4DM2A 1MQRA 3RILA 2OYKA 1HJUA 3WNLA 2J78A 3PTQA 1WZAA 4EKJA 2VRKA 3U7VA 1KR0A 4PMXA 2FH8A 4UOJA 1R7OA 1JGIA 5EFDA 1W9PA 1M04A 1QW9A 3GNPA 2FH6A 1V6XA 4WKHA 3CO4A 3VO0A 5I6SA 4DUWA 4W5UA 5CSUA 3T0DA 3ZJKA 2VZSA 4IISA 1WZLA 4WSJA 3WEMA 5A6BA 1LLOA 1MFUA 3F4VA 1A3HA 1CXFA 2DIJA 2XVLA 3AMGA 3T09A 4UQDA 2VR5A 3VILA 1E4LA 3MMWA 1DWIM 1R86A 4DWSB 1AMYA 3N9KA 4NRSA 1XRVA 1CYGA 1QNRA 5IXEA 1HJVA 3MUY1 5AY7A 3BAJA 3NSNA 1P6WA 3AIQA 1VFUA 4KMQA 5E09A 4CVUA 4P7RA 2VX5A 2IXVA 4H41A 1DP0A 5JUVA 3AYRA 5A2AA 3W53A 2WHLA 2GVYA 4BQ2A 1WPCA 3SUTA 5I3DA 4FLOA 2XWDA 1GOMA 1US3A 1F4AA 9CGTA 3D3AA 2PF0A 1VAHA 2X05A 4AZBA 1XYFA 3I3EA 1E1EA 2CKSA 1GONA 1OD8A 1KCKA 1SR0A 2W5FA 4AXNA 2YDRA 2V3FA 1MFVA 2VRQA 3HJEA 1V6WA 3ALFA 3WNOA 4EANA 1X6NA 1GW1A 5HDRA 4UOZA 1H2JA 2WANA 3FAWA 3UR7A 4GINA 3W24A 4QFUA 3OGVA 2EPNA 2CNCA 1J01A 1AVAA 4UFIA 4PSPA 3EDDA 3WF1A 1LL7A 3BAXA 4AZCA 4W89A 4LPCA 1G94A 2JIWA 1EHAA 4U5KA 1ZBWA 1FH8A 3W0KA 1KXVA 3GXFA 2A3BA 3VD5A 4M81A 3VIKA 3AIBA 1BVNP 1JIBA 3K4DA 4D6DA 3SCSA 3UR8A 2VC9A 4S3KA 2EEXA 1V02E 3THCA 1HVXA 4HZ8A 2W92A 1UD8A 4KGJA 3VIJA 3T2OA 1V0KA 3HN3A 1UZ1A 3WH7A 3ZT7A 3GH5A 3VDAA 1EXPA 4B3LA 1LG1A 2E8ZA 1UR8A 5DMYA 4E4PA 2BHUA 1UG6A 2NSXA 3AHXA 1VEPA 2DT3A 2UY3A 4MNMA 2ZX7A 1VFOA 1UKSA 1E0WA 2PBGA 2WMJA 2WM0A 1IV8A 1TE1A 3MUZ1 3ZR6A 2CETA 4BF7A 1W9XA 1QNPA 3VIGA 3THDA 4HPGA 2A3HA 2GUYA 4EE9A 2WC7A 2DSVA 2XM2A 2J8GA 4C7FA 1G5AA 2JALA 3AS2A 3MMUA 2J7EA 1PX4A 1W32A 2PWDA 3ARVA 5CXPA 1ZB5A 4UCFA 3OG2A 4D6CA 4FK9A 4IPLA 2J7GA 4AWEA 1FP9A 1GHRA 1WE5A 3VD7A 3VNZA 3PZUA 2J47A 1V03A 2YJQA 4W7VA 3S6TA 4RE3A 1EO5A 2XWEA 2PWGA 4U3CA 4KH2A 1JAEA 2V3EA 3AMCA 3DC0A 4F79A 4WJXA 4ZENA 2E9LA 4H8HA 1ODUA 1EDQA 3NDZA 5A6LA 5CLTA 3DHUA 3NCOA 4D6FA 1BYCA 4UNIA 3OB8A 1K9FA 2ZWYA 3WD0A 4ACZA 5FKYA 3RO8A 3PZGA 3UG3A 3GZAA 3SCRA 4TUFA 4MNJA 1W3JA 3WKZA 2G3JA 4UZSA 3EMZA 1ISYA 3AMLA 2VJXA 4J7RA 1ZJBA 4BCEA 1PZ2A 3B8SA 2VNCA 3SCOA 1UR9A 2IUZA 2ZX5A 3WENA 3AS1A 2YBTA 2Y24A 2XSAA 1JG9A 5GNXA 3UESA 2XUCA 1MXDA 2XG9A 1ITXA 1UQZA 5DT7A 4AC1X 4ZXLA 1D3CA 4CD8A 5BYWA 2HVMA 3WY1A 1FFQA 3BXWA 3GTNA 4AIOA 1GORA 4U3AA 1M53A 4AZIA 3TTOA 3WNNA 1QVBA 4JKLA 3W82A 2EPMX 4WIWA 2W63A 4NRRA 3JUGA 4FLQA 2QF8A 4J3VA 3N18A 1K9EA 1WB0A 5IHSA 3FXYA 1W3HA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1VJZ A;  3VX0 A;  2J62 A;  1GOI A;  4UQE A;  1C7S A;  1HT6 A;  1XC6 A;  3ART A;  3PZV A;  5CQ1 A;  1BGA A;  1EQP A;  4JIE A;  4AYS A;  4MJ4 A;  3A4X A;  3FND A;  2J7H A;  3VKK A;  1G0C A;  1TA3 B;  2ZIC A;  1JZ6 A;  3VD3 A;  3VUP A;  1JXJ A;  4WSK A;  4ZE5 A;  3MKK A;  4W88 A;  3WDI A;  3TA9 A;  3NSM A;  5A2C A;  3W26 A;  4X0V A;  4PUD A;  5AYI A;  4AZC B;  2WHK A;  4JHO A;  2BV9 A;  2XSB A;  2VVN A;  4CGT A;  1CGW A;  1HVQ A;  4AIU A;  4IM4 A;  3W27 A;  4NZC A;  2VX4 A;  2VUR A;  1J0K A;  4J28 A;  2VOT A;  3MUI A;  4ZE4 A;  4CU6 A;  2F8Q A;  1FFR A;  3QHN A;  4ATL A;  2VT0 A;  4LQ1 A;  2VZO A;  3CBW A;  1XCW A;  2J74 A;  1PJ9 A;  4MNL A;  3UCQ A;  3VDH A;  3WF2 A;  1UR1 A;  3PZN A;  2G4F A;  1QI4 A;  1XYZ A;  4A3H A;  2J7F A;  1PPI A;  3TTQ A;  2VCA A;  1UA7 A;  3WQW A;  4D6I A;  4GQQ A;  1V08 A;  2BFG A;  3LPF A;  3M7S A;  2ZUV A;  3AZS A;  1UR0 A;  2D23 A;  2EPO A;  2OWC A;  4Z2J A;  1I1X A;  4B16 A;  3WQ5 A;  4ZEP A;  2PI6 A;  4W84 A;  1V3M A;  4ACY A;  3OZP A;  3VGE A;  2CCR A;  1EOK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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