1H5VA

Thiopentasaccharide complex of the endoglucanase cel5a from bacillus agaradharens at 1.1 a resolution in the tetragonal crystal form
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
301
structure length
301
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRESA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Atomic Resolution Structure of Endoglucanase Cel5A in Complex with Methyl 4,4II,4III,4Iv-Tetrathio-Alpha-Cellopentoside Highlights the Alternative Binding Modes Targeted by Substrate Mimics
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
total genus 123
structure length 301
sequence length 301
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2001-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1h5vA00
5I0DA 4PMVA 1WZKA 3CGTA 1J12A 1G1YA 3BAIA 1K9FA 1GQLA 2WW5A 4A3YA 5AY7A 5C70A 2PC8A 5DO8A 4P7OA 3VGFA 3CLWA 4TX6A 3RM9A 2E8ZA 3IAPA 2GUYA 2Y4SA 4ATDA 3W6MA 2FHBA 2WNWA 2X1IA 1WZLA 3SEPA 4EANA 3CMGA 4F66A 1CGVA 3VD3A 1JNDA 5FL0A 3MS8A 3KZSA 4C7DA 4D72A 4HA3A 4E8CA 1W9UA 1XH0A 1UR4A 1HKJA 4ACYA 1MW1A 2C0HA 2XFRA 1XYFA 1NOUA 1MFVA 4F8XA 2JEPA 4D6HA 5BRPA 2J74A 5ABEA 4WF7A 1BPLB 1FH9A 3AHXA 4WSJA 2QPSA 2EPMX 4MTVA 2FHCA 2WVTA 2J47A 2VQTA 3WFZA 4HA4A 2J7HA 2OLHA 2IXUA 3CZKA 4NZCA 1E40A 4J3VA 1I1WA 3ALFA 1E6QM 1JZ7A 3CH9A 3WH6A 5GQBA 4PSPA 1U30A 2C8NA 4D6IA 4DWSD 1QW8A 5C71A 5BRQA 1SMDA 3VUPA 2CBUA 5I24A 5A2CA 2ZUUA 1Q6DA 1E15A 2XM2A 2VTFA 4E8DA 1LJYA 4W89A 4PUEA 1UZ1A 1HJWA 2WKLA 3VX0A 4PSRA 2GJXB 4CD8A 3KL3A 1V0NA 5EFFA 3LPOA 1JZ4A 4H04A 3W27A 2G3JA 4MNLA 4HOXA 1KGUA 4KRTA 4P7QA 1N82A 1NQ6A 3W0KA 3FW6A 4M24A 2W91A 3ECQA 1XSIA 1US2A 3WDIA 4X0NA 3BAWA 4X9YA 2XFYA 3PZOA 4ACZA 1HJQA 4BCEA 1YHTA 3AIBA 4PEEA 2PBOA 4QDMA 4AW7A 4M29A 1CXLA 1CPUA 1UR8A 1NP2A 4CVUA 3B9AA 1E3ZA 4J3UA 3GTNA 2WVUA 2TAAA 1VBUA 3VOCA 1V0LA 2F8QA 1QVBA 4L4OA 1TVPA 4P8VA 4YN5A 3VD5A 2VUYA 3MMDA 1EHAA 3SCSA 1C8YA 5DMYA 5D4YA 3CIVA 3QHMA 3HMCA 2FGLA 4RE2A 2C7FA 3GXMA 4GQRA 2PI6A 1W9BM 2WANA 4D6DA 1CZ1A 5BROA 1PIGA 1UD3A 1JDCA 1PIFA 3D3AA 2VO5A 2ZXAA 1E0XA 1HX0A 4J28A 4RL3A 3IK2A 1J0YA 5EFDA 2VQUA 3DYPA 4XB3A 2J4GA 4E2OA 1V0MA 2YDSA 3VGDA 5CLWA 4M1RA 2AMGA 5A8MA 4PMZA 1WPCA 4P8XA 5I78A 1UYQA 1U33A 2VOTA 1HNYA 5A8QA 2PWFA 4HZ7A 4P8WA 4FLSA 3WQWA 1KB3A 4H8VA 4UZSA 1EDGA 4FLOA 1A3HA 4JKLA 1UD6A 2XYLA 1A47A 3QR3A 2G3IA 4W8AA 4XZWA 1CLXA 1ECEA 2G8ZA 3CHEA 3CZ8A 4ACZB 1SYTA 4AYSA 1W9VA 2O92A 2JF7A 2WWDA 3G6LA 3SCNA 3WMSA 2J7EA 1JZ8A 3AYRA 2XSBA 2YOCA 1AQMA 4OJYA 3EDEA 3TTQA 3N17A 3PBGA 3ARZA 4RE4A 1DP0A 1G9HA 4U33A 3M6DA 1MQRA 1B2YA 3MV01 3ZT5A 1JI1A 1PJ9A 2DEPA 4UFLA 5E70A 3A4XA 3WUFA 3T2QA 2DIEA 1Q6GA 1VIWA 4AEEA 3PTMA 3UESA 2YDQA 3THDA 2CERA 3AS2A 1CXKA 1HIZA 1JAKA 3MUY1 3DYMA 1UA7A 2GDUA 1QNRA 4HMCA 1QHPA 1C91A 1UH4A 2A3AA 4CCDA 3GH4A 1B1YA 1HKMA 1KCLA 1E5JA 1TVNA 1CDGA 2HISA 1GOQA 3AMKA 1EDQA 1BYBA 2ZUWA 4A4AA 3W25A 3MMUA 1XCWA 2WC3A 1K9EA 2FGZA 4ATLA 4TVUA 4S3JA 4MDPA 2YDRA 1WZMA 3I3DA 1PPIA 2QHAA 1I1XA 1JAEA 3CHDA 1CIUA 4MB4A 1HT6A 4U2ZA 3PN8A 1ISXA 4EKJA 4GO8A 1KXVA 1RP9A 1HJXA 3AIUA 4UOJA 3W4RA 4ATWA 4TUFA 2YA1A 1W1PA 1GJWA 1ZBVA 1FHLA 2VZVA 2WBGA 2WMJA 4UFHA 4W7UA 4CUCA 5AYBA 1WNOA 3AOFA 1E4MM 3L4WA 4XX6A 3RMEA 1E4NA 3WDPP 4Z2JA 3A4AA 1CGTA 4W8BA 2O9TA 3F5JA 1QPKA 2DH2A 2NT0A 1IZKA 1UD2A 3L2MA 3WL0A 1W1YA 1CXFA 1OBAA 2JIEA 2J62A 5FD0A 1C7TA 3L4TA 2E9BA 4PMDA 1HXJA 8CGTA 3ARRA 4PCTA 1JD7A 4JHZA 3MUAA 1NWUA 1UWRA 1G5AA 2OYMA 2CESA 3WBEA 2FDMA 3WNKA 1JYVA 3WD1A 1H49A 1HP5A 1W32A 4YHEA 4Y7EA 1CTNA 4CU6A 1E9LA 4JFVA 1K9TA 2E9MA 2QMJA 2W4XA 3VM5A 2UY5A 1JGIA 2WYSA 4AD4A 4FMVA 1V02E 1KXQA 1EHNA 2ZX6A 1F4AA 2WZHA 4N0RA 3E1F1 4GI8A 3WQ5A 5A6LA 1E72M 3ZIZA 4JIEA 1WDRA 1ITCA 2VL4A 2WC4A 3VDCA 5DEZA 1DWGM 3EDJA 1M04A 2EJ1A 1JI2A 1M7XA 5CQ1A 1QOXA 3ZT6A 1KR0A 4W5ZA 2X09A 2ZUVA 4LPCA 1JZ6A 2AAAA 1E0VA 2OWWA 4C7FA 5I23A 4Q7NA 3AZRA 3WH8A 1JZ2A 3W38A 1WKYA 5HOSA 5E0CA 2CKRA 5A8OA 4UR9A 3NSNA 3GH7A 3MUZ1 5EBAA 2V38A 3POHA 7A3HA 3SCPA 1TUXA 1H5VA 1RD6A 1OT2A 1ZB5A 4U31A 3NJ3A 2F61A 2W5FA 1O7AA 1C8QA 2A3HA 3W81A 4S3KA 3T0BA 1FP8A 1NWSA 1E1EA 3ZSTA 4MPKA 1JF6A 2ZXDA 3FAXA 5ABHA 3WSUA 2QPUA 1LF1A 4GZEA 1E55A 5A6BD 1QI5A 1J0IA 3VX1A 4P7NA 3WD4A 4UQBA 3HN3A 3AXXA 4AY1A 2W92A 5ABFB 1Z32X 3ARVA 3ZJKA 4UOZA 3MO4A 3BAJA 5HDRA 1TE1A 1GVYA 2XIBA 2YBUA 8A3HA 4CU8A 1SMAA 2YL9A 2XVLA 2DSWA 1KGWA 4GI6A 4Q22A 2G3NA 2DDXA 1R7AA 3WNNA 1B3VA 1GOOA 1EGZA 2BVYA 2JFEX 3TP4A 3AIQA 2XIIA 4KMQA 1OD0A 4LYQA 1HJUA 4UZUA 4JCMA 2J77A 3IANA 3W82A 2OSXA 1GPFA 2A3BA 2OSYA 5LA2A 1OT1A 3ARUA 3WMCA 1MW0A 4DM2A 4BQ5A 4TVCA 3SUWA 2W63A 3AIWA 3K8MA 1PZ3A 1QNSA 4HZ8A 5D8WA 3WQVA 1JF5A 4GIAA 3VKKA 1MXDA 1E3XA 3N1AA 5CG0A 3IJ7A 1PZ2A 4LXFA 1XSJA 1GVIA 5I3DA 5A8PA 2D22A 5I5RA 1DTUA 2VX5A 5AC5A 1L8NA 2XVGA 3WF4A 5ABGA 2WB5A 3VIHA 1E73M 2VC9A 4F9DA 2EPNA 1MWOA 4NF7A 4WK9A 4CN6A 1E6RA 4GI9A 5HXMA 5I77A 4ZE5A 3VDHA 3L4ZA 1ISZA 3KL5A 4PMYA 2GJXA 5FOOA 3VGEA 3VMPA 2PBGA 3NDZA 2E40A 1UKQA 5A94A 3J7HA 1GW1A 1JXJA 4H8HA 1J0HA 1W9PA 4AD5A 3UERA 1UWTA 3EYPA 1TZ7A 3PZQA 1VBRA 4N42A 2ZUSA 4W86A 1QW9A 4JFWA 2D0GA 3TOPA 4AZ7A 4BZYA 1R8LA 2BXZA 4ZEPA 1IV8A 2ZUTA 1VF8A 4GXPA 5KZ6A 3WY1A 4U5IA 1SR0A 3O2LA 3PTQA 4CD6A 2DGAA 1H3GA 4A3HA 1WP6A 4GZIA 4WKAA 4AXNA 4MAVA 1KFWA 4D6JA 3AROA 2VNCA 4UTFA 1GUVA 4ZXOA 3RIKA 3OGSA 4AC1X 3M07A 4HP5A 3SCQA 3L4YA 4ML4A 5I2UA 4W7WA 3RILA 5CPSA 4FK9A 2GSJA 1VRXA 1EQPA 6A3HA 3AS3A 3I3EA 1UZ4A 3U7VA 3UG5A 1FH7A 2CBIA 5D9PA 2NT1A 4JHOA 3AISA 3JUGA 3ARTA 4AD2A 3ARXA 1PX3A 3A4WA 1CGWA 4DUXA 2FHFA 2J7CA 1XYZA 1VENA 1XV8A 1K9DA 4F9JA 5JUVA 5DT5A 2YIHA 3OLGA 3VM7A 3CMJA 3L4VA 4H2CA 4PTVA 3L4UA 2EQDA 1OGBA 3NDYA 1GQKA 3W24A 4UQEA 3U5UA 3AIVA 3NUKA 3SCTA 1EO5A 1OGSA 2PB1A 1CEOA 2WMKA 2GVYA 1TR1A 4HA1A 4MAZA 3VIJA 2DSZA 3WUBA 1MW3A 1ODZA 3L2LA 3CZLA 1NOFA 2OWCA 2XUCA 2CXGA 2Q8XA 2CPUA 1UR1A 3CHFA 3A47A 1RP8A 2YA2A 4V2XA 3RPMA 3VO0A 1YQ2A 3ZM8A 3GYCA 2ZICA 4UFJA 5GNXA 1GORA 4PRWA 3EMZA 1UH3A 1PBGA 1BGAA 1V3IA 1ITXA 2VCAA 2YLAA 1UQZA 4MB5A 1PEZA 1WCGA 1LL4A 3K4DA 2D2OA 1UWQA 3PHAA 2VZTA 3L4XA 4RE3A 1VAHA 2GK1B 2E8YA 3U5YA 5CGMA 3ZT7A 2VRKA 3VD7A 3CUJA 4JFUA 3GH5A 2F2HA 2PWGA 3DYOA 4J3TA 3FN9A 3NSMA 4JKKA 2ZX9A 2J8FA 1FP9A 4CN4A 3GBEA 4PCSA 2V5DA 4Z2KA 1ZBCA 2CITA 1EA9C 5A2AA 3II1A 4W88A 3W53A 4OUEA 1J0ZA 4BS0A 3WFLA 3MKKA 2DSUA 1E6XM 5CGTA 3AMCA 4JFTA 3WNLA 9CGTA 3F5KA 2CYGA 3A3HA 4M80A 1V6XA 4KH2A 4UOQA 4BQ3A 5A2BA 3VVGA 1GQJA 2W61A 1V6VA 3W6LA 2D1ZA 1W3JA 4CKQA 3GNPA 3ZR5A 1C7SA 3AMGA 1PX8A 3NYDA 3K4AA 1EH9A 3WH7A 1S46A 2O9OA 4UQDA 2MANA 3PZUA 1OWQA 3TTSA 3WEMA 1QNPA 3GDBA 3GXDA 4DUVA 3W37A 3UETA 1OD8A 2CCRA 2WBKA 5E09A 3AS0A 1Q6FA 3RDKA 2YL8A 4IPLA 1VFUA 3CHCA 2CBJA 1LL7A 4MNMA 5BXSA 4JZ5A 1J0KA 3GNOA 1BVZA 1O6IA 2EBNA 3MUIA 4U3AA 4AD3A 1EOKA 2WC7A 2PWDA 6TAAA 3AIRA 1UKSA 3K8KA 1HN1A 2DT3A 5E9AA 1B31A 2WK2A 3OLIA 5KEZA 1AMYA 4AZ5A 2DSVA 3CTTA 4AWEA 4B16A 1GCYA 4BQ2A 5LA1A 2FH8A 4UQCA 4CD5A 1GOWA 3EDFA 5A6BA 4C7GA 1OB0A 2IXVA 1JXKA 3BLKA 2UY3A 3LPFA 4X0VA 4CCEA 1JYXA 3OZOA 5A3HA 3T2OA 1VEPA 4TOQA 3UR7A 4HMDA 3FXYA 3EMCA 1JNEA 1OGGA 2VRQA 4XZBA 2EEXA 4OIFA 1JZ3A 4W8LA 3VTRA 2WLYA 2ZX7A 1EDTA 3WDJA 1V6WA 4MB1A 3NSXA 1CYGA 2DQXA 1ISWA 1HP4A 3VD4A 1UKPA 1WAWA 3VPLA 1BVNP 4PBGA 3PTKA 5AC4A 1FA2A 2V3EA 3AZSA 2J7DA 5HPOA 5CPQA 4F79A 5BXTA 1UH2A 3VMOA 2BV9A 4QLKA 1BYDA 3BMWA 4J3WA 2D24A 4XV0A 2ZOXA 2XWEA 3VU2A 3IJ9A 4MADA 2CEQA 3SCOA 4JAWA 5HNNA 1C3FA 1I75A 1UWUA 1EO7A 1UR2A 3KWXA 1OSEA 4EE9A 1HVQA 1CGUA 4WKFA 4UCFA 1E6NA 2WMGA 4Z2IA 1U2YA 1E1FA 4JKMA 3FNDA 1W1VA 3OGRA 5C8BB 2PWHA 4GO9A 4WLCA 5M03A 1KQZA 2OWXA 3DC0A 2ZIDA 4HZ6A 1UR0A 2CBVA 1DWAM 1EQCA 2XJ7A 1V3LA 1VFMA 1X1NA 3AZTA 3ZO9A 3B8SA 2BY1A 2YJQA 4QFUA 5BCAA 4UFKA 3AS1A 3BSGA 4MB3A 1G01A 5D9NA 3THCA 5FKYA 3ZJ8A 4D71A 4FLQA 4E4PA 1J18A 3AICA 3KE0A 2XSAA 2WMHA 3AHYA 4R27A 2RGMA 5TD4A 1UWSA 4WSKA 1GZJA 2D20A 3U7BA 4B9YA 4J3XA 3SUVA 4ZENA 3VIOA 5LA0A 5ABFA 4BA0A 4GZJA 4OZOA 2ZUNA 2A3EA 3AHTA 3VIPA 1ISVA 1QHZA 1QI3A 2D0FA 1M01A 1XRVA 1CBGA 2Y8KA 1QBAA 1ZJBA 2CNCA 1HF6A 4CU7A 3WN6A 2HVMA 3POCA 2J75A 3PZMA 1VFFA 2BVTA 3NCOA 2D23A 3ARWA 3OIHA 3QHNA 2EPKX 3VD9A 1W2PA 4QLJA 2UY4A 4CD7A 1KXTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5I0D A;  4PMV A;  1WZK A;  3CGT A;  1J12 A;  1G1Y A;  3BAI A;  1K9F A;  1GQL A;  2WW5 A;  4A3Y A;  5AY7 A;  5C70 A;  2PC8 A;  5DO8 A;  4P7O A;  3VGF A;  3CLW A;  4TX6 A;  3RM9 A;  2E8Z A;  3IAP A;  2GUY A;  2Y4S A;  4ATD A;  3W6M A;  2FHB A;  2WNW A;  2X1I A;  1WZL A;  3SEP A;  4EAN A;  3CMG A;  4F66 A;  1CGV A;  3VD3 A;  1JND A;  5FL0 A;  3MS8 A;  3KZS A;  4C7D A;  4D72 A;  4HA3 A;  4E8C A;  1W9U A;  1XH0 A;  1UR4 A;  1HKJ A;  4ACY A;  1MW1 A;  2C0H A;  2XFR A;  1XYF A;  1NOU A;  1MFV A;  4F8X A;  2JEP A;  4D6H A;  5BRP A;  2J74 A;  5ABE A;  4WF7 A;  1BPL B;  1FH9 A;  3AHX A;  4WSJ A;  2QPS A;  2EPM X;  4MTV A;  2FHC A;  2WVT A;  2J47 A;  2VQT A;  3WFZ A;  4HA4 A;  2J7H A;  2OLH A;  2IXU A;  3CZK A;  4NZC A;  1E40 A;  4J3V A;  1I1W A;  3ALF A;  1E6Q M;  1JZ7 A;  3CH9 A;  3WH6 A;  5GQB A;  4PSP A;  1U30 A;  2C8N A;  4D6I A;  4DWS D;  1QW8 A;  5C71 A;  5BRQ A;  1SMD A;  3VUP A;  2CBU A;  5I24 A;  5A2C A;  2ZUU A;  1Q6D A;  1E15 A;  2XM2 A;  2VTF A;  4E8D A;  1LJY A;  4W89 A;  4PUE A;  1UZ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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