1HEQA

Structural and thermodynamic analysis of compensating mutations within the core of chicken egg white lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNSQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITATVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords HEN EGG WHITE LYSOZYME
publication title Structural and thermodynamic analysis of compensating mutations within the core of chicken egg white lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1heqA00
4IJ4A 1BB6A 1LJ4A 4NIJA 4XJGA 4ANRA 1GB0A 5KKJA 3T6UA 1OUBA 1YAOA 1IP1A 3P64A 4BADA 4WG1A 1LSAA 5B59A 4YEMA 1YAQA 1JPOA 1RI8B 1C46A 4CFOA 4WLXA 3OK0A 1IWXA 2CGIA 4NHSA 1CJ9A 1AKIA 5ILFA 4G4CA 1QSWA 4NGZA 4NGYA 1WQMA 1HEPA 1LSBA 3D9AC 4HPEA 5KXLA 1OQMA 1B7OA 1LSZA 3CSRA 1IO5A 1XGQC 3WYHA 3N9AA 5FCPA 1JJ0A 2EPEA 1GF9A 1FN5A 1MLCE 5L3IA 1SLYA 2BQOA 1HEMA 3QE8A 4W94A 2Z2FA 4HP0A 1VDQA 4H90A 2DQJY 1JTPL 1YKZX 2C8OA 1LHJA 1LMCA 1UUZC 3LYTA 1YAPA 3HBHA 2B5ZA 2BQKA 1LZ6A 1C45A 2XBSA 1LJHA 4FJRA 1XSFA 4KT3A 1BB7A 2DQCY 4WM6A 1LZDA 1G7LC 4HJVA 2Z39A 4LYTA 4NFVA 2ZYPA 3AGIA 2BQMA 3CQLA 2W1YA 1GE4A 3LZTA 1JKBA 5DL9A 1LZRA 4X3BA 4XJBA 3W6DA 4XN6A 154LA 1IOTA 3A91A 2YSSC 1B5WA 4H9AA 4NHQA 1RCMA 1WQQA 2MEAA 5I54A 4NEBA 3AW7A 1B7LA 4H94A 1IR7A 1OUGA 3BKVA 4ETBA 4DD7A 4BAFA 5EBHA 5APEA 1J1PY 1LSPA 5I4YA 1CKHA 3IJVA 4DC4A 1GE1A 1HENA 4J0LA 4H8XA 2FBBA 3A92A 1UIFA 1BVXA 2ZWBA 1HMLA 3RU5A 1JSEA 135LA 1CKFA 2F2NA 1DI3A 3RZ4A 2MEEA 1JWRA 1RFPA 4HTQA 2AUBA 1PZYA 4Z3MA 5L9JA 4QGZA 1MELL 1CKDA 1J1OY 4J7VA 3TXKA 1GFAA 4LT2A 3EXDA 1D0MA 3CT0A 4H9EA 4I8SA 3EMSA 3VWOA 3AZ7A 4N8ZA 4N9RA 1DQJC 2MECA 1FLYA 1WTNA 3ZEKA 2BPUA 1GBSA 4A7DA 5HLLA 1LZBA 5FHWA 1IVMA 1AT6A 4PHIA 1D6QA 5D5CA 1TAYA 5HNCA 5IHGA 1IY3A 1GB3A 4W96A 1LZ9A 1ALCA 2BLYA 4H8ZA 4L41A 5LAFA 1YANA 4GCEA 2EKSC 4HTNA 2YBMA 2WARA 2IFFY 2ZIJA 3A8ZA 4WM2A 4B0DA 3TMXA 5LA5A 5E9RA 1IP7A 1JJ1A 132LA 3ATOA 1FKQA 2DQIY 2HEEA 4NGOA 2BQAA 1CJ7A 4RLNA 1IOQA 4RW1A 4OWCA 4PRUA 5FSTA 4NHPA 5HMJA 5I53A 1LSYA 1RE2A 5I5QA 3AZ6A 3TXJA 3WUMA 3A6CY 1BQLY 2Y8PA 4LYBA 1LJIA 3MGWA 1LSMA 1GFEA 1LMQA 6LYZA 4HV2A 5D5FA 5B05A 2BQCA 4MR1A 3KAMA 1B9OA 3TXIA 3WPLA 5KXKA 3WW5A 4OW1A 4HJYA 1V7SA 1EQEA 3IJUA 4ET8A 1BWIA 5I4XA 1QQYA 3A34A 1IWUA 1DZBX 1VATA 1UIGA 1IX0A 3CT1A 5ILCA 1WTMA 1YL0X 1CJ8A 5K7OA 1DPWA 1QIOA 4J1AA 2ZIKA 1HFXA 2Z18A 1OP9B 4H9HA 4H9IA 5IDDA 2C8PA 5B07A 4NG8A 1LMPA 1BVKC 2ZYCA 4P2EA 4ML7A 4NSHA 4DD2A 1LJKA 2HUBA 1EQ4A 1REMA 3B0KA 5KXTA 4XYYA 5KXMA 1LYZA 2BQIA 1WVVA 4NSIA 5APFA 3ULRA 4KL7A 4H93A 4DT3A 4B49A 4YF2A 3ATNA 4NGLA 5KJ9A 2G4PA 1IWWA 5HMVA 1ZVHL 1LMNA 4YM8A 1CKCA 1REZA 4DD1A 1WVUA 4TTDA 2DQEY 194LA 4WLTA 1AM7A 3WH1A 1GB5A 1EQ5A 1HEQA 1LZYA 1B0DA 2VB1A 5E4PA 3A90A 3IWRA 1LHMA 1ZMYL 1IC5Y 4XJHA 1XEIA 1NDMC 5F81A 1LZNA 1T6VL 4LYOA 1OUDA 1REXA 1W08A 4XJIA 1KIRC 1VDPA 1BWHA 1B5XA 2ZILA 4ZFPA 5F9UA 5LVKA 2HU1A 4NGVA 2MEIA 1LMOA 3WU7A 1LZ1A 5LVGA 134LA 1GF3A 1XEJA 1CJ6A 2FYDA 5KXNA 3WU8A 4NSJA 3TXHA 4B4JA 4DDAA 4LFXA 1GAZA 1IP6A 1D0LA 1GF8A 1AT5A 1VEDA 1XGTC 4AGAA 2MEHA 1DKKA 5DN5A 2BQDA 6LYTA 2W1LA 3G3BB 1B5YA 1LYYA 207LA 4WLYA 3TXEA 2XBRA 2FYCA 1LAAA 3HFMY 1GBZA 2X0AA 3W6BA 5APCA 1H6MA 1OUJA 2IHLA 4HV1A 4GCDA 2Z38A 4LT0A 1KXYA 4E3UA 4IASA 4O34A 3AYQA 1HNLA 1GF0A 3G3AB 3W3EA 5LXWA 1FBIX 1HHLA 3AW6A 4ETAA 2MEBA 1JKDA 1B7RA 2ZQ3A 4IATA 1EL1A 1JUGA 2BLXA 4TSCA 1N4FA 5L3HA 3WVYA 4DD9A 9LYZA 3M18B 3FI7A 3AJNA 3W6EA 1JTOL 2H5ZA 5C6IA 4LGKA 4ETEA 1XGUC 1LZEA 4NGIA 1JSFA 1B2KA 3B6LA 2DQAA 4G9SA 1YL1X 4Z98A 4H9BA 2DQFC 5DN4A 2D6BA 4M4OA 1C10A 1QTEA 1GD6A 2BQNA 4N1CC 2RSCA 1LJGA 1WQPA 1ZV5L 4H91A 4XJFA 3P66A 1IWTA 2MEGA 3P65A 3CSQA 3WW6A 5KXRA 1LZCA 2ZQ4A 1BWJA 1LJ3A 2D4IA 1QTKA 4GLVA 4R6CA 5F16A 1F0WA 4RW2A 4OWBA 1LHHA 1QSAA 5APDA 1NKHA 2D4JA 4J1BA 1NF5A 2ZNWY 3EBAB 3K3TA 2BQFA 4WOAA 4DDBA 1LMTA 1T3PA 1YROA 4TWSA 1LYSA 4YEOA 1O23A 2Z12A 1KIQC 1B7SA 5LA8A 3TMWA 4RDSA 4PJ2C 1GFGA 1XEKA 3AZ4A 1G7MC 1LKSA 1NBYC 4DWXA 2Q0MX 5LVHA 2BAAA 1GFVA 1JIYA 1YAMA 1LHLA 1NWGA 3A6BY 2EIZC 4N5RA 1B5ZA 5A3EA 4OWAA 2Z19A 3A96A 4WL6A 4C5FA 5KXPA 4ZIXA 1DKJA 2A7DA 2W1XA 1YKYX 3WPKA 1LCNA 1OUFA 4II8A 153LA 2HEAA 1KIPC 4HJZA 4HTKA 1TCYA 1IR9A 1BGIA 1IR8A 3D3DA 1IWVA 1JJ3A 4FDYA 4GN5C 3OJPA 1UIBA 1D0KA 1JEFA 1IP4A 3J4GA 1LZTA 3LYOA 1BB4A 1LMAA 4H9CA 3TXBA 2YBIA 3WVXA 3EO5A 1LSEA 4PPOA 2W1MA 4N1EI 1YILA 2HU3A 1RJCB 3AZ5A 4OOOA 1JKCA 5LYMA 1GDWA 1OUCA 7LYZA 1NHEA 1GFUA 2I26L 4QDNA 1HEOA 3AGHA 4R0FA 2ZNXY 3WUNA 5LVIA 1XGRC 1V7TA 2I25L 1VFBC 1HC0A 1LSGA 3LYMA 1LKRA 3B0OA 1LJNA 1E8LA 3A95A 3E3DA 1UIDA 4C3WA 1B7QA 1LSCA 2A7FA 5J7CA 4NGWA 5LIOA 5DLAA 3WL2A 1B5VA 5KKIA 1G7HC 1GB7A 1UICA 1GBOA 2Z2EA 2Z37A 1LPIA 4CGEA 1GBYA 2DQDY 1G7JC 2CDSA 1JKAA 5B1FA 4WM4A 1OUAA 5F9XA 3HBEX 3CT5A 1GF5A 4LZTA 3QNGA 1GB6A 4M6DA 4NWEA 3B0IA 4ET9A 4N0JA 2DKVA 4NHTA 4G4BA 3WU9A 1F6RA 2CJLA 1IOSA 2D4KA 5JENB 2BQHA 1VDSA 2YDGA 4CFPA 3J6KA 3A94A 4YENA 4ETDA 2FBDA 2LYOA 3CB7A 1SQ2L 1UIHA 1WQOA 4NGJA 4H1PA 1OUEA 4LYCA 1GEZA 1A2YC 3GXKA 3RW8A 4EMNA 4QY9A 1D9UA 4CJ2A 4KPMA 1I56A 1LSNA 3QY4A 4KXIA 1UIAA 3LN2A 1UBZA 4GN3A 2HEDA 3LZ2A 5FDJA 1IC4Y 3TMVA 2DBTA 2XJWA 3TXFA 5C6LA 2F4GA 5KY1A 1HELA 4MSTA 4QEQA 2BQJA 1B7PA 5F14A 2BQEA 3N9CA 3W6FA 4ZEEA 1YQVY 4PGJB 1IWZA 1JHLA 5AMYA 4LYZA 4LYMA 3BKHA 3N9EA 1TDYA 3LHMA 1GFJA 4AXTA 5A3ZA 1BB5A 4XADA 4WO6A 1GB9A 1GBWA 1IIZA 4LT3A 4NGKA 1UA6Y 2HEFA 4ETCA 4DDCA 3A3RX 5HNLA 1GXXA 2BQLA 1FDLY 1QUTA 1LSFA 4MCKA 3ZVQB 4PRQA 2HEBA 4WMGA 2DQHY 1GF6A 1LYOA 5DM9A 1F6SA 4D9ZA 1HFZA 1WQNA 2LZTA 1GWDA 1OUIA 2LZ2A 3WXTA 4G49A 3WXUA 5II3A 4XENA 1LTMA 3WMKA 1CNSA 4UWNA 1C08C 1LZ4A 4WL7A 1YIKA 3A3QA 1I20A 4HPIA 4DD0A 1LZAA 208LA 4UWVA 5LYTA 4OWEA 5M1YA 1CKGA 2MEDA 2YBHA 1LHIA 4HSFA 8LYZA 1FLWA 1A4VA 1IOCA 2DQGY 3P68A 1IORA 5HQ1A 2YBJA 4EOFA 1J1XY 5IELA 1XFPL 1GXV2 1LZGA 1GE3A 1IEEA 5KXXA 3WPJA 1F10A 1ZVYB 3LYZA 1JISA 1GB2A 1I1ZA 1TBYA 1GB8A 1WQRA 1GF4A 1LJJA 3W6CA 2PC2A 1HF4A 1DI5A 5KXYA 1LJEA 4WM5A 5T3FA 2YBNA 1JTTL 1OUHA 1UACY 4OWHA 2BQGA 1FKVA 4NG1A 4NSGA 2CWIA 4WO9A 2XTHA 1NDGC 1D6PA 4B1AA 3CSZA 1GFTA 1IP3A 1B7NA 4G4HA 1IP5A 1REYA 1GBXA 1HMKA 1GE0A 4OOTA 2LHMA 4H9FA 5LINA 5FELA 3SP3A 4TUNA 4UWUA 5I4WA 4RLMA 1TEWA 1LZSA 2G4NA 133LA 1NQIA 3T36A 2G4QA 3TMUA 4NY5A 4BS7A 1HSXA 3M3UA 5KXWA 4B4IA 4TX7A 5LYZA 1UCOA 4B4EA 1LZ5A 1C7PA 5C6JA 4I0CA 1GFRA 4DYGA 1JITA 4Z41A 1UIEA 4NWHA 4GCFA 1IY4A 1W6ZA 3AGGG 1VAUA 1DI4A 1FLQA 1QDTA 3RT5X 4DD3A 4WLDA 5B06A 3ZVQA 1LZ8A 1DXJA 2LYZA 5LVJA 2YBLA 4Z46A 4TSBA 1HFYA 4WM3A 1C43A 2N5ZA 4H92A 4LT1A 1IWYA 1UC0A 3B72A 4GCBA 1DPXA 5KXZA 1HSWA 193LA 3TXGA 1Z55A 1XGPC 1KXXA 3F6ZA 1B5UA 2H9JA 1IC7Y 1NMMA 1GAYA 1KXWA 1B7MA 2GV0A 2LYMA 3WULA 1LJFA 1LOZA 1BB3A 2D91A 2EQLA 4H8YA 4LFPA 4YOPA 1GHLA 2HTXA 1QUSA 4NHIA 2YVBA 2I6ZA 1P2CC 5KXSA 3HBDA 5B1GA 2H9KA 2MEFA 1FLUA 1QDRA 3GXRA 4GN4A 1GDXA 1H87A 1GF7A 1LHKA 1YKXX 1HERA 4WM1A 5FEKA 3AB6A 3P4ZA 1GPQC 1IP2A 1VDTA 1GFHA 2BQBA 4GCCA 1GFKA 1PS5A 4BAPA 4U3XB 1BHZA 1INUA 1NBZC 5LAGA 4WG7A 1AZFA 3RNXA 1G7IC 2F4AA 3FE0A 2F30A 4GLAA 1LSDA 4XJDA 3W6AA 1GE2A 4CHXA 3A93A 2NWDX 5KXOA 3TXDA 2HECA 1HEWA 1GEVA 3A67Y 3WUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XJGA 232LA 2LCBA 3CDRA 2RAYX 3C80A 1DYGA 3HUQA 173LA 1OWZA 144LA 3SB5A 3OK0A 1IWXA 2CGIA 4ARQA 1LPYA 1WQMA 1LSBA 3CDOA 3D9AC 4HPEA 1B7OA 1L81A 1XGQC 1LLHA 1MLCE 5L3IA 1HEMA 1L20A 1C6QA 1LMCA 1LYJA 170LA 1UUZC 1YAPA 1G1WA 2DQCY 1LZDA 155LA 3HT8A 1QTDA 234LA 3LZTA 1JKBA 3QAKA 3W6DA 154LA 1IOTA 4H9AA 1WQQA 5I54A 167LA 3AW7A 1B7LA 1IR7A 3BKVA 5EBHA 1LSPA 3IJVA 1G0JA 2HUMA 1UIFA 135LA 261LA 1P36A 3RZ4A 1JWRA 4HTQA 4Z3MA 5L9JA 125LA 1MELL 4J7VA 161LA 1L91A 4LT2A 3EXDA 3EMSA 1CUQA 3SN6R 3VWOA 4N9RA 1DQJC 2MECA 1FLYA 1PQJA 2BPUA 2B70A 1IVMA 1L72A 4PHIA 5D5CA 1TAYA 4L41A 4H8ZA 182LA 3C8SA 1YANA 4GCEA 4HTNA 1C6NA 233LA 2YBMA 3A8ZA 4B0DA 3TMXA 1L47A 5LA5A 219LA 1IP7A 212LA 126LA 132LA 4DQ5A 2BQAA 2Q9EA 4NHPA 5HMJA 5I53A 4YX7C 3WUMA 1D3JA 3C7WA 3A6CY 2Y8PA 2F2QA 1GFEA 1L63A 1LMQA 5B05A 4MR1A 3D4SA 5KXKA 1QTVA 4ET8A 1BWIA 1QT8A 1UIGA 1IX0A 3CT1A 1WTMA 1CJ8A 1QS5A 5K7OA 4J1AA 2Z18A 4H9IA 5IDDA 2C8PA 5B07A 1BVKC 4ML7A 4DD2A 1LJKA 1LYHA 5KXMA 5APFA 4YF2A 2G4PA 4YM8A 4DD1A 2VB1A 1QT6A 3A90A 1LHMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4IJ4 A;  1BB6 A;  1LJ4 A;  4NIJ A;  4XJG A;  4ANR A;  1GB0 A;  5KKJ A;  3T6U A;  1OUB A;  1YAO A;  1IP1 A;  3P64 A;  4BAD A;  4WG1 A;  1LSA A;  5B59 A;  4YEM A;  1YAQ A;  1JPO A;  1RI8 B;  1C46 A;  4CFO A;  4WLX A;  3OK0 A;  1IWX A;  2CGI A;  4NHS A;  1CJ9 A;  1AKI A;  5ILF A;  4G4C A;  1QSW A;  4NGZ A;  4NGY A;  1WQM A;  1HEP A;  1LSB A;  3D9A C;  4HPE A;  5KXL A;  1OQM A;  1B7O A;  1LSZ A;  3CSR A;  1IO5 A;  1XGQ C;  3WYH A;  3N9A A;  5FCP A;  1JJ0 A;  2EPE A;  1GF9 A;  1FN5 A;  1MLC E;  5L3I A;  1SLY A;  2BQO A;  1HEM A;  3QE8 A;  4W94 A;  2Z2F A;  4HP0 A;  1VDQ A;  4H90 A;  2DQJ Y;  1JTP L;  1YKZ X;  2C8O A;  1LHJ A;  1LMC A;  1UUZ C;  3LYT A;  1YAP A;  3HBH A;  2B5Z A;  2BQK A;  1LZ6 A;  1C45 A;  2XBS A;  1LJH A;  4FJR A;  1XSF A;  4KT3 A;  1BB7 A;  2DQC Y;  4WM6 A;  1LZD A;  1G7L C;  4HJV A;  2Z39 A;  4LYT A;  4NFV A;  2ZYP A;  3AGI A;  2BQM A;  3CQL A;  2W1Y A;  1GE4 A;  3LZT A;  1JKB A;  5DL9 A;  1LZR A;  4X3B A;  4XJB A;  3W6D A;  4XN6 A;  154L A;  1IOT A;  3A91 A;  2YSS C;  1B5W A; 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 4RLM A;  1TEW A;  1LZS A;  2G4N A;  133L A;  1NQI A;  3T36 A;  2G4Q A;  3TMU A;  4NY5 A;  4BS7 A;  1HSX A;  3M3U A;  5KXW A;  4B4I A;  4TX7 A;  5LYZ A;  1UCO A;  4B4E A;  1LZ5 A;  1C7P A;  5C6J A;  4I0C A;  1GFR A;  4DYG A;  1JIT A;  4Z41 A;  1UIE A;  4NWH A;  4GCF A;  1IY4 A;  1W6Z A;  3AGG G;  1VAU A;  1DI4 A;  1FLQ A;  1QDT A;  3RT5 X;  4DD3 A;  4WLD A;  5B06 A;  3ZVQ A;  1LZ8 A;  1DXJ A;  2LYZ A;  5LVJ A;  2YBL A;  4Z46 A;  4TSB A;  1HFY A;  4WM3 A;  1C43 A;  2N5Z A;  4H92 A;  4LT1 A;  1IWY A;  1UC0 A;  3B72 A;  4GCB A;  1DPX A;  5KXZ A;  1HSW A;  193L A;  3TXG A;  1Z55 A;  1XGP C;  1KXX A;  3F6Z A;  1B5U A;  2H9J A;  1IC7 Y;  1NMM A;  1GAY A;  1KXW A;  1B7M A;  2GV0 A;  2LYM A;  3WUL A;  1LJF A;  1LOZ A;  1BB3 A;  2D91 A;  2EQL A;  4H8Y A;  4LFP A;  4YOP A;  1GHL A;  2HTX A;  1QUS A;  4NHI A;  2YVB A;  2I6Z A;  1P2C C;  5KXS A;  3HBD A;  5B1G A;  2H9K A;  2MEF A;  1FLU A;  1QDR A;  3GXR A;  4GN4 A;  1GDX A;  1H87 A;  1GF7 A;  1LHK A;  1YKX X;  1HER A;  4WM1 A;  5FEK A;  3AB6 A;  3P4Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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