1HFYA

Alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
EQLTKCEVFQKLKDLKDYGGVSLPEWVCTAFHTSGYDTQAIVQNNDSTEYGLFQINNKIWCKDDQNPHSRNICNISCDKFLDDDLTDDIVCAKKILDKVGINYWLAHKALCSEKLDQWLC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Glycoprotein
publication title Crystal structures of guinea-pig, goat and bovine alpha-lactalbumin highlight the enhanced conformational flexibility of regions that are significant for its action in lactose synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
total genus 41
structure length 120
sequence length 120
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.22: Lactose synthase.
pdb deposition date 1996-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hfyA00
1SLYA 4WM3A 3TXIA 2N5ZA 1BWJA 4H9IA 1CKHA 2RSCA 4RW2A 1ZV5L 3ULRA 2BQCA 132LA 4LGKA 4NHQA 4HJVA 1WQQA 5FCPA 1F0WA 5KY1A 1FLWA 4ZFPA 4ML7A 2ZNWY 5KXSA 4G4CA 2LHMA 1GB8A 1KIRC 3WPLA 3EBAB 1PS5A 2C8PA 1I1ZA 5LVKA 1OUEA 5B07A 4NGYA 5HMVA 5LVIA 2ZWBA 4ANRA 3A92A 1WQNA 1UIFA 1JUGA 3T36A 1DKKA 1GF3A 1LJIA 5KXLA 4HPEA 1LJGA 1MLCE 3P66A 4PPOA 3TXDA 4GCEA 3LYZA 4WG7A 3WMKA 1GEZA 1WTMA 1IP7A 3WU7A 4ET8A 1WTNA 2YBNA 2FYCA 1FDLY 1NQIA 4I0CA 4ETAA 1XGRC 1B5WA 1JISA 1WVVA 4EMNA 4DDAA 2Z2EA 1UIEA 2ZYCA 5F81A 4ETCA 3GXRA 5I4XA 2LZTA 3B0IA 4DD9A 1T3PA 4NHTA 4DDBA 4MCKA 1P2CC 4YF2A 5L3IA 1OP9B 5D5CA 1GE2A 4LYCA 3RT5X 1GD6A 1LMAA 2F30A 1LYYA 4QDNA 4WO9A 4DD1A 4ZEEA 1GHLA 4H93A 2BQJA 1FLUA 2HU3A 1JTTL 1CKGA 4GN5C 4H9FA 1D9UA 1REYA 2FBBA 1LSYA 3AYQA 3TMUA 1WQPA 1GFTA 2BLYA 2BQFA 3W6FA 1QSWA 2BQDA 4DD3A 1BHZA 1HEWA 1IP2A 1GF8A 2G4QA 4R0FA 6LYTA 3AB6A 1B7PA 1LAAA 2D4KA 1A4VA 1GDXA 3MGWA 4BS7A 4UWUA 4XN6A 1VEDA 1QTKA 5L9JA 1LZRA 3AGIA 1YAOA 5B06A 3ATOA 1LJJA 4LT0A 1UA6Y 1JEFA 4NGKA 3EO5A 1IR9A 2XTHA 4XYYA 3A95A 4DYGA 3LN2A 1B7OA 1LZNA 1NF5A 1LZ5A 4YOPA 1FKQA 2YDGA 1KXXA 3N9EA 1HELA 1LSAA 1C08C 4G4HA 2I26L 4YENA 5II3A 1LJHA 1AKIA 1IOSA 4NGIA 3TXKA 5D5FA 1TDYA 5J7CA 4IJ4A 1J1PY 4HPIA 4WLTA 5I54A 5LVGA 3N9AA 2X0AA 1PZYA 3K3TA 1DI5A 4II8A 3WULA 1LJNA 3WXTA 1AT6A 5LA8A 1DZBX 2MEHA 1H87A 1GWDA 1GFJA 4GN4A 1QUTA 1LTMA 2YSSC 4B49A 5C6LA 5KXPA 1D6PA 5T3FA 1GB7A 3RW8A 1IWTA 4XJDA 4B4JA 1LJ3A 2Z39A 1MELL 3AW7A 1VATA 1D0KA 3TXEA 1GB5A 4H91A 3TXJA 1GF6A 4UWVA 4KT3A 1TBYA 2D4IA 1YAMA 4H8ZA 1G7HC 1IWXA 207LA 3CT0A 2F4AA 5APEA 4D9ZA 3IJUA 3WXUA 1LHKA 1V7TA 4BAPA 2BQHA 5LA5A 2LYMA 1G7LC 1LOZA 2YBHA 4XJIA 1EQ4A 2G4NA 3P4ZA 4HSFA 1IIZA 2BQOA 1LZAA 4HJYA 2MEIA 1GEVA 3A6CY 1XGTC 3HBHA 1B7NA 1LHJA 2C8OA 4XJFA 4CJ2A 5I53A 1HMLA 4NGJA 153LA 1B0DA 2Y8PA 5LYZA 3TXGA 3EXDA 3WVYA 2IHLA 133LA 4GN3A 3WUAA 5KXRA 1WVUA 3M18B 3IWRA 1UCOA 1GF9A 3TMXA 3P64A 3P68A 9LYZA 2BQEA 2DQJY 1G7MC 4TWSA 4DD7A 2MEGA 4Z46A 4M6DA 4J0LA 1LJFA 4AXTA 4N1EI 4C5FA 2BLXA 3TXBA 3E3DA 4H9EA 1QTEA 1RJCB 1HFZA 2HUBA 4NGOA 4LFPA 5E4PA 4PHIA 3WU9A 1IOTA 4NG1A 1B7MA 1GXV2 1YAPA 1AT5A 1GPQC 5LXWA 3J4GA 3QNGA 1IP6A 2W1XA 4N8ZA 3P65A 3TXHA 5KXYA 4NGVA 3A93A 5LYTA 2FBDA 1YKXX 1C43A 5APCA 1ALCA 4HV1A 1HMKA 1J1OY 1OUFA 193LA 1GAYA 5LIOA 3WU8A 3B0OA 4LFXA 5DN4A 2MEBA 1LSMA 4G9SA 3A34A 4N5RA 4WL7A 4CHXA 3G3AB 2GV0A 1GFRA 1YL1X 1NBZC 4NY5A 5KXWA 1GF4A 1WQMA 1IWUA 5FDJA 4A7DA 1LZ9A 2CDSA 2ZNXY 1BB7A 1NDMC 2BQLA 4HTNA 4N0JA 3AGGG 2CJLA 4KXIA 5FELA 3EMSA 1ZVHL 4WMGA 1B7RA 1TEWA 1OQMA 4J1AA 2BQGA 4CGEA 1VAUA 1B7SA 1BB6A 2ZQ3A 2ZILA 3ATNA 4ETEA 3TMVA 5A3ZA 1IC5Y 3WW6A 1YAQA 2VB1A 3OK0A 5B59A 1IOQA 1UIHA 1UIBA 2HEFA 4W94A 4WLXA 4YEOA 7LYZA 5I4YA 1UIGA 4C3WA 1LSBA 4NIJA 1RI8B 4OWCA 1XGUC 1YILA 1LMNA 4MSTA 2HU1A 4O34A 3TXFA 1RCMA 1BQLY 3CSQA 4XJHA 5E9RA 1HC0A 3A90A 1H6MA 2HTXA 3W6EA 4BADA 1LCNA 1HFYA 4G49A 5KXNA 2AUBA 1QDRA 3QE8A 1IP1A 1JWRA 2EPEA 1NBYC 4LYMA 4WM6A 4GLAA 3T6UA 1N4FA 2BQBA 4NSIA 1D0MA 2HECA 2WARA 1GB6A 1JHLA 1JKCA 3A3QA 4LT1A 5DL9A 2BQNA 5KKJA 1HERA 1GBYA 5L3HA 1XEJA 1GAZA 3CB7A 5HNCA 3A91A 1JTOL 1XSFA 1KXYA 1OUBA 4PRQA 3VWOA 3ZVQA 3B0KA 4WM5A 3AJNA 1LSEA 2BPUA 2W1LA 1BVKC 1JKDA 1YKYX 2ZIKA 3BKHA 3FE0A 1LZTA 2DQAA 4IATA 1HENA 4LZTA 1VFBC 5M1YA 1EL1A 1JJ0A 1LSCA 1NMMA 4YEMA 5C6JA 5HLLA 2DQFC 1YANA 4OWHA 1GFHA 1VDTA 4GCBA 4H9AA 2XJWA 4LYBA 1E8LA 4XENA 5B1FA 4NHIA 4RLMA 1ZVYB 3F6ZA 4IASA 1HSXA 2NWDX 1VDPA 2EKSC 4TSCA 3A67Y 2DQEY 1GE0A 3W3EA 154LA 5LVJA 1LZEA 1LYZA 1UBZA 1JJ3A 1LMCA 2YBJA 1LZ6A 5LYMA 1INUA 1B9OA 1GBZA 3ZVQB 1NWGA 1D0LA 4WM1A 4M4OA 1GFKA 1HEOA 2LYOA 3A3RX 3RZ4A 4H92A 5AMYA 5B1GA 1IWVA 1DPXA 5LINA 194LA 1GBOA 1BWIA 208LA 2D91A 1LMOA 3HBEX 5HQ1A 1QQYA 4NFVA 1REMA 5IDDA 1HSWA 4FDYA 2PC2A 1G7JC 1HEMA 1QDTA 2LZ2A 5KXZA 1JITA 5F9UA 1BWHA 4WLDA 5ILFA 1LYSA 1DI4A 1LKRA 3CSRA 2W1MA 5KXKA 1LYOA 1YL0X 1BVXA 1GE3A 4WOAA 3TMWA 5KXXA 8LYZA 4N9RA 1LJ4A 1GB0A 4OWAA 2I25L 1CJ9A 1LMPA 1QUSA 2Z19A 4GCDA 4XADA 3WL2A 3WUNA 1J1XY 1XFPL 4TSBA 1C7PA 1UIDA 3AZ4A 3W6DA 5FSTA 4CFOA 4LT2A 2Z37A 4QGZA 1ZMYL 1CJ8A 3AZ5A 1IR7A 5C6IA 3RU5A 4ETDA 1BGIA 4NGZA 2Z18A 3M3UA 5JENB 1W08A 1GBWA 4WL6A 2YBMA 2DQGY 1JSFA 1LHLA 1OUGA 2F2NA 4LT3A 1CNSA 1Z55A 1CJ6A 1SQ2L 3AGHA 3B6LA 1DXJA 1FLQA 2BQMA 2B5ZA 2EIZC 4H1PA 4RDSA 1YQVY 1YKZX 4NHPA 1XEKA 1O23A 1LMQA 1UICA 1LHHA 4L41A 1LJEA 1HEQA 3J6KA 1LSPA 1IY4A 1LSGA 2HEEA 1IORA 3LYOA 1B5ZA 1IX0A 4TTDA 5KJ9A 1LSDA 3N9CA 1OUAA 1VDQA 5HMJA 1D6QA 1CKDA 4WM2A 5F16A 1F6SA 1T6VL 2EQLA 4NGWA 2MEDA 3D3DA 3IJVA 2ZYPA 1AM7A 1GB9A 1GF5A 4DD2A 1GB3A 1YIKA 3CSZA 4NWHA 4RW1A 1GFUA 4CFPA 5IELA 5HNLA 1AZFA 1CKFA 4EOFA 1LZCA 1BB5A 5I5QA 3LHMA 1B5VA 4H8XA 4NGLA 3A94A 4OWBA 4H9CA 4J7VA 2HEAA 1LPIA 1C10A 1CJ7A 1JKBA 4LYOA 5F14A 1HF4A 2MEAA 4TX7A 5APDA 5DLAA 1IY3A 1GDWA 1OUDA 2F4GA 3LZTA 4P2EA 4WM4A 4FJRA 5I4WA 1LZSA 5KKIA 3WH1A 1JPOA 3WW5A 5FEKA 5LAFA 4YM8A 4NEBA 1OUIA 3HBDA 3A96A 3WYHA 1EQ5A 1IOCA 2D6BA 1IWWA 2FYDA 4DC4A 3A8ZA 1BB3A 2DQDY 3WPKA 2DQHY 3ZEKA 135LA 1B5UA 1KXWA 2HEDA 2IFFY 3BKVA 2D4JA 1IC7Y 1UIAA 2Z38A 4KL7A 5KXOA 5ILCA 1I20A 1IVMA 134LA 1QSAA 1HNLA 1V7SA 4Z3MA 4HP0A 1WQOA 1GE4A 5APFA 1GXXA 2ZQ4A 2DBTA 5B05A 1IP3A 4HTQA 4PRUA 4NG8A 2MEEA 2XBSA 2YVBA 2DQCY 3CT5A 4B4EA 4NHSA 1W6ZA 1UC0A 3CT1A 1B2KA 4U3XB 3SP3A 1FBIX 1HEPA 1REXA 3CQLA 4OOTA 4B4IA 3G3BB 4MR1A 1JJ1A 1B5XA 3D9AC 2BQIA 1DI3A 4DWXA 1IP4A 2CWIA 4QEQA 4ETBA 5KXMA 1B5YA 1LSFA 1NHEA 2MEFA 1OUHA 4WO6A 3W6BA 4TUNA 5LAGA 1GFAA 4KPMA 1WQRA 1GF0A 1IWZA 4LYTA 1TCYA 4N1CC 4W96A 1GBSA 1B7LA 4HV2A 4G4BA 5KXTA 4X3BA 5IHGA 4H8YA 1OUCA 2Q0MX 3RNXA 4HJZA 1KIQC 1LJKA 4GLVA 1DQJC 1IEEA 4GCFA 3OJPA 1I56A 4LYZA 1LZ8A 4R6CA 5A3EA 1B7QA 5K7OA 2A7DA 1XGQC 4DT3A 2XBRA 2LYZA 3LZ2A 4OOOA 4Z98A 1GFGA 1IC4Y 3QY4A 4BAFA 1JTPL 4XJGA 5EBHA 2HEBA 5FHWA 3AZ7A 4AGAA 3B72A 2YBLA 1LMTA 1QIOA 2DQIY 4ZIXA 1HFXA 2DKVA 2MECA 3FI7A 4UWNA 2W1YA 3GXKA 3WUMA 4WG1A 3AZ6A 1RFPA 4H9HA 5DM9A 3WVXA 1RE2A 1NKHA 1BB4A 4PJ2C 2H9KA 1KIPC 1FKVA 1LHIA 2H5ZA 1LZGA 1IP5A 2BQKA 1LZYA 3HFMY 4J1BA 2Z12A 1HHLA 1LZ1A 4H9BA 4XJBA 1F10A 1UUZC 5F9XA 3A6BY 2G4PA 1GBXA 1FLYA 1TAYA 3LYMA 4H94A 3AW6A 1JIYA 1JKAA 1GB2A 1LKSA 4GCCA 1YROA 1C45A 1GF7A 4WLYA 3KAMA 2H9JA 4PGJB 1A2YC 1REZA 4Z41A 1NDGC 4HTKA 2ZIJA 1OUJA 4NSHA 1DPWA 2CGIA 3W6CA 4DDCA 2A7FA 4OWEA 1GFVA 6LYZA 1LSNA 1LZBA 1GE1A 1LZ4A 4NSJA 1IO5A 1IR8A 1FN5A 4OW1A 1DKJA 1F6RA 1IWYA 2I6ZA 3WPJA 1VDSA 4RLNA 4DD0A 4E3UA 4H90A 1JSEA 5DN5A 4I8SA 4B0DA 2BQAA 3LYTA 4NWEA 4QY9A 1LSZA 1UACY 2Z2FA 4NSGA 4ET9A 1G7IC 1LHMA 1EQEA 1XGPC 5LVHA 1C46A 4B1AA 1XEIA 1CKCA 2YBIA 3W6AA 1GFEA 1LZDA 2BAAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H9IA 1T6HA 261LA 1WTHA 5KXSA 2C8PA 3OE0A 2ZWBA 1L80A 1C6TA 1SWZA 1UIFA 1JUGA 1DKKA 3C82A 5KXLA 1C65A 4GCEA 3LYZA 1IP7A 1L50A 4I7SA 152LA 1XGRC 4LDEA 4DDAA 5F81A 3EMLA 122LA 3CDVA 4DDBA 4YF2A 1OP9B 4LYCA 4DD1A 1GD6A 1LMAA 1LYYA 2B74A 3DMVA 1D9UA 1REYA 1L43A 2FBBA 1CV5A 3CDTA 128LA 1WQPA 1G07A 2OTZX 2BQFA 1OV5A 4W55A 2G4QA 1GF8A 109LA 4UWUA 1VEDA 216LA 1QUOA 5F16A 3A95A 262LA 2CUUA 3N9EA 1C08C 4G4HA 4WLTA 4HPIA 1D2YA 5LVGA 1C68A 2X0AA 3WULA 3WXTA 173LA 1DYFA 1LJNA 2MEHA 1QUTA 1LTMA 5C6LA 5KXPA 1DYAA 3RW8A 4XJDA 4B4JA 137LA 5I14A 1MELL 1D0KA 1GB5A 4H91A 3TXJA 233LA 1TBYA 4H8ZA 2F4AA 5APEA 1I6SA 1L87A 1L92A 1LHKA 1IIZA 1L49A 4HJYA 1D3JA 1XGTC 147LA 1L20A 1LHJA 1ZWNA 1P37A 1HMLA 4NGJA 153LA 249LA 133LA 1WVUA 3IWRA 2BQEA 4Z46A 1CX7A 1L13A 4C5FA 2BLXA 3TXBA 4PHIA 5LXWA 3TXHA 3A93A 1C43A 4HV1A 1J1OY 1KY1A 5LIOA 4WL7A 4CHXA 189LA 4NY5A 1IWUA 1G0MA 5FDJA 1LZ9A 1NDMC 1G0JA 1C6HA 3AGGG 2CJLA 3FI5A 1QTBA 1C61A 157LA 2L78A 4J1AA 2BQGA 4I7PA 1BB6A 184LA 5B59A 1IOQA 1UIHA 1UIBA 2HEFA 201LA 1L10A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1SLY A;  4WM3 A;  3TXI A;  2N5Z A;  1BWJ A;  4H9I A;  1CKH A;  2RSC A;  4RW2 A;  1ZV5 L;  3ULR A;  2BQC A;  132L A;  4LGK A;  4NHQ A;  4HJV A;  1WQQ A;  5FCP A;  1F0W A;  5KY1 A;  1FLW A;  4ZFP A;  4ML7 A;  2ZNW Y;  5KXS A;  4G4C A;  2LHM A;  1GB8 A;  1KIR C;  3WPL A;  3EBA B;  1PS5 A;  2C8P A;  1I1Z A;  5LVK A;  1OUE A;  5B07 A;  4NGY A;  5HMV A;  5LVI A;  2ZWB A;  4ANR A;  3A92 A;  1WQN A;  1UIF A;  1JUG A;  3T36 A;  1DKK A;  1GF3 A;  1LJI A;  5KXL A;  4HPE A;  1LJG A;  1MLC E;  3P66 A;  4PPO A;  3TXD A;  4GCE A;  3LYZ A;  4WG7 A;  3WMK A;  1GEZ A;  1WTM A;  1IP7 A;  3WU7 A;  4ET8 A;  1WTN A;  2YBN A;  2FYC A;  1FDL Y;  1NQI A;  4I0C A;  4ETA A;  1XGR C;  1B5W A;  1JIS A;  1WVV A;  4EMN A;  4DDA A;  2Z2E A;  1UIE A;  2ZYC A;  5F81 A;  4ETC A;  3GXR A;  5I4X A;  2LZT A;  3B0I A;  4DD9 A;  1T3P A;  4NHT A;  4DDB A;  4MCK A;  1P2C C;  4YF2 A;  5L3I A;  1OP9 B;  5D5C A;  1GE2 A;  4LYC A;  3RT5 X;  1GD6 A;  1LMA A;  2F30 A;  1LYY A;  4QDN A;  4WO9 A;  4DD1 A;  4ZEE A;  1GHL A;  4H93 A;  2BQJ A; 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 4R6C A;  5A3E A;  1B7Q A;  5K7O A;  2A7D A;  1XGQ C;  4DT3 A;  2XBR A;  2LYZ A;  3LZ2 A;  4OOO A;  4Z98 A;  1GFG A;  1IC4 Y;  3QY4 A;  4BAF A;  1JTP L;  4XJG A;  5EBH A;  2HEB A;  5FHW A;  3AZ7 A;  4AGA A;  3B72 A;  2YBL A;  1LMT A;  1QIO A;  2DQI Y;  4ZIX A;  1HFX A;  2DKV A;  2MEC A;  3FI7 A;  4UWN A;  2W1Y A;  3GXK A;  3WUM A;  4WG1 A;  3AZ6 A;  1RFP A;  4H9H A;  5DM9 A;  3WVX A;  1RE2 A;  1NKH A;  1BB4 A;  4PJ2 C;  2H9K A;  1KIP C;  1FKV A;  1LHI A;  2H5Z A;  1LZG A;  1IP5 A;  2BQK A;  1LZY A;  3HFM Y;  4J1B A;  2Z12 A;  1HHL A;  1LZ1 A;  4H9B A;  4XJB A;  1F10 A;  1UUZ C;  5F9X A;  3A6B Y;  2G4P A;  1GBX A;  1FLY A;  1TAY A;  3LYM A;  4H94 A;  3AW6 A;  1JIY A;  1JKA A;  1GB2 A;  1LKS A;  4GCC A;  1YRO A;  1C45 A;  1GF7 A;  4WLY A;  3KAM A;  2H9J A;  4PGJ B;  1A2Y C;  1REZ A;  4Z41 A;  1NDG C;  4HTK A;  2ZIJ A;  1OUJ A;  4NSH A;  1DPW A;  2CGI A;  3W6C A;  4DDC A;  2A7F A;  4OWE A;  1GFV A;  6LYZ A;  1LSN A;  1LZB A;  1GE1 A;  1LZ4 A;  4NSJ A;  1IO5 A;  1IR8 A;  1FN5 A;  4OW1 A;  1DKJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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