1HFZA

Alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
MEQLTKCEVFRELKDLKGYGGVSLPEWVCTTFHTSGYDTQAIVQNNDSTEYGLFQINNKIWCKDDQNPHSSNICNISCDKFLDDDLTDDIVCVKKILDKVGINYWLAHKALCSEKLDQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Glycoprotein
source organism Bos taurus
publication title Crystal structures of guinea-pig, goat and bovine alpha-lactalbumin highlight the enhanced conformational flexibility of regions that are significant for its action in lactose synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
total genus 41
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.4.1.22: Lactose synthase.
pdb deposition date 1996-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hfzA00
3P68A 1XGTC 5KXYA 4WLDA 1XEKA 2LYZA 1NBZC 1UBZA 3TXHA 4WOAA 3WU8A 4YF2A 4H9HA 1GFKA 1REYA 5IDDA 3ULRA 1BQLY 4BAFA 1AM7A 1IIZA 1GB3A 4LFXA 3WUAA 1LMPA 1LZSA 2DQGY 4RDSA 1GE4A 1QUSA 207LA 4NG1A 5I4YA 1WQQA 4IASA 1O23A 1B5XA 3LYOA 4QEQA 4RW1A 1NQIA 2BQBA 4OWCA 4UWUA 4HPEA 2ZIJA 1GF3A 3GXRA 1LJJA 1B0DA 1OUFA 4HV2A 4NHTA 1IO5A 5HNLA 1LYYA 3WULA 3G3AB 2G4NA 3OK0A 4PRQA 4N8ZA 4WM6A 1B7LA 2ZYCA 4EMNA 1HMLA 4H94A 1PZYA 4QY9A 3A3QA 1H6MA 1UIBA 4YENA 5KKJA 2Z12A 2BQHA 1TCYA 1CKCA 3HFMY 1G7LC 4LT0A 1V7SA 5HLLA 5DM9A 4L41A 5IHGA 4J7VA 1JKCA 4WLTA 5HNCA 2YBNA 5B59A 5L3IA 1J1OY 3AJNA 4NGVA 1XEIA 4II8A 1D0MA 4NGWA 2MEFA 4PHIA 5LVJA 4NGLA 2MEAA 1LMOA 1ZMYL 1DPXA 4WL7A 4HTNA 1LSPA 5LAFA 3WVYA 2GV0A 5KXNA 1IP2A 4BADA 1DQJC 3CT5A 1LZ1A 4LYCA 4WO9A 1LKSA 1ZV5L 3CSQA 5FELA 1GB8A 2Z37A 4W96A 1XGRC 1YKXX 1LAAA 1GPQC 3IWRA 1I20A 1RI8B 1VATA 3VWOA 5B1FA 4CGEA 3P4ZA 1OQMA 3EO5A 4OWHA 5LAGA 1BGIA 1E8LA 1JKAA 1GB5A 3ZVQA 2G4QA 1C43A 2BQGA 1JIYA 2HEEA 2XTHA 5LYZA 1HHLA 2Y8PA 1D0KA 4R0FA 5KXPA 1REXA 2DQCY 4NSJA 3TMVA 2EIZC 2D4JA 1NMMA 2YBIA 3B0IA 1EQ4A 5C6LA 4WG1A 3WL2A 1FLQA 5JENB 1GBZA 5KXRA 1YQVY 1B7MA 3TXIA 1OUJA 1LZGA 1JJ1A 1BVXA 1FLUA 4H92A 2ZYPA 1IX0A 3TXFA 1YKZX 3CQLA 1BHZA 1LHMA 1B7SA 4H9IA 4LT2A 4N5RA 4GCFA 134LA 5D5FA 135LA 1OUIA 5LVHA 1CKDA 1WQNA 2D4KA 4G4BA 4LFPA 4LYTA 2BQFA 3LZTA 4FJRA 3HBEX 1IWZA 5B07A 1OUAA 2D4IA 4NSIA 4ML7A 4LT1A 4TSCA 3A95A 4XJDA 4NWEA 153LA 1INUA 2MECA 3RT5X 3SP3A 2HUBA 2BLYA 4LYZA 1IY4A 4WM4A 3A91A 2DBTA 1MELL 2MEHA 3AW6A 3WMKA 1OUBA 1EQEA 2BQJA 4G4HA 4O34A 5FDJA 4RLNA 1LZAA 4XJFA 194LA 1IY3A 3D9AC 7LYZA 2D91A 4NIJA 5LYTA 1GFGA 1IC5Y 1HELA 1B5YA 4LGKA 5APCA 4WM2A 3AZ7A 1CJ7A 2DQDY 5FEKA 2NWDX 4DT3A 1DXJA 1AKIA 1LSMA 4G4CA 1GBYA 1LSBA 1LSZA 208LA 4LYBA 2F4AA 5A3EA 1D6QA 4ET8A 2EQLA 1UA6Y 1LMTA 4OW1A 2YBMA 1LHLA 1LSNA 1JTOL 4NY5A 1YAMA 1DI4A 4DD1A 1HFXA 4Z98A 1RFPA 1F6RA 4DD7A 1LSEA 5KY1A 1F0WA 1RJCB 3W6AA 1D6PA 1UC0A 1KXYA 3ATNA 1LZ6A 3N9EA 1YIKA 4OWAA 1VDQA 4DD2A 1YILA 3WPLA 1EL1A 4ZFPA 1GAZA 1QTEA 1GXXA 1QSAA 2LYOA 4LYOA 4NEBA 1HERA 1OP9B 2EPEA 2ZIKA 4U3XB 4NHQA 4Z3MA 1GFAA 4XYYA 1BB7A 3A3RX 4NGJA 2YBJA 1CKFA 1IP7A 1ZVYB 1FN5A 1IP5A 2DQEY 4YEMA 1KXXA 3AB6A 1GFTA 1DZBX 1B7OA 1QDTA 3J4GA 4Z46A 1KIRC 3J6KA 4TTDA 1LYOA 5DN4A 1BB3A 4J0LA 2I25L 3W6EA 5LYMA 4BAPA 4GLVA 1VAUA 4TX7A 5ILFA 4NHIA 1LZDA 1HEMA 1UIDA 4NSHA 1LZCA 2Z39A 3B0KA 1LSYA 2BQLA 3A93A 1BWHA 3P66A 1BB5A 2H9KA 3BKVA 2CDSA 5LVIA 5DL9A 4WLXA 4C3WA 1NDMC 1GE3A 3W6CA 4H91A 3GXKA 2ZQ4A 1B7QA 4B4EA 5KKIA 3RW8A 3W6DA 2YVBA 6LYTA 1YL1X 4WM1A 4NHPA 4DWXA 1LZNA 1LHHA 1GBSA 3WPJA 1LCNA 1LJFA 1JSEA 1NHEA 4HP0A 4KT3A 1LMCA 2BQKA 4GCDA 3CSRA 1UCOA 3W3EA 4H9FA 3AYQA 1KIPC 1WTMA 1LSGA 4HJVA 2N5ZA 4B49A 3TXEA 4X3BA 3N9CA 1GB9A 4MCKA 4GN5C 193LA 1GFUA 1WQPA 1VFBC 4CFOA 4GN3A 2DKVA 4WMGA 2H5ZA 4CFPA 4XJGA 2YBHA 4NSGA 4UWNA 1LZEA 4H1PA 1XGUC 5I5QA 1UIAA 1LHJA 1C45A 1DI5A 1YAOA 1JTPL 4G9SA 2XJWA 1JWRA 3TXDA 5LA5A 4ETAA 1GFVA 1VDPA 1IWWA 4R6CA 3TMXA 4A7DA 1UACY 4N0JA 2W1LA 1QQYA 4XJBA 2A7DA 5KXOA 1NBYC 2DQAA 4MR1A 1T6VL 2Z2EA 1I1ZA 1LJ3A 1IWUA 1IWYA 1WVUA 2HU1A 4B1AA 4QDNA 4YM8A 1HFZA 1QTKA 2W1XA 3LYZA 3CB7A 4KL7A 1LYZA 2ZNXY 3ZVQB 4PRUA 4GCBA 5KXLA 3AZ5A 1LZBA 1IVMA 1B2KA 1LMQA 5EBHA 2C8PA 1JPOA 1JUGA 1XGQC 1AT5A 3M18B 3RU5A 5HMVA 3FI7A 3LYTA 1WQOA 1XFPL 3M3UA 1YROA 2MEEA 1I56A 4TUNA 5LVGA 3LHMA 5F9UA 4AXTA 1B5VA 1V7TA 2F30A 3B72A 1J1PY 1TDYA 2BQDA 4QGZA 1OUEA 5LVKA 1BB4A 1BWIA 1IC4Y 2D6BA 4ETBA 5K7OA 1GF6A 2FYDA 4H8XA 1LJGA 2MEDA 1IORA 1IP1A 1BVKC 1LMNA 3A94A 4NGKA 1LZYA 5E9RA 5LIOA 1GDWA 1ALCA 4W94A 1QDRA 1G7IC 2AUBA 1HMKA 1UUZC 2LYMA 2XBRA 1GBOA 1VDSA 1W08A 1DPWA 1IEEA 2B5ZA 2IHLA 3QY4A 3A34A 1IR9A 4WL6A 1NDGC 5F16A 1GBXA 5F9XA 3HBDA 1FLYA 1HEPA 1OUCA 2C8OA 1HNLA 2EKSC 3A8ZA 4H9EA 3T6UA 4XADA 1LHIA 1JKDA 3D3DA 2CWIA 1FBIX 1HF4A 5KXSA 1HEOA 2CJLA 3QNGA 1QSWA 1LJIA 2BLXA 1FKVA 3LZ2A 4I0CA 1GF7A 5B05A 3MGWA 2A7FA 5KXTA 2HTXA 4H9BA 5KXXA 4C5FA 2W1YA 1D0LA 2ZWBA 3W6FA 1CJ6A 1GB0A 1GE2A 4WM3A 5C6IA 1BB6A 1UIFA 1HC0A 5B1GA 2IFFY 1GEVA 1LJ4A 2LZ2A 4NGYA 1FLWA 1GB7A 3CSZA 1H87A 1GB2A 1GF9A 3IJVA 2DQFC 5M1YA 1JJ3A 3A6BY 1J1XY 2FYCA 4EOFA 4I8SA 1B7NA 1HENA 1GEZA 2BQAA 4IATA 4M6DA 2X0AA 4GN4A 2F4GA 3AGGG 2I26L 3TXKA 2Q0MX 3ZEKA 4GCCA 4NHSA 1IR7A 1GE0A 1LZTA 5IELA 5II3A 4N9RA 2MEBA 1WTNA 1JTTL 1Z55A 4D9ZA 5KJ9A 1CKGA 1LYSA 2YBLA 4NGZA 1HEWA 1GFJA 3F6ZA 1W6ZA 4GCEA 1XGPC 3WU9A 1CKHA 1LSDA 8LYZA 5FHWA 4DD9A 3WUMA 4B4JA 4RW2A 5L9JA 2VB1A 4PPOA 4H93A 5APFA 5F81A 5FSTA 3K3TA 4J1BA 1LZRA 1NWGA 1N4FA 2FBBA 4GLAA 3FE0A 3WPKA 5APEA 4B0DA 1A2YC 3CT0A 4CJ2A 1B7PA 1LJKA 1VEDA 5DLAA 3TXGA 1FKQA 4NWHA 2HU3A 3WUNA 2HEFA 2H9JA 1DI3A 4J1AA 5T3FA 1KIQC 5HQ1A 3CT1A 1UIHA 1A4VA 1GXV2 3AW7A 1GFHA 3KAMA 4LT3A 2HECA 1G7HC 1DKKA 4ZEEA 1REZA 3E3DA 1GD6A 5D5CA 1YKYX 1D9UA 2BAAA 1GE1A 4N1CC 4DDBA 1UICA 4WG7A 5C6JA 5LXWA 4PGJB 1GFRA 1EQ5A 3WH1A 1RE2A 1WVVA 1BWJA 1MLCE 2DQHY 3EBAB 2DQIY 4DD0A 4ANRA 1JKBA 1HSWA 1C46A 1JITA 1GDXA 1IWVA 5LINA 1DKJA 5F14A 5DN5A 2BQMA 3G3BB 4HTQA 1WQRA 2G4PA 3P65A 4RLMA 4TSBA 4XN6A 1IOTA 5B06A 2ZILA 4N1EI 2CGIA 1B7RA 4FDYA 4DDAA 2WARA 1HSXA 3LN2A 3WVXA 4HPIA 1GF8A 1LZ4A 2YSSC 3A67Y 3WW6A 4Z41A 1LHKA 4DD3A 1LZ8A 1C10A 1REMA 2HEDA 2BQIA 4ZIXA 3TXJA 3RZ4A 1LOZA 4HJZA 1JEFA 3IJUA 1GWDA 1SLYA 1B5WA 1CJ8A 5J7CA 1AT6A 1GHLA 4LYMA 1IP4A 3ATOA 1G7MC 5KXKA 2HEBA 1CJ9A 2ZNWY 4HJYA 1LMAA 4BS7A 1IWTA 4H8ZA 3P64A 4WO6A 3HBHA 1LSFA 1TAYA 2Z2FA 2Z19A 1AZFA 1JJ0A 2HEAA 3QE8A 2ZQ3A 5AMYA 4ETCA 1C7PA 1IWXA 1SQ2L 1CNSA 1YL0X 3A96A 1IP3A 1JHLA 4LZTA 4YOPA 1HEQA 1LTMA 5ILCA 1QUTA 1GBWA 1WQMA 1B9OA 2PC2A 3EXDA 2Z38A 5APDA 1IOCA 2BQEA 3A92A 3B0OA 4OOOA 1YAPA 4KXIA 1IP6A 4NG8A 2XBSA 4HTKA 2FBDA 4YEOA 1OUDA 1XSFA 4XJHA 3W6BA 3AGIA 4DDCA 3TMWA 4UWVA 1IR8A 4H9AA 2MEIA 5FCPA 1GF0A 4HSFA 1KXWA 1F10A 1IOSA 1QIOA 1XEJA 2LZTA 4H90A 133LA 1LJHA 3EMSA 1UIGA 5KXMA 1LPIA 1PS5A 3BKHA 5I53A 2RSCA 4TWSA 1RCMA 1HFYA 1T3PA 1GB6A 1YANA 2BQCA 4H8YA 3T36A 3RNXA 5KXWA 1FDLY 5L3HA 5E4PA 3A90A 3A6CY 3WU7A 4ETEA 4NFVA 2DQJY 3TXBA 1YAQA 1GFEA 4G49A 4WM5A 3WW5A 5A3ZA 4HV1A 9LYZA 3N9AA 4PJ2C 3TMUA 1OUGA 1LZ9A 5HMJA 4H9CA 1JISA 1UIEA 4E3UA 2F2NA 2BQOA 4MSTA 3AZ4A 1C08C 2Z18A 4NGOA 1F6SA 1ZVHL 1GF5A 1B5ZA 3B6LA 4XJIA 1GAYA 3WXTA 4CHXA 5I4XA 4AGAA 4KPMA 1LJEA 4OWEA 3WXUA 2BQNA 1LZ5A 3OJPA 4IJ4A 1OUHA 4B4IA 4P2EA 4WLYA 1VDTA 132LA 1NF5A 4OWBA 5KXZA 5LA8A 1G7JC 6LYZA 154LA 4NGIA 1TBYA 1GF4A 3LYMA 5I54A 2I6ZA 3AZ6A 1P2CC 2BPUA 4ET9A 2W1MA 1TEWA 4DC4A 1JSFA 1IOQA 4OOTA 1NKHA 4DYGA 1IC7Y 5I4WA 4M4OA 3AGHA 1LSAA 1B5UA 1LSCA 1LJNA 2LHMA 2MEGA 4XENA 4ETDA 3WYHA 2YDGA 1LKRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P68A 1XGTC 1XEKA 173LA 216LA 3WU8A 4YF2A 2OE4X 3HUAA 3C8QA 1AM7A 186LA 178LA 1GB3A 4I7LA 162LA 3NYAA 1QUSA 5I4YA 1WQQA 3LYOA 2BQBA 2ZIJA 3GXRA 1LYEA 4NHTA 5HNLA 4PRQA 4WM6A 1L90A 5KKJA 2BQHA 1TCYA 1CKCA 1DYDA 2B72A 1L17A 1D0MA 2MEFA 1PQKA 1LMOA 1L13A 5LAFA 3WVYA 1LYJA 1D9WA 4BADA 3CT5A 4WO9A 2Z37A 1YKXX 1L47A 1OWZA 1VATA 5B1FA 1OQMA 1PQOA 1C6KA 3ZVQA 1C43A 1JIYA 2OU0X 1L77A 2XTHA 2Y8PA 4R0FA 5KXPA 2DQCY 4NSJA 1DYEA 2D4JA 4WG1A 3WL2A 1L05A 1JJ1A 1BVXA 3GUPA 1L09A 2ZYPA 165LA 4LYTA 3HBEX 3FI5A 2D4IA 3A95A 2MECA 2HUBA 4WM4A 3A91A 1L50A 2MEHA 4G4HA 4O34A 4XJFA 194LA 1IY3A 1HELA 5APCA 1CJ7A 2NWDX 1LWKA 1DXJA 3DN3A 1GBYA 1LSBA 1LMTA 2O7AA 138LA 2YBMA 1LHLA 4NY5A 1YAMA 7LZMA 1HFXA 3W6AA 190LA 214LA 184LA 4OWAA 3HWLA 1YILA 3WPLA 115LA 1GXXA 1LPYA 2LYOA 4LYOA 4NEBA 2EPEA 3SN6R 1C6IA 3DNAA 1QTVA 1B7OA 158LA 4Z46A 1L19A 3SB7A 5LYMA 4TX7A 4NHIA 1LZCA 200LA 2O79A 1L06A 1LSYA 2BQLA 3A93A 1L46A 4W51A 1BB5A 3G3VA 2CDSA 1QT5A 3JR6A 4WLXA 1NDMC 1PQDA 4PJZA 1B7QA 5KKIA 3GUNA 3RW8A 3DMVA 3PDSA 1YL1X 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3P68 A;  1XGT C;  5KXY A;  4WLD A;  1XEK A;  2LYZ A;  1NBZ C;  1UBZ A;  3TXH A;  4WOA A;  3WU8 A;  4YF2 A;  4H9H A;  1GFK A;  1REY A;  5IDD A;  3ULR A;  1BQL Y;  4BAF A;  1AM7 A;  1IIZ A;  1GB3 A;  4LFX A;  3WUA A;  1LMP A;  1LZS A;  2DQG Y;  4RDS A;  1GE4 A;  1QUS A;  207L A;  4NG1 A;  5I4Y A;  1WQQ A;  4IAS A;  1O23 A;  1B5X A;  3LYO A;  4QEQ A;  4RW1 A;  1NQI A;  2BQB A;  4OWC A;  4UWU A;  4HPE A;  2ZIJ A;  1GF3 A;  3GXR A;  1LJJ A;  1B0D A;  1OUF A;  4HV2 A;  4NHT A;  1IO5 A;  5HNL A;  1LYY A;  3WUL A;  3G3A B;  2G4N A;  3OK0 A;  4PRQ A;  4N8Z A;  4WM6 A;  1B7L A;  2ZYC A;  4EMN A;  1HML A;  4H94 A;  1PZY A;  4QY9 A;  3A3Q A;  1H6M A;  1UIB A;  4YEN A;  5KKJ A;  2Z12 A;  2BQH A;  1TCY A;  1CKC A;  3HFM Y;  1G7L C;  4LT0 A;  1V7S A;  5HLL A;  5DM9 A;  4L41 A;  5IHG A;  4J7V A;  1JKC A;  4WLT A;  5HNC A;  2YBN A;  5B59 A;  5L3I A;  1J1O Y;  3AJN A;  4NGV A;  1XEI A;  4II8 A;  1D0M A;  4NGW A;  2MEF A;  4PHI A;  5LVJ A;  4NGL A;  2MEA A;  1LMO A;  1ZMY L;  1DPX A;  4WL7 A;  4HTN A;  1LSP A; 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 1IP6 A;  4NG8 A;  2XBS A;  4HTK A;  2FBD A;  4YEO A;  1OUD A;  1XSF A;  4XJH A;  3W6B A;  3AGI A;  4DDC A;  3TMW A;  4UWV A;  1IR8 A;  4H9A A;  2MEI A;  5FCP A;  1GF0 A;  4HSF A;  1KXW A;  1F10 A;  1IOS A;  1QIO A;  1XEJ A;  2LZT A;  4H90 A;  133L A;  1LJH A;  3EMS A;  1UIG A;  5KXM A;  1LPI A;  1PS5 A;  3BKH A;  5I53 A;  2RSC A;  4TWS A;  1RCM A;  1HFY A;  1T3P A;  1GB6 A;  1YAN A;  2BQC A;  4H8Y A;  3T36 A;  3RNX A;  5KXW A;  1FDL Y;  5L3H A;  5E4P A;  3A90 A;  3A6C Y;  3WU7 A;  4ETE A;  4NFV A;  2DQJ Y;  3TXB A;  1YAQ A;  1GFE A;  4G49 A;  4WM5 A;  3WW5 A;  5A3Z A;  4HV1 A;  9LYZ A;  3N9A A;  4PJ2 C;  3TMU A;  1OUG A;  1LZ9 A;  5HMJ A;  4H9C A;  1JIS A;  1UIE A;  4E3U A;  2F2N A;  2BQO A;  4MST A;  3AZ4 A;  1C08 C;  2Z18 A;  4NGO A;  1F6S A;  1ZVH L;  1GF5 A;  1B5Z A;  3B6L A;  4XJI A;  1GAY A;  3WXT A;  4CHX A;  5I4X A;  4AGA A;  4KPM A;  1LJE A;  4OWE A;  3WXU A;  2BQN A;  1LZ5 A;  3OJP A;  4IJ4 A;  1OUH A;  4B4I A;  4P2E A;  4WLY A;  1VDT A;  132L A;  1NF5 A;  4OWB A;  5KXZ A;  5LA8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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