1HFZA

Alpha-lactalbumin
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
MEQLTKCEVFRELKDLKGYGGVSLPEWVCTTFHTSGYDTQAIVQNNDSTEYGLFQINNKIWCKDDQNPHSSNICNISCDKFLDDDLTDDIVCVKKILDKVGINYWLAHKALCSEKLDQWLCEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Glycoprotein
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
publication title Crystal structures of guinea-pig, goat and bovine alpha-lactalbumin highlight the enhanced conformational flexibility of regions that are significant for its action in lactose synthase.
pubmed doi rcsb
source organism Bos taurus
total genus 41
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.4.1.22: Lactose synthase.
pdb deposition date 1996-06-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hfzA00
2ZYCA 3P65A 4NGWA 4B1AA 4ML7A 2LYMA 3TXIA 3W6AA 1JITA 1GFUA 4D9ZA 1LZ9A 1JIYA 5KXWA 5JENB 1LMPA 3A95A 3N9CA 4NG1A 133LA 5KXYA 1EQEA 2GV0A 1LHMA 1LZSA 1LZTA 3VWOA 4XENA 1IC4Y 4NSGA 4H8XA 1HFZA 1XFPL 5FDJA 1YQVY 1WTMA 1OUIA 1XEKA 1CJ7A 3LZ2A 4BAPA 1J1XY 1SLYA 1QSAA 1XEIA 1O23A 2MEDA 2D4JA 2I25L 4H8YA 4J0LA 4ETEA 1GAYA 1HFYA 4IATA 4LGKA 5L3IA 1YIKA 5LIOA 1JISA 3AZ6A 1IP7A 1YKYX 1LJ3A 5LVGA 1VAUA 3AZ5A 4OWAA 4OWEA 1PS5A 1LHKA 1MELL 2I6ZA 4WLTA 1GFEA 2Z19A 4WOAA 4B0DA 4B4EA 1WQOA 3WXUA 1GB3A 1GB6A 1WQRA 3B0KA 5APEA 2EPEA 4HJYA 2FYDA 2ZNXY 4YM8A 3B72A 4H92A 1FLYA 1F6RA 5F14A 3WPLA 4DDBA 4N1CC 5FCPA 2DQDY 2BLYA 3ZVQA 1LJ4A 1UIGA 1CKCA 1F6SA 1JUGA 1HEWA 1V7SA 2XBSA 4UWVA 1WQNA 3D9AC 1GF6A 4XJFA 3CQLA 4NSHA 1IWWA 4G4HA 4XJBA 3OJPA 5KKIA 1LSGA 1CKGA 1LKSA 4RDSA 4EMNA 1ZVHL 2HEEA 4HTQA 1INUA 1OUBA 1VDTA 5DN4A 4AXTA 3QE8A 1B7MA 1UIDA 2IHLA 1LSFA 1BB3A 2W1LA 2Z18A 1EQ4A 3B6LA 3WPJA 4TSCA 1LZGA 1OUHA 1GWDA 2W1XA 4KPMA 3M3UA 4LT2A 5ILCA 1RJCB 2D6BA 4HJVA 4DDCA 1C10A 3W3EA 4H9BA 5HNCA 2MEBA 4B49A 3M18B 5C6IA 2YBJA 1LSMA 1LKRA 1HEOA 1T6VL 3FE0A 3AW6A 5B1FA 1KXWA 1WQMA 2BQIA 2G4NA 4HSFA 3CB7A 4R0FA 1P2CC 1REMA 4WG1A 3F6ZA 1HERA 2HU3A 3GXKA 1OUAA 1XGUC 1DI5A 4DD1A 3LYMA 3HBDA 2Z38A 1LSAA 1LZ5A 1BGIA 2F2NA 1NDMC 1GFAA 1UIAA 4FDYA 4ETAA 5I4WA 5KXTA 1BB7A 4G9SA 4NGLA 2YBHA 1WQQA 1LMAA 3HBEX 1BHZA 1UACY 5APFA 3SP3A 2DQGY 2N5ZA 1NWGA 2BQCA 2EQLA 1LZ6A 2RSCA 3HBHA 1LZ8A 3TMVA 8LYZA 3W6CA 3CSRA 1E8LA 1LZCA 1NBZC 4XN6A 1H6MA 1XSFA 4WM2A 5D5CA 2HECA 1BWJA 5L3HA 3WU9A 3WVYA 4N9RA 5LA5A 4NGJA 1DI3A 3WUAA 5FEKA 4PRQA 4FJRA 5LYZA 2DKVA 3A6CY 4BS7A 2YBNA 1XGPC 3ATNA 5LINA 1IP6A 4H9HA 208LA 1QQYA 2H9KA 4LYZA 1N4FA 3IWRA 1QUTA 3ATOA 3T36A 1QDTA 5KJ9A 2MEFA 1BWHA 5K7OA 4C3WA 1NKHA 1QSWA 2F4AA 4GCDA 1GFGA 3IJUA 5KXOA 1CJ6A 2LYOA 5LXWA 3AGIA 1GXV2 1JTOL 2YDGA 5KY1A 1GB0A 1GFKA 5F16A 1HHLA 1G7JC 2D91A 2EKSC 1GBWA 4N1EI 4NGYA 5ILFA 193LA 4WLXA 1JTPL 1JSEA 4QDNA 1EL1A 4M4OA 1NBYC 5M1YA 2BQMA 1CJ8A 1VDPA 4I0CA 2YVBA 1UIHA 1HMLA 5APCA 1CNSA 3A90A 5APDA 4N0JA 1IO5A 1KXXA 5KXSA 3A6BY 1OP9B 1VEDA 3CT1A 1TEWA 1WTNA 1QUSA 4NGKA 1LZBA 2CJLA 1HSWA 3EMSA 2IFFY 4XADA 5II3A 4NGVA 1GDWA 1CKHA 1DQJC 1WVUA 5E4PA 2MEGA 5C6JA 3W6DA 1B7PA 1NHEA 3IJVA 4CJ2A 2FBBA 2BQBA 4BADA 5KXNA 4MSTA 2A7FA 1W6ZA 1JKDA 1LJNA 1LYZA 1IWZA 1QTKA 1LYOA 4J1BA 2BQEA 1GB5A 3TMWA 2DQCY 3BKVA 4LYCA 1OUGA 4G49A 4I8SA 1CKDA 1LZ4A 2B5ZA 3W6EA 1LMTA 1LZ1A 4DD3A 4NHQA 1IC5Y 1FKVA 5B1GA 1GF5A 1XGTC 2Y8PA 3AZ4A 1GFTA 4X3BA 3TMUA 1YL1X 4KT3A 2DQFC 3WVXA 4WL7A 4PRUA 3N9AA 4GCCA 1SQ2L 4P2EA 4W94A 5I4YA 1D9UA 1GF7A 2DQIY 1GFVA 1FN5A 1JJ1A 1B9OA 4ETDA 2ZWBA 5IDDA 5LYMA 4WM6A 4NHTA 4DYGA 3A92A 3P64A 4NG8A 1I56A 1D0LA 1IR9A 1GEVA 4LFPA 4LYMA 1IOSA 2YSSC 4WM1A 1F0WA 2CDSA 1IP5A 1C43A 1BVXA 1OUFA 1PZYA 1YANA 2Z2FA 2PC2A 1GAZA 4YEMA 1V7TA 1B7NA 1GFHA 3EBAB 3P66A 4H9FA 3WPKA 2NWDX 1LZYA 1YKXX 4N8ZA 3TXBA 4DC4A 1RI8B 1IWYA 1B5UA 4LT1A 3G3AB 2Z39A 4NSIA 1JSFA 2HEDA 4OOTA 4YF2A 4ET9A 1GBXA 4NIJA 2YBIA 4MCKA 3FI7A 1TCYA 4Z46A 1JKCA 1OUCA 3A94A 1KIPC 1LZRA 1GFJA 5IHGA 3A91A 1LJHA 1KXYA 4DD0A 2G4QA 4LT0A 3OK0A 1UIEA 1B7LA 2Q0MX 2ZYPA 3CSZA 3QY4A 4H93A 1GB8A 1MLCE 3TXEA 207LA 2DQAA 1C46A 2ZIKA 4LYOA 2MEIA 1GXXA 1DKJA 1JKBA 1FLWA 135LA 1VFBC 1UUZC 1LOZA 3AGHA 3P68A 3B0IA 3WUMA 1HSXA 3A34A 4UWNA 4HTNA 1IOQA 4H9IA 3WH1A 1B5YA 4NSJA 1NQIA 2W1YA 2DBTA 4L41A 4HPIA 2I26L 4WM4A 1FLUA 1HEMA 1JPOA 2X0AA 3AJNA 4PJ2C 5B59A 2D4IA 5L9JA 4HV2A 2C8PA 4EOFA 3TXDA 1B5ZA 1B5WA 4HJZA 3LYZA 1LHHA 1GE1A 1LMNA 3BKHA 5B06A 2FBDA 3P4ZA 1J1PY 1GEZA 3A96A 3TXJA 1REZA 3RU5A 4E3UA 1IY4A 4NFVA 4WO9A 4OWCA 1T3PA 3LN2A 4BAFA 2BQNA 5KXKA 1BB4A 3J6KA 5I54A 1B7RA 1LPIA 5IELA 1RCMA 1YROA 4DWXA 1IX0A 4H9AA 1JTTL 4ET8A 4J7VA 1LSDA 3K3TA 1IVMA 3KAMA 1HMKA 4AGAA 1GPQC 1LSPA 1LTMA 2XBRA 3LZTA 4CHXA 1GE0A 4YOPA 1FKQA 1ZV5L 1G7LC 5DL9A 1LSBA 1TAYA 1OUEA 4U3XB 4WG7A 2MEEA 2HEFA 4GN5C 1DPWA 1KIRC 5HMVA 1GF0A 1NDGC 4J1AA 1HF4A 1BQLY 1IEEA 2D4KA 1RFPA 3WUNA 2HTXA 4B4JA 4TX7A 4WMGA 5LAGA 1LSCA 3D3DA 4KXIA 1GF8A 1LHLA 4YENA 1XGRC 2BQHA 1G7MC 5DLAA 3LYOA 5E9RA 1CJ9A 4WM3A 3CT5A 4NEBA 4RW1A 5I5QA 3A93A 1FDLY 5HNLA 1OUDA 3WW6A 3CT0A 4ZIXA 5F9XA 4DT3A 3LHMA 4QY9A 5LVHA 1XGQC 4TSBA 1UCOA 4KL7A 1JJ0A 2Z12A 2BQFA 1D6PA 4NWHA 1HNLA 1D0MA 1DPXA 1QIOA 4XJHA 4GLVA 4ZFPA 1IP4A 5F9UA 4WM5A 4WO6A 5KXMA 3EO5A 1IR7A 4NGIA 3RZ4A 4R6CA 1UIBA 1Z55A 3ZVQB 1HEQA 1IP2A 2DQJY 1DXJA 5HQ1A 5LVKA 1LMCA 1YL0X 4H91A 4LYBA 5DM9A 3W6BA 1LYYA 1GF3A 2LZ2A 2WARA 4LT3A 4HPEA 2LZTA 3TXKA 1JWRA 4GN4A 2CWIA 4IJ4A 5FSTA 3AZ7A 3TXGA 1HC0A 1NMMA 4G4BA 5KXPA 1GF9A 2XTHA 3G3BB 6LYZA 3AGGG 1LJGA 4XYYA 1REYA 1AZFA 2W1MA 3MGWA 1GD6A 1LZDA 2H5ZA 3QNGA 4HP0A 1GBZA 5I4XA 5KXLA 3GXRA 2BQAA 2VB1A 4H90A 1IOTA 1YAMA 3J4GA 2ZQ3A 5KXRA 5LYTA 5LVIA 2FYCA 1NF5A 5KXXA 154LA 1DI4A 1BVKC 4NWEA 4H94A 5B07A 3WXTA 4DDAA 4M6DA 2HEAA 1YILA 3ULRA 3WMKA 4XJIA 5A3EA 4CGEA 1VDSA 1J1OY 4IASA 1BB5A 2BQKA 4ANRA 4NGOA 1B7SA 1YAQA 4LYTA 1G7IC 1A4VA 2DQEY 4G4CA 2BQJA 3LYTA 1AT5A 1UICA 4GCBA 4GCFA 4XJGA 1CKFA 6LYTA 5HLLA 1B5VA 1C7PA 4QEQA 1DKKA 1QDRA 1UBZA 1LJJA 1IC7Y 4NHPA 4OW1A 4WLYA 1GHLA 1GDXA 5C6LA 2BQOA 1GBOA 1AKIA 9LYZA 1IP3A 2G4PA 3WU7A 1W08A 1WVVA 4Z41A 3A67Y 1I1ZA 2ZQ4A 4TUNA 4PHIA 132LA 5EBHA 2BAAA 1D0KA 1FLQA 153LA 1LHIA 1LZNA 4GCEA 4TWSA 4H9CA 4HTKA 4NHIA 1GE3A 1IORA 1HENA 2A7DA 4QGZA 1YAPA 1ALCA 1LJIA 3CSQA 1LZAA 1LZEA 4UWUA 4DD7A 2BPUA 5LAFA 1GB7A 2LHMA 5DN5A 3WU8A 1UC0A 3B0OA 4LZTA 4W96A 4YEOA 1UIFA 5FHWA 4ZEEA 3TMXA 1RE2A 1GB2A 1GE4A 4OWBA 4XJDA 1AT6A 1JEFA 3WULA 4B4IA 4Z98A 1LHJA 1JJ3A 2ZNWY 4GN3A 5B05A 1B2KA 1HEPA 1G7HC 1UA6Y 1GF4A 2AUBA 4RLMA 4DD2A 1VDQA 1GFRA 4PGJB 4N5RA 2EIZC 5LA8A 4H1PA 1BB6A 1JHLA 1IWTA 1YKZX 5J7CA 2CGIA 1OQMA 2LYZA 3ZEKA 1GE2A 5FELA 3RW8A 4H8ZA 4DD9A 1B7OA 2ZIJA 1LSEA 1IOCA 1B5XA 1TBYA 1C08C 1YAOA 1LJKA 1HFXA 1B0DA 1LAAA 1GBSA 134LA 1ZMYL 5F81A 1LSNA 3WL2A 2ZILA 1EQ5A 1LMQA 3AB6A 1IWXA 4H9EA 4OWHA 1HELA 1OUJA 2YBMA 4OOOA 3A3QA 1LJEA 3RNXA 1IIZA 5HMJA 4NY5A 1F10A 3A3RX 1LSZA 3A8ZA 1IP1A 1LMOA 1WQPA 1DZBX 2C8OA 4TTDA 5D5FA 1I20A 1LYSA 1TDYA 4C5FA 1IWVA 1BWIA 1B7QA 4NGZA 4LFXA 1C45A 3RT5X 3AYQA 3TXHA 2BQLA 2DQHY 5T3FA 4RLNA 1D6QA 1AM7A 2F30A 2XJWA 3N9EA 3WW5A 7LYZA 1VATA 4WL6A 2F4GA 4RW2A 5A3ZA 1KIQC 3WYHA 4NHSA 4MR1A 1LCNA 1XEJA 1GB9A 2HUBA 1IY3A 4ETCA 1JKAA 3TXFA 4PPOA 2MEHA 3W6FA 2HU1A 4HV1A 2BQDA 3AW7A 1QTEA 4Z3MA 1IR8A 1ZVYB 4A7DA 1A2YC 3EXDA 1GBYA 194LA 4ETBA 2BLXA 5I53A 2Z37A 2H9JA 4WLDA 1LJFA 2BQGA 2YBLA 4II8A 4CFOA 2HEBA 1LSYA 1REXA 2Z2EA 5AMYA 4CFPA 1FBIX 3HFMY 2MECA 3T6UA 4O34A 5KXZA 2MEAA 3E3DA 4GLAA 5LVJA 5KKJA 1IWUA 1H87A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HH5A 4B1AA 3TXIA 2LYMA 3W6AA 1L79A 1JIYA 1LMPA 3A95A 1EQEA 1LZTA 4XENA 2B70A 3LZ2A 4BAPA 1CJ7A 1L56A 1O23A 1P2RA 1QT3A 2MEDA 1C6TA 3EMLA 4LGKA 5LIOA 1JISA 1L90A 4OWEA 1PS5A 1LHKA 2I6ZA 1L14A 1L31A 3WXUA 164LA 169LA 1LJ4A 242LA 4I7OA 3D9AC 1P5CA 4RDSA 1ZVHL 2F2QA 1L19A 4HTQA 1INUA 1VDTA 216LA 3QE8A 2NTHA 3WPJA 4TSCA 1L64A 4LT2A 1L72A 1QSQA 1L49A 5HNCA 120LA 1L51A 1T6VL 3FE0A 2CUUA 162LA 1KXWA 1WQMA 2BQIA 4EPIA 1L42A 2HU3A 1DI5A 1NDMC 4OO9A 4NGLA 152LA 3GUOA 2YBHA 3HBEX 1BHZA 5APFA 240LA 2BQCA 1LZ6A 8LYZA 2F32A 3W6CA 1NBZC 4EKRA 5D5CA 2HECA 5L3HA 3WU9A 4IAPA 1L21A 3WVYA 5LA5A 3C8RA 3HWLA 3V2YA 1T8FA 1DI3A 4PRQA 4FJRA 5LYZA 1C6NA 3A6CY 208LA 4LYZA 1N4FA 3ATOA 3T36A 5K7OA 1GFGA 5KXOA 1L18A 5LXWA 1GXV2 1L34A 1LI3A 1GB0A 1G0KA 1G7JC 2EKSC 1L45A 4ARPA 4M4OA 142LA 5APCA 5APDA 1IO5A 5KXSA 1OYUA 3SB9A 1LZBA 2IFFY 5II3A 1C67A 1NHEA 2FBBA 2BQBA 1L20A 1C61A 1PQDA 1IWZA 1L06A 1QTKA 3BKVA 4LYCA 184LA 2B5ZA 1IC5Y 1FKVA 1XGTC 3TMUA 1GFTA 4WL7A 1QTZA 1SX2A 1D9WA 1JJ1A 4NHTA 3A92A 3P64A 3K2RA 137LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2ZYC A;  3P65 A;  4NGW A;  4B1A A;  4ML7 A;  2LYM A;  3TXI A;  3W6A A;  1JIT A;  1GFU A;  4D9Z A;  1LZ9 A;  1JIY A;  5KXW A;  5JEN B;  1LMP A;  3A95 A;  3N9C A;  4NG1 A;  133L A;  5KXY A;  1EQE A;  2GV0 A;  1LHM A;  1LZS A;  1LZT A;  3VWO A;  4XEN A;  1IC4 Y;  4NSG A;  4H8X A;  1HFZ A;  1XFP L;  5FDJ A;  1YQV Y;  1WTM A;  1OUI A;  1XEK A;  1CJ7 A;  3LZ2 A;  4BAP A;  1J1X Y;  1SLY A;  1QSA A;  1XEI A;  1O23 A;  2MED A;  2D4J A;  2I25 L;  4H8Y A;  4J0L A;  4ETE A;  1GAY A;  1HFY A;  4IAT A;  4LGK A;  5L3I A;  1YIK A;  5LIO A;  1JIS A;  3AZ6 A;  1IP7 A;  1YKY X;  1LJ3 A;  5LVG A;  1VAU A;  3AZ5 A;  4OWA A;  4OWE A;  1PS5 A;  1LHK A;  1MEL L;  2I6Z A;  4WLT A;  1GFE A;  2Z19 A;  4WOA A;  4B0D A;  4B4E A;  1WQO A;  3WXU A;  1GB3 A;  1GB6 A;  1WQR A;  3B0K A;  5APE A;  2EPE A;  4HJY A;  2FYD A;  2ZNX Y;  4YM8 A;  3B72 A;  4H92 A;  1FLY A;  1F6R A;  5F14 A;  3WPL A;  4DDB A;  4N1C C;  5FCP A;  2DQD Y;  2BLY A;  3ZVQ A;  1LJ4 A;  1UIG A;  1CKC A;  1F6S A;  1JUG A;  1HEW A;  1V7S A;  2XBS A;  4UWV A; 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 4H1P A;  1BB6 A;  1JHL A;  1IWT A;  1YKZ X;  5J7C A;  2CGI A;  1OQM A;  2LYZ A;  3ZEK A;  1GE2 A;  5FEL A;  3RW8 A;  4H8Z A;  4DD9 A;  1B7O A;  2ZIJ A;  1LSE A;  1IOC A;  1B5X A;  1TBY A;  1C08 C;  1YAO A;  1LJK A;  1HFX A;  1B0D A;  1LAA A;  1GBS A;  134L A;  1ZMY L;  5F81 A;  1LSN A;  3WL2 A;  2ZIL A;  1EQ5 A;  1LMQ A;  3AB6 A;  1IWX A;  4H9E A;  4OWH A;  1HEL A;  1OUJ A;  2YBM A;  4OOO A;  3A3Q A;  1LJE A;  3RNX A;  1IIZ A;  5HMJ A;  4NY5 A;  1F10 A;  3A3R X;  1LSZ A;  3A8Z A;  1IP1 A;  1LMO A;  1WQP A;  1DZB X;  2C8O A;  4TTD A;  5D5F A;  1I20 A;  1LYS A;  1TDY A;  4C5F A;  1IWV A;  1BWI A;  1B7Q A;  4NGZ A;  4LFX A;  1C45 A;  3RT5 X;  3AYQ A;  3TXH A;  2BQL A;  2DQH Y;  5T3F A;  4RLN A;  1D6Q A;  1AM7 A;  2F30 A;  2XJW A;  3N9E A;  3WW5 A;  7LYZ A;  1VAT A;  4WL6 A;  2F4G A;  4RW2 A;  5A3Z A;  1KIQ C;  3WYH A;  4NHS A;  4MR1 A;  1LCN A;  1XEJ A;  1GB9 A;  2HUB A;  1IY3 A;  4ETC A;  1JKA A;  3TXF A;  4PPO A;  2MEH A;  3W6F A;  2HU1 A;  4HV1 A;  2BQD A;  3AW7 A;  1QTE A;  4Z3M A;  1IR8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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