1HHLA

The three-dimensional structure of pheasant and guinea-fowl egg lysozymes
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNSQATNRNTDGSTDYGVLQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALQSSDITATANCAKKIVSDGDGMNAWVAWRKHCKGTDVRVWIKGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
molecule keywords GUINEA FOWL LYSOZYME
publication title Crystal structures of pheasant and guinea fowl egg-white lysozymes
pubmed rcsb
source organism Numida meleagris
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hhlA00
3GXKA 4NGOA 5B06A 5I54A 1LJ4A 1FN5A 5B07A 1DZBX 2D4JA 5LAFA 4HTQA 1EQ4A 1LJIA 154LA 1HNLA 1GB8A 2HU3A 3AGGG 2Z39A 3B6LA 1IOQA 1GF0A 1GAYA 1GFRA 4LT2A 1LZ8A 5KXLA 3P4ZA 1DI5A 5APCA 4GN5C 3CQLA 4R0FA 4UWVA 2Y8PA 4WLTA 5ILFA 1W08A 4NHTA 4DD9A 1HMKA 2MECA 2H9JA 4TTDA 3TMXA 1GB0A 2XJWA 4H8YA 5KXTA 1HEWA 1QTKA 1WTMA 3HFMY 4PJ2C 5KJ9A 1CKFA 1DKKA 1TEWA 1QUTA 1DKJA 1GB2A 4ETCA 4OWHA 1KXXA 1NKHA 1VDPA 3N9AA 3WU8A 1WQPA 4ETDA 1J1XY 1A4VA 3AJNA 5IELA 1IWZA 3D3DA 2F4GA 3B0IA 3WUAA 1IVMA 135LA 4W96A 1QDRA 4KL7A 4Z3MA 4ZFPA 2PC2A 1LSBA 1D0KA 1T6VL 1YKXX 4HJZA 4DDCA 1IO5A 1ZV5L 3TMWA 3OJPA 1MELL 1G7LC 1UIDA 2DQCY 4MCKA 4NG8A 4WG7A 4BAPA 2HECA 1WQNA 4NG1A 4LYOA 4C3WA 1BQLY 5B1FA 1LJJA 4YENA 3EMSA 1CJ9A 1BB6A 4J1AA 1IP6A 1LSDA 2BQGA 4ET9A 4LZTA 4NSHA 1GF5A 3RZ4A 1UIHA 1LJEA 1JTPL 1I20A 3CSZA 4WM4A 193LA 1DQJC 5HQ1A 4TUNA 1BVXA 1B7RA 1XEIA 3LYMA 1OQMA 4XJHA 3EO5A 4N9RA 1OUBA 4WO6A 5FELA 1LSMA 2HEAA 1HFXA 5A3EA 4NHIA 4DD0A 5APFA 5LIOA 2MEIA 1QUSA 4ANRA 1ALCA 1GBOA 2DQGY 2XBSA 1RJCB 2XTHA 5A3ZA 1DXJA 4H94A 5F9XA 3TXEA 4BADA 1B7SA 1GBYA 1GFVA 3TXGA 5LA5A 1SQ2L 2G4NA 1GE3A 1HELA 3IJUA 4XJIA 3K3TA 1BWIA 4PRQA 1XEJA 4FDYA 3WW5A 1GFKA 1JKBA 2I26L 1LMOA 1CJ8A 1GBSA 1JSEA 1RFPA 1JJ1A 4YEOA 5APDA 1GXXA 4LT1A 5IHGA 3CT1A 1EQ5A 1T3PA 2LYMA 1NWGA 3ATOA 4LYTA 3W6DA 1IX0A 1I56A 4G9SA 2BQCA 4J1BA 5D5CA 1CKGA 4C5FA 4B49A 1VDSA 1HMLA 3KAMA 3ZEKA 4G4HA 2D91A 4G4BA 1GEZA 1BHZA 1B5WA 2BQLA 5I5QA 3CT5A 5HMVA 4WM6A 4OOTA 1LJ3A 1FKVA 4QEQA 1D9UA 4WL7A 2YBJA 4B4EA 1G7HC 3QY4A 4DD7A 4Z46A 2HEBA 5K7OA 2I25L 4NSGA 1HERA 2BQEA 4ETBA 1OUCA 2DQFC 1LZ1A 1IY3A 2VB1A 3AGHA 3E3DA 4LFPA 4B4JA 1VFBC 4NGYA 3D9AC 4LT3A 4KXIA 4UWNA 6LYZA 3HBEX 3TXDA 4NIJA 1F6SA 1GE2A 2H9KA 3RNXA 3WXTA 5HNLA 4M4OA 1XGRC 1GFAA 4H8XA 4TX7A 4ETAA 5KXOA 5ILCA 2YVBA 4N0JA 1EL1A 5J7CA 4XYYA 2ZNWY 1D0LA 4GCEA 1IC4Y 7LYZA 1GF6A 2WARA 2D4IA 4HJYA 1IC7Y 4NGVA 5I4WA 1LYSA 5I4YA 1GXV2 1WQMA 3P64A 5DL9A 1LYYA 2BLXA 1AM7A 5DN5A 1IR8A 3LYOA 1HC0A 5DLAA 4HV1A 5KXRA 1C43A 4Z41A 3WMKA 5KXYA 1NMMA 1WQQA 1IWVA 1GDWA 5C6IA 3RW8A 1FLQA 4OWEA 4GN4A 1GFHA 1IP2A 1H87A 2MEEA 1GE1A 1GDXA 1E8LA 1OUGA 5LAGA 5LVGA 1JJ0A 2B5ZA 1B2KA 5FEKA 5II3A 1IP7A 5KXNA 2CWIA 2DQDY 2Z2FA 1LZTA 4B4IA 1LHKA 4H90A 1UA6Y 4W94A 3WPJA 2YBMA 4IATA 2A7DA 2YDGA 4IASA 1XFPL 1IOTA 2YBIA 2ZYCA 1LZSA 1GB5A 4WM5A 1BWHA 4LFXA 1IWWA 1LZ4A 4GCFA 4TSCA 4NHPA 3HBDA 1NBYC 4BAFA 5JENB 3CB7A 1BB7A 1IOSA 1WVUA 4RW1A 1F10A 2Z19A 4H9FA 5FCPA 4H9BA 4HP0A 1IR9A 4MR1A 3W6CA 3TXIA 1GB6A 5KXXA 4II8A 2MEHA 3LZ2A 2H5ZA 5LYTA 3P68A 4NHQA 4LYCA 3A96A 3ULRA 4DD1A 2YBLA 4NGKA 4WOAA 1WQOA 2IFFY 1JIYA 1OUEA 3P65A 2IHLA 4CJ2A 5LYMA 1LSCA 1ZMYL 4RW2A 1LMNA 1PZYA 2ZQ4A 4O34A 5L9JA 1LJHA 1SLYA 3SP3A 2Z12A 3HBHA 3WVXA 1JTTL 5FHWA 4EMNA 1B7OA 1B7MA 2FBDA 4HSFA 4DT3A 1DI4A 2FYCA 1LZCA 2LZ2A 3IWRA 5M1YA 1UIFA 1XGQC 1F0WA 4HV2A 1GF3A 1CNSA 4XJFA 1AZFA 2AUBA 2BQOA 4I0CA 1BGIA 1IY4A 2BQAA 4YEMA 4ZEEA 1LSYA 1IWYA 1JKCA 1LHIA 1CKHA 3J4GA 3WH1A 3WXUA 3A8ZA 1DPXA 2HEEA 1XGTC 1YL1X 2N5ZA 1B7QA 1LSAA 3A6BY 4G49A 4H9HA 2ZWBA 3AZ4A 4OWCA 1XEKA 1CKCA 1VATA 4MSTA 3FI7A 3LYTA 3AZ6A 1HEMA 3TXBA 1VEDA 1REYA 4RDSA 1LSZA 2I6ZA 5L3IA 1F6RA 1IORA 4NSJA 5LVJA 3AW6A 4DYGA 133LA 207LA 4P2EA 3RU5A 1IIZA 134LA 3IJVA 1C7PA 4YF2A 1UIAA 1J1OY 1N4FA 4GCCA 4N1CC 6LYTA 1LMQA 3A67Y 3AZ7A 3WPLA 1LSGA 2DQEY 3G3AB 5KXPA 4XENA 2LZTA 3WUNA 4DC4A 1JHLA 4NHSA 3N9CA 4KT3A 3W6BA 2NWDX 5LYZA 4CFOA 5KY1A 2ZIJA 2F2NA 2W1YA 1XGUC 3A94A 1LZEA 1LHHA 1YAMA 2HUBA 4PHIA 1JISA 2MEFA 1OUAA 3A6CY 1LKSA 3TXJA 1LSPA 4QGZA 4NGJA 1LZAA 1GB3A 1LJFA 1YL0X 1JSFA 1GAZA 1UACY 1JITA 1LKRA 3A93A 4FJRA 4H8ZA 4ML7A 4WG1A 1O23A 2DBTA 3A3QA 4I8SA 5AMYA 3RT5X 4EOFA 2MEAA 4B0DA 1CKDA 2D6BA 4DWXA 1JJ3A 1W6ZA 5KXSA 1GF7A 1XGPC 4H91A 1FDLY 4XN6A 3CT0A 1AT6A 3WVYA 2DQAA 4WM2A 1VDTA 4YOPA 2BQNA 3F6ZA 2F4AA 3WULA 3WPKA 1YILA 1HFYA 9LYZA 1GE0A 1RI8B 1GBXA 1V7SA 3W3EA 1IOCA 1HEQA 3QE8A 4DDAA 1IR7A 3WL2A 1B5VA 1IP3A 2BQIA 1TBYA 2Z37A 4H9EA 1A2YC 4OWBA 1YIKA 1LZRA 1GHLA 4WLYA 5HMJA 1G7JC 4DD2A 2W1LA 4ZIXA 1B7NA 2CDSA 4H9CA 4WLXA 2D4KA 3M3UA 1C08C 4WLDA 4NGIA 1FKQA 2C8OA 1LMTA 4WM1A 1GFUA 4HJVA 3A92A 1BWJA 3LYZA 3A90A 5KXWA 4GN3A 1LZBA 3AYQA 2LHMA 1TCYA 1DI3A 4TSBA 1INUA 2Z38A 2CJLA 1LOZA 3J6KA 1YKZX 3B0OA 4X3BA 1KXYA 1XSFA 1RCMA 1YAPA 1NQIA 5EBHA 3WU9A 1IEEA 4A7DA 3AB6A 3AW7A 4LYBA 1HFZA 1GBWA 2BQJA 1G7IC 1QSWA 5F16A 3TXHA 4HTKA 5LINA 4NFVA 194LA 3BKVA 2C8PA 3M18B 4PRUA 3BKHA 1IWXA 1UCOA 3EBAB 1LCNA 1OUJA 2HTXA 1GFGA 1OUHA 3G3BB 4WL6A 1NHEA 1LZ6A 2YBNA 4CGEA 3LN2A 1LZ5A 1MLCE 4LYMA 4N8ZA 1C10A 3ATNA 3AZ5A 4OW1A 4GLAA 4CFPA 1LPIA 5D5FA 2EQLA 5IDDA 2CGIA 1TDYA 3FE0A 1CJ6A 2YSSC 1YKYX 208LA 1LHMA 2HEDA 4GCBA 3A91A 2DQJY 1GB7A 4ET8A 3W6EA 3B72A 4J7VA 4TWSA 1LSNA 2EKSC 1KIQC 2W1MA 4NSIA 1LMCA 1LMAA 1GEVA 1LSEA 4OWAA 1ZVYB 3T36A 2XBRA 4GLVA 1IWUA 8LYZA 1FLUA 1GF9A 1QTEA 2FYDA 4QDNA 3WU7A 4HTNA 4QY9A 4Z98A 5HNCA 2ZYPA 1IC5Y 2BQKA 1UICA 2ZNXY 1GE4A 1LJNA 1LZGA 1WQRA 4U3XB 1LZNA 1UIGA 2MEBA 4WO9A 2DKVA 3QNGA 1TAYA 2A7FA 1NF5A 1UBZA 1B0DA 3TMUA 1LJGA 1Z55A 4XADA 5FSTA 5L3HA 3ZVQA 1LMPA 2EIZC 5E4PA 1JUGA 1LJKA 5F81A 1QQYA 1HF4A 2G4PA 1OP9B 3A3RX 4NY5A 4R6CA 1KIRC 1BVKC 1HSWA 4N5RA 1REZA 1HHLA 3TMVA 1VDQA 4E3UA 2ZIKA 3A34A 1GBZA 5KXZA 3WUMA 1AT5A 1AKIA 1IWTA 1OUIA 2ZQ3A 4UWUA 5KKIA 1C45A 1IP4A 1GFEA 1LSFA 2MEGA 5F14A 1KXWA 2W1XA 1BB3A 1LHLA 1FLYA 3GXRA 5HLLA 1D6PA 2Z18A 4H93A 4XJGA 2BQHA 4WM3A 1OUDA 3OK0A 1D0MA 3W6FA 5E9RA 2DQIY 1NDMC 1JKAA 2F30A 5I53A 3W6AA 1C46A 4RLNA 1IP5A 4OOOA 4WMGA 1BB5A 4N1EI 3VWOA 4XJBA 5T3FA 1FBIX 5KKJA 3EXDA 1HENA 2BLYA 2RSCA 4G4CA 5FDJA 3LHMA 1REXA 4NGLA 4PPOA 5C6JA 1GFTA 1RE2A 3WW6A 4M6DA 1UUZC 1HEPA 1UC0A 2Z2EA 3MGWA 1B9OA 1GFJA 1P2CC 3WYHA 5LVHA 153LA 1B5ZA 1EQEA 4BS7A 4ETEA 3ZVQB 1LZYA 1JTOL 5C6LA 1QSAA 3AGIA 5LA8A 2BAAA 5LVKA 5B59A 1KIPC 1LZ9A 4HPEA 5DN4A 1JWRA 1H6MA 1FLWA 4NGWA 2YBHA 2BQBA 1CJ7A 1NDGC 2MEDA 4B1AA 2EPEA 3LZTA 4AXTA 2LYOA 3TXFA 1LYZA 1GPQC 1YAOA 2BQDA 2Q0MX 1LAAA 1LHJA 2FBBA 5B05A 4IJ4A 1I1ZA 1LZDA 2BQFA 4AGAA 1WVVA 1QIOA 1UIEA 2X0AA 5I4XA 5LXWA 4H92A 1B5YA 2HEFA 1QDTA 4YM8A 4KPMA 4LT0A 4NWHA 1YROA 1GWDA 3B0KA 3CSQA 1GD6A 1YANA 4L41A 4DDBA 1IP1A 2GV0A 1UIBA 3N9EA 5KXKA 1G7MC 1NBZC 2BQMA 1D6QA 1HSXA 1OUFA 1B7LA 1PS5A 4H9IA 4PGJB 5DM9A 1B5UA 2DQHY 3T6UA 4NWEA 4D9ZA 2HU1A 3CSRA 3P66A 4NGZA 1YAQA 2BPUA 1GF8A 4XJDA 5LVIA 1BB4A 4RLMA 4H1PA 5KXMA 1DPWA 1JKDA 1GB9A 1J1PY 3TXKA 1JPOA 1YQVY 5APEA 4CHXA 4GCDA 1VAUA 2LYZA 3A95A 1HEOA 4J0LA 1B7PA 2G4QA 4LGKA 5F9UA 1ZVHL 4LYZA 1V7TA 1LTMA 1B5XA 1LYOA 1WTNA 4HPIA 2ZILA 4DD3A 5B1GA 4NEBA 1JEFA 1REMA 4H9AA 132LA 1GF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FN5A 1DZBX 154LA 1HNLA 1GB8A 2HU3A 1L75A 1GF0A 1G1WA 1DI5A 2RH1A 4W56A 1W08A 4NHTA 1GB0A 1HEWA 1QTKA 1L53A 1QUTA 1DKJA 1KXXA 5IELA 1A4VA 2F4GA 3SB5A 3WUAA 2PC2A 1JQUA 1L27A 3TMWA 1CV5A 1MELL 1G7LC 1UIDA 4GBRB 2HECA 1WQNA 4LYOA 5B1FA 1C6LA 3D4SA 3EMSA 4J1AA 1LSDA 5HQ1A 4XJHA 1OUBA 151LA 211LA 5LIOA 2MEIA 2XBSA 1DXJA 1SQ2L 2G4NA 1GE3A 1HELA 3IJUA 4XJIA 3K3TA 1JKBA 1LMOA 1JSEA 1RFPA 1QTVA 226LA 3C8SA 3CT1A 2LYMA 1IX0A 4G9SA 4ARQA 4C5FA 1CKGA 1L61A 1L28A 1HMLA 3HDFA 4G4HA 1JTNA 1L86A 1BHZA 2B7XA 149LA 4WM6A 1FKVA 4WL7A 1G0MA 3QY4A 1HERA 2BQEA 2DQFC 4LFPA 1PQKA 2RBPA 4UWNA 1L94A 3TXDA 2H9KA 1XGRC 170LA 4TX7A 5ILCA 126LA 1D0LA 7LYZA 1IC7Y 129LA 3P64A 223LA 2BLXA 4LZMA 5DN5A 1IR8A 1HC0A 5KXYA 1NMMA 1D9WA 1IWVA 1QSQA 1H87A 1GDXA 1E8LA 5LVGA 1L32A 1JJ0A 1IP7A 5KXNA 2Z2FA 1LZTA 4B4IA 4IATA 4IASA 2YBIA 4W57A 1QS9A 4WM5A 1EPYA 1KY0A 1LZ4A 4NHPA 1NBYC 2QB0B 3CB7A 1IOSA 3HUQA 1G0QA 4W54A 229LA 5LYTA 3P68A 3A96A 4PK0A 4DD1A 4YX7C 1JIYA 3P65A 145LA 2IHLA 4CJ2A 4RW2A 2ZQ4A 3WVXA 141LA 185LA 1L66A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3GXK A;  4NGO A;  5B06 A;  5I54 A;  1LJ4 A;  1FN5 A;  5B07 A;  1DZB X;  2D4J A;  5LAF A;  4HTQ A;  1EQ4 A;  1LJI A;  154L A;  1HNL A;  1GB8 A;  2HU3 A;  3AGG G;  2Z39 A;  3B6L A;  1IOQ A;  1GF0 A;  1GAY A;  1GFR A;  4LT2 A;  1LZ8 A;  5KXL A;  3P4Z A;  1DI5 A;  5APC A;  4GN5 C;  3CQL A;  4R0F A;  4UWV A;  2Y8P A;  4WLT A;  5ILF A;  1W08 A;  4NHT A;  4DD9 A;  1HMK A;  2MEC A;  2H9J A;  4TTD A;  3TMX A;  1GB0 A;  2XJW A;  4H8Y A;  5KXT A;  1HEW A;  1QTK A;  1WTM A;  3HFM Y;  4PJ2 C;  5KJ9 A;  1CKF A;  1DKK A;  1TEW A;  1QUT A;  1DKJ A;  1GB2 A;  4ETC A;  4OWH A;  1KXX A;  1NKH A;  1VDP A;  3N9A A;  3WU8 A;  1WQP A;  4ETD A;  1J1X Y;  1A4V A;  3AJN A;  5IEL A;  1IWZ A;  3D3D A;  2F4G A;  3B0I A;  3WUA A;  1IVM A;  135L A;  4W96 A;  1QDR A;  4KL7 A;  4Z3M A;  4ZFP A;  2PC2 A;  1LSB A;  1D0K A;  1T6V L;  1YKX X;  4HJZ A;  4DDC A;  1IO5 A;  1ZV5 L;  3TMW A;  3OJP A;  1MEL L;  1G7L C;  1UID A;  2DQC Y;  4MCK A;  4NG8 A;  4WG7 A;  4BAP A;  2HEC A;  1WQN A;  4NG1 A;  4LYO A;  4C3W A;  1BQL Y;  5B1F A; 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 1UC0 A;  2Z2E A;  3MGW A;  1B9O A;  1GFJ A;  1P2C C;  3WYH A;  5LVH A;  153L A;  1B5Z A;  1EQE A;  4BS7 A;  4ETE A;  3ZVQ B;  1LZY A;  1JTO L;  5C6L A;  1QSA A;  3AGI A;  5LA8 A;  2BAA A;  5LVK A;  5B59 A;  1KIP C;  1LZ9 A;  4HPE A;  5DN4 A;  1JWR A;  1H6M A;  1FLW A;  4NGW A;  2YBH A;  2BQB A;  1CJ7 A;  1NDG C;  2MED A;  4B1A A;  2EPE A;  3LZT A;  4AXT A;  2LYO A;  3TXF A;  1LYZ A;  1GPQ C;  1YAO A;  2BQD A;  2Q0M X;  1LAA A;  1LHJ A;  2FBB A;  5B05 A;  4IJ4 A;  1I1Z A;  1LZD A;  2BQF A;  4AGA A;  1WVV A;  1QIO A;  1UIE A;  2X0A A;  5I4X A;  5LXW A;  4H92 A;  1B5Y A;  2HEF A;  1QDT A;  4YM8 A;  4KPM A;  4LT0 A;  4NWH A;  1YRO A;  1GWD A;  3B0K A;  3CSQ A;  1GD6 A;  1YAN A;  4L41 A;  4DDB A;  1IP1 A;  2GV0 A;  1UIB A;  3N9E A;  5KXK A;  1G7M C;  1NBZ C;  2BQM A;  1D6Q A;  1HSX A;  1OUF A;  1B7L A;  1PS5 A;  4H9I A;  4PGJ B;  5DM9 A;  1B5U A;  2DQH Y;  3T6U A;  4NWE A;  4D9Z A;  2HU1 A;  3CSR A;  3P66 A;  4NGZ A;  1YAQ A;  2BPU A;  1GF8 A;  4XJD A;  5LVI A;  1BB4 A;  4RLM A;  4H1P A;  5KXM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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