1HHLA

The three-dimensional structure of pheasant and guinea-fowl egg lysozymes
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNSQATNRNTDGSTDYGVLQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALQSSDITATANCAKKIVSDGDGMNAWVAWRKHCKGTDVRVWIKGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase(o-glycosyl)
source organism Numida meleagris
publication title Crystal structures of pheasant and guinea fowl egg-white lysozymes
pubmed rcsb
molecule keywords GUINEA FOWL LYSOZYME
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1993-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hhlA00
3A95A 2BQKA 1ZV5L 133LA 1NDMC 1REYA 1XEKA 2YDGA 5LVJA 1B0DA 1JJ0A 4YEOA 5F9XA 4AGAA 2N5ZA 5B06A 1WQOA 1HMKA 4PJ2C 1GB8A 1HSXA 1AT6A 4HSFA 4DD9A 2B5ZA 2BPUA 1GB9A 1YAPA 2H9JA 4LYCA 5HMJA 1VDTA 3TXDA 1J1OY 1CJ9A 1QUSA 4NGKA 4ETDA 4NGZA 1BB3A 1G7LC 3WVXA 4XJFA 4GCDA 1GBOA 1JUGA 4E3UA 1IVMA 2Z18A 3AZ4A 3LN2A 5HNLA 2H5ZA 5KXKA 3FE0A 4WMGA 1F6RA 2ZNWY 4A7DA 1IOSA 1NBYC 1GFVA 1KXWA 1TEWA 1OUHA 4RW2A 1IWVA 1GBWA 2YBJA 1KIPC 1KXXA 4BAFA 2BLYA 3A6BY 4BAPA 1JSFA 4H90A 2MEAA 4CJ2A 5LA5A 4HTKA 1IR8A 1J1PY 1EQ4A 3OK0A 4YM8A 1YAQA 2DBTA 2F4AA 3WU7A 1LZCA 5KXOA 1C08C 1OUJA 1ALCA 5FDJA 1ZMYL 3IJUA 3B72A 2D91A 1IP6A 1DI5A 4PHIA 5KXWA 3W6FA 3A3QA 1LJJA 4XJIA 2ZWBA 3LYTA 3W6EA 1OUCA 5K7OA 2LZ2A 1LJ4A 1IR9A 1O23A 5A3EA 2DQGY 4HTNA 4IASA 1LHKA 1LKSA 5KXZA 1UICA 5HQ1A 1LSBA 207LA 3LZ2A 3QNGA 1OP9B 5LYMA 5F16A 4ETBA 1IY3A 3AZ5A 4I0CA 2I6ZA 4N9RA 3P64A 2YBNA 5DN4A 3TMWA 1WQRA 1LCNA 1QSWA 4M6DA 1LYSA 1UACY 3AYQA 1AT5A 4YENA 4QY9A 4WM5A 1HEPA 1D0MA 2HU3A 1LJHA 4WO9A 1GF3A 3N9CA 5LXWA 3BKHA 4GCEA 2XBRA 5LIOA 2IFFY 4WLYA 4C3WA 1GF6A 1LZTA 5KKJA 1EQEA 1LAAA 4QGZA 1BB4A 1GB3A 1FDLY 2HU1A 3WUAA 5DN5A 4H91A 2XBSA 4B4EA 1B5UA 3WPKA 4RLNA 5KXNA 1JPOA 1GB0A 2D4IA 3A67Y 4GN4A 1JJ3A 2DQAA 1JWRA 1JISA 132LA 1F10A 1LZ1A 5E9RA 1NKHA 4CFOA 3ZVQB 3B0IA 4WG1A 5I5QA 1GFUA 2Z37A 5L3HA 3WH1A 4AXTA 4ETAA 1B2KA 4DD2A 4LT2A 4YF2A 1W6ZA 4H9BA 4XJHA 5APFA 1JIYA 5LVKA 2G4NA 4NSHA 1BB6A 4W96A 1DKJA 4OWAA 1DXJA 1LMOA 4DC4A 1JKDA 1BVXA 1HENA 4RW1A 2DQFC 1CJ6A 1XGUC 4RDSA 4HJVA 1BWIA 1IWXA 1HFXA 1I56A 1GF9A 1C45A 3A94A 4G9SA 1UIBA 4LZTA 4WO6A 3WXTA 1LZDA 4PPOA 1LYOA 3WU8A 4DYGA 5LVHA 4DD0A 1IX0A 1SLYA 3W6CA 1OUGA 2DQIY 4H94A 1FLYA 4N0JA 4NGYA 1LZBA 1GHLA 1LJIA 1LHJA 1B9OA 1QSAA 4H1PA 1GF8A 4X3BA 1CJ7A 4GCFA 1N4FA 1CKGA 1LSGA 4H8YA 4LGKA 5C6JA 4B4IA 4H93A 4LT3A 3VWOA 1UIEA 4NFVA 5FSTA 2RSCA 6LYTA 1IR7A 1IEEA 1LOZA 4N1CC 1IORA 1GF0A 2HEDA 2BQBA 1LMCA 1V7SA 2HEFA 4LYMA 4MSTA 1RE2A 2FBBA 1UUZC 4G4CA 4D9ZA 4HJYA 4NWEA 1LMTA 3AW7A 1GB2A 1NHEA 1IC4Y 1PZYA 2AUBA 1IWWA 4IATA 2F30A 4NIJA 5E4PA 3WPJA 3CT5A 3WULA 1IOCA 1NF5A 1GAYA 4J1AA 1LSAA 5HNCA 3A3RX 2CJLA 1GAZA 1LMAA 4WOAA 5ILCA 1GFKA 1D0LA 4L41A 1HHLA 5JENB 1WTNA 1FLUA 3CT1A 1WQPA 1G7IC 2F4GA 1YQVY 1GF5A 1GXV2 1LSFA 1HFYA 1LHMA 4II8A 3J6KA 1OUFA 1RFPA 3IWRA 4WLXA 1LJEA 2XJWA 4UWVA 3T36A 1QUTA 3HBHA 2LYZA 3K3TA 1HELA 2BQLA 2MEBA 3LYZA 3A91A 1GFAA 1GF7A 1SQ2L 1FKVA 1AKIA 3P68A 1LTMA 5DLAA 1HFZA 1GFHA 1A2YC 2CDSA 1GBSA 3GXRA 4HP0A 4HV2A 1YAOA 1LZRA 4TX7A 3B6LA 1JKAA 1GXXA 3W3EA 4NG1A 5B59A 4H9HA 1MELL 4N8ZA 1B7QA 134LA 5J7CA 135LA 1JTOL 1GDXA 2D4KA 1LYYA 3BKVA 4MR1A 1DQJC 1WTMA 1GE2A 2LHMA 4WL7A 3EMSA 1HMLA 4ETEA 4FJRA 4I8SA 1BB5A 1GWDA 1LPIA 1LSCA 5APDA 1LMNA 1YKXX 3KAMA 1C46A 4WM2A 4Z98A 5EBHA 1UIAA 5F14A 3WMKA 1FLWA 1IP4A 1LSYA 1LZ9A 3A92A 4KPMA 4QEQA 3WL2A 3ZEKA 2LZTA 3LZTA 4UWNA 1WQMA 4DDBA 2C8PA 2FYCA 1IP3A 1C43A 4H9IA 1MLCE 2HEBA 2Z2FA 1LMQA 1YKZX 4B4JA 4DDAA 4Z3MA 1B7PA 3TXBA 1LHLA 5IELA 5KXMA 3RW8A 4CGEA 1GE0A 3WUMA 4LYBA 4KL7A 5KKIA 5LYZA 1RCMA 2ZYPA 3CQLA 4CFPA 153LA 194LA 3LHMA 1YILA 3TMXA 3B0KA 3TXKA 4U3XB 3D3DA 3TXJA 2I26L 1IP7A 4NSGA 5D5FA 4NHPA 2DQCY 1G7HC 3P4ZA 1G7JC 1UBZA 4WLDA 2CWIA 2BQCA 3CT0A 5L9JA 3D9AC 2A7DA 1TAYA 4QDNA 4DD1A 5KXRA 1VDSA 5I54A 1CJ8A 2MEHA 4B0DA 5LAFA 3AZ6A 1LZYA 5KXYA 2MEIA 2BQJA 1LZSA 1NMMA 4ET8A 1QQYA 5LA8A 1E8LA 3W6BA 1LZGA 3A8ZA 1F6SA 3AJNA 4GLAA 1CKFA 1YANA 4XYYA 5AMYA 5B1FA 5F9UA 1CKCA 1UIHA 4LFPA 4LFXA 5L3IA 1TDYA 2DKVA 5KXLA 1NQIA 2DQHY 3TXGA 1REXA 2G4PA 4XN6A 4HJZA 1HSWA 4XJGA 1GB7A 4O34A 2Z19A 3AB6A 4UWUA 4XJDA 1XGPC 3CSRA 4LT1A 5C6LA 1HC0A 3M18B 1IC5Y 4H9FA 1LYZA 1EL1A 1T6VL 2PC2A 2BQAA 1OUIA 2H9KA 3J4GA 1YAMA 3WPLA 1D0KA 1XEIA 2MECA 3QE8A 4C5FA 1GEZA 1QDTA 2W1XA 4IJ4A 4GCCA 3A93A 1GF4A 3WYHA 1LJ3A 2W1MA 4PRQA 2EQLA 4H9EA 2EPEA 1BVKC 1OQMA 1HERA 1GBZA 3LYMA 3P65A 1B7NA 1IY4A 1I1ZA 1B5WA 5M1YA 3ATOA 2DQDY 3A6CY 2Z2EA 9LYZA 1IP1A 1LSDA 2BQGA 1LSMA 5I4WA 3G3AB 3AGHA 1DZBX 5KXXA 2FBDA 3EXDA 5DM9A 3HBEX 4YEMA 1GFRA 3G3BB 4HPEA 2BLXA 3N9AA 1GBYA 4NG8A 3F6ZA 1OUEA 2WARA 4XADA 3ZVQA 4TSCA 2YBHA 1IWTA 3WW6A 2HEEA 1IIZA 4NY5A 1GB6A 1VFBC 1NWGA 3EO5A 1EQ5A 1HEOA 2X0AA 2W1YA 3A90A 4PGJB 4ETCA 193LA 4HPIA 4NEBA 5FHWA 4NSIA 3WU9A 1JKCA 4ML7A 1D9UA 4OWBA 4WL6A 3WW5A 5ILFA 1LZ4A 4LYZA 4M4OA 1OUDA 5I53A 1HEMA 2MEEA 4TWSA 1YL0X 1OUBA 2MEDA 1IWZA 5FELA 1DI4A 1I20A 3OJPA 5IDDA 1G7MC 4YOPA 4GCBA 1WVVA 4W94A 3WUNA 2D4JA 1HF4A 1RI8B 2EIZC 2C8OA 2FYDA 2GV0A 1LSNA 2NWDX 3CSZA 3HBDA 4NHIA 1VATA 1PS5A 1LZEA 2YBLA 4DD3A 5I4XA 3AGGG 1JJ1A 3FI7A 5KXSA 1KIRC 1JSEA 1LZ8A 5D5CA 4H9AA 3IJVA 1LJKA 5HLLA 1BB7A 1DKKA 2BQOA 3SP3A 4EMNA 1B7MA 2XTHA 1GFGA 4NGIA 1IO5A 1ZVHL 4NSJA 5B07A 1CKDA 1BHZA 1UCOA 1VEDA 5IHGA 5DL9A 5LAGA 5APCA 1QIOA 2F2NA 2DQEY 4TTDA 2MEFA 2ZIKA 1BGIA 1A4VA 3A34A 1UC0A 2Y8PA 2BQIA 1GE3A 1LKRA 1AZFA 2DQJY 8LYZA 1GDWA 4NGOA 4WLTA 5APEA 4G49A 3W6AA 1BWJA 4OOTA 1JKBA 1H6MA 1B7SA 1J1XY 2BQFA 1ZVYB 3AGIA 4GN5C 4N1EI 1BQLY 3T6UA 2BQEA 1QDRA 4J7VA 2D6BA 2ZQ3A 2G4QA 4NWHA 1DPWA 3TMUA 3TMVA 3TXHA 2Z38A 4BS7A 4ZIXA 2HUBA 3TXFA 1KXYA 1IC7Y 1T3PA 4OWEA 4TUNA 5LVGA 1BWHA 1XGRC 2I25L 2YBMA 1XEJA 4DDCA 1VDQA 1YROA 3QY4A 3RT5X 5KXTA 1JTTL 4HV1A 4DD7A 4NHQA 208LA 1HEWA 2EKSC 3E3DA 4H8ZA 3WVYA 1HEQA 2BAAA 1LSEA 2ZYCA 5KJ9A 4Z41A 4H9CA 1YL1X 1UIDA 1XFPL 2VB1A 1IWUA 2W1LA 4R6CA 2CGIA 2HTXA 2Z12A 5FCPA 1JITA 2ZILA 1WQNA 5LYTA 4WM6A 1INUA 1LJGA 1NBZC 4H8XA 4BADA 4GN3A 1GD6A 5T3FA 1GPQC 4LT0A 1B7LA 4ZFPA 2HECA 3ULRA 1DPXA 3HFMY 1LZ5A 1LSPA 154LA 6LYZA 1GFJA 1REZA 2YVBA 1RJCB 4N5RA 4ET9A 4OWCA 2BQDA 3GXKA 4TSBA 5II3A 4NGVA 1YKYX 1YIKA 4FDYA 1H87A 1UA6Y 1LHIA 1IWYA 2A7FA 1JEFA 3W6DA 2HEAA 4P2EA 3P66A 1D6PA 4NGWA 1DI3A 1XGTC 5B1GA 3CB7A 1B5XA 1XSFA 4EOFA 5F81A 1Z55A 1VDPA 4ZEEA 3N9EA 4RLMA 1GFEA 1GE4A 3CSQA 1NDGC 3B0OA 1JHLA 2YSSC 1QTEA 5KXPA 7LYZA 2LYMA 4DT3A 1B5ZA 1GFTA 1LMPA 4WM3A 4KT3A 4R0FA 3TXEA 5C6IA 1TCYA 1TBYA 1W08A 4MCKA 1LZAA 3AW6A 1AM7A 4G4HA 1KIQC 4WM4A 5KY1A 1C7PA 4OOOA 4NGJA 1UIGA 1FBIX 4LYOA 4GLVA 1IP2A 5B05A 2ZNXY 4NHTA 1FN5A 1GE1A 1FLQA 1IOQA 1F0WA 1P2CC 1UIFA 4H92A 3RZ4A 3EBAB 3LYOA 1IP5A 4LYTA 4B1AA 2ZIJA 1LHHA 1OUAA 1QTKA 4CHXA 2BQMA 1WVUA 3RNXA 4WG7A 4NHSA 1IOTA 1GBXA 4PRUA 1WQQA 2IHLA 5LVIA 1XGQC 4XJBA 1V7TA 3WXUA 1B5YA 3M3UA 1VAUA 3RU5A 3TXIA 4NGLA 1HNLA 4B49A 1C10A 1D6QA 4OW1A 2Z39A 1GB5A 1REMA 2LYOA 2ZQ4A 5A3ZA 1LJFA 4Z46A 2BQNA 1LZNA 2Q0MX 4XENA 4J1BA 1LJNA 1CNSA 3AZ7A 1B5VA 4OWHA 4DWXA 5LINA 4WM1A 1LZ6A 1B7OA 4HTQA 1GEVA 2BQHA 1FKQA 1LSZA 5I4YA 5FEKA 1B7RA 2MEGA 1CKHA 3MGWA 4G4BA 4ANRA 4J0LA 2YBIA 3A96A 5HMVA 1JTPL 3ATNA 4KXIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQKA 133LA 4EKPA 141LA 1T8AA 3FA0A 1PQIA 5B06A 4LZMA 1YAPA 3TXDA 4ETDA 211LA 1QSBA 1L36A 1BB3A 1G7LC 1L48A 1DYAA 1L91A 4E3UA 1K28A 1F6RA 2ZNWY 1TEWA 1IWVA 3GUOA 2YBJA 3FI5A 4BAFA 2RAZX 2BLYA 4H90A 3OK0A 1YAQA 1C6QA 1ALCA 2B6ZA 1ZMYL 3JR6A 5KXWA 3W6FA 1LI2A 221LA 1LJJA 2OU0X 4XJIA 2ZWBA 3W6EA 5K7OA 262LA 1LHKA 1LSBA 4ETBA 4W51A 3AZ5A 2YBNA 1WQRA 2HU3A 1LJHA 1GF3A 3N9CA 5LXWA 2O79A 4ARMB 3BKHA 2B7XA 4GCEA 2NTGA 5LIOA 236LA 1BB4A 1QT8A 2HU1A 1JPOA 1CV3A 1C67A 4GN4A 2DQAA 1JWRA 165LA 3B0IA 1QTZA 1GFUA 2Z37A 3WH1A 4AXTA 4I7RA 1QT4A 1W6ZA 4H9BA 4XJHA 1JIYA 4OWAA 1DXJA 1HENA 1CJ6A 3A94A 1HFXA 1I56A 3GUMA 4WO6A 3WXTA 1G0JA 4DD0A 2DQIY 3K2RA 1L23A 4N0JA 4NGYA 1L39A 197LA 4LGKA 4H8YA 1N4FA 4LT3A 1P37A 1IEEA 1GF0A 1D2WA 3AW7A 1L26A 1NHEA 1IC4Y 4NIJA 5E4PA 1NF5A 1L61A 5HNCA 1GFKA 224LA 1WQPA 178LA 1LHMA 1OUFA 4UWVA 1ZWNA 4DQ5A 3K3TA 2BQLA 1GFAA 3P68A 1L90A 1GBSA 4HV2A 4HP0A 1B6IA 4TX7A 4E97A 4NG1A 4H9HA 1QTBA 1MELL 2D4KA 4MR1A 1XJTA 2LHMA 1HMLA 1LYJA 4ETEA 4I8SA 1C68A 1G0LA 1QT5A 1LMNA 3KAMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3A95 A;  2BQK A;  1ZV5 L;  133L A;  1NDM C;  1REY A;  1XEK A;  2YDG A;  5LVJ A;  1B0D A;  1JJ0 A;  4YEO A;  5F9X A;  4AGA A;  2N5Z A;  5B06 A;  1WQO A;  1HMK A;  4PJ2 C;  1GB8 A;  1HSX A;  1AT6 A;  4HSF A;  4DD9 A;  2B5Z A;  2BPU A;  1GB9 A;  1YAP A;  2H9J A;  4LYC A;  5HMJ A;  1VDT A;  3TXD A;  1J1O Y;  1CJ9 A;  1QUS A;  4NGK A;  4ETD A;  4NGZ A;  1BB3 A;  1G7L C;  3WVX A;  4XJF A;  4GCD A;  1GBO A;  1JUG A;  4E3U A;  1IVM A;  2Z18 A;  3AZ4 A;  3LN2 A;  5HNL A;  2H5Z A;  5KXK A;  3FE0 A;  4WMG A;  1F6R A;  2ZNW Y;  4A7D A;  1IOS A;  1NBY C;  1GFV A;  1KXW A;  1TEW A;  1OUH A;  4RW2 A;  1IWV A;  1GBW A;  2YBJ A;  1KIP C;  1KXX A;  4BAF A;  2BLY A;  3A6B Y;  4BAP A;  1JSF A;  4H90 A;  2MEA A;  4CJ2 A;  5LA5 A;  4HTK A;  1IR8 A;  1J1P Y;  1EQ4 A;  3OK0 A;  4YM8 A;  1YAQ A;  2DBT A;  2F4A A;  3WU7 A;  1LZC A;  5KXO A;  1C08 C;  1OUJ A;  1ALC A;  5FDJ A;  1ZMY L;  3IJU A;  3B72 A;  2D91 A;  1IP6 A;  1DI5 A;  4PHI A;  5KXW A;  3W6F A;  3A3Q A;  1LJJ A;  4XJI A;  2ZWB A;  3LYT A;  3W6E A;  1OUC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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