The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
41
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of human oxyhaemoglobin at 2.1 A resolution.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
HEMOGLOBIN A (OXY) (ALPHA CHAIN)
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| molecule tags |
Oxygen transport
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
41
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1983-06-10 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1COH A; 1HGC B; 1UVX A; 1YCB A; 1NS6 B; 5F0B A; 1VXE A; 1XZ7 B; 1NPG A; 3HRW A; 1BZ1 B; 2MGB A; 3OZW A; 4UZV A; 5HBI A; 2HBC B; 4MAX A; 2DN1 A; 3K8B B; 2IN4 A; 1CMY B; 1G09 B; 5HLQ A; 1MKO B; 1Y31 B; 1Y0A B; 1GDL A; 2ZLX A; 2HBF A; 2H8D B; 2R1H B; 5KKK A; 1IRC A; 1QI8 B; 4AVE A; 2MHB A; 2MYA A; 3GYS B; 1X9F C; 4H2L B; 1UIW B; 3A59 A; 1BAB A; 3UH3 A; 2FAL A; 2HCO A; 4O1T A; 4F6J A; 1C7C B; 1A00 B; 3D1A A; 2M6Z B; 2PGH A; 2DN2 B; 1TU9 A; 1YH9 A; 1HGA B; 2LH1 A; 4TWU A; 3W4U B; 2ZS0 D; 2MGK A; 1YGF B; 4N7P B; 1NEJ A; 1O16 A; 2ZLW B; 2ZSN A; 1CBL A; 4FC3 B; 1X9F B; 3AT5 B; 1HAC A; 1G08 A; 1UVY A; 1V75 B; 2QLS B; 4H0B A; 3GOU B; 3EDB A; 1YZI A; 1X46 A; 1ECA A; 3WCV A; 4FH7 A; 5E83 A; 3WCW D; 1MLM A; 1LTW A; 2QSS B; 4NI0 A; 1MYT A; 1SI4 B; 1DWT A; 1YVT A; 3GQP B; 1LFZ A; 2ZLV B; 1B86 B; 2DXM B; 3CY5 B; 1Y4Q A; 3UHR A; 1Y5F B; 1Y45 B; 1QSI B; 1ASH A; 1C7D A; 1LH1 A; 4G51 A; 3UHH A; 1CG5 A; 3WHM A; 1CO9 A; 1BZ0 B; 2EF2 A; 2ZT3 A; 1YOH A; 1VHB A; 2HHE B; 3ZJM A; 1RQ4 A; 1DLY A; 1LA6 B; 2D5X B; 3UHT A; 1YE0 A; 1J3Z B; 2MYB A; 1A3N B; 1CP5 A; 3D4X B; 2QMB A; 2ZS0 C; 1HV4 B; 1YMC A; 3PI1 A; 1KD2 A; 1YEV B; 4N7O A; 3NG6 B; 1O1M B; 1BIN A; 1O1N A; 2AUO A; 1THB B; 2HBS A; 4X0L A; 3DHT B; 2NSR A; 3BJ1 B; 110M A; 1EMY A; 4JAC A; 1URV A; 2AV3 A; 5JOM A; 2ZS0 B; 3AG0 A; 3NFE A; 1KR7 A; 3ZJP A; 1GZX B; 1Y83 A; 3HEN A; 1O1K A; 4MQH A; 1C7B A; 1LH6 A; 3GKV B; 1QXD B; 1OR4 A; 1HLM A; 1LFV A; 3HEO A; 2BLJ M; 1T1N A; 5CN9 A; 5E6E A; 2WY4 A; 3OK5 A; 1VXA A; 1KFR A; 2YRS B; 5CNB A; 1A4F A; 1CH4 A; 3ODQ A; 3PIA A; 3E55 A; 2QU0 A; 1DXV B; 5ILR A; 2HZ3 A; 1VXF A; 5EE4 C; 1V4U B; 2V1K A; 1O1P A; 3ECL A; 2G11 A; 4OF9 A; 1FCS A; 3WCT D; 1RVW A; 1HDS B; 1Y4P B; 4NK2 A; 1O1I B; 1HBH B; 4MXL A; 3S1J A; 5ILP A; 3QQR A; 1J7S A; 1YEN B; 1CIO A; 1N9F A; 5EV5 A; 2FRI X; 1J41 B; 1Y2Z B; 1OUT A; 5HY8 B; 1LH3 A; 4DC8 A; 3EU1 B; 2MYE A; 1C40 B; 1SDK A; 1Y5K A; 2OHA A; 1LFY B; 4TYX A; 3BJ2 B; 3A0G B; 1CQX A; 102M A; 2GRZ A; 3IC2 B; 1K1K B; 1QPW B; 1MLQ A; 2HHB A; 1BJE A; 5D5R A; 1NGK A; 2LH2 A; 1Y0T A; 2W6X A; 5B84 A; 4ILZ A; 1PBX A; 4M4A A; 1SPG B; 3WCP B; 1HBB A; 1MLU A; 1MLO A; 1HBA B; 2V1G A; 5C6E B; 1XQ5 A; 1LHS A; 1MOD A; 4ZVB A; 3WCT C; 1Y7C A; 1GBU A; 3HYU B; 2BW9 M; 104M A; 1G0A A; 4YU3 B; 2BMM A; 3EOK A; 4F6G A; 1DXU B; 1MYG A; 5CN5 A; 2H35 B; 3A2G A; 4U8U D; 1YGD A; 4MQI B; 1IT2 A; 5KDQ B; 3BOM A; 3E4N A; 3M39 A; 3ONZ A; 3E5O A; 109M A; 2Z6N B; 3WCT B; 5EYS A; 1YHR B; 1NQP B; 3A9M A; 1YHU D; 1GJN A; 1GCW A; 3E5I A; 3UHD A; 4FH6 A; 4ZVA A; 5AB8 A; 1MTI A; 3CIU B; 1S5Y A; 3VRF B; 6HBW A; 1FHJ A; 1R1Y B; 1YDZ A; 3UI0 A; 1MWD A; 1H1X A; 1HGB A; 5F2A A; 2VYW A; 1ABY A; 1A0Z A; 1IRD B; 4MXK A; 3S1I A; 1IBE B; 1RQA A; 3ARK A; 1LH7 A; 3UHW A; 3IC0 B; 1JY7 A; 1LFL B; 2VEB A; 1UC3 A; 2ZFB B; 2G12 A; 1A9W A; 3LR7 A; 4U8U C; 1Y7G A; 5JGG A; 3S65 B; 3NL7 B; 1YG5 A; 1HAB B; 1YE2 A; 4O35 A; 1SHR B; 1M9P B; 1H97 A; 3R0G A; 1J7W A; 1M6M A; 3A5A A; 2VYY A; 1NIH A; 2D60 B; 1V9Q A; 2OIF A; 2QSP B; 5CN8 A; 1YHU C; 1ABW B; 5SW7 A; 1GBV A; 1V4W B; 4N8T A; 3QJC A; 4U8U B; 3LB2 A; 1HCO A; 2G0Z A; 4C44 A; 3S66 A; 3M3B A; 2SPM A; 1IWH B; 3ZJO A; 3G4U A; 2HBC A; 1YHU B; 1JP8 A; 3OO4 B; 1Y0W B; 3S48 C; 1DO3 A; 1YEO A; 1EBC A; 3RJN B; 1XZ2 B; 3AT6 B; 1MNI A; 2KSC A; 3G4R A; 3HF4 A; 2H8D A; 1RQ3 B; 1QSH B; 1CQ2 A; 2D2M A; 3HXN B; 1SDL A; 3PI9 A; 3VRG A; 1A6G A; 3LB1 A; 1R1X A; 1A0U A; 1DTI A; 5CNC A; 4L7Y A; 1Y4B B; 1DKE B; 1JEB A; 1N9H A; 5E29 B; 1S5X A; 5IKS A; 1DO7 A; 1MLS A; 2GTL D; 5CN7 A; 2ZSS A; 2ZLU A; 1HDA B; 3D17 B; 3LQD A; 4MQG A; 3WFW A; 1J7Y A; 1PMB A; 2XYK A; 5AZQ A; 3PT7 A; 1HDB B; 3GQG B; 1O1J B; 4HSW A; 3UBV A; 2W72 C; 3LR9 A; 1Y8K B; 4G1B A; 4SDH A; 3K3U A; 4WJG 1; 5EOH A; 3QJB A; 1ITH A; 3ASE A; 4HBI A; 3R5I B; 1V4X A; 2R4Y A; 5HU6 A; 3UHV A; 3WR1 B; 2FAM A; 5KER B; 1AJ9 B; 1MZ0 A; 3ZJN A; 2W72 B; 1MLH A; 2ZSY A; 2PEG A; 2DHB B; 3NMM A; 1A3O A; 1NZ5 A; 3WCU A; 2HZ2 A; 4BJA A; 2IG3 A; 2R80 A; 2O58 X; 3SDH A; 1S61 A; 2GKM A; 2GTL C; 1Y7Z A; 3V2V A; 4HRT B; 3QJD B; 1CG8 B; 1J3Y B; 4MQJ B; 1Y8I B; 2MGD A; 1L2K A; 1VWT B; 4MQC B; 1YHE A; 4KMW A; 3ZJR A; 5JDO D; 1O1O A; 3KMF C; 3KUN A; 2RAO B; 1RPS B; 3MJU B; 3B75 B; 1J40 B; 1XXT A; 1UX8 A; 2GTL B; 4YU4 B; 1Y5J B; 2HBG A; 3IXF A; 1FSX B; 2AA1 A; 3BJ3 B; 1YMB A; 1DWS A; 3FS4 B; 3FH9 B; 1S6A A; 5CNE A; 1U7R A; 1XZ5 A; 4NI1 B; 2MYC A; 2NRL A; 4FWZ A; 2D5Z A; 1HBS B; 2GRF A; 1VXC A; 2VRY A; 4FWY A; 1ECN A; 3P5Q A; 5C6Y A; 3WCW A; 4DC7 A; 3VRE B; 1Y35 B; 2VHB A; 2MGH A; 1XYE A; 4F69 A; 2XKG A; 2ZSX A; 1W92 A; 4HRR B; 4ROM B; 4OOD A; 4XS0 B; 1Y4R A; 1Y7D B; 1XZU B; 1FDH A; 1BZZ B; 1LFQ B; 1BZ6 A; 1Y8W B; 1CO8 A; 5JDO E; 1BBB B; 3SZK A; 1HHO A; 1O1L A; 2EB8 A; 1DXT B; 3OO5 B; 2O5L X; 5EUI A; 3UHN A; 3PT8 B; 4HHB B; 1MYZ A; 2W6Y A; 3BCQ A; 1IDR A; 3H57 A; 1CH3 A; 1CIK A; 2VLZ A; 3UGY A; 2W6W A; 5JDO C; 1DUO A; 1A01 B; 1FLP A; 2HHD B; 1QXE B; 1Y8H B; 5EYJ A; 2W6V A; 3UGZ A; 3ZJL A; 1B0B A; 1MOH A; 1D8U A; 1CBM A; 1Y85 A; 3WCV D; 1MLK A; 2MGA A; 1CH2 A; 3GLN A; 1Y46 A; 3MJP A; 4B3W A; 4B4Y A; 1LFY A; 2B7H B; 3DUT A; 3GQR A; 2RI4 A; 5EE4 D; 4NXC A; 1COH B; 1SWM A; 2HBD A; 2DC3 A; 1JWN A; 1OJ6 A; 3HRW B; 4XDI A; 2SPO A; 2VEE A; 2LH6 A; 2DN1 B; 4O4T A; 2EKT A; 1YOG A; 3D7O A; 2LH3 A; 3MOU A; 2ZLX B; 1Y01 B; 2HBF B; 1A6N A; 1LJW A; 4NK1 A; 2MHB B; 2EKU A; 1CP0 A; 4FWX A; 4ROL A; 3A59 B; 1BAB B; 2SPN A; 2HCO B; 3D1A B; 2PGH B; 1URY A; 3WCV C; 2BLH A; 1M6C A; 2G0S A; 3PI2 A; 1U7S A; 1MYJ A; 1XCH A; 2FRK X; 2O5Q X; 2E2Y A; 4ESA A; 3QQQ A; 1YH9 B; 2ZSR A; 1HBR A; 5CMV A; 1DO1 A; 2EVK A; 1NEJ B; 4MQK A; 1K0Y A; 2ZT0 A; 3K9Z A; 1G9V A; 2VM0 A; 1HAC B; 1G08 B; 4IRO A; 1FSL A; 4JYQ A; 1DWR A; 4DWU A; 3RGK A; 3MBA A; 3QM8 A; 1YZI B; 3WCV B; 5E83 B; 4NI0 B; 1MYF A; 1UT0 A; 1CLS A; 1GLI A; 1YVT B; 1LFZ B; 3MN0 A; 2HZ1 A; 4AVD A; 3HHB A; 3NML A; 1Z8U B; 1Y4Q B; 2ZFO A; 5CN6 A; 3LB4 A; 5JDO F; 1C7D B; 1J3F A; 1WMU A; 1NAZ A; 4G51 B; 1CG5 B; 1XZV A; 3WHM B; 2DN3 A; 2VLX A; 5EET A; 3D1K A; 2QFN A; 1DO4 A; 1NZ4 A; 1Y4F A; 1YFF A; 1RQ4 B; 1HRM A; 4M4B A; 4C0N A; 1YE0 B; 4KJT A; 1SHR A; 1YCA A; 3WTG A; 2QMB B; 3O7N A; 2AUQ A; 2MBW A; 4F6B A; 1KD2 B; 1XZ4 A; 4N7O B; 4ODC A; 1YIH A; 1MYI A; 1NWI A; 1O1N B; 4GZG A; 2HBS B; 4X0L B; 2ZLT A; 4UUR A; 1AJH A; 6HBI A; 1FN3 A; 3ECX A; 3GDJ A; 3NFE B; 1F5O A; 1YIE A; 5B85 A; 3KUO A; 3ZOL A; 1LFT A; 1Y83 B; 3WFT A; 2ZSO A; 2QFK A; 1O1K B; 4MQH B; 1C7B B; 1Y0D A; 1BIJ A; 1GDI A; 2H8F A; 1G0B A; 1Y22 A; 1NS9 A; 5CN4 A; 1LFV B; 4UIQ A; 1T1N B; 2Z6S A; 5E6E B; 3PEL A; 1VRF A; 3QZX A; 3WI8 A; 3DHR A; 3ORD A; 3PI3 A; 1GDJ A; 5HAV A; 2Z85 A; 1A4F B; 1BUW A; 1MBN A; 1MLG A; 2D2N A; 3ODQ B; 3MKB A; 3PIA B; 2CMM A; 4NZI A; 3UHI A; 1WLA A; 1Y4V A; 2QU0 B; 3PI8 A; 1YEU A; 1NZ2 A; 1S0H A; 1O1P B; 1YVQ B; 1FAW A; 1RVW B; 2O5M X; 3M3A A; 5EQM A; 2HBE A; 1J7S B; 2ZS1 A; 1CH5 A; 1XY0 A; 1V07 A; 3HC9 A; 1Y09 A; 3QM5 A; 1OUT B; 1LUE A; 1SDK B; 1Y5K B; 1FDH G; 1GCV A; 3G4Q A; 1HJT A; 1OUU A; 1Y0C A; 3UHZ A; 2AUR A; 3QJE A; 1MOA A; 3OZU A; 1JF3 A; 4F4O A; 1N9X A; 2HHB B; 1YOI A; 4F6F A; 1Y0T B; 1LHT A; 1Y4G A; 3QM7 A; 1AZI A; 1HGC A; 1NS6 A; 1PBX B; 4M4A B; 1XZ7 A; 4MPM A; 1HBB B; 2NRM A; 1BZ1 A; 3AQ8 A; 1XQ5 B; 3U3E A; 1Y7C B; 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3QJC B; 4MBN A; 1HCO B; 1MLN A; 1GDK A; 5CND A; 3UHC A; 2SPL A; 3NG6 A; 3S66 B; 2JHO A; 1O1M A; 2D2M C; 2GDM A; 1THB A; 3WCU D; 2ZT2 A; 3DHT A; 3BJ1 A; 2BKM A; 1I3E A; 1MBC A; 5MBN A; 5M3S A; 1YEO B; 2ZS0 A; 1JL6 A; 1GZX A; 3AQ7 A; 3HEP A; 3HF4 B; 1RTE A; 3ARJ A; 3G4W A; 3ZJI A; 3GKV A; 1QXD A; 3QM6 A; 4F6I A; 2MGJ A; 2D2M B; 1CH9 A; 1SDL B; 3PI9 B; 3VRG B; 3ZHW A; 1R1X B; 2O5O X; 1A0U B; 1BZR A; 4H07 A; 4L7Y B; 1JEB B; 2YRS A; 1S5X B; 4PQC A; 1HLB A; 1MTJ A; 2ZLU B; 1YEQ B; 3LQD B; 3UHE A; 2BLI A; 4MQG B; 5D1V A; 1J7Y B; 1JL7 A; 1DXV A; 4WCH D; 3PT7 B; 1V4U A; 1MGN A; 5MBA A; 5EU2 A; 4NS2 A; 2MB5 A; 2GNW A; 1HDS A; 3QJB B; 3WCU C; 7HBI A; 1Y4P A; 2BNL A; 1O1I A; 1HBH A; 1V4X B; 1MDN A; 1MLR A; 5CHR A; 5HU6 B; 1DUK A; 1YEN A; 1CH7 A; 1J41 A; 1JZK A; 1Y2Z A; 1VXD A; 3AQ9 A; 4NXA A; 5HY8 A; 2Z8A A; 3EU1 A; 3RJ6 A; 1C40 A; 1ABS A; 1V5H A; 2PEG B; 3G4Y A; 3DR9 A; 3NMM B; 3BJ2 A; 1A3O B; 3A0G A; 3WCU B; 1Q1F A; 3OZV A; 2V1F A; 2R80 B; 1HBI A; 3H58 A; 3IC2 A; 1K1K A; 1MNJ A; 1QPW A; 3WFU A; 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