1HKGA

Structural dynamics of yeast hexokinase during catalysis
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
457
structure length
457
Chain Sequence
AASXDXSLVEVHXXVFIVPPXILQAVVSIATTRXDDXDSAAASIPMVPGWVLKQVXGSQAGSFLAIVMGGGDLEVILIXLAGYQESSIXASRSLAASMXTTAIPSDLWGNXAXSNAAFSSXEFSSXAGSVPLGFTFXEAGAKEXVIKGQITXQAXAFSLAXLXKLISAMXNAXFPAGDXXXXVADIXDSHGILXXVNYTDAXIKMGIIFGSGVNAAYWCDSTXIADAADAGXXGGAGXMXVCCXQDSFRKAFPSLPQIXYXXTLNXXSPXAXKTFEKNSXAKNXGQSLRDVLMXYKXXGQXHXXXAXDFXAANVENSSYPAKIQKLPHFDLRXXXDLFXGDQGIAXKTXMKXVVRRXLFLIAAYAFRLVVCXIXAICQKKGYSSGHIAAXGSXRDYSGFSXNSATXNXNIYGWPQSAXXSKPIXITPAIDGEGAAXXVIXSIASSQXXXAXXSAXXA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural dynamics of yeast hexokinase during catalysis.
pubmed rcsb
molecule keywords HEXOKINASE A
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 72
structure length 457
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1980-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkgA03
1QQNA 3HTVA 1SAZA 3GG4A 4IJNA 5AQSA 4CD3A 4BRNA 4MLEA 4WQ4C 1Z05A 2P9LA 1BWFO 3H3OB 4H03B 3H1QA 4QS8A 3RSEB 4B1VA 1HPMA 1Z6RA 2FF3B 4BC2A 1NGFA 2HF4A 1YXQA 4QS9A 1U2VA 3VEXA 5I9EB 4JN4A 5KPRA 2Q1NA 3DWLA 3WQUA 5AFUA 3U8XA 3A8YA 1TUYA 3LM2A 3MMVA 2QW9A 4H5WA 4PKHA 4CJ7A 1GLJO 5TKYA 1QQOA 4O5FA 4BRKA 4BRFA 4PL8A 4JNEA 1GLEG 3VENA 3VF4A 1V4TA 5AQWA 1BUPA 3M1FA 2A3ZA 3FZFA 3FZMA 3C7NB 1NGBA 3QBWA 1JCEA 3SMPA 4FL9A 1MA9B 3BF3A 1NWKA 5ADXH 3VGLA 2A6AA 2NRHA 2KHOA 2P9IB 1HKBA 3KVGA 5AQJA 4M7XA 1IG8A 1NGHA 1HJOA 5F0XA 4HTLA 3A5OC 5E84A 3WEEA 3GE1A 2F9TA 1Q18A 3FZKA 3R6MA 4PKIA 4H0YB 3A0IX 1P8ZA 3HM8A 4H0PA 1ATNA 2CGLA 2D4WA 3ENHA 2AP1A 5FPEA 5BPMA 1QZ5A 3ULEB 3D2FA 2P9KA 2BUPA 3CI5A 3DXKB 3L6QA 3WXJA 5AQKA 4DB3A 3UB5A 2P9NB 3CQYA 2QM1A 5AQZA 2P9PA 3UKRA 2VWBA 1XQSC 2CH6A 4WQ4A 2WUSA 4M7YA 1KAXA 3AAQA 2A5XA 5AQRA 5FPNA 5BPLA 3H3NO 3WQTA 3EN9A 2GWKA 1MDUB 3MN9A 4BRMA 3VESA 4NB4A 4BVPA 2P9LB 2P9SA 1R59O 1GLBG 2Q36A 4B1ZA 4FWLA 3LL3A 1K8KB 3M3ZA 2NLXA 4BGBA 3SLCA 3R9PA 3O1BA 4CZEA 3U4LA 2HOEA 3I8BA 3QMLA 5AFUH 4RWTA 3D2EA 1U2VB 3ZX0A 4BRAA 3MN7A 3F9MA 2E8AA 3CQXA 4BC5A 2A42A 3BP8A 1RFQA 3A5NC 3VF2A 3WUHA 5F2RA 1H1VA 1ZBSA 3H6EA 4FPBA 4L3QA 4YDUC 3EKUA 1DEJA 3DXMA 3WT0A 3GL1A 2YHXA 1YVNA 2A41A 2IIRA 2I7NA 3LDLA 3P4IA 3UE5A 1WUAA 1ESVA 4BROA 3KZBA 5LJWA 2ZGZA 3BEXA 3FR0A 3A5MC 2ASPA 1CZAN 3VEOA 3CJAA 5AQHA 5JICA 1NGAA 4CZJA 3VOVA 5KPZA 4BC4A 2FSJA 3H46O 4WQ5C 2FSKA 4C23A 2E2NA 2Q97A 1TYQB 3WEEB 3ZX3A 5AQMA 4FSVA 1XUPO 4B1YB 3BUZB 3MCPA 4CZFA 4I6MA 1MWKA 3IMXA 3D2FB 4H5TA 2W41A 2QWNA 2Q0UA 5EOYA 3ZX2A 2V52B 3H45C 3LM9A 1XC3A 4BRQA 3KHYA 3BF1A 5JMVA 2EWSA 2UYTA 1ATRA 2H3GX 1NGGA 3QICA 3O1WA 1D4XA 5EX5A 4DQ8A 1BU6O 1GLDG 1ZC6A 4BREA 4CZIA 1RGIA 1ATSA 4H5RA 4AM6A 1NGIA 3AAPA 3VGKA 3CETA 2QWOA 2PBDA 1LOTB 5AZJA 4BR0A 1NGJA 1E4GT 3O4WA 2Q2RA 3SJHA 4JD2B 2VYPA 3H1VX 3QDKA 4YDUA 3ID8A 3EZWA 2ZF5O 3B8AX 4H0VB 4EIAA 1X3MA 1E4FT 2E1YA 1GLFO 4BR7A 2QXLA 5EY4A 3EO3A 4Y0WA 5AZIA 2P9UB 1X9JA 2D1KA 3DXMB 4CZMA 3ENOA 4FWQA 5AQPA 1HX1A 1EQYA 1HUXA 4FPAA 5AQLA 4PKGA 4DHYA 2V51B 4AM7A 4WQ5A 4A2BA 1BA0A 3MK6A 3HBTA 4IWVA 4B1UB 1DGKN 1NGCA 4CZGA 1HKGA 3R8EA 5ELZA 4CZLA 5LJVA 4GNIA 4QS7A 2VCPA 3QB0A 1MWMA 3VEZA 1T6CA 5EXWA 1NBWA 2E2PA 2YJEA 3FE1A 3ATVA 4E1JA 4I6MB 1KAYA 2GELA 5AQUA 2D0OA 2D0PA 3VPZA 5BRDA 3LDOA 2GTDA 4BR4A 4BRGA 2ASMA 3ZETA 3W0LA 5BRHA 4JAXA 5BN9A 2I7PA 3MN6A 4CBWA 1IJJA 3C7NA 4IJAA 2A40A 4IZ9A 4BR2A 2V7YA 4BC3A 4MO5A 4NO7A 3HSCA 3VEYA 4FO0A 4PL7A 5JLHA 1NMDA 2ZGYA 1QZ6A 4BQZA 4FOEA 3UKUA 5AQVA 5AZJB 2P9IA 3O8MA 4BGAA 4M63C 4Z94A 1KXPA 2QWRA 3CJ7A 4H0OA 2E20A 1G99A 5KPTA 3FLCO 4FWPA 2BTFA 1QHAA 4BRHA 4ISFA 2GEMA 2QWMA 3AY9A 2FF6A 3LDPA 4RTFD 5EVZA 3SK3A 4O8KA 4CI6A 2ZWHA 2ITMA 1C0GA 5BRFA 5F1XA 5AQOA 5B8HA 5FPMA 3DXKA 3VEWA 1GLAG 3U9ZA 1LCUA 2P9NA 3DAWA 3S41A 4WYBA 3QBXA 2P9KB 3GOIA 5BPNA 3QFPA 3HZ6A 4JHDA 3CJ9A 3QFUA 3DJCA 2V7ZA 3O5BA 2P9PB 4FWNA 4FWRA 1GLLO 3UKRB 4K25A 4XH4A 2YI1A 4K42A 5AQFA 3C0BA 3ZEUA 1HLUA 4HWIA 3O6WA 3CIPA 1K8KA 1ZXOA 2PAVA 3J8AA 1JCGA 4CBUA 4EHTA 5BREA 2DPNA 3JXUA 5AQYA 5BN8A 4BR5A 3IUCA 4MO4A 5AR0A 3I33A 2P9SB 3LDQA 2IVNA 4RCHA 3FGUA 2YJFA 3U9DA 2AA4A 4FWSA 4BRCA 1BA1A 5BR9A 2YHYA 3CJCA 3FZHA 3OHRA 4BRLA 4GY2B 1BDGA 2F9WA 1YUWA 4LC9B 3D2EB 4EAHD 4FOIA 4BQLA 3EKSA 5FPDA 5KQDA 3ZETB 1NM1A 5AQQA 3SMSA 2YCHA 1WOQA 5CE3A 5AQGA 1GLCG 4B9QA 2J4RA 3GBTA 3CHWA 2QWPA 2QWLA 2E88A 1S22A 3UKUB 4BRPA 4EHUA 4XH1A 4A61A 4BG8A 1RDWX 3FZLA 3WXKA 4FWMA 2HF3A 2QWQA 1TYQA 4DCHA 5AQTA 4MLHA 1TUUA 1NGEA 3IDHA 3G25A 3WXIA 3GDQA 5KQ8A 3RSEA 2E2OA 4XH5A 5LY3A 3JS6A 4BG9A 4H5VA 4FWKA 3TU5A 1OKJA 1SZ2A 3VGMA 4H5NA 4CZHA 3CJ1A 1KAZA 3FFKB 1Y64A 3CJBA 4BR9A 4K43A 2Q31A 1BO5O 3IFRA 3VEVA 4EFHA 1T44A 2E1ZA 2YHWA 4IXCA 3W3DA 4XEIA 1C0FA 4B1WB 2CGJA 4JHDB 1DKGD 5AQXA 3MN5A 1T6DA 3L4IA 4BRIA 4CBXA 3VERA 1QQMA 2OANA 2W40A 3ZEUB 1S3XA 1BOTO 4CZKA 4A62A 1HKCA 1JCFA 4JD2A 5AQIA 5AQNA 5E26A 2GUPA 4ISGA 4H0XB 3EL2A 2NZTA 1J6ZA 4F9OA 5JLFA 1BG3A 3M6GA 3VF6A 3O08A 2ASOA 2Q0RA 2FXUA 5ADXA 1V4SA 3MDQA 2HMPA 3LDNA 1U6ZA 1NLVA 1NGDA 1X3NA 2GWJA 2CH5A 2FSNA 3ATUA 3VETA 4A2AA 4H0TB 3D7EO 4KBOA 4CD1A 2P9UA 3A5LC 3CERA 4B1XB 4FWOA 3O80A 3ULEA 2CGKA 3L0QA 3TPQA 4BVOA 2IVOA 1SQKA 2E2QA 5AZIB 3AARA 4J8FA 4BRDA 2FLOA 2IVPA 3HI0A 4K41A 3WXLA 1YAGA 4ISEA 4IO8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FDLA 1EX4A 4E89A 1SV5A 3HPHA 4X66K 3GG4A 4IJNA 1NKCA 3M8QA 3TSUA 1XHZA 4JRPA 3L2QA 3KLHA 4CFCA 4B8CA 3H1QA 2RHKA 1L3SA 4JKDA 4CF1A 4U67L 2LSNA 4JK7A 1Z6RA 2FF3B 4BWJA 4QS9A 3AO1A 2YNGA 3WQUA 5AFUA 3NGZA 4GMJB 4CJUA 4KTZA 3PX6A 1TUYA 1N36K 4H5WA 2QW9A 4LFCK 3WNFA 4CVNE 3EE8A 3DRRA 3EZ5A 2ATQA 4DS5A 1RBSA 1REVA 3MEEA 4PL8A 3S9HA 3OYGA 3VENA 4CF2A 1JLEA 3B6PA 5AQWA 1RCHA 2VQEK 1FKOA 2A3ZA 4JKGB 3FZMA 3QBWA 3SMPA 4FL9A 3J7AP 1MA9B 4CIFA 1NWKA 3ASMA 4K0KK 4OPHA 5K14A 1N32K 2NRHA 3QESA 3E9OA 1HKBA 3KVGA 5AQJA 3TI0A 1IG8A 1BIUA 2VWJA 3GE1A 3FZKA 4PKIA 2D5RA 1ITGA 1P8ZA 3HM8A 1VSDA 1HYSA 3ENHA 2D4WA 2HHUA 2AP1A 2O4GA 5FPEA 5BPMA 3OYMA 3OBWA 1JXBA 5C12A 1JLQA 5C15A 3QIOA 1C6VA 2P9KA 4JI4K 3WXJA 2P9NB 3TAFA 1W0HA 2QM1A 1S9EA 1HR0K 3AAQA 2HHSA 1WN7A 1FK9A 3HP6A 2RE2A 1R0AA 1NKEA 3PSIA 3WQTA 4CFAA 2GWKA 5BR8K 4O0IA 3MN9A 4ILHA 4BRMA 1HQEA 3NDKA 4NB4A 2P9LB 4CJ4A 3LL3A 3V4IA 3R9PA 2D0CA 4RG8A 1W2BM 3AVLA 1VQ9N 3TTFA 1U2VB 3AVJA 5HRPA 3CQXA 1YTAA 3A5NC 3ZT4A 1H1VA 3NVMA 4FVUA 3DXMA 3C6TA 4LF7K 2YHXA 2P1JA 1YTUA 2UU9K 2HNYA 2I7NA 3P4IA 3UE5A 3KZBA 1DTTA 1VQON 4KH5A 1CZ9A 5LJWA 2ZGZA 3BEXA 4DMNA 1P90A 4IEIA 2HHVA 2HVIA 3OY9A 5JICA 3THWA 3SI6A 4CZJA 1XNRK 3PSFA 4WQ5C 1TYQB 3QINA 1I3AA 3WEEB 3E01A 4FVMA 3MEDA 4DLGA 4KV8A 3EYZA 4CHNA 4FJHA 5JS1A 4DTSA 1SS6A 3THXB 4Z0UA 1MWKA 3CQ8A 4H5TA 3ALYA 2JGUA 4AHCA 4BRQA 1HQUA 2VQFK 1WSEA 3LP1A 4WFNL 3SJJA 3IRXA 2EWSA 2UYTA 4C8LA 4FJ7A 1FKPA 3QICA 3O1WA 3HK2A 1KLMA 1XC9A 1YVUA 2D0AA 3V9ZA 5LL6Z 1BU6O 4CZIA 1RGIA 1ATSA 4H5RA 1NGIA 3VGKA 1D9FA 4CEOA 1LOTB 1S1TA 5AZJA 3NMUA 1EP4A 1E4GT 3O4WA 4JD2B 4YFUA 3C6UA 3CCEN 3MCAB 3QDKA 3CC7N 2WC9A 1D9DA 3ID8A 1U45A 2UUBK 3B8AX 4OPKA 1E4FT 3CM6A 1SKRA 4YOUA 1JLBA 1JJ2M 3VQ5A 1EWRA 1KVCA 4NYFA 1L3TA 5EY4A 1X9JA 4PA1A 2IC3A 4GKKK 4Q0BA 2NRWA 5HBMA 1HUXA 1L3VA 1GOBA 4GV3A 1E3MA 2OTJN 4CEEA 4PKGA 2HBKA 4JRQA 4DHYA 1U4BA 4N47A 3RRHA 1YF5L 4AM7A 2BANA 4CGHA 2YV0X 3G71N 3EY1A 1KSPA 4CE9A 3DI6A 1DGKN 3R8EA 4X65K 3RMAA 1C0MA 4DQPA 5LJVA 1ILYA 1MWMA 3AGRA 1Q9XA 1T6CA 5EXWA 1NK7A 4NXMK 2YJEA 3O3GA 1IBKK 3ATVA 3HYFA 4E1JA 4JLHA 1HNXK 4CJVA 1RT1A 4E19A 4BRGA 4BR4A 1T03A 1SL1A 2G8WA 1FJGK 2W6KA 2I7PA 3OYLA 4AHSA 3C7NA 1YHQN 1BQMA 4BC3A 2O8FA 4OGEA 4PL7A 4CHZA 3PV8A 1QZ6A 4FOEA 1KFSA 5AQVA 2P9IA 4M63C 2FC0A 3CJ7A 4H0OA 5KPTA 2XY6A 4DS4A 4ISFA 2GEMA 1RBVA 2NRVA 5EVZA 4DQIA 5I3UA 1VK0A 5FPMA 4JKFA 4DV5K 5GAGP 1O13A 3AO4A 1BL3A 2OCEA 3OTOK 3RMBA 2V7ZA 4FWNA 3ITHA 3G4SN 2YI1A 4K42A 4CIGA 4B3TK 3RTVA 1JLGA 1K8KA 1JL1A 4EHTA 5BREA 3O4QA 1C0UA 3ZSOA 3HO1A 2IDOA 2P9SB 3FFIA 2IVNA 4M41A 4B3RK 4BY9C 1TK5A 4OLAA 4FYDA 5BR9A 3NGIA 2P5OA 4M3UA 2F9WA 3O9SA 1YUWA 2OPSA 4LC9B 1OVQA 4EAHD 4FOIA 1SL2A 1LWEA 4O5BA 5FPDA 2QKKA 3DOLA 2XHBA 1NM1A 4DG1A 4DSFA 2KQ2A 3K9JA 3I55N 4K8ZA 5CE3A 2EX3A 1NK6A 5AQGA 1IV0A 1VSIA 2Y1IA 1KQSM 4IO9L 4CJLA 4BRPA 4AH9A 4EHUA 2WBNA 3L3VA 3U3GA 1TL3A 4WE1A 2HF3A 3MX2A 2PYLA 5AQTA 4MLHA 4O0JA 3G25A 1VSFA 3KK1A 2IAJA 5KQ8A 3P83D 4CFBA 5CYMA 3F2KA 4RW8A 4BE0A 4X62K 3O9RA 4JI7K 4BR9A 3IFRA 4EFHA 3VEVA 1T44A 3NVKA 4IXCA 4KO0A 4XEIA 3LAMA 2VGMA 3WXMB 4B3MK 4JHDB 2ZD1A 3NF7A 1DKGD 3MWPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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