1HKGA

Structural dynamics of yeast hexokinase during catalysis
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
457
structure length
457
Chain Sequence
AASXDXSLVEVHXXVFIVPPXILQAVVSIATTRXDDXDSAAASIPMVPGWVLKQVXGSQAGSFLAIVMGGGDLEVILIXLAGYQESSIXASRSLAASMXTTAIPSDLWGNXAXSNAAFSSXEFSSXAGSVPLGFTFXEAGAKEXVIKGQITXQAXAFSLAXLXKLISAMXNAXFPAGDXXXXVADIXDSHGILXXVNYTDAXIKMGIIFGSGVNAAYWCDSTXIADAADAGXXGGAGXMXVCCXQDSFRKAFPSLPQIXYXXTLNXXSPXAXKTFEKNSXAKNXGQSLRDVLMXYKXXGQXHXXXAXDFXAANVENSSYPAKIQKLPHFDLRXXXDLFXGDQGIAXKTXMKXVVRRXLFLIAAYAFRLVVCXIXAICQKKGYSSGHIAAXGSXRDYSGFSXNSATXNXNIYGWPQSAXXSKPIXITPAIDGEGAAXXVIXSIASSQXXXAXXSAXXA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural dynamics of yeast hexokinase during catalysis.
pubmed rcsb
molecule keywords HEXOKINASE A
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 72
structure length 457
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 1980-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hkgA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1hkgA03
2E1ZA 2A3ZA 3A5OC 1GLDG 3WEEA 5JICA 4FL9A 4XH5A 3ZEUB 3ATVA 3UKUA 3D2FA 1EQYA 4I6MA 4RTFD 4BC5A 3KVGA 4DB3A 2V7YA 5AQMA 3FGUA 1V4TA 5AQYA 3FZLA 3ENOA 3O4WA 5F2RA 4BROA 4BRAA 4BGAA 3ZEUA 4RWTA 1OKJA 3U4LA 4PL7A 1MWKA 3CJAA 4BQZA 1DKGD 4M7YA 1Z6RA 2VWBA 2QWPA 3O80A 3ULEB 3FLCO 2E2PA 3H1VX 5JLHA 1T44A 2P9IA 4BR4A 4JAXA 4EFHA 3MN9A 2PBDA 5AQPA 1KXPA 2FSNA 3AARA 4BR0A 3R9PA 3QDKA 2CGKA 4F9OA 3ULEA 4BG9A 4IJNA 1GLEG 4H5WA 5F1XA 3IUCA 5FPMA 2BTFA 5AQKA 3L0QA 4BC2A 5AQHA 3ZX3A 4CZMA 3O08A 1KAZA 4L3QA 3KHYA 4A62A 1JCEA 2CGJA 4CBUA 2VYPA 2BUPA 4NB4A 2YJFA 1ZXOA 1Z05A 1YVNA 2D0PA 2FSKA 3A0IX 4CD1A 3QFUA 4NO7A 4K43A 3I33A 4K41A 1XUPO 3U9ZA 3BEXA 4H0VB 5AQWA 1LOTB 5LJVA 1MWMA 4CBXA 2QWMA 3ATUA 3UB5A 2Q97A 1TYQB 2HF3A 1IG8A 4H5TA 4M7XA 5ELZA 1ATSA 2P9KB 1BWFO 1NMDA 1QHAA 3O1WA 4KBOA 3C0BA 3IMXA 3GDQA 4H5NA 3MN7A 4A61A 5AQIA 3AAPA 4EAHD 4PKIA 4CZKA 4XH1A 1MA9B 5EVZA 3HM8A 2NLXA 3CERA 1NGCA 2ZGYA 4IJAA 4FPAA 5AQTA 1GLJO 4CZJA 3OHRA 2A40A 5AQFA 3VEXA 3LDOA 2W40A 3WUHA 4PL8A 1IJJA 2IIRA 3MCPA 2A41A 3G25A 3P4IA 3EZWA 4FWMA 2YI1A 4K25A 5AQVA 3ZX2A 3FZKA 3R8EA 1GLAG 1X3NA 4ISEA 3VEVA 1GLBG 1G99A 3R6MA 4AM6A 1BOTO 3O8MA 5EOYA 2V52B 3ZETB 1RFQA 5BRFA 1K8KA 5AQGA 4FWSA 5AQSA 2QWRA 4JHDA 5AQNA 3ZETA 1KAXA 3H3OB 1ATNA 5BRHA 5AQZA 4IO8A 4PKHA 4E1JA 4CZLA 2AP1A 1BG3A 4QS7A 3VGLA 3MK6A 1XQSC 2YCHA 4MO4A 4JN4A 1QQOA 2EWSA 3BF1A 2E20A 3C7NB 3VF6A 2W41A 3JS6A 1QZ5A 2P9UB 1ATRA 2YHWA 3TU5A 2ITMA 3ENHA 3AY9A 3F9MA 4XH4A 3C7NA 3QICA 3VOVA 3H3NO 3LDLA 1HKGA 1QQNA 2PAVA 2ZGZA 3VF2A 4H0YB 4MO5A 5E84A 3JXUA 4DCHA 2GELA 4CZEA 1XC3A 3L6QA 1BO5O 2QWLA 2D1KA 3HBTA 5EXWA 3LM9A 1E4FT 4WQ4A 1NGFA 2QW9A 4WQ5A 5AZIB 4BC4A 3B8AX 2FLOA 1TUUA 2QXLA 3EO3A 5AR0A 4RCHA 4CZHA 1NBWA 3O5BA 4MLHA 2DPNA 4IZ9A 5AQQA 4FSVA 3FZMA 5AZIA 2P9PB 5TKYA 2P9LB 4BRCA 3EKUA 2E2OA 2E88A 3EKSA 1HLUA 1YUWA 2FSJA 4FPBA 4H03B 4K42A 2F9TA 1NGGA 2QWQA 2V7ZA 2OANA 3DAWA 3CI5A 3LDQA 3RSEB 5JMVA 2CH5A 1U2VB 2Q0RA 2E2NA 4BRKA 4HWIA 2NZTA 4BR5A 3RSEA 2I7NA 3DXKB 2FF6A 3GOIA 2HOEA 1QZ6A 1BA1A 1YXQA 4B1VA 2NRHA 2FF3B 4ISGA 3CJCA 4IXCA 5AQXA 1NGJA 1Y64A 1TYQA 3VENA 4B1XB 3SMSA 1SQKA 3CJBA 4EIAA 4BRFA 1QQMA 1NLVA 4ISFA 2HMPA 5KPTA 3A5MC 1NWKA 2P9KA 1C0GA 4AM7A 2GEMA 1BUPA 1S3XA 3CQYA 4FWPA 2A6AA 4H0OA 4BVOA 3LDPA 3ZX0A 3UE5A 3UKRB 3GE1A 4BR7A 3AAQA 4FOIA 2A42A 4YDUC 3EL2A 3GBTA 3VGMA 1T6CA 1SZ2A 4CD3A 3CJ9A 5FPNA 3A8YA 1SAZA 2FXUA 3UKRA 2Q1NA 3L4IA 5FPEA 2P9SB 3M3ZA 5BREA 5LJWA 3A5NC 2ASMA 3VEYA 3M1FA 4BR2A 3GG4A 1HJOA 3D2EB 3LL3A 4FWKA 4CJ7A 4CZFA 4IWVA 5ADXH 3WXIA 2CGLA 1TUYA 3VF4A 4H5VA 3BF3A 3O1BA 4DHYA 2A5XA 3D2EA 4GNIA 4C23A 3H1QA 5EY4A 3QMLA 2ZWHA 2P9NB 2F9WA 3VETA 2D0OA 2ASOA 2Q0UA 3QBXA 4BRGA 5KPZA 5AQOA 1JCFA 3FZHA 4FWQA 2Q36A 3FFKB 3HZ6A 2E2QA 5JLFA 5LY3A 1U6ZA 4LC9B 4B9QA 1JCGA 2VCPA 1GLFO 1P8ZA 2GTDA 2P9UA 3BP8A 4I6MB 3CJ1A 5BN8A 3KZBA 3SK3A 2QWOA 2CH6A 2I7PA 2ZF5O 2YHYA 1D4XA 5BN9A 5BRDA 1GLCG 1V4SA 4A2BA 2IVNA 1HKCA 1WUAA 3D7EO 3M6GA 3MN5A 2Q31A 4BC3A 4BQLA 4BRMA 4BRDA 4WYBA 5ADXA 1J6ZA 1WOQA 2E1YA 1NGAA 2QM1A 3O6WA 5KQDA 1H1VA 4JD2B 1T6DA 3S41A 3VEZA 1R59O 1NGBA 2P9IB 2WUSA 3FR0A 1BU6O 3MDQA 4Y0WA 4FOEA 5AFUH 3CJ7A 4O5FA 4JD2A 4BRHA 5B8HA 4BGBA 1GLLO 2ASPA 4BR9A 3WXJA 4H0PA 2J4RA 2P9PA 3CIPA 2V51B 2P9LA 4H0XB 4BRLA 1RGIA 3GL1A 4FWRA 3EN9A 2YHXA 4FWOA 4BRPA 1ESVA 2GUPA 1DGKN 5BR9A 1C0FA 5BPNA 1NGEA 1HUXA 2HF4A 3W0LA 4PKGA 3TPQA 1U2VA 2IVPA 5FPDA 3VPZA 4M63C 4Z94A 1CZAN 1HPMA 4BG8A 3VGKA 5F0XA 1BDGA 3WQTA 4J8FA 3SLCA 4B1UB 5E26A 3DXKA 2YJEA 5AQLA 5KQ8A 3VEWA 1ZC6A 3VERA 5AZJB 4B1YB 2AA4A 4O8KA 2E8AA 1NGDA 5AFUA 5AZJA 4EHTA 4BRQA 2H3GX 4FWNA 4CI6A 5AQJA 3H46O 1NGIA 5I9EB 5KPRA 2GWJA 3BUZB 3DJCA 4H5RA 1BA0A 1HX1A 4HTLA 5AQRA 3CETA 3FZFA 1LCUA 4DQ8A 3ID8A 3U9DA 3HSCA 3W3DA 3IDHA 3MN6A 1YAGA 4QS9A 5CE3A 1DEJA 1HKBA 1MDUB 2Q2RA 2UYTA 3LDNA 5AQUA 5EX5A 3WXKA 4A2AA 4FWLA 3HTVA 3WQUA 2IVOA 4XEIA 3CQXA 4QS8A 1RDWX 3DXMB 2GWKA 3I8BA 4FO0A 1X3MA 3FE1A 3U8XA 4BVPA 1ZBSA 3A5LC 4BREA 1K8KB 2P9SA 4MLEA 3DWLA 3HI0A 4CZGA 1X9JA 3SJHA 3DXMA 1NGHA 1NM1A 3J8AA 4B1ZA 1Q18A 4JHDB 5BPMA 1E4GT 4GY2B 2D4WA 2KHOA 4JNEA 4B1WB 1KAYA 3H45C 3QFPA 3VEOA 3VESA 4H0TB 3CHWA 3SMPA 4CBWA 4WQ4C 3QB0A 4BRIA 4WQ5C 4BRNA 1S22A 3WXLA 3IFRA 3LM2A 3QBWA 2P9NA 4EHUA 3H6EA 3MMVA 3WEEB 4YDUA 3UKUB 2QWNA 4CZIA 3D2FB 3WT0A 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3T19A 3CFPA 4B3SK 3QIOA 4DTSA 2A3ZA 3C6HA 4CIGA 3RMBA 1GLDG 3ZEUB 3ATVA 3UKUA 4Q0BA 3SNNA 1EQYA 5GAHP 4RTFD 4DB3A 2P1JA 3KK3A 4JI8K 4BROA 5GIOA 4BRAA 4BGAA 3ZEUA 4RWTA 4H4MA 3OYIA 3CJAA 3P31A 1DKGD 4F8RA 2OZMA 4M7YA 3O80A 4N47A 2IGIA 3ULEB 2YHAA 2P9IA 3DLHA 5AQPA 3P38A 1JLGA 3ZSOA 1JLCA 3U3GA 4BR0A 2CGKA 3M8SA 2F7TA 4F9OA 3ULEA 3L2QA 4Y1DA 2ZJPL 3AVFA 1XNQK 5F1XA 4CJKA 4DTNA 3IUCA 1WSFA 3QEVA 5AQKA 3KD1E 3TI0A 4BC2A 2HHXA 1O1WA 1WBBA 3O08A 1KAZA 2FBXA 4L3QA 3KHYA 3DLBA 4OJRA 4JYAK 4JI7K 1HYSA 2IDOA 2YJFA 4M42A 3M5RA 1YVNA 4CD1A 1F21A 4NO7A 4K41A 4DS4A 1VSDA 3U9ZA 5AQWA 5LJVA 1MWMA 2QWMA 2HF3A 1IG8A 3NVKA 1VQ7N 3CMAN 2NNWA 1TK0A 3VMFB 1X9SA 1T05A 1NOZA 3C0BA 3RTVA 3G71N 4OGEA 1LW2A 4DV1K 4JI3K 4FJKA 5AQIA 4F3OA 2GUIA 4CZKA 3VN5A 2NLXA 3CERA 1TK8A 5AQTA 3OYNA 2A40A 5LMUK 2OTLN 3WUHA 3T69A 1BI4A 2QEXN 3DRPA 2WOMA 4E7LA 4DSKA 3O9QA 3OYHA 1O13A 4FJMA 4CF8A 4LF8K 4C1NI 1QS4A 2HVHA 4OKKA 4E1NA 2YNGA 1BOTO 3O8MA 2V52B 2D0CA 3ZETB 1RFQA 5BRFA 3TTCA 4FWSA 4CGFA 2ETJA 3ZETA 2ZQBA 3K5MA 4KI6A 1EKEA 1C1CA 1HQEA 1JJ2M 1JKHA 4AHTA 3VGLA 2Z1HA 3MK6A 1XQSC 2YCHA 2QKKA 4JN4A 1QQOA 2EWSA 3IG1A 3JS6A 3ENHA 3AY9A 3F9MA 4KTZA 4XH4A 4OVLA 3DOKA 5KRSA 2XO7A 2ZGZA 3AGKA 3SUPA 2HHUA 2W6LA 3SBTA 3HXMA 1BO5O 1WAJA 4FJHA 4JLHA 2AJQA 3TABA 2D1KA 3HBTA 1NJZA 3ASMA 2QW9A 4BC4A 3OBYA 3B8AX 3MXIA 2QXLA 3EO3A 2X6NA 4RCHA 3CCEN 1TGOA 4FYDA 4ICLA 4MLHA 3FZMA 5CYQA 2QI2A 3EKUA 3L2UA 1IKWA 3F5TA 4K42A 1KFDA 4E7IA 1R0AA 1NGGA 2QWQA 2V7ZA 3D45A 2OANA 4X66K 1NJXA 1QSSA 2CH5A 2A1SA 2D0BA 2E2NA 3OYMA 4E7JA 4OLBA 4CHPA 3KLHA 1EO1A 1EETA 4CW7B 3DXKB 4E1MA 3OA9A 2FF6A 3ZT0A 5JVHL 3HPOA 4DR2K 2HOEA 2YNHA 4M3WA 2NRHA 3HO1A 4QCLA 1BHLA 3SAHA 4FXDA 1NGJA 5HL7L 4B1XB 4CGIA 3M8PA 3SMSA 1JLBA 4EIAA 4JK8A 3SQ4A 3LPUA 1QQMA 2QKBA 1U47A 5KPTA 3A5MC 4Z4IA 1N32K 3V4IA 3MEGA 4CHOA 5GADP 4CK1A 2O8EA 4AM7A 2PYJA 1SL2A 1BUPA 2F96A 2A6AA 3AO5A 4X65K 4JI2K 2OCEA 1IKYA 4KHNA 3ZX0A 3UKRB 1KVAA 4MQ3A 1W0HA 3PO4A 4DLEA 3EL2A 3G0ZA 3GBTA 5HBMA 3A8YA 2FXUA 3UKRA 1XMOK 4B3RK 1WBDA 1NU0A 2KQ2A 4FLXA 5BREA 5LJWA 3F73A 1BISA 3HM9A 3DYAA 1W7AA 4JI5K 4PY5A 4DV2K 1ZBUA 3OTOK 4CZFA 3VA3A 1UOCA 3L3UA 4LH4A 2A5XA 4IOAL 4GNIA 4C23A 3CXCM 4JK7A 2FC0A 4Z4FA 1S1WA 2Z1GA 5AQOA 2DFFA 3K58A 3FZHA 3FFKB 3VQBA 5JLFA 2HNYA 1NOYA 3RR7A 4CFDA 4BDPA 1GLFO 3J7YP 1VQ4N 1VAZA 4F2SA 2GTDA 4DMNA 3THXA 3PX0A 2P9UA 3OS0A 3CJ1A 3SK3A 3DOLA 3R1XA 2Z1JA 1FW6A 1VSJA 3IS9A 4WE1A 1JLFA 3MN5A 4YNQA 4NCAA 1WOQA 2F8TA 1C0UA 4KAZA 3FR0A 2DTUA 5T7BA 1EX4A 2WBNA 1BU6O 4O5FA 5B8HA 4BGBA 1GLLO 2WC9A 2HHQA 4H0PA 4BE1A 3E9LA 2PZSA 1S5JA 1ZBHA 1VSFA 2EHGA 2Z1IA 1RGIA 3MCAB 4FWRA 2X74A 4GV6A 3FFIA 4FWOA 4IOCL 1DGKN 5BR9A 5BPNA 1NGEA 4FJLA 3W0LA 2BGGA 3TPQA 1U2VA 4LFAK 3VPZA 1BIUA 1CZAN 3VGKA 1KRPA 2FBTA 4I2PA 3KK2A 3J7AP 1DTQA 3VQ4A 3ZCMA 2YJEA 3EY1A 5AQLA 3EEQA 3VERA 5AZJB 1RTDA 4B8CA 3ZSYA 1YIJN 5E41A 5AFUA 4LH5A 2VGNA 1WSJA 1I39A 2NRTA 5AZJA 3OYJA 2G8IA 4DTJA 4GMJB 2BE2A 2DFHA 1ZBIA 4YOTA 1RDCA 5AQJA 4CI6A 5KPRA 3TTDA 4A57A 3TSQA 3ENBA 4H5RA 1B92A 1HX1A 1S6PA 1T7PA 3U3YA 4FW1A 3SQ0A 5AQRA 3CETA 3FZFA 5D3GA 3J81O 1LCUA 3T7ZA 4CK2A 3QLHA 1HMVA 1DEJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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