1HLUA

Structure of bovine beta-actin-profilin complex with actin bound atp phosphates solvent accessible
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Complex (acetylation/actin-binding)
molecule keywords BETA-ACTIN
total genus 104
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hluA03
5JLHA 4MLEA 3U8XA 4CZMA 4BQLA 3MCPA 3U4LA 3KHYA 3CQXA 4B9QA 3WT0A 3HTVA 5AZIA 5AQRA 4GNIA 4L3QA 4A62A 2PBDA 2P9NA 4BGBA 4FPAA 3R6MA 1U6ZA 1QZ5A 2D0OA 4EHTA 1V4TA 2V7YA 4FWOA 4DB3A 3A0IX 3D2EA 2QWMA 4CZLA 3UKUA 1H1VA 5LJWA 5EX5A 2E2PA 1WUAA 3BEXA 4WYBA 3VEYA 5AQOA 3QB0A 2FXUA 2A5XA 1TUUA 5AR0A 4BRCA 4HTLA 4QS9A 3ULEA 1HX1A 2YHYA 5AQSA 1NGGA 1BDGA 1T6DA 3S41A 4JD2B 5AQHA 1HKBA 4FWLA 4BR9A 1BO5O 1KAYA 1S3XA 5AZIB 2P9LA 2E2OA 2V7ZA 4A61A 4FOEA 2P9NB 3O1BA 3VESA 4H0OA 3UKUB 2QWQA 3KVGA 3BF1A 4I6MA 4PL8A 5B8HA 3AARA 2P9LB 3DXKA 3P4IA 4MO4A 2KHOA 4IXCA 4IJNA 1HJOA 2AA4A 2FSKA 5AQFA 2ZF5O 4PKIA 3ZEUA 3W3DA 4WQ5C 3VEXA 3ZX2A 3QICA 4BGAA 4H5TA 5FPNA 4O8KA 5BR9A 4BRLA 1HKCA 1U2VB 2CGLA 1Y64A 2E1YA 4CZEA 4BRQA 3H1VX 3D7EO 3RSEB 1E4FT 1NGHA 4K42A 4J8FA 1IJJA 3QMLA 1NMDA 3EN9A 3LDPA 4FOIA 1MA9B 3H3NO 3VGMA 3WXIA 4EHUA 2P9KB 4EIAA 4MLHA 3LDNA 3VEZA 4H5WA 3C0BA 3VPZA 3SMSA 4H0VB 4YDUA 3FE1A 2FF6A 5BPLA 3ULEB 5KQDA 1ZBSA 2P9UA 2VYPA 2IIRA 3WQTA 2ZGZA 3M3ZA 5AQNA 3AAQA 3O8MA 4WQ4A 4EFHA 3CQYA 2NRHA 2NLXA 4BR0A 4H0TB 1BU6O 1U2VA 4BRNA 3CJBA 3FFKB 3LM9A 5AQPA 2H3GX 1QQOA 5AQZA 3RSEA 1RFQA 4PL7A 3QFPA 2P9PB 5FPMA 3IMXA 1T6CA 4IZ9A 3MK6A 1JCEA 3FZMA 4FL9A 2ZWHA 2A42A 1QQMA 4JNEA 1NGJA 3F9MA 1ATRA 2P9SB 4PKGA 3FZLA 4BC3A 1YVNA 2CGJA 3EKUA 3QBWA 4WQ5A 2Q2RA 2Q1NA 4DQ8A 3WUHA 4AM6A 2D0PA 3HI0A 1QZ6A 3LM2A 2IVNA 2FLOA 5AQJA 4WQ4C 4H5RA 1JCFA 4H0PA 4BRDA 5BPNA 1MDUB 1IG8A 2V51B 1K8KB 3FZKA 3VGLA 5KQ8A 3TU5A 5BN9A 2ZGYA 3EL2A 4JHDA 5AQXA 1DEJA 1GLAG 2A6AA 2VWBA 1P8ZA 4BRMA 2QWPA 2QWLA 4PKHA 3GL1A 1S22A 4FWRA 3VOVA 4BREA 2D1KA 4JHDB 2IVOA 3DWLA 2F9TA 3VEVA 3WQUA 4BC4A 3VF4A 1D4XA 3IDHA 1BWFO 3LDLA 2OANA 5BRFA 3HM8A 2W40A 3D2FA 3CJ9A 3ID8A 2FSJA 2YJEA 3LL3A 1V4SA 4B1ZA 4M63C 5FPEA 1Z6RA 4BC2A 1BUPA 4IJAA 4FWSA 3ZX0A 4CBWA 3G25A 1C0GA 5AQVA 3O4WA 2A41A 4BRHA 3IFRA 5BN8A 3FZFA 4FWKA 3ATVA 3DXMA 1C0FA 2QWRA 4B1XB 3EZWA 2Q0RA 4JAXA 1X9JA 3GBTA 3QDKA 4K25A 4A2AA 5EVZA 5AQMA 2CH6A 4B1WB 4ISGA 2YJFA 1GLJO 4H03B 1NM1A 5E84A 1X3NA 2I7PA 2EWSA 5KPZA 3VENA 4CI6A 1RGIA 1TUYA 4XH4A 4LC9B 1YAGA 4GY2B 2FF3B 3M6GA 4BR4A 4CZFA 4FWPA 5JLFA 1HUXA 5BPMA 2Q0UA 3I8BA 5AQLA 3A5LC 2HF4A 3EO3A 4O5FA 2BUPA 2YI1A 3VGKA 1ZC6A 1SQKA 2YCHA 2GELA 3IUCA 4A2BA 4K43A 3WEEA 4CZJA 2A3ZA 1NWKA 1X3MA 3CI5A 3VEOA 1G99A 5E26A 1NLVA 4BRPA 4BC5A 4CZKA 4EAHD 2J4RA 3OHRA 3SLCA 2A40A 5I9EB 1LOTB 3FR0A 4K41A 5EOYA 4B1YB 4BVOA 3FLCO 3CHWA 4JN4A 2ASMA 2IVPA 2V52B 5AZJA 2GWJA 3QBXA 1WOQA 2E1ZA 3GE1A 2QW9A 4BR7A 1QQNA 4FPBA 3UE5A 3WXLA 3H45C 1E4GT 3MN6A 3HZ6A 3L6QA 1BOTO 2QXLA 1BG3A 3AAPA 4ISFA 5ADXA 3FGUA 4FSVA 3JS6A 5JMVA 3JXUA 5CE3A 2YHWA 1YXQA 3R9PA 1OKJA 5F1XA 1DGKN 1NGEA 5BREA 3HSCA 1HLUA 3WXKA 2VCPA 2GTDA 5LJVA 3I33A 1SAZA 3TPQA 3WXJA 3LDOA 2YHXA 4HWIA 3WEEB 3DAWA 5KPRA 1NGAA 3CJ1A 4FWQA 5AFUH 4H0XB 3MDQA 3SMPA 2FSNA 4NB4A 2QM1A 1BA1A 1ATNA 3ZX3A 3LDQA 4B1VA 1QHAA 4XEIA 1GLCG 3ATUA 1SZ2A 3VF2A 3EKSA 4CD1A 1YUWA 1EQYA 5AQUA 1KAZA 3VERA 3H6EA 4C23A 3ZEUB 2ITMA 4BVPA 1K8KA 3CETA 1HKGA 4BG8A 2GWKA 3L0QA 1CZAN 4CBXA 2CH5A 2P9UB 4BR5A 1TYQA 4B1UB 1MWKA 4RCHA 5AQQA 3O6WA 1NGBA 4QS8A 2CGKA 3U9DA 3DXMB 3CIPA 5AQKA 2E8AA 3CERA 4Y0WA 3H1QA 4M7XA 4H5VA 2E2NA 3A5MC 1XC3A 4H5NA 3UB5A 1XQSC 1GLEG 1ZXOA 3MMVA 1JCGA 2F9WA 4IWVA 3VF6A 5EY4A 1Q18A 3BUZB 1KAXA 3D2EB 1MWMA 5AZJB 2GUPA 5JICA 3CJAA 1RDWX 1J6ZA 3ZETA 5TKYA 3VETA 4FWMA 3UKRA 5F2RA 3C7NB 1ESVA 2DPNA 3M1FA 1R59O 2AP1A 2P9SA 3W0LA 4DCHA 1HPMA 2D4WA 3DJCA 4KBOA 2HOEA 3C7NA 4XH1A 4DHYA 2WUSA 4BR2A 5F0XA 4ISEA 3O80A 3ZETB 5AQIA 4JD2A 2P9PA 2ASPA 3CJCA 3CJ7A 2P9IA 5AQYA 4AM7A 5FPDA 2Q36A 3SJHA 2I7NA 4BRIA 3UKRB 4IO8A 4CZGA 5AQWA 1T44A 3D2FB 4CZHA 2UYTA 3QFUA 3ENOA 4FWNA 4BRFA 1GLFO 3GOIA 1GLBG 4MO5A 4H0YB 3FZHA 3KZBA 3GG4A 4M7YA 3U9ZA 2P9IB 3ENHA 1ATSA 3A5OC 3B8AX 4F9OA 2ASOA 3R8EA 5AQTA 1DKGD 1BA0A 3A5NC 1NBWA 2QWOA 1NGDA 1TYQB 2W41A 2PAVA 3L4IA 1GLDG 2HF3A 5AQGA 4BG9A 5ADXH 1KXPA 3H46O 2P9KA 4CZIA 3SK3A 2BTFA 1NGFA 2E88A 3BP8A 4RTFD 4YDUC 5EXWA 4E1JA 4BROA 1NGCA 3MN9A 2HMPA 3MN5A 4NO7A 1LCUA 3VEWA 1Z05A 3AY9A 2E20A 4RWTA 5BRHA 2GEMA 2QWNA 3O08A 4BRKA 2Q31A 4XH5A 4CJ7A 3A8YA 3BF3A 2Q97A 4BQZA 5AFUA 5BRDA 5ELZA 2E2QA 5KPTA 3MN7A 3O1WA 4CD3A 1NGIA 3O5BA 4FO0A 3H3OB 1GLLO 4BRAA 4QS7A 3GDQA 2NZTA 4I6MB 4BRGA 3J8AA 5LY3A 3DXKB 3HBTA 4Z94A 1XUPO 4CBUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JLHA 3PUFA 3SPYA 4CIGA 2HVHA 3MCPA 1BQNA 4J2BA 2O8EB 3AVGA 4HUEA 3R3LA 4CGGA 3IG1A 3JAMO 1WBDA 2PBDA 2P9NA 3OYDA 4FPAA 3ZT0A 2RN2A 4JKBA 3K59A 3THXA 1J5EK 4NXNK 3HSTB 2YKMA 3BGRA 5C0YA 4DWIA 1OH5A 4E7IA 2B4JA 4NLBA 5LJWA 1WUAA 3TSQA 1SKWA 3DLKA 5AQOA 4AH9A 3V9UA 1D5AA 1I94K 2KZMA 2OTJN 1DTTA 2F7TA 1K73O 4HTLA 3OYMA 4OX9K 3HVRA 5AQSA 1NGGA 4IDHA 2QKBA 3DYAA 1KAYA 3ZSYA 4BE1A 4M3XA 3SJJA 3CCEN 3O1BA 3CFPA 1IV0A 3NF9A 2QWQA 3BF1A 4B3RK 4PL8A 4E7HA 2P9LB 4AHUA 3DXKA 4MO4A 2RF2A 4IXCA 1ZBIA 5AQFA 4AHVA 4E1NA 4DMNA 4Z4IA 4KHYA 3ZX2A 3QICA 3F5TA 3ZT3A 4BDZA 2E5LK 3S9HA 3SQ0A 1VQPN 4CZEA 4BRQA 4DTXA 1E4FT 1YIJN 4NYFA 3LP2A 4FK2A 1SL1A 2VG5A 2HHIA 2G8KA 3V9XA 2FC0A 4ELUA 1NMDA 3E1YA 3LDPA 1MA9B 3M5RA 3H3NO 3TSUA 5J2QA 3VGMA 1JKHA 1VQ8N 2P9KB 3VEZA 4ZTJA 4JI7K 4YDUA 4IKFA 4JEPA 1CXUA 3U6FA 3ZSQA 1VSIA 2IIRA 2ZGZA 3HYFA 3M3ZA 4EFHA 1C6VA 2B5JA 3QO9A 1U2VA 3LP0A 1UA0A 2OZMA 3CJBA 3FFKB 3SAFA 4I9QA 5JVGL 2H3GX 1QQOA 2HSTA 4B08A 1WNSA 1G15A 5JS2A 3L2QA 5I3UA 2P9PB 3NMUA 4J2AA 3LZJA 4IZ9A 3AO4A 3VTHA 4AF1A 3B6PA 4CJLA 4FL9A 5JS1A 2X6NA 3ZSWA 2A42A 1QQMA 3PIOL 3SPZA 3MXIA 1NU0A 4BWJA 4W5QA 3CCQN 2D0BA 3QIPA 4WQ5A 4ILGB 3QBWA 1WN7A 1XMOK 3AVKA 4F3OA 3HI0A 1QZ6A 5IT9O 3LM2A 4JK9A 4DQPA 4H0PA 4H8KA 3P1GA 4I2PA 2ZE2A 4E7KA 1IG8A 3Q7CA 1K8KB 5KQ8A 2NRRA 4B9TA 4JHDA 1P8ZA 2YNIA 3CPWM 4O0JA 4CCHA 1S22A 3VOVA 5M1OA 1HRHA 1RBRA 5KRSA 3VQ6A 2IVOA 5CYMA 3VEVA 4KHUA 2QK9A 3WQUA 4EZ6A 4JI3K 2W40A 3D2FA 4CJUA 4B1ZA 1Z6RA 5HRSA 4MQ3A 3IAYA 1MU2A 4O4GA 3ZSXA 4FWSA 4O55A 3ZX0A 2NRTA 1O1WA 3G25A 4CBWA 1QTMA 3VQCA 1VQ6N 4LFBK 3O3HA 5HP1A 5BN8A 4OPJA 3ZLJA 2G8WA 4K0KK 1OH6A 4B1XB 1B92A 2Q0RA 3EZWA 3GBTA 3QDKA 3I0SA 4EP4A 1KTQA 1RT6A 4DF4A 5AQMA 1W97L 4B1WB 3E9PA 4DV2K 5E84A 4Z4HA 5DM6L 4BE2A 4JRPA 1X3NA 2EWSA 1OVYA 4CI6A 3LPTA 4BR4A 2EHGA 4RW6A 4FWPA 4CESA 5GAHP 3PX0A 2YHAA 1VRUA 5JLFA 4GMJB 5I42A 1TKZA 2NUBA 3HT3A 4YOWA 4FJXA 5E41A 2GX9A 3OW2M 1J53A 3A5LC 4EZ9A 3U3YA 3EO3A 3ZSVA 2BUPA 4BECA 3OVNA 1SQKA 3C6TA 2XRIA 2YCHA 3IUCA 4A2BA 1A5VA 3WEEA 1HNVA 2XY5A 1RT1A 1X3MA 3RMBA 3TWHA 1VSLA 1G99A 1NLVA 3OHRA 3NF8A 1E3MA 5EOYA 3AGRA 1RDUA 4BVOA 2G8IA 2IDOA 3CCUN 2GWJA 2F4VK 1QQNA 3WXLA 1RT2A 2NRWA 3MN6A 4Q5VA 4YOXA 4GV3A 4FK4A 3L6QA 5ADXA 4FSVA 4CK1A 1TAQA 5JENA 3R9PA 5F1XA 1DGKN 5M1KA 1L3VA 1L3SA 3KLIA 4FJGA 2VWKA 3LAKA 3I33A 4K8ZA 4FW1A 4DS5A 3TTCA 1QE1A 3DAWA 3WEEB 4CHZA 5AFUH 3DMJA 3VA3A 1Q86O 4NCAA 2FSNA 4NB4A 2QM1A 2BE2A 4CE9A 1NNEA 4LD0A 3LDQA 4CIEA 1QHAA 1GLCG 1GOBA 1VSEA 4JKAA 3VF2A 4JKDA 3OYCA 3EE8A 5M1QA 1YUWA 3IRXA 4C23A 3ZEUB 3K9JA 3PX6A 2UUAK 3V4IA 2WBNA 1HKGA 2G8VA 2ZJPL 4BG8A 1Q9XA 2HW3A 4DFMA 1X9MA 4KV8A 4RW4A 1XNQK 4F8RA 4CEAA 1KFDA 4B1UB 1XNRK 4RCHA 4QS8A 2P5GA 5FROA 1YJWN 5AQKA 2DFHA 2E8AA 4DTOA 4AHSA 2E2NA 4BDYA 1XI1A 4H5NA 2BGGA 4MDAA 1CZBA 1ZXOA 5EY4A 3V9ZA 1KAXA 1MWMA 3SUNA 4FJJA 2GUPA 3CG7A 1YHQN 4FJLA 5T7BA 4ZHRA 3SNNA 4M3YA 3RWUA 3AA5X 4JLHA 1EKEA 5TKYA 3NH0A 2HHXA 5F2RA 3C7NB 2NRZA 1HQUA 2P9SA 1TV6A 1Q81O 1IG9A 2HOEA 2YKNA 4XH1A 2JGUA 1QHTA 4ISEA 4KPYA 3QEXA 4W5OA 1SUQA 4C8LA 4AM7A 1D9DA 1QSYA 1NKCA 4F2RA 3Q7BA 4BRIA 2I7NA 4CJ5A 4CZGA 2I5JA 1R0AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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