1HLUA

Structure of bovine beta-actin-profilin complex with actin bound atp phosphates solvent accessible
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BETA-ACTIN
publication title The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Complex (acetylation/actin-binding)
total genus 104
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hluA03
4BR5A 1S22A 2CGJA 3GDQA 3RSEA 4FWMA 4DB3A 4QS7A 1HJOA 4ISGA 5AQLA 5F2RA 2ZWHA 4HWIA 1IJJA 3EN9A 1TUYA 2GUPA 5AFUH 4FWOA 4B1UB 3TU5A 3DWLA 2D1KA 1EQYA 2HOEA 2YHYA 1QHAA 3SMSA 2FSKA 1QQNA 3MN9A 4FWPA 5FPEA 4AM7A 3ZX0A 2HF4A 4KBOA 1NGFA 3EKSA 3CIPA 2OANA 4J8FA 4I6MA 3HBTA 4XH4A 4H0YB 2ZGYA 4H0OA 3VGMA 1SZ2A 2CH5A 3LM2A 2NZTA 1BUPA 5AQYA 3VGLA 3SLCA 4PL7A 2PBDA 4F9OA 4H0TB 2P9LB 3CJ9A 5F1XA 3CHWA 3WQTA 2QWLA 4FWKA 3KVGA 1NGIA 1GLBG 1NGJA 3IFRA 5AQKA 1HUXA 3A5NC 3QB0A 1CZAN 4BRDA 4QS9A 3ULEB 4BGBA 1BG3A 4GY2B 2YHWA 4BC3A 4CBUA 4WQ5A 5AQGA 3A5MC 2FXUA 3C7NA 4BRFA 5AQUA 3UE5A 2YCHA 4EAHD 2V7ZA 4IJAA 3ZEUB 3FE1A 5BRDA 3GE1A 4M7YA 1TYQB 1D4XA 4CBXA 5FPNA 2E2OA 3CQXA 2HMPA 5BREA 3FZKA 2Q0UA 2YI1A 3QICA 4CZLA 2IVOA 3AAPA 4JD2A 4A62A 4BG8A 2F9TA 1DEJA 4AM6A 2J4RA 3VF6A 4CZGA 1BO5O 1E4FT 4WQ5C 1H1VA 2NLXA 3SJHA 5BR9A 3FLCO 4BG9A 5TKYA 5EVZA 5JLFA 1HKCA 4B1YB 1U2VB 3DAWA 4B1WB 3EL2A 4XH1A 1MWKA 4BROA 4B1VA 1SAZA 2F9WA 3CETA 1KAXA 4ISFA 3WT0A 3UB5A 1MWMA 2CGKA 4BRIA 2A6AA 4MO4A 1QZ5A 5JMVA 3U9DA 1Z6RA 3QFUA 2BUPA 3O4WA 3LDNA 2FLOA 3VF2A 1GLDG 3FR0A 4BRCA 4BR2A 2Q31A 5BPNA 1ZXOA 5AQHA 1V4SA 3ZETB 4HTLA 5E84A 3O1WA 3KHYA 5EXWA 2ASMA 2Q36A 1QQMA 4A61A 4MO5A 3LL3A 1JCGA 2H3GX 3HSCA 4CI6A 1P8ZA 1K8KA 2CH6A 2P9UA 1NLVA 3TPQA 3DXMB 3I8BA 3VERA 1ZBSA 3QFPA 2GEMA 3DXKA 5E26A 5KPRA 4JHDB 2V51B 2KHOA 4H5RA 3VEWA 4PKHA 2P9SA 2P9KB 3WXJA 1KAYA 3I33A 4K43A 1ZC6A 5AQIA 3UKUB 3H1QA 1NGHA 4BQLA 4FO0A 3LM9A 4IJNA 3G25A 1BDGA 2D0PA 4WQ4C 2P9PB 3FZHA 1KXPA 4BVOA 2P9IB 5KQDA 2P9NB 1NGEA 2ZGZA 1Y64A 5AQOA 3VPZA 3WUHA 3SK3A 5AZJB 4WYBA 4CZMA 2A42A 1T44A 1ESVA 4BR0A 4IXCA 1C0FA 2GTDA 1RDWX 1MDUB 5BRFA 4BRKA 3CJAA 4CZEA 4IZ9A 3W0LA 4BC4A 3HTVA 4IO8A 5JICA 3D7EO 1T6CA 3R8EA 3WEEA 4CZHA 1HPMA 2ASPA 3QBXA 4A2BA 4BRQA 4CZKA 3EKUA 4BR4A 3O08A 3ENOA 4BRHA 4JAXA 4NB4A 5F0XA 1ATRA 2FF6A 3D2EB 5LY3A 2PAVA 3S41A 4IWVA 2QWQA 5EOYA 2AP1A 3C0BA 2UYTA 4H5TA 1DKGD 4B1XB 2QM1A 3BEXA 2CGLA 3D2FA 1WUAA 5KPZA 1GLAG 4XH5A 2VWBA 3EZWA 1ATNA 3VEZA 1V4TA 3AARA 3MDQA 4RTFD 3WXIA 4DCHA 2A41A 3B8AX 1HKBA 2A40A 2I7PA 2IVPA 5EY4A 4FOIA 3U8XA 5AQQA 4JNEA 2QWMA 3CQYA 3LDLA 5AFUA 5AZIA 3H46O 1JCFA 1X3MA 1NGAA 4FPAA 1GLEG 1QQOA 3HI0A 3O5BA 5AR0A 1ATSA 2AA4A 2QWRA 2D0OA 1GLJO 5AQRA 4CZFA 5AQFA 5I9EB 2E1YA 1DGKN 3ZX3A 2FSNA 4PKIA 1YXQA 5ADXH 2D4WA 1RFQA 4BRAA 4MLEA 1NGCA 3DXMA 3CJCA 3KZBA 1Z05A 3LDOA 2E2QA 1BOTO 3M6GA 4DQ8A 2V52B 4O8KA 3UKRB 1G99A 3LDPA 2I7NA 1NGBA 2GWKA 4FSVA 3SMPA 3BF3A 4B9QA 1XQSC 5AQJA 3H1VX 3QBWA 3C7NB 1S3XA 1SQKA 3H6EA 3VGKA 4BR9A 5LJWA 3O1BA 4BRMA 4WQ4A 5JLHA 2QW9A 3CJ1A 4FWSA 3CJBA 3ZX2A 3GBTA 4BGAA 4PL8A 1OKJA 4BQZA 3L0QA 5B8HA 3CERA 3U9ZA 4JD2B 1NM1A 4B1ZA 4RWTA 5AQMA 2QWNA 4FL9A 3QDKA 5AZJA 3DJCA 2E20A 2E88A 5AQXA 1X3NA 2DPNA 5EX5A 4MLHA 3O80A 1BA1A 1E4GT 2E2NA 3WQUA 4M7XA 4L3QA 3VEVA 3FGUA 1XC3A 1NMDA 3JS6A 5KPTA 4FWLA 2P9LA 1NGGA 2E1ZA 1BWFO 3D2EA 4BREA 2QXLA 1HX1A 2FSJA 5LJVA 1T6DA 1KAZA 3GOIA 3ULEA 3J8AA 3L4IA 1RGIA 3VETA 4LC9B 4BRGA 3AY9A 5BN9A 3BP8A 5FPDA 1K8KB 2P9UB 3M3ZA 3HM8A 4H0XB 4A2AA 4K25A 3ZEUA 4BC2A 3DXKB 4E1JA 2ASOA 3EO3A 5AQSA 4BR7A 1TYQA 5FPMA 1BU6O 4YDUA 2VCPA 3ID8A 4FPBA 5AQPA 2P9SB 3A8YA 3R6MA 4GNIA 4XEIA 3MMVA 4Y0WA 1LCUA 1GLCG 1QZ6A 3RSEB 4FWRA 1NGDA 4Z94A 3GG4A 3O8MA 4O5FA 5AQZA 1NWKA 5AQTA 1BA0A 3H3NO 3CI5A 2GELA 4K42A 4K41A 5BN8A 1J6ZA 3FFKB 3QMLA 3A5OC 3U4LA 1U2VA 3L6QA 3A0IX 1WOQA 3M1FA 1YAGA 2WUSA 4ISEA 3MN6A 4EFHA 3H3OB 2Q97A 4CBWA 3WXLA 5ELZA 4H0PA 3UKRA 2ZF5O 3BUZB 4YDUC 4JN4A 4I6MB 4DHYA 2HF3A 1TUUA 4BRLA 2FF3B 4BVPA 3AAQA 3MN7A 3VOVA 1LOTB 3CJ7A 2W41A 3MN5A 3ZETA 1R59O 2V7YA 3WEEB 1Q18A 2IIRA 1HKGA 2EWSA 3FZLA 5BPLA 4BRNA 3VEYA 1JCEA 3MCPA 4RCHA 4FOEA 3VF4A 3VEXA 2Q0RA 4CD1A 2A5XA 2YHXA 3LDQA 3FZMA 3P4IA 2YJFA 2YJEA 4JHDA 2QWPA 3D2FB 5AQVA 3JXUA 4H5NA 1XUPO 4C23A 4CZIA 4H0VB 3IUCA 1HLUA 2P9KA 3F9MA 4QS8A 1GLLO 4FWQA 1YUWA 2IVNA 4M63C 4BC5A 1X9JA 2E2PA 2GWJA 4EHUA 3HZ6A 3UKUA 3VESA 4FWNA 2P9PA 3IMXA 4CZJA 5AZIB 4PKGA 3R9PA 2P9IA 2P9NA 3OHRA 3IDHA 3WXKA 3FZFA 2ITMA 2A3ZA 3W3DA 1GLFO 4CJ7A 5BPMA 5AQNA 2QWOA 2Q2RA 3VENA 3VEOA 4H5WA 1NBWA 3MK6A 4H5VA 4H03B 2W40A 3ENHA 2E8AA 3ATUA 2NRHA 3BF1A 3A5LC 5CE3A 1C0GA 2BTFA 5ADXA 5KQ8A 5BRHA 2Q1NA 1YVNA 4BRPA 1U6ZA 2VYPA 5AQWA 4EIAA 3O6WA 3H45C 3ATVA 4EHTA 1MA9B 4CD3A 4NO7A 3GL1A 1IG8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4ID5A 3P5JA 3RRGA 4HUGA 4FJNA 1WSIA 4CE9A 2ZJPL 4FWMA 1IKVA 4DB3A 3LANA 4ISGA 3ALYA 2QKKA 3EN9A 3SV4A 2XY5A 4I7FA 1NMNA 3NBPA 1ASWA 2IC3A 1B9DA 1TK5A 5M1PA 3VQ8A 4DSKA 5HRSA 3EYZA 3EKSA 2OANA 3PX4A 4CW7B 1Q86O 4OKEA 3VGMA 4KTQA 3M5RA 3LM2A 4O0IA 2NZTA 2O8EA 3VGLA 2O8DB 4JKGA 3SLCA 2PBDA 4I9LA 3SUOA 1N33K 2QWLA 1C0MA 5AQKA 4F3TA 1GLBG 4BE1A 1CZAN 3O9UA 3ULEB 4N47A 2UUCK 1BG3A 4BC3A 4WQ5A 4KRFA 1ILYA 1IH7A 3V1OA 3KLGA 1BCOA 4R79A 3OYFA 5HP1A 3SUNA 4DU1A 2FXUA 3C7NA 3OJSA 4OKJA 4C1NI 3OS2A 3RMDA 3NGZA 3IS9A 3DRRA 2QXFA 2E2OA 3CCLN 3NHGA 5M1FA 1QHTA 3SQ4A 3QICA 4TSXA 3MWTA 4CZLA 5HL7L 4CFDA 2E6LA 4JD2A 4JI3K 3CQ8A 1KFDA 1SL1A 1DEJA 2EHGA 3VF6A 2KLAA 4NCBA 1YVUA 3FFIA 5JLFA 4B1YB 3DAWA 4B1WB 4XH1A 2F9WA 3DM2A 1KAXA 4DTXA 4AQYK 1MWMA 3AO4A 4BRIA 1C1AA 1FKOA 2BUPA 2D0CA 4DU3A 4DTRA 4M3WA 3VF2A 1GLDG 1BIUA 4BRCA 5BPNA 3D0PA 2O8BB 4O55A 5AQHA 2NRZA 3RMBA 2RF2A 4HTLA 2HHWA 5EXWA 2KZMA 3LL3A 4CI6A 3PV8A 4KAZA 3TPQA 1T3VA 1NJWA 3WXMB 1QSLA 3DXKA 3PIOL 3AGRA 2ETJA 3EE8A 4PY5A 1VSDA 4JHDB 1BL3A 2UUBK 4H5RA 1EX4A 1LAWA 1VRUA 3M8PA 4PKHA 3OA9A 3QEVA 3LDSA 3CCRN 5CHIA 5JVHL 4IFVA 4PQUA 1RTHA 3JSMA 4LF6K 4FO0A 1F21A 4IJNA 3G25A 2OCEA 3OBWA 1Q82O 3F2KA 2P9PB 4JV5K 1GOCA 2P9IB 1WAFA 4FJHA 3WUHA 3VPZA 3SK3A 5AZJB 3AO2A 3AO1A 2A42A 1T44A 2XY6A 5EU7A 1RDWX 1MDUB 4CF1A 3CMAN 4CJLA 3W0LA 4M3XA 1BISA 4KHUA 5JICA 4FJ9A 4CZHA 3QBXA 2BANA 1UAXA 1DTQA 2W6LA 2X78A 3S41A 5EOYA 3NF8A 3HYFA 4Y1DA 1DKGD 2PY5A 2VGMA 1VQ7N 2QKBA 1WUAA 2HMIA 3S3MA 4ICLA 1RBTA 2YHBA 3VEZA 1JLAA 1V4TA 3MDQA 4RTFD 4DCHA 4XIUA 2F4VK 1XMQK 4J2AA 1D9FA 3O9QA 2A40A 5EY4A 2OPQA 3ENBA 3QNNA 3KKSA 2QWMA 3LDLA 4DTMA 1BIZA 3QINA 2YNHA 2Y1IA 3ZSVA 1JCFA 1RT4A 4M41A 3G6EN 4E3SA 3DRPA 5FRNA 4FPAA 3HJFA 2OTLN 1GLEG 3HI0A 5AR0A 3THXA 3K5LA 3Q7BA 1GLJO 1EETA 1VRTA 5AQFA 2E1YA 1DGKN 3ZX3A 4LFCK 2FSNA 4CCHA 4KV8A 1CXUA 1XI1A 2OZMA 3KZBA 1IKYA 3R1XA 4JI8K 2E2QA 3SQ0A 5LMNK 3AGKA 4C8KA 1NGBA 1SS6A 1LV5A 4MDAA 4E1NA 1JLGA 4LD0A 4ID1A 1VQMN 4CIFA 4MQ3A 1WNSA 2YX6A 4MFBA 3LP0A 3V1QA 4M45A 1RDUA 3SI6A 4JI4K 2UXCK 4WQ4A 3CJ1A 4WCEL 3CJBA 3TAEA 3SUQA 3TARA 4FZXC 1OKJA 4DV0K 4JYAK 4DR2K 3U9ZA 4CK2A 3SQ1A 4CEEA 3T19A 3TAQA 1NM1A 3C6TA 4FJJA 1RT5A 3EEQA 2E20A 3P31A 4AHVA 4AHSA 5C42A 4IOAL 1S5JA 2DPNA 5EX5A 4MLHA 1JLCA 3DRSA 2E2NA 1E4GT 4L3QA 3FGUA 2OPSA 3NFAA 1XC3A 1WSGA 3T1HK 5KPTA 2Z1JA 3KTQA 4O5BA 2HVHA 4OO1J 2E1ZA 3MX2A 4BREA 1FXXA 2QXLA 4DQRA 1HX1A 1S9GA 1YJNN 2E5LK 3PIPL 3GOIA 2O4IA 3VETA 2WFBA 4DV3K 1TL1A 4CHOA 1OH6A 3V9ZA 3L2RA 3HM8A 2HNDA 1NK7A 3ZEUA 3CFPA 3QERA 2RKIA 3VQAA 2HHXA 1VSFA 2W6KA 4FCYA 3THYA 4FPBA 1TK8A 1RNHA 2P9SB 4GNIA 4LH4A 2R7YA 3THWA 3SPYA 1VQKN 2WOMA 2XY7A 3CPEA 3AVCA 3O8MA 5AQZA 1BA0A 4CK3A 4K42A 3FFKB 4FLVA 4Q5VA 1WBDA 3M1FA 1YAGA 2WUSA 2ZQBA 1NK8A 3MN6A 2B6AA 3H3OB 4HHTA 2O8FB 4ILGB 3WXLA 2RHKA 2ZF5O 1YTAA 3T1YK 4C8NA 4JN4A 4IBNA 1J9AA 3RMCA 1BI4A 4LH5A 3SBGA 3ZSWA 3MN7A 1IKWA 4DMNA 1QVFM 4RW6A 2KQ2A 3MN5A 4LSNA 3WEEB 3E9OA 4CJUA 3MCAB 4ILHA 1SKRA 4F4KA 4DFMA 4FJKA 3THVA 5DM6L 4N5SA 3O4QA 5CYMA 4NXMK 1JCEA 3MCPA 4RCHA 4FOEA 3L4QA 3VF4A 4CD1A 4JI5K 3P4IA 2YJFA 4JI2K 4IDHA 5I42A 2QWPA 3D2FB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4DV6 K;  3H3N O;  3CI5 A;  3ZT0 A;  4X62 K;  1J6Z A;  4CJE A;  3VTI A;  3U4L A;  1U2V A;  3E9L A;  1S1X A;  1VSH A;  4B9L A;  3L2Q A;  5GAE P;  4CBW A;  3JYT A;  1VQ5 N;  4E0D A;  2IOC A;  2QEX N;  5ELZ A;  4H0P A;  4B3O A;  1P90 A;  3DLR A;  2NUB A;  2ZD1 A;  4YDU C;  4M3U A;  4I6M B;  2HF3 A;  1VQ8 N;  4GKK K;  4Q0B A;  3RR8 A;  1LOT B;  2W41 A;  4DTN A;  3VQ7 A;  1R59 O;  4MDB A;  2V7Y A;  1Q18 A;  4PHT X;  3CFO A;  2EWS A;  1JLB A;  1NOY A;  4ZHR A;  1NKC A;  3OBY A;  5DK5 A;  3LDQ A;  3FZM A;  5C24 A;  3ZSZ A;  2WTU A;  5AQV A;  4H5N A;  4CHQ A;  2P9K A;  1S6Q A;  1YUW A;  4BC5 A;  1RTJ A;  1X9J A;  2BDP A;  4I2Q A;  2E2P A;  1QTM A;  3HZ6 A;  4ZTJ A;  4JI6 K;  4DS4 A;  3VES A;  3DOL A;  4FWN A;  5AZI B;  2G8W A;  4PKG A;  4F3O A;  1JKH A;  1XC9 A;  4KTW A;  3FZF A;  3W3D A;  2HHH K;  3MAQ A;  4IEE A;  3TAN A;  3QLH A;  4DR1 K;  2UXB K;  4J2B A;  3MK6 A;  2E8A A;  2DTU A;  3ISN C;  3AVA A;  1C0G A;  5KQ8 A;  2VYP A;  2HBM A;  4EHT A;  1N36 K;  4JI0 K; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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