1HLUA

Structure of bovine beta-actin-profilin complex with actin bound atp phosphates solvent accessible
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-ACTIN
molecule tags Complex (acetylation/actin-binding)
total genus 104
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hluA03
1BWFO 4JD2B 4BG8A 1C0GA 4WQ5A 4BR5A 3KZBA 1V4SA 2A42A 3C7NB 4AM6A 3MN7A 4MLEA 5AQIA 2V51B 5AQKA 4H0YB 4PKGA 2Q0RA 3IDHA 1BU6O 2GELA 4BR0A 1GLCG 3ZX3A 5BN8A 3A5MC 4BVOA 3U9DA 3WEEA 3M6GA 5FPNA 2HMPA 3EO3A 3FGUA 3M1FA 3CJBA 1ATSA 5AQJA 4H5VA 1JCEA 2VWBA 3VENA 2D0PA 5KQ8A 5BRFA 5KPZA 3O5BA 1QZ6A 2FSJA 4L3QA 2KHOA 4EFHA 3O8MA 4BR2A 4BR4A 1DKGD 1LCUA 4YDUC 5BRHA 3J8AA 4A61A 4PL7A 3A5OC 1BOTO 5ADXH 4IZ9A 3DXKB 1U2VB 5EOYA 2Q1NA 2A41A 4FOIA 2CGLA 2EWSA 4B1YB 3RSEB 1EQYA 1GLDG 3LDLA 3D7EO 3H1QA 4H03B 2Q36A 3TU5A 1NGFA 3H3OB 3QFUA 3ULEB 2YI1A 3A0IX 3HBTA 2V7ZA 4YDUA 3UKRB 3GE1A 5EX5A 2NZTA 4BGAA 2GWJA 1Y64A 3ZEUA 2QWNA 3VESA 4WQ4C 1YXQA 3IFRA 3VEYA 2FF6A 4H0XB 5TKYA 1X9JA 5AQWA 1XQSC 2VCPA 5BPMA 3W3DA 4BRKA 4IXCA 4DB3A 5AZJA 1NGEA 1NGIA 1YVNA 4PKIA 2P9NA 4FWOA 3R9PA 4CZEA 2GUPA 1XUPO 5JMVA 3U4LA 4FPBA 1NM1A 3SJHA 4WQ4A 1HKGA 2IVOA 5AQLA 2A3ZA 2YJFA 4ISEA 4H0TB 3ZX2A 3DJCA 1YAGA 3QICA 3QBWA 2P9SB 2F9TA 1BO5O 2A40A 2VYPA 2QM1A 1NWKA 3FZHA 1DEJA 5EXWA 4O5FA 3BEXA 4BRNA 1HJOA 2QWRA 5JICA 4Y0WA 1NLVA 4WYBA 4XH1A 4FPAA 3MN9A 5AFUH 4EIAA 3ZETB 1QZ5A 4CBUA 1WUAA 3DXMB 2P9PB 1KAXA 4WQ5C 1HKCA 4RTFD 3H45C 4BRQA 1BG3A 2NLXA 4BQLA 3SLCA 1GLFO 1ATNA 3D2EB 4BGBA 4CD1A 2Q31A 3UKUA 2OANA 4RWTA 3CHWA 5AQHA 2J4RA 3FZKA 4FO0A 3CJ9A 4BRIA 3GL1A 4CZFA 4BROA 3G25A 2W41A 1BDGA 2E2NA 4K42A 3VOVA 1ZXOA 5AQYA 3SMSA 2QW9A 1R59O 2A5XA 2IIRA 1Q18A 3CJCA 3QB0A 1GLLO 4NO7A 5FPMA 2PBDA 4CBXA 4CZKA 2GEMA 3ATUA 2P9UA 5B8HA 4XH5A 3VGKA 1V4TA 1HUXA 2ZGYA 1G99A 3LDQA 1KAZA 2HOEA 3GBTA 3U8XA 2P9IA 2ASOA 5AQFA 5JLFA 3MN6A 3ENOA 2CH6A 1NGHA 2DPNA 5ELZA 1WOQA 3VF6A 3WEEB 4AM7A 4BRDA 3U9ZA 3QFPA 5F1XA 2E1ZA 3O1WA 4CZJA 1OKJA 3HZ6A 4DCHA 4FWQA 4JHDA 2AP1A 2ZGZA 2A6AA 1NGDA 5LJWA 3WQUA 4NB4A 1ATRA 4K41A 1ESVA 4XEIA 1GLBG 2CH5A 4BRAA 2PAVA 1GLAG 3WXLA 3VEXA 2AA4A 5AQZA 1TUUA 5BREA 3SMPA 1QQOA 5CE3A 3DWLA 4FWMA 4IJNA 3BF3A 4I6MA 3WUHA 4B9QA 4EHTA 3MMVA 1GLEG 2E2PA 3TPQA 4B1XB 2I7NA 2UYTA 3IUCA 2I7PA 4Z94A 2P9KA 3MDQA 3R6MA 5AQGA 5EY4A 1K8KA 1MWMA 3O4WA 3ZEUB 1S3XA 5JLHA 4H0PA 1E4FT 4B1ZA 1BA0A 4BRCA 4ISGA 5AR0A 4M7YA 1HX1A 4BRMA 3ATVA 1HPMA 3ZX0A 3H1VX 4H5NA 1T44A 1NMDA 5AZJB 3ID8A 3C0BA 2P9NB 4FL9A 2E88A 4BC4A 2FF3B 3EN9A 1IG8A 4E1JA 4FWRA 3D2FA 4BRHA 2YHXA 1T6CA 2QWLA 3CJAA 3VGLA 4MLHA 4BQZA 1RFQA 1SQKA 3CERA 3I33A 3A5NC 3A8YA 1RDWX 4GNIA 2QWMA 3QBXA 5KQDA 2W40A 3FR0A 4K25A 1RGIA 3FZLA 3VEZA 3JXUA 1S22A 2D0OA 2YHWA 2D4WA 4FWLA 5AQOA 5BN9A 4K43A 2YJEA 3SK3A 5KPRA 2BTFA 1YUWA 3AARA 3GG4A 2ZWHA 3B8AX 3F9MA 2ITMA 3IMXA 4BR9A 4RCHA 3KVGA 1NGJA 5KPTA 2QXLA 3UKUB 4HWIA 3O6WA 2P9LA 3WXIA 5ADXA 2CGJA 5AZIA 5FPEA 2WUSA 2IVPA 4LC9B 3ENHA 3O80A 3QDKA 3WXJA 3VF2A 4MO4A 2D1KA 5F2RA 2P9UB 1MA9B 3EZWA 4PL8A 5AQTA 3EKSA 2CGKA 5BRDA 4IWVA 3AAQA 4J8FA 4MO5A 2P9IB 3AY9A 3LM9A 3AAPA 1TYQA 2E8AA 1KAYA 4PKHA 2H3GX 4JD2A 1Z05A 2E20A 1JCFA 3C7NA 1BA1A 3CI5A 4JHDB 3CIPA 2FSKA 2YCHA 3CETA 3WXKA 1TUYA 3L6QA 1HKBA 1XC3A 4B1WB 2E1YA 2QWOA 4B1UB 4BREA 1QHAA 5BR9A 4GY2B 4B1VA 1NBWA 2F9WA 3LDNA 4H0VB 3UB5A 3O1BA 3VPZA 3GOIA 3WT0A 2FLOA 3JS6A 2BUPA 1X3NA 4FOEA 3HI0A 5AQNA 3QMLA 3VEWA 2Q2RA 2FSNA 3MK6A 4I6MB 1ZC6A 3L4IA 3H6EA 4BRGA 1SAZA 4FWKA 3FFKB 5AFUA 5AQMA 4KBOA 3L0QA 1E4GT 3OHRA 2QWQA 3WQTA 5BPNA 4C23A 1IJJA 4F9OA 1HLUA 2P9KB 2Q97A 1CZAN 1K8KB 1NGAA 1JCGA 1X3MA 3FLCO 4M7XA 1C0FA 3P4IA 4FWSA 1ZBSA 3DXKA 4CZGA 4CZLA 3W0LA 1U2VA 3KHYA 1T6DA 3HM8A 3DAWA 2NRHA 3HSCA 3RSEA 3CJ1A 2HF3A 4BRPA 3CQYA 4BC5A 5F0XA 3ULEA 4BR7A 5AQPA 4CD3A 3EKUA 3UKRA 1NGGA 4M63C 3D2FB 5FPDA 5AQQA 4H5WA 2YHYA 1NGCA 3O08A 4BRFA 4JAXA 3H3NO 2E2OA 4BC2A 3UE5A 5AQRA 4FWPA 5E26A 5BPLA 4DHYA 2E2QA 3BP8A 3M3ZA 1QQNA 4H5TA 4A62A 4HTLA 4BG9A 2Q0UA 3A5LC 2FXUA 3BF1A 4CI6A 4IJAA 5AQUA 4H5RA 2QWPA 4FWNA 4CZIA 3MCPA 4H0OA 1H1VA 3LM2A 4O8KA 3S41A 4CZHA 2V52B 5AQVA 4FSVA 3HTVA 4QS9A 3FE1A 4A2BA 1P8ZA 5LY3A 1LOTB 3EL2A 4XH4A 2P9SA 3R8EA 2GWKA 5E84A 4QS8A 4ISFA 3I8BA 1U6ZA 3CJ7A 2P9LB 1J6ZA 5AZIB 1BUPA 3BUZB 4JNEA 1SZ2A 3VGMA 3VF4A 2GTDA 5I9EB 3LDOA 1NGBA 1MDUB 4DQ8A 3VETA 3ZETA 4A2AA 3VEOA 1MWKA 4IO8A 4BVPA 4CZMA 4BC3A 4JN4A 3DXMA 3LL3A 2ZF5O 3FZMA 5EVZA 3CQXA 2P9PA 3FZFA 5AQSA 4CJ7A 4BRLA 2IVNA 5AQXA 3LDPA 3H46O 3D2EA 3MN5A 4CBWA 1D4XA 1Z6RA 1KXPA 2ASPA 1GLJO 3VEVA 5LJVA 2ASMA 2V7YA 4EHUA 1QQMA 1DGKN 4QS7A 3GDQA 1TYQB 3VERA 2HF4A 4EAHD
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2GUIA 2HHXA 4BG8A 5HROA 1TAQA 3ZCMA 3HYFA 5AQIA 2V51B 4DG1A 2QA4N 2KFNA 3K2PA 4W5RA 1JLCA 4PKGA 4CCHA 3CCRN 2O4IA 1S1WA 4E7KA 2GELA 4LY7A 1WSJA 4CHQA 1UA0A 1WSFA 3ZSZA 4DFJA 3EO3A 3FGUA 1NJZA 3ZLJA 1UAXA 1NK7A 4DTOA 1VQ4N 4I7FA 2X6NA 3HPGA 3AO3A 1ZBLA 4CGDA 3M5RA 1QZ6A 1Y97A 1S6QA 4A59A 1QSSA 2G8FA 4OLAA 4EFHA 4QOZB 3PX6A 4YY3K 3J8AA 5I42A 5H1SQ 4LF9K 4BDPA 4IZ9A 3DXKB 3VTHA 5EOYA 2A41A 4KRFA 1ZBUA 2CGLA 4IFYA 1ASVA 1EQYA 3D7EO 3OW2M 3D6RA 1NGFA 1QSYA 5HL7L 2G8WA 1BI4A 3P39A 1NK8A 3GE1A 4O44A 1LAVA 1Q9XA 2NZTA 4BGAA 4NCAA 1RBSA 4IFVA 4ICLA 3VEYA 4CERA 3LP3A 4UQGA 1BIUA 5TKYA 3QEIA 5DM6L 3HL8A 5AQWA 1XQSC 1S9GA 3W3DA 4DB3A 4IXCA 5AZJA 1NGEA 1YVNA 1U04A 2VGNA 4FWOA 3R9PA 4CZEA 3CD6N 3OYJA 2QK9A 5JMVA 1BQMA 1CXUA 4HUGA 2A3ZA 1VAZA 4ISEA 3K5NA 4CJKA 2NRTA 3QBWA 3QLHA 2YNIA 4I2PA 2A40A 3ZSWA 4FJIA 1NWKA 4KTQA 4FK0A 3NDKA 4WYBA 1NNEA 3EY1A 3MN9A 5AFUH 4EIAA 1KFDA 3SQ1A 1N8RO 3CFPA 1GOBA 2P9PB 1RT1A 3H45C 3RTVA 1S5JA 3SBTA 4BQLA 3K5MA 2FBTA 4BGBA 2Y1JA 3DMJA 1VQPN 2J4RA 3CJ9A 3CM5A 3GL1A 4CZFA 4BROA 2OYQA 2Z1IA 2YX6A 4LF4K 3SAHA 4B9MA 1Q82O 3P5JA 1R59O 4GVEA 4NO7A 4CBXA 3TANA 3DRSA 4XH5A 4K0KK 4PA1A 3SZ2A 5KRSA 2HOEA 3GBTA 3U3YA 2WOMA 3ENOA 4OX9K 4E7IA 1NGHA 2C1GA 5ELZA 5TKWA 1WOQA 4JK9A 4ZTFA 3QIOA 3U9ZA 5F1XA 4DSFA 3CG7A 3O1WA 4HUEA 4CF0A 2OPPA 3HZ6A 4DCHA 2XO7A 3PUFA 4DFPA 2HHTA 3BDPA 3TSPA 5C12A 4LD0A 4FM2A 4DUZK 1A5WA 4Y1DA 2PFUA 1S72N 5J2QA 5J2PA 4JKBA 1TUUA 3L3VA 4DSLA 3L4QA 3OBWA 4WFAL 1QQOA 4DV4K 4DQPA 3PSIA 4E19A 2JGUA 3BF3A 3S3NA 2HVHA 4AHSA 1IBMK 4EHTA 1RBRA 4DKWA 1GLEG 3F9KA 4DU3A 3HVTA 2I7PA 1NJYA 1BI4B 1RCHA 3RVCA 3LPTA 1VQMN 2A1SA 1W2BM 3OYMA 2UXBK 4DSIA 1K8KA 1MWMA 3O4WA 1S3XA 4RW9A 1DTTA 4CEBA 1E4FT 4FJ9A 4I2QA 4A57A 3I0SA 2VWKA 3H08A 4BRMA 2JLEA 3PX4A 3T7ZA 4H5NA 5JVGL 4ID5A 1NMDA 2KTQA 4CEDA 3OYGA 5AZJB 3ID8A 3C0BA 2C1IA 1YJNN 4FL9A 2E88A 3OBYA 2PZSA 1RT3A 2FF3B 3EN9A 4E1JA 4UY8O 3LP0A 4IG3A 4F2RA 2PYJA 1S1UA 3AVMA 4ILGB 4RW8A 3CERA 2BE2A 3I33A 3A5NC 3A8YA 4GNIA 2HBKA 1YJ9N 2W40A 3FR0A 2EHGA 4C8KA 1Z26A 3TAGA 1Q9YA 1S22A 4B9SA 4FWLA 2BTFA 5BR8K 4F3TA 3LWLA 2D0BA 2FBXA 2ITMA 3TAPA 4F4KA 4RCHA 4BE1A 4DFMA 3MX5A 1ZBIA 3O6WA 5ADXA 4DFKA 4XIUA 1FKOA 3C94A 3L2UA 4JRPA 3K9KA 1WB9A 2YNGA 3E9OA 3ENHA 4CHZA 1FKPA 4DMNA 1TKTA 1SUQA 4W5NA 4JEPA 3E9PA 4DTUA 3CXCM 2IAJA 3RR7A 4N5SA 1MA9B 4PL8A 2CGKA 2ZD1A 1XNQK 1N33K 3VQ7A 3CF5L 4J8FA 5C0YA 4MO5A 3LM9A 4KTWA 1L3VA 1K8AO 4ILJA 4KH4A 4TSXA 3HK2A 1KVAA 2H3GX 4CFCA 1ZYQA 4M3ZA 2E20A 3KLEA 1J5EK 1C1BA 1JCFA 4LSNA 5FDLA 3TI0A 3V9XA 1FW6A 1BA1A 3CI5A 4JI7K 3CIPA 3U3GA 1KVBA 4CGFA 3VTIA 4B8CA 4JI5K 1ILYA 3OY9A 1QHTA 4GY2B 4KH5A 3AGRA 3O1BA 3OA9A 3LALA 1OH5A 3CCMN 4FOEA 3HI0A 3V9ZA 4LF7K 1RBTA 2FSNA 1RDBA 3OYFA 3LP1A 3MXMA 3T3FA 3FFKB 4KBOA 3OHRA 5K14A 4AH9A 1RTDA 4C23A 3TSUA 4DUYK 1IJJA 3QIPA 1CZAN 4BDZA 3O3GA 1K8KB 1X3MA 4M7XA 4LH4A 3QEPA 3P4IA 5KI6A 1ZBSA 4DTMA 2QI2A 1C6VA 3QERA 4FCYA 4DR4K 3KHYA 1T6DA 4M41A 3HM8A 3V9SA 4N56A 4JS5A 1VSLA 2HF3A 2VQEK 1TK5A 3AA5X 4LSLA 1RT4A 1OVYA 4CEOA 4CD3A 2X6SA 1KLMA 4YOWA 5FPDA 2YHYA 2PYLA 2IGIA 1WBDA 3J7ZO 2E2OA 4LF5K 2HNZA 3J7YP 2HNYA 4CK1A 1D8YA 2E2QA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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