1HLUA

Structure of bovine beta-actin-profilin complex with actin bound atp phosphates solvent accessible
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
374
structure length
373
Chain Sequence
DDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The structure of an open state of beta-actin at 2.65 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Complex (acetylation/actin-binding)
molecule keywords BETA-ACTIN
total genus 104
structure length 373
sequence length 374
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hluA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hluA03
3HSCA 1HLUA 3LDPA 3EO3A 4H0XB 3A5NC 1DKGD 3SLCA 1KAZA 4EAHD 2GTDA 1BU6O 4MLHA 4WQ4C 3U8XA 4B9QA 3A5OC 3ULEA 4A2BA 4ISGA 4JNEA 1NBWA 4PKGA 3ATUA 3EZWA 4Y0WA 3U9ZA 4A2AA 4BQZA 3O1WA 3FZHA 3DXMA 3CHWA 4O8KA 2ZGZA 3CJ7A 2FSKA 4B1YB 4BC5A 2HF4A 3L4IA 5JMVA 3H1VX 2FLOA 2A3ZA 5AQQA 4FSVA 1BG3A 3VESA 3IFRA 5CE3A 4CZGA 1V4TA 1YAGA 5AFUA 3W3DA 3C0BA 5AQSA 3VEOA 3VGKA 4NB4A 1NM1A 4BR7A 3ENOA 2WUSA 1HKBA 1YVNA 3L0QA 1GLEG 4NO7A 3SMPA 1H1VA 3O4WA 2ZGYA 2FSNA 3CQYA 3EN9A 5AQXA 5AQRA 5E84A 4FWLA 2D0PA 1QHAA 4GNIA 2NLXA 1ATNA 1QQOA 2QXLA 3H45C 3QFPA 3SMSA 5KPTA 2FF3B 4AM7A 4B1XB 4J8FA 1Z6RA 2GELA 3ATVA 2E2OA 3C7NB 4FL9A 4PL8A 4IXCA 3EL2A 4H0OA 1ATRA 3MCPA 3H3NO 4EHUA 3HI0A 4A62A 1NGBA 1YUWA 1V4SA 1BOTO 1TYQB 5AQUA 3UKRB 3VF6A 2P9PA 3CJ9A 5AQPA 3TPQA 3WEEB 4IWVA 1T6CA 3O08A 2D1KA 4ISEA 4E1JA 2HF3A 3R9PA 3A5LC 2BUPA 4FOIA 5AQHA 1TUUA 3MN7A 4CZEA 3RSEB 4CI6A 4BR0A 4FO0A 2ZWHA 2ASPA 2P9IB 3JXUA 2HMPA 3ZEUB 5AQLA 3H3OB 4H5VA 3VOVA 3DXKB 3VEVA 4BRMA 5KQDA 5KPRA 1U6ZA 2A6AA 2YHWA 3QBWA 4H03B 2GUPA 1GLDG 3P4IA 3AY9A 1NGCA 2OANA 4F9OA 4I6MB 1GLCG 4FWQA 2Q36A 1Z05A 3GG4A 1IG8A 3HM8A 3H6EA 3CJ1A 2PBDA 4BREA 2A41A 3MMVA 1SAZA 1E4GT 1T44A 5ELZA 4H0TB 3U4LA 2PAVA 2P9NB 5BRDA 4Z94A 2E2QA 4BRPA 4YDUC 1BUPA 3MN6A 5AQOA 4BRCA 3FGUA 4HWIA 4BRQA 2P9KB 4H0PA 3CIPA 3WXJA 4CZFA 1JCFA 2FXUA 2FF6A 1GLBG 4FPBA 1RDWX 3MK6A 3VF4A 4DQ8A 4JN4A 5AZJB 1EQYA 4B1WB 5AQMA 3VPZA 1KXPA 4WYBA 1NGDA 3C7NA 4K43A 4IO8A 2BTFA 1NMDA 1BA1A 4JD2B 3G25A 3O1BA 4QS9A 1KAYA 2V7YA 4BRNA 1TYQA 1BO5O 3UKRA 4FWNA 5AQFA 3WEEA 1ATSA 2W40A 4BRHA 2CH6A 2ASOA 3ZETA 5BPMA 2CGJA 3D2EB 1J6ZA 3UE5A 4CZIA 1QZ6A 5FPMA 3RSEA 4BRDA 2YHXA 3CERA 4XH1A 2P9IA 1MWKA 3ZEUA 4BG8A 5AR0A 4H5TA 3DXKA 2E1YA 5FPDA 5EVZA 2GWJA 1HX1A 3O6WA 3WT0A 3TU5A 1RGIA 3A5MC 4CJ7A 4WQ5A 5AQGA 1NGGA 2AA4A 2F9TA 4CZKA 3A8YA 3QMLA 3OHRA 1IJJA 2QWOA 2P9SB 5AQZA 4I6MA 2QW9A 1NGHA 2Q1NA 3D7EO 1R59O 5AZIB 4PL7A 2NRHA 2ASMA 5FPNA 3FLCO 1GLLO 4BR9A 5EX5A 3O8MA 5AQNA 3I8BA 2P9NA 1HKCA 2A40A 3JS6A 3R6MA 1U2VB 3QBXA 5BPNA 4FWMA 5F1XA 1LCUA 1MA9B 3QICA 4FOEA 4GY2B 4BRKA 3BF3A 1E4FT 4FWKA 5JLFA 1ZC6A 4B1UB 2P9KA 2AP1A 4M7XA 4MLEA 2GWKA 4XH4A 3UKUA 2EWSA 3CJAA 3ZETB 5AZJA 2VWBA 4A61A 3UB5A 4BRIA 3GOIA 1KAXA 5AQJA 5EXWA 1QZ5A 2IVPA 3LDNA 2IIRA 3WUHA 3AAPA 4JD2A 3CQXA 2I7NA 2Q2RA 4DCHA 3DAWA 3GE1A 4B1ZA 3VETA 4B1VA 4QS8A 5AQYA 1SQKA 4CBUA 4IJAA 2Q0UA 1MWMA 1SZ2A 3VEZA 1ZBSA 2GEMA 4K42A 3FZFA 4M63C 1QQNA 3CI5A 3FZMA 3D2EA 4WQ4A 3MN9A 2NZTA 4K41A 3F9MA 2QWRA 3HZ6A 3WQTA 4QS7A 3VEXA 5EY4A 1GLFO 4IZ9A 3VEWA 1GLJO 3KZBA 3QDKA 3IUCA 1NGFA 4PKIA 1Y64A 3H46O 3GL1A 2J4RA 3EKSA 4PKHA 4H5NA 2Q31A 2W41A 1XUPO 4BR4A 3AAQA 2IVNA 4IJNA 4FWOA 3MN5A 2P9SA 2HOEA 4H5RA 3BUZB 3VEYA 1P8ZA 3WQUA 5LJVA 3MDQA 5AZIA 5AQKA 4BVOA 1LOTB 3B8AX 2E88A 3CETA 3J8AA 1WOQA 3UKUB 1DEJA 1ESVA 1D4XA 1Q18A 4FWRA 5KPZA 1QQMA 5BN9A 3AARA 1U2VA 3IMXA 4BR5A 4H0VB 4BC4A 2YJFA 5JLHA 4RCHA 4CBWA 3DJCA 4BC3A 3S41A 3L6QA 3U9DA 2FSJA 1BA0A 3M6GA 3LDLA 4CBXA 5FPEA 3QFUA 4BGAA 5AQIA 1TUYA 2F9WA 3LL3A 3SJHA 5JICA 2E20A 1HPMA 3H1QA 2P9LB 4CZJA 3LM9A 4BRAA 4FWPA 4MO5A 4K25A 2DPNA 4H5WA 2QWQA 4BROA 4EFHA 2P9UA 1RFQA 4KBOA 3ENHA 3VGLA 2QWLA 5ADXH 3LDOA 3I33A 3BP8A 4BRLA 2KHOA 1YXQA 3DWLA 5BPLA 2E2NA 2QWNA 3WXKA 4BGBA 3KVGA 1K8KA 2ZF5O 2V52B 2YHYA 5E26A 2CGLA 5KQ8A 1NGEA 3ZX0A 1S3XA 3BEXA 5BREA 2D4WA 2UYTA 1GLAG 4C23A 1XC3A 4AM6A 1HUXA 3LM2A 4EIAA 3R8EA 4BVPA 1X3MA 3VENA 4JHDA 3ZX3A 4JAXA 3D2FB 1JCEA 1C0FA 3ZX2A 5BN8A 2IVOA 1T6DA 4RTFD 1NLVA 1S22A 1HJOA 4BRGA 1OKJA 1X9JA 4HTLA 2VYPA 2ITMA 1BWFO 4CD1A 3FE1A 4CZLA 3WXLA 4YDUA 5AQVA 2V7ZA 3O5BA 4FWSA 1G99A 4BG9A 4MO4A 4DHYA 5F0XA 1NGIA 3IDHA 2Q0RA 2P9UB 2QM1A 3ULEB 4RWTA 4BRFA 4DB3A 5AFUH 3A0IX 3VERA 4EHTA 1WUAA 1BDGA 2A42A 3M1FA 3GDQA 2P9LA 3DXMB 1K8KB 3M3ZA 4WQ5C 3VGMA 5BR9A 5F2RA 2E2PA 3W0LA 5AQTA 4XEIA 1NGJA 4M7YA 3EKUA 2E8AA 3FFKB 1ZXOA 5B8HA 3KHYA 3CJBA 1HKGA 5BRFA 2CGKA 3GBTA 4LC9B 4XH5A 3QB0A 5EOYA 3ID8A 4JHDB 1NWKA 2Q97A 2E1ZA 1JCGA 1MDUB 2YCHA 3CJCA 3O80A 5ADXA 4BQLA 4O5FA 1C0GA 4ISFA 2I7PA 2CH5A 4CZHA 3WXIA 3LDQA 3FR0A 1CZAN 4L3QA 5I9EB 5AQWA 2YI1A 4FPAA 1NGAA 2D0OA 1X3NA 3SK3A 3FZLA 5BRHA 2A5XA 2QWMA 4BC2A 4CD3A 4CZMA 5LJWA 1XQSC 3D2FA 2YJEA 1DGKN 3BF1A 3HTVA 2VCPA 4H0YB 5LY3A 2P9PB 4BR2A 3VF2A 2V51B 2H3GX 2QWPA 3FZKA 3HBTA 5TKYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HLUA 1J5OA 3A5NC 1UA1A 1N32K 3OYNA 4PQUA 3ULEA 3T1HK 4A2BA 3DLHA 4ISGA 2VWKA 3C6HA 3DOLA 1NBWA 2IDOA 4PKGA 4CHOA 3AA4A 3OYMA 4Y0WA 2ZGZA 3CJ7A 4O5BA 4BC5A 1DT9A 4CIEA 2O8BB 3L4IA 2WC9A 2A3ZA 2B5JA 3IS9A 3K2PA 2XRIA 4FYDA 1RT1A 2PZSA 3VGKA 4J2EA 5HBMA 3Q7CA 3PIOL 5JVHL 3AVGA 4JEPA 3V4IA 2IC3A 3EN9A 4DWIA 4V19S 1RT2A 3K5MA 1N6QA 3I0RA 4GNIA 3PIPL 2NLXA 3SMSA 2QXLA 4AHSA 4CE9A 3PLAA 5KPTA 4PWDA 1Q7YO 4Z4CA 4AM7A 1Z6RA 2YX6A 2KKZA 4IXCA 3EL2A 5KRSA 1ATRA 1EX4A 5T7BA 4DSLA 1SS6A 3MCPA 4G1QA 4LF8K 3MX5A 5JENA 3MCAB 3HI0A 3DLLL 4C8OA 5AQUA 1TYQB 5AQPA 4KHPK 3WEEB 1T6CA 4ISEA 3J7AP 3R9PA 2G8FA 1TUUA 2JGUA 3ISNC 2ZWHA 2P9IB 2OYQA 2G8KA 2HMPA 4CVNE 4CJLA 2R7YA 1IBKK 2HHTA 1TKZA 3H3OB 5KQDA 4E19A 2YHWA 3CM5A 3QEIA 4Z4HA 4LH4A 3QBWA 4H03B 4EP5A 3EZ5A 3AY9A 4FJ5A 2O8BA 3O9TA 3HM8A 4AHRA 5M1FA 1HNWK 1YITN 3LPTA 1KLNA 3MMVA 1YI2N 1SAZA 5CR4A 4WFBL 4DR7K 2PFUA 4H0TB 5C42A 3O9RA 3AA5X 2P9NB 3ZSQA 5SWMA 3KLGA 4BRPA 5CYQA 4YDUC 5AQOA 1VQ5N 1RDAA 1BGXT 2BH1A 5HRRA 2UUCK 3LDSA 3SUQA 3TAGA 3E1YA 2OZMA 1CXUA 3VF4A 1RDWX 3MK6A 4CK2A 2VG6A 3O9SA 4JN4A 5AZJB 3QEWA 3KD5E 4KHUA 1KXPA 1RT7A 4OLAA 3QNOA 3CG7A 1YT3A 3NH2A 1BA1A 4AQYK 1K9MO 3RMCA 3G25A 1JLCA 1TGOA 1KAYA 5HLFA 4C8KA 1TYQA 4B08A 5AQFA 3WEEA 2VQFK 5FRMA 1HYZA 2CH6A 4JS5A 3ZETA 5BPMA 3F73A 1FW6A 3UE5A 4CZIA 4J2BA 5BR8K 2P9IA 4W5OA 4OPKA 1MWKA 1ZBFA 4BG8A 4KHYA 2VWJA 1KFDA 3LZIA 1XHXA 3AO4A 4BE0A 2HHXA 1SV5A 2GWJA 4GVEA 4B3SK 4CJ7A 4FW1A 3A5MC 1YF5L 4WQ5A 4FJJA 4IEEA 3QMLA 3T7ZA 1NU0A 5JS2A 3KLIA 3QEXA 4DU4A 1R59O 5AZIB 4IDKA 1FKOA 1OVQA 3OBYA 3CPWM 3LP2A 1L3UA 3ZT4A 1RTJA 3HPOA 2P9NA 1HKCA 5BPNA 4FWMA 1BL3A 5F1XA 1MA9B 4FOEA 3OYKA 4UY8O 1FXXA 1A5VA 2UXCK 1T3VA 3TSUA 4I7FA 4CGFA 4B1UB 1A5XA 2GWKA 3AVJA 3UKUA 2EWSA 4RW9A 4KB0A 3QESA 3CJAA 2KTQA 5AZJA 4BRIA 3UB5A 4FM0A 1S1TA 1KAXA 4QAGA 1QSYA 2B4JA 5I42A 2IS3A 1QZ5A 2IIRA 3WUHA 4C1NK 1RILA 2Q2RA 3ASMA 4Q5VA 1IKXA 1VSKA 3ZYYX 2E6MA 4MQ3A 2Q0UA 1JL1A 1MWMA 1SZ2A 2GEMA 3LAKA 1ZYQA 4JK8A 3VQEA 3E66A 4K41A 2Z1JA 3AVAA 4Z4FA 3EEQA 3KIOA 4QS7A 4NLCA 3VEXA 4IZ9A 2ZE2A 3VEWA 2NRTA 2UUBK 3K5NA 1NGFA 4JKGB 1Y64A 2EX3A 4AHVA 3H46O 3GL1A 2J4RA 3EKSA 4CW7B 2NRXA 4NCBA 1BISA 2ZJPL 4BR4A 4IJNA 3KLFA 4G9ZA 1G15A 4FWOA 2NUBA 2EHGA 2HOEA 1GOCA 4DV1K 1P8ZA 3VA0A 5AZIA 5AQKA 3TI0A 5C2DA 4Y1CA 2HHQA 2NRVA 1SUQA 4ELUA 1ESVA 4KREA 3LPUA 2XHBA 3WNHA 4U7BA 2XY5A 4KHNA 5BN9A 4DS4A 1HQEA 1VQON 3O3FA 3N4PA 5HOOA 3L6QA 4CF9A 1S6QA 2QEXN 3M6GA 3QIPA 3RMDA 1RTDA 3O9QA 4FM2A 3QFUA 4BGAA 3U6FA 1JXEA 2B6AA 4Z0UA 3HP6A 3RRGA 2F9WA 3Q7BA 3LL3A 3AVFA 5FDLA 3SQ4A 2YKNA 3H1QA 1EO1A 3HT3A 4BRAA 3I56N 1EETA 1FK9A 4DTJA 2DPNA 2Z1GA 4BROA 4CCHA 1RFQA 3K58A 4KBOA 3DRPA 3SUNA 3VGLA 3BDPA 3V9WA 3RWUA 1NKCA 4BGBA 1E3MA 4X64K 1VAZA 1YTAA 2V52B 1K8AO 1ILYA 2YHYA 2KZMA 5J2PA 3D0PA 3AVMA 1T03A 4BDZA 2RKIA 2UYTA 4WF9L 4JKGA 4LSLA 4Z4GA 3LM2A 4HHTA 3SV4A 3CC7N 1RT4A 4FJNA 1TK8A 3TARA 4CJWA 4DSJA 4CEQA 3ZT0A 1EP4A 1X3MA 4BWMA 4JHDA 4JAXA 4OPJA 4IOXA 1NLVA 4E3SA 4CK1A 4ID5A 1X9JA 2VYPA 1RT5A 3F5TA 2RE2A 3ZSZA 4CZLA 4H8KA 5KRTA 4YDUA 2V7ZA 3O5BA 4BG9A 4FXDA 4OLBA 4OJRA 2O8EB 2Q0RA 3SJJA 2VGNA 1D9FA 2P9UB 4GW6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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