1HPMA

How potassium affects the activity of the molecular chaperone hsc70. ii. potassium binds specifically in the atpase active site
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How potassium affects the activity of the molecular chaperone Hsc70. II. Potassium binds specifically in the ATPase active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 44K ATPASE FRAGMENT (N-TERMINAL) OF 7O kD HEAT-SHOCK COGNATE
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase (acting on acid anhydrides)
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1995-03-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1hpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hpmA04
1IJJA 1OKJA 1NGHA 2P9KB 4RTFD 4XH1A 1T6CA 4K42A 3MK6A 4WQ4A 5LY3A 3H46O 2AP1A 3U9DA 3ATVA 2FF6A 3AARA 2E2QA 4B1WB 2FSJA 1D4XA 1X3NA 1NGDA 4M7YA 5BREA 3P4IA 3CJ7A 1SZ2A 3WQUA 2GEMA 2IVNA 3ULEB 4H0TB 1NWKA 4BC4A 2QWNA 4BC2A 4CZEA 1TYQB 3GOIA 4K43A 2E20A 3LM9A 2Q0RA 2IIRA 3UKRB 5FPEA 3MN6A 1ATNA 3DAWA 1BDGA 2A5XA 4BC5A 2GWJA 4BQLA 5F0XA 3DXMB 4ISEA 2V7ZA 3MN5A 3ZX0A 2P9LA 3DJCA 2Q0UA 2E2OA 1GLBG 3QBWA 4I6MA 5AQNA 1HJOA 3MN7A 1LCUA 4B9QA 4IWVA 2P9PA 5JICA 1Q18A 1KXPA 4CZJA 4ISGA 5AQPA 2CH6A 3DXKA 1GLEG 4DHYA 4H03B 3WT0A 4CJ7A 4JD2B 3D2FB 4JAXA 3O6WA 3A0IX 2CGKA 3HSCA 1YUWA 1JCFA 5EXWA 2ZGYA 3BEXA 1J6ZA 5AQGA 5FPDA 3WXJA 2ITMA 1GLLO 1QZ6A 3BP8A 2YHYA 5AQWA 1S22A 3FZLA 2FXUA 3H1QA 4M7XA 4Y0WA 3OHRA 2ZF5O 5AQJA 3FGUA 1BU6O 2VYPA 3H6EA 5AQZA 4MLEA 2E1YA 5JMVA 4GY2B 4FWSA 2PAVA 5AZIB 3B8AX 1HKBA 2F9WA 3WEEA 5BPMA 1BA0A 4YDUA 1MWMA 3W0LA 3FLCO 5AZJA 3VEWA 1JCGA 4H0YB 4FOIA 3H45C 2HOEA 4HTLA 5AQHA 2P9NA 4DCHA 4MLHA 2HF4A 3ZEUA 4H0PA 1DEJA 1HKCA 4GNIA 3VEXA 2ZGZA 1HLUA 1U2VB 1HX1A 4PL7A 3WXLA 4JHDB 3ZETB 5AFUA 4BGAA 4BR4A 1ATSA 4BRMA 3HM8A 4B1YB 3O8MA 2GUPA 3VEYA 4B1XB 3FZFA 2P9IB 1S3XA 3KZBA 4CI6A 3C7NB 4BRHA 2P9SB 5AQMA 4B1UB 2ZWHA 3A5OC 3EKUA 4BRLA 3CIPA 3KVGA 3U8XA 3GL1A 5BN9A 1T44A 2A42A 4FWOA 3BF1A 5ADXA 3VGLA 4BRPA 4DB3A 1X3MA 2D0PA 2YHWA 3UKUB 5BRHA 4H5TA 5AQLA 3VGKA 3M1FA 4BR7A 3U4LA 1ESVA 3QMLA 2HF3A 3VF2A 4L3QA 3ID8A 1K8KB 2QWOA 3CETA 3MN9A 4DQ8A 1ZC6A 3GE1A 5AR0A 1RDWX 2QWMA 1P8ZA 3L6QA 3GG4A 3VENA 3RSEB 2CGLA 1BUPA 1GLDG 1LOTB 3MMVA 4FSVA 4CD1A 4JNEA 1X9JA 4BR9A 1BG3A 5ELZA 1NGCA 4LC9B 2E2PA 3O1WA 5BRDA 5F2RA 4RWTA 3J8AA 5AQTA 4H5NA 5BR9A 4BRIA 3WUHA 5AQXA 1TYQA 2A3ZA 3IUCA 2A6AA 4CZKA 4CBWA 1NGGA 5KQDA 5TKYA 3MCPA 4WYBA 1XC3A 3F9MA 3FR0A 3LDLA 2QWRA 3EZWA 2DPNA 2YCHA 1BA1A 4A2AA 1TUUA 4WQ5C 3VESA 5EVZA 2OANA 4FPAA 2E88A 3IFRA 2P9LB 1ZXOA 2Q2RA 1KAYA 2QWQA 4I6MB 4AM6A 3EN9A 4BRNA 3FZKA 4CZIA 1NGBA 3D2EA 2P9PB 1QQMA 4BQZA 1V4SA 3QFUA 3ZX3A 4FWKA 5AFUH 4A61A 1NM1A 1NGJA 4E1JA 4EAHD 5AQYA 3SJHA 2V51B 4PL8A 3BF3A 3A8YA 1TUYA 3CJ9A 3A5NC 1JCEA 5JLFA 3VF6A 5AQUA 4EFHA 3U9ZA 3KHYA 3FE1A 1NGFA 5KPRA 3VEOA 1C0GA 1HUXA 2FSKA 3LDQA 5KPTA 4K25A 4EIAA 3D7EO 5E26A 3QB0A 3AY9A 4NB4A 3CHWA 1ZBSA 3A5MC 3HZ6A 3WEEB 1NBWA 5AZIA 4CZHA 1NMDA 1E4FT 1SQKA 1MA9B 5KQ8A 1E4GT 5AZJB 5AQRA 2IVOA 5AQIA 3R6MA 2QXLA 3W3DA 3EO3A 3UE5A 1Z05A 2NLXA 4ISFA 3I33A 2F9TA 2P9NB 3O4WA 4BVPA 5AQOA 2NRHA 4BRGA 4FWQA 4FPBA 2P9UA 5LJWA 4O8KA 3HI0A 4BC3A 3WQTA 3H1VX 3CJ1A 1GLAG 1NGEA 2D0OA 1NLVA 1XQSC 4PKGA 2YHXA 3QFPA 1T6DA 5BRFA 2ASPA 4O5FA 3VGMA 1V4TA 4A62A 4BR5A 4PKIA 2VWBA 5JLHA 2P9SA 4H5RA 3VEZA 1WOQA 3HTVA 3LM2A 1Z6RA 4BR0A 4JN4A 1BOTO 3AAQA 4MO4A 4CZFA 3O5BA 3VEVA 4XEIA 1RFQA 3UB5A 2V52B 1ATRA 3IMXA 1KAZA 2Q31A 2A40A 5BPNA 1RGIA 4WQ4C 3EL2A 2P9KA 3FZHA 1CZAN 2GTDA 4NO7A 3L0QA 4XH5A 3ZX2A 3M3ZA 3HBTA 5EY4A 5CE3A 2I7NA 4BREA 1DGKN 1MDUB 3IDHA 3MDQA 4H0OA 2D1KA 4XH4A 3JS6A 1K8KA 3VF4A 4BGBA 3FZMA 3BUZB 1BWFO 4BRKA 2WUSA 2V7YA 4CBUA 4BRQA 3CQYA 1YAGA 5AQSA 3GBTA 3H3OB 3ULEA 3JXUA 4K41A 3RSEA 2UYTA 3EKSA 4EHUA 5AQVA 2J4RA 3WXKA 4H5VA 1KAXA 4FWPA 3TU5A 3SLCA 2H3GX 2YJFA 2I7PA 4BRFA 3CERA 3UKRA 4IJAA 2BTFA 3LDPA 4CZLA 4CZGA 4BROA 4BVOA 4BG8A 1MWKA 1NGIA 3DXMA 2CH5A 1G99A 1U6ZA 2W41A 3GDQA 4HWIA 3O08A 2VCPA 2GWKA 4H0VB 3G25A 5BN8A 3QBXA 2ASOA 3VPZA 1H1VA 3AAPA 2KHOA 1C0FA 4BG9A 4CD3A 4IZ9A 4WQ5A 2E8AA 3ATUA 3DXKB 4CZMA 1DKGD 2HMPA 3D2EB 3QICA 3C0BA 3D2FA 4JD2A 4IJNA 3S41A 4BRAA 2GELA 3VERA 4BRDA 1XUPO 3WXIA 1NGAA 3LL3A 5EOYA 4B1ZA 5AQQA 5ADXH 5I9EB 5AQFA 3H3NO 5EX5A 2Q97A 3CJAA 4EHTA 3CJCA 5AQKA 4FOEA 5FPMA 3ENHA 4A2BA 3O80A 3O1BA 4FO0A 4IXCA 3SK3A 2D4WA 2ASMA 4YDUC 1YVNA 5LJVA 1SAZA 1Y64A 3R9PA 3ENOA 4FWRA 2QWPA 3SMPA 2BUPA 4H5WA 1QZ5A 2AA4A 4RCHA 3VETA 3CI5A 4QS7A 3A5LC 3CJBA 1IG8A 2E2NA 4J8FA 4AM7A 3I8BA 3ZEUB 2FLOA 4Z94A 2W40A 1GLFO 3M6GA 2YJEA 2Q1NA 1U2VA 2QM1A 3VOVA 3SMSA 1BO5O 4JHDA 3ZETA 5BPLA 4QS9A 4MO5A 1QQOA 4FWMA 2NZTA 2P9UB 1R59O 1QQNA 2CGJA 4KBOA 2E1ZA 3FFKB 1QHAA 2YI1A 2QWLA 2P9IA 4BR2A 1GLCG 4BRCA 4FL9A 3C7NA 3R8EA 3QDKA 4QS8A 3DWLA 4FWLA 1WUAA 4C23A 5B8HA 1GLJO 5F1XA 4B1VA 3CQXA 4F9OA 5FPNA 2EWSA 1YXQA 4PKHA 2Q36A 2FF3B 3LDNA 1EQYA 1HPMA 2A41A 5KPZA 3LDOA 3UKUA 4H0XB 1HKGA 4CBXA 4IO8A 2IVPA 4FWNA 3TPQA 2PBDA 4M63C 3L4IA 2FSNA 2QW9A 5E84A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NH2A 2PYLA 4CF1A 3WNGA 3AA2A 3DRRA 4XH1A 4NLBA 1KCFA 3ATVA 2FF6A 4JV5K 1NKCA 1N32K 3C65A 1T0ZA 4DQQA 2YIOA 1X3NA 1NGDA 4JKGB 3L3VA 1VRUA 2HSTA 2IVNA 5C0YA 1RBTA 2X78A 4CFDA 4BC4A 2QWNA 3CFOA 4AF1A 4WFNL 5KK4A 1J53A 2W42A 1DQ7A 2KW4A 1LV5A 3KLEA 3UKRB 1BK8A 3MN6A 4FLUA 5M1PA 4CJUA 4Z4GA 4DSLA 2KBKA 3NGYA 4BQLA 3DXMB 2IDOA 3C94A 1PTXA 4FLYA 3ZX0A 4YOVA 1BHLA 2Q0UA 1QQCA 4DU4A 3V1OA 3OYKA 2XHBA 4X65K 5JICA 4CZJA 4FJ7A 1R0AA 3KLHA 5AQPA 4OKJA 1HYVA 4NYNA 3QETA 4DR6K 3QNOA 4H03B 1WBBA 5BR8K 4JAXA 3S3MA 4N56A 4RW9A 1YUWA 3P5JA 1KC8O 4E7IA 1LW2A 4CGHA 1QZ6A 2LKBA 1NK9A 2HNDA 2YHYA 4GMJB 5HRRA 3MEGA 4KYPA 5J2PA 1JL2A 2ZD1A 1Q82O 2HNYA 2WFBA 1L3SA 4DUYK 2ITGA 3KOXA 3MXMA 4DKWA 4IDHA 3WEEA 4BACA 1YJ9N 1BA0A 1U04A 3OYMA 1L5UA 3C6AA 4CJLA 1X1PA 4M3TA 2F7TA 5AQHA 4OPAA 4DCHA 1GOCA 4CEBA 5GAGP 4H0PA 1HKCA 4GNIA 4X64K 1JLGA 3V6DA 1T05A 3JAMO 2ZGZA 2KJAA 1U2VB 4CK1A 2LT8A 4BE0A 5AFUA 3ZT0A 2OCEA 3DMJA 1RDAA 3SNNA 4BRMA 4FJNA 4CHYA 3PV8A 3RTVA 4KKOA 1BIUA 2N69A 2VGMA 4CI6A 3VEYA 4QCLA 2E6LA 4DSEA 1WMTA 4M3XA 2ZWHA 4LD0A 4KREA 1YJNN 3CIPA 3RMCA 1JLQA 3QNNA 1P00A 5BN9A 2A42A 4FWOA 2OZMA 4NXMK 4KH6A 2WOMA 2Z1IA 1KVAA 3VGLA 3DOLA 1VSIA 3VGKA 2KBHA 3LALA 4ID1A 4CQKA 4DR5K 1P0AA 3QMLA 2HF3A 4B08A 2F96A 3VF2A 4CF0A 4AHUA 3SAFA 4L3QA 3VA3A 2QWOA 1L3UA 3MN9A 1KV0A 3V9ZA 3GE1A 5AR0A 1BMRA 1RDWX 1S9GA 3L6QA 4RW8A 1KTQA 3RSEB 3PX4A 1BUPA 3MMVA 3P38A 4OPJA 2C1GA 1X9JA 2YHBA 1S6PA 3LP3A 1NJXA 1QSLA 4B9VA 4M3RA 4EP4A 4DQIA 1ILYA 4JK7A 4JS5A 5F2RA 4CK2A 2BRZA 2O8DB 5BR9A 3OYIA 3T1YK 4FXDA 2A3ZA 1WT7A 3IUCA 3MEEA 2G8IA 2G8FA 3L8BA 4B9SA 5TKYA 3MCPA 3F9MA 4LF7K 4OO1J 3FR0A 3LDLA 2VY6A 1MU2A 4DV4K 2E88A 1OVQA 2G8WA 3N4PA 2HB5A 3NF9A 1M1KO 2LY6A 3P1GA 2QWQA 4I6MB 4AM6A 3FZKA 4EZ6A 2XY5A 1BL3A 1QQMA 1V4SA 2VG6A 4FWKA 1QVFM 4PA1A 1NM1A 3JSMA 4EAHD 2QKBA 3NH1A 4J2BA 2O8CB 1RBUA 2GMOA 2HHVA 1IBLK 5AQUA 1KFDA 3U9ZA 4YOYA 3I56N 4UQGA 3THXB 1VSKA 5KTQA 3DLBA 3I8DA 4DF4A 4IKFA 3VEOA 1HUXA 2FSKA 4CHPA 1RTHA 4JLHA 1ZYVA 2IS3A 3ID6A 2B5JA 4JI1K 4O44A 2OPSA 1NMDA 4CFBA 1SQKA 1VSDA 2LJMA 1MA9B 5KQ8A 2NRZA 1SN1A 4W5NA 3R6MA 2QXLA 4WCEL 4FLTA 4DSKA 5FRNA 3HOTA 4JKCA 2HHWA 1JZBA 4FWQA 1K6YA 4FPBA 3HL8A 1C6VA 1HRHA 5KI6A 5M1KA 4KHQA 2O4IA 1RT5A 2VWJA 2NNWA 1D5AA 3CJ1A 2LSNA 2IAJA 1NLVA 2JDQD 3AVBA 4O55A 3L2VA 4BR5A 2B68A 1RTDA 3KLIA 1SEGA 1BGXT 5HP1A 4FVMA 4CHZA 4PWDA 3AO1A 3SQ1A 4DFKA 5JS2A 3SV3A 4LF9K 1IO2A 4GVEA 4JN4A 4FZXC 4MO4A 4CZFA 1X9WA 4JKDA 4ZHRA 4A5BA 3VQPA 4F8RA 4FJ8A 4K8ZA 4DTNA 3UB5A 2W00A 3IMXA 3CD6N 1LQIA 2GTDA 2OPQA 1NNEA 2P51A 4AHCA 1NOZA 1WAFA 4R5PA 5EY4A 2I7NA 3HP9A 4BREA 1S6QA 3OS2A 1TKDA 4H0OA 4BGBA 5FLXO 4XH4A 5EU7A 4BRKA 2WC9A 3TAEA 4V1DC 2BGGA 5GAHP 3DLHA 4BRQA 5AQSA 3GBTA 4JKGA 2Y1JA 4DQPA 3AO4A 5K14A 3EYZA 1C0TA 4FCYA 4EHUA 2J4RA 3M8SA 5J1EA 3WXKA 4RW6A 4FWPA 2YJFA 1VNBA 3AVIA 3KHWA 3DLRA 4BRFA 3CERA 3UKRA 4IOAL 2BTFA 5HRPA 1XRSB 3PO5A 3DXMA 3L56A 1NGIA 3GDQA 1IKXA 3SUNA 1T7EA 1Q86O 3HK2A 4H0VB 3CFRA 1IKWA 3QBXA 3J7YP 2KHOA 1C0FA 4CD3A 2E8AA 3ATUA 1ZVGA 4CZMA 1WSJA 3AVLA 3D2EB 1TKZA 4OLAA 3L2QA 4CCHA 1XNRK 4Y1CA 1LAVA 4KO0A 2GELA 2R7YA 2IC3A 4OKKA 3LL3A 1VSLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3NH2 A;  2PYL A;  4CF1 A;  3WNG A;  3AA2 A;  3DRR A;  4XH1 A;  4NLB A;  1KCF A;  3ATV A;  2FF6 A;  4JV5 K;  1NKC A;  1N32 K;  3C65 A;  1T0Z A;  4DQQ A;  2YIO A;  1X3N A;  1NGD A;  4JKG B;  3L3V A;  1VRU A;  2HST A;  2IVN A;  5C0Y A;  1RBT A;  2X78 A;  4CFD A;  4BC4 A;  2QWN A;  3CFO A;  4AF1 A;  4WFN L;  5KK4 A;  1J53 A;  2W42 A;  1DQ7 A;  2KW4 A;  1LV5 A;  3KLE A;  3UKR B;  1BK8 A;  3MN6 A;  4FLU A;  5M1P A;  4CJU A;  4Z4G A;  4DSL A;  2KBK A;  3NGY A;  4BQL A;  3DXM B;  2IDO A;  3C94 A;  1PTX A;  4FLY A;  3ZX0 A;  4YOV A;  1BHL A;  2Q0U A;  1QQC A;  4DU4 A;  3V1O A;  3OYK A;  2XHB A;  4X65 K;  5JIC A;  4CZJ A;  4FJ7 A;  1R0A A;  3KLH A;  5AQP A;  4OKJ A;  1HYV A;  4NYN A;  3QET A;  4DR6 K;  3QNO A;  4H03 B;  1WBB A;  5BR8 K;  4JAX A;  3S3M A;  4N56 A;  4RW9 A;  1YUW A;  3P5J A;  1KC8 O;  4E7I A;  1LW2 A;  4CGH A;  1QZ6 A;  2LKB A;  1NK9 A;  2HND A;  2YHY A;  4GMJ B;  5HRR A;  3MEG A;  4KYP A;  5J2P A;  1JL2 A;  2ZD1 A;  1Q82 O;  2HNY A;  2WFB A;  1L3S A;  4DUY K;  2ITG A;  3KOX A;  3MXM A; 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