1HPMA

How potassium affects the activity of the molecular chaperone hsc70. ii. potassium binds specifically in the atpase active site
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title How potassium affects the activity of the molecular chaperone Hsc70. II. Potassium binds specifically in the ATPase active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 44K ATPASE FRAGMENT (N-TERMINAL) OF 7O kD HEAT-SHOCK COGNATE
molecule tags Hydrolase (acting on acid anhydrides)
source organism Bos taurus
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1995-03-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1hpmA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hpmA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1hpmA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1hpmA04
2AP1A 1NWKA 2E1ZA 2E2OA 1SAZA 2YJFA 2BTFA 2E20A 4F9OA 2QW9A 4QS7A 1SZ2A 4CZEA 4B9QA 4FOEA 3WQUA 4CJ7A 4XH1A 2DPNA 2Q2RA 4JAXA 3UKUB 1BU6O 4O5FA 5AQZA 2W40A 1IG8A 3ATVA 1NGAA 4IXCA 3CJAA 3CQXA 2E2QA 3SMPA 3VGLA 2GWKA 1RDWX 3MCPA 3FE1A 2CGLA 1XQSC 2V51B 1YVNA 4BGAA 1MDUB 1C0FA 2ASOA 3ULEA 1YXQA 1BO5O 2V7YA 3CETA 1NGCA 3MN9A 4IO8A 4M7YA 3LDLA 3U8XA 1KAYA 3LDOA 4H0TB 4CBWA 5KPTA 4CI6A 2E2NA 3O4WA 4C23A 5BPNA 2AA4A 4A2BA 4BRIA 3J8AA 3CIPA 2Q0UA 4RTFD 4CD3A 4CZMA 5AQQA 4H0VB 4NO7A 2NLXA 1ZC6A 4BC4A 3W0LA 5JICA 4FWNA 5FPNA 4EFHA 4I6MA 3VEWA 2P9PB 4QS9A 5JLFA 2EWSA 1E4GT 1T6CA 1NGJA 3VF2A 3I33A 1BOTO 4BREA 1NGBA 1TYQB 5BRDA 2HF3A 2QWQA 3R9PA 1E4FT 2Q1NA 4IJAA 2P9SA 3U9DA 3ATUA 3G25A 3ZEUB 1NGHA 1K8KB 2A3ZA 3VOVA 5F0XA 2F9WA 4CZIA 3IMXA 3TU5A 3B8AX 4A61A 4BRNA 1C0GA 2QXLA 5E84A 1JCEA 1IJJA 3HTVA 4BRQA 3WXLA 5FPEA 1GLCG 3QICA 4A62A 3D2FA 3O5BA 2VCPA 4EAHD 3FGUA 2GUPA 4ISGA 4PKGA 1DEJA 1XC3A 3R6MA 2W41A 1YUWA 3M3ZA 3UKUA 1HLUA 1DGKN 1MWMA 3O80A 4RCHA 3A8YA 1OKJA 2NZTA 4CZKA 2E88A 3FZHA 2P9LB 4BR2A 2J4RA 1U2VB 3VF4A 3VENA 3W3DA 4H03B 4K43A 5BRFA 4K41A 3U9ZA 2GELA 1GLDG 3SK3A 3GG4A 2F9TA 2ITMA 2FF3B 2VYPA 2ZF5O 4PKIA 3WEEB 3EKSA 3VEYA 4WQ4C 3EO3A 5E26A 3BF1A 4I6MB 3H3OB 4FPAA 2Q0RA 5I9EB 3IFRA 4DHYA 2A42A 4BR9A 2Q31A 1QZ5A 2P9UB 2P9PA 2CH6A 5KQ8A 3D7EO 3H3NO 2P9SB 2A6AA 4JNEA 5TKYA 1RGIA 5AQYA 3EN9A 3IUCA 2BUPA 1WUAA 4BRLA 1TYQA 3QBXA 3CJ1A 3D2EA 4ISEA 1BUPA 3L0QA 1NGFA 2YI1A 4IZ9A 4CZHA 3ZEUA 4XH5A 1K8KA 5EY4A 4LC9B 3O1BA 1X3MA 3D2FB 2P9IB 4FWOA 2PAVA 5ELZA 4FL9A 3MDQA 5AQSA 1HUXA 3QBWA 3QMLA 1LOTB 4QS8A 5EOYA 5BPMA 5EX5A 4BRFA 4ISFA 1KAZA 5AQLA 2FLOA 2OANA 2I7NA 1JCGA 3F9MA 3WT0A 4DQ8A 4B1ZA 4NB4A 2I7PA 4BVPA 3C7NB 3FZFA 3SLCA 4GY2B 4CZJA 2P9LA 1HKBA 4FWKA 1GLBG 1U2VA 3VEZA 3VEOA 3AAPA 3WQTA 2E8AA 4CZFA 3ENHA 5BR9A 4WQ5A 3M6GA 2CGJA 3EKUA 5AQRA 1QZ6A 2KHOA 1NLVA 3S41A 2P9NB 4BVOA 3M1FA 3LM9A 5AZIB 1J6ZA 4BR5A 1CZAN 5AQMA 5KPRA 4FPBA 3QFPA 4EIAA 1BG3A 3RSEA 3WEEA 5JLHA 1BWFO 3EL2A 3UKRB 3D2EB 2P9UA 4AM7A 5LJVA 1ATSA 3FR0A 3UE5A 2ZGYA 1QQOA 4L3QA 2YHYA 2E2PA 4BRAA 3C0BA 3KVGA 2FF6A 3VEXA 4CBXA 5F2RA 2ZGZA 1BA1A 4H5WA 1GLFO 1V4TA 3TPQA 4BRPA 5AQFA 2WUSA 1X9JA 1HKCA 5BPLA 4CZGA 3CERA 1XUPO 3CJBA 1D4XA 3JS6A 1GLJO 3WXIA 2P9IA 3HZ6A 5AQWA 4E1JA 1GLLO 4BGBA 1BDGA 4BG8A 3ZETB 2D1KA 1YAGA 4PKHA 1HKGA 4Y0WA 1ESVA 4BR0A 3CJ7A 5FPDA 1X3NA 4M63C 1NGDA 2NRHA 3HBTA 3VPZA 1HPMA 5JMVA 3DJCA 3C7NA 2YJEA 5LJWA 3GBTA 4BG9A 3AAQA 5AQNA 4H0PA 4BRDA 3AARA 1QHAA 5AFUA 3BF3A 3H46O 3GDQA 4KBOA 1GLAG 2P9NA 3RSEB 2D0OA 4XEIA 4IWVA 3A5OC 1GLEG 5AZIA 4CZLA 3ZX2A 3BEXA 3L4IA 4B1XB 4A2AA 2VWBA 3OHRA 2V52B 4YDUA 4BROA 2FSNA 2UYTA 4MLHA 3UKRA 2HOEA 3KZBA 3MMVA 5CE3A 2FSKA 4DCHA 1QQNA 2P9KA 1EQYA 5AQOA 3CHWA 4M7XA 3BP8A 3H45C 2CH5A 1U6ZA 1KXPA 1WOQA 1ZXOA 3WUHA 1MA9B 1G99A 4FWQA 1T6DA 3FLCO 2D4WA 2QWMA 2QWOA 1NMDA 2ZWHA 4H0OA 1NGEA 2CGKA 4H5TA 2QWNA 3DXKB 3VERA 5FPMA 3ZETA 2V7ZA 1ZBSA 5BRHA 4FO0A 3U4LA 3WXKA 5F1XA 1RFQA 4HTLA 2A5XA 4BRMA 4EHTA 1HJOA 4BR7A 3HI0A 1Q18A 4BQZA 4FWSA 4B1UB 3A5LC 4MLEA 4MO5A 2GTDA 3JXUA 2HMPA 3O08A 5ADXH 4FWLA 5AZJB 4H5VA 1S22A 3CI5A 3GE1A 5AQPA 3VF6A 4K25A 4JHDB 3BUZB 1T44A 3HSCA 2FXUA 1ATRA 1TUYA 5BREA 3A5NC 3ENOA 1BA0A 5AQIA 3QDKA 3R8EA 3QB0A 3SJHA 3WXJA 5ADXA 5AQGA 1NM1A 4H0XB 3UB5A 2P9KB 4HWIA 4CBUA 2H3GX 4B1WB 2IVPA 4JD2A 3O1WA 4BC3A 3VEVA 4K42A 2Q97A 5BN8A 2IIRA 3DXMA 3MN6A 4WQ5C 4BC5A 3L6QA 4JN4A 1NGGA 1DKGD 2D0PA 5KPZA 3LDNA 5EXWA 5AQTA 2A41A 2PBDA 4B1VA 3LM2A 3FFKB 3ZX0A 1Y64A 4RWTA 1JCFA 2GWJA 5AFUH 4BRHA 2HF4A 4BC2A 4WYBA 5AQVA 4H5NA 3I8BA 2QWPA 3DXKA 1S3XA 5AQHA 3VGMA 1TUUA 3DWLA 4EHUA 2QWRA 2YHXA 4H0YB 3H6EA 2ASPA 2IVNA 3VGKA 3O6WA 4WQ4A 5AQJA 4BR4A 2FSJA 4Z94A 3FZKA 5AR0A 3LL3A 1H1VA 3GOIA 3AY9A 3VETA 3H1VX 2QM1A 1NGIA 4PL8A 4FSVA 4XH4A 3CQYA 3IDHA 1MWKA 2QWLA 4MO4A 1QQMA 1P8ZA 5AZJA 3MK6A 3LDPA 3ULEB 5AQUA 1LCUA 4JHDA 4BRKA 4GNIA 4FWRA 5KQDA 2A40A 3KHYA 5B8HA 3FZMA 3VESA 1ATNA 3MN7A 3QFUA 3H1QA 3CJCA 2Q36A 4B1YB 4JD2B 3FZLA 4BRCA 1Z6RA 4BRGA 2IVOA 3A5MC 4DB3A 1NBWA 3DXMB 1SQKA 5AQXA 3LDQA 3GL1A 4O8KA 5LY3A 2GEMA 4BQLA 3HM8A 1V4SA 4FWPA 4H5RA 3SMSA 3MN5A 3P4IA 2ASMA 2YCHA 3O8MA 3CJ9A 3DAWA 3ID8A 4FWMA 3EZWA 1HX1A 4IJNA 5EVZA 1KAXA 1R59O 1Z05A 4CD1A 2YHWA 4PL7A 3A0IX 4J8FA 2E1YA 5BN9A 4FOIA 4AM6A 5AQKA 4YDUC 3ZX3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2E1ZA 4KHSA 3LZIA 1ZBFA 4QS7A 1F21A 1MU2A 3SF4D 2RE2A 5FRNA 3JYTA 3LPTA 4XH1A 2DPNA 4W5OA 3VQ7A 3SBGA 4YOUA 4CW7B 1BHLA 3ATVA 3DYAA 3CJAA 3CQXA 4IXCA 1RDWX 1L5UA 1XMQK 3L3VA 3NH1A 1SEGA 1XQSC 2DFFA 1YVNA 3AGKA 1BO5O 4CF0A 3BZCA 2E2FA 3LDLA 2NUBA 2Q3SA 3U8XA 3LDOA 1VQON 4IFVA 4CI6A 2E2NA 2AA4A 4QCLA 3PX0A 4AAZA 4IOXA 4EZ9A 5AQQA 3W0LA 5JICA 1EO1A 3AVBA 3TTCA 1KFSA 2VG5A 3OA9A 3CCMN 3N4QA 1TKDA 4EP4A 1NGBA 1NJXA 2LKBA 4CESA 4HCBA 2Z1IA 2P9SA 4E19A 1K8KB 1YVUA 4C1NK 4DV2K 3R1XA 4DTRA 3OYIA 3L2VA 4FLYA 1JCEA 1KVBA 3C6AA 1U47A 3NCIA 4IEEA 5HRSA 4DFJA 3D2FA 4BE0A 3O5BA 4CFCA 3E1YA 2VCPA 1D9DA 4V1DC 3FGUA 4PKGA 4UAEF 3BGRA 3OYAA 1DEJA 1TAUA 2HVHA 3V1RA 1XC3A 3SAFA 1VQLN 1YUWA 3M3ZA 4O0IA 1MWMA 4CZKA 4RCHA 1EX4A 2NZTA 2VWKA 1REVA 1PX9A 3FZHA 3C6HA 4A5AA 1U2VB 3NMUA 1PE4A 3G10A 4ZHRA 3W3DA 4M45A 5E41A 4K43A 5BRFA 3EYZA 4BECA 1RT4A 4CGJA 2HB5A 2X6SA 3C6UA 1W0HA 3GG4A 4F3TA 2ITMA 2RF2A 5M1PA 1ZYVA 4DUZK 3VEYA 3I8DA 4XJXA 5I9EB 4RW6A 2Q31A 3OYDA 4XIUA 1IBMK 4GVMA 2HHQA 4HE7A 2P9SB 3QNOA 1YITN 1S1UA 3V9WA 5FRMA 1WUAA 1D8YA 2WFBA 1JLFA 1B3CA 4IZ9A 2LY6A 3ZEUA 4CHNA 4DLEA 3SQ4A 3OYGA 1CXUA 5EY4A 2LSNA 4CEDA 3ZSQA 3D2FB 4FJ8A 1SKRA 3DOKA 2PY5A 2C1IA 3TTFA 4NLCA 5ELZA 3V9SA 3TARA 5AQSA 4QOZB 3QBWA 4DR1K 1LOTB 4QS8A 5EOYA 5EX5A 3CD6N 2HHUA 4ISFA 1KAZA 1TK8A 4M41A 3ASMA 4GMJB 2IOCA 4DQ8A 1UWBA 3AVHA 3THWB 4NCBA 5JENA 3FZFA 2P9LA 1VHXA 1GLBG 4DQQA 1QVFM 4CZFA 4C1NI 3M6GA 2CGJA 1RNHA 3NF7A 1S9EA 2A1RA 2N2QA 3M1FA 3M5RA 3PSIA 4BVOA 5H1SQ 1J53A 5KPRA 4J2DA 2OPPA 4EP5A 4LF4K 4EIAA 3RSEA 3K59A 3DRRA 4CJUA 3HYFA 2BDPA 4AHUA 1HNWK 1RDUA 2KYQA 3RWUA 4DFPA 3UKRB 2FBYA 3CCUN 1JLEA 5JVHL 2HHVA 5C42A 4DTNA 3AO3A 2P9UA 1S9GA 1ATSA 1K9MO 1QQOA 4L3QA 2YHYA 3JSMA 3KVGA 3WNGA 1VSKA 3VEXA 4CBXA 5F2RA 1BA1A 4H5WA 4FVUA 3KC6A 1BCMA 1EWRA 4CGGA 1JLQA 4CIEA 4CZGA 3CERA 4B8CA 4CJ3A 3ENBA 1GLJO 1Q8IA 2P9IA 3SJJA 5C10A 4E1JA 1RBUA 4BGBA 4FZXC 4KB0A 2HHWA 4BG8A 1NKBA 1C1BA 1W9HA 1YAGA 3SZ2A 2XY6A 2IC3A 1VQ8N 4X65K 1Z26A 4BDPA 3OY9A 4MDAA 4FYDA 1VQ4N 1NGDA 3QIPA 1OH7A 1TVRA 1YF5L 4JKCA 3VPZA 1HPMA 5JMVA 5LJWA 4O5BA 5AQNA 1MYNA 4H0PA 4BRDA 5T7BA 3KD1E 1FK9A 2G8UA 2O8BA 1VSIA 1NK4A 3RSEB 1WN7A 3NGYA 4DS5A 2ITGA 5C0YA 2KPYA 1WSEA 3AO5A 4CJ5A 4B1XB 2VWBA 1XRSB 5KTQA 2FSNA 2QKBA 2HOEA 3MMVA 3CMAN 1OH8A 2FSKA 3AVAA 1QQNA 1EQYA 3O3HA 2YHBA 3HOSA 4BDYA 1EP4A 1S6PA 3NFAA 2DFHA 4FLWA 4CJPA 1MA9B 3PX4A 4FWQA 4HUFA 4YOTA 4UADE 2G2KA 4H0OA 2QWOA 2WBNA 2A7TA 1DTTA 2CGKA 3HK2A 1WMTA 3DXKB 3ZSXA 3VERA 4Z0UA 4B3SK 5CR4A 2XY8A 2V7ZA 3WNFA 4FO0A 3U4LA 3CFRA 4AHSA 1IKXA 3RRHA 4HTLA 2A5XA 1KCFA 1L3VA 1HJOA 1Q18A 3RVCA 4CJKA 1IKVA 2HNDA 4KFBA 3CXCM 4MLEA 2E3FA 2GTDA 3O08A 3AVFA 1S22A 2Y1JA 3CI5A 2F96A 1T44A 3L56A 3AVIA 2NRRA 1SUQA 2W42A 3A5NC 1U4BA 3ENOA 4DV0K 1BA0A 4CJLA 5AQIA 3Q7BA 3QB0A 1I2UA 2VG7A 3WXJA 1YJNN 2KBHA 4CHZA 4HWIA 4CBUA 2IVPA 4JD2A 3O1WA 3VEVA 2Q97A 3MN6A 1JXEA 3DLLL 1XNRK 5KPZA 1S1XA 3LDNA 2GV9A 1N32K 5AQTA 5HRNA 1LWEA 2PBDA 4U67L 4DV5K 3KWGA 2RN2A 1Y64A 4CFBA 1RILA 1UOCA 4DS4A 3L2RA 2QKKA 3PO5A 3I8BA 2QWPA 3VGMA 4G9ZA 3DWLA 4FJIA 3AVNA 3H6EA 4DLGA 2P5OA 4LF5K 3VGKA 3VA0A 5AQJA 1XC9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2E1Z A;  4KHS A;  3LZI A;  1ZBF A;  4QS7 A;  1F21 A;  1MU2 A;  3SF4 D;  2RE2 A;  5FRN A;  3JYT A;  3LPT A;  4XH1 A;  2DPN A;  4W5O A;  3VQ7 A;  3SBG A;  4YOU A;  4CW7 B;  1BHL A;  3ATV A;  3DYA A;  3CJA A;  3CQX A;  4IXC A;  1RDW X;  1L5U A;  1XMQ K;  3L3V A;  3NH1 A;  1SEG A;  1XQS C;  2DFF A;  1YVN A;  3AGK A;  1BO5 O;  4CF0 A;  3BZC A;  2E2F A;  3LDL A;  2NUB A;  2Q3S A;  3U8X A;  3LDO A;  1VQO N;  4IFV A;  4CI6 A;  2E2N A;  2AA4 A;  4QCL A;  3PX0 A;  4AAZ A;  4IOX A;  4EZ9 A;  5AQQ A;  3W0L A;  5JIC A;  1EO1 A;  3AVB A;  3TTC A;  1KFS A;  2VG5 A;  3OA9 A;  3CCM N;  3N4Q A;  1TKD A;  4EP4 A;  1NGB A;  1NJX A;  2LKB A;  4CES A;  4HCB A;  2Z1I A;  2P9S A;  4E19 A;  1K8K B;  1YVU A;  4C1N K;  4DV2 K;  3R1X A;  4DTR A;  3OYI A;  3L2V A;  4FLY A;  1JCE A;  1KVB A;  3C6A A;  1U47 A;  3NCI A;  4IEE A;  5HRS A;  4DFJ A;  3D2F A;  4BE0 A;  3O5B A;  4CFC A;  3E1Y A;  2VCP A;  1D9D A;  4V1D C;  3FGU A;  4PKG A;  4UAE F;  3BGR A;  3OYA A;  1DEJ A;  1TAU A;  2HVH A;  3V1R A;  1XC3 A;  3SAF A;  1VQL N; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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