1HQOA

Crystal structure of the nitrogen regulation fragment of the yeast prion protein ure2p
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
249
structure length
227
Chain Sequence
FQEQPLEGYTLFSHRSAPNGFKVAIVLSELGFHYNTIFLDFNLGEHRAPEFVSVNPNARVPALIDHGMDNLSIWESGAILLHLVNKYYKETGNPLLWSDDLADQSQINAWLFFQTSGHAPMIGQALHFRYFHSQKIASAVERYTDEVRRVYGVVEMALAERREALVMFDYPVWLVGDKLTIADLAFVPWNNVVDRIGINIKIEFPEVYKWTKHMMRRPAVIKALRGE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords URE2 PROTEIN
publication title The crystal structure of the nitrogen regulation fragment of the yeast prion protein Ure2p.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Signaling protein
total genus 78
structure length 227
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2000-12-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1hqoA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1hqoA01
2V6OA 1XCCA 4LA1A 2TRXA 1ZGNA 3PH9A 3M3MA 1YF0A 3D4TA 3AY8A 4NPBA 3C8EA 1VF4A 2CT6A 3KJYA 1UVZA 2VL2C 4EC0A 3GYKA 3GV1A 3BJ5A 1OC9B 1VF3A 2H66A 5EVOA 2HZFA 1O7UA 2AHEA 3KP8A 4O5RA 4L8EA 3UIWA 3RDWA 1SJZA 1AIUA 1XPVA 2MYGA 1DSBA 3ISOA 5F0GA 5G1KA 4EF0A 3KGKA 3M9KA 5CRWA 1XFLA 2VIMA 3GMFA 5LCZA 3CMIA 3GURA 2C80A 2VLTA 4DSQA 2B3SA 4HUAA 4KAEA 3ZFBA 4ZL9A 5IOXA 3FR3A 3GSSA 4K0NA 6GSWA 3BCKA 3HKRA 4TRXA 3ZYWA 3TKRA 1SYXA 2VLVA 4EDYA 1T1VA 2NDOA 4KCEA 4PUAA 4J57E 3IAM2 2CX3A 3VPQA 4MJBA 3ZIVA 2OE0A 4ZL7A 1Z6NA 3EINA 1XWKA 2N5FA 2H6XA 4QL7A 3FEUA 2VO4A 2KHPA 5IQYA 3KH9A 2CQ9A 3V1WA 3ERFA 2M72A 3DKSA 3DYRA 2H01A 3EMXA 3J7Yk 1B4PA 1YDKA 2N5AA 4TVEA 1TK0B 5CREA 1XWBA 3L9SA 5BMUA 1KBNA 1NHYA 3IK7A 3DRNA 4WBJA 2DBCA 3S9FA 1B4QA 1EV4A 1K0MA 2C3NA 3CBUA 3TOUA 5HFKA 2M80A 4PNGA 6GSTA 1SK1A 1THXA 1F37A 4Q5RA 4F2IA 1A2LA 1V98A 4WKWA 2NPBA 2H1AA 2R4VA 1GTAA 3LFLA 1ON4A 5AGYA 4WXTA 1W89A 5F06A 3TJBA 4KB3A 3IC4A 2QKEA 3GA4A 3W8SA 3VWVA 1FW1A 3ED3A 4WR4A 1PL2A 2HSHA 1AW9A 4MDCA 1XXUA 5A4UA 1E6BA 1GSQA 3M0FA 4IN0A 2C3QA 2YZHA 2OBIA 1OC3A 1M99A 4ECIA 3LG6A 3KEBA 4BVYA 1OYJA 4EDZA 1X5EA 4K7OA 2WS2A 4G0KA 4MH2A 4IQAA 1ML6A 5GZZB 4ECBA 4TR1B 1HD2A 4WBRD 1QK8A 4I2TA 2H74A 2H73A 3UVHA 4XCSA 2RLIA 3DWVA 1ZL9A 3H8QA 4KH7A 3IHQA 5DQSA 3R3EA 1YKAA 2B1LA 2OKAA 4FH8A 2HSNB 3Q6OA 1AQVA 1A2JA 3MSZA 1BQ7A 1RK4A 3N5OA 3EYTA 4TW5A 4XS1A 1M2AA 4GWRA 2IMFA 2YV9A 5HR2A 3TKSC 4FIWA 3ZITA 4ID0A 2GSTA 3D21A 3VWUA 18GSA 4WETA 5HR3A 2HE3A 4MLYA 1B8XA 1HNCA 2GZYA 4MA9A 4PURA 5JWOB 3IR4A 1JZRA 1NW2A 3LEFA 5E4WA 1OVNA 3HZ8A 1EEMA 1EGRA 1TKDB 4YQVA 4KCAA 4KSOA 2DSAA 2GVPA 4PGTA 2I9HA 2YWMA 1K3OA 2LRNA 2AYTA 3QAVA 2OJLA 5FHIA 2CAIA 5HR1A 2VAFA 2YJ7A 1XOBA 1QUWA 16GSA 2R5GA 4G0IA 2IMEA 3IK9A 2AB6A 2F9SA 2IFQA 4V1Ag 1O85A 4OFNA 1PQNA 3VWWA 4MZCA 1UA5A 2K9FA 14GSA 3ERWA 3CSIA 1V57A 4GQFA 3D22A 1NSWA 8GSSA 2XHFA 2WULA 17GSA 1U3AA 5D93A 4NWYA 3GX8A 4V2NA 3DD3A 3GTUB 3GH9A 1YF1A 4K1FA 4QL9A 2LUSA 2C1YA 1AXDA 4IJ3A 2O85A 4ML6A 1OE8A 4TXVA 4HOJA 3FZAA 2CAQA 1XZOA 3CXGA 1G7EA 4V2MA 5JCUA 2C0DA 4MZWA 2IFQB 4FYCA 1AQWA 3K8NA 2CVBA 1TJDA 2AV4A 4TR0A 1XWAA 1VF1A 2RUEA 2DJ2A 2NTOA 3RAZA 5J3RA 2CX4A 3DGQA 5D9XA 3KD0A 2LTKA 4MPFA 2ES7A 2H30A 2G2QA 4TR3A 1PA3A 5ID2A 3UOMA 4DSSB 4RI6A 2V41A 4BWSA 2X8CA 2FWGA 3TCOA 1OAZA 4XHMA 5DJLA 1GLPA 1GUHA 1TXXA 2Z9SA 3QAWA 3A2XA 4Q5FA 1XOAA 1ILOA 3L9UA 2MMOA 4WR5A 1RW1A 2OE1A 4OO4A 4XRAA 5KEJA 1W4VA 4RQRA 2HNLA 1R4WA 4XS4B 3O76A 1K3LA 5ELAA 1ZYQB 3M9JA 2KLXA 3G7IA 5DCHA 3TKSA 1G6WA 3VI7A 3I9V2 1ERTA 1TRVA 2QGVA 2IIYA 4AJ8A 3DEXA 3TJJA 4LLRA 3WT1A 4PNFA 3FR6A 2LV3A 1FVKA 3L4NA 2PERA 2H19A 2EIRA 2OE3A 2G0FA 1TU7A 3L9VA 3IDVA 5G31A 2LNSA 5ECPB 1NHOA 3M1GA 2K6VA 5J9CA 3F4SA 3FZ4A 4IGJA 3F4RA 2V32A 3ZRDA 5ECQB 3QDNA 3IPZA 2GT6A 4K8MA 4KSMA 3TGZA 4OFTA 2I81A 5JCGA 1MDIA 2DC5A 2F8FA 3DMLA 2FY6A 3IC8A 2WCIA 1XWCA 1M7TA 4O32A 2LS5A 4HJMA 2D2ZA 3G7YA 3CRTA 2H0GA 3GSTA 3UARA 1BYEA 1SD9A 4EXJA 1IYHA 3RPPA 2DMLA 1TK5B 5FT3A 1OC9A 1T7PB 1R5AA 2FNOA 2WB9A 2JZTA 3HD5A 2J9HA 1WOUA 1TU8A 3P8WA 2VOCA 2UZ8A 4GQCA 2VM1A 4WF5A 3IE3A 1Z6MA 3GKNA 2OA7A 2FHEA 1TK8B 4FQUA 2ON7A 1X5DA 3UBLA 1FO5A 4DEJA 1XIYA 2JU5A 1Z9HA 3RHCA 4V1Ap 4GCIA 3EE2A 3F63A 1YJ6A 4JBBA 3UVTA 3QMXA 4ZILA 1GWCA 2H1GA 1SKWB 2VCVA 3CYNA 3EU4A 3SWLA 3HA9A 4ZBDA 4PQ1A 2L6DA 1QMVA 4TKYA 1Z7PA 4IVFA 4G10A 5ECLB 2JZRA 2YWOA 6GSVA 3KM6A 2ZNMA 4EVMA 3EURA 3UEMA 3KTBA 4GSNA 5ECSA 2VLUA 5H5QA 1A8LA 4G19A 2PVOC 3A3TA 3GH6A 5ECRB 5COHA 4AJ7A 3E0UA 11GSA 3IRAA 2L6CA 2H8LA 4IW9A 5J5NA 1K0BA 4PTSA 2IMDA 2REMA 1QGVA 5H5RA 4KGIA 4KF9A 4ZB9A 3QOUA 2V1MA 4YQUA 2DJ3A 2JADA 4POMA 1Q98A 3C7MA 5DVBA 5HQPA 2JL4A 3ZL5A 1U6TA 2HRNA 3ZTLA 2JACA 3LXTA 1MDJA 1WE0A 3P2AA 5DBQA 5A5KA 3TRXA 1PN9A 2VD1A 1Z5YE 3NZNA 3HJMA 4GSTA 5F05A 4OCFA 3KH7A 1SL2B 3MDKA 3PGTA 1FOVA 1DE2A 2B5EA 1QXHA 4E8HA 4NXIA 5EY6A 2GSRA 4ECCA 1YEPA 3GKMA 4HI7A 1XW9A 5ABRA 1X9SB 1FB0A 4LMVA 4CDOA 3VPTA 1HNAA 2ZUPA 1MDKA 3A5WA 4KDYA 5IMDA 4YAPA 1EOHA 5J4UA 3HJOA 3VURA 2C4JA 3GL5A 4H86A 3IBHA 1K0AA 4OWYA 3FZ9A 2ON5A 2HRKB 4WEYA 2VL3A 1C72A 3I43A 3D6IA 4ECJA 2A2RA 3FRCA 5G30A 2IL3A 1EP8A 1BAYA 2FWEA 2LNTA 1V58A 5G1LA 1T00A 4I8BA 3RBTA 2H75A 3KMOA 2I1UA 4LL4B 4NHZA 2B5XA 4TR1A 2VL2A 2YOIA 3BBYA 1X9WB 2HQTA 3QD9A 1EGOA 4TOPA 1X5CA 2FGXA 4F82A 3WYWA 2L57A 1GUMA 5F07A 2E2GA 2XBQA 3GRXA 2GS3A 5G5EA 1ST9A 7GSSA 3HYPA 1K0CA 3HHVA 1M2BA 1A0RP 2DJ0A 3TJGA 5ECOB 4TXOA 2L5OA 5KN3A 2XPEA 1GSDA 1ERVA 2M46A 3CRUA 12GSA 2P5RA 2HRAA 3FY7A 3FW2A 5LNKe 3J7Yb 1EOGA 1KEBA 5ECMB 5GSSA 3VK9A 1TI1A 1LJRA 5G5FA 1FVJA 4G9HA 4EL1A 3LSZA 1ZZYA 4LL1B 4AGSA 4YH2A 3H79A 3QPMA 4OFMA 3JCML 5IM9A 5C00A 1SKSB 2PUKC 4X1UA 2YPMA 4D73B 2KP1A 4L5OA 4TXOB 1PX7A 1MTCA 1R7HA 1B48A 1EP7A 2DLXA 2VCZA 3E9JB 1A2MA 1KNGA 4P3YB 3TRPA 3CTGA 5DJMA 1FB6A 5H5SA 1PGTA 1O81A 3IXRA 4MPGA 4MF5A 4L0UA 5ENUA 2PBJA 1WMJA 4JE1A 3NIVA 3FK8A 3LYPA 1BJXA 2DJKA 3GTUA 3I6AA 1VF2A 3A2VA 3C1RA 2FA8A 1GTUA 1A0FA 1GULA 1H75A 1WPIA 3EC3A 1HYUA 2WJUA 3EVIA 4NAXA 4JU5A 5IOWA 4O7HA 3Q74A 4IP1A 5D9WA 1SJ6A 2IJYA 2HZEA 4XTSA 5J9BA 2OADA 3GL3A 2KOKA 2YZUA 3TB2A 2QSIA 2E2MA 2VCTA 3QFAC 4BL7A 2H0IA 1GRXA 4FYUA 4DSSA 3TDGA 4OMVA 3GKKA 3WGXA 1PRXA 4GRFA 3US3A 2JSYA 1AAZA 4CHSA 5HR0A 2HYXA 3FYGA 1F3AA 1WP0A 1WJKA 1Y25A 1TRSA 3F6DA 2AAWA 4IHUA 4IP6A 2LQOA 4JZQA 3HJPA 3QFBC 3TJFA 4HU9A 2LSTA 1PKWA 4PQIA 2VL9A 1GSYA 2HZEB 1U87A 2X8GA 1PX6A 1B9YC 2WZ9A 4XS4A 3KXOA 2MBSA 1PSQA 5ECIB 1O8XA 4V2LA 4X0XA 13GSA 3ZMLA 1QFNA 4LMWA 1M9BA 1T8EB 4ZB6A 4MJEA 4TN8A 2HSMB 2MMAA 3LXZA 4BL7B 1LBKA 3I69A 2FD3A 2H6ZA 3GX0A 3N9JA 4Z7XA 1EZKA 2H72A 4MJCA 4EUYA 4IKHA 1JLVA 5A4WA 5AIXA 2GT5A 4NHWA 2LJAA 4POBA 1I9DA 2DIYA 2C0EA 4YAVA 4GTUA 1SD8A 5GAND 4MF7A 5IMCA 4K6XA 2DIZA 5B8BA 1T3BA 5ELGA 1JFUA 3ZREA 2B7KA 3PINA 2VCWA 3L0HA 3LORA 3GNJA 2R3XA 5A4VA 6GSSA 1JZDA 1SL1B 3F3QA 2DMMA 1M0UA 2B7JA 4ML1A 1SK0A 2JSZA 3C1SA 1DE1A 19GSA 2VCQA 4GSSA 3FZ5A 5B7CA 1ZCPA 3GN3A 4E8EA 5E59A 5HFGA 3CSHA 3M8NA 2HXKA 2LRCA 3LJRA 2YP6A 1U3IA 5DCGA 4BVXB 1BG5A 1EV9A 1LU4A 9GSSA 5FWGA 4L5LA 3FHKA 4CW9A 2WGRA 4O92A 3ZFLA 3ZVJA 5DALA 1TTZA 2DJ1A 5INYA 2GZZA 4IBPA 5J41A 1F3BA 2FLSA 2B6MA 4JRRA 1O8WA 1PMTA 2C3TA 5HFIA 3UAPA 3A2WA 5CRHA 3C73A 3WD6A 5IMVA 5DDLA 2B1KA 2PGTA 1KTEA 5KN0A 4DVCA 2GQKA 2IMKA 2C8UA 4IELA 3DXBA 3ZMKA 2VCXA 3KMNA 2JZSA 5CRDA 2IN3A 3IOSA 4XRDA 5D9TA 3NOFA 3Q18A 5DALB 2O89A 1BX9A 1X9MB 1Y6EA 1SU9A 1ZOFA 1GTIA 1J0FA 4ZXGA 4POKA 1VGLA 4OD7A 2VM2A 3W6GA 3P90A 1TP9A 1A24A 2GTUA 3APOA 4PX1A 4PXOA 2LJKA 1JHBA 3D5JA 3GHAA 2P0GA 4MMMA 4IS0A 3EWLA 2MMNA 3KIJA 2K8VA 5DAKA 4FO5A 1N8JA 4N11A 4OO5A 2YN1A 1XVWA 4G2EA 1ABAA 1TW9A 4K7NA 4KUNA 2F51A 3APSA 1EWXA 1SKRB 1ERWA 3O6TA 3DIEA 2C0GA 2YANA 2X64A 1CQHA 1OE7A 1GSSA 1XBSA 5DQYA 5ECHB 1THOA 5GSTA 2HLSA 2LQQA 2J23A 4N10A 3HZ4A 3ZZXA 4KDXA 2PN8A 2BJXA 3QCPA 5DAKB 3LGCA 4ULXA 3LQ7A 2P31A 4K2DA 4J2FA 4HU7A 2VUPA 2BMXA 4MK3A 3TJKA 1G7OA 1Q4JA 3OR5A 1SL0B 2E7PA 3MWHA 2P5QA 1TRWA 3PPUA 1E2YA 1S3DA 1AUCA 5AIVA 4Q5NA 6GSUA 3ME7A 1XW6A 5B6MA 3PR8A 4EE0A 4ACSA 3BCIA 4POLA 4QQ7A 2O8VB 1G6YA 5IMFA 2HRKA 3VWXA 2C0FA 4MZBA 4Q5QA 2H70A 2BTOT 2LRTA 3WT2A 2H1BA 3CTFA 4ILFA 4KNDA 4HJ2A 1DBYA 1T4ZA 1S3AA 3TKPA 3L78A 1WWJA 4L0WA 2L59A 4ZL8A 5IIZA 3ERGA 3GKXA 1QQ2A 5IPGA 3FKFA 1OKDA 1Z3EA 1IYIA 1V40A 4TR4A 2WDUA 1U88A 2EIQA 2AJQB 1M2DA 3HCZA 5AN1A 3ME8A 5D73A 2CV4A 4HS1A 4HZ4A 2TIRA 1HQOA 4ZIJA 4RQXA 10GSA 5IPHA 1BEDA 3IA1A 1J9BA 2FUG2 3GIXA 4K7IA 3F0IA 2YWNA 1SJIA 1OC8A 3APQA 2LKUA 1YQ1A 1A8YA 2YWIA 1WRYA 2KP2A 22GSA 3D0ZA 2GLRA 4NMUA 1GL8A 2B5YA 5CRGA 4KE3A 2RIIA 1J08A 1M9AA 3HVSA 4KA0A 4PQHA 3TOTA 4ZBBA 3VI5A 1GSUA 1SYRA 4D73A 4K9ZA 1AQXA 4ZBAA 4N30A 4GXZA 4RI7A 2RM5A 1A23A 2HI7A 2K18A 3WGEA 1FHEA 1UC7A 3WGDA 2F3MA 4I5QA 2GQLA 3QAGA 2I3YA 5CYYA 1S3CA 2YV7A 3HY2A 2TRCP 5F8BA 1R26A 4I2UA 1SENA 5IO2A 4IJIA 2CVKA 2N5BA 4YQMA 3G7JA 2ZCTA 3HVXA 3LYKA 1ZMAA 3H1NA 2R6KA 2OBKA 1TDIA 2YNXA 2L5LA 1GTBA 1B9XC 1H4OA 4HQSA 4FYBA 3E3EA 3ZIJA 3H4KA 4F03A 3TUEA 4MP4A 5L71A 4F9ZA 3G9BA 3DVXA 1EEJA 3IV4A 2EIOA 4EKZA 2VD0A 1GNEA 3BOAA 4KX4A 1PL1A 4BA7A 2R37A 3HDCA 2WRTA 3KZQA 1YKCA 5JCWA 1UN2A 5G2ZA 2L4CA 2OACA 4BVYB 3O3TA 4EO3A 4IQ1A 5B8AA 4DSRA 3QR6A 2NBSA 4F0CA 3F6FA 3D4MA 4G0LA 2AUVA 2L4QA 1X0RA 4K0GA 5GAPD 1K0OA 2MMZA 1O73A 4BPYA 4HDEA 2CA8A 3BD2A 2FWFA 2GGTA 4HQZA 2XPDA 4MABA 2FWHA 4F0BA 2GSQA 3SBCA 1GLQA 2H0HA 5CAXA 5ECKB 3FR9A 6GSYA 2LJRA 2X8HA 4ZB8A 4NV5A 1USBA 2GQMA 1ERUA 3ZVJD 1NM3A 1Z7RA 2PVQA 5CP1A 1OKTA 1GSFA 3TKQA 4N0VA 2HRFA 5EL8A 3R2QA 2HSMA 2H76A 5CNWA 5JWRB 4MCUA 3RPNA 2CZ3A 1MD3A 1ACVA 3TKSE 5EPFA 2LEGA 3UMAA 4AF2A 1K0NA 2V2GA 2O87A 2XBIA 4BWQA 4XIHA 4USSA 2YCDA 2PPTA 5LD0A 2PU9C 1GP1A 4NV2A 2IPAA 2RUFA 3Q19A 1CQGA 3VLNA 1YZXA 3UBKA 2MBTA 3H93A 4XS6A 2CZ2A 5D96A 2R2JA 3LWAA 1GNWA 3GFKA 4ISDA 3ZLPA 5AISA 2FCHA 1T4YA 4X43A 1AC1A 5D9VA 3MNGA 1YY7A 1VRSD 1FAAA 1URMA 5IMZA 1XW5A 1YEXA 3GUSA 2F8AA 5B6NA 4JR6A 3U5RE 1I5GA 3F3RA 2GZPA 4WF4A 3UJ1A 2PWJA 1XVQA 3DVWA 3RHBA 1G0TA 4BVXA 2PMTA 1K3YA 3W8JA 3F8UA 1F6MC 1RQMA 2O7KA 2CVDA 4I97A 1V2AA 1WIKA 2XC2A 1DUGA 3HVVA 4OCEA 4KW6A 5D8IA 5IMAA 2HT9A 4MH3A 4KDUA 2KUCA 2A4VA 3TRQA 4JEDA 2NVLA 2I4AA 5ECNB 5IO0A 2EC4A 2GSSA 4HEA2 5KN1A 2K8SA 3UL3A 2RM6A 4AJ6A 3EU3A 20GSA 1FG4A 1N2AA 3F4TA 5ID2B 2DJJA 3KP9A 4I6XA 4MJAA 3CSJA 1JZWA 1HNBA 1PKZA 3KTLA 1PD21 1F9MA 1O6JA 2H1DA 5CO3A 1TI3A 6GSXA 5JWQB 3C71A 1MEKA 2ALBA 2A2SA 2IWTA 3MAKA 1MD4A 2IMIA 4N0ZA 2HFDA 2V6KA 4GF0A 3HXSA 1ZYEA 2YJHA 3EMPA 3U6VA 4JR4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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