1HSXA

Lysozyme grown at basic ph and its low humidity variant
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Structures of orthorhombic lysozyme grown at basic pH and its low-humidity variant.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 43
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1hsxA00
4UWNA 2MEDA 5HMJA 1JTTL 2B5ZA 4LYMA 3TXEA 2LZ2A 4PPOA 5C6IA 2C8OA 1UICA 1KXXA 1A4VA 1LJIA 1B5VA 1YIKA 2F30A 4J1BA 3HBEX 5ILCA 5A3EA 1GFHA 4NHQA 2MECA 1LZ5A 4H8XA 4NGJA 4LFXA 4NHIA 1LTMA 4G9SA 1GEZA 5C6LA 2BQHA 1GHLA 1F0WA 4N8ZA 1IWYA 1LZ4A 3CQLA 1NHEA 1HFXA 3BKVA 4HJZA 4HP0A 4WM3A 1IOQA 4B49A 5LYMA 1JKAA 4AXTA 2BQOA 4I8SA 1TEWA 3WVYA 4GLAA 1GF9A 154LA 3P64A 2LHMA 5FDJA 2ZIKA 2DQJY 2DQCY 1GBSA 1UIHA 4LFPA 4CFOA 5KXTA 4CGEA 5B1GA 1TAYA 4Z41A 5DLAA 2BQBA 1BGIA 4N0JA 4WOAA 4ET9A 2BLYA 1UA6Y 4NIJA 2BQIA 4DD2A 4U3XB 1GFVA 1UCOA 4KL7A 3B0KA 1IOSA 4PGJB 1YKXX 4XJHA 7LYZA 4DD3A 4ZIXA 1XSFA 1BB5A 4WLDA 1XGUC 4WM5A 1VDSA 1D0MA 1WTMA 4WG7A 4H9AA 1OUJA 4NHPA 4B1AA 3D9AC 3AW7A 3CSRA 4HV1A 1C10A 2HEEA 1GFTA 3WPJA 1XEKA 1KXWA 4QEQA 2HUBA 1BQLY 1RCMA 1EL1A 3W6FA 5M1YA 2DQFC 5KXPA 1MLCE 6LYZA 1E8LA 6LYTA 1F6RA 3WUAA 1GWDA 2HEFA 1GD6A 2F4AA 1JSFA 4TX7A 5APCA 4HV2A 4BS7A 3OJPA 3A93A 1GB6A 2XBRA 1IY4A 4XJBA 2Z12A 1BWIA 3TXHA 1JHLA 1REZA 3AB6A 2G4PA 3CSZA 1OUEA 5F9UA 1GFKA 4MCKA 3WPLA 3ZEKA 1G7HC 1LKSA 4D9ZA 2A7DA 3TMVA 4YENA 1P2CC 4H9BA 2H9KA 4YF2A 1VATA 2BPUA 3W6DA 3IJVA 4NGOA 2ZILA 3P68A 1GBYA 1IC7Y 1WQRA 1QTKA 3WYHA 3AZ6A 3HBHA 1GBXA 2A7FA 1FLQA 1NBYC 2ZIJA 4GCFA 3QNGA 4LYTA 1LZGA 2W1XA 1I56A 1FKQA 4HPEA 3TXDA 2I26L 1IWZA 3GXRA 1HNLA 1VDQA 5I54A 1OUBA 4GLVA 2W1MA 2DQEY 2BLXA 3A3QA 1GEVA 1JEFA 1NWGA 2Z2FA 3ZVQA 5I4XA 4H9EA 1D6PA 1LSBA 1GE1A 1HERA 4G49A 4BAPA 1QIOA 2Z18A 1HSWA 1D0LA 1FDLY 2MEGA 2MEFA 2BQKA 1BWJA 1GB2A 3GXKA 4TSCA 3WU9A 1GAYA 2Q0MX 4ET8A 1LHLA 3FE0A 4H92A 3LHMA 1WVUA 1GPQC 1GBOA 1NQIA 1XEJA 1KXYA 2XJWA 4XN6A 2YBJA 2AUBA 1CJ8A 3A92A 1LSEA 2I6ZA 4XJIA 4WO9A 1HEQA 2HEDA 1JWRA 3LN2A 3A3RX 1HMKA 2DKVA 1YAQA 4J7VA 1UIBA 1SLYA 1B7SA 3TMUA 1V7SA 2HECA 3TXBA 1HF4A 2HTXA 4II8A 1WQPA 2D4JA 4L41A 4NG1A 1GE2A 3WU8A 2ZYCA 3B72A 4O34A 1IP5A 1XGPC 4DD0A 2Z39A 3WMKA 2LYOA 4ZEEA 1LAAA 5KKJA 1VAUA 1I1ZA 1YILA 5I5QA 1LHIA 1O23A 1LMCA 1IX0A 1FN5A 1LMQA 3RNXA 5HQ1A 4OWAA 4QGZA 4H1PA 1LMPA 5F14A 1HFZA 4QDNA 1MELL 1GDWA 1I20A 4B0DA 5KJ9A 1LSPA 1JIYA 1C7PA 3F6ZA 1OUFA 1OUCA 1GFRA 194LA 3LZ2A 4LYBA 2BQNA 4NHSA 2BQGA 4DT3A 3ULRA 1B7OA 1LCNA 4NFVA 5T3FA 1YAPA 1YKYX 2C8PA 4M6DA 5KXYA 3QY4A 2G4NA 4OW1A 5APDA 4NHTA 4ETCA 4WL7A 1HEPA 1SQ2L 1OQMA 1AT6A 4WM6A 1BWHA 2BQDA 4HPIA 1YANA 1OUIA 1LZAA 1IP1A 4PJ2C 1FLWA 1GF8A 1DI5A 5KXNA 1A2YC 1YL1X 2RSCA 2I25L 1DI3A 2CWIA 2YBIA 3EO5A 4YEOA 4WL6A 1IWVA 3MGWA 3A94A 3RZ4A 2HEBA 2FBDA 1REMA 4MSTA 2Z37A 5HLLA 1BHZA 1IWWA 4GN3A 1B5XA 5C6JA 5KXKA 1VDPA 5E9RA 4GCEA 2CGIA 3W6AA 5B05A 5IDDA 1HEOA 1LZEA 1JKBA 4TUNA 4A7DA 1IWUA 4YEMA 3A8ZA 4DYGA 2DBTA 1JKDA 3WPKA 1UBZA 4PRUA 2DQGY 3TMXA 5L3IA 4PHIA 1LMAA 4H93A 4YOPA 3RU5A 1RFPA 4LGKA 4DD1A 3G3AB 1LJFA 4OWEA 4XJGA 4E3UA 1GBWA 1GE0A 1QUSA 1BVKC 1LJJA 2FYCA 1CKGA 1CKCA 5KXZA 1GB9A 1LZNA 4NWEA 1HEMA 2IFFY 4ZFPA 4R6CA 207LA 3J4GA 1PZYA 3WXUA 4BAFA 1D0KA 1GBZA 2XBSA 3W3EA 5FCPA 2YBLA 4GCDA 1B0DA 1DZBX 1HELA 3AZ7A 4KT3A 1GB0A 1IP2A 5JENB 2MEBA 3CT0A 4RLNA 132LA 3AZ5A 5FELA 2VB1A 1CKFA 1NKHA 1RE2A 2D6BA 153LA 3D3DA 1FBIX 3A96A 1LJGA 1GFUA 2XTHA 4N5RA 5HNCA 3QE8A 1PS5A 1B7MA 1GXXA 4H9FA 4IASA 1VEDA 4I0CA 1LSAA 1GFJA 5KXOA 2PC2A 1GB8A 3AGIA 5D5FA 2D91A 4Z46A 4ETBA 1UIDA 4NGIA 2DQHY 1GF4A 1FLYA 1Z55A 4H9CA 1JJ0A 5HMVA 5AMYA 2H9JA 4XADA 1NBZC 2F4GA 1ZV5L 9LYZA 3AW6A 3LYZA 1FLUA 1KIQC 1IP6A 2ZYPA 4XENA 4XYYA 1W08A 2YBNA 2H5ZA 193LA 2HU1A 3IJUA 4NGWA 5ILFA 1HC0A 2HU3A 3A6CY 1J1PY 208LA 1INUA 4FJRA 3RT5X 1G7MC 1LZTA 1ALCA 4WLXA 4G4CA 5I4YA 1TDYA 3N9AA 1GDXA 1BB7A 2BAAA 4NSIA 5HNLA 2WARA 1CJ7A 3TXJA 3N9EA 4QY9A 3AZ4A 3KAMA 4NGZA 3TXGA 1IOCA 1BB6A 1LSFA 3WU7A 5LVGA 1NDGC 4N1EI 5KKIA 4DDCA 5LVKA 4TTDA 4ETEA 2BQFA 3A6BY 1B7NA 1B2KA 1IR9A 1BB3A 1D6QA 1LZCA 1LOZA 1OUHA 1UUZC 3LZTA 4NWHA 4XJFA 3CT5A 1LZ9A 1GF0A 1V7TA 5EBHA 3CT1A 1JISA 2ZNXY 4EOFA 2G4QA 4WO6A 3HBDA 1G7JC 4LZTA 1AM7A 1IVMA 2YBHA 4GN5C 5DL9A 4LT3A 5LAGA 4WM2A 1KIPC 1C46A 4OWHA 5FSTA 4P2EA 4WM4A 8LYZA 1XGRC 3ATOA 2BQJA 1LHHA 4NY5A 4R0FA 1T3PA 2FYDA 4H9HA 2MEEA 3T36A 1YAMA 1J1OY 1XEIA 5F81A 1LJKA 4B4IA 1LJ3A 4HTKA 1XGTC 4H90A 4WLYA 5K7OA 2LYMA 1BVXA 1LHKA 1LZSA 4OWCA 133LA 1LSCA 1LZYA 2DQAA 2Z19A 4HJYA 4W94A 5I53A 4C5FA 5J7CA 3W6BA 1J1XY 1OUAA 4M4OA 5DN5A 1EQEA 1T6VL 2YDGA 1GAZA 1UIFA 1WQOA 2Z38A 3N9CA 4WM1A 1LHJA 1GFAA 1LZBA 1B5UA 4NGVA 3B0IA 4ETAA 5I4WA 2F2NA 2GV0A 3AJNA 3K3TA 1HEWA 2YSSC 2MEHA 4DDBA 2Z2EA 1G7LC 1TBYA 5L9JA 1JSEA 1UIEA 5KXSA 5A3ZA 3W6CA 4TWSA 1OUDA 1OP9B 3ZVQB 3A95A 4J1AA 3FI7A 4Z3MA 1LKRA 4IATA 135LA 4GCBA 1IOTA 5B59A 3EBAB 1B5YA 1DQJC 5IELA 1NDMC 3EMSA 1JJ3A 2EQLA 4LT0A 1GE3A 3AYQA 4N1CC 4J0LA 4DC4A 1GFEA 4NGLA 4Z98A 1FKVA 1GF3A 4G4HA 4NSHA 1LMTA 4HTQA 4CJ2A 1CJ9A 4DWXA 1JPOA 3P65A 1NF5A 1LZ6A 1H6MA 3LYOA 3P4ZA 4RDSA 4GN4A 4X3BA 1IIZA 4ANRA 4B4EA 4AGAA 4DD9A 2ZQ3A 4H8YA 2CJLA 5II3A 4RW1A 1LHMA 5KXMA 3A90A 3ATNA 5KY1A 4C3WA 1B5ZA 5IHGA 1LSMA 1LYOA 1JJ1A 1QDTA 4KXIA 3WH1A 2EIZC 1CKHA 1IWTA 1IEEA 5KXWA 5LXWA 1IC4Y 1YQVY 1IO5A 3BKHA 4DD7A 1B7PA 2W1YA 1LJNA 5B1FA 5L3HA 3WUNA 1G7IC 1YROA 1CNSA 4WG1A 1LSYA 5APEA 1QQYA 5LAFA 4LT1A 5LINA 1GF7A 3RW8A 1KIRC 2N5ZA 1B9OA 1W6ZA 3E3DA 1HSXA 3A91A 4ETDA 1IR8A 1C43A 1GF5A 1XFPL 1LSDA 2CDSA 3SP3A 5KXRA 4H8ZA 1GB7A 3WW6A 1IP4A 4G4BA 4HSFA 1DPWA 1IR7A 4UWVA 4WLTA 1LZ8A 4OWBA 5LVIA 4CFPA 1F6SA 1REYA 1UACY 4NGKA 2EPEA 5LIOA 5KXXA 4LT2A 1XGQC 1UIGA 3IWRA 1N4FA 1WVVA 2Y8PA 5F9XA 5LA8A 4NSGA 1WQNA 1LJEA 1GE4A 1F10A 1JTOL 4BADA 3M18B 4RW2A 5APFA 1RJCB 1CKDA 3CSQA 1B7LA 2BQMA 3B6LA 1WQMA 1C45A 4HTNA 1NMMA 3LYTA 1CJ6A 4GCCA 1B5WA 4NGYA 5DM9A 1C08C 2HEAA 5D5CA 3WVXA 2X0AA 3G3BB 2ZQ4A 1BB4A 1VDTA 1UC0A 5B07A 4HJVA 1D9UA 1GB3A 4XJDA 2DQDY 2FBBA 5F16A 1ZVHL 2BQCA 2BQEA 5LYTA 1LYSA 1RI8B 134LA 1TCYA 2MEAA 2YVBA 3AGGG 3TXFA 1B7RA 1QUTA 1JITA 3OK0A 3WUMA 5LA5A 1LSNA 1LSGA 3LYMA 4WMGA 4H91A 1WTNA 4CHXA 4MR1A 3WXTA 3A67Y 3CB7A 1LZDA 1LZ1A 4LYOA 1HHLA 3VWOA 1IWXA 1REXA 2W1LA 5LVHA 2DQIY 1LSZA 1ZVYB 4KPMA 1OUGA 1DKJA 4LYZA 5DN4A 3WW5A 3TXKA 5LVJA 4DDAA 1AKIA 1DI4A 1GXV2 5B06A 1HENA 4W96A 3WULA 1HFYA 2LZTA 1YAOA 3TXIA 1IY3A 4H9IA 4OOOA 1QDRA 4YM8A 1H87A 3P66A 3TMWA 1GF6A 2LYZA 4NG8A 4EMNA 1YL0X 3HFMY 1LPIA 1QSWA 4UWUA 2MEIA 3W6EA 1GFGA 1B7QA 1LYYA 3B0OA 4PRQA 5FEKA 1JKCA 1DKKA 2NWDX 5LYZA 5FHWA 3AGHA 5E4PA 3A34A 2ZNWY 2BQAA 1EQ4A 1AZFA 4N9RA 4NSJA 1QTEA 2IHLA 3EXDA 4TSBA 1AT5A 1QSAA 1YKZX 1DXJA 2D4KA 2EKSC 4IJ4A 1VFBC 1LJ4A 1IC5Y 1LZRA 3WL2A 4B4JA 1IORA 1ZMYL 1JUGA 1UIAA 1WQQA 4RLMA 1DPXA 4ML7A 1LJHA 4OOTA 1HMLA 1GB5A 2BQLA 1IP3A 1IP7A 3T6UA 2ZWBA 4LYCA 1JTPL 2D4IA 5KXLA 1LMNA 2YBMA 1EQ5A 3J6KA 4FDYA 1LMOA 3M3UA 1LYZA 4NEBA 4H94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PPOA 1KXXA 183LA 4YX7C 3C7ZA 5ILCA 4NGJA 4G9SA 1GEZA 126LA 1DYCA 1GHLA 2B73A 4B49A 235LA 3WVYA 198LA 5FDJA 2DQCY 1GBSA 1UIHA 111LA 1L32A 2BQBA 4NIJA 2BQIA 3HWLA 4I7MA 4U3XB 130LA 1GFVA 4KL7A 152LA 1L29A 1XGUC 4WM5A 1WTMA 1OUJA 1KXWA 4LDEA 1RCMA 1EL1A 5M1YA 1GWDA 1JSFA 4TX7A 5APCA 3OJPA 1NHBA 2B6XA 3A93A 3TXHA 1L26A 3CSZA 1GFKA 4MCKA 1G7HC 1QT8A 1C6BA 1G0GA 3DMZA 1VATA 1L46A 3C83A 1WQRA 1QTKA 1LWGA 2ZIJA 1NBYC 3QNGA 2W1XA 1I56A 1FKQA 3GXRA 1VDQA 2W1MA 1HERA 4BAPA 1HSWA 2MEGA 4DQJA 3GXKA 1GB2A 1GAYA 1SWZA 1LHLA 125LA 2AUBA 1LSEA 1L74A 3A3RX 2DKVA 1YAQA 4J7VA 1UIBA 2HECA 1HF4A 4S0WA 3WU8A 1GE2A 1XGPC 2Z39A 3WMKA 2LYOA 1T8GA 3V2WA 4ZEEA 5KKJA 5I5QA 239LA 1FN5A 5HQ1A 4QDNA 1JIYA 3LZ2A 259LA 1B7OA 1LCNA 4M6DA 3QY4A 3F9LA 4OW1A 1YANA 1JTMA 1LZAA 4PJ2C 1FLWA 3C8QA 3FA0A 5LZMA 4I7PA 2CWIA 1IWVA 3A94A 2Z37A 2B6TA 2HUMA 1P36A 156LA 1PQDA 2DBTA 2RBNA 5L3IA 3TMXA 3RU5A 1SSYA 201LA 4E3UA 1GBWA 1PQOA 1QUSA 1G06A 1GB9A 123LA 1LZNA 2IFFY 1L69A 207LA 4ARMA 1B0DA 1CUPA 1IP2A 132LA 1OV5A 1T8FA 3HTFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UWN A;  2MED A;  5HMJ A;  1JTT L;  2B5Z A;  4LYM A;  3TXE A;  2LZ2 A;  4PPO A;  5C6I A;  2C8O A;  1UIC A;  1KXX A;  1A4V A;  1LJI A;  1B5V A;  1YIK A;  2F30 A;  4J1B A;  3HBE X;  5ILC A;  5A3E A;  1GFH A;  4NHQ A;  2MEC A;  1LZ5 A;  4H8X A;  4NGJ A;  4LFX A;  4NHI A;  1LTM A;  4G9S A;  1GEZ A;  5C6L A;  2BQH A;  1GHL A;  1F0W A;  4N8Z A;  1IWY A;  1LZ4 A;  3CQL A;  1NHE A;  1HFX A;  3BKV A;  4HJZ A;  4HP0 A;  4WM3 A;  1IOQ A;  4B49 A;  5LYM A;  1JKA A;  4AXT A;  2BQO A;  4I8S A;  1TEW A;  3WVY A;  4GLA A;  1GF9 A;  154L A;  3P64 A;  2LHM A;  5FDJ A;  2ZIK A;  2DQJ Y;  2DQC Y;  1GBS A;  1UIH A;  4LFP A;  4CFO A;  5KXT A;  4CGE A;  5B1G A;  1TAY A;  4Z41 A;  5DLA A;  2BQB A;  1BGI A;  4N0J A;  4WOA A;  4ET9 A;  2BLY A;  1UA6 Y;  4NIJ A;  2BQI A;  4DD2 A;  4U3X B;  1GFV A;  1UCO A;  4KL7 A;  3B0K A;  1IOS A;  4PGJ B;  1YKX X;  4XJH A;  7LYZ A;  4DD3 A;  4ZIX A;  1XSF A;  1BB5 A;  4WLD A;  1XGU C;  4WM5 A;  1VDS A;  1D0M A;  1WTM A;  4WG7 A;  4H9A A;  1OUJ A;  4NHP A;  4B1A A;  3D9A C;  3AW7 A; 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 1YQV Y;  1IO5 A;  3BKH A;  4DD7 A;  1B7P A;  2W1Y A;  1LJN A;  5B1F A;  5L3H A;  3WUN A;  1G7I C;  1YRO A;  1CNS A;  4WG1 A;  1LSY A;  5APE A;  1QQY A;  5LAF A;  4LT1 A;  5LIN A;  1GF7 A;  3RW8 A;  1KIR C;  2N5Z A;  1B9O A;  1W6Z A;  3E3D A;  1HSX A;  3A91 A;  4ETD A;  1IR8 A;  1C43 A;  1GF5 A;  1XFP L;  1LSD A;  2CDS A;  3SP3 A;  5KXR A;  4H8Z A;  1GB7 A;  3WW6 A;  1IP4 A;  4G4B A;  4HSF A;  1DPW A;  1IR7 A;  4UWV A;  4WLT A;  1LZ8 A;  4OWB A;  5LVI A;  4CFP A;  1F6S A;  1REY A;  1UAC Y;  4NGK A;  2EPE A;  5LIO A;  5KXX A;  4LT2 A;  1XGQ C;  1UIG A;  3IWR A;  1N4F A;  1WVV A;  2Y8P A;  5F9X A;  5LA8 A;  4NSG A;  1WQN A;  1LJE A;  1GE4 A;  1F10 A;  1JTO L;  4BAD A;  3M18 B;  4RW2 A;  5APF A;  1RJC B;  1CKD A;  3CSQ A;  1B7L A;  2BQM A;  3B6L A;  1WQM A;  1C45 A;  4HTN A;  1NMM A;  3LYT A;  1CJ6 A;  4GCC A;  1B5W A;  4NGY A;  5DM9 A;  1C08 C;  2HEA A;  5D5C A;  3WVX A;  2X0A A;  3G3B B;  2ZQ4 A;  1BB4 A;  1VDT A;  1UC0 A;  5B07 A;  4HJV A;  1D9U A;  1GB3 A;  4XJD A;  2DQD Y;  2FBB A;  5F16 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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