1I6AA

Crystal structure of the oxidized form of oxyr
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHCLRDQAMGFCFEAGADEDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 62
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA02
4PP0A 4GWOA 2ZNUA 2P2AA 3O2AA 2UVGA 3SDFA 4QSEA 3CVGA 3MVWA 2YLNA 2XXUA 3V5AA 1SD3A 1UTHB 4ECFA 3RT6B 4H8IA 5I2NB 4GRKA 3DP8A 3IAZA 2V93A 4PETA 4XTCQ 4KI0E 1A99A 1Y9UA 3A09A 2IEEA 1NNFA 4NEDA 2F6PA 4ESWA 1IITA 2OWTA 4R6HA 3RNNA 3TQLA 4NF5A 4KCCA 3RTWB 3PGFA 4C1UA 4H6DA 2RC8A 4X1DA 2HAUA 4BDLA 3CIJA 1M5CA 3K2DA 5BWJA 2HEUA 4H8JA 3B6QA 4QFLA 3QUFA 2G29A 4R2BA 4OESA 2Z23A 3KZGA 1Y1ZA 4OENA 3IOUA 1MXZA 4ZEIA 3PV0E 1PDAA 2CMOA 1WODA 5I2KB 3T9HB 2XD2A 1B7HA 1SYIA 4G68A 3JZJA 2VOZA 3BFTA 3K4UA 4WEDA 2AL5A 1B7ZA 2BJJX 3HPIA 1I6BA 4U1ZA 4ZZAA 4IO6A 3K6UA 1FQFA 3QUJA 4AQ4A 2DXYA 3IORA 3VFJA 1B5JA 4IO7A 2DE2A 4FE8A 4MF3A 3MVZA 3Q25A 4JB7A 2AL4A 5AE4A 2VGQA 4C0RA 4DLDA 1MQHA 1NNPA 3PMVA 4DXBA 5JEIA 4LP2B 1B3LA 1HSEA 4AB5A 1LGBC 1B4HA 4TLLB 4XKRA 4U21A 5EHSA 4QFPA 3SEXA 4GQOA 3T96B 2QPQA 1SW5A 5B70A 3K0VA 1ATGA 5DVFA 1O64A 3TTNA 4NWCA 4LVQA 1FW0A 5EYFA 4F3GA 3IO4A 1B6HA 1SW2A 1OVBA 4FATA 4F3PA 4YMBA 1B9JA 4K3FA 1QW0A 1FTOA 1B3FA 3MZBA 5I56A 3PPRA 2QS3A 1QKAA 1ZU0A 3IOTA 2Q9TA 1AH5A 2F8DA 4OEUA 4DCYA 1MRPA 3K1PA 2Q2AA 5EHMA 1Z7ME 2PX1A 4MLVA 3TTRA 2ZMBA 1XVYA 2XXQA 3UA8A 1B4ZA 1JEVA 5FTHA 1II5A 4GD5A 2O69A 4F3BA 2XXRA 2QS4A 1JVYA 3RUMA 3R26A 2DWHA 2FNCA 1SW4A 3IB2A 3V8XB 4P0IA 3FIRA 4KD5A 3QSLA 4U4XA 4RA1A 1A8EA 1GVCA 3C32A 4R73A 2ZYKA 2ZYOA 3T66A 4U1OA 4KFQA 3SKPA 1IQ7A 1PB9A 1QVSA 1I6QA 2I4BA 5AA4B 4F22A 2F36A 5KZTA 5AA2B 4H0WA 3G7WA 2HQ0A 1POTA 2O84X 3FD3A 3FXRA 2OJTA 3OENA 2DE3A 2QMXA 2OZZA 5K2XA 3SESA 3PD8A 4F2OA 4Z0IA 3PPPA 5L8DA 3IK6B 4IO3A 4GXAA 4THIA 1S50A 1XOCA 2ESNA 3MZ1A 1Q35A 2GH9A 3KSXA 4OWDA 1MM7A 2D21A 3OEKA 3UORA 5ELVA 1B1XA 2UVHA 1JW1A 4QSDA 3H4ZA 4Q0CA 1B3HA 3KSJA 4C1TA 2V3TA 3D4CA 2B3BA 3TAJA 1NH8A 4ND9A 3Q27A 4YB6A 1VR5A 3OO9A 2HAVA 4I9DA 3JYRA 3ODBA 3EF7A 1BIYA 1EZOA 4NF4B 4H5GA 1P1QA 3C36A 3U8QA 4HCYA 4AB6A 4XKNA 3IOWA 3EN3A 1OMPA 3RPWA 4F29A 3K00A 3EQ1A 2W7YA 2B65A 3CI8A 1URSA 1D9YA 2H99A 1B46A 3MJNA 4QFOA 1NL5A 4PQJA 3N26A 4F1VA 3FXQA 4R75A 3PUYE 4IO2A 4X9TA 2F35A 4O3CA 1YTVA 1DSNA 1IZ1A 3KJ7A 5A5XB 4QSCA 1QUJA 3MZ9A 1BLFA 4ELQA 2F78A 4GL8A 3UN6A 5DVJA 4XXUA 2PT1A 3O6GA 5JTYA 4IGTA 4KR5A 5I58B 2D3IA 3G3IA 5TPAB 3KGCA 4YAHX 4RPOA 3B6TA 2YPNA 2X26A 4HTGA 3T22A 2DP8A 3IO6A 4OFOA 3OSQA 2O6AA 1AMFA 4XKQA 1QULA 2XXXA 4Z7EA 3ZSFA 4DXUA 3UIFA 3TELA 3FVNA 3FV2A 3T9XB 1XHYA 4YKKA 2DQVA 3FVOA 3MW0A 3EPEA 1SDXA 3CFXA 1M5FA 4N13A 5AA3A 3K6XA 3RQTA 1ANFA 5CMCA 3M3FA 2ZYNA 2F7AA 3B6WA 3VXCA 3T9UA 4EQ7A 1D4NA 4FECA 4QFKA 4BLAA 3RLFE 4LZ7A 1TXFA 2ONSA 4I62A 5HBCA 1FQAA 1O63A 2ONKE 3EHTA 2FYIA 5H8HB 1SYHA 3K1MA 4JXIA 5DT6A 1GR2A 5L9MA 1WDNA 1I6AA 2QSXA 2V3UA 3C33A 5FHMA 1PBPA 4U4SA 4OETA 1L5TA 2H25A 4F39A 5H8FB 2OK2A 1N84A 2HZKA 5H8NA 3G3GA 4YZZA 4G2ZA 4G77A 3PMWA 3DP4A 4JSOA 3W9WA 1TWYA 4LZ5A 1VSOA 3PUVE 4EDPA 3SEWA 3FVGA 3O97A 1LFHA 1FQBA 3L6HA 5ISUA 2XXIA 4RY1A 5CMKA 4LUBA 3KOSA 1CB6A 2WKYA 1IXCA 1FQCA 2Z22A 4FJPA 4UA8A 5FHOA 3CRBA 3VVEA 3SEUA 2DWIA 2RCAA 3THIA 4NWDA 5IKBA 1T0KA 3MP6A 3FGSA 3GBBA 3OELA 4X48A 2H9BA 1IIWA 4U22A 1LBBA 3VVDA 4H1XA 4ISUA 4ZECA 1NH7A 1B1HA 1UIUA 4IO4A 3Q28A 2FA7A 3VLWA 2ANJA 1Y4CA 4MBPA 4FORA 4NF5B 2XX8A 2X7PA 1OQHA 1S9TA 4KYDA 3N6UA 3S9MC 1FTKA 2PVUA 3QXMA 2P1SA 1AIVA 3C35A 4NF8A 2I0BA 3KJTA 3TDJA 4DZ1A 1JEUA 3P7IA 3T9VA 1TT1A 2F7CA 1OQGA 3E4RA 2DOJA 1DTZA 1B52A 1PBQA 2F34A 1XT8A 1MXUA 4F19A 4WXJA 1NKXA 2XXWA 3DLNA 4KCDA 4G68B 5AA1A 3TTLA 1MQJA 5H8SA 1Y3QA 4YKPA 1B3EA 4R2FA 2NUVA 4NE4A 1NFTA 1LAFE 3MBPA 4FAJA 2DWJA 1H45A 3U93A 4DE8A 1IXGA 1MY0A 1JW4A 1MY3A 2GHBA 2IA4A 5DEXA 4P11A 2Y7IA 2F7BA 1UTBA 2XXTA 3Q26A 3OO8A 2ZYMA 3TTMA 1RYOA 5M2VA 4PE5B 3Q29A 2Y7WA 4OMBA 1LAXA 3G3HA 1MY4A 4R72A 1GGGA 3C31A 3FV1A 4OXVA 2DWAA 2XX9A 4YKIA 1MXVA 2NVUB 3I6VA 2CZLA 4RNSA 3IOVA 1USYE 1IXHA 4HW8A 3OMBA 3TYHA 4QHQA 2DXRA 2KLFA 5J1DA 4LQ2A 3H3GA 2ZXTA 2RC9A 1P1UA 3DELB 1IUDA 4TOZA 4XIGQ 5ICTA 1LB9A 2RF1A 1GV8A 4O3BA 3O9PA 4F3SA 3MVXA 3OOAA 4DIGA 4WEPA 3LSXA 4YICA 3TCGA 2O7IA 3QAXA 5I56B 2X7QA 4FIMA 3C34A 4OFLA 1US4A 1EZPA 4KYSA 1M5BA 4RYAA 1DOTA 4E0WA 2HCAA 3F11A 1H3DA 5ITOA 3TUSA 3LR1A 5AA2D 4OVJA 3G3KA 4RPNA 5I59A 1M5DA 4HCWA 3C9HA 4JSDA 2GFEA 2E1SA 1DTGA 1Y3PA 4DXCA 4OFJA 3LUYA 1MS7A 2OBGA 4OYVA 5CM6A 1SBPA 3MPLA 4R6YA 4TQUQ 2O7UA 1Z7NE 3H7MA 4JBZA 5KDTA 3KBRA 4GIZA 5F1QA 3E13X 3SERA 1B40A 4R6KA 3QK6A 3PUXE 1B0HA 2A5TA 2NXOA 3S9EA 3I5OA 5DTBA 3RGYA 1J1NA 1PC3A 5H8QA 3K1NA 1A7LA 3OD7A 5TP9B 3RTFB 4IY5A 3H6VA 1CE2A 2QS1A 4RJZA 2AIXA 3M3KA 4NF6A 1LBCA 2AYSA 3QYTA 1A8FA 4YMAA 4M1VA 2ALUA 3OO6A 3M3LA 3PPOA 1BKAA 3B7DA 3FVKA 1MPBA 3GBAA 2GRVA 4FEDA 1LB8A 2DVCA 1H76A 1B58A 2QMWA 2I49A 3EHUA 4M4GA 3MUQA 2Y84A 3O66A 3BBRA 4ELPA 3TCHA 3IB0A 2ONRA 1B0LA 3SEYA 5DVIA 4ZEDA 4GOTA 3TEPA 3JV9A 2G93A 4YKJA 3G3FA 1KWHA 1MQGA 4OTEA 3HCQA 3VDFA 3TTKA 3HHFA 5FHNA 4N6PA 4RK9A 2HZLA 4ZEKA 5KCJA 4QRZA 3OSRA 2O1MA 3FJMA 1JQFA 1PEBA 2PMSA 1GTKA 2DS9A 1ZIUA 3PU5A 1P1NA 3D4GA 1BTJA 2LAOA 3UP9A 4F1UA 2XHDA 3W9VA 5JTYB 1TFAA 3G3JA 4IY6A 2I58A 1S7YA 3TPAA 3N5LA 4EQ9A 4YU0A 3T93B 3RT8A 1QKBA 1O7TA 1LSTA 4G8NA 3MPKA 3S4UA 1SQYA 2I48A 2XX7A 3PUWE 4ELOA 3VE1B 4UACA 1N0TA 1A54A 3H6WA 4POWA 3CSBA 3MAMA 3N6TA 4U23A 1MQDA 3CFZA 4OEVA 1URGA 3FXUA 2V25A 1Y1MA 1YAEA 3MQ9A 1YCJA 1AL3A 3M8UA 1RYXA 2PT2A 5F7VA 5I57B 3SETA 4L17A 5CI5A 3K6VA 2ABHA 3MP8A 1QJMA 4BDMA 1VFDA 4ZEFA 4N07A 3BKIB 3O6IA 2D5WA 1UTHA 2XD3A 1ZLQA 3RY3A 5I2NA 1NMUA 3IL1B 1ELJA 3MWBA 1NNKA 3ZKLA 1R1NA 1D3KA 3GZGA 4JDFA 5L9OA 1N76A 1EH3A 2PYYA 1XVXA 3LSWA 5LOMA 5H8NB 2QJEA 3V89B 2UYFA 3K01A 3CG1A 1FQEA 2YJPA 1ZJLA 1ZBMA 2H98A 3VVFA 3H06B 2Y7KA 2PBWA 4PFYA 1P1WA 3HHGA 4ELRA 1QUIA 3TQWA 3H6TA 4I8CA 4H67A 2GHAA 2REGA 3ECRA 3KN7A 1URDA 5ICQA 2F6GA 3TODA 3ILUB 3LC8A 1ZKBA 2I3VA 3HO7A 1LLSA 4EXLA 3I3VA 4KYEA 3GLBA 3SEVA 5I2KA 3TZAA 3VXBA 3TMGA 3IB1A 4Q30B 4O3AA 4H5FA 1MXWA 3CSGA 3N94A 2M8CA 4U2RA 2RINA 1OVTA 4KPTA 3UGWA 4ESXA 4HS7A 1NNTA 1P99A 4DDDA 5TU0A 4DCXA 2P0SA 3VLVA 1N7XA 3O29A 5K2YA 1B51A 3R6UA 3O6HA 1A55A 5CMMA 2Q88A 1IEJA 1MPDA 4PFTA 4R9FA 5CBRA 1B7UA 3USDA 4NF8B 1SVXB 2I4CA 4LATA 1DPEA 1ZMGA 1FCKA 2Y7RA 2Q2CA 3UK4A 1LFGA 3ZKKA 3O28A 1HSJA 4EQBA 3V83A 3E9XA 2F97A 3KG2A 3H03A 4R9GA 4OHNA 4XKPA 3MC2A 4MLQA 2RC7A 4PFUA 3H6UA 3PPNA 4KHZE 3FZVA 1LAGE 3S9LC 5CBSA 2DYXA 5DEXB 2DVZA 2QL3A 4EF1A 2Z8FA 1R9QA 1UTBB 4I1DA 4LZ8A 4BDOA 1FQDA 3K02A 3ONMA 2R6GE 4GVOA 2UVJA 4NTLA 2DSFA 2NWJA 1Y3NA 3TKDA 4F1YA 1JETA 3W15C 1MXYA 2QRYA 1D9VA 2VD2A 2Z8DA 3TFLA 3DP6A 4IB2A 4F31B 2OLBA 3IX1A 1LFIA 4IGRA 4NMYA 1A40A 1N7WA 3BFUA 4F2QA 2UVIA 1YPNA 4EXKA 4OERA 1MQIA 4JWOA 5CMBA 5HM4B 4EF2A 4Q8RA 3R7XA 1B32A 4Q5TA 1MY2A 1M5EA 1MDQA 3LSFB 2UXAA 2VHAA 4LA9A 5I84A 2NOOA 2F5XA 3PD9A 1VFEA 1AOVA 5HPQA 4YB5A 1MH4A 2QS2A 2ZNSA 3MP1A 2O1LA 3K6WA 5AA4A 3U94A 4BDRA 2I0CA 1FTJA 5AA2A 1BP5A 2Y7PA 2V3QA 4E0XA 4QF9A 3KFMA 2RCBA 1TFDA 3E3KA 4JWXA 3EHSA 1H44A 3CFLA 4TLMB 2OWSA 4BDNA 3QIMA 5I59B 3IJXB 1LCFA 1N3WA 1MY1A 1UIVA 3A3UA 1US5A 1XS5A 5FTIA 2Z8EA 3WAFA 4GL0A 4IO5A 1N04A 1JW5A 2ZNTA 3KOTA 1ZTYA 2OCUA 1B3GA 3KN3A 1LAHE 3CG3A 2B3FA 2XXYA 4RK2A 1WVJA 3PUZE 5TP9A 4YB7A 1EU8A 3OEMA 2O68A 4FEBA 5KDTB 3FJ7A 4GF8A 2XXPA 3FATA 5BUUA 1MH3A 1HSLA 4NF4A 2V84A 5JK4A 4ZZEA 3U92A 1Y4TA 2XXHA 3HSTA 1FTMA 2THIA 2Q89A 2RKMA 2H5YA 4R74A 2A5TB 1Y20A 4GLIA 1SW1A 5H8QB 3VV5A 1F9BA 2XXVA 2HXWA 1EZ9A 5CC2A 3A3CA 4ONYA 2Q8JA 4NF6B 3ZS6A 1MG1A 3WAEA 1B2HA 4ZEBA 1VE4A 4LQ5A 1N3XA 2E0SA 1RKMA 5A5XA 2VD3A 1FTLA 3C4MA 4ZDMA 3FUZA 1H43A 4OZ9A 3CR9A 1B05A 3VLUA 4PFWA 3IR1A 2HFBA 5I58A 4GFRA 5TPAA 4POXA 4G68C 4F18A 1MDP1 5L9SA 3LSLA 1PB7A 3OXNA 5IAIA 1SI1A 4MFIA 1P1OA 4G8HA 1JVXA 1MM6A 3HV1A 4OQOA 4ZE9A 4EUOA 1SI0A 4GXSB 3U1OA 3FASA 3PPQA 1PB8A 3U72A 1IXIA 3KN8A 4G8MA 4ZE8A 5KCJB 3PMXA 3S2VA 1JNFA 3ILTB 4WKMA 1POY1 5B7DA 1OIBA 3DM0A 3RN8A 4ZS9A 3OO7A 3IJOB 2R9JA 4KQPA 1QUKA 2I3WA 4RXLA 2O51A 4JWYA 3GXAA 2R71A 1USYH 1DPPA 1I69A 5H8HA 1R9LA 2DE4A 3AXFA 4G4PA 3LBSA 2A5SA 2VP1A 1XC1A 4BDQA 3KEIA 4MH5A 2REJA 5H8FA 3TCFA 5I57A 1DMBA 4P0GA 1UQWA 1LCTA 4LONB 2I6EA 3S9NC 1Q1KA 5DYHA 1OLCA 1B5HA 5ITPA 3L6GA 1MPCA 1B5IA 1R6ZA 3HN0A 3FJGA 4H65A 4QFNA 2UYEA 4X1BA 2H4IA 5CRYA 1OLAA 1MXXA 3MVYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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