1I6AA

Crystal structure of the oxidized form of oxyr
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHCLRDQAMGFCFEAGADEDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transcription
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
total genus 62
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA02
1PBPA 2XXHA 4LA9A 3FJMA 4U1OA 5AA2A 1PB7A 4YKKA 4F29A 4RXLA 1VSOA 1B32A 1QUIA 3G3KA 5I58A 2GHBA 1WDNA 4OENA 4F2QA 1MY3A 4OZ9A 4PETA 2F36A 5HM4B 3I6VA 2DP8A 1LAGE 1SI1A 3H6TA 2OWTA 2QS2A 4I1DA 1POY1 4OHNA 4R2BA 1OVTA 2NVUB 1USYE 2XXYA 5H8QA 2GRVA 5L8DA 2DE3A 1B5IA 1SYHA 4OVJA 4ZDMA 3SEUA 2HQ0A 2Q9TA 3IORA 4KCCA 1B3FA 2F5XA 3MC2A 3KJ7A 3OSQA 1KWHA 3U93A 2XXXA 1HSJA 3HSTA 4G2ZA 5I56A 1FTOA 4KHZE 3UP9A 3CG3A 4AB5A 4BLAA 2A5TB 4RPNA 4DXUA 1TT1A 3RTWB 1ATGA 3CIJA 3K6XA 3KN3A 2F78A 2OZZA 3E13X 4LUBA 1YPNA 3V83A 2ZNTA 1NFTA 3Q28A 4POWA 5I56B 1B3EA 1D3KA 1LCTA 2I3WA 2XD3A 3FVNA 3FJGA 4JWYA 3RUMA 4TLMB 3N5LA 5I57A 3U1OA 3P7IA 1Y3PA 2THIA 2ABHA 4Q8RA 4LP2B 4LATA 3C33A 3PUYE 5H8QB 3RY3A 3V5AA 3MZBA 3TTRA 2AL4A 3FXUA 3HHGA 2X26A 3UK4A 1SI0A 1MM6A 1UTBB 1ANFA 1YAEA 2VHAA 4EXKA 3PMVA 3OD7A 4G8MA 5CM6A 3T93B 4BDMA 4HW8A 4EQBA 3TTNA 1EU8A 1NH8A 5HPQA 1FQDA 3B6WA 2OK2A 2DE4A 3GXAA 3MPKA 3G3IA 1D4NA 5AA2D 3OSRA 3W9VA 4ECFA 2UVHA 1TFAA 1N0TA 3KOSA 3K2DA 1MQHA 3M3FA 4FEDA 3OO8A 2HEUA 1MQDA 1S7YA 3RT6B 1NNTA 1N76A 3OOAA 1FTMA 2FNCA 1DSNA 2B3FA 2R9JA 3OELA 4GOTA 2Q2AA 2QS1A 3PMXA 4E0XA 5B70A 1A40A 2I49A 1ZMGA 2YLNA 3H4ZA 3IB2A 3QSLA 1HSLA 3QIMA 4PFTA 4QHQA 3R7XA 3W15C 1LSTA 3K02A 4F1YA 2YJPA 3BFTA 1SD3A 2OWSA 1N3XA 2O7UA 3VFJA 1QUKA 3JZJA 3OENA 3O6IA 4KYDA 1B9JA 2RC7A 1OVBA 1VFDA 2UYFA 3K1MA 3M8UA 3MVXA 2V25A 3Q25A 4QFPA 5CRYA 1N7XA 4F22A 2QJEA 1IITA 1B46A 3D4GA 1GV8A 3LSLA 1A54A 4FE8A 3IOUA 4N07A 3SDFA 2NWJA 3S9MC 1B3LA 4LZ7A 4PFWA 3VLWA 2E1SA 4MLVA 2GH9A 4OYVA 2OLBA 5TPAB 3SKPA 4F31B 3K0VA 4Q0CA 2O51A 4JDFA 4QSDA 3B7DA 1GTKA 2NOOA 1CB6A 3I3VA 4GXSB 3A3UA 1ZBMA 2Z23A 2PX1A 2V3TA 5L9OA 4KR5A 1GVCA 1BLFA 4P11A 4XTCQ 2PVUA 1XS5A 4GF8A 1FQCA 4NWCA 1XHYA 2QRYA 2H4IA 5EHSA 5AA4A 5L9SA 2M8CA 3IK6B 5CC2A 4C0RA 5DTBA 3KG2A 2ZYMA 3O6GA 1I6BA 2ZNSA 5K2XA 2GHAA 5DYHA 4YKPA 1FCKA 4MLQA 1MRPA 3LSXA 4DCYA 4HCYA 1L5TA 4IO4A 1BIYA 1MY0A 3K1PA 4OFLA 1NMUA 3PUXE 1TFDA 3A3CA 1JETA 1P99A 1JEUA 2HZLA 3MVZA 4GLIA 5ISUA 2AYSA 4P0IA 1N3WA 4JWXA 4X1DA 3F11A 4IY5A 1I6QA 3TAJA 5IAIA 1WODA 2PBWA 4FATA 5H8SA 5I58B 3KGCA 2DYXA 4MBPA 2Y84A 1TWYA 2DS9A 2DWJA 4THIA 3EHTA 3GBAA 3T9VA 4ESWA 5A5XA 1XVYA 5CMCA 4E0WA 2HFBA 3HCQA 1A55A 2I0CA 3PUVE 1H45A 2Y7KA 4ZZAA 4LONB 5A5XB 5CMBA 3U72A 4GVOA 1WVJA 4DXBA 3UA8A 1HSEA 3MZ9A 4PE5B 1M5EA 3LC8A 3ILUB 3K1NA 4XIGQ 1MPDA 3TTKA 1PC3A 2ONKE 3GLBA 3IOTA 4TLLB 1MG1A 4MH5A 3OO6A 5H8NA 1B0HA 3ODBA 3IX1A 3KN7A 3H6UA 4PP0A 3CRBA 4ZE8A 4EF1A 3CR9A 3KZGA 5JEIA 4NF4B 3Q27A 4FIMA 5F7VA 1MY4A 4G68B 5DEXB 5EYFA 4ZECA 5L9MA 2H99A 4TQUQ 1MXYA 1A7LA 1O63A 2PT2A 3MUQA 1O7TA 4NF4A 5I59B 1NNFA 2B65A 4QRZA 1OQHA 1MDP1 1Y9UA 2D5WA 3JV9A 2VGQA 1JW5A 4FORA 3TPAA 1BP5A 2XXTA 3EF7A 3TELA 1II5A 5TU0A 4BDOA 2HXWA 3TCGA 1J1NA 3KFMA 3MZ1A 3RGYA 1GR2A 1D9YA 3RTFB 1ELJA 2H5YA 1MH3A 2I58A 1MXUA 3TTMA 3BKIB 4Q30B 5AA1A 4YKIA 1M5CA 1P1OA 1URDA 1Y1ZA 1FTKA 1URGA 2ZYKA 3VVDA 1LLSA 1LB9A 1B0LA 1A99A 3SETA 1IXGA 4QF9A 2DXRA 2ZNUA 3THIA 5HBCA 2O69A 3B6QA 1EZOA 2V84A 2I6EA 2Y7WA 1Y1MA 3MJNA 3PU5A 4LVQA 4RNSA 4EQ7A 3DP6A 1DTGA 1DPEA 1SW4A 1MXVA 1P1UA 3H3GA 2XHDA 3FZVA 4C1UA 5ELVA 1MY2A 2DOJA 4LQ2A 3N94A 4OQOA 5H8HA 2QS3A 4IB2A 3B6TA 4OWDA 2AL5A 2PYYA 2Y7IA 4NF5A 2RKMA 1NH7A 4GL8A 3SEWA 5AA4B 1QVSA 4OXVA 2CZLA 4ELQA 5KCJB 5M2VA 1LFGA 3MWBA 3C34A 3O9PA 3PUZE 2DXYA 1VR5A 4WKMA 3Q29A 1UQWA 1R9QA 3DLNA 5BWJA 1VE4A 2UYEA 4ELOA 3W9WA 5TP9B 3A09A 1SDXA 2P2AA 3BBRA 1UIUA 3FV2A 3G3JA 1B5JA 3OO9A 4GXAA 3CFLA 1MXZA 4F3BA 3TQWA 4L17A 1OLAA 4M1VA 4U23A 1LAXA 4YICA 3N6TA 1B3GA 3QXMA 2NUVA 1MDQA 2ONSA 2P0SA 2RCAA 5F1QA 4ZEIA 3RNNA 2XXPA 5AA2B 4ZE9A 3H6VA 1DTZA 1BKAA 4RJZA 3FXQA 1POTA 1H76A 1P1WA 3PD9A 3S9EA 4PFYA 5KDTA 4LQ5A 3HHFA 3I5OA 2B3BA 3HO7A 1ZU0A 4X9TA 4XKPA 3TYHA 2V3QA 1B7UA 1P1QA 2DWIA 1FQEA 4H67A 1OMPA 4KYEA 4Q5TA 4RYAA 3PPNA 4H6DA 3T9UA 2QL3A 3C32A 3FD3A 2PMSA 2Y7PA 1B1XA 1QUJA 2Z8FA 3UORA 1R6ZA 4GFRA 3IR1A 1XOCA 5DVIA 3U8QA 4AB6A 2F6GA 2ZMBA 4OEUA 4R6YA 4IO5A 1IZ1A 1LB8A 2Q2CA 1Z7NE 2HAVA 4N13A 2IA4A 3FGSA 4IO6A 2VD3A 1DPPA 3DP8A 2A5TA 2I3VA 3EQ1A 2QPQA 1B58A 4NWDA 4I62A 4NEDA 1CE2A 1MXWA 1P1NA 4WXJA 4P0GA 1RKMA 3S4UA 4DLDA 5ICQA 4NF6A 1B40A 3LSWA 5FTHA 5KDTB 1LBBA 2I4BA 4BDLA 1UTBA 3FVKA 4EXLA 3CVGA 3VVFA 2DQVA 1GGGA 3MVYA 1A8EA 1PB8A 3PV0E 4IY6A 5AA3A 4GWOA 4KPTA 1B4HA 3HV1A 1USYH 4KD5A 3TTLA 4DZ1A 1Y4CA 1NKXA 1MPBA 2RC9A 4ISUA 2DWHA 4ND9A 3PPOA 4BDQA 1B52A 1MXXA 4F3SA 4RA1A 1MH4A 1M5DA 1XVXA 5KZTA 1B7HA 3VE1B 3E4RA 1FQAA 3DP4A 3KBRA 4H1XA 1Y3NA 3H7MA 4H8IA 1H44A 2R6GE 1NL5A 2YPNA 3K6VA 4OFOA 3VLUA 1UIVA 5DVJA 1B6HA 3MBPA 5KCJA 2REGA 4U22A 3TODA 4HCWA 1TXFA 5CI5A 2ZXTA 1D9VA 1EZ9A 2G29A 4HTGA 5TP9A 3IO6A 1MPCA 5H8FB 1H43A 2O6AA 4YB6A 2QS4A 3PD8A 4GQOA 3C35A 4YKJA 4G8NA 3VDFA 1LAFE 4JBZA 2Q88A 3MW0A 3FV1A 4O3BA 1UTHA 2V93A 5FHOA 1LGBC 2E0SA 1FQFA 3OO7A 3PPPA 4PFUA 4DCXA 2CMOA 1LFIA 4U4SA 1R9LA 4OEVA 1Y4TA 3SEXA 3SESA 4FAJA 1MQJA 2F34A 3TKDA 3IAZA 3H03A 5H8HB 1XT8A 3QUFA 1IXCA 4F39A 4FJPA 4ZZEA 3RN8A 4ZS9A 3O29A 4EF2A 1VFEA 2F6PA 4EUOA 3FUZA 2X7QA 3IJXB 4MFIA 3SERA 3G7WA 1QULA 1MY1A 3V8XB 2Q8JA 2VP1A 3IO4A 1QKAA 2W7YA 3EPEA 4O3AA 5J1DA 1SW1A 4XXUA 3S9LC 1B05A 4GIZA 1IXIA 2D21A 3TFLA 4R2FA 4ESXA 4QSCA 1UTHB 5I2NB 2XXWA 1PB9A 4RY1A 2F7CA 4FECA 4IGRA 4F19A 4IGTA 1LFHA 1MQGA 1YCJA 1N84A 3S9NC 4YMAA 1DMBA 3FASA 3GBBA 5I2NA 1B7ZA 4JB7A 2XX7A 2DVZA 4RK9A 3LBSA 1H3DA 4QFNA 3QUJA 1SVXB 3N6UA 4YMBA 2FA7A 1OQGA 4RPOA 2KLFA 1SW2A 5CMMA 4DE8A 5I57B 3O2AA 4ZEFA 3C36A 3VVEA 3AXFA 4GRKA 4F18A 1JNFA 1SQYA 3C4MA 3OEMA 5B7DA 1R1NA 1IIWA 1M5BA 2I48A 4PQJA 4QFKA 3T96B 3TQLA 3WAFA 3ILTB 1NNPA 3PPQA 4OTEA 4F1UA 3FXRA 4R9FA 3G3GA 3VV5A 3K6UA 1ZTYA 2F7AA 1QW0A 3DM0A 4YAHX 3L6GA 4G68C 3U94A 4F1VA 5I84A 2F97A 5DT6A 3SEYA 5AE4A 1B5HA 2WKYA 5H8FA 2QMWA 2DVCA 4NF6B 2OJTA 2OCUA 3CFZA 4H5FA 4OERA 4KFQA 1Z7ME 1OIBA 1BTJA 1MM7A 3KSJA 3ZSFA 5H8NB 2ONRA 4OMBA 4XKNA 4YZZA 3VLVA 3UIFA 3TEPA 1IEJA 3IOVA 3T9XB 1I6AA 2QSXA 3TDJA 3ZS6A 2RINA 2DWAA 4JXIA 4ELPA 2O7IA 5DEXA 4LZ8A 4M4GA 1IQ7A 1B51A 2XD2A 1PBQA 3CI8A 3H6WA 4ONYA 5JTYB 5TPAA 5CBSA 1B2HA 2LAOA 2O1LA 2DE2A 3CFXA 2F7BA 3JYRA 3KOTA 1SW5A 3CSGA 3MVWA 5JTYA 4UA8A 2RF1A 3LUYA 5I2KA 3OXNA 4AQ4A 3H06B 3K4UA 3RT8A 1AMFA 2UXAA 4ZEKA 4C1TA 3U92A 4NF8B 3MPLA 3OMBA 4K3FA 3KJTA 3FIRA 4X1BA 3O28A 1JQFA 3ZKLA 2V3UA 5CMKA 2O68A 5ITOA 3LSFB 1OLCA 2D3IA 1B3HA 4H0WA 1NNKA 2H9BA 2Q89A 2XXIA 2O1MA 3WAEA 2F8DA 4R9GA 3TMGA 3E3KA 2BJJX 2I4CA 4G8HA 3T22A 3QYTA 2DSFA 2RCBA 3ZKKA 4H5GA 5FHMA 3KEIA 4GL0A 5I2KB 4BDRA 1T0KA 4QSEA 1URSA 5K2YA 4F2OA 3TUSA 2XXVA 3EHSA 4R73A 4KQPA 3UN6A 4NF8A 5ITPA 3IB0A 2F35A 1US4A 2Y7RA 2R71A 3N26A 4LZ5A 3VXCA 5IKBA 4O3CA 4DXCA 3Q26A 4XKQA 4N6PA 4F3PA 5ICTA 3OEKA 4R6KA 3PPRA 4BDNA 3QAXA 1AIVA 4IO7A 3EN3A 1LCFA 3K01A 4G77A 4NF5B 4JSDA 3UGWA 1B1HA 2REJA 2UVGA 5FHNA 1M5FA 2OBGA 3MQ9A 1MS7A 3K00A 4YB5A 3EHUA 2XXUA 3M3KA 4GD5A 2O84X 4R75A 4XKRA 4ELRA 3RPWA 1PEBA 1JW1A 4EDPA 3C31A 4U4XA 2ESNA 1I69A 1F9BA 1FTJA 3IJOB 4HS7A 2Z8EA 2P1SA 4R72A 2HAUA 1B4ZA 4UACA 3RQTA 4JSOA 1JVXA 3K6WA 1RYOA 3O6HA 4KI0E 1ZKBA 2Z22A 3DELB 3MP8A 4H65A 3GZGA 4H8JA 4U21A 1AOVA 1EH3A 3CG1A 1FW0A 3R26A 4X48A 3QK6A 4JWOA 4DDDA 2H98A 2XX8A 1S9TA 3BFUA 3TCFA 3USDA 5JK4A 4QFLA 3E9XA 1YTVA 2ZYOA 4I9DA 5BUUA 4Z0IA 4WEDA 3PMWA 2NXOA 4I8CA 4NMYA 4EQ9A 3VXBA 1AL3A 5I59A 3MP1A 2ALUA 4OETA 3O97A 3ECRA 5FTIA 3FJ7A 3FATA 2G93A 3HPIA 4KCDA 4U1ZA 1LBCA 5LOMA 1N04A 3C9HA 3MAMA 4KYSA 4ZEBA 1ZJLA 1SYIA 2UVIA 2IEEA 2FYIA 4G68A 3RLFE 1SBPA 4MF3A 2ANJA 3L6HA 1EZPA 2I0BA 1A8FA 3V89B 1MQIA 1ZLQA 1ZIUA 3LR1A 3MP6A 3TCHA 3TZAA 4DIGA 4Z7EA 1Y20A 2UVJA 2VOZA 1Q35A 2ZYNA 4F3GA 1S50A 2HZKA 3KN8A 2XXQA 3M3LA 2PT1A 3O66A 4G4PA 1AH5A 4TOZA 4YB7A 4POXA 3G3FA 3S2VA 1DOTA 3FVGA 2VD2A 4IO2A 1LAHE 4YU0A 1JW4A 1N7WA 1O64A 2AIXA 2HCAA 3SEVA 1JEVA 4U2RA 1IXHA 2Z8DA 4ZEDA 5DVFA 4QFOA 1Y3QA 2QMXA 1XC1A 1Q1KA 2XX9A 3D4CA 3HN0A 3IB1A 3T9HB 3FVOA 4IO3A 2A5SA 2GFEA 1US5A 4FEBA 1JVYA 1FQBA 1FTLA 2XXRA 3IL1B 1PDAA 1QJMA 3IOWA 3KSXA 4OESA 4R6HA 4NE4A 3T66A 2X7PA 3PUWE 4OFJA 4RK2A 1QKBA 4R74A 1RYXA 3CSBA 3ONMA 5CBRA 5EHMA 1IUDA 2H25A 3G3HA 3PGFA 3R6UA 4NTLA 2RC8A 4WEPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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