1I6AA

Crystal structure of the oxidized form of oxyr
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHCLRDQAMGFCFEAGADEDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
total genus 62
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA02
3QUFA 3O28A 1FQEA 4KI0E 4THIA 3ZSFA 1EZPA 4PFTA 3T96B 3CRBA 1J1NA 5ICTA 1US4A 2PX1A 1B4ZA 4R74A 1JNFA 4MLVA 4LUBA 4NF6B 2I4BA 3OOAA 5DVJA 3VLVA 2OBGA 2DQVA 3OO6A 1ELJA 4EQBA 1MXUA 5J1DA 4ZS9A 1RKMA 3QUJA 3K02A 4DXBA 4IY6A 1N3XA 1AIVA 3S9NC 1MPCA 4H0WA 4M4GA 2RF1A 2I58A 1LSTA 3S2VA 1TT1A 2X26A 2Y84A 2I4CA 1PB8A 3UIFA 2GFEA 4G2ZA 3U94A 1B7UA 2Z22A 3TTKA 3ILTB 3G3FA 1URSA 3B7DA 2F7BA 3QIMA 4FIMA 5DVIA 1N0TA 4DZ1A 1QUIA 2GHAA 3PPRA 2O69A 4F2QA 1SW2A 1SW4A 4IB2A 3E3KA 4OETA 2VD3A 2Q89A 3TTNA 4YMAA 3ZKKA 3T66A 3TELA 2DWJA 1XC1A 1HSJA 1JETA 1N04A 4F31B 1B5IA 3C33A 4OZ9A 4NEDA 1MQJA 2D3IA 2YJPA 4IO4A 4ELQA 4GVOA 3OEMA 5AA4B 2V25A 4I8CA 2F8DA 4Q0CA 1MG1A 1MXWA 2DWHA 3MZ1A 1JW5A 3LR1A 1IEJA 1Y1MA 5CI5A 2QS3A 1BTJA 1FQBA 4IO2A 4C1UA 1B46A 3E9XA 2R6GE 2HXWA 2QL3A 3O29A 1ATGA 2ONRA 3PUZE 1M5FA 1LFIA 1PBPA 2H99A 1FQCA 2O6AA 4YKKA 1BLFA 4ISUA 1H45A 3PPNA 3LBSA 3I5OA 4BDOA 3PD8A 3RTWB 3FIRA 4IGRA 3PD9A 3O9PA 4NWDA 2NXOA 3I6VA 3MP6A 4QSDA 1P1WA 3HPIA 4H1XA 3PUWE 1FQAA 3DM0A 4POWA 3IOVA 1KWHA 5KDTB 1GGGA 1B5JA 3BFTA 3K6UA 3E13X 4IO5A 4OEUA 4IO6A 3WAEA 1MS7A 3IB2A 3EPEA 5JK4A 1B2HA 5DYHA 4PE5B 3IB1A 1LAGE 4EXKA 4G8MA 3RN8A 3HHGA 3FASA 3ONMA 4PP0A 1XOCA 4FE8A 4BDQA 1USYH 4AB6A 3KFMA 5HBCA 4X1DA 2VGQA 2KLFA 4HS7A 5K2YA 4P0GA 1BIYA 3PMVA 2DWAA 4N6PA 2DXRA 3PV0E 3G3JA 3K01A 1LB8A 4G8NA 3VVFA 2O51A 1B7HA 4PFYA 5KZTA 1N3WA 1DOTA 4LP2B 5H8NA 1R9QA 3IOTA 2Y7RA 4O3AA 3TCHA 3D4GA 2XD3A 4LATA 4NF4B 3UORA 2Y7KA 2UXAA 3SERA 4ZZEA 3HO7A 3CVGA 4ZZAA 3OENA 4RXLA 4C0RA 1D9YA 1NNKA 3VVDA 1S50A 2G29A 4BLAA 3CSBA 4XKPA 1IITA 1WDNA 4G68B 1IXHA 1FTJA 3OELA 1FCKA 5I59B 4OXVA 3MVXA 1Q35A 4NF5A 4O3BA 2I0BA 1P1UA 1UTBB 4R72A 1B1HA 5I56A 3FV2A 3Q26A 4GXAA 4GL0A 5M2VA 4DE8A 2HEUA 3Q29A 3Q28A 3FXQA 2HZKA 3K1MA 2DXYA 3TQLA 1IXCA 5H8FA 2I48A 4H6DA 4NTLA 3DP8A 4ESXA 1SD3A 4EXLA 1QKBA 2R71A 2AIXA 1YPNA 1UTHA 3IOWA 4ELRA 5HPQA 3D4CA 1UIVA 4OVJA 4WEPA 4YICA 3K2DA 3S9MC 5I2KB 3BFUA 1B0HA 5BWJA 3ECRA 4YAHX 4KCCA 3USDA 3IOUA 1LAHE 5ISUA 3FD3A 2QS4A 1IZ1A 3H7MA 1SI0A 3CFZA 1MXZA 3A09A 5LOMA 3H6UA 4H65A 4XKQA 2XXQA 1FQDA 4LVQA 1Z7NE 4PFWA 4EF2A 3FVGA 1M5EA 3KN3A 1GVCA 2UVGA 2FYIA 3JYRA 3MZBA 2PBWA 3TKDA 3TQWA 2VP1A 2I3WA 4F3GA 5CMKA 2ABHA 5TPAA 4MF3A 3EQ1A 4KCDA 3V8XB 1CE2A 2QS2A 2R9JA 1DPEA 4OFOA 4OESA 1MY2A 1M5DA 1WVJA 3LSWA 1FTMA 4L17A 1WODA 4DIGA 1OVTA 4FORA 5DEXA 4OFLA 1UQWA 5FHMA 4Q8RA 5I2NB 3V83A 5AA2D 2D21A 3S9LC 1EU8A 3AXFA 1MXXA 3KOSA 1Y4CA 1NNTA 3BKIB 4TLMB 3PUXE 3MVZA 2H5YA 2QRYA 2VOZA 1XVYA 3G3GA 4X1BA 3JV9A 1PB9A 1O63A 3TMGA 4KHZE 3IB0A 3FATA 4RJZA 3TCFA 5H8QB 2PVUA 4MLQA 2M8CA 1YAEA 3Q25A 2F34A 4Q30B 2P2AA 1ZMGA 2HZLA 1P99A 4QSCA 2UYEA 4FATA 1QJMA 3UA8A 4ELPA 5F7VA 5L9MA 4LZ5A 4KFQA 2QSXA 4IGTA 4R2BA 1MY4A 3WAFA 3QSLA 3G3HA 2NUVA 5CMCA 5B7DA 5H8HB 1S7YA 1ZIUA 4NF8B 1R1NA 3B6QA 1LBCA 2G93A 3M3FA 2QMWA 5TP9B 2XXXA 3FZVA 3G7WA 1NKXA 3EHSA 4JB7A 1XS5A 1A40A 1Y20A 3VXCA 1YTVA 4EF1A 2Q88A 2OWTA 1OQHA 1TXFA 4YU0A 1NNPA 1Y1ZA 1B1XA 4EUOA 4KYDA 4TOZA 5I57B 3VVEA 1L5TA 4E0XA 3CI8A 4F22A 1MH3A 2CZLA 3G3KA 5CBRA 2ZNTA 1MPDA 4YZZA 1A8FA 3B6WA 2O1LA 3QXMA 3C34A 5KCJA 1DTZA 4EQ7A 1QUJA 4O3CA 4LQ2A 3C9HA 2RINA 4HW8A 4ZE9A 1SDXA 1B9JA 3M8UA 5I58B 4GD5A 4ONYA 1GR2A 3A3CA 3MWBA 4YKPA 4ZE8A 2ONKE 2H98A 3IAZA 1JEVA 4JDFA 3DLNA 1JEUA 1IQ7A 1CB6A 3RGYA 3I3VA 3TTRA 3P7IA 2O1MA 4R2FA 1B32A 2PT2A 1P1OA 3G3IA 3LSLA 1B05A 2RC7A 4QFNA 3EF7A 5AA3A 1GTKA 2V93A 2HFBA 1B5HA 1RYXA 2QMXA 3O6IA 3KSJA 4QFLA 4X9TA 2HAUA 1A54A 1QVSA 4FEBA 3EHUA 3TTLA 3UP9A 4F3SA 3O97A 1AH5A 3T93B 2XXIA 4ESWA 2E1SA 3SEXA 2OJTA 1HSLA 4N07A 2A5TB 4GOTA 1VFDA 4ECFA 5AA1A 2V84A 1HSEA 1POY1 3IR1A 1DTGA 4OERA 2DSFA 5AA2B 4R73A 2OLBA 4Z7EA 1AL3A 3RUMA 3MW0A 2XXPA 3TYHA 4NMYA 4QSEA 4LZ8A 1A7LA 2F5XA 3DP6A 4F3BA 1NFTA 1JQFA 2LAOA 3KJ7A 3KJTA 1IXGA 1SYHA 4IY5A 5JTYA 2NVUB 1Y4TA 1LCTA 4JXIA 4H8JA 4F1YA 4QFOA 5CMBA 1DPPA 4GLIA 4R6HA 4BDMA 4RK9A 3LC8A 2UVIA 4FECA 2X7QA 3PGFA 4Q5TA 3FJMA 3VDFA 4G77A 4KD5A 1LBBA 4IO7A 4QFPA 1MM6A 2Z8DA 2Q2AA 1I6AA 2ZNUA 1LFGA 1LGBC 1URGA 2ALUA 3MVWA 4R6YA 2DVCA 2THIA 4F19A 1US5A 1JW1A 3QYTA 1GV8A 3MPKA 4YB6A 3A3UA 2ESNA 2XX7A 3VFJA 1LAXA 2DVZA 4Z0IA 2F7AA 2XX9A 1QKAA 3H03A 1LAFE 1FQFA 2HAVA 5FTIA 4LQ5A 3BBRA 4OENA 1PB7A 3S9EA 4OTEA 2QJEA 4BDRA 3SESA 4OWDA 4H5FA 5ELVA 1H3DA 4NF6A 4ELOA 4UA8A 1B6HA 4MFIA 3FGSA 4GF8A 4R9FA 2H9BA 3R7XA 4H67A 4P11A 1MQDA 4M1VA 1LB9A 3K00A 2I49A 4HCYA 3SEUA 3W9VA 1OMPA 3V89B 3OSQA 2DYXA 4I62A 1VSOA 3UGWA 3IO6A 1B3EA 3PMWA 1MDQA 3F11A 2AL5A 3FV1A 4JBZA 4F1VA 3SEVA 3LSFB 2Y7WA 3HHFA 1TFAA 4F18A 2DE4A 2QS1A 3M3KA 1R6ZA 2ONSA 3VV5A 3E4RA 5EHMA 3C4MA 4F39A 3GZGA 2W7YA 4RYAA 4DXCA 2REGA 4FAJA 4GRKA 4GWOA 2X7PA 3H6WA 1MH4A 3R6UA 3CR9A 2WKYA 1A8EA 3HN0A 4IO3A 4DLDA 3EHTA 2F6GA 1ZLQA 4RY1A 1O64A 5FHOA 2YPNA 5A5XA 1MQIA 3K6XA 4XKNA 5DT6A 3FJGA 3CSGA 4QHQA 4BDLA 3O66A 1I6BA 3THIA 4PFUA 3K6VA 1B52A 3MBPA 3FXUA 5AA4A 3MUQA 3Q27A 1MY0A 1MRPA 4F29A 1D9VA 4ZEDA 1JVXA 4RK2A 3RT6B 3LSXA 2XX8A 5ITOA 5TU0A 4DXUA 4YKJA 3FXRA 1EZ9A 4WKMA 2DE3A 1R9LA 3C32A 3U93A 3N94A 1PEBA 2HCAA 3U8QA 1LCFA 4RPNA 4MH5A 1Y3PA 4U21A 1O7TA 2O7UA 3U1OA 4GL8A 4KR5A 5CBSA 1B0LA 3M3LA 1H44A 3QK6A 3N6UA 2F6PA 4RPOA 1MDP1 3VE1B 1B4HA 3RTFB 3N5LA 5KDTA 4U23A 5I84A 1URDA 3ILUB 2E0SA 1JVYA 3LUYA 4JWXA 3FVOA 4NE4A 2F78A 1QULA 1H76A 3EN3A 3HV1A 5L9SA 2Q8JA 4U2RA 3PMXA 1QW0A 4N13A 3TEPA 3KGCA 5EYFA 3ZS6A 3VLUA 2AL4A 1XHYA 1JW4A 2ZYKA 3VLWA 2YLNA 1ZBMA 3KG2A 3MP1A 3RPWA 5H8NB 1YCJA 4WXJA 2UVJA 3H4ZA 5JEIA 2UVHA 1NL5A 3HSTA 1H43A 4DCYA 2UYFA 1D3KA 4KYSA 4TQUQ 3IO4A 3U92A 2VHAA 2RCBA 3W9WA 3CFXA 2XHDA 3T9VA 1F9BA 1N84A 1MPBA 1B58A 3MQ9A 1SQYA 3KN8A 4OMBA 3PPPA 3OO9A 1B7ZA 2F36A 3RLFE 3K0VA 3K1NA 5HM4B 4NF4A 5CM6A 4AB5A 4PQJA 3RNNA 3IX1A 4NF5B 4YMBA 3MZ9A 2B3FA 5I56B 1ZKBA 1LLSA 4KPTA 4G68A 4JSOA 1MQGA 3ZKLA 3PPQA 5I59A 5CC2A 2XXUA 3CIJA 2AYSA 3TDJA 1Y3NA 1SBPA 1UTBA 1BP5A 1QUKA 3MJNA 1NNFA 2IA4A 5H8FB 4KYEA 2B3BA 1T0KA 2NOOA 4BDNA 4F2OA 1Q1KA 1MXVA 3IK6B 3C31A 2I0CA 2XXRA 3HCQA 3TUSA 5IAIA 3MP8A 4JWOA 3TZAA 1LFHA 1NMUA 4R6KA 1UTHB 3MAMA 2QPQA 4P0IA 4ZEFA 4GFRA 4JWYA 1SW5A 3TCGA 1BKAA 2GHBA 5A5XB 4ND9A 5DVFA 4E0WA 1FTOA 2BJJX 4UACA 3TTMA 1VR5A 3GLBA 2Y7PA 2IEEA 3KN7A 3RQTA 1SW1A 5IKBA 4OHNA 5I2KA 3IL1B 4C1TA 4G68C 4DCXA 5ICQA 3H3GA 5B70A 4GXSB 3K1PA 4KQPA 3S4UA 4H5GA 3CG3A 4ZECA 4F3PA 3RY3A 3SEWA 1IXIA 5TPAB 1N76A 3K4UA 3GBBA 2P0SA 2FNCA 1OIBA 2O84X 1B3FA 4XTCQ 1MY1A 4JSDA 1FTLA 5DEXB 2XD2A 1M5BA 3ODBA 2DWIA 3CG1A 5F1QA 4YB5A 4GQOA 2GH9A 1PDAA 5AE4A 1A55A 4F1UA 5I2NA 1EH3A 3MPLA 1VFEA 1ZJLA 5FTHA 4LA9A 4I1DA 3H6VA 4LZ7A 2ZNSA 3DELB 2B65A 1SYIA 1MXYA 3KEIA 2I6EA 2P1SA 2DS9A 4HCWA 1N7XA 1FTKA 1VE4A 2PT1A 4G4PA 2OWSA 1S9TA 3K6WA 5H8QA 1NH7A 3IJXB 3FJ7A 2PMSA 1I69A 2V3UA 1B40A 2O68A 2GRVA 3H06B 2F97A 2REJA 3L6HA 2O7IA 5BUUA 4RA1A 3O6HA 3GXAA 3QAXA 2XXTA 4K3FA 5H8HA 4XKRA 4FEDA 2XXHA 2A5SA 3IORA 4NF8A 5ITPA 2ZYNA 1MQHA 3OEKA 3C36A 1FW0A 3MVYA 1MY3A 2VD2A 2Y7IA 1DSNA 5TP9A 3H6TA 3T9UA 1UIUA 3OMBA 3PUYE 2RC9A 3DP4A 2V3QA 3JZJA 4POXA 4WEDA 4MBPA 5EHSA 1TWYA 3TAJA 3TPAA 3O6GA 5CRYA 1D4NA 5I57A 3KSXA 3TODA 1P1NA 3SEYA 2H4IA 4XXUA 1OQGA 4OEVA 4AQ4A 5KCJB 4HTGA 4R75A 2Z8EA 3UK4A 5DTBA 4EQ9A 3PPOA 3N26A 1OVBA 4U1OA 1ZU0A 2ZXTA 2XXVA 2OK2A 3KBRA 2I3VA 1B3LA 3OXNA 3SDFA 3MC2A 5I58A 4ZEKA 2F35A 3U72A 5FHNA 1AMFA 3C35A 2ZYMA 4U4SA 3T22A 1N7WA 2V3TA 3CFLA 4ZEBA 4G8HA 4QF9A 4FJPA 3OO8A 3T9HB 3PUVE 2ZYOA 4XIGQ 3RT8A 4QRZA 4ZEIA 2H25A 3B6TA 2OCUA 2XXWA 3W15C 4DDDA 5CMMA 1IIWA 3GBAA 3KOTA 4U4XA 4U1ZA 2DP8A 2NWJA 3T9XB 1Z7ME 3N6TA 1AOVA 1II5A 1EZOA 3L6GA 1ZTYA 1RYOA 4I9DA 2CMOA 1OLCA 2FA7A 4U22A 1OLAA 1B51A 1PBQA 2A5TA 2XXYA 2Q2CA 2Z8FA 3O2AA 2DOJA 1P1QA 4RNSA 2RKMA 4OQOA 4H8IA 5L8DA 3V5AA 1NH8A 1XT8A 1A99A 2OZZA 5AA2A 3R26A 3VXBA 5K2XA 4QFKA 4ZDMA 4EDPA 1PC3A 2PYYA 1I6QA 4YB7A 1POTA 4YKIA 5H8SA 1B3GA 5JTYB 2D5WA 2RC8A 4NWCA 2ANJA 2Z23A 1SVXB 1TFDA 4R9GA 1Y9UA 4TLLB 4X48A 1SI1A 2F7CA 2Q9TA 1XVXA 4PETA 3TFLA 1USYE 1B3HA 3OO7A 3KZGA 3UN6A 5L9OA 1Y3QA 1MM7A 3FVNA 1M5CA 4OFJA 3SKPA 3PU5A 4GIZA 3OD7A 2DE2A 3FVKA 4OYVA 2HQ0A 1ANFA 3SETA 3OSRA 1IUDA 1DMBA 3IJOB 3FUZA 2RCAA 4LONB 2ZMBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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