1I6AA

Crystal structure of the oxidized form of oxyr
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHCLRDQAMGFCFEAGADEDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription
source organism Escherichia coli
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
total genus 62
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA02
2W7YA 4FJPA 4IO4A 1GV8A 2GHBA 5AE4A 4KHZE 1R1NA 2V25A 4NF4A 2ZNUA 1BIYA 2DOJA 5JEIA 4OHNA 5EHMA 2PVUA 4RPNA 2RCBA 1MPCA 2HFBA 4LP2B 3VVEA 3RPWA 1L5TA 3RY3A 3V5AA 2BJJX 2LAOA 4GRKA 2R9JA 3A09A 4U1OA 2ANJA 2D3IA 4G77A 2AL4A 1O64A 2PT2A 3FV2A 2V93A 4P0GA 3C35A 2UVHA 2UYEA 5I56A 3IJOB 3LR1A 4KYSA 4Q5TA 2OZZA 2F8DA 3ZKKA 4F3GA 1AMFA 4ZEBA 5TPAB 4ZS9A 3N5LA 2QS3A 4PFWA 4U22A 3O6IA 3Q28A 2E0SA 4RXLA 3DP6A 5BWJA 1I6AA 4G68C 5HPQA 4YAHX 3PD8A 2XXPA 1B46A 5JTYA 1PB7A 1OQHA 3H6WA 1JW1A 3QXMA 3PGFA 3IOWA 2ZYOA 5DVJA 1QVSA 3KJTA 4F1VA 4N07A 5ISUA 5ICQA 1P1QA 2F7BA 1N76A 3UK4A 3QIMA 3VXBA 2DYXA 5CMBA 2Q9TA 4P0IA 4Q0CA 4X48A 3LSLA 4YB7A 2I3WA 2DVCA 2QS2A 1IEJA 3RT8A 3PMVA 2ZYKA 1QULA 5CBRA 2XXUA 5L9MA 3HSTA 1TXFA 3B6QA 3S9MC 3MP1A 4OQOA 4R2FA 1MY2A 1WODA 4U4XA 2WKYA 1Y4CA 2VGQA 3TTKA 1DPPA 3T9XB 1FTOA 1R6ZA 1ATGA 1XS5A 3RTWB 3OO6A 1YCJA 5DTBA 4FEDA 4FATA 2Q2CA 4UACA 1MY4A 1DOTA 2R71A 4DXUA 1N3WA 3HHFA 2HEUA 1H45A 4EXKA 1XVYA 4F1YA 4DE8A 1RYOA 1Y4TA 2P1SA 3LSXA 3MWBA 3IX1A 1TWYA 1B6HA 1DTGA 3U93A 1MY1A 1Y3QA 4OENA 1H44A 4QFPA 2F7AA 3DM0A 3MC2A 2QS4A 3SEVA 4PQJA 4F2QA 1OLAA 4XIGQ 3BFUA 3WAEA 3JYRA 1LB8A 2H98A 4UA8A 4LZ7A 4DIGA 4R6HA 1MM7A 1IXIA 3PPOA 1B7UA 2Y7WA 4RJZA 1S9TA 1JEVA 4XKRA 5TP9A 1MPBA 5AA4A 1ZKBA 2D5WA 3N6UA 1YAEA 4ISUA 4F19A 3QSLA 3E9XA 2Y7IA 4I62A 3A3CA 4R74A 3SETA 4F31B 3U72A 3V89B 4NF6A 1MDQA 4GL0A 4TQUQ 3C33A 1N04A 1YTVA 4PFYA 1JETA 2UVIA 1EH3A 4YB5A 5KDTA 1OVTA 4O3BA 3S4UA 3IOVA 3U1OA 4RK9A 1IXCA 3D4CA 4Q8RA 3T9VA 4YKJA 5J1DA 1SQYA 4ZEDA 2Q89A 3DP8A 4H8JA 5I2KA 3MVXA 3G3HA 2Q88A 3U92A 4NWCA 4IO6A 4BDMA 3C32A 3VV5A 2XXQA 4GQOA 2B3BA 3M3FA 5AA3A 3MBPA 3CG3A 3S2VA 4KYEA 4H8IA 4IB2A 4FORA 1O63A 3KG2A 4YU0A 2PYYA 3D4GA 1NNPA 1A99A 1AOVA 5DVFA 4ONYA 4JBZA 1MDP1 3MZ1A 3VVDA 3QK6A 5CMCA 2KLFA 1Y9UA 2FYIA 4IGTA 2A5SA 2QMWA 3H6VA 3OO9A 3PMWA 1UTHA 5I57A 1B0LA 4PE5B 4PETA 3PV0E 4HTGA 1M5DA 2NVUB 2ONKE 3FJMA 4OEUA 3O9PA 4NMYA 1I69A 1B1XA 1SI1A 1LGBC 3EPEA 4OWDA 4EQ9A 2VD2A 3SDFA 1B3EA 4U4SA 1S7YA 4OEVA 4FECA 2XD2A 1OVBA 3K6UA 4QFNA 4ZEFA 3O6HA 4ELRA 1B7ZA 4WXJA 3T93B 3IL1B 4LZ5A 4BLAA 3VE1B 1MXXA 3LUYA 3KOSA 4JSDA 1N7WA 3MQ9A 4PP0A 1N84A 4ZZAA 2Z23A 1LFGA 3UP9A 1F9BA 1MM6A 1FTKA 4OFOA 1FTMA 4DZ1A 4F39A 3GBBA 4YKKA 1POTA 3H4ZA 3I3VA 1POY1 3FVGA 2ZNSA 3HV1A 3IJXB 1UQWA 4KCCA 5H8QA 2R6GE 4KCDA 1B3HA 1Y1MA 5DYHA 4H0WA 4U1ZA 2PMSA 2Z8DA 4U2RA 1P1OA 5BUUA 4R6YA 5CMKA 3KFMA 2HXWA 3E3KA 2IEEA 3K0VA 4MH5A 1OMPA 3K6XA 5I2NB 1D3KA 4G68B 1AIVA 2OWSA 3OXNA 1IXHA 1LAFE 3FIRA 3DP4A 3B6WA 4YKIA 3TELA 1A8FA 3L6HA 3IR1A 3VXCA 3FZVA 3RTFB 5LOMA 4OMBA 3G3FA 1UTBB 3LSFB 3U8QA 3GLBA 1PB8A 4NTLA 2DS9A 4EF2A 5DVIA 5KCJA 2D21A 2I6EA 2P2AA 3C4MA 1LBBA 3USDA 3W15C 1SVXB 1B58A 3G3IA 4H5FA 4RY1A 1MRPA 3S9EA 3MZ9A 2UXAA 1RYXA 2XX7A 4R9GA 1XT8A 5AA1A 3GBAA 3I5OA 4FAJA 1S50A 4E0WA 2ALUA 3MZBA 3OELA 5HM4B 3RQTA 3K1NA 5A5XB 3CSGA 1A8EA 4DLDA 3V8XB 4RPOA 2QSXA 4HCWA 5FHNA 2F78A 1B3GA 4F1UA 3T96B 4C1TA 4POWA 5AA2B 4GD5A 2A5TB 1M5CA 1N3XA 1P1NA 4QFLA 2B65A 1TFDA 2GHAA 4QHQA 2I0CA 3FATA 3FJGA 1B1HA 1VFEA 1A40A 3PD9A 2G29A 4LZ8A 4ZEKA 4M1VA 3A3UA 3ZS6A 4GF8A 4EUOA 3FXQA 1VFDA 4YKPA 3UN6A 5TU0A 3CRBA 4NF5B 1M5BA 2VHAA 1EZPA 3TPAA 3B7DA 4MBPA 2THIA 3TTRA 4MF3A 3M3LA 2DE4A 3S9NC 4ELPA 4AB6A 2O51A 4LQ2A 2DWIA 4R73A 5L9OA 1FQAA 5I59B 1LLSA 4E0XA 4OFLA 2XXHA 4JDFA 1DTZA 1QUIA 4HCYA 1LCFA 1ANFA 3DELB 2RKMA 3TFLA 4GFRA 1MY3A 2F5XA 5CBSA 4F18A 1AH5A 3K00A 2X26A 3SEXA 2DWJA 3HHGA 1NL5A 3CR9A 2ONRA 4ZE9A 4YB6A 4DDDA 3CIJA 2Q8JA 1XHYA 3ILUB 2HCAA 4AB5A 3SEYA 4H65A 4XKNA 1LCTA 1QW0A 3KBRA 1VSOA 2H4IA 3F11A 4WEPA 3UGWA 5CI5A 4H1XA 3T9HB 2F7CA 5I58B 1MPDA 3K1MA 2CMOA 4I8CA 1UIVA 3ILTB 3RGYA 2I48A 4L17A 4NE4A 3R6UA 4U21A 1QKAA 1FQFA 4YMBA 3GZGA 4IGRA 4POXA 4KI0E 5DEXA 3TQLA 5L9SA 4AQ4A 3SKPA 3HPIA 1B52A 2HAUA 2GFEA 2XX9A 4IO5A 4F3SA 1PB9A 3T22A 3N6TA 3V83A 5H8HB 1M5FA 2RC8A 2V84A 1A54A 2X7QA 2AL5A 3QAXA 4NF4B 3PMXA 4I1DA 1MXWA 2ZYNA 3FJ7A 2FNCA 4F29A 2NOOA 1AL3A 2VD3A 3VDFA 5DT6A 4NF8A 1MQJA 2ZXTA 1B9JA 2QPQA 2ONSA 3O28A 3TCGA 3H06B 3FD3A 1MG1A 1LAGE 5H8NA 1B5HA 3TTNA 3QYTA 4G8NA 1ZJLA 4HW8A 3EHTA 5IAIA 1T0KA 3KN3A 3T66A 2F36A 4KPTA 3HN0A 5I56B 4OYVA 2I49A 2NWJA 4XXUA 1P1UA 4ESXA 4H67A 1LFIA 1NNKA 4DXBA 3PPRA 2DSFA 4R6KA 1R9LA 2I0BA 1MY0A 2VOZA 3O66A 3PUXE 1VE4A 3P7IA 1B5JA 3THIA 4GWOA 3QUFA 1ZMGA 4TLLB 3ZSFA 2OBGA 3K2DA 4OFJA 5H8FA 2O1MA 4IO7A 5M2VA 1XOCA 2DXRA 3TTLA 5JTYB 3TKDA 4XTCQ 1LSTA 2I3VA 4OXVA 1OLCA 3N94A 2GRVA 1ZU0A 3T9UA 4ND9A 3PPNA 3B6TA 4XKQA 3UIFA 2YLNA 3TMGA 3FGSA 1SYHA 2O84X 1LBCA 3UORA 1Y1ZA 3O2AA 2XXVA 3E4RA 1CE2A 5FHOA 3OSQA 1DSNA 2QL3A 3W9WA 4JWXA 3L6GA 2Q2AA 4EF1A 3KGCA 5TPAA 1Y3PA 5F1QA 1EZ9A 1MXVA 1SBPA 3H6UA 4Z7EA 2PBWA 1P1WA 2F6PA 3IB0A 3G7WA 1EU8A 2RINA 1LB9A 3SERA 1HSEA 1ZLQA 3BFTA 1NMUA 3FXRA 1YPNA 2ZNTA 4F2OA 1MQHA 3OOAA 5I59A 3VLWA 3HCQA 4JWYA 2DQVA 2H25A 1GVCA 4C0RA 5AA2D 3MJNA 3TAJA 4X1BA 4N6PA 1URSA 3CG1A 3EF7A 4QRZA 1MS7A 2DP8A 2DE2A 1SYIA 5FTIA 4ECFA 3CVGA 3QUJA 1SDXA 1B51A 1MH3A 3C31A 3MVWA 2O7UA 3AXFA 1D9YA 3O29A 4HS7A 1N7XA 3U94A 1NH8A 4JSOA 1B2HA 2M8CA 5TP9B 2I4CA 5AA4B 2AIXA 3H03A 4WEDA 1EZOA 2AYSA 1MQIA 1SI0A 4NF6B 4H6DA 2F97A 5CMMA 3Q27A 4EQBA 4QF9A 2RF1A 1UIUA 3RNNA 3C34A 5I84A 4RNSA 5H8SA 1R9QA 1WVJA 3UA8A 1BKAA 3C9HA 3LBSA 5KDTB 2RC7A 4BDRA 4O3CA 3CI8A 2XXWA 4OESA 2O7IA 3FV1A 3MP6A 4BDQA 5ITOA 1MH4A 1IIWA 5I2KB 3LC8A 1GR2A 1GGGA 4EXLA 1USYH 4LA9A 5CC2A 4M4GA 3OEKA 3IO4A 1H3DA 3TQWA 2F34A 3KEIA 4LONB 3MPLA 1ZIUA 3C36A 2ABHA 3ECRA 4G2ZA 4G8HA 4RYAA 2HZKA 2E1SA 4OETA 3TODA 3K4UA 1ELJA 3MPKA 4R2BA 4DCYA 2H9BA 5KZTA 3VFJA 1FQDA 5FTHA 4JWOA 4G4PA 3IAZA 4OTEA 2OWTA 3OEMA 1B05A 2QS1A 3Q26A 1SW1A 1FW0A 3RLFE 3M3KA 3Q29A 4KR5A 3TTMA 1URDA 3K6WA 4KFQA 1UTHB 5I57B 2UYFA 2Z22A 1FQCA 2O6AA 1PBQA 3MVYA 4KQPA 1Y3NA 3TDJA 3MUQA 2YPNA 2DWAA 2PT1A 4ZDMA 4ZEIA 4NEDA 3KSJA 2O68A 4N13A 2DE3A 3EHUA 1BLFA 5B70A 2F6GA 1Z7NE 4BDNA 4MFIA 5CM6A 1PDAA 1SD3A 3FXUA 3TUSA 4LVQA 1DPEA 1B0HA 3TEPA 3K1PA 3PU5A 3K02A 1JEUA 3ODBA 1SW5A 3R26A 1URGA 4FE8A 3O97A 1US5A 1XVXA 3FUZA 3IK6B 1NFTA 1VR5A 4I9DA 4JB7A 3SEWA 2HZLA 2Y7RA 5K2YA 3H6TA 3DLNA 1IZ1A 2DXYA 5H8QB 4QSDA 3OENA 4LATA 4MLQA 2Y84A 3EQ1A 3Q25A 3KN8A 3VVFA 3S9LC 3I6VA 4G8MA 3CFLA 2FA7A 1LAHE 3OO8A 3OMBA 3IOTA 4IO3A 1JW4A 1N0TA 3ZKLA 2DWHA 1HSLA 4QFKA 4LUBA 3RUMA 1SW2A 3KZGA 3PUVE 5HBCA 2Y7KA 3W9VA 1P99A 1CB6A 4IY5A 3GXAA 1HSJA 2XXXA 5F7VA 1BTJA 3EN3A 2H99A 2XHDA 4IY6A 3LSWA 4WKMA 4EQ7A 2GH9A 2RC9A 4TOZA 3TYHA 5KCJB 1OIBA 1TFAA 4EDPA 1ZTYA 5ELVA 2O69A 4GL8A 4GXSB 1A7LA 1XC1A 3VLUA 2V3UA 1B4HA 1FQEA 4NWDA 1FTLA 2DVZA 3PUWE 4BDLA 4GIZA 1MXZA 1MXUA 4QSCA 1PC3A 4GVOA 1RKMA 4GOTA 1D4NA 3WAFA 3KJ7A 5IKBA 3OO7A 4F3BA 2YJPA 4BDOA 5CRYA 3TZAA 2HAVA 5ICTA 1II5A 5I2NA 1FQBA 1H76A 4G68A 3IORA 3KSXA 3RN8A 2V3QA 1IQ7A 1QJMA 5EHSA 4X1DA 3CFZA 3MAMA 2OJTA 3R7XA 4YZZA 4Q30B 2UVGA 5EYFA 1MXYA 1JQFA 1QUJA 1O7TA 1UTBA 3IO6A 4U23A 3PPPA 3MW0A 2ZMBA 4R75A 2I4BA 3SEUA 3SESA 5B7DA 3OSRA 4K3FA 4PFTA 1TT1A 1JVYA 3TCHA 1FCKA 3G3GA 4ZECA 1Y20A 2V3TA 5K2XA 2B3FA 1QUKA 4X9TA 2ESNA 1ZBMA 3PUYE 3H7MA 1Z7ME 4PFUA 4H5GA 3H3GA 1A55A 1PBPA 1MQGA 1LAXA 2H5YA 4ZE8A 2O1LA 3MVZA 3N26A 5A5XA 2PX1A 1NH7A 3PUZE 5FHMA 2Y7PA 2QMXA 1I6BA 4Z0IA 5AA2A 3HO7A 2F35A 1B40A 2A5TA 1NNTA 4YMAA 3CFXA 4DCXA 2REJA 2ZYMA 1B5IA 1FTJA 3G3KA 1NNFA 1JW5A 4QFOA 2QJEA 1SW4A 4GXAA 3KOTA 4THIA 1IXGA 1JNFA 3EHSA 5ITPA 1QKBA 1B32A 3O6GA 3IB1A 4RA1A 4MLVA 3K01A 4P11A 1B4ZA 4NF5A 2Z8FA 1M5EA 4RK2A 3OD7A 5DEXB 1BP5A 2REGA 1H43A 2XD3A 1IITA 5L8DA 3FASA 4KYDA 1D9VA 4GLIA 2UVJA 3TCFA 3BBRA 2OLBA 1Q1KA 4R9FA 1WDNA 3E13X 4O3AA 1NKXA 3JZJA 3JV9A 1I6QA 4ELQA 2NXOA 3PPQA 2QRYA 2VP1A 3IOUA 4QSEA 2OCUA 4OZ9A 4DXCA 1B7HA 4IO2A 4F3PA 4JXIA 1OQGA 4ZZEA 3CSBA 3M8UA 2OK2A 4KD5A 2XXTA 2G93A 4ELOA 2RCAA 4NF8B 1USYE 2Z8EA 4C1UA 1Q35A 4FEBA 2NUVA 3KN7A 1PEBA 5H8NB 5I58A 2HQ0A 4XKPA 2P0SA 2XXRA 3FVOA 3G3JA 1B3LA 3ONMA 4OERA 1GTKA 3FVKA 4YICA 1MQDA 2IA4A 3BKIB 3RT6B 1LFHA 1B3FA 2I58A 1US4A 2XXYA 3VLVA 2XX8A 4R72A 1KWHA 1J1NA 4TLMB 2CZLA 4FIMA 3IB2A 2XXIA 3FVNA 3MP8A 1IUDA 5JK4A 2X7PA 3K6VA 4F22A 1JVXA 4ESWA 4LQ5A 4OVJA 5H8HA 1DMBA 5H8FB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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