1I6AA

Crystal structure of the oxidized form of oxyr
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
b'ETMSGPLHIGLIPTVGPYLLPHIIPMLHQTFPKLEMYLHEAQTHQLLAQLDSGKLDAVILALVKESEAFIEVPLFDEPMLLAIYEDHPWANREAVPMADLAGEKLLMLEDGHCLRDQAMGFCFEAGADEDTHFRATSLETLRNMVAAGSGITLLPALAVPPERKRDGVVYLPAIKPEPRRTIGLVYRPGSPLRSRYEQLAEAIRARMDGHFD'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of the redox switch in the OxyR transcription factor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROGEN PEROXIDE-INDUCIBLE GENES ACTIVATOR
source organism Escherichia coli
molecule tags Transcription
total genus 62
structure length 212
sequence length 212
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-03-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1i6aA02
1MXVA 3HHGA 3SEVA 5CMMA 4AB5A 3MPLA 2RINA 5AA2D 3F11A 1A99A 1XT8A 4H8IA 1SD3A 5AA2B 4TLLB 4EDPA 3FVGA 4EF1A 2REGA 3OMBA 3PPRA 4KCCA 2H98A 1LCTA 3GBBA 3MVZA 3W9WA 2OLBA 3G7WA 2XXTA 2QMXA 2XD3A 3ILTB 2VP1A 3TODA 3IAZA 3L6HA 2QS3A 3LBSA 3WAEA 3EF7A 2AYSA 4ECFA 1D9VA 2R71A 2XXHA 3MW0A 1XVYA 4ZE9A 4M4GA 3M3LA 3PPNA 4Q0CA 3PUYE 3U92A 1URGA 4O3AA 1JW1A 3S4UA 1Y3QA 4IY5A 4OETA 2F35A 3IORA 5I58A 3WAFA 4LONB 1DTGA 4F2QA 2XX7A 2XXXA 4EUOA 3OD7A 5H8QA 3OXNA 3TDJA 2ZYKA 2O69A 3OSRA 3U8QA 3VXCA 4HS7A 2GFEA 2D3IA 1B0LA 3VVEA 1VR5A 5DEXB 3C33A 4DXBA 1P1OA 1MY1A 4R6YA 1DOTA 2QSXA 4RJZA 3OO6A 4MBPA 3SKPA 3T66A 1OQHA 1RYOA 4TQUQ 3H7MA 1WODA 1QULA 3V89B 1MXZA 5I84A 5H8NB 2DWIA 4F3SA 3CFZA 1S50A 5H8SA 3C32A 1ZU0A 4DCXA 3BFUA 2IEEA 1LSTA 5I56A 1MQDA 2D5WA 3TZAA 4F18A 1FQCA 3Q28A 1AL3A 4ELPA 3V8XB 4GQOA 4OTEA 1P99A 1CB6A 3TQWA 4H5FA 3A3UA 2F8DA 3CIJA 4C1TA 2DXRA 4MH5A 3K1PA 3C4MA 4QSDA 3PPQA 1FTMA 5CM6A 1VFDA 2CZLA 1MPCA 4OYVA 4XKNA 3G3IA 4NF6B 3RY3A 4BDOA 4FE8A 3SEXA 1LAGE 3LSWA 1EZPA 5I59A 4G4PA 4POWA 4JXIA 1SVXB 3FASA 3FD3A 4BDLA 3VVDA 2PBWA 1FTKA 3LSLA 4JSDA 3LR1A 3E9XA 2XXIA 4MLQA 1M5FA 3MVYA 1TFAA 4OZ9A 1IQ7A 3CG3A 3E4RA 3S9MC 4JWOA 1I6QA 3K6XA 1AOVA 2FA7A 3FVKA 3K2DA 5FTHA 1P1WA 3IB1A 4EQBA 4FAJA 1TWYA 1QJMA 1D4NA 4ZZEA 2P1SA 2I48A 5CMKA 3SEUA 1ZMGA 4GWOA 4R9GA 3IOWA 4BDQA 1L5TA 3K1MA 1B5JA 3E3KA 1MY3A 1FQEA 5HPQA 3O97A 4DXCA 4DLDA 4AB6A 4FJPA 3KN7A 2F7BA 4GXAA 2UVGA 4XKRA 1H43A 4RXLA 5TPAA 4BDMA 1B3HA 1OVBA 4ZS9A 4EQ7A 1FQDA 4KR5A 4KPTA 3KEIA 3QUFA 2HAUA 3KSJA 2XXPA 4G77A 1B3EA 1Y9UA 3SERA 1YPNA 4THIA 5KDTA 4X1DA 4C0RA 1MS7A 4KYEA 2QS2A 5I2NB 2RF1A 3CFLA 4F31B 5I2KA 4XXUA 3HCQA 4BDNA 3LSFB 3KJ7A 5DVJA 1MDQA 4I62A 5ICQA 4O3CA 4DDDA 5TP9A 4R72A 4OESA 3U93A 1I69A 1N7WA 4GFRA 1JVYA 1NKXA 2Z22A 4U1ZA 4HTGA 4H65A 1US5A 2UXAA 3ZKKA 2DYXA 1Y3NA 1FW0A 1SW1A 2IA4A 2HAVA 3O6GA 5A5XA 3EN3A 4ELQA 1UQWA 4NWCA 1NH8A 3FJMA 3QUJA 1Y1ZA 2ABHA 4EF2A 4I1DA 1B3GA 4QSCA 1B1XA 4NWDA 3DELB 3DP6A 3FXQA 2ZMBA 4ZE8A 4YB7A 3M3KA 1SQYA 2RC8A 4F1UA 4X9TA 4ZEFA 1USYE 3LUYA 2WKYA 3TKDA 1LFIA 3VLWA 5JK4A 2LAOA 4NF4A 3T9UA 4U23A 4GL0A 1MQIA 2V3QA 4Q30B 1FTLA 1IXIA 1D9YA 3TEPA 1N7XA 5CI5A 3T93B 4GIZA 1Y20A 4LZ7A 1O64A 5JTYA 4H1XA 2ESNA 2Q9TA 4DCYA 2ONSA 1IZ1A 4JDFA 2Y7RA 2Z23A 3MJNA 2HCAA 1PBQA 2Q2AA 3D4GA 3KOSA 1QVSA 1LAXA 2F5XA 1PC3A 4EXKA 4G8MA 3MAMA 2OCUA 4N13A 3VLVA 2QRYA 4WEDA 3I3VA 4P0IA 4F22A 4KFQA 5DTBA 2D21A 1MDP1 2OZZA 4OFOA 3K6WA 3H6WA 3BFTA 3QIMA 3VV5A 2Z8FA 4OERA 1BLFA 1NNFA 3V83A 3U1OA 1A54A 3TTLA 4G68C 4U22A 1URSA 2R6GE 5F1QA 1US4A 3FVNA 3VE1B 2QS4A 3RUMA 4KI0E 1XVXA 5ITPA 2XX8A 2I3WA 3MZ9A 3MP6A 4GVOA 1IXCA 1OQGA 3R7XA 1B3LA 4UA8A 1OLAA 1B05A 3S2VA 3CSBA 4RK2A 1BIYA 3FGSA 4GXSB 2E1SA 1TT1A 1B40A 3ODBA 1B52A 5CRYA 1OIBA 1JETA 3IX1A 3N5LA 4IO5A 5KCJB 4ZEDA 3C34A 3C9HA 5H8HB 4IGTA 1PEBA 4G8NA 2G93A 1DPPA 4F19A 4TOZA 2V3UA 3M3FA 1MXXA 3R26A 1S9TA 2PT2A 3K02A 4KYSA 4OVJA 4EXLA 5HM4B 4I8CA 1MG1A 2PMSA 3O9PA 1R9LA 4MFIA 1LFGA 2ZNTA 5L9MA 4YAHX 3OENA 4KD5A 1USYH 2ONRA 2DWAA 2XXQA 3TYHA 2A5TB 3TPAA 2UVIA 1FTJA 3PUZE 3W15C 1QKBA 4NF5A 4XIGQ 3GLBA 1B5HA 4H8JA 3ILUB 3MUQA 2ZYNA 1TXFA 1SW4A 2VD2A 3SETA 1H3DA 5KZTA 1MY0A 2UYEA 3PGFA 1F9BA 2I0CA 3IL1B 3K0VA 5TU0A 4FIMA 3THIA 1MXUA 4XTCQ 2KLFA 5LOMA 2H4IA 3RPWA 1NH7A 2H99A 3VVFA 4G2ZA 2VD3A 5AA3A 4Q5TA 4PFTA 3O6IA 3SEWA 4OMBA 2X7PA 1QKAA 2V84A 1DPEA 3MVXA 1UIVA 5AA4A 1ZIUA 1UIUA 2I0BA 4RPNA 3CG1A 3G3GA 3ZS6A 3TCHA 3GZGA 3IJXB 5EHSA 4FORA 2PYYA 1QUIA 4RA1A 3S9NC 3MP1A 3K6UA 1B7ZA 1BTJA 1B32A 5F7VA 1LAHE 4YICA 3FATA 1Z7ME 1JEVA 4IO6A 3MPKA 4MLVA 4ZDMA 3TAJA 3BBRA 1S7YA 3Q26A 5L9SA 4EQ9A 1AMFA 1ZJLA 4NF8B 2QPQA 3IO6A 1FQBA 1IEJA 3B6WA 3FIRA 1JNFA 4U4XA 5H8QB 4R73A 3FUZA 4FEBA 2F36A 1VE4A 3IO4A 3Q25A 1OMPA 2DQVA 2XXVA 4U4SA 5DYHA 2I3VA 2DE3A 1IXGA 3IR1A 5ISUA 4RK9A 1XC1A 3RTWB 5DVIA 4M1VA 4LZ8A 4N6PA 2Q89A 3VFJA 5DVFA 1MM7A 1UTHA 1N3WA 5I57A 3OEKA 1LBBA 1FCKA 5ELVA 2O51A 1M5DA 3K4UA 2VOZA 2ZNSA 1ZLQA 3PD9A 5I56B 2NOOA 3BKIB 4WEPA 1II5A 1TFDA 3KBRA 2UVHA 3CVGA 2O84X 1ATGA 3UIFA 5CMCA 5L9OA 1GR2A 4KCDA 3PMWA 2GHBA 1JW5A 3HV1A 4G68B 1MXWA 3CR9A 4C1UA 1KWHA 4QFLA 1IUDA 1H45A 2Y84A 4PETA 1O63A 1HSEA 3OO9A 3A3CA 3TTRA 3A09A 3UK4A 1P1UA 1SDXA 4ELOA 2I4BA 3VDFA 4IO4A 4F39A 4ESXA 5K2YA 1SYIA 1A55A 2F6GA 4R75A 3RTFB 1B5IA 1EH3A 1XS5A 1BP5A 1YAEA 3EHTA 1M5CA 2B3FA 4GD5A 1R1NA 5ICTA 3JZJA 2QS1A 2A5SA 3EPEA 3OOAA 1N76A 1Q1KA 2FNCA 4DZ1A 2XXUA 1LB9A 1PB8A 1MY4A 2PVUA 2NWJA 1PBPA 1NMUA 3O66A 3HSTA 3U72A 1I6AA 4ZEIA 2OWTA 2F6PA 4PP0A 5IKBA 5H8FA 4HCWA 2I58A 2F97A 4I9DA 5L8DA 4NE4A 4QFKA 2O6AA 4POXA 3QYTA 4R6HA 2OWSA 3KN8A 4OFJA 2REJA 3O6HA 1VSOA 3IB2A 4LATA 1ZBMA 1IIWA 4GLIA 1OLCA 1SYHA 1GGGA 4P11A 2HZLA 3RGYA 3T22A 2B65A 2ONKE 4H5GA 3T96B 4YB5A 4JSOA 4N07A 4XKQA 2E0SA 3UORA 1MPDA 1QW0A 2FYIA 3SEYA 4F1YA 1QUKA 3PPOA 2O7UA 2NUVA 5AA2A 3EHUA 3KZGA 2AIXA 3N6UA 1UTBB 3O29A 4IO7A 1LLSA 4ZECA 3N94A 4ESWA 3K1NA 3UN6A 1NNTA 4BLAA 2OJTA 5KDTB 2DWJA 4K3FA 1J1NA 1WVJA 1ZKBA 3Q27A 2P2AA 2Z8DA 4LP2B 2BJJX 1B1HA 4F3PA 3TQLA 1DSNA 2CMOA 5I2KB 2QL3A 1EZ9A 1MY2A 3FJGA 1D3KA 3V5AA 3MVWA 3TTKA 1LAFE 5TP9B 2F7AA 2ZYMA 2XD2A 4JBZA 4LUBA 3CRBA 2Q2CA 1SBPA 4YKIA 4IGRA 4QF9A 2RCBA 2O68A 3GXAA 4U2RA 4PFUA 1PB9A 1IXHA 3VXBA 5A5XB 2HZKA 4GOTA 3PMXA 5DEXA 3N26A 4YMAA 3H6UA 4YU0A 1A8EA 2QJEA 4QFPA 1MH3A 1N84A 1NL5A 4DIGA 3TTNA 1POTA 2VHAA 1MQGA 3QK6A 3UGWA 3RLFE 3GBAA 2NXOA 5H8NA 2RCAA 3H3GA 1JQFA 3K01A 4X1BA 2AL4A 1N0TA 4QRZA 2F78A 2YJPA 4JB7A 2RC7A 4NF4B 4GL8A 1PDAA 3Q29A 2Y7IA 2M8CA 3N6TA 4YKKA 3B6QA 1B0HA 4L17A 3FV1A 5EHMA 2HFBA 1SI1A 4QSEA 4F3BA 2B3BA 5JTYB 4NEDA 4R74A 1Y4CA 1A40A 1ZTYA 3B6TA 3G3HA 2GHAA 2DWHA 5CBRA 3FVOA 1GVCA 2HXWA 2G29A 3R6UA 3RT6B 4YB6A 3E13X 5ITOA 4OXVA 2PX1A 5AE4A 4NF6A 1B51A 3OO7A 3ONMA 3MC2A 3TELA 2DE4A 3B7DA 3T9XB 1FQFA 3OO8A 1B58A 1B7HA 5IAIA 1MH4A 4NF8A 2ANJA 3S9EA 2RC9A 1AH5A 3O28A 4G8HA 4JWXA 4GF8A 3QAXA 1WDNA 1B2HA 3DLNA 3H03A 4OHNA 3ZSFA 4QFNA 4H6DA 1JEUA 4F2OA 3RNNA 1NFTA 3PMVA 1POY1 3MZ1A 3H06B 1MRPA 2VGQA 1B4ZA 3IOTA 3U94A 1CE2A 3EQ1A 1SI0A 3RQTA 4H0WA 2X26A 1B6HA 4FATA 3HO7A 3OELA 3H6VA 4TLMB 2OBGA 3S9LC 2DE2A 2THIA 1MQJA 3UP9A 3K00A 2DVZA 3DM0A 4UACA 2DOJA 4F1VA 3HHFA 1IITA 2O7IA 2H5YA 2PT1A 4OENA 1YCJA 4G68A 4RPOA 2Q8JA 2XHDA 2I49A 3IOVA 1MQHA 1LFHA 4Z7EA 2OK2A 3ECRA 3TUSA 1P1NA 5FHMA 3TMGA 4R2FA 2QMWA 2V93A 5EYFA 4LQ2A 1RYXA 3P7IA 3UA8A 4NTLA 5I58B 4NMYA 4HCYA 2AL5A 3G3FA 4Z0IA 4YKPA 3DP8A 3PUXE 5CBSA 4ISUA 1MM6A 2XX9A 2Y7PA 5I2NA 1JW4A 1DTZA 4NF5B 3W9VA 5FHNA 3OSQA 1LB8A 1R9QA 3I5OA 2XXRA 4MF3A 1M5EA 3MWBA 4RNSA 5BWJA 4QHQA 4PFYA 3LC8A 1JVXA 3JV9A 1LBCA 3H4ZA 2GRVA 2I6EA 1Y3PA 3CI8A 3SESA 3FV2A 3PU5A 1B4HA 3I6VA 2Q88A 2DP8A 2R9JA 5AA4B 1FQAA 2XXYA 5J1DA 1MPBA 3KGCA 4KQPA 4IB2A 1GTKA 2Y7KA 5FTIA 3T9HB 4OEUA 3ZKLA 4YMBA 1O7TA 3KFMA 3MP8A 3KSXA 3C31A 5CMBA 4JWYA 1GV8A 2H9BA 5JEIA 4O3BA 4BDRA 4PQJA 4U1OA 2X7QA 1N04A 3MQ9A 1B9JA 4FECA 2HEUA 3KOTA 3CSGA 4AQ4A 3KG2A 1UTBA 1XHYA 2ALUA 1VFEA 2YPNA 1AIVA 5I59B 1NNPA 2I4CA 3DP4A 3TTMA 4ND9A 2ZYOA 3RN8A 1HSJA 1YTVA 3G3KA 5K2XA 4WXJA 3EHSA 5M2VA 4YKJA 3D4CA 1QUJA 4PE5B 4R2BA 3IB0A 4LZ5A 4QFOA 2NVUB 1Z7NE 5CC2A 4E0WA 3M8UA 3QXMA 1UTHB 1SW5A 2O1LA 5BUUA 5I57B 1EU8A 3LSXA 5HBCA 4HW8A 3IJOB 1N3XA 4Q8RA 1HSLA 2DS9A 1A7LA 4IY6A 4H67A 4OEVA 4FEDA 4ONYA 4ZEKA 1I6BA 3SDFA 4ZEBA 1RKMA 4KHZE 1ELJA 4ZZAA 3PPPA 2UVJA 2YLNA 3HPIA 1M5BA 4DXUA 3O2AA 3USDA 4IO3A 2V25A 3FXUA 3PV0E 2P0SA 3KJTA 4ELRA 3TCFA 2HQ0A 3FZVA 2RKMA 3VLUA 1H44A 4GRKA 3TCGA 3L6GA 4PFWA 1DMBA 3FJ7A 5TPAB 5DT6A 3IK6B 4OQOA 3FXRA 2XXWA 4YZZA 1A8FA 4DE8A 1B46A 2DXYA 2Z8EA 2V3TA 1SW2A 1LCFA 5KCJA 3K6VA 3AXFA 3G3JA 3H6TA 2DVCA 2H25A 4LVQA 2ZXTA 2F7CA 5H8HA 1P1QA 2W7YA 3IOUA 3QSLA 4RY1A 4RYAA 4P0GA 3JYRA 1B3FA 2UYFA 1Y4TA 1T0KA 3CFXA 5B7DA 1BKAA 1OVTA 1Y1MA 5B70A 4IO2A 4F29A 4KYDA 4WKMA 3T9VA 3KN3A 2DSFA 5FHOA 1LGBC 1Q35A 5H8FB 4R9FA 1H76A 1B7UA 4X48A 2F34A 3TFLA 2GH9A 4XKPA 5AA1A 2A5TA 3MZBA 3MBPA 4LQ5A 1FTOA 3C36A 3OEMA 4OFLA 1R6ZA 2Y7WA 1MXYA 1XOCA 2O1MA 3C35A 3PD8A 4E0XA 1EZOA 2ZNUA 1URDA 1NNKA 4LA9A 4F3GA 1ANFA 3PUWE 4U21A 1PB7A 3RT8A 4OWDA 4R6KA 3HN0A 3PUVE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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