1IC7Y

Crystal structure of hyhel-10 fv mutant(hd32a99a)-hen lysozyme complex
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Protein binding/hydrolase
molecule keywords LYSOZYME BINDING IG KAPPA CHAIN
publication title Structural evidence for entropic contribution of salt bridge formation to a protein antigen-antibody interaction: the case of hen lysozyme-HyHEL-10 Fv complex.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 49
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
Y PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ic7Y00
1G7JC 3RU5A 2EKSC 4H8XA 2I25L 1GF0A 2FBBA 4HJYA 5C6JA 4ANRA 1GB3A 4XJFA 4NGVA 1NBYC 2Z2EA 1UIDA 3T6UA 4A7DA 1IR9A 5APCA 3N9CA 4KPMA 5A3EA 1GFHA 1D0LA 1RJCB 2LYMA 2HU3A 4B4EA 2DQDY 3A67Y 1KIQC 1XFPL 5T3FA 1LMAA 2PC2A 2MEAA 154LA 4NHPA 1T3PA 4OWCA 4ETAA 1JEFA 1QSAA 1RCMA 1GF7A 1HSXA 2ZNWY 3TXKA 3ZEKA 2ZWBA 1GXV2 4NG1A 1DQJC 1JSFA 3T36A 1B7PA 3W6AA 3RT5X 1IOCA 4M4OA 5LVHA 5HNCA 1LZ9A 2LZ2A 3CT0A 3EO5A 4LT2A 5KXPA 4N5RA 1DPXA 5AMYA 3TMUA 1JIYA 3AGGG 1YL0X 2F4AA 4FJRA 1D0MA 1GFAA 4IJ4A 4EOFA 1UBZA 1WQPA 4NG8A 2WARA 1LSYA 3FE0A 3J4GA 1GB6A 4J0LA 3G3AB 5LA8A 4QEQA 2BAAA 1LSFA 3AGIA 4WG7A 3ULRA 4H92A 1C10A 1GE1A 1AZFA 1LYZA 4XJGA 4QGZA 4GCFA 5APFA 4OW1A 2EQLA 5B07A 4DC4A 1GBWA 1OUDA 4FDYA 1IWXA 1LSNA 3QE8A 5DN5A 5ILFA 1LAAA 4WM3A 4DD9A 1D0KA 2Z38A 1E8LA 1LHJA 4WM2A 4GN3A 1NKHA 1YKXX 1BB3A 4TTDA 207LA 4WM5A 3N9EA 1REMA 3WU9A 1GF4A 1WQNA 3TMVA 3WVYA 1REYA 1UIBA 2DBTA 3RNXA 4L41A 3A8ZA 3TXEA 1BB5A 2YSSC 1IIZA 4H93A 1UUZC 1AT6A 4PPOA 1LSCA 1LZTA 2W1YA 1DXJA 1LZBA 1UIAA 3WUMA 2G4NA 1OUGA 3ATNA 4GLVA 2MEDA 3WYHA 2HU1A 3HBEX 3ZVQA 4ZEEA 4WM1A 4H1PA 1B5UA 4LYMA 1LJJA 1GFTA 5IDDA 1IO5A 1OUIA 1CKFA 5FDJA 1HENA 3AJNA 1CKGA 2BQNA 1BB6A 5LAGA 2BQIA 4H8ZA 1G7HC 1RE2A 4G49A 2YBNA 4MCKA 1GF8A 1GBYA 1IC4Y 2B5ZA 1I20A 3CT1A 3EMSA 1FLWA 4OWHA 5LYMA 1GFUA 3IJVA 5APDA 1UACY 1LJHA 1B7LA 1LZNA 1XGUC 2XJWA 3AZ6A 5ILCA 1HNLA 4LT3A 4NGKA 1DKKA 3TMXA 1CKCA 3AZ4A 1CKDA 3TXJA 5KXWA 4HSFA 1LSZA 4LYZA 1LSMA 4O34A 3WL2A 4C3WA 1LMNA 1B5VA 1FKVA 5E4PA 3K3TA 4YM8A 5B05A 1H6MA 1B9OA 4X3BA 1LYYA 4C5FA 5FEKA 3B0KA 1A4VA 2BPUA 1LJNA 5M1YA 135LA 1WVVA 1GB8A 1GFEA 4H90A 2Z19A 2YBMA 4BAPA 4ETCA 2DQCY 1GFGA 2BQFA 2HTXA 2BLYA 4OWEA 4B1AA 3A6CY 4AGAA 2XBSA 2AUBA 3BKHA 1V7TA 4NHSA 1B2KA 1XGRC 1LKRA 1IP4A 1LZ8A 1IEEA 2BQLA 4ET8A 1LZRA 1IP6A 1XEIA 1PZYA 1HERA 1WQOA 1VDPA 2EPEA 3FI7A 4H9BA 4MR1A 5HNLA 1LJ4A 2BQBA 4NGZA 4RDSA 1EQ4A 5FSTA 3A93A 1FKQA 1BB7A 1JKDA 1GFJA 3HFMY 1WVUA 4H94A 1C45A 4DYGA 1WQQA 1FDLY 1IP7A 5C6LA 5KXKA 1ZMYL 1LMCA 1QDRA 2Z2FA 4HPEA 4PGJB 2H9JA 1YAPA 3WULA 1LHKA 1NF5A 2D6BA 4CFOA 4TSCA 3QNGA 1CKHA 4XJDA 1OUEA 1OUJA 4GLAA 1GE4A 1HEPA 2YBHA 5HMJA 5LXWA 6LYZA 1GEVA 1GFVA 3WH1A 4HTNA 4LZTA 3CT5A 1JJ1A 5D5FA 1AM7A 4UWNA 1NMMA 1XGQC 2W1XA 3SP3A 4OWAA 4Z46A 4NGOA 1H87A 1IY3A 2W1MA 2ZILA 1MELL 133LA 1LHLA 4DDAA 4OOTA 1GEZA 1UICA 4UWUA 4WLDA 5KKIA 5LYTA 1GB0A 1LZ1A 4OWBA 4RLMA 1ALCA 5C6IA 3W6EA 5B1FA 4W94A 1JHLA 1F0WA 1LSPA 3B0OA 3CSZA 3WUNA 1IOQA 3G3BB 4XYYA 4WG1A 1AKIA 5APEA 4YENA 3WU8A 1GF5A 1LZGA 4ETBA 1HELA 3GXRA 4DD1A 1W6ZA 1YAQA 1GD6A 3F6ZA 1EL1A 2YBIA 4J1BA 4RW1A 1REXA 3LYMA 4NSIA 4OOOA 3TXGA 4AXTA 4WM4A 5JENB 1IP1A 1QIOA 1T6VL 5KKJA 1YANA 4WLXA 3WXUA 132LA 4IATA 4PRUA 2HEBA 1J1XY 1YKZX 1FLQA 4WLTA 3A90A 3LYTA 5E9RA 1B7SA 1JKAA 1KXYA 3A6BY 4KT3A 1WQRA 3TXBA 3W6FA 1ZVYB 4XJIA 5LAFA 1NWGA 4N1EI 1B0DA 1LYSA 2LHMA 4XJBA 1CJ7A 4J7VA 5IELA 2ZIJA 4DD3A 1UA6Y 1LMOA 4LYOA 5FELA 4YEMA 2ZYCA 4E3UA 2ZQ3A 1HMLA 2DQGY 5DLAA 1LMPA 1OUHA 2MEHA 3A3QA 5K7OA 1C08C 1RFPA 2I26L 1DI4A 5KXSA 1WTMA 5KY1A 3M3UA 1JTPL 4NHQA 4MSTA 4CFPA 7LYZA 1UCOA 1ZV5L 1JKBA 4YF2A 4H9HA 2YBLA 2BQMA 2W1LA 4H8YA 3A95A 4DWXA 2C8PA 4HJZA 1YIKA 2DQAA 2G4PA 1HF4A 1KXXA 1VFBC 2DQJY 1HSWA 2MECA 2ZYPA 4N1CC 2A7DA 1LSEA 3B6LA 1DKJA 1HFZA 3D9AC 2BQCA 1NQIA 2DQEY 5KXYA 1MLCE 4NY5A 3TXDA 4HTQA 1KXWA 4YOPA 1LJKA 1IP2A 1C43A 1UIGA 1LJEA 5LA5A 2F4GA 4LYCA 5F9UA 2MEGA 2Z18A 3A34A 1IWVA 1JJ3A 1W08A 4Z3MA 1IY4A 1LHHA 1IR8A 4NGIA 2F2NA 1GHLA 1SLYA 2HUBA 4LYTA 5I53A 4HJVA 4LGKA 5KJ9A 2BQOA 5B06A 3P64A 4NGJA 4B49A 4NWHA 1GE3A 4II8A 1HEOA 3LYZA 6LYTA 4H9AA 2BLXA 1ZVHL 1IX0A 3LYOA 2BQKA 4DD0A 3AZ7A 5LVKA 3TMWA 4NEBA 1KIRC 3D3DA 1LZCA 4TUNA 1HMKA 4WMGA 2D91A 2DKVA 3BKVA 2G4QA 4GCEA 1LTMA 1D9UA 153LA 2DQHY 4N0JA 1JTTL 4KXIA 1JPOA 4KL7A 5DL9A 3WPLA 4UWVA 1LOZA 1BB4A 3KAMA 4ET9A 4BS7A 4PHIA 4H9FA 1QUSA 1HFXA 1LMQA 1DPWA 3W6BA 4HV2A 4DT3A 2YDGA 1HHLA 1B5WA 5KXRA 1TEWA 4M6DA 1IVMA 3OJPA 2ZIKA 2BQJA 3RZ4A 4J1AA 4TWSA 5LINA 3MGWA 1GFRA 1IOSA 1BQLY 1IWZA 3P4ZA 1J1OY 1O23A 1UC0A 4CGEA 1B7QA 1XEKA 1LJGA 2I6ZA 1BVXA 5J7CA 4LFPA 1V7SA 208LA 3A94A 4G9SA 3B0IA 4IASA 1TCYA 1B5XA 1UIFA 4GN5C 1OQMA 5LYZA 1LZSA 2A7FA 4NGLA 3GXKA 3LZTA 3OK0A 1BVKC 4H9IA 5FCPA 5KXOA 5KXNA 3A92A 1N4FA 1NDGC 2YVBA 5I4WA 1LHIA 1BWIA 1GBZA 4YEOA 1A2YC 1LYOA 1B7RA 2CDSA 2Z39A 1QSWA 4GCBA 1LZEA 4HPIA 3AGHA 3WU7A 1GBOA 5I4XA 1YKYX 4QDNA 1GB5A 3IWRA 1XGPC 1LJIA 2LZTA 4HV1A 5B59A 2RSCA 4GCCA 4WM6A 4BAFA 1Z55A 1XSFA 2Y8PA 1LCNA 1C7PA 1LJFA 2BQAA 1LZYA 1GWDA 1NDMC 1DI5A 1GE2A 1JITA 1HFYA 1P2CC 3A3RX 4PJ2C 1INUA 4WO9A 4ZFPA 4P2EA 1NBZC 3WPJA 1FBIX 5KXTA 5F81A 1JKCA 1G7LC 1CJ8A 1LSBA 1IWTA 1BHZA 3N9AA 1QUTA 4R6CA 5A3ZA 2GV0A 5IHGA 4G4CA 2D4KA 2HEAA 4TSBA 1IORA 1I1ZA 3ATOA 1LJ3A 4LT0A 4NSJA 1D6QA 1TBYA 1YL1X 2CJLA 5KXMA 4WOAA 3AW7A 4NFVA 1LZ4A 2BQHA 3QY4A 5F14A 3IJUA 1JTOL 1JUGA 2BQDA 2D4IA 1YQVY 2FYCA 3CSRA 4DDBA 1VATA 2FBDA 1VAUA 1G7IC 1TDYA 4ETEA 1WTNA 9LYZA 3EXDA 4N8ZA 3P65A 4RLNA 4B0DA 2HECA 3W3EA 1B5YA 1FLUA 1VDSA 2CWIA 1J1PY 4H91A 1EQ5A 1YROA 4WL7A 1VDQA 1LZ5A 1HEQA 4LYBA 1GAZA 3HBHA 1YILA 2YBJA 3AYQA 1GBXA 2IHLA 3WVXA 4ETDA 2ZNXY 4ML7A 4R0FA 4NGWA 1TAYA 5DM9A 1F6SA 3W6CA 3LZ2A 3WW5A 4NIJA 2VB1A 1UIHA 2X0AA 1BWHA 5HLLA 3LHMA 4XJHA 4NSGA 3VWOA 8LYZA 3EBAB 3TXHA 4DD2A 4QY9A 1IP3A 1IP5A 1SQ2L 1GXXA 4U3XB 1LZDA 5HQ1A 3WXTA 2Q0MX 3E3DA 1VEDA 2MEFA 3ZVQB 3AW6A 4GN4A 5DN4A 2HEEA 1GB2A 1IR7A 5II3A 2N5ZA 1F10A 1F6RA 1VDTA 1GB7A 1YAOA 2BQGA 1GDWA 2C8OA 2EIZC 2HEFA 2LYOA 5F16A 4B4IA 1QTEA 5F9XA 5I5QA 1LSGA 1GAYA 5LVGA 2XBRA 3WPKA 5L3HA 5KXZA 2MEEA 1LPIA 2MEBA 1B5ZA 4I8SA 2LYZA 1BGIA 1CJ9A 4CHXA 1IWUA 194LA 4WLYA 3A96A 5KXLA 4WO6A 4TX7A 3WW6A 1C46A 1HC0A 1B7OA 1AT5A 1NHEA 4H9CA 3B72A 4EMNA 4D9ZA 1G7MC 1WQMA 1GPQC 1QQYA 1B7MA 1YAMA 2BQEA 3TXIA 2FYDA 5HMVA 1OUFA 1IC5Y 2NWDX 1REZA 1JSEA 5FHWA 1LMTA 1GE0A 1OUAA 1HEWA 1B7NA 1QTKA 2H9KA 2IFFY 4XADA 4BADA 1LZ6A 1GBSA 4NSHA 4NHIA 4W96A 4G4HA 5EBHA 1GF6A 2ZQ4A 1GB9A 1GFKA 1LZAA 1QDTA 2H5ZA 1OUBA 3AZ5A 3P66A 5I54A 3AB6A 3TXFA 1GDXA 1RI8B 3CQLA 4XN6A 4NWEA 4B4JA 1PS5A 1FLYA 4LFXA 4G4BA 3WMKA 5LVIA 4DD7A 4WL6A 193LA 4CJ2A 2F30A 134LA 3WUAA 4PRQA 3HBDA 1JISA 4N9RA 1IWWA 2XTHA 3M18B 1FN5A 3CB7A 1XGTC 2HEDA 3W6DA 1XEJA 3A91A 5L9JA 4Z41A 4Z98A 1DI3A 1IWYA 1HEMA 3P68A 1BWJA 2DQIY 2Z37A 4LT1A 4RW2A 4HP0A 3RW8A 2DQFC 4I0CA 1LKSA 1DZBX 1JWRA 1CJ6A 1LHMA 1EQEA 5L3IA 5LVJA 4HTKA 5KXXA 4ZIXA 4XENA 3CSQA 4NGYA 1UIEA 2MEIA 4NHTA 5D5CA 4H9EA 1LSAA 4GCDA 1IC7Y 5I4YA 1GF3A 2CGIA 3LN2A 1D6PA 2D4JA 1LSDA 5LIOA 1GF9A 1I56A 1IOTA 1CNSA 1KIPC 2Z12A 4DDCA 1OP9B 5B1GA 1JJ0A 1OUCA 3J6KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1G7JC 3DNAA 3SN6R 2EKSC 205LA 1L54A 1NBYC 4A7DA 1D0LA 177LA 1RJCB 2DQDY 1KIQC 1L39A 1LGWA 2PC2A 2MEAA 154LA 4NHPA 1T3PA 4ETAA 220LA 1HSXA 230LA 3ZEKA 2ZWBA 1PQKA 1L80A 1SWYA 3RT5X 1QUHA 1PQIA 2LZ2A 4LT2A 4N5RA 2F47A 4EOFA 223LA 4NG8A 3J4GA 4J0LA 1GB6A 1KY1A 1LSFA 4WG7A 1JTMA 1QUDA 2NTHA 4H92A 4XJGA 1AZFA 1LYZA 4GCFA 231LA 1OUDA 4FDYA 1LSNA 3HTDA 4WM5A 4PJZA 3N9EA 3WU9A 1L82A 209LA 3WVYA 4L41A 3TXEA 1IIZA 4EKSA 232LA 1AT6A 1LGUA 4GLVA 1L75A 1G06A 4LYMA 1LJJA 1CKGA 1PQOA 1RE2A 2YBNA 3EMSA 1FLWA 5LYMA 1GFUA 1LJHA 1C6KA 1WTHA 2O4WA 2QARC 4HSFA 2RAYX 4C3WA 1B5VA 5E4PA 5B05A 1C66A 1B9OA 4YXAC 2Z19A 2RBOA 3ODUA 4OWEA 1NHBA 125LA 1QTZA 168LA 3BKHA 1B2KA 2RBRA 1PZYA 1HERA 214LA 1VDPA 2EPEA 4MR1A 4H9BA 201LA 1OWYA 4RDSA 233LA 249LA 1G0PA 1JKDA 4DYGA 1WQQA 1L29A 1L21A 173LA 1C61A 2H9JA 3G3WA 1G07A 2D6BA 4CFOA 4TSCA 1QS9A 4XJDA 1L72A 1HEPA 5LXWA 1G0KA 1C6EA 1L49A 3SP3A 4YX7C 1H87A 3SB7A 1L69A 1MELL 133LA 3HH3A 1DYGA 1PQMA 1GB0A 1JHLA 1LSPA 1IOQA 1CVKA 1DYAA 3WU8A 4DD1A 3GXRA 1DYDA 3F6ZA 4RW1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G7J C;  3RU5 A;  2EKS C;  4H8X A;  2I25 L;  1GF0 A;  2FBB A;  4HJY A;  5C6J A;  4ANR A;  1GB3 A;  4XJF A;  4NGV A;  1NBY C;  2Z2E A;  1UID A;  3T6U A;  4A7D A;  1IR9 A;  5APC A;  3N9C A;  4KPM A;  5A3E A;  1GFH A;  1D0L A;  1RJC B;  2LYM A;  2HU3 A;  4B4E A;  2DQD Y;  3A67 Y;  1KIQ C;  1XFP L;  5T3F A;  1LMA A;  2PC2 A;  2MEA A;  154L A;  4NHP A;  1T3P A;  4OWC A;  4ETA A;  1JEF A;  1QSA A;  1RCM A;  1GF7 A;  1HSX A;  2ZNW Y;  3TXK A;  3ZEK A;  2ZWB A;  1GXV 2;  4NG1 A;  1DQJ C;  1JSF A;  3T36 A;  1B7P A;  3W6A A;  3RT5 X;  1IOC A;  4M4O A;  5LVH A;  5HNC A;  1LZ9 A;  2LZ2 A;  3CT0 A;  3EO5 A;  4LT2 A;  5KXP A;  4N5R A;  1DPX A;  5AMY A;  3TMU A;  1JIY A;  3AGG G;  1YL0 X;  2F4A A;  4FJR A;  1D0M A;  1GFA A;  4IJ4 A;  4EOF A;  1UBZ A;  1WQP A;  4NG8 A;  2WAR A;  1LSY A;  3FE0 A;  3J4G A;  1GB6 A;  4J0L A;  3G3A B;  5LA8 A;  4QEQ A;  2BAA A;  1LSF A;  3AGI A;  4WG7 A;  3ULR A;  4H92 A;  1C10 A;  1GE1 A;  1AZF A;  1LYZ A;  4XJG A;  4QGZ A;  4GCF A;  5APF A;  4OW1 A;  2EQL A;  5B07 A;  4DC4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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