1IG8A

Crystal structure of yeast hexokinase pii with the correct amino acid sequence
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
469
structure length
469
Chain Sequence
DVPKELMQQIENFEKIFTVPTETLQAVTKHFISELEKGLSKKGGNIPMIPGWVMDFPTGKESGDFLAIDLGGTNLRVVLVKLGGDRTFDTTQSKYRLPDAMRTTQNPDELWEFIADSLKAFIDEQFPQGISEPIPLGFTFSFPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNIENHDVVPMLQKQITKRNIPIEVVALINDTTGTLVASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAYYDVCSDIEKLQGKLSDDIPPSAPMAINCEYGSFDNEHVVLPRTKYDITIDEESPRPGQQTFEKMSSGYYLGEILRLALMDMYKQGFIFKNQDLSKFDKPFVMDTSYPARIEEDPFENLEDTDDLFQNEFGINTTVQERKLIRRLSELIGARAARLSVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNRYPGFKEKAANALKDIYGWTQTSLDDYPIKIVPAEDGSGAGAAVIAALAQKRIAEGKSVGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The high resolution crystal structure of yeast hexokinase PII with the correct primary sequence provides new insights into its mechanism of action.
pubmed doi rcsb
molecule keywords hexokinase PII
molecule tags Transferase
total genus 163
structure length 469
sequence length 469
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2001-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ig8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1ig8A03
3FFKB 2YJEA 5AZJB 5AQTA 3SMSA 3D7EO 1BWFO 3M1FA 4FOIA 3BF3A 2P9IB 1MWKA 4BRAA 3CQYA 5AQLA 2H3GX 3VGLA 3ATVA 3CERA 4DHYA 1GLBG 1BA1A 2QWNA 4QS9A 5KPZA 3SK3A 3H46O 1DKGD 3QFPA 3FZMA 3P4IA 1NM1A 5AQJA 4C23A 4WYBA 3D2FB 4FPAA 4H0VB 5KQ8A 5AQUA 3UB5A 2E2OA 1MDUB 1GLLO 4BQLA 3VETA 2OANA 2D1KA 1NGAA 3ZEUA 1C0FA 4BG8A 2PBDA 1GLFO 4MLEA 4H0OA 1TYQA 2I7PA 2NRHA 4F9OA 3VEVA 4CZMA 5AFUA 1D4XA 2YJFA 4FWPA 2E20A 5AFUH 3EL2A 5AQHA 4M63C 5F1XA 5JICA 3KZBA 4EAHD 3FE1A 3UKUB 3R6MA 1KAYA 3DAWA 4I6MA 2HMPA 4H5WA 1C0GA 2IIRA 3LL3A 2CGJA 5F0XA 1U6ZA 1IJJA 3KHYA 3MDQA 4FWNA 2ASPA 4CJ7A 1LCUA 5AQWA 3S41A 4MO4A 3WEEB 4QS8A 2V7YA 2FSJA 4HTLA 3H45C 3ULEB 2FLOA 2Q31A 4H5VA 4YDUC 3H3NO 2CH6A 1BU6O 3AAQA 3O8MA 3HZ6A 3WQTA 3WT0A 4BVPA 3TPQA 5EX5A 2J4RA 4BC4A 5FPMA 5E84A 2E8AA 2P9UB 4BR4A 2E2NA 1GLJO 3RSEA 1BOTO 3MN7A 4B1UB 1K8KB 1NWKA 4WQ4A 5EVZA 3MK6A 3FZFA 2W41A 3LDLA 2A42A 3FZKA 4BRCA 2P9PA 1XQSC 3ULEA 4FWSA 4FSVA 1RDWX 2ASOA 4BRMA 3VEWA 1S22A 4FWRA 5AQVA 3DXKB 4BQZA 2V52B 2QWQA 4CZLA 1MA9B 4H0PA 1ZBSA 3M6GA 2A41A 4JD2B 4Z94A 4JHDB 2ZF5O 1KAZA 3HI0A 5AQMA 2GELA 2P9UA 4FO0A 4BRFA 3ENHA 2E2QA 2FSKA 4L3QA 4CZHA 3R8EA 2Q0UA 3A5MC 3BP8A 2A5XA 3JXUA 1GLCG 4BR2A 2D0OA 5EOYA 3KVGA 3U4LA 4BRDA 3D2EA 4FWOA 3QBXA 3O1WA 5AQRA 1J6ZA 1ZC6A 2F9WA 3L0QA 2D0PA 1V4TA 4H5RA 1QZ5A 5E26A 1HKCA 1GLDG 3IFRA 5AQSA 3SLCA 5B8HA 2DPNA 3MMVA 5BRDA 4B1WB 4BR5A 2IVNA 5CE3A 1YUWA 2ASMA 4E1JA 5LY3A 1NBWA 3ZEUB 5KQDA 3R9PA 3CJ1A 4XH5A 4BRGA 1NGBA 4PKGA 2EWSA 1HLUA 5BREA 1TYQB 2PAVA 1NGIA 2P9LB 3MN6A 2A40A 4IZ9A 3CIPA 5ADXA 1RGIA 3GOIA 3HSCA 5ADXH 3ATUA 4I6MB 1NGFA 1Q18A 3WUHA 1WUAA 2YCHA 3L6QA 1BA0A 4A2BA 3I8BA 3ZETA 5JLHA 4H0TB 3VEXA 3VOVA 3WXLA 4BR9A 2P9KA 2QWRA 4EIAA 4ISGA 4FOEA 1NGGA 1E4GT 5FPDA 5ELZA 2GUPA 2P9NB 2P9LA 4JN4A 4H5TA 3F9MA 2GWJA 5AQGA 2V7ZA 4IXCA 3VGKA 4CBUA 4H03B 4BC3A 3OHRA 4CBWA 3WXIA 3H3OB 3RSEB 4J8FA 3BF1A 3FR0A 3B8AX 4FPBA 3EZWA 5AQPA 3C0BA 4B1VA 1JCEA 1HPMA 4XEIA 3VGMA 1NGCA 1SQKA 4WQ5C 4H0XB 1WOQA 4CZIA 4CD3A 1HKBA 5KPRA 2P9PB 1G99A 2V51B 4YDUA 5I9EB 2GEMA 4FWQA 2P9NA 3U8XA 3U9DA 4LC9B 1XC3A 3A8YA 1HUXA 4K43A 4GY2B 4O5FA 3VEOA 4BVOA 5BR9A 3FZHA 1DGKN 1EQYA 4JAXA 2QWPA 4BRQA 3CJ9A 3FGUA 3A0IX 3W3DA 3BEXA 2QWOA 1QHAA 2A6AA 1GLAG 2D4WA 3ZX0A 1JCGA 4BREA 3GBTA 5BRHA 1SZ2A 3LM2A 3C7NB 4RWTA 3D2EB 3QMLA 4IJAA 4K42A 1KXPA 4QS7A 5TKYA 1RFQA 3H6EA 3CQXA 1BUPA 1QZ6A 3CETA 4BRIA 4PL7A 3O08A 3O4WA 4XH1A 3DXMA 4CZGA 1NLVA 5BPNA 4GNIA 3GL1A 3UE5A 2P9SA 5BPMA 5BRFA 3LDQA 2FSNA 3FZLA 1SAZA 3LDOA 2YHWA 4IWVA 5AQKA 2E1YA 3SJHA 2QWMA 2GWKA 5AQZA 5KPTA 3C7NA 3HBTA 2A3ZA 5JLFA 3DJCA 4BGAA 2QM1A 3HM8A 1S3XA 2IVPA 5AQOA 1HKGA 4CZKA 2QW9A 3CJCA 3W0LA 4JNEA 1R59O 1T6CA 4MLHA 1HX1A 2VWBA 3AARA 4B1YB 3EN9A 2NZTA 5LJVA 1OKJA 2FF6A 3A5LC 1X3MA 3AY9A 3VPZA 3ZETB 2FXUA 3O80A 1BDGA 3CJAA 2P9KB 4FL9A 4BRPA 1T6DA 1P8ZA 4RCHA 2Q97A 3EO3A 2WUSA 5AZIA 3QDKA 3VENA 2YI1A 4B1ZA 5AQYA 4NB4A 3LM9A 3VESA 3QFUA 1NGHA 4BR7A 1ATSA 3HTVA 5BN8A 3H1VX 3LDNA 4PKHA 1ATRA 2Q0RA 4A61A 4CI6A 4H0YB 4B9QA 2Q36A 3M3ZA 3QICA 1HJOA 4XH4A 2IVOA 3A5NC 3JS6A 4CBXA 4ISEA 4RTFD 1QQMA 1U2VA 5EY4A 3IDHA 3ID8A 3GE1A 3CJBA 5EXWA 2VCPA 2E88A 4BRLA 1E4FT 3VEYA 2ZWHA 1GLEG 3CHWA 1V4SA 4CZEA 3AAPA 4BRKA 4CD1A 3EKSA 3CJ7A 5AQIA 3LDPA 3L4IA 3UKRA 1YXQA 1TUUA 4EHUA 4BGBA 5AZJA 1NGJA 4BRHA 4MO5A 3MN9A 4CZJA 2QWLA 3MN5A 1NGDA 3MCPA 4WQ5A 3CI5A 2P9IA 5F2RA 3BUZB 3O1BA 1LOTB 4BC5A 2QXLA 1BO5O 1NGEA 4A62A 1CZAN 5AQXA 4AM6A 3VERA 2F9TA 3DXMB 1QQNA 4O8KA 2FF3B 3D2FA 2E2PA 3IUCA 3QBWA 4PKIA 4PL8A 3QB0A 2P9SB 1XUPO 4AM7A 2E1ZA 5AR0A 4H5NA 4FWLA 2Q2RA 4BC2A 2BUPA 4A2AA 1ATNA 2VYPA 1YVNA 4M7XA 3VF2A 1Z6RA 3VEZA 1Z05A 2Q1NA 5FPEA 1H1VA 2W40A 2YHYA 4BRNA 1DEJA 3G25A 3VF6A 4CZFA 1JCFA 3GDQA 1ZXOA 3O5BA 3UKUA 4HWIA 4NO7A 3U9ZA 1X3NA 4K41A 5AQFA 2AA4A 4EHTA 2HF4A 2I7NA 2ZGYA 3EKUA 5FPNA 3WEEA 3ENOA 4WQ4C 3VF4A 2YHXA 4FWMA 1BG3A 5LJWA 4IO8A 4DQ8A 4IJNA 1Y64A 3SMPA 4K25A 5AZIB 1NMDA 1YAGA 2CH5A 3GG4A 4DCHA 3H1QA 4FWKA 1QQOA 3I33A 4KBOA 5JMVA 4M7YA 2GTDA 2CGKA 1KAXA 5AQQA 2KHOA 1IG8A 3WXJA 4BROA 1K8KA 3DWLA 3ZX2A 3WXKA 4BG9A 5BPLA 1ESVA 2HF3A 4DB3A 2ZGZA 1TUYA 1U2VB 2BTFA 5BN9A 3TU5A 3O6WA 4BR0A 3DXKA 3A5OC 4ISFA 4Y0WA 2CGLA 4JD2A 2ITMA 3ZX3A 2HOEA 4JHDA 1X9JA 2NLXA 4B1XB 3J8AA 3FLCO 3IMXA 2UYTA 1MWMA 3WQUA 4EFHA 3UKRB 1T44A 2AP1A 5AQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5HP1A 2OTLN 3FFKB 2KW4A 2YJEA 3HVRA 1QE1A 1KLNA 5GAHP 1BWFO 3KD5E 1LV5A 1X9WA 2DTUA 4G1QA 1RCHA 4CEFA 3ATVA 1XMQK 1NJXA 4K8ZA 4WFAL 3THYB 1RDDA 3NF8A 2JWLA 4QS9A 1EXQA 5KPZA 3H46O 1BI4B 3P4IA 5C15A 5KQ8A 3CQ8A 2OPSA 5FRMA 2HBMA 4BQLA 3OY9A 1VQ9N 5KI6A 3ZEUA 1NGAA 4E7LA 3TANA 1C0FA 2D0AA 2PBDA 4B9VA 1GLFO 4AQYK 4CJ3A 1TYQA 3OW2M 3THVA 4YFUA 4KH4A 2IGIA 5AFUA 1D4XA 4MDAA 2O8DA 4FWPA 3H08A 3O4QA 2NNWA 3KZBA 2DFFA 1X1PA 3JSMA 4DR1K 1KAYA 1C0GA 2IIRA 1TK8A 5KTQA 3KHYA 1IJJA 4FJ5A 3CC4N 2ASPA 4CJ7A 1LCUA 1VAZA 4MO4A 3THXB 2WFBA 4FJMA 2V7YA 4HTLA 3H45C 3KKRA 3U3GA 3PX4A 3WQTA 5EX5A 5M1QA 4CESA 4BC4A 3KK7A 4EZ6A 5FPMA 4LFBK 1C0UA 3ENBA 4B1UB 4C8OA 3MK6A 2W41A 4I2PA 3SBGA 2BH1A 4IFVA 1WSEA 2JWKA 4Q5VA 3VEWA 3B6PA 5M1KA 3I56N 2G8VA 2OZMA 2V52B 3TAGA 1S6PA 4H0PA 4JD2B 4Z94A 3A2FA 3S3NA 2HBLA 1XHZA 3LALA 1X9SA 2GELA 4FO0A 3PSIA 2E2QA 3J7YP 4LSLA 1LWEA 1K9MO 2RF2A 3BP8A 2UU9K 5SWMA 1T03A 2D0CA 5FLXO 4BRDA 3SNNA 4JLHA 4FWOA 3QBXA 3HM9A 5CYMA 3SZ2A 3O1WA 5AQRA 4I9QA 3L0QA 4FJXA 4H5RA 4DG1A 2O8CA 1KFSA 1HKCA 1NJZA 5AQSA 4JK9A 3J81O 3KLHA 5B8HA 2KQ2A 4BR5A 5CE3A 1ILYA 1VQ7N 4NXMK 3TARA 1NBWA 4FVMA 3QEPA 3CJ1A 4HHTA 3RMDA 4M41A 3AO5A 4B9MA 5BREA 1U47A 3MXMA 2EX3A 4KPYA 4Y1DA 5CYQA 5ADXH 3VTHA 4M3ZA 4C8MA 3NVKA 4E19A 4I6MB 1NGFA 1VRTA 4ILJA 1WUAA 2G8WA 4IFEA 2WOMA 4KHQA 2HHTA 5JLHA 3HXMA 5C25A 3LPUA 2QWRA 3HPHA 1N8RO 4KHPK 4EIAA 1KVCA 1EP4A 1NGGA 1E4GT 3V1QA 1VSJA 5FPDA 5ELZA 4H5TA 4CJVA 2YKNA 4B8CA 1VQ4N 3PUFA 4CBUA 4IXCA 4B8AB 1YT3A 1IKWA 2O8EA 4BC3A 1VQKN 3HPGA 3WXIA 3RVCA 3FR0A 3T1HK 3RTVA 3QERA 4FJ9A 4F8RA 1SQKA 4GV6A 3N4QA 3V9ZA 4CZIA 1VSIA 4CD3A 2P9PB 4YDUA 2GEMA 5H1SQ 1Q8IA 4JKAA 1NK9A 4K8XA 4LC9B 3VEOA 4K43A 3OTOK 3FZHA 2NRWA 4I2QA 2Z1JA 1ZBUA 3CXCM 3FGUA 1B92A 3VA0A 4JI5K 1JCGA 3SUQA 3NF9A 2OZSA 2ZM6K 5M1OA 2F96A 4GVEA 4IJAA 4BE1A 1BQNA 3H6EA 2IC3A 1QZ6A 5HRNA 4DTNA 3O4WA 1EWRA 4CZGA 3OVNA 3ITHA 3O9TA 4OGCA 5BPNA 3UE5A 5BRFA 1W0HA 3ZT4A 4FZZA 1T8EA 5AQKA 3OS0A 3D6RA 3KK1A 2HSTA 4LH4A 4WCEL 3OYKA 1NK7A 5AQZA 2QTDA 1VQ8N 4RW8A 1XHXA 5J2QA 1T6CA 3V1OA 3MX5A 1HX1A 1S5JA 3THWA 4FM0A 4CJTA 4FLYA 1OKJA 3A5LC 3AY9A 3D45A 5FDLA 3RMAA 3NH0A 3O80A 3T7ZA 1OH7A 1P8ZA 4NLCA 2OA8A 3KD1E 3SI6A 3LM9A 4DLGA 1NGHA 4BR7A 3H1VX 4PKHA 1ATRA 2HBJA 3LP1A 3L2VA 4CI6A 2E6LA 1HJOA 1J54A 1S6QA 2I5JA 1WLJA 2QI2A 1RBRA 3A5NC 3JS6A 1QQMA 4JI7K 3ID8A 3CJBA 4FK2A 1UWBA 4M3WA 4ID1A 1U48A 1FW6A 3NH1A 1YITN 4CHQA 4RW7A 3MEEA 4HCCA 3NVMA 2BDPA 3PO4A 3OYCA 1JLEA 1YXQA 1ZBIA 4JKGA 4JI8K 3F9KA 1NNEA 3VMFB 5AZJA 2Y1IA 4CZJA 3T19A 2QWLA 3CC2N 2O8BA 3VN5A 1A5XA 4B3TK 3P5JA 1TKZA 3KWGA 4CGHA 5M1FA 1YI2N 5K14A 1DTTA 5FRNA 3VQQA 5AQXA 4DTPA 2ZD1A 4O8KA 3QBWA 4PL8A 4PKIA 3V9WA 3QLHA 2P9SB 2GX9A 3LPTA 1NK4A 4FW1A 1JL2A 4AM7A 4DV4K 5AR0A 4FWLA 3CMEN 4DTMA 1QQCA 2BUPA 1ATNA 1NU0A 4BE2A 1Z6RA 4R79A 5FPEA 1WSIA 3J7ZO 1RT5A 5GINA 4B9SA 1JLGA 4BRNA 1IBLK 3G25A 3VF6A 4CHZA 2KFZA 3LDSA 1NG9A 3VQ6A 4IEIA 3EE8A 1J53A 4NO7A 1NK8A 4PUOA 1A5WA 2HHVA 4DTOA 1U4BA 3ENOA 3VF4A 5LJWA 4FYDA 5T7BA 4DV3K 1Y64A 3SMPA 4M3UA 1NMDA 5I3UA 3E9LA 3GG4A 4DCHA 4CF1A 4BWMA 4KBOA 5JMVA 4NCGA 4C8NA 2W6LA 3LWMA 2NRXA 4Z4IA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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