1IG8A

Crystal structure of yeast hexokinase pii with the correct amino acid sequence
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
469
structure length
469
Chain Sequence
DVPKELMQQIENFEKIFTVPTETLQAVTKHFISELEKGLSKKGGNIPMIPGWVMDFPTGKESGDFLAIDLGGTNLRVVLVKLGGDRTFDTTQSKYRLPDAMRTTQNPDELWEFIADSLKAFIDEQFPQGISEPIPLGFTFSFPASQNKINEGILQRWTKGFDIPNIENHDVVPMLQKQITKRNIPIEVVALINDTTGTLVASYYTDPETKMGVIFGTGVNGAYYDVCSDIEKLQGKLSDDIPPSAPMAINCEYGSFDNEHVVLPRTKYDITIDEESPRPGQQTFEKMSSGYYLGEILRLALMDMYKQGFIFKNQDLSKFDKPFVMDTSYPARIEEDPFENLEDTDDLFQNEFGINTTVQERKLIRRLSELIGARAARLSVCGIAAICQKRGYKTGHIAADGSVYNRYPGFKEKAANALKDIYGWTQTSLDDYPIKIVPAEDGSGAGAAVIAALAQKRIAEGKSVGIIGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords hexokinase PII
publication title The high resolution crystal structure of yeast hexokinase PII with the correct primary sequence provides new insights into its mechanism of action.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
total genus 163
structure length 469
sequence length 469
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2001-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ig8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 1ig8A03
2QWPA 3A0IX 2VWBA 4DQ8A 2P9UB 3WQTA 5AQFA 3CQYA 3SMPA 3MMVA 4J8FA 4RCHA 3IMXA 1Z6RA 3VEVA 2ZGZA 3QICA 4IXCA 1S22A 3VOVA 5B8HA 1BU6O 3D2EA 2FSJA 1TYQB 4FWNA 5LY3A 5FPNA 3A5OC 2GUPA 5EXWA 3ULEA 2FLOA 3BEXA 4DCHA 1G99A 4FWRA 3ATUA 1NGDA 2ASPA 3LDLA 1BOTO 3AAPA 2IVNA 5EY4A 4BQZA 3ZETB 5AZIA 4BVOA 2VCPA 2QWQA 3DJCA 3BF3A 1DKGD 1EQYA 4CZKA 2QWOA 2E20A 5FPDA 4M7XA 3IFRA 1TUYA 4ISFA 4CZLA 2P9LB 2YJFA 3C0BA 1E4GT 4CBUA 4BR2A 2P9PA 1BA1A 4CJ7A 3SJHA 1ATNA 3G25A 4MO5A 4BRHA 3VEZA 4DHYA 3CJ1A 1NGIA 5BPNA 4FL9A 4JNEA 2ZF5O 3QBXA 3FE1A 4GY2B 5BRHA 2Q97A 2I7PA 5LJVA 3VF2A 1SAZA 3CJ7A 5ADXA 3WQUA 5BREA 3QDKA 2YHWA 4C23A 2CGKA 3ZX2A 2P9KB 3C7NA 3EO3A 4JHDB 3UKRB 1X9JA 4E1JA 3MN5A 3WT0A 3VPZA 3WEEA 4BREA 4FOEA 2CH5A 5FPMA 4BRIA 5BRDA 2FSKA 2NLXA 3ID8A 2QWMA 5AQRA 4H5VA 4JAXA 4BRNA 5ELZA 3DXKB 4BR9A 3F9MA 5AQWA 2HF4A 4EHUA 1NLVA 3GOIA 1GLBG 2E2NA 4H0OA 4WQ5C 4A2AA 5BRFA 4WYBA 3QBWA 1GLJO 3MN6A 3AAQA 4BC5A 3O1BA 1U2VB 2F9WA 3IUCA 4WQ5A 1GLFO 3FZKA 4MO4A 3SMSA 5KPZA 3O08A 2UYTA 4LC9B 3VENA 3VEXA 4CI6A 4FWPA 3H3OB 3ATVA 1NMDA 1YUWA 5JMVA 3ZETA 1QQOA 3EKSA 4HWIA 2GELA 3LM9A 1MDUB 4EAHD 4FSVA 4BC3A 4PL7A 2P9LA 4BRCA 2V7ZA 4CD3A 3AY9A 3J8AA 2QWLA 2E88A 2ASMA 1HPMA 3O4WA 4L3QA 4BRGA 2YJEA 4RTFD 1RDWX 2BUPA 2I7NA 3D2FA 5AQHA 4PKGA 3AARA 1X3MA 4H0TB 1T6DA 1E4FT 1D4XA 2QWRA 5I9EB 4B1VA 2Q36A 4CZMA 1NGFA 4BRKA 2EWSA 1RFQA 2V7YA 3UKRA 4B1WB 4IJNA 3FZHA 1BO5O 1HKCA 2GEMA 2BTFA 3VETA 1R59O 2P9SA 5JLFA 4M7YA 3VGMA 1H1VA 3UE5A 3DXMA 4XH5A 3DXKA 2DPNA 3HM8A 3R8EA 2CH6A 2QM1A 4GNIA 2YHXA 1T6CA 3B8AX 4IZ9A 3O5BA 2CGJA 1NGHA 5KPRA 5BPLA 3U9ZA 1DEJA 5AFUA 4O5FA 1HKGA 2Q0UA 3MCPA 4AM7A 2QWNA 2A3ZA 2W41A 4BGAA 2PAVA 3FFKB 1GLLO 5AQYA 3A5MC 5ADXH 2AP1A 1YXQA 4BC2A 1LOTB 1MA9B 4JD2B 3HBTA 1T44A 4FPBA 1NGGA 3ZX0A 4A61A 3ZEUA 1V4SA 1WUAA 3HZ6A 3WXLA 1C0GA 5AZJB 1XQSC 3FLCO 4QS7A 1CZAN 3CHWA 5AR0A 3O80A 3CJAA 4WQ4C 4CBXA 1BG3A 4BRMA 4NO7A 3CI5A 2GWJA 4FWKA 4M63C 2CGLA 5KPTA 3CERA 4WQ4A 5AQMA 2V52B 3VESA 2Q31A 2IIRA 4H0VB 5AQZA 3UB5A 3A5NC 5F2RA 5AQOA 3O6WA 2AA4A 5BR9A 1KAXA 2D0PA 2P9UA 4XH1A 5AQLA 4BC4A 1BUPA 1P8ZA 3H46O 3LDQA 2E2PA 4BG8A 1SQKA 3GL1A 4FWOA 3WXIA 3HTVA 4K43A 1NGBA 2E1YA 2FF3B 2A40A 3VEYA 4CZGA 4NB4A 1HJOA 3OHRA 1TYQA 1K8KB 3D2EB 1NGCA 3L0QA 3ULEB 1MWMA 2FF6A 3VGKA 2V51B 1GLAG 1Z05A 1ZC6A 3R6MA 4FOIA 2HF3A 4B1YB 1TUUA 2WUSA 3BP8A 3EZWA 3L6QA 2ZWHA 2A5XA 5KQ8A 3O1WA 1J6ZA 4CZHA 1RGIA 4EFHA 1C0FA 2HOEA 1X3NA 2E2OA 2Q2RA 4H0YB 4BRQA 4EHTA 3H1VX 1NGAA 2P9PB 3KVGA 4BR0A 3JXUA 4JD2A 1ATRA 3FZLA 4FWSA 1Y64A 3BUZB 4BRLA 1S3XA 5EOYA 4BRAA 5AZJA 2A42A 3EKUA 3VF4A 4CD1A 3I8BA 5AQKA 2IVOA 4CBWA 4PKIA 3ZX3A 2P9KA 1GLCG 4XH4A 4JHDA 3R9PA 1XC3A 2P9IB 1QQMA 1NGJA 2Q0RA 3QFUA 4IJAA 1KXPA 3WEEB 4CZJA 4QS9A 4PKHA 2W40A 4FWMA 4K25A 4DB3A 3P4IA 4I6MB 4EIAA 3KZBA 4BRDA 5BN9A 5AFUH 2P9NB 4Y0WA 3FZFA 3ENOA 4AM6A 1IJJA 2D0OA 4K41A 2ASOA 5JICA 3QMLA 2QXLA 5AQQA 2ITMA 4RWTA 2E1ZA 3U4LA 1YAGA 1U6ZA 3EL2A 3UKUB 1U2VA 1HX1A 4FO0A 3CJ9A 5AQGA 3MN9A 1K8KA 5AQIA 3WXJA 3CJBA 4QS8A 4H0XB 5E26A 3RSEB 5AQJA 3LDPA 1NWKA 1ZXOA 1JCFA 5KQDA 2KHOA 4H5NA 3TPQA 4B1UB 1GLDG 4H5RA 3VEOA 2FXUA 2YI1A 1MWKA 5BPMA 1NGEA 3H1QA 4ISGA 4BVPA 2ZGYA 3QB0A 3GG4A 4A62A 4H5TA 4HTLA 3KHYA 4B1ZA 1BWFO 4CZEA 3MDQA 4A2BA 3U8XA 5BN8A 4O8KA 2A6AA 3LM2A 2H3GX 1JCEA 1ESVA 4B1XB 1DGKN 3ENHA 1LCUA 3VGLA 1NM1A 2F9TA 3H3NO 4H5WA 4BQLA 3S41A 2GWKA 4ISEA 3VERA 2D1KA 2E2QA 3D2FB 3M1FA 4IO8A 3DWLA 3U9DA 1KAYA 4CZFA 3A8YA 1SZ2A 5FPEA 3CJCA 3FR0A 1V4TA 3GE1A 5AQVA 4MLHA 3H6EA 4BR7A 3CIPA 3FZMA 1JCGA 4K42A 2P9IA 3LL3A 1ZBSA 3M6GA 1BDGA 1YVNA 3WXKA 3CETA 3JS6A 3I33A 4KBOA 4I6MA 5LJWA 2P9SB 4BRFA 1Q18A 5AQUA 2P9NA 4BR4A 4Z94A 2NRHA 1KAZA 2HMPA 3DXMB 4MLEA 3VF6A 4H03B 1HUXA 2YCHA 1NBWA 4BGBA 5F0XA 3VEWA 2IVPA 1IG8A 2YHYA 3WUHA 4FWQA 5AZIB 2QW9A 3UKUA 3W3DA 1QHAA 4BG9A 2OANA 3DAWA 2FSNA 3GDQA 3D7EO 4JN4A 3GBTA 2NZTA 5EX5A 3IDHA 3MN7A 4CZIA 4PL8A 5CE3A 5AQXA 5AQNA 1ATSA 4YDUC 3RSEA 3HI0A 5EVZA 2VYPA 3W0LA 1HLUA 3LDNA 4H0PA 2Q1NA 3SLCA 4BROA 2GTDA 3H45C 1QQNA 3MK6A 1HKBA 5TKYA 5AQTA 3ZEUB 5AQSA 3L4IA 5JLHA 4YDUA 1OKJA 5E84A 1QZ5A 3O8MA 2E8AA 1QZ6A 3TU5A 3CQXA 1GLEG 3A5LC 3EN9A 3QFPA 3C7NB 3M3ZA 3LDOA 2PBDA 4FPAA 4F9OA 4FWLA 2D4WA 4IWVA 1WOQA 3BF1A 3SK3A 5F1XA 1XUPO 4B9QA 3HSCA 4BR5A 2A41A 3FGUA 4XEIA 4BRPA 1BA0A 2J4RA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QWPA 3E9OA 2HVIA 3WQTA 3SMPA 4U67L 3F2KA 4RCHA 3P5JA 1Z6RA 3O9TA 1S9GA 5JS2A 5HRPA 4M3ZA 2YV0X 1N8RO 3DLGA 4LSLA 4KHYA 4DTJA 3D2EA 1TYQB 4PUOA 5FPNA 2YHBA 3PLAA 2Y1IA 1X9WA 4CGDA 1X1PA 1EWRA 3T19A 2ASPA 1DLOA 1KTQA 4BQZA 2BANA 5HRRA 2BDPA 4OKKA 3PO4A 3J7ZO 3CM5A 4CZKA 3B6OA 4DQRA 3J7AP 2HHVA 3SCXA 4CZLA 1SKWA 2P9LB 3C0BA 4EZ6A 4CBUA 4BR2A 3P1GA 5DMRA 3G25A 4MO5A 2E6MA 2HMIA 3L2WA 1NGIA 4FLTA 3NF6A 5H1SQ 5LJVA 5ADXA 2HNZA 3WQUA 4I7FA 3QDKA 1BI4B 2YHWA 4E19A 4U7BA 4E1JA 3MN5A 4BREA 1DTQA 4I9QA 3HL8A 4IG0A 2DY4A 5FDLA 5BRDA 2FSKA 3U6FA 1IBMK 3S3OA 1RTIA 3DRPA 4BRNA 5ELZA 3DXKB 4CJEA 2DTUA 1GLBG 2E2NA 5KRTA 4NYNA 4A2AA 3ZYYX 3SBTA 1ASVA 4GV6A 1N36K 1NJIO 3J80O 3TTDA 2RN2A 3O1BA 4A57A 4ZTFA 2UUAK 3PX6A 5CY4A 3DLBA 3TAFA 3ULDA 2O8CA 3PV8A 4E7LA 2OPSA 3SV4A 3WXMB 1NMDA 3ZETA 1QQOA 1RBTA 3EKSA 1NJXA 1KVBA 1YJWN 3LM9A 4R5PA 1S1TA 3HPHA 4IFEA 4FSVA 2F8SA 4DF8A 1WSJA 4YOUA 2YNHA 2UUBK 1X9MA 3TTFA 2E88A 1D8YA 1RT2A 2DFHA 2FC0A 1OH7A 4BRGA 3BZKA 4RTFD 1QS4A 3QEXA 3D2FA 5AQHA 4H0TB 2KKZA 3SZ2A 4F4KA 4FXDA 2D0AA 5I9EB 4B1VA 5FRMA 1REVA 4B1WB 3SAHA 3FZHA 1BO5O 4X62K 1HKCA 4I9LA 2BTFA 3K0SA 4RG8A 3ALYA 5JLFA 3C6AA 5FRNA 3UE5A 2G8FA 4XH5A 2CH6A 2YX6A 1RNHA 3OJSA 4CFDA 4O44A 3B8AX 3K9KA 2G8IA 3KK7A 3SJJA 4DTSA 3K58A 3SI6A 4NCBA 2W6KA 2ATQA 3NGZA 2G8UA 1JLBA 5AFUA 5FLXO 1KD1O 3RWUA 4ID1A 4CHOA 2Q0UA 3LP0A 4E1MA 3D45A 3L3VA 4CFCA 2AP1A 1YXQA 2XY6A 2O4GA 1LOTB 4FW2A 3ZX0A 4A61A 3CFRA 1TKZA 4DMNA 1Q82O 1VQ7N 4KH6A 1QSSA 4CBXA 4BDPA 5GIPA 3L2RA 1I94K 3AVIA 3OS1A 3L4QA 2O8BA 5KPTA 4FK2A 1JJ2M 4H4MA 3R1XA 4DKWA 3CERA 1WBBA 2V52B 3C6UA 3VQEA 4O8UA 1VQ5N 5I42A 5T7BA 4CEEA 3KLGA 4LF5K 2D0PA 4JKFA 4V19S 2E2PA 1BQNA 1VSEA 3AVFA 4CE9A 3AO4A 4K43A 4OVLA 3KK1A 2A40A 3VEYA 4JKBA 2WBNA 3V9ZA 1VQON 1NGCA 1XMOK 4CIEA 3ULEB 4Y1CA 4DR3K 1HMVA 4B1YB 2WUSA 3O9SA 4QCLA 4W5NA 3L6QA 3IKMA 5KQ8A 4Z0UA 3CG7A 1J5EK 3HVTA 4EFHA 3THXB 1C0FA 2HOEA 4IOCL 4H0YB 3S3MA 3H1VX 4DFMA 5CHIA 2P9PB 3KVGA 2UUCK 3JXUA 1S5JA 3MWTA 3K59A 4FWSA 5C12A 1S3XA 5AZJA 2KZZA 4X66K 1B9FA 4JKGA 4CD1A 3CQ8A 4CBWA 4CERA 3ZX3A 2P9KA 4BY9C 4OPKA 4DWIA 2P9IB 4CGHA 2VGMA 3AGKA 1VQMN 4OLBA 3WEEB 1A5WA 3MEEA 3DOLA 4HUEA 2FBVA 3LALA 4JKAA 4KPYA 1W2BM 3FZFA 4CEDA 5I3UA 4LY7A 1QVGM 4LD0A 2ZJRL 4FK0A 4YY3K 2KFZA 2ITMA 4CGGA 4RWTA 1VQ4N 1QQCA 1KLNA 1ZBHA 4EP4A 4DU3A 1VSDA 4Z4FA 3QINA 3UKUB 4FJIA 4BE2A 3CJ9A 3VQ9A 3MN9A 5AQIA 4RW7A 2O4IA 4CK2A 5AQJA 3LDPA 1ZXOA 1VQ6N 1JCFA 3TARA 5KQDA 2KHOA 3TPQA 4DV0K 3VEOA 2X6SA 1MWKA 4ISGA 4BVPA 1IKWA 1KVCA 4HTLA 4B1ZA 2EHGA 4CZEA 3MDQA 4FLYA 1YI2N 4CJWA 4KI6A 4JLHA 1UAXA 1ESVA 4N47A 3RMBA 4B1XB 1T05A 2ZJQL 3OYIA 1LCUA 4K8XA 1FKOA 4BQLA 4DSKA 4ISEA 3VERA 3U9DA 1KAYA 4CZFA 4CJTA 3CJCA 2YKMA 1TK0A 3KTQA 3GE1A 3VQ7A 3FZMA 3E9PA 1VQNN 1S1WA 1QSYA 5LMNK 4M3XA 3AVCA 4X64K 3I33A 5GAGP 4FJMA 1BQMA 3KK3A 4FJNA 5MLCQ 4FYDA 1Q18A 4B9NA 2NRHA 2HMPA 2RKIA 5HOOA 1NBWA 3BZCA 3A2FA 1WSEA 1VSFA 2DFFA 5F0XA 1IKXA 2QW9A 1NJYA 4PHTX 1YITN 3CCQN 1QHAA 4BG9A 2FBXA 3DAWA 5HLFA 4KH4A 3ZSXA 4DTOA 3MN7A 5LL6Z 2Z1GA 5GADP 4CK3A 2VYPA 4YOTA 4Z4HA 5M1FA 1J54A 4B3TK 1YIJN 2OA8A 3H45C 1TKTA 4PWDA 4HHTA 3MK6A 1HKBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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