1IITA

Glur0 ligand binding core complex with l-serine
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
226
structure length
221
Chain Sequence
b'GSAMALKVGVVGNPPFVFYGAFTGISLDVWRAVAESQKWNSEYVRQNSISAGITAVAEGELDILIGPISVTPERAAIEGITFTQPYFSSGIGLLIPGTATPLFRSVGDLKNKEVAVVRDTTAVDWANFYQADVRETNNLTAAITLLQKKQVEAVMFDRPALIYYTRQNPNLNLEVTEIRVSLEPYGFVLKENSPLQKTINVEMLNLLYSRVIAEFTERWLG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Mechanisms for ligand binding to GluR0 ion channels: crystal structures of the glutamate and serine complexes and a closed apo state.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Slr1257 protein
source organism Synechocystis sp. pcc 6803 substr. kazusa
molecule tags Membrane protein
total genus 69
structure length 221
sequence length 226
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iitA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1iitA02
1Y3NA 4F3BA 1FQCA 2B3BA 3KFMA 1Y1ZA 1Y3PA 4YKKA 4I9DA 4PFUA 3K2DA 4LONB 4X1DA 5DVFA 5AA4B 1I6QA 1MG1A 1EZ9A 2QJEA 3V8XB 2E1SA 3UP9A 3K1MA 1VFEA 2ZYNA 1PB8A 3DLNA 1AH5A 4FAJA 3KSXA 3IR1A 4GOTA 3DELB 2GFEA 3AXFA 1GV8A 5ISUA 3K00A 4LZ7A 5K2XA 4XXUA 3TODA 4ELOA 1GGGA 4F2OA 2AIXA 4OEUA 1MY0A 1MDP1 1NL5A 2QMXA 1LCTA 5KZTA 3KOSA 5F1QA 4EXKA 4GWOA 4OESA 3FUZA 4QSDA 3MJNA 4AQ4A 1B1HA 2ZNUA 5I59B 3TCFA 3W9WA 1MS7A 4QFNA 2Y7WA 3IO4A 1JW5A 1H43A 1A55A 4EF2A 4JXIA 3H4ZA 1SYHA 1ZU0A 5F7VA 4EUOA 3O2AA 4IGTA 4OQOA 1LFIA 3FJ7A 1P1QA 1TFAA 1JQFA 1DPEA 3FZVA 1DTGA 3PGFA 2R6GE 1II5A 5FHMA 5DTBA 4X48A 5FHOA 2Z8DA 3KGCA 1FTLA 3T9VA 4IO5A 3TDJA 2HCAA 1JVYA 1N04A 4OYVA 3E4RA 2RKMA 3VE1B 1POY1 3VV5A 2XX7A 2I49A 5H8FA 1AIVA 2AYSA 1MQGA 3OMBA 1MY4A 3K1PA 4HTGA 3GBBA 1MY3A 2UVJA 4NF6B 2F6GA 1SQYA 3VFJA 1B40A 3G3HA 4M4GA 2QRYA 4FJPA 4NF4B 5AA2D 3MP6A 1IXCA 1B05A 4XTCQ 4OXVA 4KCDA 1NNTA 1O63A 1PEBA 3VLUA 4TQUQ 3QK6A 5DT6A 2Q8JA 2DYXA 1N7WA 1LAGE 2REGA 1IIWA 3PPNA 1D4NA 4Q5TA 1MH3A 4ZE8A 1MPBA 5A5XA 3UGWA 1N7XA 2DWAA 1B3FA 1OLCA 3KN7A 3MPKA 3MVXA 1N84A 3IOWA 3SEWA 5CMCA 3Q29A 4YMBA 4OFLA 4L17A 3BFTA 4RYAA 5CMBA 5JEIA 4ZEFA 3S9EA 1LFGA 4EXLA 1B46A 5ICQA 3Q28A 4IGRA 4ZEIA 5KDTA 5HM4B 4YZZA 1QULA 2G29A 1HSLA 2DWIA 4LQ5A 3T93B 4GD5A 3U1OA 1M5BA 3SDFA 4RK9A 4G2ZA 1IEJA 3H7MA 3Q25A 3PUXE 2PX1A 4EQBA 1Q35A 1FQDA 3KG2A 5TP9B 3UA8A 4H8IA 3E3KA 1ATGA 2DP8A 1MXVA 2FYIA 3LR1A 2F5XA 3VLWA 4F1VA 2BJJX 3K6WA 4QFKA 4XKNA 3VLVA 4UACA 1SYIA 1FQFA 1T0KA 2LAOA 4G68B 5AA1A 4R73A 3K6XA 2H98A 2D5WA 4JSDA 4G8MA 4POWA 4ZZAA 4HCWA 4N13A 4QFOA 2XD2A 5CM6A 3H06B 5I56B 4H67A 2V84A 4XKRA 3C35A 3FJMA 3GZGA 3OSQA 1USYH 1M5EA 1ELJA 1AOVA 5TU0A 2DE4A 4KQPA 2F7BA 3CSGA 4KPTA 4P0GA 3VXBA 4OFJA 4U2RA 3O97A 1UTBA 1NNKA 2ZNSA 3TCHA 3PPPA 3C33A 3O28A 3G3KA 5I84A 3PPQA 1PBPA 2P2AA 3CG3A 1BP5A 4BDMA 3SEYA 3TTLA 3N6UA 1UIVA 3BBRA 3TQLA 5I57A 2H99A 5FTIA 4YMAA 4OWDA 4RY1A 2Z8FA 3LSLA 3W9VA 5H8HB 4P0IA 3LBSA 1JVXA 4F2QA 4X1BA 1A40A 4XKPA 3O6IA 1NMUA 5FTHA 1S7YA 3EQ1A 4U4SA 4R75A 3OEKA 1SW5A 3KN3A 4E0WA 2XHDA 3V5AA 1FTOA 3TUSA 1OQGA 4LVQA 3RN8A 2O51A 3A09A 4GIZA 3ZKKA 2NOOA 3PUWE 4ZECA 1DMBA 2H4IA 2X26A 4OMBA 1UTHA 1LB8A 2I6EA 2AL5A 1Y9UA 4F22A 4F3GA 5JK4A 3LSWA 3IL1B 1MQHA 2GHBA 4QHQA 2XD3A 3K6VA 2Y7PA 1R9QA 1SW1A 5ITOA 3O6GA 3A3UA 2O69A 4ISUA 2GRVA 4PFYA 4MBPA 4JWOA 3FASA 4DXBA 1S9TA 2D3IA 2DQVA 1KWHA 4GFRA 2PBWA 3TTRA 1H45A 3MZBA 4R72A 1O7TA 3THIA 3MUQA 1IUDA 1RKMA 1ZTYA 2YPNA 2O6AA 3P7IA 4YU0A 1MXWA 4OETA 3FD3A 2VGQA 2OWSA 3KJTA 1FQAA 3DP4A 4DDDA 3TELA 1SBPA 4TOZA 2I3VA 2Y7KA 3TFLA 2R9JA 3RTWB 4BDLA 3C34A 2ZMBA 4NE4A 2HAUA 1Y4TA 1VFDA 1B3LA 2Y7RA 3PD8A 3U94A 2ESNA 3H6VA 2D21A 1LBCA 4RXLA 3OO6A 4BDRA 1B9JA 3CIJA 4H5FA 1M5FA 1OLAA 3G3FA 2RCBA 3ILUB 4P11A 2IA4A 2O1MA 2DXYA 2DXRA 4R2FA 3IJOB 4U1ZA 3MP1A 3UIFA 3ECRA 4JSOA 5L9MA 2VP1A 2HXWA 1L5TA 2A5TA 4U23A 1FW0A 1ZKBA 1EU8A 2I4CA 1LBBA 1QJMA 4PFTA 5I58A 3HV1A 1QUJA 2CZLA 2YLNA 3HHGA 3IB0A 3S4UA 3EPEA 2OZZA 3MVYA 2Y7IA 3VVDA 1YTVA 1A99A 2PT1A 4BDNA 5KCJB 1QUIA 4R74A 4FEDA 1A7LA 4OEVA 5DVIA 4KCCA 3FV1A 4R2BA 1LB9A 1IXGA 4I1DA 2V3UA 2ZXTA 3U72A 1NFTA 2QL3A 1Q1KA 2R71A 3TCGA 5KDTB 2NUVA 3B6WA 3SETA 4FE8A 4EDPA 3BFUA 1OVBA 3PPOA 3H6TA 4R6YA 5L8DA 4RPNA 5B7DA 5H8NA 2Q89A 4FORA 4NWDA 4KYSA 1GR2A 2PVUA 2QS1A 5BWJA 3ONMA 4QSCA 1M5CA 5DEXA 4NF8B 3C32A 3QXMA 1P1WA 3JYRA 3CSBA 1LGBC 2HZKA 5TPAB 3ZSFA 2DE2A 1B0HA 3G3IA 2HEUA 4DCYA 1CE2A 2UXAA 3IO6A 4NF5A 3FV2A 2IEEA 4H1XA 2E0SA 5EYFA 3FVNA 4DZ1A 5CBSA 1PB9A 1I6BA 1SW2A 4NMYA 5L9SA 3ILTB 2O1LA 3TTKA 5DYHA 4ELPA 3FVOA 5JTYA 1MQJA 3S9NC 1ZMGA 3MC2A 2I0BA 4MLQA 3KBRA 2QPQA 4KI0E 2Q88A 4PE5B 4O3CA 3PMWA 2QS2A 4ECFA 2X7QA 4DIGA 3TKDA 1ZJLA 3TQWA 2KLFA 4ZEDA 3B7DA 5AA4A 2UVGA 1MM7A 3CFZA 1D9VA 3ZS6A 4BDQA 1S50A 1OVTA 4F3SA 1N0TA 1MPCA 4C1TA 1Z7ME 1ZBMA 5EHSA 1B5JA 3KOTA 5CMMA 3B6TA 4RPOA 4N07A 4YAHX 1B4HA 2OK2A 1FTJA 2XXIA 2UVHA 1B5HA 1Z7NE 4YB7A 2QSXA 2OCUA 1LAFE 4MH5A 5I57B 3MAMA 1D3KA 3LSXA 1VSOA 5CI5A 4O3AA 4F1YA 4ZEBA 2V3QA 4U22A 4ND9A 4IY6A 3WAFA 2O68A 4OHNA 4QF9A 4HW8A 5AE4A 1TFDA 3PMXA 3CRBA 4LQ2A 4ELQA 5EHMA 2G93A 4ZDMA 1JW4A 3CR9A 4GL0A 2O7UA 1LLSA 2HFBA 1MDQA 3PUVE 5ICTA 1B52A 1TXFA 3IORA 3FJGA 2DWJA 4TLMB 2PMSA 3RY3A 4HCYA 2I48A 2DS9A 3PUYE 3MVWA 3OO7A 3SEXA 2VD2A 2VOZA 1QKAA 1AL3A 5K2YA 1OQHA 1PBQA 2F34A 3QUFA 2GHAA 3GXAA 4Q30B 1HSJA 5ELVA 3VDFA 1EZPA 4G8HA 4NF6A 1Y4CA 2I4BA 1DSNA 3G3GA 3E9XA 4KYEA 3C31A 1SDXA 1JNFA 5AA2A 3PPRA 3DP6A 4OERA 1VR5A 4GF8A 4ESXA 4Q8RA 4H65A 4U4XA 1MQIA 4XKQA 1XT8A 1UIUA 1MXXA 3JZJA 3OOAA 2XXXA 2ABHA 4THIA 1XHYA 2XXVA 4MF3A 1URSA 2DOJA 4HS7A 1US5A 1IXHA 4FEBA 2XX8A 5H8QA 3PV0E 2NWJA 3FVKA 3S2VA 5I2NA 3ZKLA 5HPQA 1RYOA 4DCXA 4OFOA 1N3XA 1URGA 4F19A 2ZYKA 1B0LA 3C36A 3Q26A 2A5TB 2RC7A 1FCKA 4Z0IA 1ANFA 1B4ZA 4IO4A 1FTMA 4G4PA 2XXUA 3L6HA 3O9PA 3DP8A 1B32A 1I69A 4ELRA 4IO3A 2B3FA 1WVJA 5CC2A 5J1DA 1B7UA 1EH3A 3S9MC 2RINA 3O6HA 4JBZA 3CG1A 4U1OA 4NWCA 2ONSA 3H03A 1XVXA 3TPAA 3T66A 4LZ5A 3OD7A 1IZ1A 2HZLA 3KJ7A 3M3KA 4EF1A 3PUZE 3TYHA 4KD5A 4G68A 3N5LA 2OJTA 3UK4A 2F35A 3UORA 2ONRA 1N76A 5H8SA 3EHUA 5H8NB 1QUKA 3G7WA 4DLDA 4IO2A 3C9HA 1Y1MA 5DEXB 1MQDA 2ANJA 3IJXB 4GRKA 3TTNA 4RK2A 2O84X 3E13X 4K3FA 4YB6A 3SKPA 4M1VA 2DWHA 2OBGA 2A5SA 3PMVA 2YJPA 3LSFB 3IAZA 4F3PA 3T9UA 4R6KA 2PT2A 4GVOA 3R7XA 2ZYOA 3A3CA 4NF5B 3D4GA 1BKAA 1MY2A 4U21A 1JEVA 2THIA 3MW0A 4IY5A 1GTKA 4ZZEA 2H25A 5H8FB 3HPIA 1XS5A 1CB6A 1TT1A 3RUMA 3LUYA 1B5IA 3U93A 4R6HA 3M3LA 1B58A 1P99A 3D4CA 3RGYA 3CFXA 4FIMA 1IXIA 5H8HA 2I3WA 3ODBA 4JWYA 4YKJA 3FXQA 1NKXA 2P1SA 4Q0CA 4R9GA 3K6UA 3H6UA 5AA3A 3FATA 4YB5A 4MLVA 3N26A 1IQ7A 1Y3QA 1B7ZA 2Z22A 4RNSA 3OELA 1AMFA 5A5XB 5I2KA 1SI0A 1ZLQA 4UA8A 1URDA 1JW1A 1YCJA 1J1NA 3C4MA 4ESWA 4PFWA 2XX9A 2Z23A 3KZGA 3MQ9A 1D9YA 1MY1A 4POXA 3U8QA 2QS3A 3BKIB 5LOMA 5FHNA 4QRZA 3RT6B 3T9HB 1OIBA 1QKBA 1XC1A 2NVUB 1BIYA 1B3HA 4JDFA 5CBRA 2QS4A 1TWYA 2X7PA 2DSFA 1A8EA 2GH9A 3G3JA 3MBPA 3KN8A 3VVFA 3PD9A 4AB6A 5ITPA 1B2HA 4LP2B 4Z7EA 3UN6A 2DVCA 1MXYA 4OZ9A 4DXUA 1MXZA 1PC3A 4EQ7A 3N94A 4XIGQ 5L9OA 1B1XA 2RC9A 2ZYMA 4KHZE 3MZ1A 1LAXA 1XVYA 2H5YA 2HQ0A 4DXCA 3QIMA 2DE3A 1HSEA 4G77A 1USYE 2V3TA 2ZNTA 4LUBA 2F78A 2VHAA 4OENA 2V25A 3HSTA 3CI8A 3IOVA 2XXPA 3T96B 3TAJA 3DM0A 1ZIUA 3RTFB 1PB7A 5HBCA 4KFQA 2Q9TA 1XOCA 2Q2AA 4C1UA 3QAXA 4JWXA 4R9FA 1WDNA 5AA2B 3SERA 3TMGA 1M5DA 1UTBB 4ZEKA 2REJA 1LFHA 2QMWA 4I8CA 4LZ8A 3QSLA 3EHSA 2F97A 4GL8A 3RLFE 1QVSA 1NNPA 3TTMA 1F9BA 2UYFA 2FNCA 1BLFA 3V89B 3OO9A 3HHFA 1H44A 5KCJA 2DVZA 1B7HA 4H8JA 2ALUA 1DOTA 5H8QB 4EQ9A 1R6ZA 1SW4A 1UQWA 1SI1A 3QYTA 4OTEA 5DVJA 3EN3A 3CVGA 5I2NB 2XXYA 3MVZA 1DTZA 3GBAA 3MP8A 3K4UA 1MPDA 2HAVA 1YPNA 3IX1A 4GLIA 3T22A 5I59A 3FXRA 1B51A 1RYXA 2P0SA 4GXSB 2RC8A 3H6WA 2XXWA 4PP0A 4DE8A 2Y84A 4QFPA 4KR5A 2O7IA 4F39A 3TEPA 3I5OA 4NF8A 5IAIA 2UYEA 3K02A 3HCQA 1UTHB 1VE4A 2I58A 1YAEA 3RNNA 3OENA 3IOTA 4NEDA 4H0WA 2OWTA 4WKMA 3H3GA 3EHTA 4RJZA 5TPAA 1LSTA 3TZAA 3I6VA 1MRPA 1EZOA 1P1OA 1MM6A 5CMKA 4E0XA 3W15C 2WKYA 3PU5A 3IK6B 4G68C 1OMPA 1POTA 3OO8A 3O66A 1JETA 4LA9A 1NNFA 5CRYA 2RCAA 1FQBA 3K01A 4I62A 1B6HA 3L6GA 3RQTA 2NXOA 2Q2CA 3HO7A 3F11A 1H76A 2F7CA 4JB7A 2H9BA 3T9XB 3FIRA 1US4A 5M2VA 2FA7A 4AB5A 1QW0A 4FATA 4NF4A 5BUUA 1H3DA 4WEDA 1R9LA 2PYYA 1R1NA 2XXHA 4FECA 1JEUA 3V83A 4ZS9A 2F36A 1A54A 4H6DA 2RF1A 3B6QA 3SEVA 3K0VA 3LC8A 3FVGA 3VXCA 2VD3A 3HN0A 4WEPA 4H5GA 4QSEA 3R6UA 4YICA 4F1UA 1IITA 4N6PA 3FGSA 4NTLA 2V93A 3IOUA 4BDOA 1P1UA 4PETA 2CMOA 3R26A 3OEMA 4PQJA 1MXUA 2I0CA 1Y20A 3Q27A 1DPPA 3CFLA 3MWBA 4RA1A 3WAEA 3GLBA 4C0RA 3SEUA 2XXQA 1FTKA 5I58B 5B70A 4G8NA 3KEIA 3OXNA 1I6AA 3IB1A 4WXJA 1B3EA 5TP9A 1NH8A 4YKIA 3N6TA 4O3BA 1N3WA 2W7YA 2UVIA 3JV9A 5I2KB 4F18A 3VVEA 3M8UA 3USDA 4IO7A 4ONYA 4GXAA 4MFIA 3M3FA 2F6PA 4TLLB 1LCFA 4F29A 3QUJA 2OLBA 3SESA 4IB2A 1NH7A 3RPWA 1FQEA 1P1NA 1A8FA 1GVCA 4KYDA 3EF7A 3I3VA 3IB2A 3S9LC 2ONKE 3K1NA 5I56A 4X9TA 2B65A 2AL4A 1B3GA 2F8DA 2M8CA 3KSJA 3OSRA 4ZE9A 1LAHE 2XXTA 3U92A 2Z8EA 4YKPA 3O29A 4BLAA 1WODA 1PDAA 1MH4A 1SD3A 4GQOA 4OVJA 4F31B 1O64A 2XXRA 3MPLA 5JTYB 2F7AA 4LATA 5IKBA 3MZ9A 1SVXB 3RT8A 1BTJA 4IO6A 3FXUA 4QFLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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