1IJJA

The x-ray crystal structure of the complex between rabbit skeletal muscle actin and latrunculin a at 2.85 a resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
370
structure length
363
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN, ALPHA SKELETAL MUSCLE
publication title Polylysine induces an antiparallel actin dimer that nucleates filament assembly: crystal structure at 3.5-A resolution
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
total genus 97
structure length 363
sequence length 370
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-04-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1ijjA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ijjA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ijjA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ijjA04
3UB5A 4H0PA 4DB3A 2ASOA 3MN7A 3WUHA 3GG4A 3MCPA 4H0YB 3EKSA 5AZIB 4IO8A 4BGBA 3GL1A 4DCHA 5AQKA 4AM6A 3MDQA 2E2QA 3HBTA 5BPNA 4B1UB 2Q97A 3GE1A 4CD3A 5FPMA 1HKBA 2QWLA 4I6MA 4BRDA 1WUAA 3AY9A 2CGLA 4H03B 4RCHA 5BRDA 1YAGA 4XH1A 3LM2A 3OHRA 4IJAA 1ZBSA 4K42A 1CZAN 2CGJA 4CZIA 1RGIA 4H5TA 4A61A 3H3OB 1HX1A 4GNIA 5AQFA 1X9JA 2YJFA 3H6EA 3QFUA 2Q2RA 4XH4A 2IIRA 2QXLA 2YHWA 1NWKA 1NGFA 1QQOA 2P9PA 4ISFA 5B8HA 1QHAA 1ATNA 2FSJA 3U9ZA 1G99A 3ZETA 2D0PA 3FE1A 3GDQA 4AM7A 5KQDA 4BRCA 3BF1A 3SMSA 4O8KA 1ATSA 3LM9A 5BN8A 3A5NC 3H46O 3ZEUA 1OKJA 5AR0A 3O6WA 3QDKA 5AZJA 1K8KA 3LL3A 1LOTB 2ZGZA 1IJJA 3WQTA 3CHWA 2FSKA 2Q0UA 3QBXA 3VOVA 1X3MA 2E20A 4FWSA 3EO3A 4LC9B 4CZMA 3EL2A 1Q18A 2YJEA 1E4FT 2E2NA 4H0OA 3C0BA 4FOEA 4Y0WA 3FZFA 3W3DA 3DJCA 4DHYA 5AQVA 1XUPO 2A40A 1MA9B 4CZGA 4BR4A 1U2VA 3J8AA 3I33A 1NMDA 3SLCA 4RTFD 4L3QA 3CJCA 4XEIA 3HM8A 3LDLA 4XH5A 4BC5A 1Z05A 4F9OA 4BG9A 2A3ZA 3B8AX 5EY4A 4BRFA 2P9KB 4CZLA 1E4GT 3WXKA 2FLOA 3VESA 1WOQA 1XQSC 2VYPA 2OANA 1ZXOA 3VETA 4QS8A 1SZ2A 3L4IA 2HF3A 2V51B 4QS9A 3D7EO 5AQHA 1YVNA 2P9SA 3H1VX 5AQOA 5AQUA 5AQWA 4FWPA 3VEYA 4CJ7A 2VCPA 1ATRA 5AQTA 3U8XA 3U9DA 4H5WA 2DPNA 4B1YB 2Q31A 2QM1A 3ID8A 2ZWHA 2W40A 3D2FA 2NRHA 2UYTA 2AA4A 4FWKA 4JHDA 2E2OA 2FF6A 3L6QA 1HPMA 2W41A 1BDGA 4BC3A 1HUXA 4B9QA 4ISEA 1QZ6A 5KPTA 3VGMA 3A0IX 3WQUA 5JICA 3U4LA 3KZBA 4JN4A 3EN9A 4JD2B 3BP8A 3UE5A 4IJNA 2FF3B 5BPMA 1JCGA 3RSEA 4M7XA 1D4XA 3S41A 4CZHA 3TU5A 3L0QA 4M63C 1GLLO 1T6CA 4EFHA 1YXQA 2D1KA 3ULEB 3HSCA 3H3NO 1C0FA 2BUPA 2WUSA 1QQMA 3D2EA 5AQIA 3CIPA 3QB0A 3VEWA 1HJOA 1KXPA 2P9IB 5EXWA 2ASMA 4BC4A 4QS7A 2A6AA 4K25A 5AQJA 5FPNA 1QQNA 2P9UA 2GWJA 3CI5A 3VEOA 3HTVA 2QWOA 1JCFA 3SJHA 2QWNA 2P9KA 1SQKA 2ZGYA 5AQXA 1EQYA 1ESVA 2IVPA 2QWRA 3WEEB 3SK3A 3VENA 3WXLA 3CJBA 1MWMA 4BRMA 3ZX0A 1BOTO 4YDUA 2I7PA 3IFRA 4FWLA 4FWRA 1BA1A 4B1XB 4JAXA 5TKYA 3ATUA 1V4SA 3ZX3A 4H0XB 3DXMA 1YUWA 4ISGA 2Q36A 4K41A 3WXIA 2V52B 3UKUB 1HLUA 4FWOA 5AQPA 3FZLA 3MN9A 4MO5A 3C7NB 4A62A 2YI1A 4FSVA 3GOIA 5AZIA 1NGEA 2FXUA 2YCHA 1KAYA 3AARA 3IMXA 3P4IA 3CQXA 4WYBA 3CERA 4B1WB 3AAQA 5KQ8A 4BRAA 3G25A 4JNEA 1Y64A 1BU6O 1P8ZA 4BRGA 4NO7A 4BQZA 3FZMA 3M6GA 4FPBA 2Q1NA 2P9LB 4PKHA 4BRIA 2CH5A 2E1YA 5LY3A 4CD1A 1GLFO 2D4WA 3F9MA 5JLHA 3AAPA 1TUUA 1BG3A 4HWIA 4IXCA 1XC3A 3O80A 5AQSA 4A2AA 4MLHA 2CGKA 3R6MA 3O5BA 4BRLA 1DKGD 2A5XA 4IWVA 1GLEG 1NGGA 4C23A 4B1VA 4H5VA 5BRFA 3LDOA 1NM1A 5AQRA 2V7ZA 4PKIA 5F1XA 3WEEA 1MWKA 3MMVA 1NGAA 4BRNA 5EOYA 5E84A 4BROA 4K43A 4IZ9A 2AP1A 2QWQA 3FZHA 4WQ4A 5AFUH 3WT0A 5AFUA 4EHTA 2HF4A 3DWLA 3VEXA 2P9PB 1X3NA 2QWPA 1T6DA 3A5MC 2F9TA 3R8EA 5AQLA 1DGKN 4DQ8A 4FOIA 2GUPA 4H0TB 4CZJA 3VF4A 3VF2A 4BQLA 2PBDA 4O5FA 5AQNA 2GELA 3O4WA 3W0LA 1Z6RA 5ADXH 3ATVA 2ITMA 5ADXA 3KVGA 3DXKB 3VGKA 2P9NB 5E26A 2GEMA 2HMPA 1R59O 1GLCG 2F9WA 3HZ6A 2VWBA 2QW9A 4J8FA 2H3GX 3CETA 2PAVA 3MN5A 3O1BA 5AZJB 1K8KB 1TUYA 3BEXA 4A2BA 4WQ5A 4YDUC 4EIAA 5BPLA 3HI0A 3FR0A 2P9LA 3FZKA 1HKGA 3EKUA 3MN6A 4CZFA 2E2PA 4NB4A 3LDPA 3CJ7A 5F0XA 2FSNA 5FPEA 4H5NA 1NGHA 2ASPA 2V7YA 4MLEA 4BREA 2NLXA 4E1JA 1DEJA 4FWNA 1U2VB 4CBUA 5AQQA 4BGAA 1TYQB 4PL8A 2IVOA 3VPZA 4BR2A 1HKCA 4BRPA 1RFQA 2A41A 1NGDA 3A5LC 1NGBA 4FPAA 4BR0A 3ENHA 2HOEA 1T44A 2E8AA 2NZTA 1U6ZA 3KHYA 4EAHD 5I9EB 1GLAG 3O1WA 5KPZA 2YHXA 1QZ5A 3CJ9A 4RWTA 4BR9A 3QICA 3M1FA 5F2RA 3CJAA 3ENOA 5BN9A 1NBWA 3IDHA 4BR5A 5AQYA 5BR9A 1KAXA 3BUZB 4CZKA 3A8YA 4BC2A 1H1VA 3BF3A 2P9SB 3JS6A 1J6ZA 4BRHA 3ZX2A 4FO0A 2EWSA 3FLCO 3MK6A 4BR7A 4H0VB 3O8MA 4FWMA 3UKRB 3R9PA 3GBTA 1SAZA 3DXKA 4JD2A 4CZEA 2P9NA 2BTFA 3D2FB 2A42A 1NLVA 4FWQA 4JHDB 3CJ1A 3O08A 5LJWA 3H45C 3FFKB 3EZWA 4BVOA 2J4RA 3ULEA 3A5OC 4BVPA 5BRHA 3FGUA 1KAZA 4EHUA 4FL9A 4KBOA 4WQ4C 2P9IA 3H1QA 2D0OA 3DAWA 3RSEB 3VERA 5KPRA 1GLJO 5JMVA 1MDUB 5EX5A 2IVNA 4CI6A 5AQMA 2GWKA 3WXJA 4H5RA 1BUPA 4I6MB 5AQZA 4BRKA 4CBXA 2ZF5O 3JXUA 5LJVA 1ZC6A 4BRQA 1C0GA 5BREA 3M3ZA 1TYQA 3D2EB 1GLBG 4BG8A 5FPDA 2P9UB 1RDWX 3QBWA 1NGCA 1JCEA 2E88A 1LCUA 3TPQA 3QFPA 1BWFO 1IG8A 3IUCA 5AQGA 3I8BA 4Z94A 4WQ5C 4GY2B 3LDNA 4HTLA 1GLDG 2KHOA 2YHYA 1S3XA 1NGJA 2I7NA 3VEZA 5CE3A 2CH6A 3ZETB 3UKUA 3VF6A 2E1ZA 4M7YA 3C7NA 3VGLA 5EVZA 4MO4A 4PL7A 3LDQA 1BA0A 5ELZA 3DXMB 1BO5O 1NGIA 4B1ZA 3UKRA 3CQYA 3SMPA 4PKGA 2QWMA 5JLFA 2GTDA 4CBWA 3ZEUB 1S22A 2Q0RA 3QMLA 1V4TA 3VEVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UB5A 1RT5A 2NRZA 3ZT3A 2ASOA 3EY1A 3O3GA 3WUHA 1X9WA 5A2QO 4QOZB 4BGBA 4DCHA 2E2QA 3ITHA 2QA4N 3KIOA 5HRPA 4CF8A 4B1UB 2O8BB 3OYMA 2HMIA 5FPMA 3PSFA 1NK5A 3BDPA 1HKBA 4I2PA 1VQMN 1P90A 2CGLA 4G9ZA 1KQSM 4E7IA 3ZYYX 1YAGA 4XH1A 3LM2A 4K42A 2HHHK 1OH6A 5DM7L 1NK7A 4KO0A 4LSLA 4GNIA 5M1OA 2B4JA 2FBYA 4DV4K 4XH4A 2HBLA 5CR4A 4CHPA 1QQOA 4MQ3A 3HJFA 4F2SA 3OY9A 2KLAA 4FJIA 5B8HA 1ATNA 4DLGA 3SPYA 4ID1A 4CHYA 3PLAA 2UU9K 4B9MA 4L8RB 2VQEK 4BRCA 4CEOA 3MXJA 4B8AB 1ATSA 2VG6A 2Z1HA 3A5NC 5JS2A 5BN8A 2PYJA 4C8MA 1T7PA 1KVCA 1JLCA 3ZEUA 4DF8A 5AR0A 3CF5L 2NRWA 3O6WA 4CJWA 1BGXT 1C1AA 2X6SA 1IJJA 2ZGZA 2E6MA 2W42A 2QK9A 1QTMA 4K8XA 2NNWA 3L3UA 4FWSA 4LFCK 1Q18A 3KLIA 4KHSA 4Y0WA 3C94A 4DSFA 4DHYA 1Z26A 5AQVA 1XUPO 2A40A 3TTCA 1IKWA 4PQUA 3UIQA 1VQON 4R5PA 3I33A 4M45A 4B3RK 3SLCA 4OX9K 4RTFD 1ZBLA 4IEIA 3CJCA 3HM8A 3J7YP 4M3ZA 3OJUA 4F9OA 4TSXA 4CZLA 1E4GT 1JLGA 2YKMA 4JI4K 3T3FA 2XRIA 1IBMK 1N33K 4KPYA 4FJHA 1SZ2A 4QS9A 5AQHA 1YVNA 4OPKA 3MXIA 5FRMA 1BL3A 4IFYA 4KTZA 5AQTA 1LAWA 3U9DA 3TAEA 4H5WA 1W2BM 2WFBA 2E5LK 2O8CA 3DM2A 1CXUA 3KLEA 3CXCM 1MU2A 3D2FA 2AA4A 1K9MO 4YOWA 1BDGA 2B6AA 4NYFA 4B9QA 1F21A 4KAZA 3OA9A 5KPTA 4KREA 2O8EA 3A0IX 3AVAA 5JICA 4BECA 3KZBA 3ALYA 1RBSA 4F3TA 2G8FA 3QIPA 1SS6A 1VSKA 1GLLO 1IH7A 1VSJA 4AF1A 4EFHA 4DQRA 4YFUA 3K58A 3I0SA 1D9FA 2ITGA 1OH5A 2WUSA 4IDHA 4ICLA 4CECA 1CZBA 3CIPA 1BQMA 2P9IB 2ASMA 1HQEA 3PX0A 4JV5K 2OZMA 4LH4A 1RDDA 2GWJA 1U04A 3VEOA 1DLOA 2C1GA 3VQDA 4O5BA 1U49A 1ESVA 2QWRA 3TAGA 4B3SK 3SK3A 2EX3A 1XMOK 4JK7A 3WXLA 3CJBA 1ASWA 4BRMA 3HT3A 2I7PA 3IFRA 3OYHA 2UUCK 3HYFA 3U3GA 3CPWM 4XJXA 1IKVA 4DR2K 1JLEA 3HVRA 1YUWA 3PIOL 3O9QA 4DFJA 4CCHA 3SQ2A 2O8FA 1KFDA 2Z1IA 3UKUB 3C6TA 4MO5A 4ZHRA 3CCEN 4B9UA 3DRRA 3VQ6A 3V1OA 3GOIA 1YI2N 4OLBA 2YCHA 3JYTA 3IMXA 3S3OA 4CFCA 1XNRK 4WYBA 3CERA 3AAQA 2QXFA 5K14A 4DV7K 3LDSA 4M3TA 5HLFA 1Y64A 1P8ZA 4BQZA 2OZSA 3NFAA 4YHHK 4FCYA 2F4VK 4BRIA 5LY3A 3I8DA 3JAMO 4LY7A 2Z1GA 3CCSN 3PIPL 2RF2A 4DG1A 3A2FA 3THXA 4MLHA 4I9LA 3R6MA 4Q5VA 3LZJA 4GV9A 3CPEA 1RT6A 4JKDA 1GLEG 3QNNA 4OPHA 4KH6A 4B1VA 4KTQA 1RDBA 1YITN 1HNWK 5BRFA 3ULDA 4FW2A 2V7ZA 5F1XA 1J53A 4BRNA 1N32K 3AO3A 2ATQA 4K43A 4X64K 4AILC 4DR7K 4O8UA 3OYBA 4CK2A 3QERA 4WQ4A 4EHTA 1EP4A 3V9XA 2D0AA 3JSMA 3SUNA 1JKHA 2YHAA 1T6DA 5GAHP 4ID5A 3EYZA 1HYZA 2F9TA 3R8EA 1DGKN 3IS9A 4DQ8A 1QSSA 2IAJA 3VF2A 4BQLA 2PBDA 3W0LA 1Z6RA 4DUYK 3ZSQA 1B92A 4FLZA 4GV6A 1U4BA 4JYAK 3CMEN 1R59O 2IS3A 1NJXA 4B3MK 3HZ6A 2IC3A 3CCMN 2D0CA 1Q9YA 3CETA 5KGWA 3K2PA 5AZJB 3BEXA 4FYDA 1Q82O 4YDUC 4IFVA 4EIAA 2VGMA 4DQSA 1REVA 4NCGA 4E7KA 3D0PA 3M8QA 2E2PA 4IEEA 3CJ7A 4OLAA 2B5JA 2OPPA 1NGHA 2ASPA 4MLEA 2NLXA 1WSIA 4LF6K 4DLEA 3RR8A 4DQPA 3EEQA 4FJGA 4FVUA 4BR2A 1HKCA 4DV6K 4PY5A 1RFQA 2A41A 4FK2A 4BE1A 3QEIA 2IOCA 4FPAA 2HOEA 1T44A 3NH0A 1VSMA 5I9EB 1XWLA 4CERA 3CJ9A 1SL2A 1C0UA 4BR9A 3HXMA 3QICA 3D45A 2HHTA 5BN9A 4BR5A 4C8OA 2UXDK 3OYNA 4CZKA 4E72A 3A8YA 4BC2A 5HOOA 2P9SB 4Z4CA 1S6PA 3HOSA 3MK6A 4BR7A 5J2QA 4K8ZA 1JJ2M 1S1XA 1Q8IA 3R9PA 3NGZA 4DV2K 3DXKA 4DTJA 3TI0A 2BTFA 3MX5A 2YX6A 3VQ8A 3QINA 4CJ5A 1TAUA 1QSLA 3D6RA 2J4RA 3TTDA 3A5OC 1S9GA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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