1ILOA

Nmr structure of a thioredoxin, mth895, from the archeon methanobacterium thermoautotrophicum strain delta h.
Total Genus 14
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
14
sequence length
77
structure length
77
Chain Sequence
MMKIQIYGTGCANCQMLEKNAREAVKELGIDAEFEKIKEMDQILEAGLTALPGLAVDGELKIMGRVASKEEIKKILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Identification of a novel archaebacterial thioredoxin: determination of function through structure.
pubmed doi rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein MtH895
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus str. delta h
molecule tags Structural genomics
total genus 14
structure length 77
sequence length 77
ec nomenclature ec 1.8.4.8: Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin).
pdb deposition date 2001-05-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1iloA00
3HXSA 4MZBA 5HFIA 5A4WA 2GQLA 2IMIA 1JZWA 1R5AA 1GH2A 2CVKA 1ZYEA 5D8IA 5HR2A 3ZFBA 4N10A 1X0RA 1GLQA 4TKYA 3GN3A 1PD21 1YF0A 3BJ5A 2C1YA 4TVEA 3I6AA 4I2TA 2X8GA 5HR1A 4WF5A 4ECIA 3QAWA 2J9HA 1M0UA 3F63A 1R26A 4L5OA 2CZ2A 2HRNA 3P8WA 1XWCA 1LBKA 1WIKA 1WJKA 4RQXA 1FW1A 2LTKA 1NSWA 2A2RA 1B4QA 3KP8A 2DIZA 4EXJA 4X43A 4AF2A 2CAQA 22GSA 2K9FA 4IKHA 3VI5A 1XFLA 1T00A 2B5EA 3C71A 4I6XA 3TJFA 2ON7A 3CBUA 3ED3A 4H86A 2D2ZA 3BD2A 2H6XA 1A24A 3SWLA 2CX3A 1WOUA 5J41A 1F6MC 1GLPA 1UC7A 5GZZB 5CRHA 2XPDA 3CSIA 1EEMA 5EPFA 2P31A 3MWHA 2OADA 3OR5A 5IMAA 3FZ4A 3CSJA 1AQWA 1GTUA 1V9WA 2LKUA 5F8BA 5IMZA 1V2AA 18GSA 3IDVA 2X99A 5D9TA 1GUHA 4HEA2 13GSA 1AQVA 3G9BA 10GSA 3L78A 1O8WA 2O7KA 4NWYA 3QFAC 4TN8A 1Z5YE 2O87A 2VL2C 5ECMB 5ID2B 1GNEA 2V41A 2KLXA 3EU3A 4QL7A 3A2VA 1U88A 2ALBA 2O8VB 2H1AA 1OE8A 3UIWA 4BWSA 1QK8A 5H5SA 1BAYA 2E7PA 1AIUA 3MAKA 3TGZA 4ZL9A 5ECSA 3G7IA 2WFCA 1GUKA 4KW6A 4MA9A 1K3YA 4I2UA 3GH6A 2DJ0A 3HHVA 4ZB6A 3P2AA 2VO4A 2QGVA 3APOA 5IMDA 4ILFA 5ECNB 1AC1A 1RK4A 1K0AA 2Z9SA 3H4KA 3RBTA 3HA9A 5HFKA 4PUAA 3TJBA 4MPGA 3LYPA 2ZCTA 4F2IA 3HD5A 5IO0A 4PNGA 4ECBA 1K3LA 4V1Ag 4I8BA 2VUPA 3W8SA 3PINA 3H79A 4MJCA 5GSSA 1TRWA 2L4QA 3KGKA 4KH7A 2RM5A 2EIRA 2JSYA 2I81A 4HI7A 5INYA 2KHPA 1FAAA 3DKSA 4BWQA 1Z7RA 5AIXA 2PWJA 4XS6A 1N2AA 4HOJA 4JRRA 3VK9A 1H75A 4XRDA 2FA4A 1JLVA 2L59A 3P7XA 5DCGA 4GXZA 2MMOA 4MZCA 3E0UA 1A8YA 3TUEA 4NXIA 5DALA 2OE0A 3M3MA 4IQ1A 2V32A 1VF4A 2AJQB 4EC0A 2GSSA 1GSQA 2NVLA 4EE0A 1K0BA 3ERWA 4GSNA 2F3MA 2HRFA 1SKWB 3ZTLA 1SJ6A 5G1KA 5F06A 1R5PA 3TCOA 2R6KA 6GSTA 4XIHA 2YZHA 3O6TA 3F6FA 1M2BA 1XZOA 1ERUA 2MZCA 3GRXA 3TOUA 2OJLA 2GLRA 1OAZA 5LD0A 2OBIA 3HJPA 3DEXA 2LNTA 2I9HA 2VCQA 4POMA 5JCGA 4YH2A 2AV4A 3PH9A 4LL1B 4RI7A 5LCZA 3GKMA 5FHIA 5E4WA 3EE2A 4MH3A 2GVPA 2DJ2A 5E59A 1U87A 1T7PB 3QPMA 4ZL8A 4D73B 1K0MA 3UAPA 1G6YA 3IPZA 3GKXA 1SENA 3GUSA 4GLTA 1K3OA 3FR9A 3D21A 2HT9A 4HS1A 2OKAA 1HNBA 3LG6A 2CQ9A 3EYTA 1GNWA 1H4OA 4JU5A 3FZ5A 4MCUA 4OO4A 4TR0A 1V98A 3QD9A 1PN9A 1HNAA 5IMCA 1ERWA 5D73A 2FWGA 5D96A 4IN0A 1GSDA 4ECCA 2H76A 3TRXA 5H5QA 1M7TA 2GQMA 3VI7A 2JSZA 1S3DA 1VF1A 12GSA 2FGXA 5GAPD 3LWAA 3L9UA 1N8JA 2HZFA 4KAEA 3CTFA 2C0DA 2YPMA 1QMVA 4X1UA 1WMJA 2FUG2 1G6WA 4F9ZA 2IJYA 1J08A 3LORA 3Q74A 4HU9A 2TIRA 1V40A 3TOTA 1Z6MA 5A4UA 3DVWA 1ERTA 5HR0A 2C4JA 5G2ZA 5ID2A 3E9JB 3HKRA 1SD9A 1DE1A 4E8EA 2VM2A 2HNLA 2PMTA 4BL7A 1XW6A 2FWHA 2C80A 1XIYA 4OWYA 4XS4B 1FVJA 1XVWA 2PERA 2WRTA 1BEDA 1X5DA 2DJ3A 2HLSA 3MNGA 5ECIB 3QMXA 3KP9A 4ZB9A 3FEUA 2AYTA 2CAIA 3MDKA 1SU9A 2XBQA 2JADA 3U6VA 3BOAA 4IVFA 1HNCA 2E2MA 2K6VA 4ZL7A 4HUAA 2IL3A 2F51A 5FT3A 2FNOA 3GTUA 4EL1A 3FZAA 5ECRB 1TK0B 2DLXA 5HFGA 2VCZA 2R37A 4YQUA 4OFTA 3RHCA 2LRCA 1FOVA 1PRXA 2WZ9A 4GF0A 4HQSA 3L0HA 3EWLA 1TXXA 1AXDA 2MMZA 3IAM2 4FYCA 3L9VA 3CMIA 1SD8A 3VWVA 2HSYA 1BQ7A 2L57A 4TW5A 1ACVA 2GDRA 4EDYA 3RPNA 5IPHA 2O85A 2PGTA 4KE3A 2IFQB 2BMXA 5B8AA 1TJDA 1S3AA 4N11A 4QL9A 2B3SA 3O76A 3CRTA 4TR4A 1T1VA 1A2MA 2DBCA 3C1RA 1UVZA 2O89A 5CRWA 3LXZA 3DYRA 2YJ7A 5IOWA 1X5CA 5CREA 2DIYA 4IGJA 5ECOB 2LJKA 7GSSA 1CQGA 2EIOA 4KCAA 4KB3A 4ID0A 1J9BA 2GGTA 2NTOA 1R7HA 4Q5QA 3HZ8A 5J3RA 4PNFA 5DJMA 2HZEB 2C0GA 3F9UA 5JCWA 14GSA 4GQFA 3R2QA 3RHBA 2CV4A 2DJKA 3FHKA 3FR3A 3RPPA 4IBPA 3TKSC 3CYNA 19GSA 1NHOA 2R5GA 1YY7A 4XHMA 4EO3A 2X64A 1GSSA 1A0FA 4ZILA 3D0ZA 4PXOA 3VPQA 4MF5A 3QOUA 4AGSA 2I3YA 2WGRA 4J2FA 4ZBAA 3VWXA 5G5FA 2HFDA 1TKDB 3LXTA 4Z7XA 3ME7A 2HSHA 3ZL5A 5B6NA 2VD0A 4Q5FA 2H0IA 1TDIA 2P0GA 4D73A 2PPTA 3ZREA 1BX9A 1U3IA 5J9BA 4OFNA 3IV4A 1F9MA 3W6GA 5JWOB 5G5EA 3JCML 1QGVA 3DD3A 1RQMA 1B9YC 2CA8A 2LRNA 3TRQA 5ECHB 5HQPA 3CRUA 1YQ1A 1B48A 1JFUA 3A2XA 4K1FA 5F07A 2VCXA 1XW9A 2GZYA 4KDYA 1E2YA 2JACA 2VD1A 4EF0A 3GSTA 3KZQA 3TKSE 1TI1A 4LL4B 3EURA 3ISOA 1ZGNA 4XS1A 1F3AA 3KH9A 1BG5A 3TB2A 2YWNA 1NW2A 1JHBA 4DSSB 2K8SA 2H8LA 5COHA 5EL8A 2WDUA 2NPBA 2H1GA 4N30A 4WETA 1PX7A 2WULA 5IMFA 1OE7A 4O7HA 2MYGA 1PKZA 1EP7A 2K8VA 5CNWA 8GSSA 1BJXA 2AHEA 3F3RA 4AJ7A 2NBSA 2KUCA 3IBHA 5B6MA 3ZIVA 5G31A 3SBCA 5H5RA 1KTEA 1XW5A 1SYXA 4WBJA 3UMAA 4FH8A 3L9SA 4GQCA 3HYPA 2YNXA 2VOCA 1K0OA 5IMVA 3KM6A 3RAZA 4X0XA 3HZ4A 4XS4A 4MP4A 2G0FA 2XBIA 3KXOA 2N5FA 4V2LA 1GP1A 3H1NA 1AW9A 2L5LA 4HZ2A 4HQZA 3D22A 1IYHA 1FG4A 2LQQA 4IJIA 2LEGA 1W4VA 3NZNA 3BBYA 3L4NA 3GX0A 1OKTA 4TR1B 5JWQB 1PKWA 2I1UA 4KSOA 3VPTA 4WXTA 1BYEA 1F2EA 1DSBA 3WD6A 6GSWA 3ZFLA 4G2EA 1OYJA 1HQOA 2CX4A 4J56E 3KH7A 1C72A 2OACA 2DMLA 3HJOA 3WYWA 2C8UA 2KP1A 4DSRA 4EKZA 1O6JA 5DCHA 1XOAA 3FZ9A 3QDNA 4NHZA 1R4WA 1GWCA 1KBNA 3KCMA 3M9KA 3ME8A 3W8JA 1MEKA 1U6TA 4IS0A 1FHEA 3CSHA 3FKFA 2VL2A 3HVVA 2LQOA 5FWGA 1PA3A 3H8QA 4PQIA 2MBTA 3QR6A 5LNKe 4NV2A 1I9DA 1MDJA 3D6IA 6GSVA 5CAXA 5A5KA 1V58A 3UEMA 4HDEA 3DXBA 2B5YA 5EY6A 2BTOT 1O73A 2H19A 2AUVA 4POBA 4ML1A 2YJHA 4BVXA 3UBLA 2QSIA 2ZUPA 1TRVA 1U3AA 1JLWA 3J7Yb 2HZEA 2RUFA 1M9AA 4N0VA 1E6BA 1X9WB 1XPVA 1VF2A 5ECLB 4GSSA 4BA7A 5B7CA 1A8LA 2AAWA 2YOIA 1GSUA 2KP2A 4O5RA 4RQRA 3D4MA 3Q6OA 1LJRA 3FK8A 4ZBDA 4IP6A 4IW9A 5D9WA 1F37A 2JZTA 1OC3A 2GS3A 3G7JA 3EMXA 4OFMA 2WCIA 3US3A 5KEJA 4F82A 2QC7A 2F9SA 4LA1A 1AUCA 2H0HA 4CDOA 1X5EA 1K0CA 4KSMA 3GH9A 1ON4A 4K0NA 2VLVA 3VURA 2VM1A 5EVOA 3UVTA 4PURA 4ACSA 1PSQA 3C73A 2VLUA 2CVDA 4IELA 2FA8A 5AGYA 2JZRA 4GTUA 2RIIA 2WS2A 1Z3EA 2FD3A 1M2DA 3GKNA 2DJJA 1SJIA 3VWUA 1W89A 2C3QA 3BCKA 5GAND 2TRCP 2FCHA 1A2LA 1TK5B 1A23A 2PBJA 4JBBA 1VRSD 4MZWA 4DSQA 4DSSA 2R3XA 3QFBC 1XWBA 3FW2A 1YDKA 3GL3A 2IMFA 2JL4A 4OMVA 5CP1A 3I9V2 1Y25A 3DRNA 6GSYA 1FB6A 4L8EA 5ECKB 2IMDA 2VCWA 3DVXA 1ILOA 1SL1B 2PUKC 3IC4A 4NPBA 2MMAA 5KN2A 4EUYA 3GX8A 3WGDA 3ZVJD 20GSA 4RUVA 3GIXA 3APSA 3UBKA 3VLNA 3F3QA 1M2AA 4LMVA 1T3BA 3M0FA 1EP8A 3I69A 3P90A 4L5LA 2C0EA 4PQHA 3FRCA 4CW9A 3IRAA 5KN0A 2B7KA 2GZZA 3V1WA 3IK7A 3N9JA 2RM6A 1A2JA 1XVQA 4TR1A 4WEYA 3GL5A 4MMMA 4J57E 4IP1A 1GSYA 5IQYA 1ST9A 3IR4A 4N0ZA 2VL9A 1ERVA 3Q19A 3ZIJA 1G7OA 2PVQA 4O92A 1SKSB 4HZ4A 3LYKA 4TRXA 2R4VA 4TOPA 3Q18A 3TJGA 2HXKA 4CHSA 1GTAA 3HJMA 3ZITA 5DVBA 5HR3A 4NHWA 4RI6A 4YAPA 4LMWA 5IM9A 3LGCA 1K0NA 2XPEA 1EOHA 4TR3A 5KN1A 5GSTA 1EGOA 3QCPA 5IIZA 1ZMAA 2GT5A 5CO3A 2DC5A 2R2JA 3H93A 1Y6EA 3TRPA 1T8EB 3APQA 1QFNA 1VGLA 2B7JA 3O3TA 1EWXA 3A3TA 1KEBA 2DSAA 4XCSA 2GTUA 3EVIA 1XBSA 4FIWA 1NHYA 1OC8A 2B1KA 3WGXA 4I97A 11GSA 2REMA 1SKRB 3DGQA 4PUFC 3GKKA 1TU8A 2H72A 2E0QA 2OBKA 1ZOFA 2GSQA 4V2NA 4IJ3A 3F4RA 5AISA 17GSA 1XOBA 2HE3A 1VF3A 3M8NA 4FO5A 3DIEA 3WT2A 3D5JA 1OKDA 3KJYA 1M9BA 2YWIA 4TXVA 4MPFA 1THOA 4IHUA 1FO5A 4LLRA 1MD3A 1TP9A 2L6CA 5CYYA 2M80A 4WF4A 4JE1A 3GV1A 1SK2A 5DAKB 2YP6A 2H71A 4ZIJA 4MJEA 4ML6A 2IMKA 2DMMA 4PX1A 3ZMLA 3ZZXA 3EC3A 3GFKA 1WRYA 1SK1A 2OE1A 2HYXA 1HD2A 1B4PA 1TK8B 1TRUA 3KMOA 4KUNA 2C0FA 3UJ1A 5L71A 1QXHA 4ZB8A 2H6ZA 4BVYA 3ZYWA 1SL2B 1CQHA 4L0WA 2F8AA 3G7YA 1TOFA 1O7UA 3TKSA 2V6KA 1KNGA 4YQMA 1TTZA 3HVXA 4F0CA 1ZZYA 2XC2A 3TDGA 3UVHA 1I5GA 4DEJA 2H70A 1IYIA 2CZ3A 2B6MA 4HU7A 3C8EA 3VWWA 1SJZA 4E8HA 3UOMA 4K6XA 2VCVA 2H66A 4TXOB 1TU7A 1SL0B 5ELAA 4K9ZA 2WJUA 4G9HA 1G0TA 1PQNA 2FHEA 2H6YA 1JZOA 1TW9A 5J4UA 1PL1A 2L4CA 1EV9A 4YAVA 2L6DA 4MF7A 4ECJA 4Q5NA 2H74A 1MD4A 3KD0A 6GSXA 1WWJA 2TRXA 3QAVA 3IHQA 1NM3A 2I4AA 3PR8A 2ON5A 3HCZA 3GYKA 3M1GA 3ERGA 3GSSA 3IAS2 3KTLA 2X8HA 4V1Ap 1EZKA 3ZVJA 1AQXA 3GURA 1X9SB 5D93A 1ZYQB 2KOKA 3KTBA 1ML6A 1GTIA 3ERFA 1PGTA 2YANA 4Q5RA 2GT6A 2PU9C 6GSUA 2AB6A 2IIYA 2VLTA 3GTUB 2LSTA 2G2QA 4OCFA 5ELGA 2H1BA 4K8MA 2L5OA 1S3CA 5CRGA 5AIVA 2CT6A 4K7NA 5ECQB 2EC4A 3F4SA 3I43A 2IFQA 1WPIA 4F03A 2P5QA 3RDWA 5JWRB 2GSTA 4K0GA 9GSSA 1Z7PA 2BJXA 5D9XA 2H1DA 3FYGA 4JR4A 3F0IA 1YEPA 2CVBA 16GSA 1YZXA 3KEBA 1GUMA 2YCDA 2FY6A 1ZCPA 2H30A 3LSZA 3IA1A 2IWTA 4MLYA 4JZQA 3TJJA 1Z9HA 1G7EA 4POKA 1SK0A 1UA5A 1OVNA 5JCUA 3C7MA 4DVCA 4O32A 4MABA 3IOSA 1OC9B 1AAZA 3U5RE 4V2MA 4WR5A 4AJ6A 1EEJA 1O81A 3GNJA 1V57A 4KGIA 1DUGA 2C3NA 5J9CA 4HJ2A 2GSRA 2V1MA 4YQVA 3QAGA 1QUWA 1JZRA 3IE3A 2V2GA 5DBQA 2VL3A 4WR4A 4ZXGA 2M46A 4KCEA 3DMLA 2DJ1A 2HI7A 1HYUA 1FB0A 4G19A 1URMA 1YKAA 1GL8A 1B9XC 1UN2A 4L0UA 2N5AA 4GRFA 1Q98A 2M72A 4QQ7A 4FYBA 3A5WA 3F6DA 5DAKA 4ULXA 5DQYA 3TKRA 2GZPA 1YJ6A 4MF6A 2X8CA 4ISDA 1WP0A 2H0GA 1WE0A 3NOFA 5F05A 4POLA 1USBA 1J0FA 1MTCA 3CTGA 1MDIA 3LQ7A 4NMUA 3TJKA 4NAXA 1GRXA 3F8UA 2MMNA 1EGRA 2OE3A 4KNDA 4MJAA 2NDOA 3ZMKA 3TKPA 3FR6A 4KDXA 4EVMA 2LRTA 4JR6A 5IPGA 4OD7A 3PGTA 3ZLPA 3S9FA 5B8BA 3NIVA 3GHAA 3WT1A 1Q4JA 3GA4A 3E3EA 2N5BA 1XWGA 5KN3A 3MSZA 2XHFA 1ABAA 1XWAA 4AJ8A 1TRSA 3VFIA 2VAFA 4XRAA 2ZNMA 3UARA 5ECPB 2JZSA 1FVKA 1O85A 2PN8A 2LV3A 1YEXA 3LEFA 4G10A 4GWRA 2LJRA 4GSTA 3D4TA 2RUEA 3EU4A 3C1SA 5F0GA 4TXOA 3UL3A 2YZUA 4FYUA 2OA7A 2J23A 1THXA 1A0RP 2H73A 3HDCA 6GSSA 4IQAA 4WKWA 3ZRDA 4K7OA 1F3BA 3GMFA 2EIQA 1GSFA 5D9VA 2YV9A 4XTSA 4MJBA 4MK3A 3LFLA 3N5OA 3KIJA 1M99A 3KMNA 4PQ1A 5ABRA 2K18A 3F4TA 4I5QA 3AY8A 2VIMA 2ES7A 4KA0A 4ZBBA 1MDKA 2IPAA 2V6OA 5DQSA 1XWKA 1PMTA 1O8XA 5A4VA 3DWVA 1PL2A 2YN1A 4F0BA 4WBRD 1EV4A 4K7IA 2LJAA 5DJLA 3M9JA 4GCIA 3CXGA 2MBSA 1X9MB 4P3YB 1XXUA 2YWOA 1DBYA 2RLIA 3K8NA 5CRDA 3LJRA 2P5RA 1GSEA 2A4VA 3HVSA 3EINA 2A2SA 2FLSA 1DE2A 1Z6NA 4NV5A 5G30A 2PVOC 1SYRA 4OCEA 1YF1A 2YWMA 3HY2A 2F8FA 5ENUA 2FWFA 1XCCA 4OO5A 4BPYA 3FY7A 4KX4A 2VCTA 5G1LA 2LS5A 1JZDA 3EMPA 2LUSA 1LU4A 1RW1A 1EOGA 1GULA 4K2DA 2B1LA 5DDLA 1B8XA 5C00A 1TI3A 2H75A 4MH2A 4HJMA 1PX6A 4EDZA 2QKEA 1T4YA 5IOXA 2JU5A 1ZL9A 5IO2A 2IMEA 2E2GA 1K0DA 5J5NA 3IXRA 5AN1A 4KDUA 2H01A 2B5XA 1QQ2A 3BCIA 3WGEA 3J7Yk 2YV7A 2WB9A 2IN3A 4PGTA 1GTBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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