1INUA

Crystal structure of mutant human lysozyme substituted at the surface positions
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWRAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Positive contribution of hydration structure on the surface of human lysozyme to the conformational stability.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1inuA00
1HHLA 5DN4A 1QUSA 1IP1A 4HTNA 2IHLA 6LYTA 3WU8A 1CKCA 2BQLA 4DD1A 3A34A 5HMVA 1ZMYL 1LSEA 4HP0A 4CFPA 1T6VL 1CKGA 3TXBA 1JUGA 5I4YA 4H9IA 4WM3A 3VWOA 3WUNA 1UBZA 2G4QA 1REYA 1LZ5A 5DN5A 1RCMA 1QSWA 1BVXA 3WU7A 3FE0A 4NSHA 1D0LA 1V7SA 4TSCA 3TMUA 3TXGA 3P64A 3B0KA 1AM7A 2G4NA 3AYQA 1REMA 1REZA 4HV1A 4KXIA 1JSEA 5F14A 5I4XA 1YL0X 2HEFA 5KXOA 1FN5A 1ZVYB 3LYTA 3QY4A 3TXHA 5LA5A 4DDAA 4W94A 1AKIA 3P68A 1YANA 2BAAA 3ATNA 1GD6A 1IR8A 1B7SA 1LJNA 4BAFA 3IWRA 1FLQA 2C8PA 2RSCA 2YBIA 2BQGA 1LZTA 3CQLA 5FDJA 4ET9A 153LA 5APCA 1GFAA 1XEIA 4LGKA 3TMVA 4DD9A 2FYDA 4M4OA 1P2CC 4N8ZA 1CJ7A 2F4GA 5DL9A 1LJKA 1LZAA 2CJLA 4B49A 3WVXA 5B05A 1DPWA 3WL2A 1GE4A 2ZYCA 1BB7A 1I20A 4CJ2A 1YAPA 3QNGA 2YBLA 1CKHA 3LYMA 1UA6Y 2DQEY 2I6ZA 1W08A 4XJHA 1LCNA 4H93A 2CDSA 1J1XY 1LYZA 1VATA 2W1YA 3WYHA 4RW2A 1HNLA 3IJVA 1LOZA 2ZILA 4XJFA 4UWVA 1GB2A 5B07A 1JIYA 5L3HA 2W1XA 5FCPA 4N1CC 3M3UA 2FBDA 2MEBA 5KXKA 1LYSA 1UC0A 1LYYA 3E3DA 1B5YA 4DD2A 5IHGA 4WL6A 1LSNA 3CSRA 1LHIA 1GE2A 3SP3A 5E9RA 1G7LC 1IOSA 4B1AA 1GBYA 1C10A 1RI8B 1W6ZA 1OUEA 1UIFA 1LZBA 1VDPA 5KXLA 1FDLY 1GAYA 3CB7A 4LYCA 1TAYA 2BQAA 5B06A 1MELL 5A3EA 3RT5X 2D4KA 4HTKA 3MGWA 3W6DA 5C6LA 1HFYA 4CFOA 1JJ3A 1JPOA 3A94A 4H94A 4DWXA 1B5WA 1GF3A 2MEHA 3TMXA 1G7IC 2I26L 4U3XB 1GB9A 1QTKA 3F6ZA 3J4GA 4MSTA 1LZEA 1PZYA 2YVBA 1I1ZA 2YDGA 4N1EI 3P4ZA 1WQPA 4OWHA 4NGIA 1JISA 2MEDA 1F0WA 1UIDA 3A90A 5LVGA 1GEVA 1NHEA 1IEEA 4NWHA 1WQMA 4WLYA 5KKJA 1CNSA 2Y8PA 1BGIA 4DC4A 134LA 3HFMY 4RLMA 4O34A 1VDTA 5T3FA 1QDTA 5EBHA 1DZBX 3ZEKA 4XJGA 3QE8A 1EQ5A 1LJEA 1LKSA 4NGLA 1GFJA 1B5UA 1HEOA 4LYMA 2YBNA 1IWWA 1JTTL 4X3BA 5IELA 4N5RA 1IWUA 1LZCA 1LMOA 4UWUA 3GXRA 2I25L 5KXPA 4WM1A 4WOAA 2BQKA 4NSJA 1V7TA 4YF2A 1TDYA 2Z38A 5LXWA 2IFFY 4OOOA 1NQIA 1LZYA 3A92A 2BQFA 133LA 3RZ4A 2MEGA 3BKHA 4UWNA 1GB6A 2LZ2A 4LYZA 4Z41A 1LZ6A 1FLYA 4G4HA 4NGJA 1BWJA 1T3PA 1WQQA 1GEZA 1XGPC 135LA 3TXIA 2BQOA 2BQMA 3W6FA 5LYTA 1LZ9A 9LYZA 3WU9A 1DPXA 1NKHA 3LZ2A 4DYGA 2BPUA 1INUA 1KIRC 1GB5A 2ZIKA 4B4IA 1IVMA 1OUGA 4HJZA 1HENA 3BKVA 4DDBA 5LINA 1DKKA 1I56A 1YQVY 3IJUA 5HLLA 5ILFA 1XEKA 3WULA 1C43A 1GBWA 2LZTA 4LYTA 5KXWA 5FELA 1RFPA 4ETDA 1HEQA 1LZ4A 2FYCA 1WTNA 1XSFA 5L3IA 4H9HA 2D6BA 4NEBA 2BQDA 3W6AA 1IC4Y 4J7VA 4XENA 2MEAA 2BQHA 2YBJA 1J1OY 1QDRA 1IOTA 1IR9A 1D0MA 4GCEA 1GPQC 5FEKA 3TXFA 3ZVQB 1B5ZA 2HEBA 5F81A 1FKQA 1HEMA 1GBXA 1YIKA 3A96A 4YM8A 1GFKA 3T6UA 1AT5A 2Q0MX 1LHKA 4OWEA 4LT1A 1IWXA 4A7DA 3G3BB 1LMNA 1WQRA 1LPIA 2A7DA 1GFVA 4NG8A 5KKIA 1FBIX 1DQJC 1LMCA 1BWIA 4W96A 1JKCA 3CSZA 4GCCA 3WUAA 3HBEX 1GDWA 1IY4A 2MEIA 1HSXA 1IY3A 1TCYA 7LYZA 5F16A 2BQBA 1DI3A 1OQMA 4XJIA 4XJDA 3J6KA 2BQIA 1LZDA 3WXUA 4YEOA 1B5XA 1QQYA 1NBZC 2AUBA 4NWEA 4WM4A 1EQEA 4QY9A 5L9JA 4XJBA 5KXXA 1OP9B 1B7RA 2D4IA 3A93A 2F4AA 1HSWA 4NSGA 1DXJA 2W1MA 1LSGA 2HU3A 3D3DA 4H92A 4H8XA 1F6RA 4I0CA 4TUNA 5APFA 2HEAA 1GFRA 4AXTA 1QTEA 5LVHA 1HF4A 3TXKA 1IOQA 5KXNA 2BLXA 5I54A 1GB0A 3EBAB 1YILA 1JEFA 3AGGG 4TWSA 132LA 4XN6A 1LJGA 4OWCA 4IJ4A 5KY1A 1GHLA 1OUAA 2LHMA 2DKVA 1GDXA 1IWYA 3CSQA 3KAMA 1IP5A 5APDA 5KXRA 4ML7A 1LZNA 4ANRA 4II8A 3WXTA 1OUHA 2N5ZA 4ZFPA 4CGEA 2F2NA 2CWIA 3LYZA 5KXZA 1GF8A 4C3WA 4BADA 2Z18A 1SLYA 2EKSC 4PJ2C 1JITA 4D9ZA 1B5VA 3FI7A 4LT3A 1BHZA 1GFEA 1YAOA 3A3QA 1LSDA 1XEJA 2ZNWY 1C46A 1CJ6A 1B7PA 4B4EA 1LHMA 1GBSA 1IP2A 1UIGA 1LHLA 5C6JA 1AT6A 1UUZC 2BLYA 2NWDX 1IO5A 1GFTA 5LVIA 1LZSA 5KXTA 4ZIXA 3RNXA 3WW5A 1OUFA 4Z98A 3CT0A 3LN2A 3WUMA 4NGKA 2C8OA 3ULRA 1B7OA 3N9CA 2PC2A 1YKYX 4B4JA 1VDQA 1G7JC 1LSMA 3B0IA 3CT1A 4H1PA 1LJHA 1OUIA 1JKBA 4GCFA 4XADA 4J0LA 1JJ1A 5F9UA 4BS7A 3AJNA 1LZ1A 4CHXA 2D4JA 1XFPL 2LYZA 5B59A 4G4BA 4DDCA 5K7OA 4C5FA 4DT3A 1DI5A 1GF0A 3LYOA 4H90A 4NG1A 4WMGA 3P65A 4H9BA 1FKVA 4M6DA 5LAFA 5B1GA 1MLCE 4GN3A 2XBSA 5A3ZA 5KXSA 2ZNXY 3AGHA 2LYOA 4NGYA 4WM6A 1CJ8A 1GF9A 1YAMA 1GWDA 1UCOA 4GN5C 4P2EA 5HNLA 2MECA 2HECA 4R0FA 5LAGA 1DKJA 1GB3A 3B0OA 4WO6A 4H91A 1IX0A 1NDMC 1B7MA 1HMKA 1XGQC 4QEQA 1LAAA 1NMMA 4YEMA 1G7MC 1JTOL 3A91A 5DM9A 5KJ9A 4H9FA 1ALCA 1LJ4A 4NGVA 3GXKA 1BQLY 1UIHA 3HBDA 1GFGA 1OUCA 5IDDA 2BQNA 3EO5A 4KPMA 1LYOA 1HEPA 4LZTA 1GBZA 1RE2A 4MCKA 4NHIA 1WVUA 4NGOA 4DD0A 1LSBA 4GCDA 1RJCB 4PRQA 1JKDA 3WW6A 2Z39A 4TTDA 2BQCA 8LYZA 2H9KA 5LA8A 1VDSA 4WLDA 4WLXA 4ETAA 5FHWA 3WVYA 2G4PA 1B9OA 1GFUA 4NHPA 2EQLA 3A6CY 3RU5A 4QGZA 3A8ZA 4HV2A 4WO9A 3W6CA 1LSYA 5LVJA 4NGZA 1C45A 1FLUA 5C6IA 1IP7A 1OUDA 1LMPA 1D9UA 1SQ2L 2XJWA 4DD3A 2ZQ4A 3A3RX 1JWRA 3AZ5A 2DBTA 1GFHA 4H8ZA 2YSSC 1YL1X 4I8SA 4OWAA 3AZ4A 1XGUC 1UACY 4H8YA 4NFVA 5I4WA 1NF5A 1YKXX 1IP3A 1HFZA 5I5QA 2Z37A 1A2YC 4WG1A 1KIPC 1ZVHL 5LYZA 1IC5Y 1LSZA 2F30A 1KXXA 4ETEA 1LJIA 2W1LA 1GE3A 1GAZA 2Z12A 3A95A 1HMLA 2HEDA 4IATA 4YOPA 1C7PA 2EPEA 1LTMA 1O23A 1BB4A 1HELA 4IASA 3AZ6A 1KXWA 4HPIA 4LFPA 4PHIA 5ILCA 1ZV5L 4PPOA 2FBBA 1HFXA 1XGRC 4ETCA 4GLAA 2ZQ3A 4E3UA 5I53A 1IP6A 2Z2FA 1VAUA 3ZVQA 4BAPA 2DQAA 1B0DA 2ZWBA 1UIAA 2GV0A 4ET8A 1FLWA 3OJPA 2D91A 4GLVA 4LT2A 1GF6A 5D5FA 3AW6A 4H9EA 1HEWA 1LHJA 1NDGC 1IIZA 2Z19A 5E4PA 2XTHA 1B7QA 154LA 2DQDY 1D6QA 3B72A 1LSAA 3TXDA 1D0KA 1OUJA 2BQJA 2EIZC 4PRUA 2DQFC 1LZRA 1BB5A 1OUBA 4WL7A 1CJ9A 4NHSA 3RW8A 4PGJB 5FSTA 4LYBA 2YBMA 3ATOA 4KL7A 1N4FA 2HUBA 2LYMA 5J7CA 3A6BY 1LZ8A 1DI4A 1LSCA 1IOCA 2ZIJA 2HTXA 4KT3A 4XYYA 1JJ0A 5DLAA 1AZFA 1WTMA 2HEEA 4LT0A 1CKFA 4NSIA 4G9SA 3D9AC 3W3EA 3WH1A 1BWHA 1GB7A 1C08C 2CGIA 1JTPL 1J1PY 5APEA 1LZGA 1NBYC 4EMNA 5LYMA 3W6BA 1GB8A 1LMTA 5HNCA 3TMWA 2BQEA 3TXEA 1LJJA 2WARA 2XBRA 4ZEEA 4RDSA 1BB6A 4LYOA 1BVKC 3AW7A 1LJ3A 208LA 3OK0A 1E8LA 3G3AB 4HJVA 4NY5A 5D5CA 1UIBA 1LMAA 3TXJA 194LA 1H6MA 4YENA 4NGWA 4EOFA 4NHTA 5HMJA 1GF7A 1B7LA 1LJFA 2DQJY 4L41A 4OOTA 4WLTA 4WM2A 1IORA 4N0JA 2YBHA 1HC0A 3AGIA 1H87A 2MEEA 3K3TA 1GE1A 1GF4A 4FDYA 193LA 2MEFA 4WG7A 1GBOA 2B5ZA 3LHMA 1XGTC 1IWTA 4H9CA 1LHHA 1LSPA 1UIEA 4HTQA 1NWGA 4B0DA 1TBYA 5LIOA 1YAQA 1VEDA 1GXXA 4J1BA 2HU1A 1QUTA 3P66A 5II3A 5F9XA 3WPJA 4OWBA 1UICA 2DQIY 4G49A 4HSFA 1JKAA 1YKZX 5LVKA 2ZYPA 1IWZA 3WMKA 1TEWA 1GE0A 1BB3A 3WPKA 1B2KA 1EQ4A 1YROA 1F6SA 3N9AA 4G4CA 1QSAA 4MR1A 1CKDA 1QIOA 1JSFA 2Z2EA 5HQ1A 1IP4A 2VB1A 1IWVA 3EXDA 4RW1A 4TX7A 4N9RA 4NHQA 1WVVA 5KXYA 4AGAA 4Z46A 1A4VA 3M18B 4QDNA 1IC7Y 1IR7A 3T36A 3W6EA 5M1YA 4HPEA 5B1FA 4ETBA 2H5ZA 1WQNA 1Z55A 3A67Y 4LFXA 2A7FA 4Z3MA 4WM5A 5KXMA 3LZTA 3AZ7A 1LSFA 1PS5A 4NIJA 1GF5A 1LMQA 4GCBA 2DQHY 1EL1A 4HJYA 3B6LA 1D6PA 3N9EA 4TSBA 3HBHA 2DQGY 1WQOA 1G7HC 4OW1A 2H9JA 1VFBC 3EMSA 1B7NA 1KXYA 3CT5A 4H9AA 1HERA 1LKRA 207LA 2DQCY 1JHLA 5JENB 4FJRA 3WPLA 4GN4A 1F10A 4J1AA 1GXV2 4R6CA 4DD7A 4RLNA 1KIQC 2X0AA 5AMYA 6LYZA 3AB6A 1REXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5DN4A 1IP1A 198LA 1DYGA 3A34A 4HP0A 1L51A 3TXBA 5I4YA 4H9IA 4WM3A 1UBZA 2G4QA 1REYA 1RCMA 1C66A 1QSWA 4NSHA 1L47A 1REMA 3C8QA 122LA 5F14A 5I4XA 5KXOA 1LYJA 104LA 243LA 5LA5A 3P68A 1B7SA 4BAFA 224LA 1FLQA 2RSCA 153LA 4M4OA 2RH1A 1L37A 1L84A 1QTDA 2ZYCA 238LA 1I20A 1XJTA 1CKHA 127LA 1LYZA 4I7PA 1DYDA 1HNLA 4XJFA 1JIYA 1L49A 3C82A 1UC0A 1LYYA 3E3DA 1C6TA 1LSNA 4LDOA 5E9RA 5KXLA 1LZBA 1FDLY 1GAYA 3RT5X 3D4SA 232LA 1P36A 7LZMA 3F6ZA 2YVBA 1I1ZA 1QUHA 2B6XA 1F0WA 5LVGA 3HFMY 5T3FA 3QE8A 1LJEA 4NGLA 1GFJA 1JTTL 1LMOA 2HUKA 1V7TA 2IFFY 1L30A 3BKHA 1LYEA 2LZ2A 4Z41A 164LA 129LA 2NTGA 1WQQA 2BQOA 2BQMA 5LYTA 1CV0A 9LYZA 1DPXA 3LZ2A 1LGWA 1GB5A 1G0LA 4HJZA 1GBWA 2LZTA 4LYTA 178LA 1WTNA 4H9HA 4NEBA 2YBJA 1LYGA 1WTHA 4W52A 1FKQA 1GBXA 1CUPA 1C62A 1AT5A 2Q0MX 1D2YA 2A7DA 1GFVA 5KKIA 1DQJC 3DN2A 1BWIA 1IY3A 2BQBA 111LA 4XJIA 189LA 3G3XA 1LZDA 130LA 1EQEA 1L63A 1B7RA 1OV5A 1LSGA 2HU3A 229LA 2CUUA 2HEAA 1QTEA 108LA 1HF4A 5KXNA 2BLXA 1L35A 4OWCA 4IJ4A 1CU5A 1OUAA 1GDXA 1L34A 1IP5A 1LZNA 3CDOA 1L04A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HHL A;  5DN4 A;  1QUS A;  1IP1 A;  4HTN A;  2IHL A;  6LYT A;  3WU8 A;  1CKC A;  2BQL A;  4DD1 A;  3A34 A;  5HMV A;  1ZMY L;  1LSE A;  4HP0 A;  4CFP A;  1T6V L;  1CKG A;  3TXB A;  1JUG A;  5I4Y A;  4H9I A;  4WM3 A;  3VWO A;  3WUN A;  1UBZ A;  2G4Q A;  1REY A;  1LZ5 A;  5DN5 A;  1RCM A;  1QSW A;  1BVX A;  3WU7 A;  3FE0 A;  4NSH A;  1D0L A;  1V7S A;  4TSC A;  3TMU A;  3TXG A;  3P64 A;  3B0K A;  1AM7 A;  2G4N A;  3AYQ A;  1REM A;  1REZ A;  4HV1 A;  4KXI A;  1JSE A;  5F14 A;  5I4X A;  1YL0 X;  2HEF A;  5KXO A;  1FN5 A;  1ZVY B;  3LYT A;  3QY4 A;  3TXH A;  5LA5 A;  4DDA A;  4W94 A;  1AKI A;  3P68 A;  1YAN A;  2BAA A;  3ATN A;  1GD6 A;  1IR8 A;  1B7S A;  1LJN A;  4BAF A;  3IWR A;  1FLQ A;  2C8P A;  2RSC A;  2YBI A;  2BQG A;  1LZT A;  3CQL A;  5FDJ A;  4ET9 A;  153L A;  5APC A;  1GFA A;  1XEI A;  4LGK A;  3TMV A;  4DD9 A;  2FYD A;  4M4O A;  1P2C C;  4N8Z A;  1CJ7 A;  2F4G A;  5DL9 A;  1LJK A;  1LZA A;  2CJL A;  4B49 A;  3WVX A;  5B05 A;  1DPW A;  3WL2 A;  1GE4 A;  2ZYC A;  1BB7 A;  1I20 A;  4CJ2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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