The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
63
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Structure and function of 6,7-dicarboxyheme-substituted myoglobin
pubmed doi rcsb |
| total genus |
63
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-12-12 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WCU B; 5M3S A; 2O5T X; 3E5I A; 4ODC B; 4HBI A; 1Z8U B; 2PGH B; 1A6M A; 3H57 A; 1IDR A; 2MGG A; 2Z85 A; 5HLU A; 3G4W A; 1MLF A; 3NMM A; 1RSE A; 1HGC A; 3TLD A; 1DWR A; 4YU4 A; 3G4V A; 3OVU C; 3M3B A; 1O1O B; 3ZJJ A; 1RQ4 A; 1G0B A; 5CN7 A; 1WMU A; 3ORD A; 2QU0 B; 2NRL A; 1ITH A; 3GQR A; 1HAB B; 1A01 A; 3UHE A; 2EVK A; 3D17 A; 2M6Z B; 1DXV A; 1LTW A; 1NS6 A; 1UVY A; 3PT8 B; 2H35 A; 109M A; 1YG5 B; 2DC3 A; 1SHR B; 3HXN A; 4MQJ B; 1LH2 A; 1G9V B; 1XZ7 A; 108M A; 2MGD A; 4MPM A; 1N9X A; 3WCV B; 1A4F A; 1MYT A; 3UGZ A; 1S69 A; 3OJ1 A; 2GRH A; 4KN3 A; 1HDB A; 2GTL B; 1V75 B; 1CMY B; 3FH9 B; 3ZJH A; 1YGF B; 1Y7C A; 4MXL A; 3PI8 B; 2D6C A; 2ZSX A; 3S1I A; 1QXD A; 5AZQ A; 1MKO B; 1CP0 A; 1QPW A; 1Y45 B; 1LFT A; 1MLH A; 3LHB A; 1MYJ A; 1T1N B; 2ZS1 A; 1CH4 A; 3OO5 B; 1J52 A; 2QFN A; 2LH3 A; 3S66 B; 1Y35 A; 4F6G A; 1LA6 A; 1S6A A; 1F5O A; 112M A; 1QSH B; 5HLQ A; 1GDK A; 3WCW C; 3QJB B; 5E29 A; 1J3Z B; 1F65 A; 2AUR A; 2HBG A; 1Y4G B; 1O1N A; 2EB9 A; 2ZLW A; 1RQ3 B; 1A3N B; 2HZ2 A; 4DWU A; 4ESA B; 1THB B; 2LH7 A; 1A6K A; 2DN2 A; 2LH2 A; 4H2L A; 3MN0 A; 1HHO B; 3UHV A; 1W92 A; 3OZU A; 1Y85 A; 1YFF B; 4LPI A; 1TU9 A; 2ZFB A; 4UIQ A; 1DO4 A; 3QM9 A; 4PQC A; 3LQD B; 3UHB A; 2HBF B; 1O1J B; 2BNL A; 3O89 A; 4N7O B; 2ZLX B; 3ZJR A; 2O5B X; 1Y8I A; 1YE2 A; 1NZ5 A; 3A0G A; 3NML A; 3CIU A; 1Y0W B; 4IRO B; 1BBB B; 2DN1 A; 1DKE A; 1BUW B; 1OR4 A; 1NS9 B; 3ZJN A; 3IC2 B; 3VRE A; 3UHS A; 3CY5 B; 1Y4F A; 3NFE A; 3MJU B; 1ABW B; 1DXT B; 2MHB A; 1MLO A; 2ZLV A; 4NI1 B; 2HHE B; 2H8D A; 1DTI A; 2O5M X; 2ZST A; 1R1X A; 2PEG B; 2VEE A; 1GDJ A; 3K8B B; 3UHH A; 5F0B A; 2GRF A; 3MBA A; 1N9F A; 4MQK A; 2SPL A; 2DN3 B; 3G4Y A; 4X0L B; 1XY0 B; 1Y4V A; 1A00 A; 3R5I A; 1Y4R B; 1MLK A; 3PIA B; 2EKT A; 3S65 B; 1S5X A; 1PMB A; 1Y4P B; 3ZJQ A; 1DTM A; 1Y7Z A; 5E6E A; 4OF9 A; 1CIO A; 5EYJ A; 1YOG A; 1YMB A; 3BJ2 B; 1MWB A; 2WTH A; 3HYU B; 2FAM A; 5IKS A; 2RI4 B; 3LB3 A; 3WR1 B; 1HBH A; 1Y5J A; 5HU6 A; 1HBS A; 2VYY A; 2ZS0 C; 1LFL B; 1XYE A; 3HEP A; 2R1H A; 2D60 A; 1MLU A; 2MGJ A; 1Y0D B; 1CO8 A; 3QQQ A; 2GKM A; 5F2A A; 4C44 A; 4N7N A; 5JGG B; 2H8F B; 1JY7 B; 1NAZ A; 1MYM A; 3LB4 A; 1MLR A; 3RJN B; 3PT7 B; 3VRF A; 3TM3 A; 5B85 A; 1Y2Z A; 1ASH A; 1HBI A; 3MJP B; 1G08 A; 2W72 A; 1XXT B; 2R4X A; 4MQH A; 3HF4 A; 1O1P A; 3WCT A; 3HRW B; 3QM5 A; 1EBT A; 4F4O A; 2LH1 A; 1NEJ A; 4M4A B; 1HGB A; 2EKU A; 2ZT0 A; 1LFQ A; 1CG8 B; 1EBC A; 1UVX A; 1S56 A; 1A3O A; 2EB8 A; 2ZSO A; 1KD2 A; 2VHB A; 1O1L A; 1GCV A; 1RVW A; 1YHR B; 5HAV A; 3QJC A; 3NL7 A; 3UHY A; 2MGF A; 5KKK A; 4HRT B; 1MTI A; 3WCV D; 2HBE B; 3ODQ B; 1AJ9 B; 1NZ3 A; 3UHW A; 3A2G A; 4MQI B; 1YE0 B; 1M6M A; 1DXU B; 1X46 A; 1Y7G B; 1HV4 B; 2BLH A; 1OBM A; 2FRJ X; 1MYG A; 1YMC A; 1V4W B; 5E83 A; 5HY8 A; 3UH3 A; 5CN6 A; 3GQP A; 1MOC A; 2G10 A; 2ZS1 D; 1CH1 A; 2OH9 A; 1NPG A; 3WCP B; 2VYW A; 3M39 A; 1M9P A; 3IC0 A; 1Y8H B; 1YIH B; 3ZJI A; 2AV0 A; 1RPS B; 1YEO B; 1MTK A; 1UIW B; 1A0Z A; 2QLS B; 3DHR A; 1BZR A; 3D1A B; 1G09 A; 1Y8W B; 1HBR A; 1J3Y B; 1MWC A; 2ZT1 A; 2QSP B; 2GNV A; 1A0U A; 1JZM A; 1MLM A; 1V07 A; 1YHU C; 3QMA A; 4ROL A; 3GQG B; 2AUO A; 4HSW A; 3MKB B; 3HHB A; 1DWS A; 1Y0T B; 3ARJ A; 3B75 A; 1K0Y A; 3WTG B; 5KDQ B; 107M A; 1S0H A; 1BZ1 B; 2HHD B; 3QM6 A; 1FDH G; 4HRR A; 3AT5 B; 4ILZ A; 4IT8 A; 4FH6 A; 1IT2 A; 1JPB A; 1HBA B; 1Y0A A; 2AA1 B; 3LB1 A; 2VYZ A; 4U8U C; 3UHX A; 1GBV B; 5CMV A; 3QZX A; 2ZSY A; 4UZV A; 1O1M B; 1XZV A; 1QI8 B; 4FWZ A; 1WLA A; 2XKG A; 1Y5F A; 3AT6 A; 4L7Y B; 1A6G A; 1O1I A; 2RAO A; 2XYK A; 1LHS A; 1Y83 B; 1J7W A; 1YDZ B; 1X9F C; 2VEB A; 4N7P A; 2D5X A; 1FAW B; 1Y46 A; 1O1K B; 1YHE B; 1OFK A; 3ECZ A; 1JZK A; 5AB8 A; 1GCW B; 3QJE B; 1BZZ A; 5EE4 D; 1VXD A; 1MYH A; 1H97 A; 1NIH A; 1LJW A; 3HEN A; 4AVE A; 1YEN B; 2ZFO A; 3D4X B; 4YU3 B; 3W4U B; 1IRC A; 1DXC A; 1LHT A; 2HHB B; 3ZJP A; 2Z8A A; 3EOK A; 4MQC A; 4G51 B; 1OUU A; 1IRD B; 2G11 A; 1MOH A; 1XCH A; 3UHI A; 1D8U A; 4AVD A; 5JDO C; 1XZ5 B; 2R50 A; 1YEU A; 4SDH A; 7HBI A; 1NPF A; 1VXC A; 2D2N A; 2QMB A; 4MU5 A; 1B0B A; 1MNJ A; 4H0B A; 2QSS A; 1IT3 A; 1HGA B; 1VXE A; 1NQP B; 2HBS B; 1YVT B; 1JF3 A; 3GYS A; 2Z6N A; 2ZLU A; 2ZS0 B; 1CG5 A; 3E55 A; 1YCA A; 2ZSN A; 3G52 A; 2IN4 A; 1C40 A; 1Y31 A; 1MBA A; 3FS4 A; 3R0G A; 4M4B A; 2AUP A; 1LH7 A; 3IA3 B; 1ABS A; 1LFZ A; 2MYB A; 1HBG A; 3WFX A; 5CNE A; 1VWT A; 2OLP A; 3SDH A; 1K1K A; 1UT0 A; 1RQ4 B; 1G0B B; 1QXE A; 1ECA A; 3QZZ A; 4O4T A; 2W72 C; 2BLI A; 3GQR B; 1ABY A; 1I3D A; 1OFJ A; 1A01 B; 3EU1 B; 3WCT C; 3D17 B; 1J3F A; 1NS6 B; 1YH9 A; 4F69 A; 2ZT3 A; 2H35 B; 2D2M C; 1HAC A; 1YEV A; 2ZLT A; 3HXN B; 3GK9 A; 1LFV A; 4JYQ A; 3M38 A; 3OGB A; 1GZX A; 3VAU A; 2R4Z A; 1A4F B; 4NS2 A; 1XQ5 A; 2VLX A; 3QJD B; 3ARL A; 1NGK A; 1HAB A; 2G0S A; 4BJA A; 5ILP A; 1DXD A; 1HCO B; 4N8T A; 1YG5 A; 1QXD B; 4MQJ A; 1MWD A; 3ARK A; 2E2Y A; 1MNK A; 4F6B A; 1QPW B; 1PBX A; 2O58 X; 1LH3 A; 1LFT B; 5SW7 A; 1MNH A; 3DHT A; 1V9Q A; 2ZS1 B; 3LB2 A; 3AQ5 A; 3HC9 A; 3HEO A; 2MGA A; 2MBW A; 2C0K A; 4MBA A; 1YGF A; 1Y35 B; 1LA6 B; 3U3E A; 1COH A; 5ILM A; 3S1J A; 1FSL A; 1C7C A; 1MYZ A; 1JL6 A; 3WCW D; 1S5Y B; 3BOM A; 5E29 B; 1MKO A; 5HBI A; 1O1N B; 1MNI A; 1GLI A; 1AJG A; 2ZLW B; 1Y22 A; 2MYE A; 4ZVA A; 1CBL A; 3QM7 A; 2DN2 B; 5HLX A; 1YHU A; 4H2L B; 3LR7 A; 1Y85 B; 2G14 A; 2ZFB B; 1MBS A; 1LH5 A; 3UBC A; 3WFT A; 1YIE A; 2GL3 A; 2ZT2 A; 2R4Y A; 4B4Y A; 3D7O A; 5D1V A; 1CPW A; 3ED9 A; 5CND A; 1CBM A; 1SI4 A; 2MYD A; 3UH6 A; 4FWX A; 4U8U A; 1J7Y A; 1LFY A; 2V1I A; 3A0G B; 3CIU B; 1HHO A; 2DN1 B; 1YFF A; 1NWI A; 2DHB B; 2MB5 A; 3GLN A; 2MYC A; 2HBD A; 3H58 A; 1BVC A; 2BWH A; 3VRE B; 2AV3 A; 3NFE B; 1XZU B; 1YGD B; 1MLN A; 1X9F A; 6HBW B; 5KER A; 2MHB B; 2ZLV B; 1Y7D A; 2W6X A; 3ZHW A; 2H8D B; 4PQB A; 4IRO A; 1R1X B; 3D1K A; 1C7D A; 1RQA A; 3UHN A; 1ECN A; 2HZ1 A; 106M A; 2GKN A; 1Y5K A; 5CNF A; 1A00 B; 1FN3 A; 3R5I B; 2NX0 A; 2ZFO C; 1MLG A; 3GDJ B; 1GBU A; 3MJU A; 3A59 A; 2MYA A; 3P5Q A; 4NI1 A; 2GLN A; 4F6F A; 1JWN A; 2PEG A; 1EWA A; 5E6E B; 5CN8 A; 2HBC A; 4QAU A; 4NXA A; 1FCS A; 4NK1 A; 3UHC A; 4XS0 A; 2D2N C; 1FSX A; 1HBH B; 1Y5J B; 5HU6 B; 1HBS B; 1URV A; 1BIJ A; 1DWT A; 4KJT A; 4O2G A; 1VXH A; 1CLS A; 1XYE B; 2ZS0 D; 2D60 B; 1JZL A; 3RGK A; 1J40 A; 4WJG A; 3ZJO A; 1C7B A; 3E5O A; 3V2V A; 1YVQ A; 1Y8K B; 4N7N B; 2HCO A; 1MNO A; 101M A; 2MGL A; 2JHO A; 5MBN A; 3VRF B; 1B86 A; 1MZ0 A; 3WR1 A; 2V1K A; 1MLQ A; 1JEB A; 1UFP A; 1HRM A; 1MBO A; 1MYF A; 3ONZ A; 1G08 B; 2W72 B; 1H1X A; 1OJ6 A; 3WCU C; 3HF4 B; 3WCT B; 4TWU A; 1NZ2 A; 1V4X B; 1Y0D A; 2NRM A; 1NEJ B; 2W6V A; 1DO1 A; 2Z6T A; 1HGB B; 4FC3 A; 1LFQ B; 2H8F A; 1A9W A; 1X3K A; 3WI8 A; 2D2M A; 1BZ6 A; 1G0A A; 3DUT A; 3PT7 A; 1A3O B; 1MBD A; 1VRE A; 3UHG A; 3PI9 A; 1O1L B; 1GCV B; 1HBB A; 2O5L X; 4MQG A; 1VRF A; 3BJ1 B; 3NL7 B; 1XZ4 A; 2FRI X; 1I3E A; 3HRW A; 3A9M A; 2MGK A; 3OZV A; 1DLW A; 5EV5 A; 1SDK A; 103M A; 4KMV A; 3OO4 B; 1FLP A; 3MOU A; 1J7S A; 3IXF A; 1YCB A; 2R80 B; 1BJE A; 5E83 B; 3GQP B; 1J41 A; 3WCV C; 5ILE A; 1IBE A; 3GOU A; 2HBE A; 1AJ9 A; 1UX9 A; 1SPG A; 4O4Z A; 1M9P B; 1RTE A; 2GTL C; 1A6N A; 2NSS A; 3WCW B; 3BCQ B; 3EDB A; 3PEL B; 1A0Z B; 3DHR B; 1MYI A; 3BJ3 B; 4NI0 A; 4O1T A; 2FAL A; 1G09 B; 1VXB A; 1HBR B; 1Y09 A; 1QSI B; 3WFW A; 3BA2 A; 1A0U B; 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3GKV A; 4FWY A; 1C40 B; 1Y31 B; 1ECO A; 3FS4 B; 2G3H A; 3ZJL A; 1L2K A; 1V4U A; 3NMM B; 1LFZ B; 1HGC B; 1BIN A; 2B7H A; 2KSC A; 2V1H A; 5ILR A; 4YU4 B; 1VWT B; 1HDS A; 2LHB A; 1MLL A; 1CH7 A; 1IWH A; 3WCU A; 1WMU B; 102M A; 1ABY B; 4ODC A; 1RTX A; 2G0Z A; 2PGH A; 3WCT D; 1YH9 B; 1CP5 A; 3ECL A; 1DXV B; 5EET A; 1HAC B; 1YEV B; 2ZLT B; 2D2M D; 1LFV B; 2WY4 A; 1GZX B; 4MAX A; 2BLJ M; 1XQ5 B; 1O1O A; 1XZ7 B; 2QU0 A; 1JW8 A; 3EU1 A; 3ZOM A; 1LH6 A; 1HDB B; 2BW9 M; 3G4U A; 2G12 A; 4L2M A; 4N8T B; 1VXF A; 1Y7C B; 2M6Z A; 4G1B A; 3K9Z A; 1UMO A; 3PT8 A; 1PBX B; 1SHR A; 5SW7 B; 1G9V A; 3DHT B; 3WCV A; 3QJD A; 3ZJS A; 4MBN A; 2GTL A; 5MBA A; 1V75 A; 1CMY A; 1COH B; 3FH9 A; 1HCO A; 1C7C B; 3TM9 A; 3PI8 A; 2GNW A; 3BOM B; 1IOP A; 2SPN A; 1GLI B; 1OR6 A; 1Y45 A; 1Y22 B; 4XDI A; 1VXA A; 1ECD A; 1T1N A; 1YHU B; 2O5S X; 3OO5 A; 3S66 A; 5CNG A; 1YIE B; 1QSH A; 1S5Y A; 1CIK A; 4KMW A; 3D7O B; 3UHQ A; 3QJB A; 1J3Z A; 3AQ9 A; 1SI4 B; 2BMM A; 1Y4G A; 5JDO F; 3UH7 A; 3KMF C; 1SPE A; 1MBN A; 4U8U B; 1RQ3 A; 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