1IR7A

Im mutant of lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNMPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords lysozyme
publication title Tolerance of point substitution of methionine for isoleucine in hen egg white lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Gallus gallus
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2001-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ir7A00
3G3BB 4H91A 1UC0A 1LJNA 1GPQC 2BQIA 4BAFA 4WM4A 2X0AA 4N0JA 1IWVA 5E9RA 3RNXA 1WQQA 3TXBA 3G3AB 1OUGA 4XJGA 4DDCA 4II8A 1BB4A 4DT3A 5KXOA 1GFUA 1AM7A 1LHHA 1OUJA 2ZWBA 2LYMA 4RW1A 3CT5A 4HP0A 3P66A 4RLNA 4ANRA 4DD7A 4B4JA 4WL6A 5LVIA 3HFMY 3WH1A 3D3DA 4GN5C 5I5QA 2D4JA 5KXZA 1BGIA 4CGEA 1YKYX 4HTKA 5ILCA 1LJEA 1UIEA 1IEEA 1LSFA 1WQPA 1LZGA 2BQKA 3N9CA 5HLLA 1JPOA 1J1PY 3AW6A 2ZNXY 1GFRA 2W1YA 3N9EA 4GLAA 1RFPA 4NGVA 1FKVA 3AZ7A 1OUIA 5I53A 3WXTA 1BVXA 1D6PA 1LJIA 3A93A 4NHSA 1IP5A 4LYTA 1JJ3A 4H9IA 1B2KA 1EL1A 1BQLY 1WQNA 3LZ2A 132LA 3WW5A 1FLUA 3TMWA 1B7SA 3WUAA 3N9AA 4XYYA 1JITA 4B4IA 3WVXA 1F6RA 3WPLA 4WLXA 1YKZX 2Z38A 2Z12A 3QNGA 1LHIA 2A7FA 1FN5A 4HJYA 135LA 4XJIA 3T36A 3K3TA 1WTNA 4WM6A 4WG1A 1D0LA 1GE1A 4DDBA 5AMYA 5A3ZA 5FELA 3A95A 4UWNA 3WMKA 1WVVA 208LA 2Z19A 1D9UA 4H90A 4MCKA 1OUCA 1LYOA 3J6KA 1G7MC 5B06A 1WQOA 4M6DA 1JTPL 1IWUA 2EIZC 4CFOA 4WM3A 2HEDA 1HENA 1LHLA 4NEBA 1B5VA 5D5CA 5LVHA 1JUGA 1RE2A 1CKDA 1IWWA 5LVKA 3LYZA 2EQLA 4GLVA 1XEJA 1SLYA 1CKCA 2FBBA 1LMTA 1LPIA 1H6MA 2BQJA 2DQCY 1QSWA 2Z2FA 2F4GA 3LHMA 1JKBA 1YANA 1HC0A 1C7PA 1WVUA 1GB7A 1KIPC 1LJJA 1YKXX 1IP2A 5F9XA 1LMNA 1YAQA 3A8ZA 3P64A 5KXMA 2ZIKA 3AZ4A 1N4FA 1UCOA 4ETDA 1GBOA 1QTKA 4NY5A 5EBHA 1RI8B 4W94A 1NQIA 1GB0A 4N1CC 2MEBA 4TSBA 3SP3A 3A6BY 3A91A 1YL1X 1G7IC 4N8ZA 1GB8A 1HMLA 2MEDA 1T6VL 4I8SA 5KXXA 4NGYA 1GF9A 4WO6A 1LHJA 4OW1A 1LZ9A 1F10A 2MEHA 1XGUC 1B5YA 1LAAA 4ETCA 3W6FA 4RLMA 1JJ1A 1UBZA 5APDA 4GCFA 3WPKA 5D5FA 4LFPA 1LKRA 4NGZA 4E3UA 4YF2A 3RT5X 4LYMA 1GD6A 1QUSA 1LZCA 4HPIA 4OWCA 9LYZA 2DBTA 3LZTA 4B4EA 1UIGA 4LFXA 4H9EA 5LIOA 1I56A 3TXHA 1C10A 1B5WA 1UIAA 1GB3A 4R6CA 1VFBC 1LJKA 1LZ1A 2ZQ4A 4WOAA 5DM9A 4AGAA 4NWHA 1JTOL 5LAGA 4NHIA 4ETBA 1F6SA 3WUMA 4H94A 1QSAA 3WYHA 2LYOA 1IP7A 1YILA 5DN5A 5ILFA 1GBXA 4BADA 1ZVHL 1TDYA 2DQGY 1HEWA 1XSFA 4CFPA 4XJFA 3QE8A 2I6ZA 1LTMA 1VATA 1BB6A 3A94A 3B0KA 1IOTA 1FLQA 4EMNA 1IX0A 3AB6A 3AW7A 4N5RA 4XADA 2D4KA 3ATOA 3EMSA 5FSTA 4XJBA 5T3FA 3ZVQB 2BLYA 5JENB 1B7MA 2D91A 2G4QA 3WU9A 4H9AA 1YROA 2ZNWY 1C43A 1FDLY 1LZAA 4LYCA 2BQGA 5LVJA 5B1FA 4WO9A 5KKIA 1OP9B 2Q0MX 4NHTA 1KXXA 1GDWA 3EXDA 4ET9A 4ZFPA 1CJ7A 4TWSA 4XJDA 3AYQA 4QEQA 1KXWA 1PZYA 5I4WA 1HEPA 4LT3A 3W6EA 1I1ZA 2RSCA 5F16A 4YENA 1LJFA 133LA 1INUA 2ZILA 4MR1A 4G49A 5F9UA 4DD2A 3M3UA 4KL7A 1HELA 5KXSA 4R0FA 1LSBA 3ATNA 4NGJA 1J1OY 2BQHA 1TCYA 2WARA 5I4XA 1JHLA 3AGIA 1HFYA 1HMKA 1GFHA 1CKFA 2DQFC 4G4BA 4IASA 2BQLA 1IR9A 1REZA 3ZEKA 4NSJA 8LYZA 2DQJY 5F81A 4C5FA 4OOTA 1CKGA 3RW8A 4TX7A 3IJUA 1JWRA 4LT0A 4WM5A 2HU1A 3W3EA 4DD1A 1XGRC 1LSCA 3TXJA 4DDAA 5KXWA 3W6AA 7LYZA 5KKJA 3OK0A 4GCDA 2MEFA 1T3PA 5C6IA 1NF5A 1IVMA 1GFGA 1YAMA 5HNCA 3W6BA 2BQBA 1VDTA 3ULRA 1LSPA 154LA 4LT1A 3IWRA 1GWDA 3A92A 1D0KA 4HSFA 207LA 3T6UA 1NMMA 5APFA 5II3A 2BQEA 4IATA 2BQAA 1LSGA 4CHXA 3A34A 2HEFA 4KT3A 2HTXA 1UUZC 1LJ4A 2MEAA 4ML7A 5LA5A 2IFFY 4H92A 5C6LA 1IORA 1GAZA 1IWYA 1CJ9A 2F30A 4I0CA 1B7OA 3ZVQA 4QY9A 1I20A 1GF8A 4H9HA 1AZFA 5KXRA 4NSHA 3EO5A 2DQHY 3WW6A 3CQLA 4LYBA 4P2EA 5I54A 5KY1A 1VEDA 1V7TA 4L41A 1GF7A 2DQDY 1JKAA 4QGZA 4OWAA 3E3DA 1LSNA 1GEZA 1OUBA 3VWOA 3HBHA 4NIJA 4X3BA 1LSYA 4WLTA 1DPWA 2LZTA 4WLYA 1LMQA 1IIZA 3B0OA 1V7SA 2D6BA 1LSZA 2EPEA 1LZRA 1HFZA 4GN3A 1QQYA 3M18B 3P4ZA 2MEIA 4ZEEA 3MGWA 1UIDA 4PGJB 1DKJA 2Z18A 3LYOA 5IDDA 1LYSA 4LGKA 4Z46A 1IP3A 2BPUA 2LZ2A 3D9AC 2HECA 4NG1A 4PHIA 4PPOA 4H8XA 1OUAA 1ALCA 3TXDA 1GB2A 5KJ9A 1WTMA 1H87A 5FEKA 4H9FA 3AGHA 4HV1A 4WG7A 4HJZA 1CKHA 1KIRC 1QDRA 1FKQA 1YAOA 1MELL 3B72A 4U3XB 4WM1A 2EKSC 4J7VA 4TSCA 3TMVA 5LVGA 2CJLA 2BQOA 4G4CA 1LMOA 1NKHA 4W96A 4UWVA 3WULA 1EQEA 2W1MA 1G7HC 5LAFA 1KXYA 1ZVYB 2F2NA 1EQ5A 5LXWA 4LT2A 5KXLA 3W6DA 1IC4Y 1LJ3A 1NBZC 4ET8A 1XGQC 3CT0A 3LN2A 2YBIA 1JKCA 1GFEA 1LMPA 3HBDA 5KXNA 3CSZA 5HMVA 1DPXA 1LKSA 3WXUA 1GF6A 2CWIA 1LZDA 5KXYA 1HHLA 2CGIA 4LZTA 2HEBA 1JKDA 1GFAA 5L3IA 3P68A 2YBHA 5LYZA 2NWDX 5LYMA 2H9KA 3CSRA 1A2YC 3J4GA 4Z98A 5FCPA 1GAYA 4GN4A 1HSWA 1IC7Y 4XENA 1GE2A 1HEMA 1OUDA 4OOOA 3A6CY 2ZIJA 1REXA 4NGLA 2MEEA 4NG8A 4NHPA 1UIBA 3P65A 1IP1A 1AT5A 1IR8A 1B7PA 1GE0A 1IWZA 1LZ5A 1W6ZA 1LZ8A 4Z3MA 4DYGA 1AKIA 1GB5A 1DI3A 1LYZA 4WM2A 4FDYA 4LYOA 4XJHA 1TBYA 5HNLA 2Z37A 4C3WA 1DI5A 1VDQA 2YBJA 4ETEA 1QDTA 2LYZA 5LINA 1TAYA 2N5ZA 3AZ6A 4NHQA 4NSIA 1MLCE 4OWHA 3RU5A 2MECA 1P2CC 3A90A 1IY3A 4HTQA 4NGWA 3A67Y 4B49A 2ZYCA 6LYZA 5F14A 2BQDA 2FYDA 1RJCB 4H8YA 1GFTA 1KIQC 2F4AA 2D4IA 1IC5Y 1BB5A 1FBIX 1LMAA 2H5ZA 1QIOA 1VAUA 1LSEA 5E4PA 2ZYPA 2DQIY 1LOZA 4NGIA 1A4VA 1GBZA 1LSAA 1IR7A 3FI7A 3QY4A 4NSGA 4RW2A 1IWXA 1EQ4A 1LJGA 4WMGA 3TXKA 4B0DA 5L9JA 1YAPA 4DWXA 2B5ZA 1YQVY 4H93A 1HEOA 3W6CA 1GFJA 4HV2A 1NBYC 1LSDA 2BQNA 4B1AA 5IHGA 5KXKA 1C46A 1G7JC 4YOPA 1LZEA 1IOSA 1VDPA 1GXV2 3CB7A 3HBEX 4H1PA 4A7DA 2BQCA 3AGGG 3BKVA 1NHEA 4N1EI 1IOCA 1NWGA 4CJ2A 1LHKA 2LHMA 1C45A 1GFVA 1QUTA 3IJVA 5K7OA 4AXTA 1B5XA 1D0MA 1HF4A 2DKVA 4QDNA 4NWEA 5A3EA 5IELA 2W1XA 5I4YA 3WL2A 2W1LA 4WLDA 4PJ2C 1F0WA 1UACY 1OQMA 5B07A 4ZIXA 1XEIA 1SQ2L 1GXXA 1REYA 1IP6A 1CJ8A 2YBMA 3A3QA 4BAPA 3A96A 4Z41A 5J7CA 1ZV5L 2HEEA 1GBWA 1UIFA 4J1BA 1AT6A 5DLAA 5KXPA 1GE4A 1LZ6A 4G4HA 1BB7A 3B6LA 1HEQA 2ZQ3A 1GHLA 1UIHA 1HNLA 2CDSA 4DD3A 1B7NA 3TMUA 2MEGA 3F6ZA 5HQ1A 5LA8A 1GF0A 1OUHA 1ZMYL 4J1AA 2G4NA 4H9BA 2FBDA 1LHMA 5LYTA 3LYTA 2BQMA 153LA 1WQRA 3AZ5A 1GB9A 4XN6A 1RCMA 4YEOA 2IHLA 2PC2A 3GXRA 4BS7A 2C8OA 3WU7A 1HERA 193LA 2H9JA 2HEAA 2YVBA 3AJNA 4KPMA 1OUEA 1UA6Y 4DD9A 4H9CA 1NDGC 4M4OA 4IJ4A 3TXGA 6LYTA 1HFXA 1JEFA 1YL0X 1BVKC 1LCNA 1BB3A 1GF5A 1LZTA 1LJHA 3CSQA 3FE0A 2I25L 2XJWA 4G9SA 1DKKA 2DQEY 1LMCA 1PS5A 4PRUA 1LZBA 4ETAA 2A7DA 2XBRA 5FHWA 1LSMA 4HJVA 2HU3A 3TXIA 1LZSA 3BKHA 3TXFA 4YEMA 5HMJA 1IY4A 4OWEA 134LA 1GDXA 1TEWA 1IOQA 4FJRA 4DD0A 3WPJA 1XFPL 2AUBA 2Z2EA 5C6JA 1B7RA 1GBYA 1B7LA 1CJ6A 3TMXA 5DN4A 1B5UA 1JTTL 1QTEA 2GV0A 2BAAA 1B7QA 1BHZA 3RZ4A 4YM8A 4HPEA 4PRQA 1LZ4A 4TUNA 1G7LC 4MSTA 4UWUA 5KXTA 1IO5A 1XEKA 2XTHA 1FLWA 1BWIA 2Y8PA 1GF4A 194LA 1LZNA 4H8ZA 4NFVA 1BWJA 3B0IA 1GEVA 4NGOA 4OWBA 3WU8A 1JSEA 1YIKA 1VDSA 4J0LA 5FDJA 4LYZA 2BLXA 1GBSA 1HSXA 4D9ZA 1REMA 1JJ0A 3OJPA 1OUFA 2YDGA 1Z55A 4RDSA 5M1YA 4GCBA 1J1XY 2DQAA 2YSSC 1NDMC 4N9RA 2XBSA 3WVYA 4DC4A 5B1GA 1BWHA 1WQMA 1GF3A 1XGPC 1DI4A 2I26L 2Z39A 3GXKA 4WL7A 1JIYA 2HUBA 1XGTC 1IWTA 2VB1A 4EOFA 5L3HA 3KAMA 1B9OA 2G4PA 5APCA 1LZYA 3A3RX 5DL9A 4O34A 1CNSA 4GCEA 4TTDA 1O23A 1B5ZA 1DXJA 1D6QA 3TXEA 5B59A 1GE3A 2BQFA 1DZBX 1B0DA 2YBNA 1DQJC 2YBLA 3LYMA 2C8PA 3EBAB 4GCCA 1FLYA 1JSFA 1W08A 1UICA 2FYCA 3CT1A 4KXIA 5APEA 3WUNA 5B05A 1GFKA 1IP4A 4NGKA 1LYYA 1JISA 4HTNA 1E8LA 1C08C 1GB6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3G3BB 3HU8A 4I7LA 4WM4A 3C8RA 1IWVA 5E9RA 3RNXA 1D3JA 3TXBA 1OUGA 159LA 4XJGA 4II8A 2F32A 1D2YA 4RW1A 4K5YA 3HTGA 3P66A 4ANRA 4DD7A 4B4JA 3HFMY 5I5QA 1BGIA 4W58A 3N9CA 1LZGA 1RFPA 1QT3A 1FKVA 1C63A 1OUIA 251LA 5I53A 3UONA 1LJIA 2O7AA 4LYTA 250LA 1B2KA 3LZ2A 3TMWA 3WUAA 144LA 1QTDA 1JITA 3WPLA 184LA 1YKZX 1LHIA 239LA 2ANVA 1L12A 1L56A 4HJYA 1LI2A 3T36A 1C6QA 1WTNA 4WG1A 1CV5A 5AMYA 183LA 1PQOA 1T6HA 1WVVA 4H90A 2Z19A 3RUNA 4DDCA 1I6SA 1OUCA 1L0KA 1JTPL 1IWUA 4CFOA 4WM3A 177LA 4PK0A 1LHLA 1B5VA 3HTDA 1IWWA 5LVKA 1L30A 1C64A 1L59A 2BQJA 130LA 1PQKA 3DN1A 3CDVA 1GB7A 1IP2A 3CDQA 5KXMA 3HH5A 1UCOA 1QTKA 4NY5A 4N1CC 3A91A 1YL1X 1G7IC 1GB8A 1HMLA 1GF9A 1LHJA 2MEHA 1L41A 1G07A 236LA 201LA 4ETCA 1L71A 185LA 3W6FA 1JJ1A 4GCFA 3WPKA 2RBQA 1QUSA 1C10A 4R6CA 1LJKA 1ZYTA 5DM9A 4AGAA 1JTOL 4NHIA 3WYHA 2LYOA 1PQIA 2DQGY 248LA 4XJFA 1BB6A 1CV3A 1FLQA 224LA 4XADA 3ATOA 4ARMB 4I7OA 4ARJA 1L65A 2OU0X 1LZAA 3C8SA 5LVJA 4WO9A 1OP9B 4PJZA 1QT6A 4E97A 1G0QA 5I4WA 4LT3A 1L11A 3C8QA 4MR1A 1JTMA 4DD2A 3M3UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3G3B B;  4H91 A;  1UC0 A;  1LJN A;  1GPQ C;  2BQI A;  4BAF A;  4WM4 A;  2X0A A;  4N0J A;  1IWV A;  5E9R A;  3RNX A;  1WQQ A;  3TXB A;  3G3A B;  1OUG A;  4XJG A;  4DDC A;  4II8 A;  1BB4 A;  4DT3 A;  5KXO A;  1GFU A;  1AM7 A;  1LHH A;  1OUJ A;  2ZWB A;  2LYM A;  4RW1 A;  3CT5 A;  4HP0 A;  3P66 A;  4RLN A;  4ANR A;  4DD7 A;  4B4J A;  4WL6 A;  5LVI A;  3HFM Y;  3WH1 A;  3D3D A;  4GN5 C;  5I5Q A;  2D4J A;  5KXZ A;  1BGI A;  4CGE A;  1YKY X;  4HTK A;  5ILC A;  1LJE A;  1UIE A;  1IEE A;  1LSF A;  1WQP A;  1LZG A;  2BQK A;  3N9C A;  5HLL A;  1JPO A;  1J1P Y;  3AW6 A;  2ZNX Y;  1GFR A;  2W1Y A;  3N9E A;  4GLA A;  1RFP A;  4NGV A;  1FKV A;  3AZ7 A;  1OUI A;  5I53 A;  3WXT A;  1BVX A;  1D6P A;  1LJI A;  3A93 A;  4NHS A;  1IP5 A;  4LYT A;  1JJ3 A;  4H9I A;  1B2K A;  1EL1 A;  1BQL Y;  1WQN A;  3LZ2 A;  132L A;  3WW5 A;  1FLU A;  3TMW A;  1B7S A;  3WUA A;  3N9A A;  4XYY A;  1JIT A;  4B4I A;  3WVX A;  1F6R A;  3WPL A;  4WLX A;  1YKZ X;  2Z38 A;  2Z12 A;  3QNG A;  1LHI A;  2A7F A;  1FN5 A;  4HJY A;  135L A; 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 3BKH A;  3TXF A;  4YEM A;  5HMJ A;  1IY4 A;  4OWE A;  134L A;  1GDX A;  1TEW A;  1IOQ A;  4FJR A;  4DD0 A;  3WPJ A;  1XFP L;  2AUB A;  2Z2E A;  5C6J A;  1B7R A;  1GBY A;  1B7L A;  1CJ6 A;  3TMX A;  5DN4 A;  1B5U A;  1JTT L;  1QTE A;  2GV0 A;  2BAA A;  1B7Q A;  1BHZ A;  3RZ4 A;  4YM8 A;  4HPE A;  4PRQ A;  1LZ4 A;  4TUN A;  1G7L C;  4MST A;  4UWU A;  5KXT A;  1IO5 A;  1XEK A;  2XTH A;  1FLW A;  1BWI A;  2Y8P A;  1GF4 A;  194L A;  1LZN A;  4H8Z A;  4NFV A;  1BWJ A;  3B0I A;  1GEV A;  4NGO A;  4OWB A;  3WU8 A;  1JSE A;  1YIK A;  1VDS A;  4J0L A;  5FDJ A;  4LYZ A;  2BLX A;  1GBS A;  1HSX A;  4D9Z A;  1REM A;  1JJ0 A;  3OJP A;  1OUF A;  2YDG A;  1Z55 A;  4RDS A;  5M1Y A;  4GCB A;  1J1X Y;  2DQA A;  2YSS C;  1NDM C;  4N9R A;  2XBS A;  3WVY A;  4DC4 A;  5B1G A;  1BWH A;  1WQM A;  1GF3 A;  1XGP C;  1DI4 A;  2I26 L;  2Z39 A;  3GXK A;  4WL7 A;  1JIY A;  2HUB A;  1XGT C;  1IWT A;  2VB1 A;  4EOF A;  5L3H A;  3KAM A;  1B9O A;  2G4P A;  5APC A;  1LZY A;  3A3R X;  5DL9 A;  4O34 A;  1CNS A;  4GCE A;  4TTD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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