1ISZA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with galactose
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
total genus 160
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1iszA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1iszA02
2D20A 5JLVA 4X3AA 3AMGA 5C71A 4HU0A 1M53A 3FJ9A 1V0NA 1CXEA 3EF2A 1FH8A 1KB3A 3OBRA 4HU8A 3N11A 4ZE4A 3MV11 1WO2A 5I5RA 2WWDA 4TX6A 4UQCA 3VIKA 4UNIA 4W89A 5E9AA 2VURA 4AZ5A 3AZTA 1V3IA 4XFTA 1TWMA 1HX0A 4P7OA 2Y9FA 1N4KA 3CH9A 2J7GA 1JT4A 1DTUA 1FWUA 1ABRB 4AIUA 3OLDA 4D6JA 3CQAA 1B31A 4YN5A 2VI0A 1PX4A 3NBEA 3Q7XA 4I4SA 3WO4A 1GUVA 2O9PA 1B3YA 3WF2A 1PJ9A 3BH4A 1KGWA 1UZ4A 2DRYA 4X0NA 2VRKA 3K8KA 1EQCA 1Q1UA 3NSNA 4W84A 2BFHA 3CA5A 3BAJA 4JIEA 3SCWA 4OWJA 3L4VA 1WZMA 3PG0A 3L2LA 3RPMA 4Q91A 3M7SA 4LO0C 5DT5A 2WVSA 4OOZA 5GPRA 5IHSA 4KEIA 1W3JA 4DENA 1JD9A 1UKPA 3IJ7A 3PZMA 1OSEA 4MJ2A 3WQ6A 2KKIA 3QGVA 2X2TA 4LO2C 2VR4A 5A3HA 2OSWA 3IM6A 1E0VA 3EBVA 3HU7A 6A3HA 4PMXA 3MMWA 4KGLA 4G6JA 2DH3A 1HKIA 4PMVA 1UQYA 1E9LA 1V08A 3I3EA 5JUVA 1E0OA 1DHKA 1V6YA 1O6IA 2AOSA 2NVHA 2WSKA 3SCOA 1HWMB 4UTFA 1NP2A 1OB0A 1JYWA 3EDDA 3MSGA 3CUJA 4HMEA 5LA1A 1G1YA 4AD2A 9CGTA 1JFXA 1JQZA 1QI0A 2NT1A 5GNXA 4ML4A 2VNCA 1JT3A 1CNVA 4J7RA 5HXMA 4QKSA 5FD0A 4QKRA 4PUDA 1WDSA 2FDBM 2GVYA 3OBAA 3WDIA 2J25A 5D61A 3BGAA 3BAIA 3VT2A 5D4YA 1CGUA 1JZ3A 3CRHA 1RP8A 3DC0A 3G6LA 1DQOA 3AH2A 2BY0A 1JXKA 4F66A 5BP5C 3PTMA 1IJTA 2ZQNA 2VCCA 7I1BA 1E6ZA 2VVSA 3WQWA 1WD3A 3D5HA 2VX4A 1PC8B 1BF2A 3N0KA 3GXIA 4LO7B 2G3NA 3MMUA 4OZOA 2VCBA 3R4UA 4M24A 4GXPA 1E3ZA 1TFMB 1VENA 2PWFA 3OIHA 3CA0A 3L4XA 1W1VA 3AI0A 1Q03A 3WMBA 2ZX8A 3BAYA 4CU7A 5DEZA 2ZR1B 4AIEA 4HZ8A 2UY5A 5CLTA 2LIQA 3N9KA 4GO9A 3BADA 2X1IA 3AS2A 3CPUA 3PZUA 1ZU8A 1XGZA 4KEJA 5HNNA 1IRPA 1VB9A 2NYYA 1H0GA 2VSAA 1FV3A 4OBRA 3GZAA 4UQEA 3VM5A 3AZWA 4A3YA 1PAMA 2VZSA 3IIRA 4PMYA 5HDRA 4U33A 4I4VA 3KE0A 1XC6A 4TOQA 4CJMA 5CZKA 4ISQA 1FV2A 4X39A 4XB3A 1HIZA 4J2SA 2YA0A 4RE4A 1QW8A 4Q9GA 4QD2C 2E4TA 2QMKA 3T08A 4EFQA 2JIWA 2FH6A 4A7ZA 1G9CA 1HL8A 2OWXA 1EA9C 4P8WA 2CBIA 1NWRA 2XJ7A 4DUWA 4AD0A 4CU6A 1CWYA 1E6SM 3EYPA 5A6LA 1CZ1A 1MQQA 2CHNA 1L0PA 4AXNA 3F62B 2WHJA 1H4PA 3O6AA 1KBBA 4EEEB 3K8LA 4FLRA 4IY9A 3AH1A 3WQ4A 3FJKA 4GOVA 2GK1B 2E4MC 4JQ0A 1CLVA 1BGGA 3PTKA 1ONKB 1CYGA 5IFPA 2VTFA 1W1PA 5FZZA 1ESWA 3CUIA 1VBUA 4MB3A 4PEEA 3NJ3A 1UWRA 1GQJA 3VEQA 1GOMA 1M04A 4H9WA 1JYNA 3IM5A 3WINC 3WL1A 3SCPA 1XH1A 4WSKA 1BFGA 1NWUA 3GBDA 2EQDA 1GJUA 3WQ5A 3SNVA 4GKLA 3VGFA 3UJ0A 1ZJAA 5KZ6A 4USOA 1I1BA 3GXDA 3D3AA 4ENDA 1US3A 1W9DM 1BTCA 1PBGA 3WH5A 3N04A 2FH8A 1V3JA 4ZA3B 3AYRA 4BF7A 4GZIA 4CD4A 1CVSA 1E55A 1P63A 3T8SA 3SCUA 1I1WA 3AHXA 3NDZA 1ODZA 2W4XA 3UR7A 1CIUA 2VC9A 4W87A 3WIJA 4BQ5A 1UUQA 1M16A 4I96A 2CITA 2VU9A 1WP6A 1QNRA 2ZQOA 5I2UA 4MB1A 1TWEA 1AVWB 2GJRA 5FCZA 2HVMA 3AQUA 1DQGA 5E6ZA 1VEOA 1EDGA 2J7FA 1YHTA 1KQZA 1ZBVA 1US2A 1CTNA 1GQLA 2RG9B 3RILA 1BG9A 2RGLA 4MDPA 3CRIA 1AVXB 3VPLA 1I75A 1CE7B 3S8JA 3POKA 1CGWA 4NF7A 5F8YA 4MNMA 4IZXA 1FH9A 1EO7A 3W4RA 3B9UA 4P8XA 4ACZB 4IYBA 3O5WB 1JNDA 4PMZA 3WF0A 4ATDA 3ZXDA 4ZXLA 5HPCA 1B90A 1WDPA 1XZZA 4ZKTB 3VT1A 4PTMA 5A69A 4PMUA 3QOKA 2UY2A 4D6CA 4S3KA 2J8FA 1EV2A 1WKYA 7A3HA 2F61A 3ARUA 4MDOA 3CBWA 4ACYA 1S0CA 2BHYA 1TOOA 4USPA 2J77A 2NW0A 2GSJA 1AQ0A 4QLJA 3VIIA 4IISA 1UWUA 1E3XA 3WH9A 3OA5A 2WVTA 3BAGA 4XKIA 3WO3A 1SFSA 3U5UA 1K5VA 4U2ZA 4UQAA 3OGRA 3UESA 4C7DA 2BVYA 1NQ6A 1Q6CA 3OJMA 4HPHA 2OYLA 1EGZA 2D22A 2P39A 2KI4A 2WCGA 3V0BA 4NRSA 1RP9A 1NP0A 5ABEA 4CN1A 2E0PA 3AS1A 1XRVA 4LYPA 4JKXB 1XCWA 2UWFA 4PYSA 2BY3A 3SCVA 3ZT6A 4NZCA 1MVYA 2MANA 5M3WA 2CXGA 1UKQA 2AAIB 3ZJ8A 3RIKA 4W7WA 4OWKA 3O3QA 4ZFWB 1B2YA 3CZ8A 3W9TA 1DFQA 5D63A 1S0GA 3FGMA 4HR6C 2HZ9A 3BLPX 2J7HA 4P7QA 4DWSD 1E43A 4J3WA 3VIMA 5A6JA 4CCEA 4EFRA 2Q9XA 3L4ZA 2E3ZA 1JD7A 1S46A 2YL9A 1KCLA 6TAAA 1J01A 1KXVA 1JDAA 3D7WB 2WLZA 1YTOA 1Q6FA 3KL5A 2OWWA 2EPOA 3BRGC 4YOLA 3N1AA 1JY0A 1N82A 1XYFA 1UH3A 3WDHA 4XFSA 1PZ2A 4X37A 4WLCA 1XH2A 3F5LA 3LMYA 1EXPA 2FGLA 1KGUA 2KI6B 2G8ZA 1EOKA 1A3HA 3VGDA 3AMCA 5FKYA 1BGAA 4QD2B 3HMCA 5EFFA 1AQHA 3UG5A 5FZUA 4EE9A 3FW6A 3PZGA 2X09A 3GNPA 5AYBA 1JZ2A 4V28A 3VU2A 4J2YA 41BIA 2BY2A 1B3WA 5D8WA 2D24A 1WB0A 1W9PA 3CZLA 4FLQA 2AAAA 4I4XA 1HKNA 4QC4A 3V0AB 3MSDA 3VINA 4EK7A 2AFGA 3CU1B 1TA3B 3QR5A 2XG9A 4B16A 31BIA 1E1EA 4JRAA 2YKKA 3GNRA 4ZE5A 2ZUUA 1X6NA 3G6MA 1UKSA 3F5JA 2V3DA 5IXEA 1DWIM 1MW0A 5D9NA 1DZDA 3PZ9A 1UD8A 1WZLA 5BOWA 4PMOA 2ZOXA 4UFMA 2UY3A 4DUVA 2O92A 5DF0A 4JFTA 1G5AA 4HA4A 1S0FA 2E8ZA 2E9BA 1R85A 1VEMA 4OEEA 2MC2A 4QDMA 3I3BA 3I3DA 1FGAA 3A4XA 2ZUNA 4LO8B 1LL4A 3UETA 1ISWA 1Z4SA 2WMGA 2XGIA 5A2AA 4F8XA 3WNPA 4I4YA 4AC1X 1G82A 4KMQA 3I29B 2BEAA 3PHAA 4AMCA 2GJPA 2CERA 5BQUA 1CGVA 1LL6A 3O4BA 1ZB5A 3ARTA 5D8ZA 1EVTA 2DREA 4LO7C 5BXSA 1CGTA 2W61A 3GH7A 4ISRA 3GNOA 2A3AA 4V2XA 3EDFA 4UFKA 1GOWA 4BA0A 1JF5A 3BAOA 1J11A 1JYXA 2ESUA 2OLHA 1V6XA 3WELA 3EDJA 1UG6A 1FMZA 3FJHA 3O44A 4JPZA 3SUSA 3S2CA 4P0LA 4QBCA 1QQKA 4AD4A 4TTUA 2IXVA 1R8NA 2IWTB 3BX1C 3QR3A 5D9MA 3W81A 4B3LA 3RM9A 4U2YA 2AXMA 5DT7A 4XUYA 3W0KA 2ZXDA 3VD3A 1DLLA 1DJSB 4LO1C 3RJXA 2XTKA 1HP5A 1WZKA 1LQ0A 3FAWA 4KBBA 1LJYA 5B2HA 1IHKA 4XFUA 1G9HA 1BLAA 2FGZA 1V6VA 1ZBCA 3N13A 1DWHM 3LPGA 1GQIA 1F31A 4MNJA 4P7NA 1XSIA 1UWQA 1JFHA 5CG0A 3AXXA 4W5ZA 1XCXA 4J3XA 4P8UA 3T2QA 2P23A 2XVLA 2ZICA 2XIBA 3WDPP 1CENA 3WFZA 2XVGA 1GJWA 3S6TA 4P7RA 1CEOA 3POCA 5A8PA 1UD4A 1EH9A 5DVHA 1V6WA 1OGGA 4MPKA 3ZC9A 4ATLA 5EHAA 3MO4A 1QNSA 3QHNA 1SR4C 4CGTA 3N7MA 2CPUA 4M80A 4JFSA 2UUSA 4QCEA 4MNLA 3NBNA 3M6DA 5CGMA 3BA5A 5EBAA 1FMMS 2J8GA 4D6GA 1BVNP 3AXHA 5I79A 3SUVA 2WW5A 1HJQA 1LG2A 2PWHA 4ZGRB 5DSSB 2X0HA 5LA0A 1TG7A 3UERA 3FJAA 3A3HA 4JHOA 1DWAM 3FHAA 1ILR1 1GVIA 1E6RA 4D8HA 1ZBKA 3IJ8A 3ZO9A 1UH4A 1CXLA 1VFMA 2YDQA 3GYCA 1KWGA 7CGTA 3TOPA 2OSYA 4KGJA 3WD2A 3FJDA 2WK2A 2XGBA 1K9FA 2V3FA 2WC3A 1F4AA 3AMKA 3SCTA 2G3IA 1U33A 1BFCA 2WVVB 3OLEA 2EPKX 2F8QA 4K68A 2K8RA 1MW3A 4D71A 1GORA 2Y8VA 2VX5A 1LG1A 5CQ1A 4AZCB 1KNMA 1FFRA 3EDKA 4CCDA 3WDQA 4KRUA 4PMRA 3VIGA 4JP0A 3S8KA 2CCRA 2ZIDA 3GXMA 1O7AA 4D1JA 2WKGA 1WDRA 2VOTA 1PZ3A 3AMDA 2VCAA 1J18A 3OGGA 5F90A 4AY1A 3ZMRA 2HISA 3SIMA 5I0DA 1AVUA 5ABHA 4D72A 4CUCA 1E72M 4EANA 3BCDA 4PMDA 4E4PA 1HJUA 1G01A 5I23A 5BXRA 2XFYA 3CUGA 3PZVA 2G3JA 2HW9A 2WWCA 5CSUA 3W82A 3AIRA 4UFLA 3QYDA 2VZOA 4F9DA 3OG2A 1RG8A 4H8VA 3UD7A 4AZIA 4PSPA 3HJEA 2WC4A 3ZJ7A 1UZ1A 2BHZA 1WD4A 1NOUA 1LWJA 4JKLA 2X2SA 1W3HA 2C0HA 1W2PA 3AYSA 5A8MA 3BA7A 4CN4A 3AZVA 3BAQA 3THCA 5JIWA 1GONA 2XM1A 5F8WA 9ILBA 3NIYA 4PC4A 3UCQA 4GAIA 3WMUA 3A4AA 3H6QA 4LO3C 3CA3A 4LO0A 1IILA 3RDKA 1CXFA 5TD4A 3WY1A 2VR5A 2DT2A 2DIEA 4WK9A 3AS3A 1E73M 1W9BM 4I6IA 3IK2A 2AMGA 2Q3NB 3MMDA 4LO2A 1H49A 4XV0A 2K4AB 5F7UA 1UQZA 3VD5A 3WKZA 3WO2A 4TTGA 4L4PA 2J78A 4BQ4A 3AISA 1NH6A 2V3GA 2YL6A 4AD5A 3KWXA 2ESCA 4G6MA 3ZR6A 2XM2A 3L2MA 4UFJA 3ZOAA 1H2JA 3VM7A 4QALA 4TX8A 5ABGA 4TVUA 1CLXA 3GH4A 3IJ9A 4IUGA 1QHOA 4W5UA 4CVWA 1XD0A 4GP3A 3VDHA 3BB2A 3L4UA 3RTIB 3CIVA 1IZJA 1B3XA 5I3DA 3A4WA 3IAQA 1SMAA 3VNYA 4XX6A 1J0JA 3A23A 1Q4NX 2Y9WC 2NZ9A 1BARA 3H6RA 3IAGC 3NJ5A 4W7VA 1BA7A 4CN6A 1TIEA 3WBEA 4D6IA 1RPKA 2WMJA 1QVBA 4JCMA 2ZXAA 2OYMA 5ABFA 2GDUA 2W67A 2WZEA 2EJ1A 2YDSA 1W9XA 1NZKA 1J12A 1E6NA 4EAMA 4UQDA 1GOIA 4QBVA 2BXYA 2Q8XA 1WPCA 2CBUA 2XVKA 1FOBA 4JKQA 1DFCA 1I1XA 2BS9A 1QPKA 3E8LC 1AMYA 4H8UA 4Z2IA 4UZSA 1R86A 1Z32X 4F34A 4OOUA 2WHLA 3VO0A 3FUQA 4J2KA 1OWQA 2FHBA 5M03A 2WAGA 1FP8A 4PUEA 4CD7A 2ZXBA 3WF3A 4JL1A 1ODUA 1KQYA 4AW7A 3CZKA 1UR0A 2ZXQA 4C7GA 1W32A 1CGXA 1XSJA 4JCLA 2HWMA 1HJSA 1OT2A 4QLLA 3W29A 4GP0A 1RD6A 3ALGA 3GH5A 1HXJA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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