1IZEA

Crystal structure of aspergillus oryzae aspartic proteinase complexed with pepstatin
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
AATGSVTTNPTSNDEEYITQVTVGDDTLGLDFDTGSADLWVFSSQTPSSERSGHDYYTPGSSAQKIDGATWSISYGDGSSASGDVYKDKVTVGGVSYDSQAVESAEKVSSEFTQDTANDGLLGLAFSSINTVQPTPQKTFFDNVKSSLSEPIFAVALKHNAPGVYDFGYTDSSKYTGSITYTDVDNSQGFWGFTADGYSIGSDSSSDSITGIADTGTTLLLLDDSIVDAYYEQVNGASYDSSQGGYVFPSSASLPDFSVTIGDYTATVPGEYISFADVGNGQTFGGIQSNSGIGFSIFGDVFLKSQYVVFDASGPRLGFAAQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords aspartic proteinase
publication title Crystal structures of Aspergillus oryzae aspartic proteinase and its complex with an inhibitor pepstatin at 1.9A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 84
structure length 323
sequence length 323
ec nomenclature ec 3.4.23.18: Aspergillopepsin I.
pdb deposition date 2002-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1izeA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1izeA01
1QBSA 3LINA 5P1JA 5JODA 3PBZA 5P2QA 1HSHA 5P37A 2BPZA 1LYBB 5P4AA 1AM5A 1PROA 2HPEA 1MRXA 5P4PA 3EKTA 5P3SA 2QI5A 1FEJC 5P3WA 5OZHA 3BUFA 5P0TA 1LZQA 2V10C 5P0NA 5P78A 4GJCA 5P6VA 1HSIA 1HXWA 5P02A 5KAOA 4GJ6A 2OHSA 2BJUA 5P8BA 1W5VA 4FRIA 3BRAA 5P0ZA 5P1CA 1MSMA 5P7ZA 3UQXA 3OXVA 3UQUA 6APRE 3KMXA 2ZHVA 2VJ7A 1LS5A 2ZJKA 1Z1HA 1EBYA 3CYXA 2QHYA 3IGBA 5CLMA 4J5JA 5P4MA 3IN3A 5P8NA 4X2LA 2G69A 5AH9A 4ER1E 4Q1WA 5AGZA 5P4RA 8HVPA 3APRE 5P6QA 3ZPTA 1TW7A 1HSGA 2ZJLA 4XX3A 5P85A 1HOSA 5P2ZA 1MEUA 5P42A 1K6TA 5P5CA 4B1EA 3O9HA 3EM3A 1EBZA 3H0BA 4J54A 1T3RA 5P03A 4Y51A 1HPOA 4I8ZA 2VIZA 2QI3A 3ST5A 4ZLSA 5P2EA 1D4JA 5P0RA 4J1FA 3VUCA 5P1XA 1HHPA 5KOSA 5P2TA 5OZMA 1RQ9A 1YT9A 5OYTA 3LIVA 1XE6A 3BUGA 5P11A 2HB3A 1J71A 5KR1A 3QIHA 3UDMA 5ER1E 4OBKA 5P6KA 3WZ7A 5OZZA 5P33A 3BXSA 3PSYA 3KYRA 3BXRA 1HEFE 5P6GA 1YTJA 3HD8A 5P2MA 3G72A 5P34A 3G70A 3LNKA 1IZDA 1OEXA 1D4KA 3PVKA 4Y58A 1DP5A 4Y5EA 3UQWA 4Y4DA 5P6XA 3CMSA 5P22A 3PMYA 4HDPA 4GYEA 3Q5HA 1ZJ7A 2I4XA 3JVWA 2HS2A 3U7SA 3LITA 4OBZA 4NJTA 5P5XA 3URLA 5OZJA 4YD3A 1FG8C 4Y39A 2FS4A 2QNQA 1SGZA 2FNSA 4APEA 5P0YA 5JFPA 2O40A 5P69A 3OTSA 2NXLA 1NPVA 1ZLFA 3OUCA 3HBOA 1KJFA 5P1ZA 1GKTA 5EZXA 5P75A 5COOA 3MSKA 3K1WA 4EQJA 3S8IA 2V12C 3Q70A 5P2LA 1MRWA 4J0YA 2IQGA 2VJ6A 3TOGA 4BFDA 2ZYEA 5P1KA 3OQFA 4FE6A 2BPWA 5P3OA 4D83A 5E5JA 2QNPA 2Q64A 5P5UA 2HC0A 3BVAA 1AJVA 3OADB 2WEBA 2MIPA 3EBZA 3SM2A 1FKNA 1RV7A 3NDTA 5ENMA 5OZ7A 2IKUA 4Y37A 2QZWA 1SH9A 3MWSA 4Y5NA 3LHGA 2BPVA 2IL2A 4PYVA 4HVPA 4Y3TA 2P4JA 2AOHA 4R91A 3UFNA 4Z4XA 4NPUA 4B05A 1AVFA 1FIVA 4ZSMA 4TRYA 4Z22A 4L6BA 5P1AA 5P7QA 2VA6A 2VNNA 3EKQA 2AOIA 3APPA 5DQ4A 5P8KA 3DOXA 3OQKA 3OQDA 1OHRA 3M9FA 1SDTA 3PJ6A 4EJLA 1SBGA 5P6LA 1HEGE 5P6TA 4OBDA 5P23A 1MT7A 2ZHSA 5P6NA 3OXWA 2A1EA 4DJRA 3JW2A 3EXOA 3QBHA 1TSQA 2P8HA 4F73A 3D1ZA 1GVUA 3QPJA 3D91A 3L5BA 5E5KA 1FQ6A 5OYYA 4WY1A 1EPLE 4HZTA 3LPIA 1ZTZA 1K6PA 3PWWA 1HTFA 3ZLQA 2VA7A 4I10A 3TPRA 2Q54A 1NSOA 2AOEA 3SA9A 1W5YA 1HRNA 1BVEA 5P5IA 5APRE 1RNEA 2CEJA 3HW1A 3GGUA 1G0VA 3PRSA 1T7KA 2RKFA 5P1NA 5P0LA 1FF0C 5P4EA 1G2KA 4H3JA 2ZJHA 1QBTA 4DH6A 1AJXA 4PEPA 5P8OA 1B6PA 4Y3JA 1FMBA 3S56A 2QHCA 1FFIC 1HTGA 2AZ8A 4KB9A 4H1EA 2OHKA 5P4VA 4NPTA 3NU5A 1HPXA 5AHCA 5P3QA 4L7GA 1HVRA 5P07A 4DV9A 3UDQA 1CMSA 3O9DA 1IVPA 2I4VA 5P2AA 5DR7A 2AZBA 5P24A 5P3TA 3UDJA 4Y3SA 4D88A 4YOAA 3URIA 5OZWA 1EC0A 3CYWA 5P7MA 4Y3MA 2B8VA 4FS4A 5P2XA 4J0TA 2RKGA 5P05A 2IEOA 2PK6A 5P54A 5P5LA 5P28A 2B42A 4D85A 2JJJA 2FGVA 4COEA 3K5GA 5HDUA 5P3VA 5P7FA 4ZSRA 2ZDZA 3BGCA 5JG1A 3HVPA 5P31A 3VF7A 4RRSA 3QAAA 4E43A 5P7JA 2R5PA 3DV5A 3FKTA 4I0DA 2OHLA 3UDRA 5P1IA 5OYUA 5P1BA 1ZSRA 3K5FA 5P13A 1BBSA 1QBRA 2HS1A 3DM6A 4Y4EA 1EC1A 3L5DA 3OAGA 2I1AA 2J9KA 4DJUA 2QAKA 5P1FA 1SGUA 2AODA 3PCWA 3VF5A 3VV8A 5J25A 4I0EA 2VKMA 3BC4A 2QD8A 5P17A 3O9EA 3KT2A 5P30A 2I4UA 1EAGA 4PZWA 5P29A 5P2SA 1Z1RA 4Y4JA 1FLHA 1FQXA 3KN0A 3UPJA 5P5JA 3KFPA 5OYRA 1PSOE 5P3HA 5P3RA 3OOZA 4A6BA 2XFJA 3NSHA 5P8VA 5KOQA 4Y5KA 2OF0A 5P1DA 4FAFA 5P41A 5DQ1A 3NYGA 3Q4BA 3CIDA 4U7VA 3OK9A 4Y36A 2IGXA 5P26A 1K6VA 3CICA 5I70A 1APVE 5P7AA 4FGXA 5P7VA 1BV7A 3FIVA 1B5FB 3MXEA 5P60A 5P38A 4J1CA 5P1TA 5P7RA 5P1EA 4B1DA 3VFBA 3URJA 3H5BA 2HB2A 3GGVA 2Z54A 1LYWA 2ZJJA 3BUHA 4HDBA 5B18A 2AVSA 3OOTA 3ZKMA 5P06A 1CPIA 3PM4A 5P19A 5HE4A 2WJOA 1UPJA 1XL2A 5DQ5A 5OZ5A 4L1AB 5FIVA 2R3WA 5P1HA 3WB4A 1A94A 3KMYA 4FSLA 1QRPE 1G6LA 3VV7A 3WZ8A 9HVPA 1F34A 1HVHA 3UDKA 4LL3A 1ZBGA 1ZPAA 2HB4A 2AOJA 1IDBA 5P56A 3SA7A 4XX4A 1B6KA 5OZNA 5P7CA 3TKGA 4TVGA 3UTLA 3LIQA 1YG9A 4Y5PA 5P4CA 1MESA 1KJ4A 1B6JA 5P36A 3NXNA 2IDWA 4M8XA 1BXQA 2VA5A 4H3GA 3GGXA 4TRWA 2FDPA 5CONA 1M4HA 5T4SA 4QJ2A 4I0ZA 5P7EA 2F3KA 5P45A 1DIFA 5P5PA 5P3MA 4EP3A 3Q3TA 4Y5CA 3OUAA 5P7XA 3JVYA 1FMUA 1GVVA 5P0OA 2I0AA 4B72A 3OWNA 4Y4UA 5P0KA 5P5MA 5P4LA 5F01A 1TQFA 3K4VC 3FNSA 5P5NA 4Y3PA 3R1GB 5OZ8A 5UPJA 2NXDA 3KFSA 2B7FA 3L5CA 2VIEA 3NDXA 2ASIA 1ZP8A 4OBHA 4AA8A 2FNTA 5P68A 3NUOA 4H3IA 5P4BA 4GJ8A 5P6MA 5P51A 2BB9A 5P3YA 2PQZA 3T6IA 1E81E 1DW6C 2UY0A 3QI1A 5P6FA 3BGBA 4CKUA 4Y53A 5P7GA 5P5EA 4GZFA 3PGIA 1D4HA 4Y4GA 4Q1YA 4JPEA 2BQVA 3K5DA 2F3FA 3KA2A 2OHNA 3NDUA 1UH9A 2VS2A 5ENKA 1BWBA 3O9GA 3EM4A 5DR0A 1NPWA 5P2GA 4JECA 2QU3A 5P7TA 4Y48A 3IA9A 4RCFA 5P4ZA 5P09A 3R2FA 1AXAA 1XE5A 2CENA 4PPHA 3L58A 3HLOA 4Y44A 1HPSA 3VFAA 2Q63A 5P58A 3UQRA 1M0BA 3KF0A 5P1UA 5P82A 1ODYA 5P04A 3OU4B 5P8MA 4Y43A 5P2FA 2G1SA 4Y3GA 1W5XA 2Z4OA 3O9AA 5AH8A 3SABA 4YHQA 5P8DA 4R5NA 4Y3DA 5P4NA 5P44A 2FIVA 5OZ1A 4QLHA 6FIVA 5P0HA 3TPLA 4CP7A 2NNKA 5P84A 1APWE 3OHHA 1BXOA 5P6UA 2BKSA 4YD4A 3DJKA 2BKTA 1GNOA 3MSJA 4RGHA 4CPRA 1KJHA 3SA5A 3HVGA 3OUDB 1U8GA 4U7QA 5HDVA 1IIQA 2QZKA 5C9FA 3D20A 5P88A 3NXEA 3VF3A 5P8HA 4D8CA 1EPPE 4DJOA 5P3AA 5P27A 5P7YA 2P3BB 2QU2A 4YCKA 5P0DA 5SY2A 4XXSA 3ZPSA 4AA9A 1HTRB 4Y4WA 4GJDA 1QBUA 2PH8A 5KQYA 2IS0A 4DFGA 4Y57A 3KFNA 5OZ2A 5COKA 2OHUA 4RRNA 5P7BA 4GB2A 2OHRA 3OU3A 2V13A 5AH7A 3PWMA 4CPQA 3T7QA 5IVTA 5P0JA 4R93A 1PFZA 4CPXA 4OD9B 4QJ6A 3NUJA 3S2OA 2V00A 1A8KA 2XFKA 1B5FA 5P5OA 3I2LA 5P80A 5SY3A 4OC6B 3VLAA 5OYSA 5IVRA 4Y54A 2JJIA 4Y3RA 5P3NA 3N3IA 3RU1A 5P87A 5P4OA 1RPIA 5P4SA 2ER7E 3D1YA 3O9IA 5P5RA 4EXHA 5KR8A 5OZAA 2ZHUA 3OTYA 3SQFA 2FLEA 3BHEA 4L1AA 5P6HA 4YD7A 3EKPA 4DJYA 1ZAPA 3TPPA 4N00A 2BBBA 3ECGA 3NWXA 5P6ZA 3OUBA 1M43A 4K4RA 5ER2E 3G6ZA 4QJ9A 1Q9PA 1A9MA 3GW5A 4F76A 5DR4A 3EL0A 5P4DA 4Y4ZA 3VLBA 1NPAA 5OZBA 5P16A 1AZ5A 2ZGAA 3NR6A 5P5KA 3C9XA 3KFRA 4RLDA 4ZIPA 3T7XA 4DQGA 4Y41A 1W6HA 3S45A 2AQUA 5P5TA 5P5BA 2NMYA 1EC3A 5P86A 2ZE1A 3GI5A 5P7KA 3RVIA 4HDFA 2WF0A 3CKTA 2APRA 1AIDA 4DQBA 5HU0A 5HU1A 5P46A 2AZ9A 3KDBA 5P8CA 4ZPEA 2ER6E 5P81A 3LIXA 4ER4E 2G26A 2G1YA 4Y9WA 5P50A 5P6WA 4Y3EA 2HPFA 7UPJA 6UPJA 3I6OA 1HIIA 3TTPA 5P5WA 2NMZA 4YD6A 4FSEA 5P3IA 3VSXA 5P1PA 1W6IA 1YTHA 5OZOA 3EC0A 4FM6A 5OZFA 1K2CA 3VG1A 4MC1A 3GI0A 5DPZA 4ZE6A 1YTGA 3TPJA 1LYBA 2F8GA 1XL5A 4RVJA 5P0IA 5P62A 5TOLA 5C9DA 4Y3LA 2RENA 4Y4XA 1RL8A 5P18A 2PSUA 2UPJA 1EPME 4EP2A 4QJAA 2G22A 5P3JA 5P5SA 3UDYA 4Q1XA 1LYAB 1C6XA 3NU4A 1ENTE 2ER9E 5P7UA 3NWQA 1K1UA 2IENA 5IVQA 5P4HA 3LZUA 1HVJA 4XKXA 2IGYA 2IRZA 1KJGA 2JYSA 3LPJA 3OY4A 5P32A 4B70A 1TCXA 4DJVA 5P2VA 2P3DA 3RTHA 5P1RA 1IZEA 5P1VA 5P71A 3S53A 4J1HA 1UH7A 5P4FA 5F00A 2B60A 4AMTA 1WBKA 3IXOA 5P6DA 3L59A 4J0VA 5P3EA 4LXAA 5OZIA 2WEZA 1PPME 3O99A 1G35A 5DQ2A 2O4PA 1LV1A 4IVTA 3ZKIA 4M8YA 1ODXA 3TNEA 2PK5A 1K1TA 3DK1A 3QVIA 5OZSA 2O4NA 4YDFA 3EL4A 1HWRA 5I3WA 2F80A 2QD7A 5P6RA 1DMPA 1B6LA 1HIHA 3OUDA 4TRZA 2QHZA 5BRYA 1HVLA 4YDGA 2FGUA 1FFFC 2QZXA 5P08A 2NPHA 5P65A 1ODWA 5P67A 1FG6C 3SACA 5HDZA 4ZSPA 1SMEA 5OZDA 4IVSA 5P2CA 2RMPA 2G24A 1DPJA 4U8WA 3HAWA 3QS1A 3R4BA 1C70A 5P7NA 3O9BA 3GI6A 4NJUA 2HIZA 3L3AA 2OHQA 2G1RA 4I12A 4FRKA 1IVQA 5P8GA 2QI6A 3QRVA 4Y3WA 3ZPUA 2AVQA 3GI4A 5P40A 1A8GA 5HTZA 1PPKE 1GNNA 3PLLA 3NLSA 1C6ZA 4K4QA 3PI0A 5I3XA 5EZZA 2QMPA 1JLDA 4OD9A 3CKPA 2Q5KA 5P8EA 4Y5AA 2NTRA 1ER8E 1APUE 1LF2A 4I8WA 5P2IA 3VYFA 4GJBA 2G27A 5P12A 1BDRA 4JPCA 3OADA 1MTRA 1EPRE 1D4YA 4DI2A 2H6SA 5P73A 2I4WA 5P64A 1FGCC 5P0GA 4HLAA 3BVBA 3SA8A 5P72A 4MC2A 3VYDA 1DAZC 2AVOA 3OXXA 2G94A 5P4JA 4A6CA 1SIPA 4ACXA 5P74A 4HE9A 1META 4YCTA 4QJ8A 1SMRA 3LZSA 5P5QA 4DQCA 3D3TA 3L5EA 5P0VA 3K5CA 4Y38A 4RVXA 4ZEAA 1MSNA 3B80A 5P3KA 5P6AA 5P2UA 5P8IA 5P66A 1SP5A 2AZCA 3EL1A 4BEKA 5P7WA 2QMFA 4QGIA 5P49A 1BDQA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QBS A;  3LIN A;  5P1J A;  5JOD A;  3PBZ A;  5P2Q A;  1HSH A;  5P37 A;  2BPZ A;  1LYB B;  5P4A A;  1AM5 A;  1PRO A;  2HPE A;  1MRX A;  5P4P A;  3EKT A;  5P3S A;  2QI5 A;  1FEJ C;  5P3W A;  5OZH A;  3BUF A;  5P0T A;  1LZQ A;  2V10 C;  5P0N A;  5P78 A;  4GJC A;  5P6V A;  1HSI A;  1HXW A;  5P02 A;  5KAO A;  4GJ6 A;  2OHS A;  2BJU A;  5P8B A;  1W5V A;  4FRI A;  3BRA A;  5P0Z A;  5P1C A;  1MSM A;  5P7Z A;  3UQX A;  3OXV A;  3UQU A;  6APR E;  3KMX A;  2ZHV A;  2VJ7 A;  1LS5 A;  2ZJK A;  1Z1H A;  1EBY A;  3CYX A;  2QHY A;  3IGB A;  5CLM A;  4J5J A;  5P4M A;  3IN3 A;  5P8N A;  4X2L A;  2G69 A;  5AH9 A;  4ER1 E;  4Q1W A;  5AGZ A;  5P4R A;  8HVP A;  3APR E;  5P6Q A;  3ZPT A;  1TW7 A;  1HSG A;  2ZJL A;  4XX3 A;  5P85 A;  1HOS A;  5P2Z A;  1MEU A;  5P42 A;  1K6T A;  5P5C A;  4B1E A;  3O9H A;  3EM3 A;  1EBZ A;  3H0B A;  4J54 A;  1T3R A;  5P03 A;  4Y51 A;  1HPO A;  4I8Z A;  2VIZ A;  2QI3 A;  3ST5 A;  4ZLS A;  5P2E A;  1D4J A;  5P0R A;  4J1F A;  3VUC A;  5P1X A;  1HHP A;  5KOS A;  5P2T A;  5OZM A;  1RQ9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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