1J0FA

Solution structure of the sh3 domain binding glutamic acid-rich protein like 3
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
100
structure length
100
Chain Sequence
GSEGAATMSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRTLAGNPKATPPQIVNGNHYCGDYELFVEAVEQDTLQEFLKLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of the SH3 Domain Binding Glutamic Acid-rich Protein Like 3
rcsb
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Mus musculus
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3
total genus 25
structure length 100
sequence length 100
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1j0fA00
4F2IA 2JSZA 1R4WA 4FYCA 3GL5A 4MDCA 3WGXA 3CSJA 1T7PB 4LA1A 1H4OA 1F3BA 1EGOA 2HYXA 3JCML 1B9YC 1PQNA 5B7CA 3KP9A 2TIRA 5GZZB 2I81A 4IELA 1GNWA 1M9AA 4ML1A 3LYKA 3C1RA 1B4PA 3RBTA 3C1SA 1ZL9A 3KZQA 5DALB 16GSA 3D0ZA 3Q6OA 1FOVA 3WGEA 3EINA 2FWHA 2LNTA 3QOUA 4D73B 3G7IA 1LJRA 1XOBA 4TR0A 3GN3A 1XIYA 2WULA 3VPTA 3TDGA 4OFNA 7GSSA 1I9DA 4OFMA 4ML6A 4MLYA 3TCOA 1XCCA 3A2WA 1GTBA 1PX6A 4JBBA 5AGYA 1MDKA 3A2VA 2VCTA 3QDNA 5DBQA 3I69A 1W89A 3TOUA 1PGTA 4TR3A 2AUVA 4V2NA 1QGVA 3APSA 3QFAC 1M0UA 5ELGA 2N5FA 1SK1A 1JZRA 3Q18A 2QSIA 1B48A 2VLVA 3GNJA 5IMVA 4N10A 2IMFA 4L8EA 4FYBA 1S3AA 4YQVA 2FA4A 2KHPA 4DVCA 3HJMA 2GQLA 5FT3A 4ECJA 1WRYA 2A4VA 4MZCA 3TKSA 4F82A 4ZXGA 3KCMA 1X0RA 2DC5A 4RUVA 4N0ZA 1ABAA 1XW9A 2C0DA 2BJXA 3GH9A 1OKTA 3IAS2 4HI7A 2AV4A 2E0QA 2H0GA 1V58A 2O7KA 2GLRA 3CRUA 2HT9A 1BQ7A 2LV3A 4PQIA 5J4UA 2K8SA 4NV2A 1G7OA 3P7XA 2WJUA 1KBNA 3VURA 4TVEA 2HE3A 5EY6A 4MA9A 5D96A 3M0FA 1YQ1A 2CZ3A 3HVVA 1F3AA 2H19A 5IPGA 2F51A 2P31A 4Z7XA 4HOJA 1GLQA 2I3YA 4TOPA 4GSSA 1NM3A 1QMVA 3HD5A 2NTOA 5A5KA 4MJAA 3Q19A 4XS1A 2YZHA 3EU4A 4PURA 2R4VA 4XRDA 3TJFA 4XS4A 1YZXA 4JRRA 3H4KA 3MNGA 6GSWA 1O7UA 1YDKA 1SL0B 1S3CA 4ZBBA 1YJ6A 3K8NA 2FUG2 1O6JA 5COHA 3NIVA 1ON4A 1XW6A 5G30A 5E4WA 2VOCA 1JFUA 3VLNA 1AW9A 2GSTA 1X5CA 4PX1A 4MH3A 2YV9A 4EVMA 1FG4A 1V9WA 2M46A 2X8GA 1Z9HA 4WF4A 5IMDA 3QD9A 3ERWA 2LQOA 1F2EA 2H75A 4O5RA 3L9VA 3LORA 3DRNA 5JCGA 5CRGA 4KSOA 4KW6A 5AIVA 3TKQA 2C0EA 2IMIA 4MMMA 3UEMA 3VPQA 5FWGA 3A2XA 3U6VA 1AQVA 3ZFLA 2V1MA 5D9XA 1JZOA 5AISA 3ZIVA 5J41A 4ZL7A 2B5EA 4I97A 1A2LA 3C73A 3ERFA 1E6BA 2L6CA 3RDWA 2V32A 3BBYA 4MPGA 3E3EA 3RPNA 4TW5A 3GIXA 4BWQA 3VI5A 2K9FA 4KDUA 4K2DA 4IGJA 3F4SA 4POBA 2YOIA 3CBUA 2WFCA 3LSZA 3WD6A 5JWOB 4XS4B 1LBKA 2L6DA 2FD3A 3EC3A 1H75A 2VCWA 3F9UA 5AIXA 4Q5FA 2RM6A 4ECBA 3F6DA 5ECLB 2HLSA 4EC0A 1URMA 1TTZA 2B5XA 2YP6A 2L5OA 4NPBA 4QL7A 2DJ2A 1K3YA 4DSRA 4GTUA 4NWYA 5CREA 5IIZA 3HKRA 2IPAA 2DLXA 1GSSA 1KNGA 2GT5A 3ED3A 6GSYA 3ZIJA 3CSHA 5CRWA 3M9KA 2JSYA 4FYUA 1GP1A 1TRWA 1QQ2A 2G2QA 3GH6A 2R37A 2IFQA 5CNWA 4TR1A 1UVZA 4POLA 3LG6A 5IMAA 4OFTA 4Q5RA 2Z9SA 2B6MA 5ECOB 3ZREA 3TB2A 3UIWA 1K0NA 2O89A 2HRFA 1EZKA 1K0CA 1O8WA 1T00A 3IK7A 3HVSA 3IPZA 3NOFA 2WGRA 1ST9A 2YANA 1GL8A 2H0HA 4DSSA 1UA5A 4I8BA 2P5RA 1VF1A 3MSZA 4P3YB 3P90A 4JEDA 5CP1A 4F0BA 3HYPA 4YQMA 4L0WA 2C8UA 2KLXA 2KP1A 5IMFA 1BAYA 4G19A 1AAZA 1YY7A 3QAWA 1G0TA 4GSNA 3MDKA 3WT2A 4I2TA 1R26A 4OWYA 5HR1A 5J5NA 2B7KA 4KUNA 3IBHA 20GSA 3GUSA 2QC7A 1AQXA 4IQ1A 4K0GA 3ZL5A 2C1YA 3QAGA 1HD2A 1PX7A 1TJDA 2XC2A 3TJJA 2PN8A 5L71A 5HQPA 3D21A 2GTUA 2JZTA 2PUKC 5A4UA 4E8EA 1TI1A 4OCEA 2E2GA 1WE0A 2CZ2A 3UJ1A 2X99A 4KA0A 1Z6NA 4GF0A 2YZUA 2IFQB 4TR1B 1XWAA 3RAZA 1R5AA 3MAKA 4WR4A 2BTOT 3EVIA 2FA8A 5C00A 4WETA 4CDOA 1THOA 3APOA 5J9BA 1PKWA 4MZWA 5ECQB 5HR2A 1PN9A 2MZCA 1JLVA 3FR6A 4KCAA 4EDYA 2HZEA 4QL9A 5DQYA 4DSSB 3ZLPA 1XVWA 2E7PA 3KGKA 3LWAA 1FHEA 5EL8A 3V1WA 4F03A 2PERA 3APQA 2LS5A 4N11A 3F6FA 4L5LA 5G31A 2C4JA 4PNFA 1G6WA 5HR3A 2EC4A 2H74A 1CQGA 4HZ4A 1FW1A 1ZYQB 1MD3A 2RUFA 1AQWA 2GSSA 4HUAA 4XIHA 1TU8A 2EIOA 2GQMA 1M2BA 3UAPA 1GLPA 3ZYWA 3EURA 1GSUA 1YEXA 3BOAA 3FKFA 5G5EA 5CAXA 3CYNA 3EMPA 3HJOA 3IR4A 3LEFA 2LUSA 3F3QA 5A4VA 3ME7A 3BJ5A 4RI6A 4LL1B 4ZILA 2LRTA 4N30A 4JR6A 3ZZXA 2HI7A 1ZOFA 2JL4A 1TOFA 2YWNA 1TKDB 2QKEA 2AJQB 1WIKA 3H1NA 1TRSA 1DE2A 5GSSA 2X8HA 2C3QA 2F8AA 4K7IA 4HEA2 3FK8A 1ERTA 4O7HA 1R5PA 3KJYA 2F3MA 1OYJA 1F9MA 2G0FA 5DCHA 3TKPA 2HZEB 3NZNA 5G2ZA 4HZ2A 5HFGA 2MBTA 1GRXA 3G9BA 3M1GA 3ZFBA 19GSA 4IKHA 3TGZA 4MJEA 12GSA 2DJJA 4ZB6A 4CW9A 4I2UA 2X64A 3DGQA 5ECRB 3H93A 4HU9A 8GSSA 1V57A 1GUMA 2CAIA 2H76A 5F0GA 3ZTLA 3IXRA 1AC1A 1MD4A 2HRNA 2R3XA 2H1GA 2O8VB 5ECNB 1A2JA 2CVDA 1FVKA 3KTBA 2MYGA 4G10A 2H6YA 3QAVA 2DMMA 3IC4A 4K0NA 4KE3A 5DCGA 2FGXA 4MH2A 4BWSA 3LXTA 2IL3A 1NHOA 4K9ZA 2CAQA 5CRHA 1GH2A 2XBIA 1Z3EA 1U87A 3DIEA 3ZVJD 2OA7A 3VWUA 1M9BA 4K7NA 3L9SA 4XRAA 2K6VA 4ZIJA 4XTSA 2PMTA 3UBLA 4YQUA 3D4MA 1FB0A 4HU7A 2IJYA 2PBJA 2ZCTA 2WCIA 5IMZA 3G7YA 2DSAA 5CO3A 3BCIA 4ZBAA 3EU3A 3M8NA 4EXJA 1IYIA 1PL2A 1V98A 4GQFA 3UVHA 4OCFA 1Z6MA 2C0FA 1Z7RA 3GKNA 5ECHB 3UVTA 4EL1A 4MCUA 1SD8A 3M3MA 4JE1A 2OACA 2FWFA 3R2QA 2JACA 5D73A 1ERWA 1SYXA 5D9WA 1UN2A 3VK9A 2VIMA 3U5RE 3DXBA 5J9CA 3HA9A 2VL2C 1A24A 1ERVA 3IV4A 1T4YA 1SKSB 2M72A 3GURA 4J56E 2LNSA 5C04A 2FHEA 2H1AA 2FLSA 4BVXA 1EOGA 2GZPA 4PNGA 1TK5B 5DQSA 2JZRA 1SU9A 2O85A 3O76A 4JZQA 1TP9A 1T1VA 2VL9A 2YCDA 1KTEA 2NVLA 1AIUA 3GL3A 4FO5A 2H70A 3H8QA 1BEDA 2XPEA 3GX0A 2R6KA 1MDJA 3FZ5A 2H1DA 1ZZYA 4HQSA 4IHUA 4EUYA 1BYEA 2B7JA 2DMLA 4IN0A 2RLIA 2WZ9A 1ZMAA 1V2AA 2LKUA 3HZ8A 3TJKA 3A5WA 3CSIA 3DVWA 1OKDA 1WOUA 3Q74A 1TU7A 17GSA 1A8YA 4QQ7A 2V6KA 1T4ZA 1J0FA 3GSTA 4IVFA 2H30A 1R7HA 4BPYA 1C72A 3FW2A 4O32A 5JWRB 1SD9A 2K8VA 4YH2A 4MZBA 3W8SA 3LFLA 6GSUA 5F05A 3C7MA 4F9ZA 1SK2A 3KD0A 1U3IA 4OO5A 2IIYA 1SJ6A 1LU4A 3QR6A 4X0XA 4HS1A 5DJMA 2YJHA 1KEBA 2RM5A 4KDXA 2HFDA 1NHYA 3FHKA 1A0RP 1NSWA 4O92A 1YF0A 3D6IA 2DJ0A 4KGIA 4TXVA 2J9HA 2OE1A 4KCEA 3ZMLA 1OVNA 4MF5A 4MF6A 2YJ7A 5KN2A 3UMAA 5GAPD 1XBSA 5IPHA 3TKSE 2WRTA 4KAEA 4EE0A 4CHSA 2CQ9A 3IDVA 2IN3A 1Y6EA 1T8EB 2XHFA 4XS6A 1THXA 1B8XA 1YKCA 4ZL8A 3CRTA 4IW9A 4FIWA 2ON7A 5B6MA 2DIYA 4MF7A 5JCWA 3GTUA 1M2AA 3GA4A 4WR5A 1U88A 4F0CA 2KP2A 3IRAA 3N9JA 3W6GA 4IJIA 3BCKA 1X9MB 2WB9A 3GV1A 3KH7A 2YPMA 1GSYA 2IMKA 2ON5A 3VWVA 5AN1A 4YAPA 3D22A 1WMJA 5B8BA 3TJGA 1F6MC 2M80A 1VF3A 2A2SA 2I1UA 3EMXA 1HNBA 3QMXA 2H71A 1Z7PA 1Q4JA 1SL1B 2OE3A 4ILFA 2PVOC 2ES7A 5DVBA 2CX3A 1GSDA 3DYRA 1SKWB 1PL1A 2NBSA 2VCZA 13GSA 4NHWA 4H86A 2VLUA 1S3DA 3SWLA 1IYHA 2ALBA 1VGLA 4MJCA 4J2FA 4IS0A 2C3TA 4RQRA 2LTKA 2VCXA 4IJ3A 1JHBA 1O85A 3J7Yk 5JCUA 4I6XA 4TR4A 4V2LA 3DEXA 1JZWA 1ZYEA 4BL7A 2FWGA 2IMDA 4JU5A 1N2AA 2REMA 3GKXA 4AJ8A 4OMVA 4PGTA 3WYWA 2AAWA 1RW1A 1QFNA 11GSA 2GS3A 2GQKA 3GTUB 4ID0A 1ACVA 1A2MA 4X1UA 3ERGA 1PSQA 2GSRA 3FR3A 1O8XA 1FVJA 5DALA 2HNLA 2YWMA 3ME8A 1VF2A 2HSYA 1SJIA 2VUPA 1W4VA 5KEJA 3IK9A 5ECPB 5E59A 1MEKA 1K0BA 3KIJA 3O3TA 2B1KA 3D4TA 1T3BA 4NMUA 4POMA 3LYPA 3UARA 4AGSA 2CV4A 4LMVA 2J23A 3GYKA 5IQYA 1Z5YE 3DD3A 1V40A 1TW9A 2I9HA 1ILOA 1AXDA 2R5GA 3DMLA 3E0UA 3L4NA 2L59A 1N8JA 3GFKA 2XBQA 4ULXA 3HJPA 1SYRA 4RI7A 2HXKA 1GUKA 2GVPA 1K0MA 3VI7A 3IHQA 1A23A 2NDOA 2KOKA 2RIIA 4GXZA 3FZ9A 1A0FA 1GWCA 3C71A 2PWJA 4MK3A 4KH7A 3IA1A 2F9SA 2DJKA 1GSFA 2YV7A 5LCZA 3OR5A 3CMIA 4K6XA 2RUEA 3F4TA 4PUFC 6GSXA 2GSQA 1ZGNA 1X9SB 1XZOA 5D8IA 4HDEA 3E9JB 4OO4A 3TKRA 1EV9A 14GSA 4PUAA 2FY6A 2LRNA 3D5JA 2PGTA 1M99A 6GSSA 1XXUA 1E2YA 1WP0A 2DIZA 2KUCA 3I9V2 1B4QA 5G1KA 3TRPA 2H8LA 4HJMA 4ECIA 2PPTA 1WWJA 1HNCA 4MJBA 2JU5A 4TXOA 3EWLA 3EYTA 3L0HA 1PKZA 2K18A 1XPVA 2LJAA 1EV4A 2H01A 5KN3A 1X5DA 1DUGA 4J57E 1WPIA 2EIQA 4ISDA 3N5OA 3RPPA 1EWXA 1YEPA 4K1FA 1X9WB 2H72A 3PH9A 5JWQB 3KMNA 3ZMKA 1QK8A 5A4WA 5G1LA 4POKA 4EKZA 4DSQA 2AHEA 4IQAA 1USBA 2V2GA 3BD2A 5D93A 4NAXA 3L9UA 1XW5A 1A8LA 5KN1A 3US3A 4GWRA 5CRDA 5DDLA 1PMTA 4EF0A 3W8JA 4XHMA 3KEBA 4XCSA 2LJKA 1FB6A 4KNDA 3F0IA 5ID2A 4FH8A 3GMFA 4EDZA 5H5SA 3KMOA 1HYUA 5H5RA 2X8CA 4WBJA 3TUEA 4NHZA 5B8AA 3PR8A 1ERUA 4WBRD 1UC7A 5HFKA 4KX4A 4E8HA 1SL2B 1XOAA 4HJ2A 1ZCPA 2MMAA 1TK0B 5EVOA 2XPDA 3TOTA 2VM1A 3QCPA 2VL2A 4TKYA 4I5QA 2WS2A 5DAKA 2NPBA 4GRFA 2CA8A 1OC3A 2CT6A 2DBCA 4IP6A 1X5EA 4TXOB 3WGDA 4GCIA 1EEJA 18GSA 3TKSC 3H79A 3HVXA 5DJLA 4EO3A 2A2RA 4MPFA 4YAVA 3F3RA 5GSTA 3MWHA 4V2MA 1BG5A 2CVBA 1HQOA 4MP4A 2H6ZA 4TN8A 1OC8A 4WKWA 1SK0A 3DWVA 1ML6A 1EP7A 1FAAA 2L4QA 2GT6A 3I43A 1JLWA 2OKAA 4ECCA 1Q98A 2HSHA 2L5LA 5KN0A 1OAZA 1RQMA 5LD0A 2C3NA 2LEGA 3FEUA 5F07A 3QPMA 5IOWA 4ZL9A 2YN1A 2VD1A 4TRXA 1GUHA 5ID2B 2L57A 3IOSA 3TRQA 2H0IA 1GTAA 3EE2A 2TRXA 4KDYA 3AY8A 3UBKA 1EOHA 3KH9A 3KP8A 2YNXA 3GX8A 2AB6A 3QFBC 1RK4A 3HCZA 1YKAA 1DE1A 1CQHA 5DAKB 1SKRB 3UL3A 1K0DA 2OBIA 3LJRA 3ISOA 2V6OA 5HR0A 2H6XA 3FYGA 1TK8B 2VL3A 2HZFA 3O6TA 2VD0A 2QGVA 4K8MA 1J08A 1DSBA 3F63A 2CVKA 4GSTA 3UOMA 3S9FA 4WF5A 4BA7A 4N0VA 2OE0A 3ZVJA 1TRUA 1HNAA 2LQQA 3ZRDA 1B9XC 1GSEA 3DKSA 3GRXA 1VRSD 3FR9A 2JADA 1K3LA 3FY7A 1VF4A 4ZB8A 5H5QA 1OC9A 2PU9C 1SENA 1TI3A 4LLRA 22GSA 2MMNA 2D2ZA 3FZAA 2P5QA 1O73A 3KTLA 4KSMA 2VCVA 2AYTA 2F8FA 3DVXA 1PRXA 4PXOA 3FZ4A 1EEMA 3VWXA 2N5AA 5ECSA 3GSSA 4LMWA 3LXZA 5D9VA 1MTCA 2GDRA 1XWBA 1U6TA 2YWOA 2VLTA 2V41A 3HDCA 4LL4B 3HZ4A 3ZITA 3SBCA 4WXTA 3RHBA 5ECKB 1XVQA 1TXXA 3M9JA 2ZNMA 2FNOA 4HQZA 4DEJA 3GKKA 1YF1A 3GKMA 3RHCA 2GZZA 4GQCA 2I4AA 5EPFA 5F06A 2H66A 3HHVA 1SJZA 2VCQA 1FO5A 1GULA 4V1Ap 1K0AA 3L78A 1XWGA 2DJ3A 5CYYA 1WJKA 4L5OA 1XWKA 3I6AA 3J7Yb 6GSTA 3WT1A 1XWCA 2VM2A 1QUWA 5HFIA 2IWTA 1TDIA 1EGRA 3KXOA 3VWWA 2GGTA 1BJXA 1PD21 3IE3A 1K0OA 1M2DA 1OC9B 4NV5A 1GNEA 4BVYA 4JR4A 4Q5QA 5ECMB 1Y25A 2B5YA 4ZB9A 3F4RA 2OADA 3P8WA 1GTIA 1O81A 3KM6A 2FWEA 2LSTA 3CXGA 1M7TA 4ACSA 4IBPA 2E2MA 4AJ7A 2C0GA 1GSQA 1I5GA 3HXSA 2GZYA 3TRXA 2IMEA 1G6YA 2OBKA 1U3AA 4OD7A 5FHIA 4PQ1A 2H73A 4L0UA 5G5FA 1GTUA 4RQXA 2R2JA 2DJ1A 1AUCA 3IAM2 1NW2A 1OE8A 4IP1A 3LQ7A 2B3SA 3GHAA 2C80A 2PVQA 3FRCA 3A3TA 5ABRA 5IOXA 4X43A 2N5BA 9GSSA 2FCHA 1PA3A 3LGCA 1EP8A 5B6NA 1MDIA 5LNKe 4KB3A 5ENUA 1BX9A 3CTGA 5IO0A 5D9TA 2O87A 2EIRA 2LRCA 4G9HA 5ELAA 4D73A 10GSA 3HY2A 3PGTA 1JZDA 4PQHA 4AJ6A 3PINA 5F8BA 5IMCA 5ECIB 1K3OA 2VO4A 5GAND 5INYA 3P2AA 1XFLA 2YWIA 2LJRA 4GLTA 2MMOA 1DBYA 1OE7A 3G7JA 2H1BA 1J9BA 4MABA 1QXHA 3TJBA 1F37A 2JZSA 1TRVA 4ZBDA 2TRCP 4K7OA 3C8EA 3F8UA 4V1Ag 1G7EA 2WDUA 2OJLA 2B1LA 2MMZA 5IO2A 2VAFA 2MBSA 6GSVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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